# -------------------- # version: 0 # protein: # name: NPC1_HUMAN # organism: Homo sapiens (Human) # uniprot: O15118 # sequence: MTARGLALGLLLLLLCPAQVFSQSCVWYGECGIAYGDKRYNCEYSGPPKPLPKDGYDLVQELCPGFFFGNVSLCCDVRQLQTLKDNLQLPLQFLSRCPSCFYNLLNLFCELTCSPRQSQFLNVTATEDYVDPVTNQTKTNVKELQYYVGQSFANAMYNACRDVEAPSSNDKALGLLCGKDADACNATNWIEYMFNKDNGQAPFTITPVFSDFPVHGMEPMNNATKGCDESVDEVTAPCSCQDCSIVCGPKPQPPPPPAPWTILGLDAMYVIMWITYMAFLLVFFGAFFAVWCYRKRYFVSEYTPIDSNIAFSVNASDKGEASCCDPVSAAFEGCLRRLFTRWGSFCVRNPGCVIFFSLVFITACSSGLVFVRVTTNPVDLWSAPSSQARLEKEYFDQHFGPFFRTEQLIIRAPLTDKHIYQPYPSGADVPFGPPLDIQILHQVLDLQIAIENITASYDNETVTLQDICLAPLSPYNTNCTILSVLNYFQNSHSVLDHKKGDDFFVYADYHTHFLYCVRAPASLNDTSLLHDPCLGTFGGPVFPWLVLGGYDDQNYNNATALVITFPVNNYYNDTEKLQRAQAWEKEFINFVKNYKNPNLTISFTAERSIEDELNRESDSDVFTVVISYAIMFLYISLALGHMKSCRRLLVDSKVSLGIAGILIVLSSVACSLGVFSYIGLPLTLIVIEVIPFLVLAVGVDNIFILVQAYQRDERLQGETLDQQLGRVLGEVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSVMPAVHTFSLFAGLAVFIDFLLQITCFVSLLGLDIKRQEKNRLDIFCCVRGAEDGTSVQASESCLFRFFKNSYSPLLLKDWMRPIVIAIFVGVLSFSIAVLNKVDIGLDQSLSMPDDSYMVDYFKSISQYLHAGPPVYFVLEEGHDYTSSKGQNMVCGGMGCNNDSLVQQIFNAAQLDNYTRIGFAPSSWIDDYFDWVKPQSSCCRVDNITDQFCNASVVDPACVRCRPLTPEGKQRPQGGDFMRFLPMFLSDNPNPKCGKGGHAAYSSAVNILLGHGTRVGATYFMTYHTVLQTSADFIDALKKARLIASNVTETMGINGSAYRVFPYSVFYVFYEQYLTIIDDTIFNLGVSLGAIFLVTMVLLGCELWSAVIMCATIAMVLVNMFGVMWLWGISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHITRAFTVSMKGSRVERAEEALAHMGSSVFSGITLTKFGGIVVLAFAKSQIFQIFYFRMYLAMVLLGATHGLIFLPVLLSYIGPSVNKAKSCATEERYKGTERERLLNF # diabetes_genes: True # membrane_protein: True # human_proteome: True # merged: # file_00: prism_uniprot_XXX_O15118.txt (version 1) # file_01: prism_netsurfp_001_O15118.txt (version 1) # file_02: prism_clinvar_XXX_O15118-NPC1-NM_000271.txt (version 1) # file_03: prism_gnomad_001_O15118-ENST00000269228-ENSG00000141458.mis.txt (version 1) # file_04: prism_spliceai_XXX_O15118-ENST00000269228-ENSG00000141458.txt (version 1) # file_05: prism_pdb_XXX_O15118-3jd8-A.txt (version 1) # file_06: prism_pdb_XXX_O15118-6w5s-A.txt (version 1) # file_07: prism_pdb_XXX_O15118-5f1b-C.txt (version 1) # file_08: prism_pdb_XXX_O15118-5jnx-A.txt (version 1) # file_09: prism_pdb_XXX_O15118-6uox-A.txt (version 1) # file_10: prism_pdb_XXX_O15118-5hns-A.txt (version 1) # file_11: prism_pdb_XXX_O15118-5u74-A.txt (version 1) # file_12: prism_pdb_XXX_O15118-5hns-B.txt (version 1) # file_13: prism_pdb_XXX_O15118-6w5t-A.txt (version 1) # file_14: prism_pdb_XXX_O15118-6w5u-A.txt (version 1) # file_15: prism_pdb_XXX_O15118-3gki-A.txt (version 1) # file_16: prism_pdb_XXX_O15118-5kwy-A.txt (version 1) # file_17: prism_pdb_XXX_O15118-5f18-A.txt (version 1) # file_18: prism_pdb_XXX_O15118-5u73-A.txt (version 1) # file_19: prism_pdb_XXX_O15118-5kwy-B.txt (version 1) # file_20: prism_pdb_XXX_O15118-6w5r-A.txt (version 1) # file_21: prism_pdb_XXX_O15118-6w5v-A.txt (version 1) # file_22: prism_pdb_XXX_O15118-3gkj-A.txt (version 1) # file_23: prism_pdb_XXX_O15118-3gkh-A.txt (version 1) # variants: # number: 1202 # coverage: 0.601 # depth: 1.565 # width: single mutants # columns: # uniprot;pfam_name_00: pfam_name # uniprot;TRANSMEM_00: TRANSMEM # uniprot;TOPO_DOM_00: TOPO_DOM # uniprot;CARBOHYD_00: CARBOHYD # uniprot;SIGNAL_00: SIGNAL # uniprot;DISULFID_00: DISULFID # uniprot;STRAND_00: STRAND # uniprot;HELIX_00: HELIX # uniprot;TURN_00: TURN # uniprot;COMPBIAS_00: COMPBIAS # uniprot;MOTIF_00: MOTIF # uniprot;REGION_00: REGION # netsurfp;burried_exposed_01: Classification if residue is burried (RSA <= 0.25) or exposed (RSA > 0.25) # netsurfp;rsa_01: Relative Surface Accessibility # netsurfp;asa_01: Absolute Surface Accessibility # netsurfp;q3_ss_pred_01: Secondary structure prediction in 3 class scheme (q3) # netsurfp;p_q3_H_01: probability of class H (helix) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_E_01: probability of class E (strand) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_C_01: probability of class C (coil) in q3 assignment # netsurfp;q8_ss_pred_01: Secondary structure prediction in 8 class scheme (q8) # netsurfp;p_q8_G_01: probability of class G (3-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_H_01: probability of class H (4-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_I_01: probability of class I (5-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_B_01: probability of class B (isolated beta-bridge) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_E_01: probability of class E (strand) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_S_01: probability of class S (bend) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_T_01: probability of class T (turn) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_C_01: probability of class C (coil) in q8 assignment # netsurfp;phi_01: phi angle # netsurfp;psi_01: psi angle # netsurfp;disorder_01: probability of residue being disordered # clinvar;Clinvar_ID_02: Clinvar_ID # clinvar;Clinvar_signifiance_02: Clinvar_signifiance # clinvar;Clinvar_review_status_02: Clinvar_review_status # gnomad;AF_tot_03: Frequency estimate of the variant allele from exome and genome data combined (if present in both, otherwise just AF_ex or AF_g). Calculated as (AC*_ex + AC*_g) / (max(AN_ex) + max(AN_g)) where AC*_ex = sum(AF_ex_i) * max(AN_ex) # gnomad;std_AF_tot_03: Error estimate on AF_tot from error propagation # gnomad;AF_ex_03: Variant allel frequency in exomes data # gnomad;std_AF_ex_03: Error estimate on AF_ex derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_ex_03: Counts of variant allel in exomes data # gnomad;AN_ex_03: Total allel counts at this site in exomes data # gnomad;AF_g_03: Variant allel frequency in genomes data # gnomad;std_AF_g_03: Error estimate on AF_g derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_g_03: Counts of variant allel in genomes data # gnomad;AN_g_03: Total allel counts at this site in genomes data # gnomad;Codons_ex_03: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Codons_g_03: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Homozygotes_ex_03: Number of individuals homozygous for the variant in exome data # gnomad;Homozygotes_g_03: Number of individuals homozygous for the variant in genome data # spliceai;maxdelta_04: naximum delta score # spliceai;DS_AG_04: delta score for acceptor gain # spliceai;DS_AL_04: delta score for acceptor loss # spliceai;DS_DG_04: delta score for donor gain # spliceai;DS_DL_04: delta score for donor loss # spliceai;HGVSc_04: change on nucleotide level # pdb;SS_05: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_05: Accessible surface area # pdb;SS_06: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_06: Accessible surface area # pdb;SS_07: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_07: Accessible surface area # pdb;SS_08: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_08: Accessible surface area # pdb;SS_09: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_09: Accessible surface area # pdb;SS_10: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_10: Accessible surface area # pdb;SS_11: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_11: Accessible surface area # pdb;SS_12: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_12: Accessible surface area # pdb;SS_13: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_13: Accessible surface area # pdb;SS_14: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_14: Accessible surface area # pdb;SS_15: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_15: Accessible surface area # pdb;SS_16: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_16: Accessible surface area # pdb;SS_17: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_17: Accessible surface area # pdb;SS_18: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_18: Accessible surface area # pdb;SS_19: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_19: Accessible surface area # pdb;SS_20: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_20: Accessible surface area # pdb;SS_21: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_21: Accessible surface area # pdb;SS_22: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_22: Accessible surface area # pdb;SS_23: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_23: Accessible surface area # pdb;IDs: PDB_ID + chain # -------------------- # # variant uniprot;pfam_name_00 uniprot;TRANSMEM_00 uniprot;TOPO_DOM_00 uniprot;CARBOHYD_00 uniprot;SIGNAL_00 uniprot;DISULFID_00 uniprot;STRAND_00 uniprot;HELIX_00 uniprot;TURN_00 uniprot;COMPBIAS_00 uniprot;MOTIF_00 uniprot;REGION_00 netsurfp;burried_exposed_01 netsurfp;rsa_01 netsurfp;asa_01 netsurfp;q3_ss_pred_01 netsurfp;p_q3_H_01 netsurfp;p_q3_E_01 netsurfp;p_q3_C_01 netsurfp;q8_ss_pred_01 netsurfp;p_q8_G_01 netsurfp;p_q8_H_01 netsurfp;p_q8_I_01 netsurfp;p_q8_B_01 netsurfp;p_q8_E_01 netsurfp;p_q8_S_01 netsurfp;p_q8_T_01 netsurfp;p_q8_C_01 netsurfp;phi_01 netsurfp;psi_01 netsurfp;disorder_01 pdb;SS_05 pdb;ASA_05 pdb;SS_06 pdb;ASA_06 pdb;SS_07 pdb;ASA_07 pdb;SS_08 pdb;ASA_08 pdb;SS_09 pdb;ASA_09 pdb;SS_10 pdb;ASA_10 pdb;SS_11 pdb;ASA_11 pdb;SS_12 pdb;ASA_12 pdb;SS_13 pdb;ASA_13 pdb;SS_14 pdb;ASA_14 pdb;SS_15 pdb;ASA_15 pdb;SS_16 pdb;ASA_16 pdb;SS_17 pdb;ASA_17 pdb;SS_18 pdb;ASA_18 pdb;SS_19 pdb;ASA_19 pdb;SS_20 pdb;ASA_20 pdb;SS_21 pdb;ASA_21 pdb;SS_22 pdb;ASA_22 pdb;SS_23 pdb;ASA_23 pdb;IDs clinvar;Clinvar_ID_02 clinvar;Clinvar_signifiance_02 clinvar;Clinvar_review_status_02 gnomad;AF_tot_03 gnomad;std_AF_tot_03 gnomad;AF_ex_03 gnomad;std_AF_ex_03 gnomad;AC_ex_03 gnomad;AN_ex_03 gnomad;AF_g_03 gnomad;std_AF_g_03 gnomad;AC_g_03 gnomad;AN_g_03 gnomad;Codons_ex_03 gnomad;Codons_g_03 gnomad;Homozygotes_ex_03 gnomad;Homozygotes_g_03 spliceai;maxdelta_04 spliceai;DS_AG_04 spliceai;DS_AL_04 spliceai;DS_DG_04 spliceai;DS_DL_04 spliceai;HGVSc_04 M1I NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.8287155628204346 165.825984120369 C 7.1232802838494536e-06 3.768883232169173e-07 0.9999924898147584 C 2.2313983549793195e-07 1.1445407608334792e-06 1.6974488481480418e-10 1.8377610899733554e-07 8.455180733335509e-08 2.9076718419673853e-06 4.3050290514656825e-06 0.9999910593032836 -80.27399444580078 154.09286499023438 0.9986875653266908 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 551469 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA M1V NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.8287155628204346 165.825984120369 C 7.1232802838494536e-06 3.768883232169173e-07 0.9999924898147584 C 2.2313983549793195e-07 1.1445407608334792e-06 1.6974488481480418e-10 1.8377610899733554e-07 8.455180733335509e-08 2.9076718419673853e-06 4.3050290514656825e-06 0.9999910593032836 -80.27399444580078 154.09286499023438 0.9986875653266908 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 371098 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T2I NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.8130524158477783 112.77037007808686 C 8.587588672526181e-05 2.899506944231689e-05 0.9998850822448728 C 6.14502687312779e-06 1.5224745766317938e-05 1.0126300686863487e-08 6.113590643508361e-06 9.872891496343073e-06 7.216383528430015e-05 4.6010194637347006e-05 0.9998445510864258 -87.7914810180664 151.28945922851562 0.9983273148536682 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.6679474038213777e-05 NA NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.6679474038213777e-05 1 143340 NA aCc/aTc NA 0 NA NA NA NA NA NA A3T NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.691230058670044 76.17355246543885 C 0.0004953455063514411 4.890124546363951e-05 0.9994557499885559 C 3.275938070146367e-05 0.00015232007717713714 2.154272209509145e-07 9.020022844197227e-06 2.459756433381699e-05 0.0003370412741787732 0.00016434643475804478 0.9992796778678894 -80.18406677246094 154.41175842285156 0.996757447719574 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 555997 VUS 2 5.130122821517318e-05 2.1109286812569274e-05 2.3155300368671305e-05 1.5235454622445237e-05 3 129560 7.674170046811922e-05 1.4611054451432425e-05 11 143338 Gct/Act Gct/Act 0 0 NA NA NA NA NA NA R4C NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.700238823890686 160.3546906709671 C 0.0005142174195498228 0.0001243088481714949 0.9993614554405212 C 3.5596807720139616e-05 0.00015674415044486523 2.441288415866439e-07 1.9722194338100962e-05 6.862701411591843e-05 0.00028544236556626856 0.00016855208377819506 0.9992650151252748 -82.89228820800781 146.02687072753906 0.9947934746742249 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.715570063737688e-06 1.5564105822451583e-05 7.715570063737688e-06 1.5564105822451583e-05 1 129608 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G5S NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.659718930721283 51.91987984776497 C 0.0008236594148911536 6.018063868395984e-05 0.9991161227226256 C 5.64932961424347e-05 0.00027387356385588646 6.605994826713868e-07 8.153150702128187e-06 3.600393029046245e-05 0.00038367146044038236 0.00035858777118846774 0.9988825917243958 -56.11764907836914 -89.61530303955078 0.9941763877868652 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.622165963770707e-05 NA NA NA NA 1.3952800145489167e-05 1.622165963770707e-05 2 143340 NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA L8F NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.668018102645874 122.31411459445951 C 0.0004951421869918704 1.3264207154861653e-05 0.9994915723800659 C 1.7932778064277954e-05 0.0001128343428717926 8.514246729873778e-08 2.007505372603191e-06 6.014403425069759e-06 0.00012021249858662483 7.23703415133059e-05 0.9996684789657592 -72.4880142211914 -34.64754104614258 0.9988178610801696 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.3260065821605926e-06 2.41188043081378e-05 7.713430022704415e-06 1.9339484313220176e-05 1 129644 6.97564018992125e-06 1.441183776459328e-05 1 143356 Ctt/Ttt Ctt/Ttt 0 0 NA NA NA NA NA NA G9S NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6404463648796082 50.40312891602515 C 0.0003705086128320545 6.181975095387315e-06 0.9996232986450196 C 7.64513333706418e-06 8.846205309964715e-05 6.218022008397384e-08 4.982491077498705e-07 2.6165810140810213e-06 6.998592289164662e-05 5.550838613999076e-05 0.9997753500938416 -69.57841491699219 -53.23954772949219 0.9989753961563108 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.326599162545253e-06 2.199969008196729e-05 7.713790182606317e-06 1.5720070768273818e-05 1 129638 6.976420081628021e-06 1.539044309768478e-05 1 143340 Ggc/Agc Ggc/Agc 0 0 NA NA NA NA NA NA L10F NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6914252042770386 126.59995490312576 C 0.00033071896177716564 3.46387582794705e-06 0.9996658563613892 C 8.33403282740619e-06 6.835853127995506e-05 7.60911547104115e-08 3.868888711622276e-07 1.3667772691405844e-06 5.5457287089666345e-05 3.69398039765656e-05 0.9998290538787842 -72.66395568847656 -44.17196273803711 0.999643087387085 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.716410436842125e-06 1.96825626866488e-05 7.716410436842125e-06 1.96825626866488e-05 1 129594 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L11V NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.7058225274085999 129.23610476851462 C 0.0002404852129984647 2.2924377844901755e-06 0.9997572302818298 C 6.5804151745396675e-06 3.9190854295156896e-05 6.952775777335772e-08 2.8502873306024407e-07 8.025742772588274e-07 5.1952982175862423e-05 3.172471042489633e-05 0.9998693466186525 -72.61846160888672 -44.476783752441406 0.9998058676719666 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.4658356654793826e-05 1.9910555718714248e-05 7.72140992921777e-06 1.503785649144179e-05 