# -------------------- # version: 0 # protein: # name: AQP2_HUMAN # organism: Homo sapiens (Human) # uniprot: P41181 # sequence: MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGLEPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA # diabetes_genes: False # membrane_protein: True # human_proteome: True # merged: # file_00: prism_uniprot_XXX_P41181.txt (version 1) # file_01: prism_netsurfp_001_P41181.txt (version 1) # file_02: prism_clinvar_XXX_P41181-AQP2-NM_000486.txt (version 1) # file_03: prism_gnomad_001_P41181-ENST00000199280-ENSG00000167580.mis.txt (version 1) # file_04: prism_spliceai_XXX_P41181-ENST00000199280-ENSG00000167580.txt (version 1) # file_05: prism_pdb_XXX_P41181-6qf5-A.txt (version 1) # file_06: prism_pdb_XXX_P41181-6qf5-B.txt (version 1) # file_07: prism_pdb_XXX_P41181-6qf5-D.txt (version 1) # file_08: prism_pdb_XXX_P41181-4nef-B.txt (version 1) # file_09: prism_pdb_XXX_P41181-4nef-D.txt (version 1) # file_10: prism_pdb_XXX_P41181-4nef-C.txt (version 1) # file_11: prism_pdb_XXX_P41181-4nef-A.txt (version 1) # file_12: prism_pdb_XXX_P41181-6qf5-C.txt (version 1) # variants: # number: 214 # coverage: 0.568 # depth: 1.390 # width: single mutants # columns: # uniprot;pfam_name_00: pfam_name # uniprot;TRANSMEM_00: TRANSMEM # uniprot;INTRAMEM_00: INTRAMEM # uniprot;TOPO_DOM_00: TOPO_DOM # uniprot;MOD_RES_00: MOD_RES # uniprot;CARBOHYD_00: CARBOHYD # uniprot;STRAND_00: STRAND # uniprot;HELIX_00: HELIX # uniprot;TURN_00: TURN # uniprot;MOTIF_00: MOTIF # uniprot;mobidb_00: mobidb # netsurfp;burried_exposed_01: Classification if residue is burried (RSA <= 0.25) or exposed (RSA > 0.25) # netsurfp;rsa_01: Relative Surface Accessibility # netsurfp;asa_01: Absolute Surface Accessibility # netsurfp;q3_ss_pred_01: Secondary structure prediction in 3 class scheme (q3) # netsurfp;p_q3_H_01: probability of class H (helix) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_E_01: probability of class E (strand) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_C_01: probability of class C (coil) in q3 assignment # netsurfp;q8_ss_pred_01: Secondary structure prediction in 8 class scheme (q8) # netsurfp;p_q8_G_01: probability of class G (3-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_H_01: probability of class H (4-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_I_01: probability of class I (5-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_B_01: probability of class B (isolated beta-bridge) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_E_01: probability of class E (strand) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_S_01: probability of class S (bend) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_T_01: probability of class T (turn) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_C_01: probability of class C (coil) in q8 assignment # netsurfp;phi_01: phi angle # netsurfp;psi_01: psi angle # netsurfp;disorder_01: probability of residue being disordered # clinvar;Clinvar_ID_02: Clinvar_ID # clinvar;Clinvar_signifiance_02: Clinvar_signifiance # clinvar;Clinvar_review_status_02: Clinvar_review_status # gnomad;AF_tot_03: Frequency estimate of the variant allele from exome and genome data combined (if present in both, otherwise just AF_ex or AF_g). Calculated as (AC*_ex + AC*_g) / (max(AN_ex) + max(AN_g)) where AC*_ex = sum(AF_ex_i) * max(AN_ex) # gnomad;std_AF_tot_03: Error estimate on AF_tot from error propagation # gnomad;AF_ex_03: Variant allel frequency in exomes data # gnomad;std_AF_ex_03: Error estimate on AF_ex derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_ex_03: Counts of variant allel in exomes data # gnomad;AN_ex_03: Total allel counts at this site in exomes data # gnomad;AF_g_03: Variant allel frequency in genomes data # gnomad;std_AF_g_03: Error estimate on AF_g derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_g_03: Counts of variant allel in genomes data # gnomad;AN_g_03: Total allel counts at this site in genomes data # gnomad;Codons_ex_03: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Codons_g_03: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Homozygotes_ex_03: Number of individuals homozygous for the variant in exome data # gnomad;Homozygotes_g_03: Number of individuals homozygous for the variant in genome data # spliceai;maxdelta_04: naximum delta score # spliceai;DS_AG_04: delta score for acceptor gain # spliceai;DS_AL_04: delta score for acceptor loss # spliceai;DS_DG_04: delta score for donor gain # spliceai;DS_DL_04: delta score for donor loss # spliceai;HGVSc_04: change on nucleotide level # pdb;SS_05: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_05: Accessible surface area # pdb;SS_06: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_06: Accessible surface area # pdb;SS_07: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_07: Accessible surface area # pdb;SS_08: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_08: Accessible surface area # pdb;SS_09: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_09: Accessible surface area # pdb;SS_10: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_10: Accessible surface area # pdb;SS_11: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_11: Accessible surface area # pdb;SS_12: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_12: Accessible surface area # pdb;IDs: PDB_ID + chain # -------------------- # # variant uniprot;pfam_name_00 uniprot;TRANSMEM_00 uniprot;INTRAMEM_00 uniprot;TOPO_DOM_00 uniprot;MOD_RES_00 uniprot;CARBOHYD_00 uniprot;STRAND_00 uniprot;HELIX_00 uniprot;TURN_00 uniprot;MOTIF_00 uniprot;mobidb_00 netsurfp;burried_exposed_01 netsurfp;rsa_01 netsurfp;asa_01 netsurfp;q3_ss_pred_01 netsurfp;p_q3_H_01 netsurfp;p_q3_E_01 netsurfp;p_q3_C_01 netsurfp;q8_ss_pred_01 netsurfp;p_q8_G_01 netsurfp;p_q8_H_01 netsurfp;p_q8_I_01 netsurfp;p_q8_B_01 netsurfp;p_q8_E_01 netsurfp;p_q8_S_01 netsurfp;p_q8_T_01 netsurfp;p_q8_C_01 netsurfp;phi_01 netsurfp;psi_01 netsurfp;disorder_01 pdb;SS_05 pdb;ASA_05 pdb;SS_06 pdb;ASA_06 pdb;SS_07 pdb;ASA_07 pdb;SS_08 pdb;ASA_08 pdb;SS_09 pdb;ASA_09 pdb;SS_10 pdb;ASA_10 pdb;SS_11 pdb;ASA_11 pdb;SS_12 pdb;ASA_12 pdb;IDs clinvar;Clinvar_ID_02 clinvar;Clinvar_signifiance_02 clinvar;Clinvar_review_status_02 gnomad;AF_tot_03 gnomad;std_AF_tot_03 gnomad;AF_ex_03 gnomad;std_AF_ex_03 gnomad;AC_ex_03 gnomad;AN_ex_03 gnomad;AF_g_03 gnomad;std_AF_g_03 gnomad;AC_g_03 gnomad;AN_g_03 gnomad;Codons_ex_03 gnomad;Codons_g_03 gnomad;Homozygotes_ex_03 gnomad;Homozygotes_g_03 spliceai;maxdelta_04 spliceai;DS_AG_04 spliceai;DS_AL_04 spliceai;DS_DG_04 spliceai;DS_DL_04 spliceai;HGVSc_04 W2S NA NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6685410737991333 160.78412824869156 C 0.07903146743774414 0.03794323652982712 0.8830252885818481 C 0.01877647079527378 0.038459435105323785 0.00028495118021965027 0.00874575972557068 0.026537304744124413 0.03158202022314072 0.020381348207592964 0.8552327752113342 -87.87382507324219 125.62549591064452 0.2920311689376831 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.986160209024092e-06 8.064997388704871e-06 3.986160209024092e-06 8.064997388704871e-06 1 250868 NA NA NA NA tGg/tCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E3K MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6883574724197388 120.25605043172837 C 0.14246810972690582 0.08881726861000061 0.7687146663665771 C 0.02273536473512649 0.06922756880521774 0.0003987874079030007 0.0087948152795434 0.06847196817398071 0.034710057079792016 0.018140379339456558 0.7775210738182068 -89.73627471923828 123.16665649414062 0.23869921267032626 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7268041237113402 NA NA - 0.3350515463917525 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 3.984890099673066e-06 9.052452752411028e-06 3.984890099673066e-06 9.052452752411028e-06 1 250948 NA NA NA NA Gag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L4P MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5001160502433777 91.57124879956244 C 0.2234908491373062 0.10558857768774033 0.6709206104278564 C 0.06511950492858888 0.11690725386142732 0.0012987044174224134 0.02623462677001953 0.07788939774036407 0.03938734531402588 0.04391516000032425 0.6292480826377869 -82.21338653564453 86.70316314697266 0.2513495087623596 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA T 0.38414634146341453 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.732462813071074e-05 NA NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.732462813071074e-05 2.0 143314.0 NA cTc/cCc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L4V MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5001160502433777 91.57124879956244 C 0.2234908491373062 0.10558857768774033 0.6709206104278564 C 0.06511950492858888 0.11690725386142732 0.0012987044174224134 0.02623462677001953 0.07788939774036407 0.03938734531402588 0.04391516000032425 0.6292480826377869 -82.21338653564453 86.70316314697266 0.2513495087623596 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA T 0.38414634146341453 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 1.3950099855719598e-05 1.5919405631726834e-05 NA NA NA NA 1.3950099855719598e-05 1.5919405631726834e-05 2.0 143368.0 NA Ctc/Gtc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R5C MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6061208844184875 138.80168253183365 C 0.15995952486991882 0.09871645271778108 0.7413240671157837 C 0.05480628460645677 0.08337991684675218 0.0003888813371304423 0.01051157433539629 0.09229881316423416 0.08122990280389786 0.0515388585627079 0.6258457899093628 -94.48140716552734 56.73750686645508 0.12532326579093933 - 0.9556451612903226 - 0.935483870967742 NA NA NA NA H 0.5483870967741935 NA NA T 0.8387096774193549 - 1.0 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B NA NA NA 7.606796766121988e-06 1.715605916456246e-05 7.967300007294398e-06 8.414801517832761e-06 2 251026 6.9755401455040555e-06 1.4950634818409785e-05 1.0 143358.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R5H MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6061208844184875 138.80168253183365 C 0.15995952486991882 0.09871645271778108 0.7413240671157837 C 0.05480628460645677 0.08337991684675218 0.0003888813371304423 0.01051157433539629 0.09229881316423416 0.08122990280389786 0.0515388585627079 0.6258457899093628 -94.48140716552734 56.73750686645508 0.12532326579093933 - 0.9556451612903226 - 0.935483870967742 NA NA NA NA H 0.5483870967741935 NA NA T 0.8387096774193549 - 1.0 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B NA NA NA 5.8318471958985924e-05 1.7970612051878996e-05 5.1786599215120084e-05 8.668770667524994e-06 13 251030 6.975640280870722e-05 1.574151557611264e-05 10.0 143356.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA I7V MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4625524282455444 85.57219922542572 C 0.4741927683353424 0.03809533640742302 0.4877118170261383 H 0.02548847906291485 0.5045292377471924 0.0007536833873018622 0.00914861261844635 0.02439001761376857 0.07719375193119049 0.04204433411359787 0.3164518475532532 -77.23921966552734 -30.18116569519043 0.023049963638186455 H 0.5088757396449705 H 0.6035502958579881 - 1.0 H 0.6804733727810651 H 0.3550295857988165 H 0.6272189349112426 H 0.7041420118343196 H 0.5680473372781065 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9750599323015194e-06 1.7761976559675402e-05 NA NA NA NA 6.9750599323015194e-06 1.7761976559675402e-05 1.0 143368.0 NA Ata/Gta NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A8D MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.41104719042778015 45.297400385141366 H 0.7440375685691833 0.005325386766344311 0.2506369650363922 H 0.03691283985972405 0.7093353867530823 0.0005943276919424534 0.0009129347163252534 0.0037279734387993813 0.02533902786672116 0.03242705762386322 0.1907504200935364 -69.00321960449219 -40.1317253112793 0.01103819627314806 H 0.5 H 0.5188679245283019 H 0.5849056603773585 H 0.6037735849056604 H 0.4528301886792453 H 0.660377358490566 H 0.5943396226415094 H 0.6037735849056604 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.981149802712024e-06 8.76025697814869e-06 3.981149802712024e-06 8.76025697814869e-06 1 251184 NA NA NA NA gCc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A8T MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.41104719042778015 45.297400385141366 H 0.7440375685691833 0.005325386766344311 0.2506369650363922 H 0.03691283985972405 0.7093353867530823 0.0005943276919424534 0.0009129347163252534 0.0037279734387993813 0.02533902786672116 0.03242705762386322 0.1907504200935364 -69.00321960449219 -40.1317253112793 0.01103819627314806 H 0.5 H 0.5188679245283019 H 0.5849056603773585 H 0.6037735849056604 H 0.4528301886792453 H 0.660377358490566 H 0.5943396226415094 H 0.6037735849056604 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.981149802712024e-06 7.699247325238696e-06 3.981149802712024e-06 7.699247325238696e-06 1 251184 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R11K MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4590870141983032 105.13092625141144 H 0.9930419921875 0.0001701526780379936 0.006787953898310661 H 0.003299413248896599 0.9882752895355223 0.001777883735485375 4.304733738536015e-05 9.03270483831875e-05 0.0007972813327796758 0.002638405654579401 0.003078393172472716 -64.30662536621094 -40.32624053955078 0.002249468117952347 H 0.2862903225806452 H 0.3024193548387097 H 0.2983870967741936 H 0.3346774193548387 H 0.2620967741935484 H 0.3024193548387097 H 0.27419354838709675 H 0.2862903225806452 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 882312.0 VUS 1.0 2.7873226495213917e-05 1.6837837402618634e-05 3.979719986091368e-05 9.091835332569256e-06 10 251274 6.974959887884323e-06 1.4172201617337665e-05 1.0 143370.0 aGg/aAg aGg/aAg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F14L MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4759250283241272 95.51815318465229 H 0.9986315369606018 6.7053988459520025e-06 0.0013617564691230655 H 0.0003021527954842895 0.9939210414886476 0.004439594689756632 3.1833656066737608e-06 1.7170644923680813e-06 0.00011409245053073391 0.0008802796946838498 0.0003379648260306567 -67.54132843017578 -45.02322769165039 0.000281574873952195 H 0.3553299492385787 H 0.350253807106599 H 0.3604060913705584 H 0.3350253807106599 H 0.3401015228426396 H 0.3553299492385787 H 0.3451776649746193 H 0.4010152284263959 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.958429705468006e-06 7.687952436673953e-06 7.958429705468006e-06 7.687952436673953e-06 2 251306 NA NA NA NA ttC/ttA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A15T MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.1264142096042633 13.930845898389814 H 0.9988093376159668 5.17169974045828e-06 0.0011855487246066332 H 0.00038113148184493184 0.994668185710907 0.003859983291476965 3.7363834053394393e-06 1.4656243365607224e-06 0.0001244504819624126 0.0006908507784828544 0.00027015406521968544 -63.94103622436523 -41.93472290039063 0.00011424630065448582 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2805432377500997e-05 1.7465979251132114e-05 2.387769927736372e-05 8.79752837961244e-06 6 251280 2.0925999706378207e-05 1.5088536231553119e-05 3.0 143362.0 Gca/Aca Gca/Aca 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F17L MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.2535200119018555 50.88146638870239 H 0.9994545578956604 1.3144095873940387e-06 0.0005440724780783056 H 0.00017251611279789358 0.9907797574996948 0.008468007668852806 2.422451927941437e-07 3.222411635306344e-07 4.123646795051173e-05 0.00043157293112017214 0.00010641563130775468 -63.250770568847656 -43.23881912231445 2.410920933471061e-05 H 0.3197969543147208 H 0.3045685279187817 H 0.29949238578680204 H 0.3299492385786802 H 0.3197969543147208 H 0.3096446700507614 H 0.3299492385786802 H 0.3045685279187817 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978550012107007e-06 9.23892253832724e-06 3.978550012107007e-06 9.23892253832724e-06 1 251348 NA NA NA NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A19T MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.06789344549179077 7.481857693195343 H 0.9993968009948728 1.2328019920460065e-06 0.0006020601722411811 H 0.0002906589361373335 0.9932613968849182 0.0058729955926537505 1.1524438150445349e-06 2.444338065288321e-07 5.5183973017847165e-05 0.0004168125451542437 0.00010153400216950104 -64.61367034912111 -41.89375305175781 5.3336381824919954e-05 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978710083174518e-06 8.733190174264499e-06 3.978710083174518e-06 8.733190174264499e-06 1 251338 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T20I MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.026648133993148804 3.6960961848497385 H 0.9994001388549804 4.838581844524015e-06 0.0005950257764197888 H 0.00030708403210155666 0.9966841340065002 0.00232886360026896 1.5961161352606725e-06 1.3204521565057805e-06 7.273074879776686e-05 0.0004865044029429555 0.00011785230162786321 -65.87642669677734 -42.32278823852539 3.502459003357217e-05 H 0.0 H 0.007042253521126761 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.5511926146992055e-05 NA NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.5511926146992055e-05 2.0 143380.0 NA aCa/aTa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L21F MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.24554461240768435 44.959218531847 H 0.9997113347053528 1.293314085160091e-06 0.00028730093617923563 H 0.00012233603047206998 0.9969781637191772 0.002611940726637841 2.701207506561332e-07 3.684427554162539e-07 2.011383548961021e-05 0.00021547359938267618 5.146584226167762e-05 -62.489830017089844 -44.12451171875 3.098669185419567e-05 H 0.08536585365853659 H 0.1402439024390244 H 0.12195121951219512 H 0.09146341463414634 H 0.08536585365853659 H 0.08536585365853659 H 0.09146341463414634 H 0.0975609756097561 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.182909858878702e-05 9.9074853589037e-06 3.182909858878702e-05 9.9074853589037e-06 8 251342 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L21P MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.24554461240768435 44.959218531847 H 0.9997113347053528 1.293314085160091e-06 0.00028730093617923563 H 0.00012233603047206998 0.9969781637191772 0.002611940726637841 2.701207506561332e-07 3.684427554162539e-07 2.011383548961021e-05 0.00021547359938267618 5.146584226167762e-05 -62.489830017089844 -44.12451171875 3.098669185419567e-05 H 0.08536585365853659 H 0.1402439024390244 H 0.12195121951219512 H 0.09146341463414634 H 0.08536585365853659 H 0.08536585365853659 H 0.09146341463414634 H 0.0975609756097561 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4834789033559451e-05 NA NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4834789033559451e-05 1.0 143340.0 NA cTc/cCc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L22V MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.3782418966293335 69.25609127283096 H 0.9997690320014954 4.5728117470389407e-07 0.00023050002346280962 H 0.0001147202419815585 0.994465172290802 0.0051361829973757284 2.0250308807590045e-07 9.297200875835188e-08 1.4889324120304087e-05 0.00024087994825094936 2.776751534838695e-05 -64.07865142822266 -45.088279724121094 5.133763261255808e-05 H 0.006097560975609756 H 0.024390243902439025 H 0.012195121951219513 H 0.012195121951219513 H 0.012195121951219513 H 0.006097560975609756 H 0.012195121951219513 H 0.03048780487804878 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2800156193284525e-05 1.6504677901248597e-05 3.182710133842193e-05 8.649585453474243e-06 8 251358 6.97467021382181e-06 1.405663772411492e-05 1.0 143376.0 Ctc/Gtc Ctc/Gtc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F23L MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.13496538996696472 27.08755376636982 H 0.999581515789032 1.4732447652932026e-06 0.0004170129250269383 H 0.0002786950208246708 0.9932554960250854 0.0059211431071162215 9.747845979291014e-07 4.26992983193486e-07 4.139753946219571e-05 0.0004240654816385359 7.775893755024299e-05 -66.67125701904297 -41.84574508666992 4.984860061085783e-05 H 0.04060913705583756 H 0.06598984771573604 H 0.05583756345177665 H 0.045685279187817264 H 0.03553299492385787 H 0.03553299492385787 H 0.03553299492385787 H 0.045685279187817264 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97622999723535e-06 1.5187771142892504e-05 NA NA NA NA 6.97622999723535e-06 1.5187771142892504e-05 1.0 143344.0 NA Ttc/Ctc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V24I MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.055728137493133545 8.565414732694625 H 0.9994416832923888 7.83301038609352e-06 0.0005504220607690513 H 0.0005574866663664579 0.9937611222267152 0.0049324724823236465 2.027618165811873e-06 2.2492372409033128e-06 5.642668475047686e-05 0.0006011127843521535 8.718034223420544e-05 -66.46652984619139 -41.86840438842773 4.76799214084167e-05 H 0.007042253521126761 H 0.014084507042253518 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 309232.0 conflict 1.0 0.00011402300102118196 1.7722614010333345e-05 0.00014324400399345905 8.466388447811087e-06 36 251320 6.278869841480628e-05 1.5569563706476652e-05 9.0 143338.