1 129510 2.092460090352688e-05 1.3049639886633909e-05 3 143372 Ctc/Gtc Ctc/Gtc 0 0 NA NA NA NA NA NA L14P NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.7693820595741272 140.8738551080227 C 0.00015879557759035381 1.9146968952554744e-06 0.9998393058776855 C 7.67742585594533e-06 2.6626403268892318e-05 5.613738096599264e-08 3.918522111234779e-07 7.3025495339607e-07 7.601964171044527e-05 4.188545790384524e-05 0.9998466968536376 -76.06563568115234 -38.32847213745117 0.9998962879180908 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.727019692538306e-06 1.68575370741148e-05 7.727019692538306e-06 1.68575370741148e-05 1 129416 NA NA NA NA cTa/cCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L15M NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.7315284013748169 133.94285029172894 C 0.00024196552112698555 4.882912890025182e-06 0.9997531771659852 C 1.59109022206394e-05 4.653167707147077e-05 1.3188902414640324e-07 1.1368206287443172e-06 1.9993708519905344e-06 0.00016164046246558428 7.409054524032399e-05 0.999698519706726 -80.79046630859375 -29.75771331787109 0.9997714161872864 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.728809578111395e-06 1.6612988447672087e-05 7.728809578111395e-06 1.6612988447672087e-05 1 129386 NA NA NA NA Ctg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C16R NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6713886857032776 94.2629714727402 C 0.0001103985050576739 5.9277731452311855e-06 0.9998836517333984 C 7.450710654666182e-06 1.7483151168562472e-05 3.381849822403637e-08 1.3395423366091563e-06 1.9370168047316842e-06 0.00020287009829189628 3.466388079687023e-05 0.9997342228889464 -87.11763763427734 150.71820068359375 0.9997883439064026 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.4577524938383387e-05 NA NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.4577524938383387e-05 1 143310 NA Tgt/Cgt NA 0 NA NA NA NA NA NA C16Y NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6713886857032776 94.2629714727402 C 0.0001103985050576739 5.9277731452311855e-06 0.9998836517333984 C 7.450710654666182e-06 1.7483151168562472e-05 3.381849822403637e-08 1.3395423366091563e-06 1.9370168047316842e-06 0.00020287009829189628 3.466388079687023e-05 0.9997342228889464 -87.11763763427734 150.71820068359375 0.9997883439064026 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.547009924252052e-05 1.6497763130950574e-05 1.547009924252052e-05 1.6497763130950574e-05 2 129282 NA NA NA NA tGt/tAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A18T NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.7036998271942139 77.54772095680238 C 0.002403782214969397 0.0004913808079436421 0.997104823589325 C 0.000494574080221355 0.0006998088792897763 3.119035682175308e-06 9.131612023338675e-05 0.0002201561292167753 0.0010598277440294623 0.0011991973733529446 0.996231973171234 -89.3786392211914 147.23915100097656 0.9968193769454956 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.4354977805939582e-05 NA NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.4354977805939582e-05 2 143370 NA Gcg/Acg NA 0 NA NA NA NA NA NA Q19* NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.0 0.0 0.31 0.03 55C>T Q19= NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6865914463996887 122.6252323269844 C 0.0046230498701334 0.00518688140437007 0.990190088748932 C 0.0010496036848053336 0.0012548533268272875 1.0489746273378842e-05 0.0008051228942349553 0.002461883006617427 0.003015667200088501 0.002265998395159841 0.9891364574432372 -91.80287170410156 129.93905639648438 0.974240243434906 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.0 0.0 0.0 0.41 57G>A Q19H NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6865914463996887 122.6252323269844 C 0.0046230498701334 0.00518688140437007 0.990190088748932 C 0.0010496036848053336 0.0012548533268272875 1.0489746273378842e-05 0.0008051228942349553 0.002461883006617427 0.003015667200088501 0.002265998395159841 0.9891364574432372 -91.80287170410156 129.93905639648438 0.974240243434906 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.64 0.0 0.0 0.0 0.64 57G>C V20L NA NA NA NA SIGNAL|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5038433670997621 77.44072552323341 C 0.01497615687549114 0.033759813755750656 0.9512640833854676 C 0.004851410631090404 0.008179128170013428 0.00010573599865892902 0.0060495943762362 0.02618261426687241 0.01914788223803044 0.022598134353756905 0.9128854870796204 -92.5169448852539 122.36295318603516 0.8415656089782715 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.601046311736929e-06 1.7984326088661996e-05 3.97730991608114e-06 9.087634379285654e-06 1 251426 1.3961000149720347e-05 1.5519371322697127e-05 2 143256 Gtg/Ttg Gtg/Ttg 0 0 0.43 0.43 0.02 0.0 0.0 58G>T S24A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3392960429191589 39.76549623012543 C 0.01756155490875244 0.3719754815101624 0.61046302318573 C 0.009937060065567492 0.006274491082876921 0.00017406867118552333 0.02733413688838482 0.3490089774131775 0.12091369181871416 0.06957966834306717 0.4167779386043549 -112.38473510742188 139.27455139160156 0.0470341295003891 - 0.24615384615384614 - 0.17692307692307693 NA NA - 0.24615384615384614 - 0.676923076923077 NA NA NA NA NA NA - 0.16923076923076924 - 0.2384615384615385 - 0.26153846153846155 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.2076923076923077 - 0.2307692307692308 - 0.24615384615384614 - 0.26153846153846155 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 70T>G W27* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.00881057268722467 E 0.01762114537444934 NA NA E 0.013215859030837005 E 0.09251101321585904 NA NA NA NA NA NA S 0.07048458149779736 E 0.06167400881057269 E 0.00881057268722467 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.02643171806167401 S 0.04405286343612335 E 0.00881057268722467 E 0.00881057268722467 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 838982 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Y28C NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA b 0.20193949341773987 43.15446974337101 E 0.06535360962152481 0.5988249182701111 0.3358214497566223 E 0.0227994117885828 0.049103714525699615 0.0039438693784177295 0.047138936817646034 0.5239678025245667 0.06530062109231949 0.10592526197433473 0.18182043731212616 -109.7364501953125 135.04129028320312 0.007824638858437538 E 0.19369369369369369 E 0.2072072072072072 NA NA E 0.20270270270270271 E 0.2702702702702703 NA NA NA NA NA NA - 0.22072072072072071 E 0.3648648648648649 E 0.20270270270270271 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.32432432432432434 - 0.2297297297297297 E 0.19369369369369369 E 0.20270270270270271 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.3959999705548398e-05 1.4751934384415603e-05 NA NA NA NA 1.3959999705548398e-05 1.4751934384415603e-05 2 143266 NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA E30D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.3912538886070252 68.35205433964728 C 0.02955862134695053 0.28090262413024897 0.6895387768745422 T 0.02298660017549992 0.012865941971540451 0.0011217998107895255 0.021816624328494072 0.2314410209655761 0.12221983820199965 0.4161172807216644 0.17143094539642334 -101.3278350830078 54.288307189941406 0.01325812004506588 E 0.22164948453608246 E 0.17010309278350516 NA NA E 0.2268041237113402 - 0.3402061855670103 NA NA NA NA NA NA - 0.24742268041237114 E 0.17010309278350516 E 0.21134020618556698 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2422680412371134 B 0.15979381443298968 E 0.23195876288659795 E 0.21134020618556698 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976740117650479e-06 8.914130273319387e-06 3.976740117650479e-06 8.914130273319387e-06 1 251462 NA NA NA NA gaG/gaC NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E30V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.3912538886070252 68.35205433964728 C 0.02955862134695053 0.28090262413024897 0.6895387768745422 T 0.02298660017549992 0.012865941971540451 0.0011217998107895255 0.021816624328494072 0.2314410209655761 0.12221983820199965 0.4161172807216644 0.17143094539642334 -101.3278350830078 54.288307189941406 0.01325812004506588 E 0.22164948453608246 E 0.17010309278350516 NA NA E 0.2268041237113402 - 0.3402061855670103 NA NA NA NA NA NA - 0.24742268041237114 E 0.17010309278350516 E 0.21134020618556698 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2422680412371134 B 0.15979381443298968 E 0.23195876288659795 E 0.21134020618556698 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 597904 VUS 1 1.2669179731032895e-05 1.7134263763014867e-05 3.976740117650479e-06 8.353691218706807e-06 1 251462 2.7933700039284307e-05 1.4959907677625055e-05 4 143196 gAg/gTg gAg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA G32R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.28937166929244995 22.773550373315807 C 0.006407464854419231 0.08929341286420822 0.9042991399765016 T 0.005743012763559818 0.0014659437583759427 0.00021444071899168201 0.012280480936169623 0.08522797375917435 0.2576912045478821 0.32157522439956665 0.3158017694950104 90.15870666503906 5.632669925689697 0.00811972189694643 E 0.08333333333333333 - 0.0 NA NA E 0.08333333333333333 - 0.5595238095238095 NA NA NA NA NA NA - 0.0 E 0.16666666666666666 E 0.08333333333333333 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.0 E 0.08333333333333333 E 0.08333333333333333 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.953300155350007e-06 8.680639924976764e-06 7.953300155350007e-06 8.680639924976764e-06 2 251468 NA NA NA NA Gga/Aga NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I33F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.4348406195640564 80.44551461935043 C 0.004849437158554792 0.4239618480205536 0.5711886882781982 E 0.0037056559231132273 0.000986870494671166 9.201547800330444e-05 0.06801929324865341 0.373003214597702 0.1538112908601761 0.02881932444870472 0.37156230211257935 -102.4770965576172 140.13796997070312 0.010404954664409159 E 0.4674556213017752 - 0.4970414201183432 NA NA E 0.4792899408284024 E 0.6331360946745562 NA NA NA NA NA NA - 0.4733727810650887 E 0.5207100591715976 E 0.4792899408284024 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5443786982248521 - 0.485207100591716 E 0.4674556213017752 E 0.485207100591716 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.3956900147604754e-05 1.6844592086884628e-05 NA NA NA NA 1.3956900147604754e-05 1.6844592086884628e-05 2 143298 NA Att/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA I33T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.4348406195640564 80.44551461935043 C 0.004849437158554792 0.4239618480205536 0.5711886882781982 E 0.0037056559231132273 0.000986870494671166 9.201547800330444e-05 0.06801929324865341 0.373003214597702 0.1538112908601761 0.02881932444870472 0.37156230211257935 -102.4770965576172 140.13796997070312 0.010404954664409159 E 0.4674556213017752 - 0.4970414201183432 NA NA E 0.4792899408284024 E 0.6331360946745562 NA NA NA NA NA NA - 0.4733727810650887 E 0.5207100591715976 E 0.4792899408284024 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5443786982248521 - 0.485207100591716 E 0.4674556213017752 E 0.485207100591716 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.123394485272129e-06 3.97652001993265e-06 8.123394485272129e-06 1 251476 NA NA NA NA aTt/aCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y35H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|1 NA NA NA NA NA e 0.5092731118202211 108.83166399598122 E 0.028326600790023807 0.5348746180534363 0.4367987513542175 E 0.029727853834629062 0.003942543175071478 6.0522041167132556e-05 0.0400446318089962 0.4935342669487 0.07944003492593765 0.12880149483680725 0.22444866597652435 -108.06112670898438 104.57288360595705 0.01681770756840706 E 0.30180180180180183 B 0.3963963963963964 NA NA E 0.3108108108108108 E 0.34234234234234234 NA NA NA NA NA NA B 0.5135135135135135 E 0.35135135135135137 E 0.3153153153153153 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.5 S 0.6621621621621622 E 0.3108108108108108 E 0.3108108108108108 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.599232606522842e-06 1.8852252425499e-05 3.976590051024687e-06 8.766130781040659e-06 1 251472 1.3956299881101584e-05 1.66901879151921e-05 2 143304 Tat/Cat Tat/Cat 0 0 NA NA NA NA NA NA D37G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7995219826698303 115.21111770272259 C 0.03826868906617165 0.03804203122854233 0.923689305782318 T 0.04353966563940048 0.0035663754679262642 4.857796739088371e-05 0.004960636142641306 0.0252013485878706 0.2615027129650116 0.4700967073440552 0.19108393788337708 -83.06378936767578 23.974651336669922 0.015175772830843925 T 0.8036809815950919 T 0.6134969325153374 NA NA T 0.8159509202453987 T 0.5644171779141104 NA NA NA NA NA NA T 0.558282208588957 T 0.7607361963190185 T 0.8159509202453987 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5521472392638037 T 0.5644171779141104 T 0.7975460122699386 T 0.8159509202453987 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 5.82635257710193e-05 1.7162343545810658e-05 7.555510092061013e-05 8.088652249000093e-06 19 251472 2.791619954223279e-05 1.5136701780083222e-05 4 143286 gAc/gGc gAc/gGc 0 0 NA NA NA NA NA NA E43K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|2 NA NA NA NA NA e 0.3288059234619141 57.44239482879639 C 0.0517318956553936 0.1958794742822647 0.752388596534729 T 0.0595838874578476 0.013105527497828008 0.00023472493921872223 0.02593948319554329 0.1375240683555603 0.17037825286388394 0.320227712392807 0.27300626039505005 -76.67430877685547 36.09846878051758 0.0013332786038517954 E 0.4175257731958763 E 0.38144329896907214 NA NA E 0.4175257731958763 E 0.3247422680412371 NA NA NA NA NA NA - 0.27835051546391754 E 0.3505154639175257 E 0.4381443298969072 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.1958762886597938 - 0.34536082474226804 E 0.42268041237113396 E 0.4329896907216495 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.013369581981932e-05 1.7855802375289177e-05 1.1930200344067998e-05 8.1905093745264e-06 3 251462 6.980319994909222e-06 1.586648148302508e-05 1 143260 Gaa/Aaa Gaa/Aaa 0 0 NA NA NA NA NA NA G46V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.21270984411239624 16.740264731645585 C 0.0009345914586447179 0.08581753075122832 0.91324782371521 S 0.000194434032891877 0.00011668705701595171 9.234804565494414e-06 0.017937354743480682 0.028911016881465912 0.7587283253669739 0.005521771963685751 0.18858110904693606 173.93753051757812 -172.75338745117188 0.001021530944854021 S 0.21428571428571427 S 0.21428571428571427 NA NA S 0.19047619047619047 S 0.3690476190476191 NA NA NA NA NA NA S 0.21428571428571427 S 0.19047619047619047 S 0.2261904761904762 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.2023809523809524 S 0.21428571428571427 S 0.21428571428571427 S 0.2261904761904762 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.533484263551831e-05 NA NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.533484263551831e-05 1 143250 NA gGc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA P50L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5811699032783508 82.46800927519799 E 8.231682841142174e-06 0.8940527439117432 0.1059390902519226 E 2.5938250018953117e-06 1.9373178474779702e-06 1.8744332308529007e-08 0.09374632686376573 0.7678382396697998 0.0031285237055271864 0.0002581870066933334 0.13502416014671326 -61.2667350769043 140.27853393554688 0.0010839919559657574 E 0.6029411764705882 - 0.7426470588235294 NA NA E 0.5955882352941176 E 0.6029411764705882 NA NA NA NA NA NA - 0.6102941176470589 - 0.5441176470588235 E 0.5441176470588235 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7720588235294118 - 0.36764705882352944 E 0.5073529411764706 E 0.5073529411764706 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976780135417357e-06 8.898609616458154e-06 3.976780135417357e-06 8.898609616458154e-06 1 251460 NA NA NA NA cCa/cTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P52L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.407696932554245 57.852194729447355 C 0.0047801341861486435 0.0035980220418423406 0.9916218519210817 C 0.0006105263018980622 0.0015403185971081257 1.1519396139192395e-05 0.001444547320716083 0.0017772150458768012 0.01535123586654663 0.00298501318320632 0.9762796759605408 -65.01224517822266 155.88319396972656 0.0013569063739851115 - 0.4338235294117647 - 0.5220588235294118 NA NA - 0.4264705882352941 - 0.3088235294117647 NA NA NA NA NA NA - 0.5220588235294118 - 0.38235294117647056 - 0.4044117647058824 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6029411764705882 - 0.5 - 0.4117647058823529 - 0.4117647058823529 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.4186548201063507e-05 NA NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.4186548201063507e-05 1 143238 NA cCa/cTa NA 0 NA NA NA NA NA NA G55E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA NA b 0.037726759910583496 2.969096004962921 H 0.9496232271194458 0.00018798612290993333 0.05018876865506172 H 0.1061192899942398 0.8318953514099121 0.0010573634644970298 0.0002080641861539334 8.066581358434632e-05 0.008966750465333462 0.02873810194432736 0.022934453561902046 -69.79154205322266 -31.396738052368164 0.0015518411528319118 G 0.0 - 0.09523809523809523 NA NA G 0.0 T 0.05952380952380953 NA NA NA NA NA NA - 0.08333333333333333 S 0.047619047619047616 G 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.10714285714285714 - 0.011904761904761904 G 0.0 G 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5907200577203184e-05 9.896431209464043e-06 1.5907200577203184e-05 9.896431209464043e-06 4 251458 NA NA NA NA gGa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G55R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA NA b 0.037726759910583496 2.969096004962921 H 0.9496232271194458 0.00018798612290993333 0.05018876865506172 H 0.1061192899942398 0.8318953514099121 0.0010573634644970298 0.0002080641861539334 8.066581358434632e-05 0.008966750465333462 0.02873810194432736 0.022934453561902046 -69.79154205322266 -31.396738052368164 0.0015518411528319118 G 0.0 - 0.09523809523809523 NA NA G 0.0 T 0.05952380952380953 NA NA NA NA NA NA - 0.08333333333333333 S 0.047619047619047616 G 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.10714285714285714 - 0.011904761904761904 G 0.0 G 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.514855105943729e-05 NA NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.514855105943729e-05 1 143290 NA Gga/Aga NA 0 NA NA NA NA NA NA Y56C NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA b 0.23432376980781555 50.074989607930185 H 0.9909942746162416 0.00023275475541595367 0.008772959001362324 H 0.005163954105228186 0.9868479371070862 0.0008007365395314991 6.455527181969956e-05 0.00010019411274697632 0.0006311183678917588 0.002894837874919176 0.003496713005006313 -60.63447952270508 -42.129638671875 0.0004886271199211478 H 0.2297297297297297 H 0.28378378378378377 NA NA H 0.23423423423423426 H 0.2117117117117117 NA NA NA NA NA NA H 0.463963963963964 H 0.2612612612612613 H 0.2117117117117117 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2072072072072072 H 0.3963963963963964 H 0.22522522522522526 H 0.2477477477477477 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976870175392833e-06 8.281069773998847e-06 3.976870175392833e-06 8.281069773998847e-06 1 251454 NA NA NA NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D57N NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA e 0.6292998790740967 90.68211257457732 H 0.996075451374054 5.395205516833812e-05 0.003870564280077815 H 0.0031450537499040365 0.9926145076751708 0.0006414939416572453 1.1512797755131032e-05 2.62428820860805e-05 0.00020999903790652752 0.0022874579299241304 0.0010637702653184533 -63.25210189819336 -40.15903854370117 0.0003846687031909824 H 0.8159509202453987 H 0.4969325153374233 NA NA H 0.7975460122699386 H 0.6012269938650306 NA NA NA NA NA NA H 0.392638036809816 H 0.4355828220858896 H 0.7975460122699386 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6441717791411042 H 0.392638036809816 H 0.8036809815950919 H 0.7914110429447853 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.519971468686647e-05 1.8170074785199382e-05 1.5907600754871964e-05 8.631861736474773e-06 4 251452 1.3957500414107926e-05 1.598882674439001e-05 2 143292 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA Q60* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2676767676767677 H 0.24242424242424246 NA NA H 0.2676767676767677 H 0.2474747474747475 NA NA NA NA NA NA H 0.1919191919191919 H 0.3080808080808081 H 0.5202020202020202 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2323232323232323 H 0.12626262626262627 H 0.5606060606060606 H 0.5252525252525253 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.0 0.0 0.37 0.01 178C>T Q60H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA e 0.4087915718555449 73.01017473340035 H 0.9939208030700684 0.00010872716666199267 0.0059704785235226146 H 0.0038605493027716884 0.9831364750862122 0.007234327495098114 2.9926030038041066e-05 3.5281427699374035e-05 0.0003401251160539687 0.0045018112286925325 0.0008614624966867268 -64.10289001464844 -36.42269134521485 0.00032178364926949143 H 0.2676767676767677 H 0.24242424242424246 NA NA H 0.2676767676767677 H 0.2474747474747475 NA NA NA NA NA NA H 0.1919191919191919 H 0.3080808080808081 H 0.5202020202020202 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2323232323232323 H 0.12626262626262627 H 0.5606060606060606 H 0.5252525252525253 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 593342 VUS 2 0.0002837654240830701 1.9858254040982378e-05 0.00025453799753449857 8.895527900034006e-06 64 251436 0.00033506398904137313 1.7754431473181832e-05 48 143256 caG/caT caG/caT 0 0 NA NA NA NA NA NA E61* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5412371134020618 H 0.5515463917525774 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.5 NA NA NA NA NA NA H 0.4484536082474227 H 0.08247422680412371 H 0.5618556701030928 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3865979381443299 H 0.4690721649484536 H 0.5206185567010311 H 0.5721649484536082 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 931605 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.43 0.43 0.08 0.0 0.0 181G>T E61= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA e 0.7212923169136047 126.00976776480671 H 0.9698088765144348 0.00010255890083499251 0.03008863143622875 H 0.004166168160736561 0.9605239033699036 0.0036781490780413146 3.20779909088742e-05 2.262884663650766e-05 0.0006957321311347188 0.029540741816163063 0.0013405996141955256 -68.38092041015625 -35.57383346557617 0.000520196626894176 H 0.5412371134020618 H 0.5515463917525774 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.5 NA NA NA NA NA NA H 0.4484536082474227 H 0.08247422680412371 H 0.5618556701030928 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3865979381443299 H 0.4690721649484536 H 0.5206185567010311 H 0.5721649484536082 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.0 0.0 0.0 183A>G L62V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA NA b 0.19973933696746826 36.57227259874344 H 0.9397810697555542 0.00016459132893942294 0.06005433574318887 H 0.006081512663513422 0.9271573424339294 0.010555650107562542 2.884969762817491e-05 3.0320677979034368e-05 0.0030350852757692337 0.050408538430929184 0.0027027425821870565 -82.89240264892578 -33.11180877685547 0.0012347250012680884 H 0.018292682926829267 H 0.06097560975609756 NA NA H 0.018292682926829267 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA NA NA H 0.08536585365853659 H 0.04878048780487805 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.1097560975609756 H 0.07926829268292683 H 0.024390243902439025 H 0.054878048780487805 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.66 0.66 0.0 0.0 0.0 184C>G C63* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.007407407407407408 - 0.11851851851851852 NA NA - 0.014814814814814815 - 0.037037037037037035 NA NA NA NA NA NA - 0.1111111111111111 - 0.037037037037037035 - 0.022222222222222227 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.08148148148148149 - 0.1111111111111111 - 0.014814814814814815 - 0.022222222222222227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 189T>A C63F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|3 NA NA NA NA NA NA b 0.03750729560852052 5.26602430343628 C 0.0205245278775692 0.00042752327863126993 0.979047954082489 C 0.002672594273462892 0.014218577183783053 0.0001644520234549418 0.0003080636088270694 0.00021532327809836715 0.2095344066619873 0.02030054107308388 0.7525860667228699 -115.26414489746094 57.65060043334961 0.0009957131696864963 - 0.007407407407407408 - 0.11851851851851852 NA NA - 0.014814814814814815 - 0.037037037037037035 NA NA NA NA NA NA - 0.1111111111111111 - 0.037037037037037035 - 0.022222222222222227 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.08148148148148149 - 0.1111111111111111 - 0.014814814814814815 - 0.022222222222222227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.01 0.0 0.0 188G>T C63R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|3 NA NA NA NA NA NA b 0.03750729560852052 5.26602430343628 C 0.0205245278775692 0.00042752327863126993 0.979047954082489 C 0.002672594273462892 0.014218577183783053 0.0001644520234549418 0.0003080636088270694 0.00021532327809836715 0.2095344066619873 0.02030054107308388 0.7525860667228699 -115.26414489746094 57.65060043334961 0.0009957131696864963 - 0.007407407407407408 - 0.11851851851851852 NA NA - 0.014814814814814815 - 0.037037037037037035 NA NA NA NA NA NA - 0.1111111111111111 - 0.037037037037037035 - 0.022222222222222227 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.08148148148148149 - 0.1111111111111111 - 0.014814814814814815 - 0.022222222222222227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.978560122661293e-06 1.5008179280871594e-05 NA NA NA NA 6.978560122661293e-06 1.5008179280871594e-05 1 143296 NA Tgt/Cgt NA 0 NA NA NA NA NA NA F66L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|3 NA NA NA NA b 0.07868146896362305 15.791370820999145 H 0.8333991765975952 0.002840645844116807 0.16376006603240967 G 0.6200857758522034 0.2239088863134384 0.0017983075231313703 0.0006888819043524562 0.0011448176810517907 0.025772344321012497 0.09854743629693984 0.02805355377495289 -74.76351928710938 -25.87653923034668 0.005068358965218067 G 0.13705583756345174 G 0.13705583756345174 NA NA G 0.116751269035533 T 0.09137055837563453 NA NA NA NA NA NA G 0.0964467005076142 G 0.07614213197969544 G 0.14213197969543148 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.116751269035533 G 0.18781725888324874 G 0.13705583756345174 G 0.14213197969543148 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9829497988394e-06 1.414937013521619e-05 NA NA NA NA 6.9829497988394e-06 1.414937013521619e-05 1 143206 NA ttC/ttG NA 0 NA NA NA NA NA NA F67Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.15170827507972715 30.447850808501247 H 0.5032025575637817 0.08679547160863876 0.4100019037723541 H 0.17188473045825958 0.2944954335689545 0.009136228822171688 0.04763348400592804 0.03843831270933151 0.13246525824069974 0.18923832476139069 0.11670824140310287 -89.42105865478516 0.6370888352394104 0.006562227848917246 - 0.3248730964467005 - 0.3451776649746193 NA NA - 0.3248730964467005 - 0.4213197969543147 NA NA NA NA NA NA - 0.4619289340101523 - 0.4365482233502538 - 0.350253807106599 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.39593908629441626 - 0.39086294416243655 - 0.3350253807106599 - 0.3451776649746193 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.981969818298239e-06 1.534314435854599e-05 NA NA NA NA 6.981969818298239e-06 1.534314435854599e-05 1 143226 NA tTc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA F68L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|3 NA NA NA NA NA e 0.5676521062850952 113.92777773141859 C 0.30447158217430115 0.07472845911979675 0.6207999587059021 T 0.08265118300914764 0.1827394962310791 0.006892336998134852 0.025526046752929688 0.0487515814602375 0.17482934892177582 0.28311166167259216 0.19549831748008728 -101.73704528808594 29.643123626708984 0.01267338264733553 S 0.7766497461928934 S 0.7208121827411168 NA NA S 0.766497461928934 S 0.7461928934010152 NA NA NA NA NA NA S 0.7817258883248731 S 0.6649746192893401 S 0.766497461928934 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.8629441624365483 S 0.8071065989847716 S 0.7817258883248731 S 0.7715736040609137 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 595387 VUS 1 1.0142166765450082e-05 1.7113539010147175e-05 1.1945199730689634e-05 8.408497601831786e-06 3 251146 6.980999842198799e-06 1.4905381093142776e-05 1 143246 ttT/ttG ttT/ttG 0 0 NA NA NA NA NA NA F68V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|3 NA NA NA NA NA e 0.5676521062850952 113.92777773141859 C 0.30447158217430115 0.07472845911979675 0.6207999587059021 T 0.08265118300914764 0.1827394962310791 0.006892336998134852 0.025526046752929688 0.0487515814602375 0.17482934892177582 0.28311166167259216 0.19549831748008728 -101.73704528808594 29.643123626708984 0.01267338264733553 S 0.7766497461928934 S 0.7208121827411168 NA NA S 0.766497461928934 S 0.7461928934010152 NA NA NA NA NA NA S 0.7817258883248731 S 0.6649746192893401 S 0.766497461928934 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.8629441624365483 S 0.8071065989847716 S 0.7817258883248731 S 0.7715736040609137 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.981840109190672e-06 8.300501551974886e-06 3.981840109190672e-06 8.300501551974886e-06 1 251140 NA NA NA NA Ttt/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G69= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|3 NA NA NA NA NA e 0.5800896883010864 45.6530584692955 C 0.019880568608641624 0.008202358148992063 0.9719171524047852 S 0.00766418967396021 0.0073118363507092 0.0015144619392231107 0.004117719829082489 0.004370319191366434 0.4379047155380249 0.3787023723125458 0.15841437876224518 82.79596710205078 -163.7269287109375 0.0278827603906393 T 0.7738095238095238 S 0.7380952380952381 NA NA T 0.7738095238095238 S 0.8928571428571429 NA NA NA NA NA NA S 0.6428571428571429 S 0.8452380952380952 T 0.8452380952380952 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.7261904761904762 S 0.6547619047619048 T 0.8452380952380952 T 0.8452380952380952 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 207C>T G69D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|3 NA NA NA NA NA e 0.5800896883010864 45.6530584692955 C 0.019880568608641624 0.008202358148992063 0.9719171524047852 S 0.00766418967396021 0.0073118363507092 0.0015144619392231107 0.004117719829082489 0.004370319191366434 0.4379047155380249 0.3787023723125458 0.15841437876224518 82.79596710205078 -163.7269287109375 0.0278827603906393 T 0.7738095238095238 S 0.7380952380952381 NA NA T 0.7738095238095238 S 0.8928571428571429 NA NA NA NA NA NA S 0.6428571428571429 S 0.8452380952380952 T 0.8452380952380952 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.7261904761904762 