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 1 0.0 NA NA NA NA NA NA G27R MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.03745317459106445 2.9475648403167725 H 0.998016357421875 9.076245078176726e-06 0.001974596409127116 H 0.001738326856866479 0.9689854979515076 0.02708396688103676 6.957724508538376e-06 2.7352073175279656e-06 0.00029909907607361674 0.0015006157336756587 0.00038289392250590026 -65.29299926757811 -41.98872375488281 0.00015499004803132266 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 H 0.011904761904761904 H 0.011904761904761904 H 0.011904761904761904 H 0.011904761904761904 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978069798904472e-06 9.19869883424254e-06 3.978069798904472e-06 9.19869883424254e-06 1 251378 NA NA NA NA Ggc/Cgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L28F MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.09231695532798767 16.90323452055454 H 0.992128610610962 7.101074152160436e-05 0.007800403051078319 H 0.005187924951314926 0.9733558893203736 0.012469206005334854 3.805563028436154e-05 2.578821295173839e-05 0.0007546935812570156 0.006618358194828034 0.0015500420704483984 -67.27407836914061 -38.39870071411133 0.00010233049397356808 H 0.006097560975609756 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.006097560975609756 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977850155933993e-06 8.106657488251669e-06 3.977850155933993e-06 8.106657488251669e-06 1 251392 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G29S MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.16444912552833554 12.942146179080007 H 0.981978476047516 0.00014110864140093327 0.017880454659461975 H 0.017227334901690483 0.9381157755851746 0.021978341042995453 7.255254604388028e-05 5.4849893786013126e-05 0.0015104984631761909 0.018806293606758118 0.002234282437711954 -65.71240234375 -33.44095993041992 0.00033745719701983035 H 0.03571428571428571 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.093250077450648e-05 1.5900192558765272e-05 NA NA NA NA 2.093250077450648e-05 1.5900192558765272e-05 3.0 143318.0 NA Ggc/Agc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A31G MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.057597994804382324 6.347299027442932 H 0.9330365657806396 0.0002387493586866185 0.06672462075948715 H 0.08578614890575409 0.7888245582580566 0.014054902829229832 0.00018976225692313164 8.841545059112832e-05 0.005854445043951273 0.09730520844459534 0.00789647176861763 -68.88636779785156 -30.84703254699707 0.0014916947111487384 H 0.12264150943396225 T 0.22641509433962265 H 0.16037735849056606 H 0.16981132075471694 H 0.1792452830188679 H 0.1509433962264151 H 0.1509433962264151 H 0.08490566037735849 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.066267237314579e-06 1.880872408156271e-05 3.977469987148652e-06 7.695445423235378e-06 1 251416 6.97583982400829e-06 1.7162407212112252e-05 1.0 143352.0 gCc/gGc gCc/gGc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P35S MIP NA NA Extracellular|1 NA NA STRAND|1 NA NA NA NA e 0.5490200519561768 77.90594537258148 C 0.15976248681545258 0.0018151454860344527 0.8384224176406859 C 0.10749439150094986 0.05027838423848152 0.0006103417836129665 0.0009442121954634787 0.0011233347468078136 0.1273127645254135 0.2714879512786865 0.4407485127449036 -66.15067291259766 -11.957727432250975 0.022765405476093292 S 0.3235294117647059 T 0.6838235294117647 S 0.6911764705882353 S 0.6102941176470589 S 0.6985294117647058 S 0.2426470588235294 S 0.2426470588235294 S 0.4779411764705882 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977189862780506e-06 8.529354729081823e-06 3.977189862780506e-06 8.529354729081823e-06 1 251434 NA NA NA NA Cca/Tca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A37V MIP NA NA Extracellular|1 NA NA STRAND|1 NA NA NA NA e 0.5264146327972412 58.01089253425597 C 0.28918981552124023 0.0096295103430748 0.7011807560920715 C 0.15516063570976255 0.09072238951921464 0.000717064889613539 0.005176207982003689 0.004858666099607945 0.2351224571466446 0.2118701189756393 0.29637253284454346 -87.03374481201172 6.3521599769592285 0.016205964609980583 S 0.6037735849056604 - 0.3490566037735849 S 0.33962264150943394 S 0.4339622641509434 S 0.3018867924528302 S 0.3867924528301887 S 0.4339622641509434 S 0.5 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97564018992125e-06 1.6667230748546137e-05 NA NA NA NA 6.97564018992125e-06 1.6667230748546137e-05 1.0 143356.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L42P MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.4187830984592438 76.67918532788754 H 0.982676923274994 0.0001331274543190375 0.017189987003803253 H 0.0052921888418495655 0.9773739576339722 0.0019042224157601593 4.026241731480695e-05 5.071660780231469e-05 0.0019359210273250933 0.009651685133576391 0.0037510544061660775 -63.86090469360352 -38.923072814941406 0.0006888147909194231 H 0.07317073170731707 H 0.054878048780487805 H 0.04878048780487805 H 0.054878048780487805 H 0.042682926829268296 H 0.04878048780487805 H 0.054878048780487805 H 0.12195121951219512 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.06595932606776e-06 1.6483390342655955e-05 3.977029791712994e-06 8.758116275427639e-06 1 251444 6.976029908400959e-06 1.3964152551961505e-05 1.0 143348.0 cTa/cCa cTa/cCa 0 0.0 NA NA NA NA NA NA Q43P MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3698136806488037 66.04872336387632 H 0.9962517619132996 5.616842463496141e-05 0.003692091442644596 H 0.002485171426087618 0.991860330104828 0.001971630845218897 3.0176150175975642e-05 2.292153840244282e-05 0.0005475225043483078 0.0019485788652673364 0.0011336763855069876 -66.54938507080078 -41.10423278808594 0.0005052614142186942 H 0.040404040404040414 H 0.06565656565656566 H 0.02525252525252525 H 0.045454545454545456 H 0.040404040404040414 H 0.040404040404040414 H 0.05555555555555555 H 0.05555555555555555 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2665888092877495e-05 1.7458704354739327e-05 1.1931800145248415e-05 8.971858185077815e-06 3 251428 1.3953599591332022e-05 1.4977053063037673e-05 2.0 143332.0 cAg/cCg cAg/cCg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA Q43R MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3698136806488037 66.04872336387632 H 0.9962517619132996 5.616842463496141e-05 0.003692091442644596 H 0.002485171426087618 0.991860330104828 0.001971630845218897 3.0176150175975642e-05 2.292153840244282e-05 0.0005475225043483078 0.0019485788652673364 0.0011336763855069876 -66.54938507080078 -41.10423278808594 0.0005052614142186942 H 0.040404040404040414 H 0.06565656565656566 H 0.02525252525252525 H 0.045454545454545456 H 0.040404040404040414 H 0.040404040404040414 H 0.05555555555555555 H 0.05555555555555555 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.954559805511963e-06 8.397118325388437e-06 7.954559805511963e-06 8.397118325388437e-06 2 251428 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I44T MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0970485508441925 17.953981906175613 H 0.9972232580184937 6.319198291748762e-05 0.002713548950850964 H 0.0014666434144601224 0.9943345785140992 0.002220947528257966 2.362532904953696e-05 2.362875602557324e-05 0.0002643977932166308 0.0009317664080299436 0.0007344376645050943 -62.68268203735352 -41.571754455566406 0.00012051763769704849 H 0.1301775147928994 H 0.10650887573964496 H 0.17159763313609466 H 0.11834319526627217 H 0.1301775147928994 H 0.1242603550295858 H 0.1301775147928994 H 0.15976331360946747 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.065827426490827e-06 1.6174110131083497e-05 3.977119831688469e-06 9.763789116078587e-06 1 251438 6.975250016694189e-06 1.2894582607791652e-05 1.0 143364.0 aTt/aCt aTt/aCt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A45G MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.03313538432121277 3.651519352197647 H 0.9982447624206544 4.760867159347981e-05 0.0017076015938073395 H 0.001136023085564375 0.9945032596588136 0.0026887229178100824 8.277585038740654e-06 1.7708396626403555e-05 0.00018604162323754284 0.0010064415400847793 0.0004535915795713663 -63.10689163208008 -40.87462615966797 6.149523687781766e-05 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.018867924528301886 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.4026106351712802e-05 NA NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.4026106351712802e-05 2.0 143380.0 NA gCc/gGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA M46I MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.31044435501098633 62.11991543769835 H 0.998539924621582 1.6207706721615978e-05 0.0014438756043091414 H 0.0005344517412595451 0.9942016005516052 0.003960225731134415 3.78969639314164e-06 5.517436875379644e-06 0.00014995582750998435 0.0008207421051338315 0.00032367391395382583 -64.81626892089844 -43.33988571166992 0.00010217584349447859 H 0.03723404255319149 H 0.03723404255319149 H 0.026595744680851064 H 0.031914893617021274 H 0.031914893617021274 H 0.031914893617021274 H 0.03723404255319149 H 0.03723404255319149 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.954819920996671e-06 7.904526283711971e-06 7.954819920996671e-06 7.904526283711971e-06 2 251420 NA NA NA NA atG/atA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M46L MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.31044435501098633 62.11991543769835 H 0.998539924621582 1.6207706721615978e-05 0.0014438756043091414 H 0.0005344517412595451 0.9942016005516052 0.003960225731134415 3.78969639314164e-06 5.517436875379644e-06 0.00014995582750998435 0.0008207421051338315 0.00032367391395382583 -64.81626892089844 -43.33988571166992 0.00010217584349447859 H 0.03723404255319149 H 0.03723404255319149 H 0.026595744680851064 H 0.031914893617021274 H 0.031914893617021274 H 0.031914893617021274 H 0.03723404255319149 H 0.03723404255319149 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977409960498336e-06 7.90458529383608e-06 3.977409960498336e-06 7.90458529383608e-06 1 251420 NA NA NA NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A47E MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.19498410820960999 21.487248724699025 H 0.9987205862998962 1.2156385309936013e-05 0.001267189742065966 H 0.0005755623569712043 0.9926377534866332 0.005609847605228424 6.981850219744957e-06 3.5594634937297087e-06 0.00013138115173205733 0.0007552356109954418 0.0002796789922285825 -65.37348937988281 -43.45737075805664 0.00010288438352290541 H 0.009433962264150943 H 0.03773584905660377 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977790129283676e-06 8.884490631503603e-06 3.977790129283676e-06 8.884490631503603e-06 1 251396 NA NA NA NA gCg/gAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A47V MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.19498410820960999 21.487248724699025 H 0.9987205862998962 1.2156385309936013e-05 0.001267189742065966 H 0.0005755623569712043 0.9926377534866332 0.005609847605228424 6.981850219744957e-06 3.5594634937297087e-06 0.00013138115173205733 0.0007552356109954418 0.0002796789922285825 -65.37348937988281 -43.45737075805664 0.00010288438352290541 H 0.009433962264150943 H 0.03773584905660377 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 631682.0 VUS 1.0 3.977790129283676e-06 7.767155013364661e-06 3.977790129283676e-06 7.767155013364661e-06 1 251396 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F48I MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.1448478102684021 29.070955520868306 H 0.9983662962913512 4.1141076508210965e-05 0.0015925482148304582 H 0.0008609391516074537 0.992405116558075 0.004945348948240279 1.1401044503145386e-05 1.812467962736264e-05 0.0002197530266130343 0.0010940504726022482 0.0004452420689631254 -63.954307556152344 -41.7486686706543 0.00010695934179238976 H 0.015228426395939087 H 0.03553299492385787 H 0.005076142131979695 H 0.005076142131979695 H 0.005076142131979695 H 0.005076142131979695 H 0.005076142131979695 H 0.03553299492385787 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977530013798969e-06 7.934381755321776e-06 3.977530013798969e-06 7.934381755321776e-06 1 251412 NA NA NA NA Ttt/Att NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T54I MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.2882321774959564 39.97780301868915 H 0.9986752867698668 1.2186174899397885e-05 0.0013125678524374962 H 0.0009429549681954086 0.992077112197876 0.005515219643712044 3.230380116292508e-06 4.968424036633223e-06 0.00014598394045606256 0.0010264996672049165 0.00028410027152858675 -66.68461608886719 -43.13423156738281 6.649865827057508e-05 H 0.035211267605633804 H 0.056338028169014086 H 0.035211267605633804 H 0.028169014084507043 H 0.028169014084507043 H 0.028169014084507043 H 0.035211267605633804 H 0.08450704225352113 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.6880657618981142e-05 NA NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.6880657618981142e-05 2.0 143370.0 NA aCc/aTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V56I MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.06447917222976685 9.910448771715163 H 0.9949829578399658 0.00010214497160632165 0.004914885386824608 H 0.00683284644037485 0.9712716341018676 0.016114918515086174 3.8551774196093895e-05 5.157656050869264e-05 0.0005788651178590952 0.00391564704477787 0.0011958961840718985 -66.92632293701172 -39.95209503173828 0.0001928770798258484 H 0.13380281690140844 H 0.04929577464788732 H 0.1267605633802817 H 0.14084507042253522 H 0.09859154929577464 H 0.06338028169014084 H 0.07042253521126761 H 0.1619718309859155 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.980449946539012e-06 8.259331930884895e-06 3.980449946539012e-06 8.259331930884895e-06 1 251228 NA NA NA NA Gta/Ata NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q57P MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3006010055541992 53.68733959197998 H 0.9837740659713744 0.00031949111144058406 0.015906475484371185 H 0.011358389630913734 0.9489910006523132 0.022067220881581303 6.816654786234722e-05 0.00013746456534136092 0.0015198456821963187 0.01344556361436844 0.0024123459588736296 -68.04848480224611 -38.49568176269531 0.00024126294010784482 H 0.045454545454545456 H 0.05555555555555555 H 0.08585858585858586 H 0.09595959595959597 H 0.015151515151515154 H 0.010101010101010102 H 0.030303030303030307 H 0.03535353535353535 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17842.0 pathogenic 1.0 2.3886499548098072e-05 9.008510849157874e-06 2.3886499548098072e-05 9.008510849157874e-06 6 251188 NA NA NA NA cAg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A58G MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3341992199420929 36.828754037618644 H 0.9356029629707336 0.00039277441101148725 0.06400420516729355 H 0.02487192675471306 0.8767823576927185 0.03142065554857254 0.00017572315118741244 0.0001429108378943056 0.004913389682769775 0.055435355752706535 0.0062576602213084715 -71.2319107055664 -32.688751220703125 0.00050711864605546 H 0.018867924528301886 H 0.03773584905660377 H 0.02830188679245283 H 0.009433962264150943 H 0.04716981132075472 H 0.009433962264150943 H 0.009433962264150943 H 0.02830188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2674124398323574e-05 1.8768073985338225e-05 1.1945599908358416e-05 8.544477208619607e-06 3 251138 1.3950299944553988e-05 1.6710251654314172e-05 2.0 143366.0 gCt/gGt gCt/gGt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A58T MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3341992199420929 36.828754037618644 H 0.9356029629707336 0.00039277441101148725 0.06400420516729355 H 0.02487192675471306 0.8767823576927185 0.03142065554857254 0.00017572315118741244 0.0001429108378943056 0.004913389682769775 0.055435355752706535 0.0062576602213084715 -71.2319107055664 -32.688751220703125 0.00050711864605546 H 0.018867924528301886 H 0.03773584905660377 H 0.02830188679245283 H 0.009433962264150943 H 0.04716981132075472 H 0.009433962264150943 H 0.009433962264150943 H 0.02830188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.069556734045411e-06 1.7097790178592726e-05 3.9813999137550135e-06 8.331678017091283e-06 1 251168 6.97622999723535e-06 1.493042432118725e-05 1.0 143344.0 Gct/Act Gct/Act 0 0.0 NA NA NA NA NA NA I62K MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.21275657415390006 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.03534114733338356 0.6526034474372864 T 0.10517293214797974 0.2306262254714965 0.03851934894919395 0.023422721773386 0.019838588312268257 0.11801847815513612 0.2363144755363465 0.22808730602264404 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.0012253731256350875 H 0.20118343195266272 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.14201183431952666 H 0.14201183431952666 H 0.1242603550295858 H 0.13609467455621302 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.4558581497858315e-05 NA NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.4558581497858315e-05 2.0 143340.0 NA aTa/aAa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I62L MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.21275657415390006 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.03534114733338356 0.6526034474372864 T 0.10517293214797974 0.2306262254714965 0.03851934894919395 0.023422721773386 0.019838588312268257 0.11801847815513612 0.2363144755363465 0.22808730602264404 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.0012253731256350875 H 0.20118343195266272 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.14201183431952666 H 0.14201183431952666 H 0.1242603550295858 H 0.13609467455621302 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.983489932579687e-06 9.811795308238067e-06 3.983489932579687e-06 9.811795308238067e-06 1 251036 NA NA NA NA Ata/Cta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I62T MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.21275657415390006 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.03534114733338356 