S 0.6547619047619048 T 0.8452380952380952 T 0.8452380952380952 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.3972499800729565e-05 1.5771294249487598e-05 NA NA NA NA 1.3972499800729565e-05 1.5771294249487598e-05 2 143138 NA gGc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA N70S NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|1 NA NA STRAND|3 NA NA NA NA NA e 0.8040684461593628 117.71562051773071 C 0.006327452603727579 0.010671917349100113 0.983000636100769 C 0.006356821395456791 0.0013557765632867813 6.425975152524188e-05 0.003393959952518344 0.007814133539795877 0.3668584525585175 0.24477942287921906 0.3693771362304688 -91.44214630126952 43.22845077514648 0.030455639585852626 T 0.7643312101910829 S 0.8471337579617835 NA NA T 0.7579617834394905 - 0.9681528662420382 NA NA NA NA NA NA - 0.961783439490446 S 0.8089171974522293 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.9681528662420382 - 0.9235668789808916 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A 596173 VUS 1 2.2820896146957292e-05 1.6738821387464167e-05 2.786759978334885e-05 9.963383527213442e-06 7 251188 1.3967700397188308e-05 1.345061820627883e-05 2 143188 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA C75W NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|4 NA NA NA NA NA NA b 0.08738473057746887 12.268816173076631 C 0.005530519410967828 0.14392589032649994 0.8505436182022095 C 0.0025629887823015447 0.0029249044600874186 5.235706339590251e-05 0.03953726962208748 0.10731828212738036 0.21389083564281464 0.02421497367322445 0.6094983816146851 -102.27315521240234 112.3316650390625 0.003000982804223895 - 0.0 - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.0 NA NA NA NA NA NA - 0.05925925925925926 - 0.022222222222222227 - 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.007407407407407408 - 0.02962962962962963 - 0.0 - 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.980159817729145e-06 8.319144617141668e-06 3.980159817729145e-06 8.319144617141668e-06 1 251246 NA NA NA NA tgT/tgG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D76V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3489868640899658 50.28900711536407 C 0.0011932909255847335 0.03476328030228615 0.964043378829956 C 0.00024170019605662682 0.0005365844117477536 5.9552867242018675e-06 0.011230319738388063 0.020290927961468697 0.12916550040245056 0.0016790282679721713 0.8368499875068665 -102.25509643554688 158.91017150878906 0.004331393167376518 - 0.2331288343558282 - 0.147239263803681 NA NA - 0.2331288343558282 - 0.147239263803681 NA NA NA NA NA NA - 0.22699386503067484 - 0.2331288343558282 - 0.2331288343558282 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.1656441717791411 - 0.25153374233128833 - 0.2331288343558282 - 0.2392638036809816 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.0 0.0 0.0 227A>T D76Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3489868640899658 50.28900711536407 C 0.0011932909255847335 0.03476328030228615 0.964043378829956 C 0.00024170019605662682 0.0005365844117477536 5.9552867242018675e-06 0.011230319738388063 0.020290927961468697 0.12916550040245056 0.0016790282679721713 0.8368499875068665 -102.25509643554688 158.91017150878906 0.004331393167376518 - 0.2331288343558282 - 0.147239263803681 NA NA - 0.2331288343558282 - 0.147239263803681 NA NA NA NA NA NA - 0.22699386503067484 - 0.2331288343558282 - 0.2331288343558282 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.1656441717791411 - 0.25153374233128833 - 0.2331288343558282 - 0.2392638036809816 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.31 0.01 0.0 0.0 226G>T V77A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.370699942111969 56.97658110260964 H 0.9562549591064452 0.0004932107403874396 0.04325179010629654 H 0.014344871044158937 0.9507241249084472 0.0002872572804335505 0.0002292489662067965 0.00022737622202839702 0.0050368057563900965 0.02046872302889824 0.008681528270244598 -60.72101211547852 -36.78349304199219 0.006485608406364918 H 0.24647887323943665 H 0.23943661971830985 NA NA H 0.2605633802816901 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA H 0.34507042253521125 H 0.2112676056338028 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2605633802816901 H 0.3028169014084507 H 0.2535211267605634 H 0.2676056338028169 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.979049885558197e-06 1.6425851903679405e-05 NA NA NA NA 6.979049885558197e-06 1.6425851903679405e-05 1 143286 NA gTt/gCt NA 0 NA NA NA NA NA NA V77F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.370699942111969 56.97658110260964 H 0.9562549591064452 0.0004932107403874396 0.04325179010629654 H 0.014344871044158937 0.9507241249084472 0.0002872572804335505 0.0002292489662067965 0.00022737622202839702 0.0050368057563900965 0.02046872302889824 0.008681528270244598 -60.72101211547852 -36.78349304199219 0.006485608406364918 H 0.24647887323943665 H 0.23943661971830985 NA NA H 0.2605633802816901 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA H 0.34507042253521125 H 0.2112676056338028 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2605633802816901 H 0.3028169014084507 H 0.2535211267605634 H 0.2676056338028169 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 229G>T V77I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.370699942111969 56.97658110260964 H 0.9562549591064452 0.0004932107403874396 0.04325179010629654 H 0.014344871044158937 0.9507241249084472 0.0002872572804335505 0.0002292489662067965 0.00022737622202839702 0.0050368057563900965 0.02046872302889824 0.008681528270244598 -60.72101211547852 -36.78349304199219 0.006485608406364918 H 0.24647887323943665 H 0.23943661971830985 NA NA H 0.2605633802816901 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA H 0.34507042253521125 H 0.2112676056338028 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2605633802816901 H 0.3028169014084507 H 0.2535211267605634 H 0.2676056338028169 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.96051972429268e-06 8.772750412249463e-06 7.96051972429268e-06 8.772750412249463e-06 2 251240 NA NA NA NA Gtt/Att NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R78L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.6190792918205261 141.76915782690045 H 0.982223629951477 0.00016407128714490682 0.017612406983971596 H 0.014835312962532043 0.971723735332489 0.00014706840738654137 5.921667616348714e-05 8.642639295430854e-05 0.0009642894146963953 0.006673614960163832 0.005510442424565554 -66.9149169921875 -38.60624694824219 0.008942686021327972 H 0.6733870967741935 H 0.4314516129032258 NA NA H 0.6774193548387096 H 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA H 0.4838709677419355 H 0.5241935483870968 H 0.6653225806451613 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3709677419354839 H 0.5040322580645161 H 0.6693548387096774 H 0.6653225806451613 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 233G>T R78P NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.6190792918205261 141.76915782690045 H 0.982223629951477 0.00016407128714490682 0.017612406983971596 H 0.014835312962532043 0.971723735332489 0.00014706840738654137 5.921667616348714e-05 8.642639295430854e-05 0.0009642894146963953 0.006673614960163832 0.005510442424565554 -66.9149169921875 -38.60624694824219 0.008942686021327972 H 0.6733870967741935 H 0.4314516129032258 NA NA H 0.6774193548387096 H 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA H 0.4838709677419355 H 0.5241935483870968 H 0.6653225806451613 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3709677419354839 H 0.5040322580645161 H 0.6693548387096774 H 0.6653225806451613 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 233G>C R78Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.6190792918205261 141.76915782690045 H 0.982223629951477 0.00016407128714490682 0.017612406983971596 H 0.014835312962532043 0.971723735332489 0.00014706840738654137 5.921667616348714e-05 8.642639295430854e-05 0.0009642894146963953 0.006673614960163832 0.005510442424565554 -66.9149169921875 -38.60624694824219 0.008942686021327972 H 0.6733870967741935 H 0.4314516129032258 NA NA H 0.6774193548387096 H 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA H 0.4838709677419355 H 0.5241935483870968 H 0.6653225806451613 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3709677419354839 H 0.5040322580645161 H 0.6693548387096774 H 0.6653225806451613 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 326279 VUS 2 0.00011157940968571426 1.778257486245428e-05 8.35881000966765e-05 7.907335161763773e-06 21 251232 0.00016071999561972916 1.5927775091905496e-05 23 143106 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R78W NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.6190792918205261 141.76915782690045 H 0.982223629951477 0.00016407128714490682 0.017612406983971596 H 0.014835312962532043 0.971723735332489 0.00014706840738654137 5.921667616348714e-05 8.642639295430854e-05 0.0009642894146963953 0.006673614960163832 0.005510442424565554 -66.9149169921875 -38.60624694824219 0.008942686021327972 H 0.6733870967741935 H 0.4314516129032258 NA NA H 0.6774193548387096 H 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA H 0.4838709677419355 H 0.5241935483870968 H 0.6653225806451613 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3709677419354839 H 0.5040322580645161 H 0.6693548387096774 H 0.6653225806451613 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 954808 VUS 1 2.282029925573392e-05 1.6099271257041087e-05 1.5923600585665554e-05 8.249113719809967e-06 4 251200 3.491960160317831e-05 1.3825290515769714e-05 5 143186 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA L80V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA b 0.09699007868766783 17.75888340771198 H 0.9852880239486694 0.0005738330073654653 0.01413815747946501 H 0.0040900730527937395 0.9832872152328492 0.0019652186892926693 0.0001794316922314465 0.0002485246805008501 0.0007425189251080155 0.004067393485456705 0.005419515538960695 -65.19256591796875 -40.71744918823242 0.0026297972071915865 H 0.0 H 0.04878048780487805 NA NA H 0.0 H 0.042682926829268296 NA NA NA NA NA NA H 0.06707317073170732 H 0.07317073170731707 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.042682926829268296 H 0.03658536585365853 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.4 0.0 0.0 0.01 238C>G T82I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.29147666692733765 40.42781370282173 H 0.9865900278091432 6.65106563246809e-05 0.013343431986868382 H 0.0017857514321804047 0.9866368174552916 0.002650302601978183 3.503801781334914e-05 2.2571686713490635e-05 0.0006783043500036001 0.00454944698140025 0.00364172225818038 -65.40982818603516 -42.61958312988281 0.0025363210588693623 H 0.30985915492957744 H 0.23943661971830985 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.5070422535211268 NA NA NA NA NA NA H 0.3873239436619718 H 0.2535211267605634 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2605633802816901 H 0.4577464788732394 H 0.3028169014084507 H 0.2676056338028169 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5922400052659217e-05 8.882941642532068e-06 1.5922400052659217e-05 8.882941642532068e-06 4 251218 NA NA NA NA aCa/aTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D85E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA NA e 0.6009078621864319 86.59082294106483 H 0.9797416925430298 5.764769230154343e-05 0.020200636237859733 H 0.004553854465484619 0.9354326128959656 0.04449915513396263 2.934169606305659e-05 1.7792328435461968e-05 0.0010735407704487443 0.012138714082539082 0.002255030907690525 -67.39572143554689 -37.49492645263672 0.0019162565004080527 H 0.4969325153374233 H 0.5214723926380368 NA NA H 0.5030674846625767 H 0.6073619631901841 NA NA NA NA NA NA H 0.4110429447852761 H 0.4539877300613497 H 0.4601226993865031 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5521472392638037 H 0.5153374233128835 H 0.5030674846625767 H 0.4539877300613497 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.3957100236439144e-05 1.4666778572726999e-05 NA NA NA NA 1.3957100236439144e-05 1.4666778572726999e-05 2 143296 NA gaC/gaG NA 0 NA NA NA NA NA NA N86D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.289591908454895 42.39625539779663 H 0.8668864369392395 0.0003334049251861871 0.13278016448020935 H 0.01987198926508427 0.8126896619796753 0.046554017812013626 0.00027705682441592216 9.665581455919893e-05 0.008795436471700668 0.09328779578208923 0.01842733658850193 -80.7304458618164 -24.646743774414066 0.004669912159442903 T 0.2929936305732484 H 0.2356687898089172 NA NA T 0.28662420382165604 H 0.4203821656050956 NA NA NA NA NA NA H 0.2420382165605096 H 0.3949044585987261 H 0.2420382165605096 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3057324840764331 H 0.4140127388535032 T 0.2929936305732484 H 0.2611464968152866 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.857759999266122e-05 NA NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.857759999266122e-05 1 143250 NA Aac/Gac NA 0 NA NA NA NA NA NA Q88R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|5 NA NA NA NA e 0.4887056946754456 87.28283706903456 H 0.8023514151573181 0.0025137874763458967 0.1951348036527633 H 0.11478863656520845 0.6609625220298767 0.018102098256349564 0.0017105282749980688 0.0008351121796295048 0.014649884775280952 0.1474265605211258 0.04152457788586617 -71.95032501220703 -28.69059944152832 0.003216823562979698 H 0.6717171717171717 H 0.5707070707070707 NA NA H 0.6818181818181818 H 0.4898989898989899 NA NA NA NA NA NA H 0.5202020202020202 H 0.2929292929292929 H 0.6262626262626263 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4494949494949495 H 0.5808080808080808 H 0.6868686868686869 H 0.6414141414141414 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.610216376348314e-05 NA NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.610216376348314e-05 1 143310 NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA S95F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3153510689735413 36.95914528369904 H 0.5387003421783447 0.0005634130211547017 0.4607362449169159 H 0.0733545646071434 0.4847712516784668 0.0032295065466314554 0.0007511510048061607 9.958609734894708e-05 0.01897191628813744 0.3956596851348877 0.023162303492426872 -72.37627410888672 -19.340373992919922 0.002903496148064733 T 0.4846153846153846 T 0.4461538461538462 NA NA T 0.4846153846153846 - 0.6230769230769231 NA NA NA NA NA NA T 0.4538461538461538 T 0.1076923076923077 T 0.4923076923076923 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5076923076923077 T 0.4153846153846154 T 0.4846153846153846 T 0.4692307692307692 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.194909964397084e-05 9.284024313007727e-06 1.194909964397084e-05 9.284024313007727e-06 3 251064 NA NA NA NA tCc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S95P NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3153510689735413 36.95914528369904 H 0.5387003421783447 0.0005634130211547017 0.4607362449169159 H 0.0733545646071434 0.4847712516784668 0.0032295065466314554 0.0007511510048061607 9.958609734894708e-05 0.01897191628813744 0.3956596851348877 0.023162303492426872 -72.37627410888672 -19.340373992919922 0.002903496148064733 T 0.4846153846153846 T 0.4461538461538462 NA NA T 0.4846153846153846 - 0.6230769230769231 NA NA NA NA NA NA T 0.4538461538461538 T 0.1076923076923077 T 0.4923076923076923 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5076923076923077 T 0.4153846153846154 T 0.4846153846153846 T 0.4692307692307692 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.606257444875003e-06 1.8077864717656928e-05 7.964379619807005e-06 8.757754463933127e-06 2 251118 6.978660167078488e-06 1.5814895810575693e-05 1 143294 Tcc/Ccc Tcc/Ccc 0 0 NA NA NA NA NA NA R96I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.35490137338638306 81.27241450548172 C 0.3512512743473053 0.0004106854903511703 0.6483380198478699 T 0.049391698092222214 0.2774180173873901 0.0018400454428046946 0.00035082432441413397 7.06976352375932e-05 0.062070332467556 0.5821833610534668 0.02667500637471676 -91.41153717041016 -15.144667625427244 0.001591393374837935 T 0.4395161290322581 T 0.3467741935483871 NA NA T 0.4475806451612903 S 0.4717741935483871 NA NA NA NA NA NA T 0.532258064516129 T 0.18951612903225806 T 0.5564516129032258 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4354838709677419 T 0.4153225806451613 T 0.5846774193548387 T 0.6008064516129032 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.65 0.02 0.0 0.0 0.65 287G>T R96K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.35490137338638306 81.27241450548172 C 0.3512512743473053 0.0004106854903511703 0.6483380198478699 T 0.049391698092222214 0.2774180173873901 0.0018400454428046946 0.00035082432441413397 7.06976352375932e-05 0.062070332467556 0.5821833610534668 0.02667500637471676 -91.41153717041016 -15.144667625427244 0.001591393374837935 T 0.4395161290322581 T 0.3467741935483871 NA NA T 0.4475806451612903 S 0.4717741935483871 NA NA NA NA NA NA T 0.532258064516129 T 0.18951612903225806 T 0.5564516129032258 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4354838709677419 T 0.4153225806451613 T 0.5846774193548387 T 0.6008064516129032 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.02 0.0 0.0 0.24 287G>A R96T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.35490137338638306 81.27241450548172 C 0.3512512743473053 0.0004106854903511703 0.6483380198478699 T 0.049391698092222214 0.2774180173873901 0.0018400454428046946 0.00035082432441413397 7.06976352375932e-05 0.062070332467556 0.5821833610534668 0.02667500637471676 -91.41153717041016 -15.144667625427244 0.001591393374837935 T 0.4395161290322581 T 0.3467741935483871 NA NA T 0.4475806451612903 S 0.4717741935483871 NA NA NA NA NA NA T 0.532258064516129 T 0.18951612903225806 T 0.5564516129032258 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4354838709677419 T 0.4153225806451613 T 0.5846774193548387 T 0.6008064516129032 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.51 0.03 0.0 0.0 0.51 287G>C C97G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|5 NA NA NA NA NA NA b 0.06225737929344177 8.740936052799226 C 0.001307451049797237 0.0014227005885913966 0.9972698092460632 C 0.00016807595966383815 0.0006474757101386787 4.600902229867643e-06 0.0012671543518081307 0.0005260577891021967 0.2501705586910248 0.0015584013890475035 0.7456576824188232 -102.09503936767578 117.75194549560548 0.0008895415812730789 - 0.0 S 0.0 NA NA - 0.0 - 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.0 - 0.007407407407407408 - 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.007407407407407408 S 0.014814814814814815 - 0.0 - 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.98145994040533e-06 8.14013771519029e-06 3.98145994040533e-06 8.14013771519029e-06 1 251164 NA NA NA NA Tgt/Ggt NA 0 NA 0.42 0.42 0.07 0.0 0.0 289T>G C97S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|5 NA NA NA NA NA NA b 0.06225737929344177 8.740936052799226 C 0.001307451049797237 0.0014227005885913966 0.9972698092460632 C 0.00016807595966383815 0.0006474757101386787 4.600902229867643e-06 0.0012671543518081307 0.0005260577891021967 0.2501705586910248 0.0015584013890475035 0.7456576824188232 -102.09503936767578 117.75194549560548 0.0008895415812730789 - 0.0 S 0.0 NA NA - 0.0 - 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.0 - 0.007407407407407408 - 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.007407407407407408 S 0.014814814814814815 - 0.0 - 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.27 0.21 0.0 0.0 289T>A P98T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA e 0.35741257667541504 50.7168446302414 H 0.9883129000663756 3.115397339570336e-05 0.011655992828309536 H 0.007016940508037806 0.9822483062744141 0.0001924638490891084 1.5509693184867498e-05 7.359670689766063e-06 0.0010554740438237786 0.008123929612338543 0.0013399500166997313 -60.01549911499024 -35.37247848510742 0.0003790508781094104 H 0.2867647058823529 H 0.3602941176470588 NA NA H 0.2867647058823529 H 0.5 NA NA NA NA NA NA H 0.38235294117647056 H 0.21323529411764705 H 0.29411764705882354 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2794117647058824 H 0.36764705882352944 H 0.2867647058823529 H 0.2867647058823529 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.983049843256595e-06 1.4894117760138519e-05 NA NA NA NA 6.983049843256595e-06 1.4894117760138519e-05 1 143204 NA Cca/Aca NA 0 NA NA NA NA NA NA S99P NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.0851433277130127 9.978798007965088 H 0.9965494871139526 2.105360545101576e-05 0.003429414238780737 H 0.005165291484445334 0.9919880628585817 0.00022292521316558125 1.0399172424513381e-05 4.0558629734732685e-06 0.00016879658505786208 0.0019558744970709085 0.0004845777875743807 -63.4784049987793 -39.06203842163086 0.0002592491800896824 H 0.0 H 0.02307692307692308 NA NA H 0.0 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA NA NA H 0.015384615384615384 H 0.007692307692307694 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.04615384615384616 H 0.02307692307692308 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.97988014810835e-06 9.056229286315048e-06 3.97988014810835e-06 9.056229286315048e-06 1 251264 NA NA NA NA Tcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F101C NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.1293230652809143 25.9551392018795 H 0.9995821118354796 2.0012659661006186e-05 0.00039786307024769485 H 0.0005168456700630486 0.99817156791687 0.0010044275550171733 3.5825989925797334e-06 5.613421308225952e-06 1.9489152691676278e-05 0.0002045444562099874 7.39009483368136e-05 -61.24171829223633 -42.68117141723633 3.9888022001832724e-05 H 0.15228426395939088 H 0.15228426395939088 NA NA H 0.14720812182741114 H 0.15736040609137056 NA NA NA NA NA NA H 0.09137055837563453 H 0.116751269035533 H 0.14720812182741114 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.15228426395939088 H 0.1319796954314721 H 0.14213197969543148 H 0.15228426395939088 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 500461 VUS 1 3.040775201558893e-05 1.6871026617450118e-05 2.387260065006558e-05 8.46767563706781e-06 6 251334 4.186959995422512e-05 1.4592121450704786e-05 6 143302 tTt/tGt tTt/tGt 0 0 NA NA NA NA NA NA Y102* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3108108108108108 H 0.35135135135135137 NA NA H 0.32432432432432434 H 0.3333333333333333 NA NA NA NA NA NA H 0.40540540540540543 H 0.2297297297297297 H 0.2972972972972973 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.35585585585585583 H 0.427927927927928 H 0.3108108108108108 H 0.3063063063063063 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 579540 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.57 0.57 0.0 0.0 0.0 306T>G N103S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.04099708795547485 6.0019736766815175 H 0.999519944190979 1.6047422832343727e-05 0.0004639779508579521 H 0.00016270752530544996 0.9970710277557372 0.0024380518589168787 7.899234333308414e-06 3.8741536627640025e-06 3.354858927195892e-05 0.0001778430741978809 0.00010499438212718816 -64.36026763916016 -43.6220588684082 3.2497515348950394e-05 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.025477707006369428 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.86 0.86 0.03 0.0 0.0 308A>G L105Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.07376429438591002 13.506242302060127 H 0.9996033310890198 1.5494113540626128e-05 0.00038120750105008483 H 0.00022401375463232403 0.9954791069030762 0.003956479020416737 2.472071628289996e-06 3.943674073525472e-06 1.4248451407183893e-05 0.0002523836155887693 6.734777707606554e-05 -62.01263427734375 -43.17316436767578 2.0963694623787887e-05 H 0.10365853658536583 H 0.13414634146341464 NA NA H 0.10365853658536583 H 0.10365853658536583 NA NA NA NA NA NA H 0.14634146341463414 H 0.1951219512195122 H 0.1097560975609756 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.17073170731707318 H 0.17682926829268292 H 0.1097560975609756 H 0.1097560975609756 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.88 0.88 0.05 0.0 0.0 314T>A L105V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.07376429438591002 13.506242302060127 H 0.9996033310890198 1.5494113540626128e-05 0.00038120750105008483 H 0.00022401375463232403 0.9954791069030762 0.003956479020416737 2.472071628289996e-06 3.943674073525472e-06 1.4248451407183893e-05 0.0002523836155887693 6.734777707606554e-05 -62.01263427734375 -43.17316436767578 2.0963694623787887e-05 H 0.10365853658536583 H 0.13414634146341464 NA NA H 0.10365853658536583 H 0.10365853658536583 NA NA NA NA NA NA H 0.14634146341463414 H 0.1951219512195122 H 0.1097560975609756 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.17073170731707318 H 0.17682926829268292 H 0.1097560975609756 H 0.1097560975609756 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.978269993851428e-06 1.4798543354124646e-05 NA NA NA NA 6.978269993851428e-06 1.4798543354124646e-05 1 143302 NA Ctg/Gtg NA 0 0.41 0.41 0.03 0.0 0.0 313C>G E110* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.84 0.84 0.49 0.0 0.0 328G>T E110= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.37 0.04 0.0 0.0 330G>A E110A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.63 0.63 0.03 0.0 0.0 329A>C E110D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.81 0.81 0.19 0.0 0.0 330G>T E110G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.3 0.04 0.0 0.0 329A>G E110K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.03 0.0 0.0 328G>A E110Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.83 0.83 0.08 0.0 0.0 328G>C E110V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.21333760023117065 37.27007876038551 H 0.9898723363876344 0.0002375352341914549 0.009890149347484112 H 0.004626448731869459 0.9098275303840636 0.07402621954679489 8.72046803124249e-05 8.367634291062133e-05 0.0007812069961801171 0.009309811517596243 0.001257937983609736 -68.58943176269531 -38.5129508972168 9.794955985853449e-05 H 0.09278350515463918 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.09278350515463918 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA NA NA H 0.05154639175257732 H 0.1958762886597938 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 H 0.005154639175257732 H 0.08762886597938144 H 0.10309278350515463 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.83 0.83 0.23 0.0 0.0 329A>T L111= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.02784007787704468 5.09751825928688 H 0.9478131532669068 0.0008958010585047305 0.05129106715321542 H 0.013899822719395159 0.8787644505500793 0.05286655947566032 0.0004818431043531745 0.0002477405359968543 0.004342435859143734 0.0442403145134449 0.005156816449016333 -72.28317260742188 -32.543079376220696 0.00020143738947808745 H 0.054878048780487805 H 0.042682926829268296 NA NA H 0.04878048780487805 H 0.1402439024390244 NA NA NA NA NA NA H 0.08536585365853659 H 0.11585365853658534 H 0.03658536585365853 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.054878048780487805 H 0.07926829268292683 H 0.04878048780487805 H 0.03048780487804878 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.09 0.0 0.0 333G>T L111Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.02784007787704468 5.09751825928688 H 0.9478131532669068 0.0008958010585047305 0.05129106715321542 H 0.013899822719395159 0.8787644505500793 0.05286655947566032 0.0004818431043531745 0.0002477405359968543 0.004342435859143734 0.0442403145134449 0.005156816449016333 -72.28317260742188 -32.543079376220696 0.00020143738947808745 H 0.054878048780487805 H 0.042682926829268296 NA NA H 0.04878048780487805 H 0.1402439024390244 NA NA NA NA NA NA H 0.08536585365853659 H 0.11585365853658534 H 0.03658536585365853 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.054878048780487805 H 0.07926829268292683 H 0.04878048780487805 H 0.03048780487804878 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.4 0.0 0.0 0.0 332T>A C113G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|4 NA HELIX|6 NA NA NA NA b 0.06447979807853699 9.052963650226593 C 0.1700940579175949 0.03456980735063553 0.7953361272811891 T 0.03019250556826592 0.11829861253499985 0.012152630835771559 0.022673198953270912 0.01443374715745449 0.24498942494392395 0.3348333537578583 0.22242648899555206 -94.61692810058594 13.161656379699707 0.0010005306685343383 H 0.0 H 0.022222222222222227 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.02962962962962963 H 0.014814814814814815 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.022222222222222227 H 0.022222222222222227 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.58 0.58 0.21 0.0 0.0 337T>G S114N NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.06701081991195679 7.8536680936813354 C 0.0008572462247684598 0.003805420361459255 0.9953372478485109 C 0.00016248614701908082 0.0005296655581332743 1.2700417755695524e-05 0.004226068966090679 0.001376720261760056 0.2820427417755127 0.003070369828492403 0.7085793018341064 -95.04071044921876 137.88229370117188 0.00021864943846594542 - 0.015384615384615384 - 0.0 NA NA - 0.007692307692307694 - 0.0 NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.0 - 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.04615384615384616 - 0.007692307692307694 - 0.015384615384615384 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9779802136763465e-06 8.525748544584495e-06 3.9779802136763465e-06 8.525748544584495e-06 1 251384 NA NA NA NA aGc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P115L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2209072709083557 31.34674174189568 H 0.6086792349815369 0.0009534510318189859 0.390367329120636 T 0.16104045510292053 0.3388364315032959 0.0013852751580998304 0.0005391708109527826 0.0002793697058223188 0.049371398985385895 0.4276953935623169 0.02085250057280064 -62.30801773071289 -26.52722549438477 0.00020488574227783832 T 0.14705882352941174 T 0.25 NA NA T 0.13970588235294118 S 0.3897058823529412 NA NA NA NA NA NA T 0.22794117647058826 T 0.17647058823529413 T 0.15441176470588236 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.3161764705882353 T 0.4411764705882353 T 0.14705882352941174 T 0.15441176470588236 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9779802136763465e-06 1.0145986578025508e-05 3.9779802136763465e-06 1.0145986578025508e-05 1 251384 NA NA NA NA cCt/cTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R116* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4516129032258064 T 0.2862903225806452 NA NA T 0.4516129032258064 - 0.5080645161290323 NA NA NA NA NA NA T 0.2298387096774193 T 0.4879032258064516 T 0.4395161290322581 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.2258064516129032 T 0.4919354838709678 T 0.4516129032258064 T 0.4637096774193548 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 872388 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.54 0.54 0.0 0.0 0.0 346C>T R116= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3091830611228943 70.8029209971428 H 0.5221260786056519 0.0020949954632669687 0.4757789671421051 T 0.1920233517885208 