0.6526034474372864 T 0.10517293214797974 0.2306262254714965 0.03851934894919395 0.023422721773386 0.019838588312268257 0.11801847815513612 0.2363144755363465 0.22808730602264404 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.0012253731256350875 H 0.20118343195266272 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.14201183431952666 H 0.14201183431952666 H 0.1242603550295858 H 0.13609467455621302 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.984639988630079e-06 7.793282343690924e-06 3.984639988630079e-06 7.793282343690924e-06 1 250964 NA NA NA NA aTa/aCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S63N MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.07536107301712036 8.832317757606507 C 0.1601838618516922 0.017231827601790428 0.822584331035614 C 0.04002157226204872 0.13252224028110504 0.006332830525934696 0.03677767142653465 0.006104889325797558 0.18120868504047394 0.2498137205839157 0.34721839427948 -92.1742172241211 55.02476119995117 0.0011368830455467105 H 0.09230769230769233 H 0.08461538461538462 H 0.12307692307692307 H 0.08461538461538462 H 0.09230769230769233 H 0.1153846153846154 H 0.07692307692307693 H 0.12307692307692307 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.072591588821488e-06 1.7651650663109828e-05 3.98539987145341e-06 8.944903873867593e-06 1 250916 6.97545010552858e-06 1.521740667195742e-05 1.0 143360.0 aGc/aAc aGc/aAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA S63R MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.07536107301712036 8.832317757606507 C 0.1601838618516922 0.017231827601790428 0.822584331035614 C 0.04002157226204872 0.13252224028110504 0.006332830525934696 0.03677767142653465 0.006104889325797558 0.18120868504047394 0.2498137205839157 0.34721839427948 -92.1742172241211 55.02476119995117 0.0011368830455467105 H 0.09230769230769233 H 0.08461538461538462 H 0.12307692307692307 H 0.08461538461538462 H 0.09230769230769233 H 0.1153846153846154 H 0.07692307692307693 H 0.12307692307692307 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.988070147897815e-06 8.729341724355145e-06 3.988070147897815e-06 8.729341724355145e-06 1 250748 NA NA NA NA agC/agA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G64R MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.06069844961166384 4.776967984437943 C 0.07698854804039001 0.004148537293076515 0.9188628792762756 C 0.04568153992295265 0.03705026581883431 0.007927217520773409 0.004119140561670065 0.0027801201213151217 0.2016424685716629 0.32239824533462524 0.378400981426239 50.53944396972656 -3.9354500770568848 0.00014252503751777112 - 0.5714285714285714 - 0.6071428571428571 - 0.5476190476190477 - 0.5119047619047619 - 0.4761904761904762 - 0.5357142857142857 - 0.4761904761904762 - 0.5238095238095238 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17830.0 pathogenic 1.0 1.594360037415754e-05 9.376426689367732e-06 1.594360037415754e-05 9.376426689367732e-06 4 250884 NA NA NA NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A65P MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.021529942750930783 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.011650342494249344 0.8499643206596375 C 0.12814448773860931 0.05535627156496048 0.010305121541023254 0.013567625544965269 0.0068668094463646395 0.14003275334835052 0.25274938344955444 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.000125826321891509 - 0.04716981132075472 - 0.10377358490566037 - 0.05660377358490566 - 0.08490566037735849 - 0.07547169811320754 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.08490566037735849 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.985309821378905e-06 8.921940127697755e-06 7.985309821378905e-06 8.921940127697755e-06 2 250460 NA NA NA NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A65T MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.021529942750930783 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.011650342494249344 0.8499643206596375 C 0.12814448773860931 0.05535627156496048 0.010305121541023254 0.013567625544965269 0.0068668094463646395 0.14003275334835052 0.25274938344955444 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.000125826321891509 - 0.04716981132075472 - 0.10377358490566037 - 0.05660377358490566 - 0.08490566037735849 - 0.07547169811320754 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.08490566037735849 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.078461284860142e-06 1.6336170019690164e-05 3.992649908468593e-06 7.978550980861824e-06 1 250460 6.97545010552858e-06 1.42552858672849e-05 1.0 143360.0 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A65V MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.021529942750930783 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.011650342494249344 0.8499643206596375 C 0.12814448773860931 0.05535627156496048 0.010305121541023254 0.013567625544965269 0.0068668094463646395 0.14003275334835052 0.25274938344955444 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.000125826321891509 - 0.04716981132075472 - 0.10377358490566037 - 0.05660377358490566 - 0.08490566037735849 - 0.07547169811320754 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.08490566037735849 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.611921526606339e-05 NA NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.611921526606339e-05 1.0 143348.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA H66Y MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.061396718025207526 11.168063008785248 C 0.0916256308555603 0.0932324156165123 0.8151419758796692 C 0.09217734634876253 0.04338179528713226 0.00951554160565138 0.11198735237121582 0.04467310383915901 0.15919135510921478 0.23062999546527865 0.308443546295166 -92.96077728271484 27.69938087463379 0.00040533530409447854 - 0.15217391304347827 - 0.16304347826086954 - 0.15217391304347827 - 0.15217391304347827 - 0.21739130434782608 - 0.10869565217391304 - 0.08695652173913042 - 0.14673913043478262 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.989910055679502e-06 8.895915802703407e-06 3.989910055679502e-06 8.895915802703407e-06 1 250632 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V71L MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.03488868474960327 5.362390846014024 H 0.99749493598938 0.00020636094268411398 0.0022987364791333675 H 0.002387818647548557 0.9908638596534728 0.004137437790632248 6.466417835326865e-05 9.066353959497064e-05 0.0002770673600025475 0.0016012523556128144 0.0005771871656179428 -65.30359649658203 -41.45535278320313 2.7263995434623208e-05 H 0.02112676056338028 H 0.04929577464788732 H 0.056338028169014086 H 0.056338028169014086 H 0.035211267605633804 H 0.04929577464788732 H 0.04225352112676056 H 0.028169014084507043 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5252508636044674e-05 NA NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5252508636044674e-05 1.0 143366.0 NA Gtg/Ctg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V71M MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.03488868474960327 5.362390846014024 H 0.99749493598938 0.00020636094268411398 0.0022987364791333675 H 0.002387818647548557 0.9908638596534728 0.004137437790632248 6.466417835326865e-05 9.066353959497064e-05 0.0002770673600025475 0.0016012523556128144 0.0005771871656179428 -65.30359649658203 -41.45535278320313 2.7263995434623208e-05 H 0.02112676056338028 H 0.04929577464788732 H 0.056338028169014086 H 0.056338028169014086 H 0.035211267605633804 H 0.04929577464788732 H 0.04225352112676056 H 0.028169014084507043 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 446860.0 pathogenic 2.0 1.015341189217798e-05 1.7707198572148543e-05 7.981159797054715e-06 8.206923886380305e-06 2 250590 1.3950299944553988e-05 1.5690483791032694e-05 2.0 143366.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA C75G MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.02322205901145935 3.260377085208893 H 0.998538374900818 5.077041714685038e-05 0.0014108194736763835 H 0.004836141131818295 0.9846280813217164 0.008245852775871755 1.060665545082884e-05 2.3632106604054567e-05 0.00013617963122669607 0.0018733032047748566 0.0002461789408698678 -66.01241302490234 -39.3445930480957 9.324702659796458e-06 H 0.05925925925925926 H 0.11851851851851852 H 0.1851851851851852 H 0.037037037037037035 H 0.1037037037037037 H 0.037037037037037035 H 0.1111111111111111 H 0.05185185185185185 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 35693.0 pathogenic 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA C75Y MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.02322205901145935 3.260377085208893 H 0.998538374900818 5.077041714685038e-05 0.0014108194736763835 H 0.004836141131818295 0.9846280813217164 0.008245852775871755 1.060665545082884e-05 2.3632106604054567e-05 0.00013617963122669607 0.0018733032047748566 0.0002461789408698678 -66.01241302490234 -39.3445930480957 9.324702659796458e-06 H 0.05925925925925926 H 0.11851851851851852 H 0.1851851851851852 H 0.037037037037037035 H 0.1037037037037037 H 0.037037037037037035 H 0.1111111111111111 H 0.05185185185185185 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952299923403185e-05 1.5027573363571524e-05 NA NA NA NA 1.3952299923403185e-05 1.5027573363571524e-05 2.0 143346.0 NA tGc/tAc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA G78S MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.19505959749221802 15.351190322637555 C 0.3511357605457306 0.00048069693730212753 0.6483835577964783 T 0.012532715685665607 0.3631823360919952 0.008284221403300762 0.00035968358861282473 5.058897295384668e-05 0.02307459339499474 0.5813400745391846 0.011175804771482944 -86.72986602783203 -3.2789108753204346 0.0004988624132238328 T 0.2380952380952381 S 0.25 H 0.25 S 0.19047619047619047 S 0.08333333333333333 T 0.5714285714285714 T 0.11904761904761905 H 0.4166666666666667 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2862815868513525e-05 1.688840981614202e-05 1.9976299881818704e-05 8.88608708879221e-06 5 250296 2.790260077745188e-05 1.4361610020062601e-05 4.0 143356.0 Ggc/Agc Ggc/Agc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V81A MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.10293340682983396 15.820864629745483 C 0.001387678668834269 0.02831544913351536 0.9702968001365662 C 0.000265222362941131 0.0006461227894760668 3.3452910429332405e-05 0.012706963345408441 0.014186857268214226 0.4731590747833252 0.004340052139014007 0.4946623742580414 -110.71260833740234 142.57656860351562 0.0006687848945148289 S 0.8098591549295775 - 0.2112676056338028 - 0.16901408450704225 - 0.2323943661971831 - 0.3591549295774648 - 0.14788732394366194 S 0.18309859154929575 - 0.17605633802816897 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.998749889433384e-06 8.638746983690975e-06 3.998749889433384e-06 8.638746983690975e-06 1 250078 NA NA NA NA gTc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V81I MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.10293340682983396 15.820864629745483 C 0.001387678668834269 0.02831544913351536 0.9702968001365662 C 0.000265222362941131 0.0006461227894760668 3.3452910429332405e-05 0.012706963345408441 0.014186857268214226 0.4731590747833252 0.004340052139014007 0.4946623742580414 -110.71260833740234 142.57656860351562 0.0006687848945148289 S 0.8098591549295775 - 0.2112676056338028 - 0.16901408450704225 - 0.2323943661971831 - 0.3591549295774648 - 0.14788732394366194 S 0.18309859154929575 - 0.17605633802816897 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.778471870894975e-05 1.9861577895639154e-05 2.397599928372074e-05 8.893172745773189e-06 6 250250 6.976129952818155e-06 1.7759328675892533e-05 1.0 143346.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA S82F MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4361588954925537 51.117822551727286 C 0.002402038546279073 0.004567538853734732 0.9930304884910583 C 8.585441537434235e-05 0.0008052269113250077 2.2476519916381213e-06 0.0009854581439867618 0.0014558850089088082 0.006299381610006094 0.0005690045654773713 0.9897969365119934 -75.8786849975586 155.40113830566406 0.0005986459436826407 S 0.7307692307692307 - 0.5 - 0.476923076923077 - 0.4307692307692308 - 0.5538461538461539 - 0.476923076923077 - 0.3461538461538461 - 0.3230769230769231 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.997220119345002e-06 8.740949637851256e-06 3.997220119345002e-06 8.740949637851256e-06 1 250174 NA NA NA NA tCc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V83I MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.7032608985900879 108.09120011329651 H 0.8941864371299744 0.00022060982882976532 0.10559292137622832 H 0.03875147551298142 0.8637351393699646 0.0005028943414799869 7.172151526901871e-05 9.53267008299008e-05 0.014729210175573826 0.0665324255824089 0.015581771731376646 -60.51805114746094 -36.99993515014648 0.0006998094613663852 - 0.2887323943661972 H 0.7746478873239436 H 0.7816901408450704 H 0.7957746478873241 H 0.7605633802816901 H 0.8239436619718309 H 0.7887323943661971 H 0.8309859154929577 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 9.149996367174009e-05 1.797020145170373e-05 0.00011595799878705293 8.421373294705739e-06 29 250090 4.883079964201898e-05 1.58747791180234e-05 7.0 143352.0 Gtt/Att Gtt/Att 0 0.0 NA NA NA NA NA NA L84R MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.6594114899635315 120.7382438123226 H 0.9282002449035645 0.000378924363758415 0.07142077386379242 H 0.10203325748443604 0.7994551658630371 0.0012451909715309741 0.0002192303072661161 0.00017161156574729833 0.010506038554012777 0.07614480704069138 0.010224670171737673 -65.10060119628906 -33.09945297241211 0.0004901985521428287 H 0.7073170731707317 H 0.5609756097560976 H 0.5914634146341463 H 0.5853658536585366 H 0.5853658536585366 H 0.5914634146341463 H 0.4146341463414634 H 0.5060975609756098 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0001300476433235e-06 9.077324250116555e-06 4.0001300476433235e-06 9.077324250116555e-06 1 249992 NA NA NA NA cTc/cGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R85Q MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1952514052391052 44.712571799755096 H 0.9611335992813108 0.00022644105774816128 0.03864000737667084 H 0.13204726576805115 0.8121097683906555 0.001915222266688943 0.00015441498544532806 8.627500938018784e-05 0.00476467702537775 0.03842401131987572 0.01049841195344925 -72.2690658569336 -30.41126823425293 0.0005379659123718739 H 0.3588709677419355 H 0.2298387096774193 H 0.2983870967741936 H 0.33064516129032256 H 0.3387096774193548 H 0.2983870967741936 H 0.2056451612903226 H 0.3064516129032258 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.0928700905642472e-05 1.3607854974771021e-05 NA NA NA NA 2.0928700905642472e-05 1.3607854974771021e-05 3.0 143344.0 NA cGa/cAa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A86T MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0538882315158844 5.938483113050461 H 0.994504988193512 8.551801329303999e-06 0.005486416630446911 H 0.0015700727235525846 0.9933846592903136 0.0010746207553893328 2.429753521937528e-06 2.1592711618723115e-06 0.0007259122212417424 0.0021309140138328075 0.0011092436034232378 -60.69098663330078 -42.83027267456055 3.200368882971816e-05 H 0.018867924528301886 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.08490566037735849 H 0.0660377358490566 H 0.04716981132075472 H 0.09433962264150944 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.001470188086387e-06 8.833567107905292e-06 4.001470188086387e-06 8.833567107905292e-06 1 249908 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A86V MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0538882315158844 5.938483113050461 H 0.994504988193512 8.551801329303999e-06 0.005486416630446911 H 0.0015700727235525846 0.9933846592903136 0.0010746207553893328 2.429753521937528e-06 2.1592711618723115e-06 0.0007259122212417424 0.0021309140138328075 0.0011092436034232378 -60.69098663330078 -42.83027267456055 3.200368882971816e-05 H 0.018867924528301886 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.08490566037735849 H 0.0660377358490566 H 0.04716981132075472 H 0.09433962264150944 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.005059963674285e-06 9.5630816644343e-06 4.005059963674285e-06 9.5630816644343e-06 1 249684 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A87T MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.5491927266120911 60.521038472652435 H 0.9940509200096128 1.975163831957616e-05 0.005929265171289444 H 0.0017463972326368091 0.9871686697006226 0.004663285799324513 1.0814656889124308e-05 5.30496936335112e-06 0.0006510002422146499 0.004897583741694689 0.0008569069905206561 -64.16121673583984 -42.17277145385742 9.705143747851253e-05 H 0.5471698113207547 H 0.5283018867924528 H 0.5660377358490566 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 H 0.5471698113207547 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.202139992528828e-05 8.373896025359967e-06 1.202139992528828e-05 8.373896025359967e-06 3 249554 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A87V MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.5491927266120911 60.521038472652435 H 0.9940509200096128 1.975163831957616e-05 0.005929265171289444 H 0.0017463972326368091 0.9871686697006226 0.004663285799324513 1.0814656889124308e-05 5.30496936335112e-06 0.0006510002422146499 0.004897583741694689 0.0008569069905206561 -64.16121673583984 -42.17277145385742 9.705143747851253e-05 H 0.5471698113207547 H 0.5283018867924528 H 0.5660377358490566 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 H 0.5471698113207547 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6942193711504412e-05 NA NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6942193711504412e-05 1.0 143362.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA F88V MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.32188600301742554 64.60252080559731 H 0.996920108795166 1.235231957252836e-05 0.00306756142526865 H 0.002271863631904125 0.9894101619720459 0.0051711369305849075 1.1267301488260273e-05 4.112760052521479e-06 0.0003587972605600953 0.0022164429537951946 0.0005563298473134637 -64.19858551025389 -40.2968978881836 7.948389975354074e-05 H 0.5736040609137056 H 0.5126903553299492 H 0.5380710659898477 H 0.5126903553299492 H 0.4923857868020304 H 0.5025380710659898 H 0.4010152284263959 H 0.5025380710659898 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.601999974809587e-05 7.882262296022613e-06 1.601999974809587e-05 7.882262296022613e-06 4 249688 NA NA NA NA Ttc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y89N MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.021866649389266968 4.672902974486352 H 0.9996685981750488 5.6059820963127996e-06 0.0003257931675761938 H 0.0003947716031689197 0.9970116615295408 0.002194469561800361 1.493279683018045e-06 1.769451728250715e-06 3.878449933836237e-05 0.00027845590375363827 7.85713127697818e-05 -62.38782119750977 -42.10335159301758 1.3475183550326621e-05 H 0.040540540540540536 H 0.03153153153153153 H 0.022522522522522518 H 0.009009009009009007 H 0.022522522522522518 H 0.009009009009009007 H 0.009009009009009007 H 0.036036036036036036 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.6497680558874807e-05 NA NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.6497680558874807e-05 1.0 143350.0 NA Tac/Aac NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V90A MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1912584900856018 29.396429926156998 H 0.9997454285621644 7.144911364775908e-07 0.00025379902217537165 H 8.197478018701077e-05 0.9969373941421508 0.002766605466604233 1.13172390570071e-07 1.424725297738405e-07 1.5426008758367967e-05 0.0001588545273989439 3.94130329368636e-05 -61.89892578125 -43.1649169921875 4.535486823442625e-06 H 0.2746478873239437 H 0.29577464788732394 H 0.22535211267605634 H 0.2535211267605634 H 0.24647887323943665 H 0.2535211267605634 H 0.24647887323943665 H 0.2746478873239437 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.031350262172053e-06 9.967012147097504e-06 8.031350262172053e-06 9.967012147097504e-06 2 249024 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V90M MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1912584900856018 29.396429926156998 H 0.9997454285621644 7.144911364775908e-07 0.00025379902217537165 H 8.197478018701077e-05 0.9969373941421508 0.002766605466604233 1.13172390570071e-07 1.424725297738405e-07 1.5426008758367967e-05 0.0001588545273989439 3.94130329368636e-05 -61.89892578125 -43.1649169921875 4.535486823442625e-06 H 0.2746478873239437 H 0.29577464788732394 H 0.22535211267605634 H 0.2535211267605634 H 0.24647887323943665 H 0.2535211267605634 H 0.24647887323943665 H 0.2746478873239437 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.274184786106306e-05 1.7429401088561546e-05 1.6060399502748623e-05 9.316220244259818e-06 4 249060 6.976029908400959e-06 1.4730650449535282e-05 1.0 143348.