0.20553907752037048 0.0010108285350725057 0.00106139259878546 0.0005893530324101447 0.03965304419398308 0.5290383696556091 0.031084606423974037 -80.37541198730469 -14.14887809753418 0.00024265817773994058 T 0.4516129032258064 T 0.2862903225806452 NA NA T 0.4516129032258064 - 0.5080645161290323 NA NA NA NA NA NA T 0.2298387096774193 T 0.4879032258064516 T 0.4395161290322581 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.2258064516129032 T 0.4919354838709678 T 0.4516129032258064 T 0.4637096774193548 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 346C>A R116Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3091830611228943 70.8029209971428 H 0.5221260786056519 0.0020949954632669687 0.4757789671421051 T 0.1920233517885208 0.20553907752037048 0.0010108285350725057 0.00106139259878546 0.0005893530324101447 0.03965304419398308 0.5290383696556091 0.031084606423974037 -80.37541198730469 -14.14887809753418 0.00024265817773994058 T 0.4516129032258064 T 0.2862903225806452 NA NA T 0.4516129032258064 - 0.5080645161290323 NA NA NA NA NA NA T 0.2298387096774193 T 0.4879032258064516 T 0.4395161290322581 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.2258064516129032 T 0.4919354838709678 T 0.4516129032258064 T 0.4637096774193548 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 4.815368489658759e-05 1.817140487621269e-05 1.988989970413968e-05 9.45281966797447e-06 5 251384 9.777490049600601e-05 1.5519154471168897e-05 14 143186 cGa/cAa cGa/cAa 0 0 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 347G>A Q117* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 G 0.0 NA NA G 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA G 0.010101010101010102 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 T 0.015151515151515154 H 0.0 G 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 349C>T Q117L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA b 0.0399438738822937 7.133975875377655 H 0.8875052928924559 0.0020851721055805683 0.11040950566530228 H 0.413805216550827 0.4612419903278351 0.001411314820870757 0.001546116778627038 0.0012419025879353285 0.016468681395053864 0.06487732380628586 0.03940744325518608 -64.75267028808594 -25.956398010253906 0.00016710642375983298 G 0.0 G 0.0 NA NA G 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA G 0.010101010101010102 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 T 0.015151515151515154 H 0.0 G 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.6 0.6 0.0 0.0 0.0 350A>T Q117R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA b 0.0399438738822937 7.133975875377655 H 0.8875052928924559 0.0020851721055805683 0.11040950566530228 H 0.413805216550827 0.4612419903278351 0.001411314820870757 0.001546116778627038 0.0012419025879353285 0.016468681395053864 0.06487732380628586 0.03940744325518608 -64.75267028808594 -25.956398010253906 0.00016710642375983298 G 0.0 G 0.0 NA NA G 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA G 0.010101010101010102 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 T 0.015151515151515154 H 0.0 G 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 581349 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S118I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA b 0.07942035794258118 9.308065950870514 H 0.9412665367126464 0.0010198955424129963 0.057713601738214486 G 0.6293820738792419 0.301734983921051 0.00039390884921886027 0.0004107631975784898 0.000373638526070863 0.004258363973349333 0.05480753630399704 0.0086387163028121 -63.58313369750977 -26.408958435058594 0.0003394608211237937 G 0.3461538461538461 G 0.25384615384615383 NA NA G 0.3461538461538461 H 0.4384615384615385 NA NA NA NA NA NA G 0.26153846153846155 G 0.4307692307692308 G 0.3461538461538461 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.3615384615384615 T 0.3692307692307693 H 0.3692307692307693 G 0.3538461538461539 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 353G>T S118T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA b 0.07942035794258118 9.308065950870514 H 0.9412665367126464 0.0010198955424129963 0.057713601738214486 G 0.6293820738792419 0.301734983921051 0.00039390884921886027 0.0004107631975784898 0.000373638526070863 0.004258363973349333 0.05480753630399704 0.0086387163028121 -63.58313369750977 -26.408958435058594 0.0003394608211237937 G 0.3461538461538461 G 0.25384615384615383 NA NA G 0.3461538461538461 H 0.4384615384615385 NA NA NA NA NA NA G 0.26153846153846155 G 0.4307692307692308 G 0.3461538461538461 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.3615384615384615 T 0.3692307692307693 H 0.3692307692307693 G 0.3538461538461539 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 353G>C Q119* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 355C>T Q119= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.54 0.54 0.0 0.0 0.0 357G>A Q119E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.616421365393681e-05 NA NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.616421365393681e-05 1 143284 NA Cag/Gag NA 0 NA NA NA NA NA NA Q119H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.61 0.61 0.0 0.0 0.0 357G>T Q119K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.02 0.0 355C>A Q119L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.62 0.0 0.0 0.0 356A>T Q119P NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 356A>C Q119R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA NA e 0.4000243544578552 71.44434970617293 H 0.7523511052131653 0.005433284677565098 0.24221563339233398 G 0.5164034962654114 0.2512397766113281 0.0008813112508505582 0.0007448100950568914 0.0020254747942090034 0.015010114759206772 0.19872185587882998 0.014973138459026812 -76.86643981933594 -18.693307876586914 0.0004426935920491816 G 0.2929292929292929 G 0.404040404040404 NA NA G 0.2828282828282828 H 0.4090909090909091 NA NA NA NA NA NA G 0.3434343434343434 G 0.297979797979798 G 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.202020202020202 T 0.3333333333333333 H 0.2929292929292929 G 0.24242424242424246 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0 356A>G L121F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA b 0.04228585958480835 7.742540889978407 E 0.052597276866436005 0.5343231558799744 0.413079559803009 E 0.025967905297875404 0.03075649961829185 0.0007502254447899759 0.06642534583806993 0.4537830352783203 0.13003991544246676 0.053546667098999016 0.238730326294899 -95.70816040039062 133.989501953125 0.0005653252592310307 E 0.0 E 0.03048780487804878 NA NA E 0.0 E 0.06707317073170732 NA NA NA NA NA NA E 0.06097560975609756 E 0.1097560975609756 E 0.024390243902439025 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.08536585365853659 E 0.04878048780487805 E 0.024390243902439025 E 0.024390243902439025 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.41 0.0 0.0 0.0 363G>T N122H NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|2 NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.4344836473464966 63.60840597152711 E 0.004671669099479914 0.5777512192726135 0.4175770878791809 E 0.0018171335104852915 0.001972720492631197 6.694349576719105e-05 0.032625488936901086 0.5659385323524475 0.0390576496720314 0.012248433195054531 0.34627318382263184 -96.22248840332031 112.51033020019531 0.0003130088734906167 E 0.4968152866242038 E 0.5286624203821656 NA NA E 0.5159235668789809 E 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA E 0.5031847133757962 E 0.2929936305732484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5923566878980892 E 0.4012738853503185 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 364A>C N122I NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|2 NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.4344836473464966 63.60840597152711 E 0.004671669099479914 0.5777512192726135 0.4175770878791809 E 0.0018171335104852915 0.001972720492631197 6.694349576719105e-05 0.032625488936901086 0.5659385323524475 0.0390576496720314 0.012248433195054531 0.34627318382263184 -96.22248840332031 112.51033020019531 0.0003130088734906167 E 0.4968152866242038 E 0.5286624203821656 NA NA E 0.5159235668789809 E 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA E 0.5031847133757962 E 0.2929936305732484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5923566878980892 E 0.4012738853503185 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.46 0.46 0.0 0.0 0.0 365A>T N122T NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|2 NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.4344836473464966 63.60840597152711 E 0.004671669099479914 0.5777512192726135 0.4175770878791809 E 0.0018171335104852915 0.001972720492631197 6.694349576719105e-05 0.032625488936901086 0.5659385323524475 0.0390576496720314 0.012248433195054531 0.34627318382263184 -96.22248840332031 112.51033020019531 0.0003130088734906167 E 0.4968152866242038 E 0.5286624203821656 NA NA E 0.5159235668789809 E 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA E 0.5031847133757962 E 0.2929936305732484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5923566878980892 E 0.4012738853503185 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 365A>C N122Y NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|2 NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.4344836473464966 63.60840597152711 E 0.004671669099479914 0.5777512192726135 0.4175770878791809 E 0.0018171335104852915 0.001972720492631197 6.694349576719105e-05 0.032625488936901086 0.5659385323524475 0.0390576496720314 0.012248433195054531 0.34627318382263184 -96.22248840332031 112.51033020019531 0.0003130088734906167 E 0.4968152866242038 E 0.5286624203821656 NA NA E 0.5159235668789809 E 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA E 0.5031847133757962 E 0.2929936305732484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5923566878980892 E 0.4012738853503185 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.59 0.59 0.0 0.0 0.0 364A>T V123F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA b 0.1250312328338623 19.217300486564643 E 0.001105399103835225 0.9026183485984802 0.09627629816532136 E 0.0005801241495646536 0.00026523091946728533 6.537812168971867e-06 0.008099923841655254 0.9071035385131836 0.002253775717690587 0.0020494333002716303 0.07964134216308594 -73.84752655029297 115.05164337158205 0.00034755791421048343 E 0.2605633802816901 E 0.323943661971831 NA NA E 0.2676056338028169 E 0.34507042253521125 NA NA NA NA NA NA E 0.20422535211267606 E 0.2605633802816901 E 0.2535211267605634 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2746478873239437 E 0.2323943661971831 E 0.2605633802816901 E 0.23943661971830985 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.53 0.53 0.0 0.0 0.0 367G>T V123L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA b 0.1250312328338623 19.217300486564643 E 0.001105399103835225 0.9026183485984802 0.09627629816532136 E 0.0005801241495646536 0.00026523091946728533 6.537812168971867e-06 0.008099923841655254 0.9071035385131836 0.002253775717690587 0.0020494333002716303 0.07964134216308594 -73.84752655029297 115.05164337158205 0.00034755791421048343 E 0.2605633802816901 E 0.323943661971831 NA NA E 0.2676056338028169 E 0.34507042253521125 NA NA NA NA NA NA E 0.20422535211267606 E 0.2605633802816901 E 0.2535211267605634 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2746478873239437 E 0.2323943661971831 E 0.2605633802816901 E 0.23943661971830985 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.42 0.42 0.0 0.0 0.0 367G>C A125D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.2958950996398926 32.607639980316165 E 0.0001433314464520663 0.9931026697158812 0.006753996014595032 E 4.704953607870266e-05 2.1678097255062315e-05 1.6145376093845698e-06 0.00019887962844222784 0.9935095906257628 0.0017225613119080665 7.585821003885941e-05 0.0044228131882846355 -156.8431396484375 149.70587158203125 0.0006968881352804601 E 0.33962264150943394 E 0.37735849056603776 NA NA E 0.33962264150943394 E 0.3679245283018868 NA NA NA NA NA NA E 0.2452830188679245 E 0.2169811320754717 E 0.3584905660377358 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.4716981132075472 E 0.33962264150943394 E 0.3679245283018868 E 0.3584905660377358 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.47 0.47 0.0 0.0 0.0 374C>A A125G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.2958950996398926 32.607639980316165 E 0.0001433314464520663 0.9931026697158812 0.006753996014595032 E 4.704953607870266e-05 2.1678097255062315e-05 1.6145376093845698e-06 0.00019887962844222784 0.9935095906257628 0.0017225613119080665 7.585821003885941e-05 0.0044228131882846355 -156.8431396484375 149.70587158203125 0.0006968881352804601 E 0.33962264150943394 E 0.37735849056603776 NA NA E 0.33962264150943394 E 0.3679245283018868 NA NA NA NA NA NA E 0.2452830188679245 E 0.2169811320754717 E 0.3584905660377358 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.4716981132075472 E 0.33962264150943394 E 0.3679245283018868 E 0.3584905660377358 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.62 0.0 0.0 0.0 374C>G T126S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.35313159227371216 48.97935184836387 E 9.417178807780148e-05 0.994234263896942 0.005671546328812839 E 3.624954479164444e-05 2.2262503989622928e-05 8.140745535456517e-07 0.00031537809991277754 0.9947701096534728 0.0004283855960238725 9.252665768144652e-05 0.004334278404712677 -131.45841979980472 137.22384643554688 0.000162495140102692 E 0.4859154929577465 - 0.4577464788732394 NA NA E 0.5 E 0.5915492957746479 NA NA NA NA NA NA E 0.3380281690140845 E 0.3661971830985916 E 0.4788732394366197 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.4436619718309859 E 0.34507042253521125 E 0.5 E 0.5 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.980019861657637e-06 1.480831381545613e-05 NA NA NA NA 6.980019861657637e-06 1.480831381545613e-05 1 143266 NA aCt/aGt NA 0 NA NA NA NA NA NA D128G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.5346438288688661 77.0421757400036 E 0.0001029861596180126 0.9822090268135072 0.017687957733869553 E 5.827271888847465e-05 1.3500540262612047e-05 2.3972228291313513e-07 0.00026214009267278016 0.9867967367172241 0.0012825219891965394 0.00026624408201314514 0.011320425197482107 -100.3134994506836 128.94985961914062 0.0006432703812606633 E 0.7116564417177914 E 0.6625766871165644 NA NA E 0.7055214723926381 E 0.8036809815950919 NA NA NA NA NA NA - 0.6441717791411042 E 0.7607361963190185 E 0.7116564417177914 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.6196319018404908 E 0.6503067484662577 E 0.7239263803680982 E 0.7239263803680982 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.3956700058770364e-05 1.6033624841733717e-05 NA NA NA NA 1.3956700058770364e-05 1.6033624841733717e-05 2 143300 NA gAt/gGt NA 0 NA NA NA NA NA NA V130I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|5 NA NA NA NA NA e 0.4665915966033936 71.71512839794158 E 0.00045712679275311535 0.964900553226471 0.03464232385158539 E 0.00027982809115201235 0.00014405799447558818 8.059982064878568e-06 0.01631458662450314 0.9510309100151062 0.0049617295153439045 0.0013866790104657412 0.02587422356009484 -109.17778778076172 132.98219299316406 0.009901578538119793 E 0.5845070422535211 - 0.6338028169014085 NA NA E 0.5774647887323944 - 0.7112676056338029 NA NA NA NA NA NA - 0.7183098591549296 - 0.5985915492957746 E 0.6126760563380281 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.8098591549295775 - 0.7112676056338029 E 0.5845070422535211 E 0.6619718309859155 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5201084290163834e-05 1.7220151807993355e-05 1.5910500223981217e-05 8.719127848289592e-06 4 251406 1.3956499969935974e-05 1.484959386163533e-05 2 143302 Gtt/Att Gtt/Att 0 0 NA NA NA NA NA NA V133G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|1 NA NA NA e 0.7222242951393127 111.00587416291236 C 0.01022376213222742 0.006106060463935137 0.9836701154708862 T 0.004542727954685688 0.0006107992958277464 1.1679530871333556e-05 0.0002676561998669058 0.0012212404981255533 0.05026765540242195 0.9280179142951964 0.015060258097946644 -75.9838638305664 -33.00906753540039 0.04891522601246834 T 0.8802816901408451 T 0.8239436619718309 NA NA T 0.8732394366197183 S 0.7323943661971831 NA NA NA NA NA NA T 0.8028169014084507 T 0.8239436619718309 T 0.8591549295774648 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.908450704225352 T 0.8873239436619719 T 0.8802816901408451 T 0.8591549295774648 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 501360 VUS 1 5.0670482382863594e-05 1.9406955436321392e-05 1.591060026839841e-05 9.656565959172086e-06 4 251404 0.0001116519997594878 1.683391378092223e-05 16 143302 gTt/gGt gTt/gGt 0 0 NA NA NA NA NA NA T134R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|1 NA NA NA e 0.5325763225555421 73.86833593845367 C 0.012562979012727736 0.005971448495984078 0.9814655780792236 T 0.008292007260024548 0.0010575081687420607 1.2509015505202115e-05 0.0003598853654693812 0.0017929611494764683 0.07691587507724762 0.8803002238273621 0.03126906976103784 -99.9412078857422 -9.354985237121582 0.035896848887205124 T 0.5211267605633803 T 0.528169014084507 NA NA T 0.528169014084507 S 0.5985915492957746 NA NA NA NA NA NA T 0.4929577464788733 T 0.6901408450704225 T 0.4929577464788733 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4225352112676056 T 0.4788732394366197 T 0.528169014084507 T 0.4929577464788733 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9797301875951234e-06 1.6177637660952484e-05 NA NA NA NA 6.9797301875951234e-06 1.6177637660952484e-05 1 143272 NA aCa/aGa NA 0 NA NA NA NA NA NA N135D NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|3 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7626186609268188 111.64737195968628 C 0.002422244055196643 0.0071868752129375935 0.9903908967971802 C 0.0016993655590340495 0.0008175618713721633 1.6850108295329846e-05 0.00044166951556690037 0.01148026343435049 0.0999164655804634 0.4317833483219147 0.4538444876670837 66.10575103759766 31.726030349731445 0.06360871344804764 - 0.7643312101910829 S 1.0 NA NA - 0.7643312101910829 - 0.5222929936305732 NA NA NA NA NA NA S 0.9235668789808916 - 0.8280254777070064 - 0.7261146496815286 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.9554140127388536 - 0.8853503184713376 - 0.7515923566878981 - 0.7388535031847133 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.75 0.75 0.0 0.0 0.0 403A>G N135S NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|3 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7626186609268188 111.64737195968628 C 0.002422244055196643 0.0071868752129375935 0.9903908967971802 C 0.0016993655590340495 0.0008175618713721633 1.6850108295329846e-05 0.00044166951556690037 0.01148026343435049 0.0999164655804634 0.4317833483219147 0.4538444876670837 66.10575103759766 31.726030349731445 0.06360871344804764 - 0.7643312101910829 S 1.0 NA NA - 0.7643312101910829 - 0.5222929936305732 NA NA NA NA NA NA S 0.9235668789808916 - 0.8280254777070064 - 0.7261146496815286 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.9554140127388536 - 0.8853503184713376 - 0.7515923566878981 - 0.7388535031847133 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.733307798313049e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.733307798313049e-05 1 143336 NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA T137M NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA e 0.6105505228042603 84.68335751295089 E 0.0002853443147614599 0.9537715911865234 0.0459429919719696 E 0.00018386899319011718 5.052319829701446e-05 2.1028165519965111e-07 0.011789177544414995 0.9462888836860656 0.003565620863810181 0.0013620348181575535 0.03675967827439308 -89.75308990478516 131.33731079101562 0.01747908443212509 E 0.5422535211267606 - 0.5422535211267606 NA NA E 0.5704225352112676 - 0.6901408450704225 NA NA NA NA NA NA - 0.4647887323943662 - 0.4788732394366197 E 0.5704225352112676 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5422535211267606 - 0.5633802816901409 E 0.5492957746478874 E 0.5985915492957746 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 449504 conflict 1 7.602216052396544e-06 1.7222406886852958e-05 7.955390174174681e-06 9.469010773937696e-06 2 251402 6.982269951549823e-06 1.4385726743525055e-05 1 143220 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA E143K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA e 0.27500325441360474 48.04306854605674 E 6.188823317643255e-05 0.997498095035553 0.0024400954134762287 E 1.5384826838271692e-05 9.140226211457048e-06 4.946293756802335e-07 7.911470311228186e-05 0.997669756412506 0.0005905565340071918 3.7935653381282464e-05 0.0015976154245436196 -158.31373596191406 147.6476593017578 0.00029379015904851263 E 0.3402061855670103 E 0.29381443298969073 NA NA E 0.34536082474226804 E 0.2371134020618557 NA NA NA NA NA NA E 0.4175257731958763 E 0.4381443298969072 E 0.3402061855670103 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.3402061855670103 E 0.28350515463917525 E 0.3402061855670103 E 0.3505154639175257 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 5.067115077781166e-06 1.745159368257528e-05 3.9778201426088344e-06 8.688745632635805e-06 1 251394 6.977979865041562e-06 1.5134854521701017e-05 1 143308 Gag/Aag Gag/Aag 0 0 NA NA NA NA NA NA Q145* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2777777777777778 E 0.101010101010101 NA NA E 0.2828282828282828 E 0.2878787878787879 NA NA NA NA NA NA E 0.13131313131313133 E 0.2878787878787879 E 0.26262626262626265 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.1717171717171717 E 0.2676767676767677 E 0.2525252525252525 E 0.2575757575757576 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 370763 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q145H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA b 0.24372199177742004 43.52874773144722 E 0.0001302676828345284 0.9960414171218872 0.003828319953754544 E 4.7332163376268e-05 2.7922143999603577e-05 1.1903606491614478e-06 8.26664618216455e-05 0.9968807697296144 0.000366475636838004 9.362550190417096e-05 0.002500047907233239 -120.30619049072266 131.70698547363278 6.128039240138605e-05 E 0.2777777777777778 E 0.101010101010101 NA NA E 0.2828282828282828 E 0.2878787878787879 NA NA NA NA NA NA E 0.13131313131313133 E 0.2878787878787879 E 0.26262626262626265 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.1717171717171717 E 0.2676767676767677 E 0.2525252525252525 E 0.2575757575757576 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.977570031565847e-06 9.254474271926089e-06 3.977570031565847e-06 9.254474271926089e-06 1 251410 NA NA NA NA caA/caC NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V148I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA b 0.018472224473953247 2.8391809016466136 E 0.00016616236825939268 0.9275579452514648 0.07227581739425659 E 3.3742791856639094e-05 5.418961518444121e-05 8.180811050806369e-07 0.011270091868937016 0.9101210832595824 0.007053326349705458 0.0005568269407376647 0.07090990990400314 -117.2887725830078 132.67161560058594 0.00015390790940728039 E 0.0 E 0.0 NA NA E 0.0 E 0.09154929577464788 NA NA NA NA NA NA B 0.014084507042253518 E 0.07042253521126761 E 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.007042253521126761 - 0.04225352112676056 E 0.0 E 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.2669930595827625e-05 1.6317586153362704e-05 1.1933199857594444e-05 8.450610652949914e-06 3 251400 1.3963000128569547e-05 1.395889671373292e-05 2 143236 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA V148L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|6 NA NA NA NA NA b 0.018472224473953247 2.8391809016466136 E 0.00016616236825939268 0.9275579452514648 0.07227581739425659 E 3.3742791856639094e-05 5.418961518444121e-05 8.180811050806369e-07 0.011270091868937016 0.9101210832595824 0.007053326349705458 0.0005568269407376647 0.07090990990400314 -117.2887725830078 132.67161560058594 0.00015390790940728039 E 0.0 E 0.0 NA NA E 0.0 E 0.09154929577464788 NA NA NA NA NA NA B 0.014084507042253518 E 0.07042253521126761 E 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.007042253521126761 - 0.04225352112676056 E 0.0 E 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5910900401649993e-05 9.435517180429793e-06 1.5910900401649993e-05 9.435517180429793e-06 4 251400 NA NA NA NA Gtc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G149E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07264202833175659 5.716927629709244 C 0.0008088207105174661 0.3468773066997528 0.652313768863678 C 9.406699246028437e-05 0.00028295660740695894 7.655023182451263e-06 0.011317260563373566 0.2913924753665924 0.03626954182982445 0.0014577970141544938 0.6591781973838806 -88.56583404541016 166.90846252441406 9.641422366257757e-05 - 0.0 - 0.03571428571428571 NA NA - 0.0 E 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 E 0.047619047619047616 - 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 - 0.0 - 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.977790129283676e-06 8.659853944428658e-06 3.977790129283676e-06 8.659853944428658e-06 1 251396 NA NA NA NA gGa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G149R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07264202833175659 5.716927629709244 C 0.0008088207105174661 0.3468773066997528 0.652313768863678 C 9.406699246028437e-05 0.00028295660740695894 7.655023182451263e-06 0.011317260563373566 0.2913924753665924 0.03626954182982445 0.0014577970141544938 0.6591781973838806 -88.56583404541016 166.90846252441406 9.641422366257757e-05 - 0.0 - 0.03571428571428571 NA NA - 0.0 E 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 E 0.047619047619047616 - 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 - 0.0 - 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 497771 benign 2 0.0005879792000138125 1.9084823395078545e-05 0.0007279529818333684 9.597241561231096e-06 183 251390 0.00034222198883071536 1.6496164355289255e-05 49 143182 Gga/Aga Gga/Aga 2 0 NA NA NA NA NA NA Q150R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA e 0.4298946559429169 76.77918555140495 H 0.98562091588974 0.00023120170226320624 0.0141478031873703 H 0.008106962777674198 0.9760615825653076 0.0004472446453291923 6.918936560396105e-05 0.0001022248252411373 0.002736050169914961 0.011198153719305992 0.0012785954168066382 -59.15786743164063 -39.26320266723633 0.000156388632603921 H 0.4292929292929293 H 0.2828282828282828 NA NA H 0.42424242424242425 H 0.4595959595959596 NA NA NA NA NA NA H 0.3888888888888889 H 0.3333333333333333 H 0.4141414141414141 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3232323232323233 H 0.5252525252525253 H 0.42424242424242425 H 0.42424242424242425 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9775000004738095e-06 8.838583974211184e-06 3.9775000004738095e-06 8.838583974211184e-06 1 251414 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M156R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA b 0.018208146095275882 3.643450033664704 H 0.9975487589836121 6.390761700458825e-05 0.0023874146863818173 H 0.001099855755455792 0.9925000071525574 0.0043603042140603065 1.8987424482475035e-05 1.553397305542603e-05 0.00017725228099152446 0.0015117444563657045 0.0003162851207889616 -62.67547607421875 -43.05767059326172 4.391081165522337e-05 H 0.0053191489361702135 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0 H 0.026595744680851064 NA NA NA NA NA NA H 0.02127659574468085 H 0.015957446808510637 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.010638297872340424 H 0.05319148936170213 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 467T>G M156T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA b 0.018208146095275882 3.643450033664704 H 0.9975487589836121 6.390761700458825e-05 0.0023874146863818173 H 0.001099855755455792 0.9925000071525574 0.0043603042140603065 1.8987424482475035e-05 1.553397305542603e-05 0.00017725228099152446 0.0015117444563657045 0.0003162851207889616 -62.67547607421875 -43.05767059326172 4.391081165522337e-05 H 0.0053191489361702135 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0 H 0.026595744680851064 NA NA NA NA NA NA H 0.02127659574468085 H 0.015957446808510637 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.010638297872340424 H 0.05319148936170213 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 285856 VUS 1 0.00011908289540967246 1.723580458058695e-05 0.00011931700282730161 8.0144701294439e-06 30 251432 0.00011867199646076189 1.5259135889179094e-05 17 143252 aTg/aCg aTg/aCg 0 0 NA NA NA NA NA NA M156V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA b 0.018208146095275882 3.643450033664704 H 0.9975487589836121 6.390761700458825e-05 0.0023874146863818173 H 0.001099855755455792 0.9925000071525574 0.0043603042140603065 1.8987424482475035e-05 1.553397305542603e-05 0.00017725228099152446 0.0015117444563657045 0.0003162851207889616 -62.67547607421875 -43.05767059326172 4.391081165522337e-05 H 0.0053191489361702135 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0 H 0.026595744680851064 NA NA NA NA NA NA H 0.02127659574468085 H 0.015957446808510637 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.010638297872340424 H 0.05319148936170213 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.094407671452249e-05 1.6695446913769405e-05 4.3749099859269336e-05 8.332393503393055e-06 11 251434 0.0001186790032079443 1.4467521078439997e-05 17 143244 Atg/Gtg Atg/Gtg 0 0 0.94 0.94 0.0 0.0 0.0 466A>G Y157C NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA b 0.09463387727737428 20.22325957417488 H 0.9960865974426272 0.0001981973036890849 0.003715179162099958 H 0.004035983234643936 0.9836022853851318 0.0077341264113783845 6.269656296353787e-05 5.33852398802992e-05 0.00023968493042048067 0.003655285341665149 0.0006165662198327483 -63.06051635742188 -40.24374008178711 0.00012024580792058259 H 0.14414414414414414 H 0.16216216216216214 NA NA H 0.14864864864864866 H 0.1981981981981982 NA NA NA NA NA NA H 0.2117117117117117 H 0.2477477477477477 H 0.14414414414414414 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.13063063063063066 H 0.20270270270270271 H 0.13963963963963966 H 0.14864864864864866 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.983239927649264e-06 1.4197173417390836e-05 NA NA NA NA 6.983239927649264e-06 1.4197173417390836e-05 1 143200 NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA A159V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA NA b 0.07816654443740845 8.613953197002411 H 0.8721134662628174 0.0005265675135888159 0.12735997140407562 H 0.03149303793907165 0.822188138961792 0.004770573228597641 0.00023723306367173788 0.00013248344475869092 0.0067788902670145035 0.12541648745536804 0.00898314081132412 -68.43953704833984 -31.02778434753418 0.00017417609342373908 H 0.018867924528301886 H 0.02830188679245283 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA H 0.018867924528301886 H 0.12264150943396225 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.04716981132075472 H 0.19811320754716985 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 864676 