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A92V MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.04796120524406433 5.28532481789589 H 0.999112904071808 1.8186893839811093e-06 0.0008852623868733644 H 0.0004081553197465837 0.9933969974517822 0.005254543386399746 1.7942570593731946e-06 4.502327044519915e-07 8.117261313600466e-05 0.0007102338131517173 0.00014666157949250194 -63.32688522338867 -41.21318054199219 1.2170487025287002e-05 H 0.07547169811320754 H 0.11320754716981132 H 0.11320754716981132 H 0.05660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.04716981132075472 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.027740033052396e-06 9.50121029515061e-06 4.027740033052396e-06 9.50121029515061e-06 1 248278 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q93* MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 446861.0 pathogenic 2.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V98L MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.3557476103305817 54.6784077078104 H 0.999352753162384 6.938635124242865e-06 0.0006402878207154572 H 0.0003463790053501725 0.9924384951591492 0.006548541598021984 1.3024844065512298e-06 1.9194496871932643e-06 4.981573147233576e-05 0.0005156763945706189 9.797739039640874e-05 -64.57452392578125 -44.732181549072266 2.9486176572390832e-05 H 0.3591549295774648 H 0.2887323943661972 H 0.30985915492957744 H 0.2887323943661972 H 0.2676056338028169 H 0.2605633802816901 H 0.2676056338028169 H 0.3380281690140845 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.8199207671666246e-05 1.7674867486265117e-05 2.4318900614161976e-05 9.170601579130381e-06 6 246722 3.4877200960181653e-05 1.5109632931804902e-05 5.0 143360.0 Gtg/Ttg Gtg/Ttg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V98M MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.3557476103305817 54.6784077078104 H 0.999352753162384 6.938635124242865e-06 0.0006402878207154572 H 0.0003463790053501725 0.9924384951591492 0.006548541598021984 1.3024844065512298e-06 1.9194496871932643e-06 4.981573147233576e-05 0.0005156763945706189 9.797739039640874e-05 -64.57452392578125 -44.732181549072266 2.9486176572390832e-05 H 0.3591549295774648 H 0.2887323943661972 H 0.30985915492957744 H 0.2887323943661972 H 0.2676056338028169 H 0.2605633802816901 H 0.2676056338028169 H 0.3380281690140845 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.7944931863712577e-05 1.808528988286522e-05 2.0265699276933447e-05 8.553010676909175e-06 5 246722 1.395090021105716e-05 1.5934984107552312e-05 2.0 143360.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G100R MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0056621134281158465 0.44560832679271706 H 0.9994677901268004 3.2196787742577726e-06 0.0005290133995003998 H 0.0007633424829691647 0.99375182390213 0.0049317306838929644 2.2609756342717446e-06 9.723241873871302e-07 7.328772335313259e-05 0.0003240876831114292 0.00015241223445627836 -64.22560882568361 -45.10423278808594 1.4347830983751919e-05 H 0.0 H 0.023809523809523808 H 0.011904761904761904 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.064880158693995e-06 8.473587104964935e-06 4.064880158693995e-06 8.473587104964935e-06 1 246010 NA NA NA NA Gga/Aga NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G100V MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0056621134281158465 0.44560832679271706 H 0.9994677901268004 3.2196787742577726e-06 0.0005290133995003998 H 0.0007633424829691647 0.99375182390213 0.0049317306838929644 2.2609756342717446e-06 9.723241873871302e-07 7.328772335313259e-05 0.0003240876831114292 0.00015241223445627836 -64.22560882568361 -45.10423278808594 1.4347830983751919e-05 H 0.0 H 0.023809523809523808 H 0.011904761904761904 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.1340500853497295e-06 1.7154673960534054e-05 4.061670097144088e-06 9.33353112612828e-06 1 246204 6.97583982400829e-06 1.4393333019485785e-05 1.0 143352.0 gGa/gTa gGa/gTa 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A101T MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.036226511001586914 3.992161512374878 H 0.9989157915115356 1.0959088285744656e-05 0.0010732157388702037 H 0.0010091647272929554 0.9963653087615968 0.0015567064983770251 2.6424461339047407e-06 3.3328392419207375e-06 0.0001078774148481898 0.0007658538524992764 0.00018910141079686585 -63.97304916381836 -41.54487228393555 9.586517080606427e-06 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.5783762626051964e-05 NA NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.5783762626051964e-05 1.0 143342.0 NA Gcc/Acc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A102S MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.366277813911438 40.36381509304047 H 0.9970589876174928 4.675425225286745e-05 0.0028943438082933426 H 0.0021296206396073107 0.9884200096130372 0.0063661481253802785 1.1098311915702652e-05 1.7637830751482394e-05 0.00032930710585787887 0.0022656735964119434 0.00046050894889049227 -64.80665588378906 -43.24689102172852 9.368735481984912e-05 H 0.4245283018867925 H 0.5 H 0.3867924528301887 H 0.4339622641509434 H 0.4056603773584906 H 0.4245283018867925 H 0.4245283018867925 H 0.330188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.715412502149702e-06 1.7079348211084828e-05 8.147099833877292e-06 7.508234746826863e-06 2 245486 6.976129952818155e-06 1.534048715986648e-05 1.0 143346.0 Gct/Tct Gct/Tct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A102T MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.366277813911438 40.36381509304047 H 0.9970589876174928 4.675425225286745e-05 0.0028943438082933426 H 0.0021296206396073107 0.9884200096130372 0.0063661481253802785 1.1098311915702652e-05 1.7637830751482394e-05 0.00032930710585787887 0.0022656735964119434 0.00046050894889049227 -64.80665588378906 -43.24689102172852 9.368735481984912e-05 H 0.4245283018867925 H 0.5 H 0.3867924528301887 H 0.4339622641509434 H 0.4056603773584906 H 0.4245283018867925 H 0.4245283018867925 H 0.330188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.0367799152154475e-05 8.980753317328065e-06 2.0367799152154475e-05 8.980753317328065e-06 5 245486 NA NA NA NA Gct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I107L MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.4338504374027252 80.26233091950418 H 0.8256223797798157 0.0006217522895894946 0.1737559139728546 H 0.023691875860095024 0.7962691783905029 0.02004782110452652 0.00018788081069942564 0.0001703122688923031 0.02444358728826046 0.1234886422753334 0.011700809933245182 -84.61035919189453 -28.457500457763672 0.004405223298817873 H 0.04142011834319527 S 0.017751479289940832 H 0.02366863905325444 H 0.0 T 0.017751479289940832 H 0.0 H 0.0 H 0.02366863905325444 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.633159990888089e-05 9.672993240973683e-06 1.633159990888089e-05 9.672993240973683e-06 4 244924 NA NA NA NA Atc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I107T MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.4338504374027252 80.26233091950418 H 0.8256223797798157 0.0006217522895894946 0.1737559139728546 H 0.023691875860095024 0.7962691783905029 0.02004782110452652 0.00018788081069942564 0.0001703122688923031 0.02444358728826046 0.1234886422753334 0.011700809933245182 -84.61035919189453 -28.457500457763672 0.004405223298817873 H 0.04142011834319527 S 0.017751479289940832 H 0.02366863905325444 H 0.0 T 0.017751479289940832 H 0.0 H 0.0 H 0.02366863905325444 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0859399632608975e-06 9.844675302469173e-06 4.0859399632608975e-06 9.844675302469173e-06 1 244742 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T108M MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1954040229320526 27.10253798067569 C 0.02450009062886238 0.005088991951197386 0.9704110026359558 S 0.002167444908991456 0.013048101216554642 0.0008116451208479702 0.0038990501780062905 0.0012670343276113276 0.6350706815719604 0.017120486125350002 0.32661548256874084 -117.8056411743164 112.75415802001952 0.006408765912055968 S 0.14084507042253522 - 0.2887323943661972 S 0.028169014084507043 S 0.0 S 0.0 S 0.0 S 0.0 S 0.056338028169014086 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.201969649235252e-06 9.513325411076398e-06 8.201969649235252e-06 9.513325411076398e-06 2 243844 NA NA NA NA aCg/aTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P109T MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.437157928943634 62.03271011710167 C 0.30759042501449585 0.004063119180500507 0.6883464455604553 C 0.18178361654281616 0.11891811341047287 0.0013620000099763276 0.002178818685933948 0.0024425475858151913 0.07486561685800552 0.1785285472869873 0.4399207234382629 -63.55710220336914 -23.92159080505371 0.01060550007969141 - 0.13970588235294118 - 0.4558823529411765 - 0.1323529411764706 - 0.09558823529411764 - 0.08088235294117647 - 0.08088235294117647 - 0.10294117647058824 - 0.08088235294117647 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.3868085738242584e-05 NA NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.3868085738242584e-05 1.0 143330.0 NA Cca/Aca NA 0.0 NA NA NA NA NA NA D111G MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5999798178672789 86.4570917546749 C 0.4754892289638519 0.008445081301033497 0.5160657167434692 G 0.3286459743976593 0.17013317346572876 0.0013143857941031456 0.002554174279794097 0.004810517653822899 0.06968037784099579 0.2626611590385437 0.16020020842552185 -85.3284683227539 -2.5049304962158203 0.009890860877931118 S 0.6441717791411042 NA NA T 0.7423312883435583 H 0.8527607361963192 H 0.7484662576687117 H 1.0 H 0.9263803680981596 S 0.7914110429447853 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4197110007772238e-05 NA NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4197110007772238e-05 1.0 143334.0 NA gAc/gGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I112N MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA b 0.14935192465782166 27.63010606169701 C 0.22178314626216888 0.08145080506801605 0.6967660784721375 C 0.11626157909631728 0.10110826790332794 0.002483907854184509 0.031871836632490165 0.049397148191928864 0.1204897239804268 0.0828612893819809 0.4955262839794159 -88.54808807373047 92.92927551269531 0.025429228320717808 S 0.20710059171597636 NA NA T 0.02366863905325444 H 0.04733727810650888 H 0.0650887573964497 H 0.15384615384615385 H 0.05325443786982249 S 0.11834319526627217 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.618368969561673e-05 NA NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.618368969561673e-05 1.0 143288.0 NA aTc/aAc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R113C MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5485734939575195 125.62333011627196 C 0.1185976341366768 0.1098562553524971 0.7715461850166321 C 0.046732727438211434 0.07497922331094742 0.002686783205717802 0.028566140681505207 0.08172228187322618 0.07573691755533217 0.1361318677663803 0.5534440279006958 -95.2447509765625 116.56314849853516 0.0151455020532012 - 0.4112903225806452 NA NA - 0.2379032258064516 H 0.2661290322580645 H 0.1935483870967742 H 0.2338709677419355 H 0.2258064516129032 - 0.08064516129032258 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 1.0400050805869472e-05 1.7149791388429894e-05 1.2433500160113907e-05 8.981752441090908e-06 3 241284 6.9769098445249256e-06 1.460970457448137e-05 1.0 143330.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R113H MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5485734939575195 125.62333011627196 C 0.1185976341366768 0.1098562553524971 0.7715461850166321 C 0.046732727438211434 0.07497922331094742 0.002686783205717802 0.028566140681505207 0.08172228187322618 0.07573691755533217 0.1361318677663803 0.5534440279006958 -95.2447509765625 116.56314849853516 0.0151455020532012 - 0.4112903225806452 NA NA - 0.2379032258064516 H 0.2661290322580645 H 0.1935483870967742 H 0.2338709677419355 H 0.2258064516129032 - 0.08064516129032258 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 2.864836014863529e-05 1.7188812563954814e-05 2.493429929018021e-05 9.045478264584615e-06 6 240632 3.4883600164903335e-05 1.4616244398739994e-05 5.0 143334.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G114R MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4451961517333984 35.036937141418456 C 0.36311328411102295 0.02514277771115303 0.6117439270019531 T 0.14049454033374786 0.1568419635295868 0.010103926993906498 0.005669338162988424 0.015213366597890854 0.2331550270318985 0.32130125164985657 0.11722051352262496 -23.916337966918945 -75.75531005859375 0.009521491825580595 T 0.4880952380952381 NA NA S 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6428571428571429 T 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6666666666666666 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 9.374035152585761e-05 1.7261368915799652e-05 8.308480028063059e-05 8.202910401343551e-06 20 240718 0.00011163699673488735 1.5187729184932955e-05 16.0 143322.0 Ggg/Agg Ggg/Agg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G114V MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4451961517333984 35.036937141418456 C 0.36311328411102295 0.02514277771115303 0.6117439270019531 T 0.14049454033374786 0.1568419635295868 0.010103926993906498 0.005669338162988424 0.015213366597890854 0.2331550270318985 0.32130125164985657 0.11722051352262496 -23.916337966918945 -75.75531005859375 0.009521491825580595 T 0.4880952380952381 NA NA S 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6428571428571429 T 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6666666666666666 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 4.153199824941112e-06 9.773588943208017e-06 4.153199824941112e-06 9.773588943208017e-06 1 240778 NA NA NA NA gGg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A120G MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.21221259236335754 23.385827678442002 C 0.11929734796285628 0.1938553601503372 0.6868473291397095 C 0.044613979756832116 0.04734375700354576 0.002150169340893626 0.03083009645342827 0.15087823569774628 0.1698434203863144 0.07377243787050247 0.4805678725242615 -91.33057403564452 118.29200744628906 0.0073816985823214045 - 0.29245283018867924 - 0.3962264150943397 - 0.2075471698113208 - 0.2735849056603773 - 0.2735849056603773 - 0.4245283018867925 - 0.4339622641509434 - 0.3584905660377358 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.75 0.0 0.0 0.75 0.0 359C>G L121H MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.22703871130943296 41.57078804075718 C 0.06342712044715881 0.1755904108285904 0.7609824538230896 C 0.024285260587930683 0.028629139065742493 0.0010676769306883216 0.06013557687401772 0.1081530749797821 0.14641937613487244 0.06843440979719162 0.562875509262085 -86.9638442993164 126.4272232055664 0.011017887853085995 - 0.2682926829268293 - 0.2378048780487805 - 0.25 - 0.2621951219512195 - 0.2865853658536585 - 0.29878048780487804 - 0.2804878048780488 - 0.4329268292682927 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 362T>A L121R MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.22703871130943296 41.57078804075718 C 0.06342712044715881 0.1755904108285904 0.7609824538230896 C 0.024285260587930683 0.028629139065742493 0.0010676769306883216 0.06013557687401772 0.1081530749797821 0.14641937613487244 0.06843440979719162 0.562875509262085 -86.9638442993164 126.4272232055664 0.011017887853085995 - 0.2682926829268293 - 0.2378048780487805 - 0.25 - 0.2621951219512195 - 0.2865853658536585 - 0.29878048780487804 - 0.2804878048780488 - 0.4329268292682927 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 362T>G S122C MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3109332621097565 36.44137831926346 C 0.028879335150122643 0.10245270282030106 0.8686679005622864 C 0.014555496163666247 0.010693144053220749 0.0005169872893020512 0.02342027984559536 0.06965173035860063 0.11461491882801055 0.047896996140480035 0.7186504602432251 -101.20709991455078 154.5799560546875 0.015301158651709557 - 0.3769230769230769 S 0.8307692307692308 - 0.4538461538461538 - 0.3384615384615385 - 0.2692307692307692 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.143089881836204e-06 9.497522564229573e-06 4.143089881836204e-06 9.497522564229573e-06 1 241366 NA NA NA NA Agc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S122R MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3109332621097565 36.44137831926346 C 0.028879335150122643 0.10245270282030106 0.8686679005622864 C 0.014555496163666247 0.010693144053220749 0.0005169872893020512 0.02342027984559536 0.06965173035860063 0.11461491882801055 0.047896996140480035 0.7186504602432251 -101.20709991455078 154.5799560546875 0.015301158651709557 - 0.3769230769230769 S 0.8307692307692308 - 0.4538461538461538 - 0.3384615384615385 - 0.2692307692307692 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.27 0.0 0.0 0.0 366C>G N123S MIP NA NA Extracellular|2 NA N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|1 NA NA NA NA NA e 0.7294129133224487 106.7860505104065 C 0.01864549517631531 0.003794143442064524 0.9775604009628296 T 0.009777307510375977 0.0047694616951048366 7.500276115024462e-05 0.0003183116496074945 0.0015819929540157318 0.16259898245334625 0.7754347324371338 0.04544421285390854 -68.07376861572266 -17.200599670410153 0.011925222352147102 S 0.22929936305732485 S 0.4012738853503185 S 0.4777070063694268 T 0.2547770700636943 T 0.1592356687898089 T 0.2802547770700637 T 0.2547770700636943 S 0.4203821656050956 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.01 0.0 0.0 368A>G T125A MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.14610552787780762 20.264836716651914 C 0.021042536944150925 0.09163717180490494 0.8873202800750732 C 0.004877878818660975 0.012715571559965607 0.00015207160322461277 0.02277008630335331 0.057995166629552834 0.28475531935691833 0.013568168506026268 0.6031657457351685 -90.85462188720705 141.9168243408203 0.0028833476826548576 - 0.035211267605633804 S 0.3591549295774648 - 0.2746478873239437 - 0.04929577464788732 - 0.04225352112676056 - 0.04929577464788732 - 0.04929577464788732 - 0.13380281690140844 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.136709776503267e-06 9.868448293422667e-06 4.136709776503267e-06 