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R161Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4436260759830475 101.59037140011787 C 0.14311963319778442 0.13090926408767695 0.7259711027145386 T 0.06156224384903908 0.08221596479415894 0.0011326917447149756 0.008849825710058212 0.03979193791747093 0.042485211044549935 0.7397110462188721 0.02425111457705497 -72.02935791015625 -13.73965072631836 0.00044075475307181483 T 0.4596774193548387 T 0.3790322580645161 NA NA T 0.4556451612903226 T 0.5604838709677419 NA NA NA NA NA NA T 0.4879032258064516 T 0.3951612903225806 T 0.4798387096774194 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4233870967741936 T 0.40725806451612906 T 0.4919354838709678 T 0.4838709677419355 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.98158009981853e-06 1.4519580740444782e-05 NA NA NA NA 6.98158009981853e-06 1.4519580740444782e-05 1 143234 NA cGg/cAg NA 0 NA NA NA NA NA NA R161W NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4436260759830475 101.59037140011787 C 0.14311963319778442 0.13090926408767695 0.7259711027145386 T 0.06156224384903908 0.08221596479415894 0.0011326917447149756 0.008849825710058212 0.03979193791747093 0.042485211044549935 0.7397110462188721 0.02425111457705497 -72.02935791015625 -13.73965072631836 0.00044075475307181483 T 0.4596774193548387 T 0.3790322580645161 NA NA T 0.4556451612903226 T 0.5604838709677419 NA NA NA NA NA NA T 0.4879032258064516 T 0.3951612903225806 T 0.4798387096774194 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4233870967741936 T 0.40725806451612906 T 0.4919354838709678 T 0.4838709677419355 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 181454 VUS 1 3.0407142954677954e-05 1.9885354614467402e-05 1.590770079928916e-05 8.688775196922274e-06 4 251450 5.586829865933396e-05 1.788665742167799e-05 8 143194 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA E164A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5422340631484985 94.72829083204269 E 0.002527933102101088 0.7973296046257019 0.2001424878835678 E 0.0007771120290271938 0.0010586082935333252 3.27977686538361e-05 0.2942986190319061 0.4871846735477448 0.010444543324410915 0.0035601607523858547 0.2026435285806656 -112.06206512451172 134.67308044433594 0.002710979664698243 B 0.20618556701030927 B 0.02577319587628866 NA NA B 0.21134020618556698 B 0.20103092783505155 NA NA NA NA NA NA B 0.030927835051546393 - 0.4793814432989691 B 0.17010309278350516 NA NA NA NA NA NA NA NA B 0.07731958762886597 B 0.11855670103092784 B 0.14432989690721648 B 0.18041237113402064 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976780135417357e-06 9.164805038307117e-06 3.976780135417357e-06 9.164805038307117e-06 1 251460 NA NA NA NA gAg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E164G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5422340631484985 94.72829083204269 E 0.002527933102101088 0.7973296046257019 0.2001424878835678 E 0.0007771120290271938 0.0010586082935333252 3.27977686538361e-05 0.2942986190319061 0.4871846735477448 0.010444543324410915 0.0035601607523858547 0.2026435285806656 -112.06206512451172 134.67308044433594 0.002710979664698243 B 0.20618556701030927 B 0.02577319587628866 NA NA B 0.21134020618556698 B 0.20103092783505155 NA NA NA NA NA NA B 0.030927835051546393 - 0.4793814432989691 B 0.17010309278350516 NA NA NA NA NA NA NA NA B 0.07731958762886597 B 0.11855670103092784 B 0.14432989690721648 B 0.18041237113402064 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976780135417357e-06 1.0064639649733844e-05 3.976780135417357e-06 1.0064639649733844e-05 1 251460 NA NA NA NA gAg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A165D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.08854261040687561 9.757395666837693 C 0.006699323188513517 0.33878618478775024 0.654514491558075 C 0.0019473774591460824 0.002356574172154069 4.2151736124651507e-05 0.0253573190420866 0.2572236657142639 0.025112254545092583 0.006296816747635603 0.6816639304161072 -104.19094848632812 128.40435791015622 0.003677876433357597 - 0.04716981132075472 - 0.018867924528301886 NA NA - 0.05660377358490566 - 0.0 NA NA NA NA NA NA - 0.04716981132075472 - 0.02830188679245283 - 0.08490566037735849 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0 - 0.0660377358490566 - 0.08490566037735849 - 0.08490566037735849 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 502282 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S167* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.2307692307692308 T 0.16923076923076924 NA NA S 0.24615384615384614 T 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA T 0.3692307692307693 T 0.5615384615384615 T 0.946153846153846 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.3230769230769231 T 0.2384615384615385 T 0.9384615384615383 T 0.9615384615384616 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 370794 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S167L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.35867154598236084 42.03630518913268 C 0.26316314935684204 0.029060628265142437 0.7077762484550476 T 0.18784834444522852 0.05045943707227707 0.0004823319031856954 0.0077866767533123485 0.012358499690890312 0.10853560268878937 0.5157120227813721 0.11681710928678513 -73.7104721069336 -19.133747100830078 0.004068887326866388 S 0.2307692307692308 T 0.16923076923076924 NA NA S 0.24615384615384614 T 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA T 0.3692307692307693 T 0.5615384615384615 T 0.946153846153846 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.3230769230769231 T 0.2384615384615385 T 0.9384615384615383 T 0.9615384615384616 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 5.066805370105739e-06 1.706407720804748e-05 3.976870175392833e-06 8.307787406101794e-06 1 251454 6.9797301875951234e-06 1.4905146741217341e-05 1 143272 tCa/tTa tCa/tTa 0 0 NA NA NA NA NA NA D170E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|7 NA NA NA NA NA e 0.34965795278549194 50.38571099638938 C 0.2484139055013657 0.06414783000946045 0.6874383091926575 C 0.018626514822244644 0.19548754394054413 0.003451323835179209 0.01708136685192585 0.04810460284352303 0.2355284392833709 0.07196887582540512 0.4097513258457184 -83.20536041259766 170.54046630859375 0.002623301697894931 S 0.588957055214724 S 0.4723926380368098 NA NA S 0.5950920245398773 S 0.3496932515337423 NA NA NA NA NA NA S 0.4601226993865031 S 0.147239263803681 S 0.6319018404907976 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.4846625766871165 S 0.5398773006134969 S 0.6380368098159509 S 0.6196319018404908 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 890772 VUS 1 1.2667634436521692e-05 1.73074513594368e-05 1.590770079928916e-05 9.103086341660473e-06 4 251450 6.980510079301894e-06 1.4720111807168627e-05 1 143256 gaC/gaG gaC/gaG 0 0 NA NA NA NA NA NA K171R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|7 NA NA NA NA NA e 0.3422457575798035 70.39995233416558 E 0.2492768913507461 0.5406004786491394 0.21012261509895325 B 0.00995676312595606 0.2024656981229782 0.0010231578489765523 0.3841990530490875 0.2306131422519684 0.0194743312895298 0.02464246191084385 0.12762542068958282 -66.64235687255861 129.77471923828122 0.001252391142770648 B 0.3024390243902439 B 0.35121951219512193 NA NA B 0.2975609756097561 B 0.3560975609756097 NA NA NA NA NA NA B 0.3463414634146341 - 0.3121951219512195 B 0.3121951219512195 NA NA NA NA NA NA NA NA B 0.3707317073170732 B 0.3804878048780488 B 0.32195121951219513 B 0.32195121951219513 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.979239969950868e-06 1.788168517811156e-05 NA NA NA NA 6.979239969950868e-06 1.788168517811156e-05 1 143282 NA aAg/aGg NA 0 NA NA NA NA NA NA A172S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.016044259071350098 1.7680773496627809 H 0.9243521094322203 0.008159801363945006 0.06748811900615692 H 0.10550448298454283 0.7939484119415283 0.0021579931490123268 0.0012450404465198515 0.007708002813160419 0.015851445496082306 0.03883475065231323 0.03474992886185646 -68.25070953369139 -37.02891159057617 0.0005876675713807342 T 0.0 G 0.009433962264150943 NA NA T 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA G 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 T 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 G 0.009433962264150943 T 0.0 T 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.980319994909222e-06 1.9192312698117886e-05 NA NA NA NA 6.980319994909222e-06 1.9192312698117886e-05 1 143260 NA Gcc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA A172T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.016044259071350098 1.7680773496627809 H 0.9243521094322203 0.008159801363945006 0.06748811900615692 H 0.10550448298454283 0.7939484119415283 0.0021579931490123268 0.0012450404465198515 0.007708002813160419 0.015851445496082306 0.03883475065231323 0.03474992886185646 -68.25070953369139 -37.02891159057617 0.0005876675713807342 T 0.0 G 0.009433962264150943 NA NA T 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA G 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 T 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 G 0.009433962264150943 T 0.0 T 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976840162067673e-06 8.817411072460158e-06 3.976840162067673e-06 8.817411072460158e-06 1 251456 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A172V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.016044259071350098 1.7680773496627809 H 0.9243521094322203 0.008159801363945006 0.06748811900615692 H 0.10550448298454283 0.7939484119415283 0.0021579931490123268 0.0012450404465198515 0.007708002813160419 0.015851445496082306 0.03883475065231323 0.03474992886185646 -68.25070953369139 -37.02891159057617 0.0005876675713807342 T 0.0 G 0.009433962264150943 NA NA T 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA G 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 T 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.0 G 0.009433962264150943 T 0.0 T 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.6005531368088605e-06 1.802846910366288e-05 7.953989552333951e-06 8.541412571492456e-06 2 251446 6.980219950492027e-06 1.587671154569729e-05 1 143262 gCc/gTc gCc/gTc 0 0 NA NA NA NA NA NA L175F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.12231716513633728 22.396272936463355 H 0.97786146402359 0.0006724416161887348 0.021466050297021862 H 0.08839243650436401 0.8761797547340393 0.004550765268504621 0.00013542300439439714 0.0004200597759336233 0.002438316354528069 0.02446484565734864 0.003418333362787962 -65.32932281494139 -35.93361282348633 0.0016275668749585748 H 0.4817073170731707 G 0.6036585365853658 NA NA H 0.4878048780487805 H 0.5365853658536586 NA NA NA NA NA NA G 0.6036585365853658 H 0.1524390243902439 H 0.573170731707317 NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.6280487804878049 G 0.5975609756097561 H 0.573170731707317 H 0.573170731707317 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976840162067673e-06 8.59351556046754e-06 3.976840162067673e-06 8.59351556046754e-06 1 251456 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C177Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|7 STRAND|8 NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.14710241556167605 20.653179144859315 C 0.4845328629016876 0.007579593453556298 0.5078876018524171 H 0.02627642825245857 0.41227641701698303 0.01100295316427946 0.006203984841704369 0.00166853831615299 0.0964115560054779 0.3972623348236084 0.04889786243438722 -101.16100311279295 4.96697998046875 0.0012153548886999488 S 0.0 S 0.0 NA NA S 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.0 T 0.0 S 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.0 S 0.02962962962962963 S 0.0 S 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 2974 pathogenic 2 1.395599974785e-05 1.4718573942040685e-05 NA NA NA NA 1.395599974785e-05 1.4718573942040685e-05 2 143308 NA tGt/tAt NA 0 NA NA NA NA NA NA D180E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.6029664278030396 86.887462246418 C 0.033037129789590836 0.006924301851540804 0.9600386023521424 C 0.037414003163576126 0.013148468919098377 0.0001351479149889201 0.0065066819079220295 0.004181105177849531 0.2359218746423721 0.1793033480644226 0.5233893394470215 -96.26998138427734 100.6766357421875 0.004549202974885702 - 0.7177914110429447 - 0.6871165644171779 NA NA - 0.6993865030674846 - 0.5398773006134969 NA NA NA NA NA NA - 0.6012269938650306 - 0.4355828220858896 - 0.7177914110429447 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5950920245398773 - 0.5521472392638037 - 0.7116564417177914 - 0.7055214723926381 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 8.58205957852166e-06 3.9766500776750036e-06 8.58205957852166e-06 1 251468 NA NA NA NA gaC/gaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D180Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.6029664278030396 86.887462246418 C 0.033037129789590836 0.006924301851540804 0.9600386023521424 C 0.037414003163576126 0.013148468919098377 0.0001351479149889201 0.0065066819079220295 0.004181105177849531 0.2359218746423721 0.1793033480644226 0.5233893394470215 -96.26998138427734 100.6766357421875 0.004549202974885702 - 0.7177914110429447 - 0.6871165644171779 NA NA - 0.6993865030674846 - 0.5398773006134969 NA NA NA NA NA NA - 0.6012269938650306 - 0.4355828220858896 - 0.7177914110429447 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5950920245398773 - 0.5521472392638037 - 0.7116564417177914 - 0.7055214723926381 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.013162872856244e-05 1.8322720948958547e-05 1.1929600077564826e-05 9.656493252316682e-06 3 251476 6.976999884500401e-06 1.5571584410115973e-05 1 143328 Gac/Tac Gac/Tac 0 0 NA NA NA NA NA NA A181T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|2 NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.15130695700645447 16.674026662111284 H 0.7147181630134583 0.0024429887998849162 0.2828388214111328 G 0.6932517290115356 0.09012702852487564 0.00027009088080376387 0.0013112991582602262 0.0010634203208610415 0.030280133709311482 0.10687381774187088 0.07682240754365921 -60.47493362426758 -24.632568359375 0.005952614825218916 T 0.2358490566037736 T 0.2735849056603773 NA NA T 0.2452830188679245 T 0.2075471698113208 NA NA NA NA NA NA T 0.2641509433962264 T 0.5471698113207547 T 0.2075471698113208 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.3679245283018868 T 0.16981132075471694 T 0.2358490566037736 G 0.2169811320754717 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 497961 VUS 2 0.00011651648565085569 1.7404644188837203e-05 0.00011929500033147632 7.985342194084145e-06 30 251478 0.00011164099851157518 1.5464667774750423e-05 16 143316 Gct/Act Gct/Act 0 0 NA NA NA NA NA NA D182N NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|2 NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.8387943506240845 120.87026592493055 H 0.7566519975662231 0.0009397450485266744 0.2424083054065705 G 0.7245690226554871 0.06670185178518295 0.00011771642311941831 0.00033216425799764693 0.00034140344359911984 0.02468985877931118 0.15937452018260956 0.0238733533769846 -67.26066589355469 -25.40362548828125 0.0039126710034906855 T 0.9079754601226994 T 0.9325153374233128 NA NA T 0.9141104294478528 T 0.8159509202453987 NA NA NA NA NA NA T 0.9079754601226994 T 0.8650306748466258 T 0.9202453987730062 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9386503067484664 T 0.8588957055214724 T 0.9325153374233128 G 0.9325153374233128 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 502363 VUS 2 6.839136861483526e-05 1.8183755729008014e-05 3.181320062