9.868448293422667e-06 1 241738 NA NA NA NA Acg/Gcg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T125M MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.14610552787780762 20.264836716651914 C 0.021042536944150925 0.09163717180490494 0.8873202800750732 C 0.004877878818660975 0.012715571559965607 0.00015207160322461277 0.02277008630335331 0.057995166629552834 0.28475531935691833 0.013568168506026268 0.6031657457351685 -90.85462188720705 141.9168243408203 0.0028833476826548576 - 0.035211267605633804 S 0.3591549295774648 - 0.2746478873239437 - 0.04929577464788732 - 0.04225352112676056 - 0.04929577464788732 - 0.04929577464788732 - 0.13380281690140844 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17837.0 pathogenic 1.0 1.2986288952432393e-05 1.803484692118753e-05 8.274450010503642e-06 9.96455098305338e-06 2 241708 2.093309922202025e-05 1.5032079935151932e-05 3.0 143314.0 aCg/aTg aCg/aTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T126K MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4404597282409668 61.0917643070221 C 0.01291588135063648 0.07667674124240875 0.9104073643684388 C 0.0007650679908692838 0.007071920670568944 2.844490700226743e-05 0.025045180693268776 0.03124082460999489 0.020612794905900955 0.002872010925784707 0.9123637676239014 -89.06804656982422 160.7197265625 0.0037813959643244735 - 0.5070422535211268 - 0.3732394366197183 - 0.6830985915492958 - 0.5774647887323944 - 0.5704225352112676 - 0.5774647887323944 - 0.5633802816901409 - 0.6408450704225352 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.134929895371897e-06 9.439136639639826e-06 4.134929895371897e-06 9.439136639639826e-06 1 241842 NA NA NA NA aCg/aAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T126M MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4404597282409668 61.0917643070221 C 0.01291588135063648 0.07667674124240875 0.9104073643684388 C 0.0007650679908692838 0.007071920670568944 2.844490700226743e-05 0.025045180693268776 0.03124082460999489 0.020612794905900955 0.002872010925784707 0.9123637676239014 -89.06804656982422 160.7197265625 0.0037813959643244735 - 0.5070422535211268 - 0.3732394366197183 - 0.6830985915492958 - 0.5774647887323944 - 0.5704225352112676 - 0.5774647887323944 - 0.5633802816901409 - 0.6408450704225352 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.8174178388717185e-05 1.7015896681608768e-05 2.4809600290609524e-05 8.413887968117012e-06 6 241842 6.9773900577274625e-06 1.4790105785259281e-05 1.0 143320.0 aCg/aTg aCg/aTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A130V MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.008496999740600586 0.9363693714141846 H 0.9989332556724548 1.45137737490586e-05 0.0010522445663809776 H 0.0006765220314264297 0.997730314731598 0.0008198335999622941 3.6295004974817857e-06 4.017322680738289e-06 9.579908510204405e-05 0.00040439204894937586 0.0002655212301760912 -61.34875869750977 -41.73571395874024 5.061227057012729e-05 H 0.0 H 0.018867924528301886 H 0.03773584905660377 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.02830188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2381799933791625e-05 9.58888479729056e-06 1.2381799933791625e-05 9.58888479729056e-06 3 242292 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V131M MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.1951727271080017 29.99804815649986 H 0.9985767602920532 1.5371157132904042e-05 0.0014078897656872864 H 0.000334534008288756 0.9968457818031312 0.001527458312921226 2.3439849883288844e-06 4.766813617607113e-06 0.000107983905763831 0.0007878902833908796 0.00038915546610951424 -62.32516860961914 -42.42886734008789 0.000109789842099417 H 0.18309859154929575 H 0.11971830985915492 H 0.2112676056338028 H 0.17605633802816897 H 0.16901408450704225 H 0.17605633802816897 H 0.17605633802816897 H 0.15492957746478872 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 882578.0 VUS 1.0 7.256742307479237e-05 1.8580387549281348e-05 9.48289016378112e-05 8.687575437682144e-06 23 242542 3.489039954729378e-05 1.6424275767779567e-05 5.0 143306.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T132S MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.5091004967689514 70.61223890185356 H 0.9991793036460876 3.563088966984651e-06 0.0008171244408003986 H 0.0002038290404016152 0.9963703155517578 0.002632959745824337 1.1311465186736316e-06 1.0709755997595494e-06 5.470034739119001e-05 0.0005650089005939662 0.00017097356612794099 -64.57180786132811 -44.5981330871582 8.823936514090747e-05 H 0.31690140845070425 H 0.323943661971831 H 0.2605633802816901 H 0.23943661971830985 H 0.2605633802816901 H 0.24647887323943665 H 0.3591549295774648 H 0.30985915492957744 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.04 0.0 0.28 0.0 395C>G E134D MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.009554386138916016 1.6691512584686283 H 0.9997521042823792 6.123037110228324e-06 0.00024175790895242247 H 0.00034400468575768173 0.9971755743026732 0.0021929913200438023 1.5084177675817043e-06 1.7643433238845319e-06 2.650944406923373e-05 0.00019554904429242007 6.2097045884002e-05 -62.9585189819336 -41.01195907592773 1.428784707968589e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.01 0.0 0.0 402G>T L135F MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.25179925560951233 46.104443702101705 H 0.999589502811432 1.920524937304436e-06 0.0004086135886609554 H 0.0001665953459450975 0.9964147806167604 0.0030039099510759115 3.393128338302631e-07 5.128691782374517e-07 2.542591573728714e-05 0.000310383562464267 7.805658242432399e-05 -61.64667892456055 -42.439056396484375 1.891295141831506e-05 H 0.18292682926829268 H 0.27439024390243905 H 0.18292682926829268 H 0.2195121951219512 H 0.201219512195122 H 0.2073170731707317 H 0.2073170731707317 H 0.15853658536585366 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.7063142824447726e-05 NA NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.7063142824447726e-05 1.0 143308.0 NA Ctc/Ttc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA Q140* MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.020202020202020204 H 0.030303030303030307 H 0.03535353535353535 H 0.020202020202020204 H 0.015151515151515154 H 0.015151515151515154 H 0.020202020202020204 H 0.015151515151515154 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 846025.0 pathogenic 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L141Q MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.09880372881889343 18.090962746739386 H 0.999022364616394 7.062727036100115e-06 0.0009706515120342373 H 0.0005386878619901836 0.9885741472244264 0.009697732515633106 2.6441812224220484e-06 2.621428393467795e-06 0.00012445473112165928 0.0008305576629936695 0.0002291820856044069 -67.18727111816406 -41.324684143066406 6.273400504142046e-05 H 0.042682926829268296 H 0.03048780487804878 H 0.018292682926829267 H 0.03658536585365853 H 0.03658536585365853 H 0.03048780487804878 H 0.03048780487804878 H 0.054878048780487805 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.0 0.0 0.28 0.0 422T>A L141V MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.09880372881889343 18.090962746739386 H 0.999022364616394 7.062727036100115e-06 0.0009706515120342373 H 0.0005386878619901836 0.9885741472244264 0.009697732515633106 2.6441812224220484e-06 2.621428393467795e-06 0.00012445473112165928 0.0008305576629936695 0.0002291820856044069 -67.18727111816406 -41.324684143066406 6.273400504142046e-05 H 0.042682926829268296 H 0.03048780487804878 H 0.018292682926829267 H 0.03658536585365853 H 0.03658536585365853 H 0.03048780487804878 H 0.03048780487804878 H 0.054878048780487805 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.159855076674027e-06 1.8456073049649067e-05 4.093430106877349e-06 1.0186786584455096e-05 1 244294 6.9776901909790484e-06 1.5390127078641955e-05 1.0 143314.0 Ctg/Gtg Ctg/Gtg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA L143F MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.4086138606071472 74.81719787716865 H 0.998313307762146 3.384231604286469e-05 0.0016528471605852244 H 0.0016070673009380698 0.9833633899688721 0.012677457183599472 1.4164259482640771e-05 1.5606234228471294e-05 0.00018809718312695625 0.001820769626647234 0.0003133113496005535 -63.54004669189453 -42.205039978027344 0.0001771858660504222 H 0.042682926829268296 H 0.054878048780487805 H 0.024390243902439025 H 0.006097560975609756 H 0.0 H 0.012195121951219513 H 0.006097560975609756 H 0.024390243902439025 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0887798604671835e-06 9.518867464136743e-06 4.0887798604671835e-06 9.518867464136743e-06 1 244572 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I145V MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.06100854277610779 11.286580413579939 H 0.9977784752845764 2.279288491990883e-05 0.002198668895289302 H 0.003932634834200144 0.9756362438201904 0.017214950174093246 9.60507895797491e-06 1.187719408335397e-05 0.0003236372140236199 0.0023669961374253035 0.0005040490650571883 -65.06680297851561 -40.20113754272461 7.646467565791681e-05 H 0.1242603550295858 H 0.20710059171597636 H 0.1242603550295858 H 0.15976331360946747 H 0.16568047337278108 H 0.13609467455621302 H 0.1301775147928994 H 0.17751479289940827 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 9.272966188259815e-05 1.7616004759644947e-05 0.000106147002952639 8.861728053292853e-06 26 244944 6.979239697102457e-05 1.5224762710837757e-05 10.0 143282.0 Atc/Gtc Atc/Gtc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F146L MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.2245982587337494 45.07687052786351 H 0.985207200050354 0.00021650601411238315 0.014576325193047525 H 0.009544596076011658 0.9575257301330566 0.015843382105231285 8.075455843936652e-05 0.00010189278691541404 0.0013928201515227554 0.012667546048760414 0.0028433711268007755 -66.65296173095703 -37.862789154052734 0.00026286914362572134 H 0.06598984771573604 H 0.10152284263959392 H 0.0964467005076142 H 0.0964467005076142 H 0.07106598984771574 H 0.04060913705583756 H 0.045685279187817264 H 0.06598984771573604 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.856927085304051e-05 1.2261716680597067e-05 2.856927085304051e-05 1.2261716680597067e-05 6,1 245024,244986 NA NA NA NA Ttc/Ctc,ttC/ttA NA 1,0 NA NA NA NA NA NA NA A147T MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.3284964859485626 36.20031275153161 H 0.9162353873252868 0.0008726664236746727 0.08289189636707306 H 0.034130897372961044 0.8316150903701782 0.027787458151578903 0.0004461488570086658 0.0004514402244240046 0.008164491504430771 0.08390988409519196 0.013494628481566906 -67.675048828125 -32.863189697265625 0.0014541196869686244 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.02830188679245283 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17832.0 pathogenic 1.0 6.180596803302586e-05 1.7835964396836604e-05 5.304910155246034e-05 9.178792990806255e-06 13 245056 7.678560359636322e-05 1.529285405662229e-05 11.0 143256.0 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T149I MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA b 0.13674911856651306 18.96710274517536 H 0.5177072882652283 0.03212656453251839 0.4501661658287048 H 0.046738117933273315 0.4616910517215729 0.02498419024050236 0.023806627839803696 0.01562882959842682 0.08734004944562912 0.2024405300617218 0.13737060129642487 -88.06896209716797 -14.155173301696776 0.004358514677733183 T 0.647887323943662 S 0.5140845070422535 S 0.6197183098591549 H 0.4225352112676056 T 0.5704225352112676 T 0.5211267605633803 T 0.5845070422535211 T 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5024714047431189e-05 NA NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5024714047431189e-05 1.0 143312.0 NA aCc/aTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA T149N MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA b 0.13674911856651306 18.96710274517536 H 0.5177072882652283 0.03212656453251839 0.4501661658287048 H 0.046738117933273315 0.4616910517215729 0.02498419024050236 0.023806627839803696 0.01562882959842682 0.08734004944562912 0.2024405300617218 0.13737060129642487 -88.06896209716797 -14.155173301696776 0.004358514677733183 T 0.647887323943662 S 0.5140845070422535 S 0.6197183098591549 H 0.4225352112676056 T 0.5704225352112676 T 0.5211267605633803 T 0.5845070422535211 T 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.147500011546072e-06 9.329714996056422e-06 8.147500011546072e-06 9.329714996056422e-06 2 245474 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D150E MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.06296394765377045 0.6846764087677002 C 0.026741832494735718 0.15845026075839996 0.011726371943950651 0.03355596214532852 0.042479828000068665 0.11112448573112488 0.05787025019526481 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.016014069318771362 - 0.12883435582822084 - 0.15337423312883436 - 0.2147239263803681 - 0.11042944785276074 - 0.10429447852760736 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 441134.0 pathogenic 1.0 1.541578187747928e-05 1.805902558490683e-05 2.033350028796121e-05 8.882716366995987e-06 5 245900 6.977779776207171e-06 1.5723414229098625e-05 1.0 143312.0 gaT/gaA gaT/gaA 0 0.0 NA NA NA NA NA NA D150G MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.06296394765377045 0.6846764087677002 C 0.026741832494735718 0.15845026075839996 0.011726371943950651 0.03355596214532852 0.042479828000068665 0.11112448573112488 0.05787025019526481 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.016014069318771362 - 0.12883435582822084 - 0.15337423312883436 - 0.2147239263803681 - 0.11042944785276074 - 0.10429447852760736 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.98 0.0 0.0 0.98 0.0 449A>G D150N MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.06296394765377045 0.6846764087677002 C 0.026741832494735718 0.15845026075839996 0.011726371943950651 0.03355596214532852 0.042479828000068665 0.11112448573112488 0.05787025019526481 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.016014069318771362 - 0.12883435582822084 - 0.15337423312883436 - 0.2147239263803681 - 0.11042944785276074 - 0.10429447852760736 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.0285424595819816e-05 1.6858121720659587e-05 1.221309958054917e-05 8.593549029060009e-06 3 245638 6.980219950492027e-06 1.4503350751937162e-05 1.0 143262.0 Gat/Aat Gat/Aat 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R152C MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.02476279623806477 0.738119900226593 C 0.07212119549512863 0.1493319571018219 0.0031914059072732925 0.00800861045718193 0.01838590763509273 0.09949290752410887 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.11246412992477416 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.6266400052700192e-05 8.872733928901254e-06 1.6266400052700192e-05 8.872733928901254e-06 4 245906 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R152G MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.02476279623806477 0.738119900226593 C 0.07212119549512863 0.1493319571018219 0.0031914059072732925 0.00800861045718193 0.01838590763509273 0.09949290752410887 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.11246412992477416 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5654919199496974e-05 NA NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5654919199496974e-05 1.0 143306.0 NA Cgc/Ggc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R152H MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.02476279623806477 0.738119900226593 C 0.07212119549512863 0.1493319571018219 0.0031914059072732925 0.00800861045718193 0.01838590763509273 0.09949290752410887 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.11246412992477416 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.8260040336936828e-05 1.9624288915184413e-05 2.845940070983488e-05 9.855856837822553e-06 7 245964 2.791780025290791e-05 1.696982031192365e-05 4.0 143278.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R152L MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.02476279623806477 0.738119900226593 C 0.07212119549512863 0.1493319571018219 0.0031914059072732925 0.00800861045718193 0.01838590763509273 0.09949290752410887 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.11246412992477416 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.131270078592934e-06 9.053790645690684e-06 8.131270078592934e-06 9.053790645690684e-06 2 245964 NA NA NA NA cGc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R153H MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4632119238376618 106.07553055882454 C 0.19511841237545013 0.02912713959813118 0.7757545113563538 C 0.08016325533390045 0.10585063695907593 0.002242148853838444 0.012182786129415035 0.016879752278327942 0.15193039178848267 0.30532798171043396 0.32542315125465393 -92.05215454101562 14.871673583984375 0.11717111617326735 G 0.2620967741935484 G 0.21370967741935484 T 0.18951612903225806 G 0.13306451612903225 G 0.2540322580645161 G 0.2459677419354839 S 0.0967741935483871 S 0.09274193548387097 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.8232327722046014e-05 1.8227130372412207e-05 1.6238500393228605e-05 9.22148050388945e-06 4 246328 4.8849899030756205e-05 1.5722359203672282e-05 7.0 143296.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G154* MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5952380952380952 - 0.42857142857142855 T 0.5714285714285714 T 0.5238095238095238 - 0.6071428571428571 - 0.6071428571428571 - 0.5833333333333334 - 0.6190476190476191 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 848236.0 pathogenic 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G154= MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5256166458129883 41.366030025482175 C 0.03369006142020225 0.01508107129484415 0.95122891664505 C 0.023401597514748573 0.011845625005662441 0.0006933188415132463 0.007211497053503991 0.010283126495778559 0.22178588807582847 0.2639767825603485 0.4608021974563599 61.70980453491211 -5.816244602203369 0.10950832068920137 - 0.5952380952380952 - 0.42857142857142855 T 0.5714285714285714 T 0.5238095238095238 - 0.6071428571428571 - 0.6071428571428571 - 0.5833333333333334 - 0.6190476190476191 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.0 0.0 0.99 0.0 462A>T G154R MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5256166458129883 41.366030025482175 C 0.03369006142020225 0.01508107129484415 0.95122891664505 C 0.023401597514748573 0.011845625005662441 0.0006933188415132463 0.007211497053503991 0.010283126495778559 0.22178588807582847 0.2639767825603485 0.4608021974563599 61.70980453491211 -5.816244602203369 0.10950832068920137 - 0.5952380952380952 - 0.42857142857142855 T 0.5714285714285714 T 0.5238095238095238 - 0.6071428571428571 - 0.6071428571428571 - 0.5833333333333334 - 0.6190476190476191 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 883362.0 VUS 1.0 4.361438019108913e-05 1.757487422651992e-05 4.46226003987249e-05 9.247083484329894e-06 11 246512 4.187960075796582e-05 1.4945489323264975e-05 6.0 143268.0 Gga/Aga Gga/Aga 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P157L MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.51834636926651 73.55334979891778 C 0.042535293847322464 0.016567816957831383 0.9408969283103944 T 0.028262449428439137 0.01576688326895237 0.00019219634123146534 0.007450574077665806 0.0101304417476058 0.13347387313842773 0.44639140367507935 0.3583321273326874 -66.24589538574219 40.11314392089844 0.08936107903718947 - 0.3382352941176471 S 0.2426470588235294 - 0.2647058823529412 T 0.04411764705882353 - 0.22794117647058826 S 0.75 T 0.1176470588235294 T 0.036764705882352935 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.100119885057211e-06 8.9464364248837e-06 8.100119885057211e-06 8.9464364248837e-06 2 246910 NA NA NA NA cCg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G158= MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4579187035560608 36.038201969862 C 0.1449028253555298 0.018514525145292282 0.8365827202796936 T 0.05488185584545136 0.07753961533308029 0.001814933377318084 0.0089054424315691 0.010458294302225113 0.16277967393398285 0.38715919852256775 0.2964609563350677 -62.45027160644531 -8.626885414123535 0.052267834544181824 - 0.16666666666666666 - 0.4047619047619048 - 0.15476190476190474 S 0.10714285714285714 - 0.07142857142857142 S 0.2380952380952381 T 0.023809523809523808 T 0.047619047619047616 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.66 0.0 0.0 0.66 0.0 474C>T A161S MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.057477205991745 6.3339881002902985 H 0.94822359085083 0.000703672063536942 0.05107277259230614 H 0.013531873002648357 0.9434903860092164 0.001826167106628418 0.0005962632712908089 0.00030704127857461566 0.004422117490321398 0.013546831905841827 0.02227932401001453 -62.2459602355957 -37.87075424194336 0.0011471951147541404 H 0.04716981132075472 H 0.07547169811320754 H 0.07547169811320754 H 0.07547169811320754 H 0.05660377358490566 H 0.018867924528301886 H 0.018867924528301886 H 0.04716981132075472 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.403788682157255e-05 NA NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.403788682157255e-05 1.0 143270.0 NA Gct/Tct NA 0.0 NA NA NA NA NA NA S163P MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA e 0.3013414144515991 35.317213773727424 H 0.9925259351730348 0.00033105214242823417 0.007142987567931414 H 0.006770519074052572 0.9780465960502625 0.007393303792923689 0.0001928222773130983 0.00016691323253326118 0.0009473609388805926 0.004354109056293964 0.002128387335687876 -65.05091094970703 -39.235084533691406 0.0003521762846503407 H 0.030769230769230767 H 0.07692307692307693 H 0.030769230769230767 H 0.015384615384615384 H 0.02307692307692308 H 0.038461538461538464 H 0.030769230769230767 H 0.015384615384615384 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9848001658101575e-06 1.5520753037275078e-05 NA NA NA NA 6.9848001658101575e-06 1.5520753037275078e-05 1.0 143168.0 NA Tcc/Ccc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I164T MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.054826349020004266 10.142874568700787 H 0.9981448650360109 7.103311509126797e-05 0.0017840726068243387 H 0.0014194208197295664 0.9925205707550048 0.0041753030382096785 2.7134670744999312e-05 2.9084363632136963e-05 0.00023566886375192553 0.0011088777100667355 0.00048394792247563606 -64.13788604736328 -41.70495223999024 8.869678276823834e-05 H 0.04142011834319527 H 0.08875739644970414 H 0.035502958579881665 H 0.04733727810650888 H 0.05325443786982249 H 0.04142011834319527 H 0.02366863905325444 H 0.04733727810650888 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.981879778322763e-06 1.643483479124455e-05 NA NA NA NA 6.981879778322763e-06 1.643483479124455e-05 1.0 143228.0 NA aTa/aCa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I164V MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.054826349020004266 10.142874568700787 H 0.9981448650360109 7.103311509126797e-05 0.0017840726068243387 H 0.0014194208197295664 0.9925205707550048 0.0041753030382096785 2.7134670744999312e-05 2.9084363632136963e-05 0.00023566886375192553 0.0011088777100667355 0.00048394792247563606 -64.13788604736328 -41.70495223999024 8.869678276823834e-05 H 0.04142011834319527 H 0.08875739644970414 H 0.035502958579881665 H 0.04733727810650888 H 0.05325443786982249 H 0.04142011834319527 H 0.02366863905325444 H 0.04733727810650888 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.04227012040792e-06 9.78238734174699e-06 4.04227012040792e-06 9.78238734174699e-06 1 247386 NA NA NA NA Ata/Gta NA 0 NA 0.2 0.0 0.0 0.2 0.0 490A>G G165S MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.030034542083740238 2.3637184619903566 H 0.999140739440918 1.2711275303445287e-05 0.0008464346174150705 H 0.00080591143341735 0.9925968647003174 0.005919505376368761 3.4731601772364233e-06 4.189894298178842e-06 0.00010362046305090188 0.00031632985337637365 0.00025009078672155743 -64.47385406494139 -42.74343872070313 2.694588147278409e-05 H 0.023809523809523808 H 0.011904761904761904 H 0.03571428571428571 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 H 0.047619047619047616 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5868257447525047e-05 NA NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5868257447525047e-05 1.0 143244.0 NA Ggc/Agc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA S167P MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.1893441081047058 22.191129469871527 H 0.9990476965904236 2.8094584195059724e-05 0.0009242169326171279 H 0.0015195281011983752 0.990724503993988 0.006524893455207348 9.065445738087874e-06 1.2213477020850405e-05 9.102954209083691e-05 0.0009533297852613033 0.0001653638028074056 -64.95059967041016 -41.31997680664063 6.455451512010768e-05 H 0.007692307692307694 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2812050792863185e-05 1.9274475655961184e-05 8.096510100585874e-06 9.218158353448344e-06 2 247020 2.094420051435009e-05 1.6927225655227467e-05 3.0 143238.0 Tct/Cct Tct/Cct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V168M MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.036441028118133545 5.600986021757126 H 0.9990179538726808 4.684517625719309e-05 0.0009352458291687072 H 0.0013160950038582089 0.988856852054596 0.008644420653581621 1.0696960089262577e-05 2.0147248505963944e-05 0.00013471697457134724 0.0008045680588111281 0.00021243632363621145 -65.74604034423828 -41.6869010925293 3.527710578055121e-05 H 0.014084507042253518 H 0.08450704225352113 H 0.014084507042253518 H 0.04929577464788732 H 0.04929577464788732 H 0.04225352112676056 H 0.04225352112676056 H 0.06338028169014084 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.6218290392837107e-05 1.765593095525051e-05 6.904110341565683e-05 8.798314313046616e-06 17 246230 6.981969818298239e-06 1.5307565552543362e-05 1.0 143226.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA H172Q MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.04083693027496338 7.428237617015839 H 0.9908577799797058 0.00023412200971506544 0.0089081060141325 H 0.009998244233429432 0.9472852945327759 0.03334103152155876 7.547793211415409e-05 0.00011248345981584858 0.0011887630680575967 0.0059436229057610035 0.0020551104098558426 -69.79582214355469 -38.32950210571289 8.168429485522209e-05 H 0.016304347826086956 H 0.03804347826086957 H 0.005434782608695652 H 0.010869565217391304 H 0.016304347826086956 H 0.010869565217391304 H 0.010869565217391304 H 0.02717391304347826 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.091350092494395e-06 8.51472873064531e-06 4.091350092494395e-06 8.51472873064531e-06 1 244418 NA NA NA NA caC/caA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G175= MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.035167157649993896 2.7676553070545205 H 0.8728574514389038 0.00016507797408848998 0.12697754800319672 H 0.035032328218221664 0.7923447489738464 0.05783077701926233 0.00021222732902970162 4.739954601973295e-05 0.01392316073179245 0.07739151269197464 0.0232178308069706 -72.28236389160156 -30.262041091918945 0.00038238285924307997 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.63 0.0 0.0 0.04 0.63 525G>C I176F MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.10521280765533447 19.46436941623688 H 0.9461491703987122 0.000593058648519218 0.0532577782869339 H 0.07080163806676865 0.8417295217514038 0.029986761510372162 0.00041312258690595627 0.00023277339641936123 0.005576918367296457 0.03930438682436943 0.011954965069890022 -61.81291198730469 -39.93989181518555 0.0004914983292110263 H 0.21301775147928995 H 0.2781065088757396 H 0.17751479289940827 H 0.15976331360946747 H 0.15384615384615385 H 0.15384615384615385 H 0.15976331360946747 H 0.17751479289940827 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3965500329504721e-05 1.7115566245018025e-05 NA NA NA NA 1.3965500329504721e-05 1.7115566245018025e-05 2.0 143210.0 NA Atc/Ttc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA H177Y MIP NA NA Extracellular|3 NA NA NA HELIX|7 NA NA NA e 0.4665572345256805 84.8667609602213 H 0.8904944062232971 0.0007076119654811919 0.10879791527986526 H 0.1210647001862526 0.7230765223503113 0.014982085675001144 0.00029041754896752536 0.00026786111993715167 0.011269419454038143 0.1204463317990303 0.008602683432400227 -66.20994567871094 -33.394962310791016 0.0003622260701376945 H 0.03804347826086957 H 0.16304347826086954 H 0.09239130434782608 H 0.02717391304347826 H 0.03804347826086957 H 0.02717391304347826 H 0.03260869565217391 H 0.14673913043478262 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.0131346004993103e-05 1.8257835856379464e-05 3.976359948865138e-06 8.669152760166078e-06 1 251486 2.0931000108248558e-05 1.6068427445752136e-05 3.0 143328.0 Cat/Tat Cat/Tat 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G180R MIP NA NA Extracellular|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.09478425979614258 7.459521245956421 C 0.008792819455265999 0.004263212904334068 0.9869439601898192 C 0.005271672736853361 0.0030718061607331038 0.0012407691683620214 0.003664999036118388 0.0033212213311344385 0.20646564662456512 0.17236988246440887 0.6045939922332764 80.07557678222656 17.005790710449222 0.0001955655898200348 S 0.27380952380952384 S 0.10714285714285714 S 0.2261904761904762 S 0.2976190476190476 S 0.2857142857142857 S 0.2857142857142857 S 0.2857142857142857 S 0.2976190476190476 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.800142009003025e-05 1.875526366967745e-05 2.3857399355620146e-05 9.805710994742484e-06 6 251494 6.283690163400024e-05 1.598774365589808e-05 9.0 143228.0 Ggc/Cgc Ggc/Cgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA C181Y MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.03100711107254028 4.353398394584656 C 0.007324502803385258 0.07728814333677292 0.9153873920440674 C 0.002893522381782532 0.0018355890642851593 0.0005493166390806437 0.0341423936188221 0.04842773452401161 0.1127101704478264 0.01761363260447979 0.7818276286125183 -96.76285552978516 141.07110595703125 0.00027779198717325926 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976239895564503e-06 8.687382600733667e-06 3.976239895564503e-06 8.687382600733667e-06 1 251494 NA NA NA NA tGc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N184S MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA NA NA NPA_2|1 NA b 0.06121814250946045 8.96233606338501 C 0.013305355794727802 0.08707687258720398 0.8996177315711975 C 0.003166459035128355 0.005830964539200068 0.00019642763072624805 0.014805708080530168 0.052516158670187 0.04842395707964897 0.014446405693888663 0.8606138229370117 -89.04288482666016 119.42829132080078 0.00020008251885883507 - 0.025477707006369428 S 0.050955414012738856 - 0.03184713375796178 - 0.03184713375796178 - 0.01910828025477707 - 0.01910828025477707 - 0.025477707006369428 - 0.03821656050955414 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.983440016483655e-06 1.4775182386008167e-05 NA NA NA NA 6.983440016483655e-06 1.4775182386008167e-05 1.0 143196.0 NA aAt/aGt NA 0.0 NA NA NA NA NA NA P185A MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NPA_2|1 NA b 0.030971497297286987 4.394855466485024 H 0.6326968669891357 0.02630819007754326 0.3409949243068695 H 0.11665072292089462 0.4735209941864014 0.011179490014910698 0.004610226023942232 0.01638917066156864 0.04094305634498596 0.2294742614030838 0.10723209381103516 -64.76774597167969 -23.494991302490234 0.00012971145042683932 H 0.0 H 0.0 H 0.014705882352941175 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.5196265863568125e-05 1.821188375166818e-05 1.988119947782252e-05 9.581705327621657e-06 5 251494 6.976420081628021e-06 1.5487531526970403e-05 1.0 143340.0 Cct/Gct Cct/Gct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A186V MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NPA_2|1 NA b 0.03461331129074097 3.8143869042396545 H 0.8388950228691101 0.008630869910120964 0.15247415006160736 H 0.1845312863588333 0.6096619963645935 0.03660016506910324 0.004531720653176308 0.004236536566168071 0.014212805777788162 0.1168338805437088 0.02939167059957981 -66.78546905517578 -33.010753631591804 0.0002011811448028311 H 0.0 H 0.018867924528301886 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97680980010773e-06 1.4762494732194394e-05 NA NA NA NA 6.97680980010773e-06 1.4762494732194394e-05 1.0 143332.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R187C MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.14482545852661133 33.165030002593994 H 0.9008768200874328 0.007192501798272133 0.09193066507577896 H 0.20812463760375974 0.626937747001648 0.04190075024962425 0.002471970859915018 0.003605099627748132 0.015171072445809841 0.08627589792013167 0.015512806363403797 -73.76443481445312 -31.667638778686523 0.00020030105952173471 H 0.028225806451612906 H 0.024193548387096774 H 0.03629032258064517 H 0.024193548387096774 H 0.024193548387096774 H 0.024193548387096774 H 0.028225806451612906 H 0.016129032258064516 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17828.0 pathogenic 2.0 4.812634644878881e-05 1.5183256944698428e-05 4.771519888890907e-05 8.109322005795771e-06 12 251492 4.8847901780391105e-05 1.2836284043875372e-05 7.0 143302.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R187H MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.14482545852661133 33.165030002593994 H 0.9008768200874328 0.007192501798272133 0.09193066507577896 H 0.20812463760375974 0.626937747001648 0.04190075024962425 0.002471970859915018 0.003605099627748132 0.015171072445809841 0.08627589792013167 0.015512806363403797 -73.76443481445312 -31.667638778686523 0.00020030105952173471 H 0.028225806451612906 H 0.024193548387096774 H 0.03629032258064517 H 0.024193548387096774 H 0.024193548387096774 H 0.024193548387096774 H 0.028225806451612906 H 0.016129032258064516 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 35695.0 pathogenic 1.0 5.067345099702957e-06 1.6758170122010095e-05 3.976269908889663e-06 8.528804857466323e-06 1 251492 6.983630100876326e-06 1.44255243766558e-05 1.0 143192.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A192V MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.02856990694999695 3.148403745889664 H 0.9991279244422911 0.00010197154915658756 0.0007701824069954455 H 0.00757830124348402 0.9844054579734802 0.007081762887537479 1.7775055312085893e-05 4.083424937562087e-05 6.0463691625045606e-05 0.0006814326625317335 0.0001341028546448797 -63.254920959472656 -41.00181579589844 3.073529660468921e-05 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.598757232839793e-06 1.5677431406371854e-05 3.976299922214822e-06 8.466319785717282e-06 1 251490 1.3955599570181219e-05 1.3194820377233884e-05 2.0 143312.0 gCt/gTt gCt/gTt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V193= MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.09541055560112 14.664602395892146 H 0.996820330619812 0.0001414392463630065 0.0030383041594177485 H 0.007866679690778255 0.9706320762634276 0.0171681996434927 3.144894071738236e-05 3.857388583128341e-05 0.00019377024727873504 0.003798371879383922 0.0002708957763388753 -63.95095825195313 -41.35733413696289 6.257256609387697e-05 H 0.5422535211267606 H 0.5352112676056338 H 0.6338028169014085 H 0.5422535211267606 H 0.5563380281690141 H 0.5492957746478874 H 0.5492957746478874 H 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.0 0.27 579C>A V194I MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA HELIX|8 NA NA NA e 0.27295514941215515 41.953206464648254 H 0.954245388507843 0.0007445314549840988 0.045010119676589966 H 0.011862029321491718 0.9209091067314148 0.020702224224805832 0.00024158749147318306 0.000165901830769144 0.002413405338302255 0.041206777095794685 0.002498935908079148 -71.19284057617188 -33.275279998779304 0.00033725492539815605 H 0.2535211267605634 T 0.4366197183098591 H 0.35211267605633795 H 0.3309859154929577 H 0.3309859154929577 H 0.3380281690140845 H 0.3591549295774648 H 0.2676056338028169 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.29352269328034e-05 1.8535879589875197e-05 3.976299922214821e-05 8.773410899834124e-06 10 251490 2.0946199583704583e-05 1.6328076841839763e-05 3.0 143224.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T195S MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.2347403466701508 32.55848608314991 H 0.6322765946388245 0.0007776874117553232 0.366945743560791 H 0.021173777058720592 0.5901495218276978 0.011463412083685398 0.0004273178055882453 0.00011880521924467756 0.017677726224064827 0.3494464457035065 0.009542991407215595 -97.27127838134766 -10.742962837219238 0.0005125540774315597 H 0.2887323943661972 S 0.20422535211267606 S 0.34507042253521125 T 0.24647887323943665 T 0.2535211267605634 H 0.3732394366197183 H 0.4154929577464789 H 0.5352112676056338 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976269908889663e-06 8.434916824624279e-06 3.976269908889663e-06 8.434916824624279e-06 1 251492 NA NA NA NA aCt/aGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G196= MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3931715488433838 30.942600893974305 C 0.011507732793688774 0.0009369609178975224 0.9875553250312804 T 0.002648907946422696 0.0092839440330863 0.0011628138599917293 0.0011725923977792265 0.0003863642050419003 0.1749909520149231 0.6530105471611023 0.15734387934207916 77.05644989013672 25.20864486694336 0.0007782977190800012 - 0.6785714285714286 S 0.9166666666666666 - 0.9047619047619048 T 0.7857142857142857 T 0.8333333333333334 - 0.6190476190476191 - 0.5595238095238095 - 0.27380952380952384 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.79 0.0 0.0 0.79 0.64 588C>T K197* MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.2975609756097561 - 0.5512195121951221 - 0.3902439024390244 - 0.3560975609756097 - 0.473170731707317 - 0.5512195121951221 - 0.5658536585365853 - 0.7414634146341463 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.0 0.27 589A>T F198L MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3695414066314697 74.16696031093598 C 0.4105471968650818 0.009824471548199657 0.5796284079551697 T 0.2423417717218399 0.13749927282333374 0.003535621333867312 0.006717619486153126 0.005011271685361861 0.14912371337413788 0.2582921087741852 0.19747857749462128 -81.5665512084961 -12.935670852661133 0.004861969966441393 - 0.6091370558375635 - 0.5837563451776651 - 0.5634517766497462 - 0.5583756345177665 - 0.5279187817258884 - 0.4771573604060914 - 0.5076142131979695 - 0.6802030456852792 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.5114661306750547e-05 NA NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.5114661306750547e-05 1.0 143268.0 NA Ttt/Ctt NA 0.0 NA NA NA NA NA NA D200N MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA e 0.32072070240974426 46.215853217244145 C 0.2906010448932648 0.010076937265694141 0.699321985244751 G 0.25544312596321106 0.09950874745845796 0.0015381034463644028 0.005464268848299979 0.004841563291847706 0.1380564421415329 0.2529365122318268 0.2422113120555877 -96.69001770019531 21.33171844482422 0.0038787499070167533 S 0.392638036809816 T 0.32515337423312884 T 0.392638036809816 T 0.3987730061349693 T 0.37423312883435583 T 0.392638036809816 T 0.37423312883435583 T 0.3496932515337423 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.5904999600024897e-05 7.358453404652069e-06 1.5904999600024897e-05 7.358453404652069e-06 4 251494 NA NA NA NA Gac/Aac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H201L MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA b 0.1686002016067505 30.668376672267915 H 0.5256035923957825 0.030833261087536805 0.4435631334781647 H 0.09983919560909273 0.4195571541786194 0.013836478814482687 0.01687916181981564 0.01764710620045662 0.11902247369289398 0.09143835306167604 0.22178007662296287 -79.4293441772461 -13.496238708496096 0.0003610685234889388 - 0.1032608695652174 H 0.15760869565217392 - 0.16304347826086954 T 0.14130434782608695 T 0.125 T 0.16304347826086954 T 0.14673913043478262 H 0.14673913043478262 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976239895564503e-06 9.6067879366445e-06 3.976239895564503e-06 9.6067879366445e-06 1 251494 NA NA NA NA cAc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H201Q MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA b 0.1686002016067505 30.668376672267915 H 0.5256035923957825 0.030833261087536805 0.4435631334781647 H 0.09983919560909273 0.4195571541786194 0.013836478814482687 0.01687916181981564 0.01764710620045662 0.11902247369289398 0.09143835306167604 0.22178007662296287 -79.4293441772461 -13.496238708496096 0.0003610685234889388 - 0.1032608695652174 H 0.15760869565217392 - 0.16304347826086954 T 0.14130434782608695 T 0.125 T 0.16304347826086954 T 0.14673913043478262 H 0.14673913043478262 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.02 0.0 0.35 0.2 603C>G W202* MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA TURN|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5903083700440529 H 0.7092511013215859 H 0.6696035242290749 T 0.5638766519823789 T 0.5770925110132159 T 0.5726872246696035 T 0.5770925110132159 H 0.6167400881057269 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.73 0.06 0.0 0.0 0.73 606G>A W202C MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA TURN|1 NA NA e 0.4709707200527191 113.26845817267895 H 0.8487279415130615 0.011254653334617616 0.14001737534999847 H 0.0838022530078888 0.7190009951591492 0.03181067481637001 0.005451084580272436 0.006307561881840229 0.027854649350047108 0.08659963309764862 0.03917323797941208 -67.45601654052734 -37.16478729248047 0.0005777219193987548 H 0.5903083700440529 H 0.7092511013215859 H 0.6696035242290749 T 0.5638766519823789 T 0.5770925110132159 T 0.5726872246696035 T 0.5770925110132159 H 0.6167400881057269 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.82 0.05 0.0 0.0 0.82 606G>C V203F MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.10262098908424376 15.772846022248268 H 0.9815130233764648 0.0015991219552233815 0.0168878473341465 H 0.03710310161113739 0.8797202110290527 0.059690307825803764 0.0005944502190686762 0.0008753395522944629 0.00277368538081646 0.014734065160155296 0.00450881477445364 -67.87215423583984 -40.20306396484375 9.553263953421264e-05 H 0.0 H 0.04929577464788732 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.007042253521126761 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.0 0.31 0.0 0.0 607G>T V203L MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.10262098908424376 15.772846022248268 H 0.9815130233764648 0.0015991219552233815 0.0168878473341465 H 0.03710310161113739 0.8797202110290527 0.059690307825803764 0.0005944502190686762 0.0008753395522944629 0.00277368538081646 0.014734065160155296 0.00450881477445364 -67.87215423583984 -40.20306396484375 9.553263953421264e-05 H 0.0 H 0.04929577464788732 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.007042253521126761 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.1259600038756625e-06 8.665650922295672e-06 4.1259600038756625e-06 8.665650922295672e-06 1 242368 NA NA NA NA Gtc/Ctc NA 0 NA 0.23 0.0 0.23 0.0 0.0 607G>C W205L MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.31043291091918945 74.65911507606506 H 0.9701592326164246 0.0004924727836623788 0.02934833988547325 H 0.03142745047807693 0.6640890836715698 0.277011513710022 0.00013027054956182837 0.0001484466774854809 0.0030830716714262962 0.02013393118977547 0.003976242151111364 -72.30474853515625 -37.18893814086914 0.00010210648906650022 H 0.3171806167400881 H 0.32158590308370044 H 0.3876651982378855 H 0.2907488986784141 H 0.2995594713656388 H 0.29515418502202645 H 0.29515418502202645 T 0.3788546255506608 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.114080184081104e-06 9.174149142333204e-06 4.114080184081104e-06 9.174149142333204e-06 1 243068 NA NA NA NA tGg/tTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P208T MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.04245740175247192 6.024705308675768 H 0.9989890456199646 1.6784850231488235e-05 0.0009941622847691178 H 0.003478107042610645 0.9894145727157592 0.005928769707679749 2.4087373731163098e-06 5.235349817667157e-06 0.00010501370707061144 0.0008659373270347713 0.000199968068045564 -62.02483367919922 -39.39707946777344 1.002471981337294e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.204249752452597e-06 8.338479959874093e-06 8.204249752452597e-06 8.338479959874093e-06 2 243776 NA NA NA NA Ccc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L209P MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.31679368019104004 58.00492284297943 H 0.9991683959960938 1.4605509022658225e-05 0.0008169962675310671 H 0.0008450048044323921 0.987305223941803 0.010945990681648254 3.476898427834385e-06 4.062247626279714e-06 6.705238047288731e-05 0.0006715428899042307 0.00015770156460348517 -66.12423706054689 -43.400821685791016 4.387887383927591e-05 H 0.2865853658536585 H 0.2865853658536585 H 0.2682926829268293 H 0.2865853658536585 H 0.2926829268292683 H 0.3048780487804878 H 0.2682926829268293 H 0.3353658536585366 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 881000.0 VUS 1.0 1.3961200238554737e-05 1.5055489293986672e-05 NA NA NA NA 1.3961200238554737e-05 1.5055489293986672e-05 2.0 143254.0 NA cTg/cCg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L209V MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.31679368019104004 58.00492284297943 H 0.9991683959960938 1.4605509022658225e-05 0.0008169962675310671 H 0.0008450048044323921 0.987305223941803 0.010945990681648254 3.476898427834385e-06 4.062247626279714e-06 6.705238047288731e-05 0.0006715428899042307 0.00015770156460348517 -66.12423706054689 -43.400821685791016 4.387887383927591e-05 H 0.2865853658536585 H 0.2865853658536585 H 0.2682926829268293 H 0.2865853658536585 H 0.2926829268292683 H 0.3048780487804878 H 0.2682926829268293 H 0.3353658536585366 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.921180152450688e-05 1.0017146315991401e-05 4.921180152450688e-05 1.0017146315991401e-05 12 243844 NA NA NA NA Ctg/Gtg NA 1 NA NA NA NA NA NA NA V210M MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3819413781166077 58.7043898165226 H 0.999545395374298 4.7118351176322895e-06 0.00044976340723223984 H 0.00029549523605965083 0.9903073310852052 0.008866108953952791 1.901606424326019e-06 1.4506211982734385e-06 3.86952051485423e-05 0.0004163222329225391 7.267040928127244e-05 -64.86922454833984 -44.52633666992188 3.939124144380912e-05 H 0.4788732394366197 H 0.4014084507042254 H 0.3873239436619718 H 0.3661971830985916 H 0.3732394366197183 H 0.3732394366197183 H 0.4154929577464789 H 0.39436619718309857 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.096209977433318e-06 8.640544028087147e-06 4.096209977433318e-06 8.640544028087147e-06 1 244128 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A212P MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.027289539575576786 3.0073072612285614 H 0.9998088479042052 2.3223290099849687e-06 0.0001888913830043748 H 0.0002821881207637489 0.997077226638794 0.002418636810034513 5.4763171419836e-07 6.110194021857751e-07 1.6331023289239965e-05 0.00016890249389689416 3.558003299986012e-05 -64.21243286132811 -43.157447814941406 4.749831077788258e-06 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.6484000298078175e-05 9.01784765234818e-06 1.6484000298078175e-05 9.01784765234818e-06 4 242660 NA NA NA NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L214R MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.4165361225605011 76.26776404082773 H 0.9996337890625 3.2554794415773362e-06 0.00036296810139901936 H 0.0002230875106761232 0.9900572896003724 0.009258782491087914 1.1084752031820244e-06 1.0811123729581595e-06 2.9156828531995416e-05 0.00036979260039515793 5.9646878071362146e-05 -64.4833984375 -44.72064208984375 7.566894055344164e-05 H 0.4024390243902439 H 0.4573170731707317 H 0.4817073170731707 H 0.4329268292682927 H 0.4085365853658536 H 0.4207317073170732 H 0.4146341463414634 H 0.4634146341463415 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.061239906150149e-06 9.338173235059713e-06 4.061239906150149e-06 9.338173235059713e-06 1 246230 NA NA NA NA cTg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y219* MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I 0.040540540540540536 I 0.022522522522522518 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.013513513513513514 I 0.022522522522522518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.44 0.44 0.3 0.0 0.0 657C>A Y219= MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.12769398093223572 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.003127441043034196 H 0.0038651549257338047 0.8916479349136353 0.10124041140079497 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693422 0.002233827020972967 0.0006464470643550158 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.00030613536364398897 I 0.040540540540540536 I 0.022522522522522518 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.013513513513513514 I 0.022522522522522518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.07 0.0 0.0 657C>T Y219C MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.12769398093223572 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.003127441043034196 H 0.0038651549257338047 0.8916479349136353 0.10124041140079497 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693422 0.002233827020972967 0.0006464470643550158 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.00030613536364398897 I 0.040540540540540536 I 0.022522522522522518 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.013513513513513514 I 0.022522522522522518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3958099771116395e-05 1.3491413129878172e-05 NA NA NA NA 1.3958099771116395e-05 1.3491413129878172e-05 2.0 143286.0 NA tAc/tGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA Y219H MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.12769398093223572 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.003127441043034196 H 0.0038651549257338047 0.8916479349136353 0.10124041140079497 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693422 0.002233827020972967 0.0006464470643550158 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.00030613536364398897 I 0.040540540540540536 I 0.022522522522522518 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.009009009009009007 I 0.013513513513513514 I 0.022522522522522518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.373433995569092e-05 NA NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.373433995569092e-05 1.0 143342.0 NA Tac/Cac NA 0.0 NA NA NA NA NA NA N220S NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3280002474784851 48.01923623085022 H 0.985782265663147 0.00027133256662636995 0.013946414925158024 H 0.014577750116586685 0.8367598652839661 0.1350012570619583 6.342451524687931e-05 9.69804241321981e-05 0.0015660298522561784 0.009368829429149628 0.002565908012911677 -67.02587890625 -37.11647033691406 0.0005625704652629793 I 0.19745222929936307 I 0.10191082802547773 I 0.2356687898089172 I 0.1464968152866242 I 0.17197452229299362 I 0.08280254777070062 I 0.12738853503184713 I 0.16560509554140124 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 659A>G N220T NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3280002474784851 48.01923623085022 H 0.985782265663147 0.00027133256662636995 0.013946414925158024 H 0.014577750116586685 0.8367598652839661 0.1350012570619583 6.342451524687931e-05 9.69804241321981e-05 0.0015660298522561784 0.009368829429149628 0.002565908012911677 -67.02587890625 -37.11647033691406 0.0005625704652629793 I 0.19745222929936307 I 0.10191082802547773 I 0.2356687898089172 I 0.1464968152866242 I 0.17197452229299362 I 0.08280254777070062 I 0.12738853503184713 I 0.16560509554140124 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 740161.0 benign 1.0 0.00035339322880889194 1.827835693600574e-05 0.0005096429958939551 8.095092285517672e-06 126 247232 8.375909965252504e-05 1.6388038722464057e-05 12.0 143268.0 aAc/aCc aAc/aCc 1 0.0 NA NA NA NA NA NA Y221* NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I 0.6846846846846847 I 0.6441441441441441 I 0.7747747747747747 I 0.536036036036036 I 0.6396396396396397 I 0.6531531531531531 I 0.6351351351351351 I 0.6621621621621622 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.46 0.46 0.0 0.0 0.0 663C>G Y221H NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.6190492510795593 132.29082495570182 H 0.96038019657135 0.0011672275140881536 0.03845260664820671 H 0.027480248361825943 0.7560042738914491 0.17724284529685974 0.0002823870163410902 0.0005184128531254828 0.004162217024713755 0.028205618262290955 0.006104113534092903 -70.6322021484375 -38.55044937133789 0.004062050487846136 I 0.6846846846846847 I 0.6441441441441441 I 0.7747747747747747 I 0.536036036036036 I 0.6396396396396397 I 0.6531531531531531 I 0.6351351351351351 I 0.6621621621621622 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0432501009490815e-06 9.340784174668036e-06 4.0432501009490815e-06 9.340784174668036e-06 1 247326 NA NA NA NA Tac/Cac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V222= NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4832846224308014 74.28084646761417 H 0.9259748458862304 0.0007787408540025352 0.07324633747339249 H 0.01959648914635181 0.7742439508438109 0.13762617111206055 0.00023878292995505035 0.00029647338669747114 0.010276774875819685 0.04715195670723915 0.010569346137344835 -77.55719757080078 -34.35962677001953 0.006898135412484407 I 0.4225352112676056 I 0.4366197183098591 I 0.4647887323943662 I 0.4436619718309859 I 0.4436619718309859 I 0.471830985915493 I 0.4436619718309859 I 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.41 0.0 0.0 0.0 666G>T V222M NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4832846224308014 74.28084646761417 H 0.9259748458862304 0.0007787408540025352 0.07324633747339249 H 0.01959648914635181 0.7742439508438109 0.13762617111206055 0.00023878292995505035 0.00029647338669747114 0.010276774875819685 0.04715195670723915 0.010569346137344835 -77.55719757080078 -34.35962677001953 0.006898135412484407 I 0.4225352112676056 I 0.4366197183098591 I 0.4647887323943662 I 0.4436619718309859 I 0.4436619718309859 I 0.471830985915493 I 0.4436619718309859 I 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0424902181257485e-06 9.147664934469956e-06 4.0424902181257485e-06 9.147664934469956e-06 1 247372 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L223= NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2953580617904663 54.08006111383438 H 0.6760007739067078 0.00521783111616969 0.3187814056873321 H 0.02840239554643632 0.5969877243041992 0.05292328074574471 0.004248003475368023 0.0020843814127147198 0.09759137779474256 0.11999916285276413 0.09776356816291808 -92.54405975341795 -14.760578155517578 0.007530380040407182 I 0.018292682926829267 S 0.006097560975609756 I 0.018292682926829267 I 0.012195121951219513 I 0.012195121951219513 I 0.006097560975609756 I 0.018292682926829267 S 0.024390243902439025 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.37 0.0 0.0 0.0 669G>T L223M NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2953580617904663 54.08006111383438 H 0.6760007739067078 0.00521783111616969 0.3187814056873321 H 0.02840239554643632 0.5969877243041992 0.05292328074574471 0.004248003475368023 0.0020843814127147198 0.09759137779474256 0.11999916285276413 0.09776356816291808 -92.54405975341795 -14.760578155517578 0.007530380040407182 I 0.018292682926829267 S 0.006097560975609756 I 0.018292682926829267 I 0.012195121951219513 I 0.012195121951219513 I 0.006097560975609756 I 0.018292682926829267 S 0.024390243902439025 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.678134766842009e-06 1.6733204495490617e-05 4.0426898522127885e-06 8.63659601061754e-06 1 247360 1.395090021105716e-05 1.433210877844892e-05 2.0 143360.0 Ctg/Atg Ctg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F224L NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3974937498569489 79.77699559628962 C 0.011813283897936344 0.006259581539779902 0.9819270968437196 C 0.0015422569122165446 0.006618530489504336 0.0007718299748376013 0.006025633774697782 0.002526599681004882 0.4392301142215729 0.022761864587664604 0.520523190498352 -109.02741241455078 116.52357482910156 0.007487778551876545 - 0.3350253807106599 - 0.3299492385786802 S 0.39086294416243655 S 0.3197969543147208 S 0.29949238578680204 - 0.2284263959390863 S 0.2233502538071066 - 0.3147208121827411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.040370185975917e-06 9.424188527363756e-06 4.040370185975917e-06 9.424188527363756e-06 1 247502 NA NA NA NA Ttt/Ctt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P225= NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.005394546315073967 0.0009131063707172873 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706795 0.0025914523284882307 7.122094393707812e-05 0.00039976139669306576 0.0005596239352598786 0.1180872991681099 0.03455716744065285 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413067 - 0.05882352941176471 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.19852941176470587 - 0.15441176470588236 - 0.2867647058823529 - 0.22058823529411764 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 675G>T P225L NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.005394546315073967 0.0009131063707172873 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706795 0.0025914523284882307 7.122094393707812e-05 0.00039976139669306576 0.0005596239352598786 0.1180872991681099 0.03455716744065285 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413067 - 0.05882352941176471 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.19852941176470587 - 0.15441176470588236 - 0.2867647058823529 - 0.22058823529411764 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.5618714392730382e-05 NA NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.5618714392730382e-05 2.0 143340.0 NA cCg/cTg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA P225Q NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.005394546315073967 0.0009131063707172873 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706795 0.0025914523284882307 7.122094393707812e-05 0.00039976139669306576 0.0005596239352598786 0.1180872991681099 0.03455716744065285 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413067 - 0.05882352941176471 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.19852941176470587 - 0.15441176470588236 - 0.2867647058823529 - 0.22058823529411764 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 674C>A P226T NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6438327431678772 91.35986625552178 C 0.024184798821806908 0.005605047103017569 0.9702101945877076 C 0.016792818903923038 0.009625878185033798 0.00015341045218519866 0.0032525283750146627 0.003263980383053422 0.14064879715442655 0.18505114316940308 0.6412113904953003 -67.69782257080078 131.864013671875 0.058594435453414924 S 0.5367647058823529 - 0.3897058823529412 - 1.0 - 0.6397058823529411 - 0.6838235294117647 - 0.3602941176470588 - 0.4558823529411765 - 1.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.0 0.0 0.0 676C>A A227G NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6449156999588013 71.06971013545991 C 0.03587617352604866 0.0063420082442462436 0.9577818512916564 C 0.02579942531883717 0.01896398887038231 0.00011380919022485612 0.004015970043838024 0.003767383983358741 0.11367380619049072 0.12324313074350356 0.7104225158691406 -81.93953704833984 106.19904327392578 0.0805005431175232 - 0.660377358490566 - 0.8113207547169812 NA NA - 0.8867924528301887 - 0.5188679245283019 - 0.7358490566037735 - 0.3679245283018868 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 680C>G K228R NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6160751581192017 126.72666002511976 C 0.054237499833107 0.005511919036507607 0.94025057554245 C 0.015461571514606476 0.027870705351233482 0.00016258614778053015 0.0033892602659761906 0.0028108006808906802 0.27893784642219543 0.029304184019565582 0.6420630812644958 -91.87073516845705 118.7792739868164 0.09827441722154616 S 0.7512195121951221 - 0.6536585365853659 NA NA - 0.8097560975609757 - 1.0 - 0.5560975609756098 S 0.8341463414634146 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 683A>G L230R NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4031502306461334 73.81680723130702 H 0.7285189032554626 0.000759684422519058 0.2707214951515198 H 0.05441998317837715 0.7170257568359375 0.0009886771440505981 0.0004153332265559584 0.0004183301061857492 0.0277179591357708 0.04226721823215485 0.15674670040607452 -65.63974761962889 -34.08396530151367 0.12226827442646028 T 1.0 H 0.7804878048780488 NA NA T 0.8109756097560976 T 0.8353658536585366 H 0.7987804878048781 T 1.0 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.628181555821519e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.628181555821519e-05 1.0 143336.0 NA cTg/cGg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA E232D NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.5703091621398926 99.63301062583923 H 0.9108636379241944 0.0007026194361969829 0.08843369036912918 H 0.049855362623929984 0.8557695150375366 0.000655865587759763 0.00029492820613086224 0.0005277974996715784 0.00786362774670124 0.023335177451372147 0.06169763207435607 -67.28882598876953 -37.70706558227539 0.07728791236877441 - 1.0 H 0.21134020618556698 NA NA H 0.6134020618556701 T 0.922680412371134 H 0.24742268041237114 H 0.26804123711340205 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.113965004138677e-06 1.728714266941478e-05 4.036619884573156e-06 9.569898190436984e-06 1 247732 6.975739779591095e-06 1.439660898605544e-05 1.0 143354.0 gaG/gaT gaG/gaT 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R233C NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.2605181634426117 59.65865942835808 H 0.9212921261787416 0.0012698700884357095 0.07743792235851288 H 0.025409657508134842 0.8983291983604431 0.00197734497487545 0.0004810406535398215 0.0007254148367792367 0.005963709205389023 0.01673382893204689 0.05037980526685715 -65.23469543457031 -39.38766860961914 0.1047891229391098 NA NA H 0.5080645161290323 NA NA H 0.7016129032258065 - 0.8467741935483871 H 0.5 H 0.6693548387096774 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.073960088950116e-06 8.926554239226808e-06 8.073960088950116e-06 8.926554239226808e-06 2 247710 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R233G NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.2605181634426117 59.65865942835808 H 0.9212921261787416 0.0012698700884357095 0.07743792235851288 H 0.025409657508134842 0.8983291983604431 0.00197734497487545 0.0004810406535398215 0.0007254148367792367 0.005963709205389023 0.01673382893204689 0.05037980526685715 -65.23469543457031 -39.38766860961914 0.1047891229391098 NA NA H 0.5080645161290323 NA NA H 0.7016129032258065 - 0.8467741935483871 H 0.5 H 0.6693548387096774 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.036980044475058e-06 1.040912269921178e-05 4.036980044475058e-06 1.040912269921178e-05 1 247710 NA NA NA NA Cgc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E241D NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6307028532028198 110.18378845453262 C 0.003978331107646228 0.005506254266947508 0.9905154705047609 C 0.0012850139755755665 0.0021644521038979288 2.411189598205965e-05 0.003230712842196226 0.002978833392262459 0.07765951007604599 0.00738388253375888 0.9052734971046448 -97.79377746582031 125.67694091796876 0.3198315501213074 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 1.0 NA NA NA NA nan|4nef-C NA NA NA 4.065539997100132e-06 9.330395218323765e-06 4.065539997100132e-06 9.330395218323765e-06 1 245970 NA NA NA NA gaG/gaT NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P242L NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5591873526573181 79.34868534207344 C 0.020038403570652008 0.002606973284855485 0.9773545861244202 C 0.01704148948192596 0.00702513987198472 2.785001197480597e-05 0.0011197389103472233 0.0021152792032808065 0.05306502431631088 0.265518456697464 0.6540870070457458 -63.77836227416992 114.58120727539062 0.21712861955165866 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 2.312684624624057e-05 1.7687709763862235e-05 2.0340399714768868e-05 8.072269547845661e-06 5 245816 2.7905300157726746e-05 1.573828265845899e-05 4.0 143342.0 cCg/cTg cCg/cTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA D243G NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.7126537561416626 102.69340626001356 C 0.02574496529996395 0.0031765729654580355 0.9710784554481506 C 0.013556132093071938 0.013258907943964005 9.280817175749692e-05 0.0018407388124614954 0.0021183451171964407 0.08156471699476242 0.205405667424202 0.6821626424789429 -88.54071044921875 37.1845817565918 0.2783437669277191 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.072920091857668e-06 8.366060960469441e-06 4.072920091857668e-06 8.366060960469441e-06 1 245524 NA NA NA NA gAc/gGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T244I NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5167946219444275 71.6794140636921 C 0.05876155942678452 0.004181607160717249 0.937056839466095 C 0.01664125919342041 0.035855263471603394 0.00012998106831219047 0.0022112180013209573 0.0027138309087604284 0.15985122323036194 0.04713381826877594 0.7354633808135986 -84.27201843261719 90.33106994628906 0.2921237647533417 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.6321999282808974e-05 7.752939202373942e-06 1.6321999282808974e-05 7.752939202373942e-06 4 245068 NA NA NA NA aCc/aTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D245N NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5989713072776794 86.31176537871359 C 0.12555067241191864 0.006123667117208242 0.8683257102966309 C 0.020139915868639943 0.08079762756824492 0.0002530658384785056 0.0030279741622507572 0.003609885228797794 0.05047157034277916 0.06353071331977844 0.7781693339347839 -81.88878631591797 48.99696731567383 0.2547702193260193 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.97545010552858e-06 1.659069572092355e-05 NA NA NA NA 6.97545010552858e-06 1.659069572092355e-05 1.0 143360.0 NA Gat/Aat NA 0.0 NA NA NA NA NA NA D245V NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5989713072776794 86.31176537871359 C 0.12555067241191864 0.006123667117208242 0.8683257102966309 C 0.020139915868639943 0.08079762756824492 0.0002530658384785056 0.0030279741622507572 0.003609885228797794 0.05047157034277916 0.06353071331977844 0.7781693339347839 -81.88878631591797 48.99696731567383 0.2547702193260193 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.086739863851108e-06 8.41263910841393e-06 4.086739863851108e-06 8.41263910841393e-06 1 244694 NA NA NA NA gAt/gTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E247G NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5361323356628418 93.66231904029846 H 0.5158892273902893 0.003889231476932764 0.4802215397357941 C 0.040358148515224464 0.41850799322128296 0.0008361632353626193 0.0017452103784307835 0.003223419887945056 0.02561731077730656 0.060061153024435036 0.4496505558490753 -68.55755615234375 -35.924781799316406 0.1970788091421128 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.1290199987997775e-06 8.697935035247209e-06 4.1290199987997775e-06 8.697935035247209e-06 1 242188 NA NA NA NA gAg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E248D NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.5230167508125305 91.37102636694908 H 0.6024175882339478 0.002338475314900279 0.3952439725399017 H 0.04152311012148857 0.5104870796203613 0.0015141618205234408 0.0009721598471514881 0.002010607859119773 0.023582344874739647 0.05880265310406685 0.36110779643058777 -70.77190399169922 -33.25347900390625 0.2422855198383332 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.975250016694189e-06 1.4552903243953357e-05 NA NA NA NA 6.975250016694189e-06 1.4552903243953357e-05 1.0 143364.0 NA gaG/gaT NA 0.0 NA NA NA NA NA NA E248Q NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.5230167508125305 91.37102636694908 H 0.6024175882339478 0.002338475314900279 0.3952439725399017 H 0.04152311012148857 0.5104870796203613 0.0015141618205234408 0.0009721598471514881 0.002010607859119773 0.023582344874739647 0.05880265310406685 0.36110779643058777 -70.77190399169922 -33.25347900390625 0.2422855198383332 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.129400167585118e-06 8.904020345453642e-06 4.129400167585118e-06 8.904020345453642e-06 1 242166 NA NA NA NA Gag/Cag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R249H NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.42241305112838745 96.73258870840073 C 0.4802060723304749 0.0022322991862893105 0.5175615549087524 H 0.020659593865275383 0.4545935690402985 0.0017062677070498464 0.0009382431744597851 0.0017124852165579796 0.023671893402934074 0.04752872511744498 0.4491892158985138 -68.03000640869139 -31.54310417175293 0.3616432547569275 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.174839887127747e-06 9.790723756058496e-06 4.174839887127747e-06 9.790723756058496e-06 1 239530 NA NA NA NA cGc/cAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R249S NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.42241305112838745 96.73258870840073 C 0.4802060723304749 0.0022322991862893105 0.5175615549087524 H 0.020659593865275383 0.4545935690402985 0.0017062677070498464 0.0009382431744597851 0.0017124852165579796 0.023671893402934074 0.04752872511744498 0.4491892158985138 -68.03000640869139 -31.54310417175293 0.3616432547569275 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.486335697305849e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.486335697305849e-05 1.0 143336.0 NA Cgc/Agc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA E250K NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.445157527923584 77.76902012825012 C 0.4101356863975525 0.007839425466954708 0.5820249319076538 C 0.014989068731665613 0.34776395559310913 0.002196181332692504 0.003300473093986511 0.0057079377584159366 0.02319966070353985 0.029111946001648906 0.5737307667732239 -70.00395965576172 -37.13715362548828 0.3677815496921539 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.974959887884323e-06 1.6003287990192382e-05 NA NA NA NA 6.974959887884323e-06 1.6003287990192382e-05 1.0 143370.0 NA Gag/Aag NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R253Q NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.5170539021492004 118.4053435921669 C 0.30684560537338257 0.004566182848066092 0.6885882616043091 C 0.007106760516762734 0.28409433364868164 0.0014508669264614582 0.001603483920916915 0.003162511624395848 0.013211402110755444 0.026619117707014084 0.6627515554428101 -72.92241668701172 -34.865161895751946 0.586942195892334 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.7644326161926203e-05 1.7486827236598946e-05 2.1878800907870755e-05 8.813993467677004e-06 5 228532 6.277459760894999e-05 1.5103067435273072e-05 9.0 143370.0 cGg/cAg cGg/cAg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R254W NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.5281835198402405 120.95402604341507 C 0.230862557888031 0.005026272963732481 0.7641111612319946 C 0.008062680251896381 0.2073400616645813 0.001350579783320427 0.0017658325377851727 0.003475888865068555 0.01850913651287556 0.03423821926116944 0.7252576947212219 -76.23065948486328 -30.761707305908203 0.6323550939559937 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.377789991849569e-06 9.238197669914698e-06 4.377789991849569e-06 9.238197669914698e-06 1 228426 NA NA NA NA Cgg/Tgg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q255* NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 285666.0 pathogenic 2.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S256* NA NA NA Cytoplasmic|5 Phosphoserine;_by_PKA|1 NA NA NA NA NA disordered|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 849994.0 pathogenic 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V257M NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.44118094444274897 67.80951116085052 C 0.10018577426671982 0.004195944871753454 0.8956182599067688 C 0.0069690956734120854 0.08664900064468384 0.0006129585090093317 0.0009510968811810016 0.0030289827845990658 0.01687232218682766 0.01931815966963768 0.8655984401702881 -80.9679183959961 -22.183338165283203 0.7618712186813354 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 9.085380042961333e-06 1.014446823052423e-05 9.085380042961333e-06 1.014446823052423e-05 2 220134 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H260N NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.5943571925163269 108.11357331871989 C 0.03130801022052765 0.0029020789079368114 0.9657899141311646 C 0.007061826065182686 0.019574739038944244 0.000226604679482989 0.0012933710822835565 0.002036600606516004 0.02888222225010395 0.028831832110881805 0.912092924118042 -94.35285186767578 39.821205139160156 0.7975578904151917 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5697653246405613e-05 NA NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5697653246405613e-05 1.0 143366.0 NA Cac/Aac NA 0.0 NA NA NA NA NA NA S261L NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.4849629104137421 56.83765310049057 C 0.0019045104272663593 0.0010441894410178065 0.997051239013672 C 0.0004760988522320985 0.000933149305637926 5.365196102502523e-06 0.0004026342649012804 0.0005272849230095744 0.029297688975930214 0.0013250740012153985 0.9670326709747314 -95.87454223632812 130.11427307128906 0.8553361296653748 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 2.8929630659484227e-05 1.741932473659519e-05 1.4828099665464832e-05 1.032601296255927e-05 3 202318 4.88322002638597e-05 1.4028767963581655e-05 7.0 143348.0 tCg/tTg tCg/tTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P262L NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.6015160083770752 85.35512158870698 C 0.018900923430919647 0.0005990121280774474 0.9804999828338624 C 0.008040160872042179 0.005549554713070393 2.3282742404262532e-05 0.00015025724133010954 0.0003611902939155698 0.008047993294894695 0.015168984420597553 0.9626585841178894 -67.50373840332031 84.44633483886719 0.8624323606491089 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 17844.0 pathogenic 1.0 4.945625558133824e-05 1.979501587417626e-05 5.4896201618248604e-05 1.0780661413469928e-05 11 200378 4.185270154266618e-05 1.6601806918134262e-05 6.0 143360.0 cCg/cTg cCg/cTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P262R NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.6015160083770752 85.35512158870698 C 0.018900923430919647 0.0005990121280774474 0.9804999828338624 C 0.008040160872042179 0.005549554713070393 2.3282742404262532e-05 0.00015025724133010954 0.0003611902939155698 0.008047993294894695 0.015168984420597553 0.9626585841178894 -67.50373840332031 84.44633483886719 0.8624323606491089 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 4.990569777874043e-06 9.86763626536534e-06 4.990569777874043e-06 9.86763626536534e-06 1 200378 NA NA NA NA cCg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T269A NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.6899140477180481 95.69107841849329 C 0.0018641405040398238 0.002278810134157539 0.9958570599555968 C 0.000513537204824388 0.0007170565659180285 1.1589205541895351e-06 0.0005794523167423903 0.0009941037278622387 0.004836102016270161 0.002242306713014841 0.9901162981987 -95.94374084472656 133.06388854980472 0.9534127712249756 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.147920011135284e-05 1.2901076723578775e-05 1.147920011135284e-05 1.2901076723578775e-05 2 174228 NA NA NA NA Acc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T269N NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.6899140477180481 95.69107841849329 C 0.0018641405040398238 0.002278810134157539 0.9958570599555968 C 0.000513537204824388 0.0007170565659180285 1.1589205541895351e-06 0.0005794523167423903 0.0009941037278622387 0.004836102016270161 0.002242306713014841 0.9901162981987 -95.94374084472656 133.06388854980472 0.9534127712249756 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.770470124843996e-06 1.2738547191637164e-05 5.770470124843996e-06 1.2738547191637164e-05 1 173296 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K270R NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.7637741565704346 157.10834400653837 C 0.0009579217294231057 0.002406053710728884 0.9966360330581664 C 0.00029137995443306863 0.0002972941438201815 3.8511905131599633e-07 0.0006026367773301897 0.0008313703001476824 0.0009142635972239076 0.001376398024149239 0.995686411857605 -97.68775177001952 133.56834411621094 0.9726596474647522 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 9.551512129958498e-06 2.2929287939902038e-05 5.857749783899635e-06 1.4500935355739273e-05 1 170714 1.3949699678050821e-05 1.7761619274142998e-05 2.0 143372.0 aAg/aGg aAg/aGg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A271P NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.9155907630920408 100.89810209274292 C 1.3950540051155258e-05 2.8961612770217467e-06 0.9999831914901732 C 1.615738597138261e-06 2.8112037853134098e-06 8.705297593891714e-11 8.222297651627741e-07 7.818873655196512e-07 1.676204556133598e-05 1.4649201148131397e-05 0.9999625682830808 -93.22439575195312 147.9992218017578 0.9797850251197816 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.2118300219299272e-05 1.4899169517840177e-05 1.2118300219299272e-05 1.4899169517840177e-05 2 165040 NA NA NA NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A271V NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA disordered|1 e 0.9155907630920408 100.89810209274292 C 1.3950540051155258e-05 2.8961612770217467e-06 0.9999831914901732 C 1.615738597138261e-06 2.8112037853134098e-06 8.705297593891714e-11 8.222297651627741e-07 7.818873655196512e-07 1.676204556133598e-05 1.4649201148131397e-05 0.9999625682830808 -93.22439575195312 147.9992218017578 0.9797850251197816 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.046900125511456e-06 1.2089731996160875e-05 6.046900125511456e-06 1.2089731996160875e-05 1 165374 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA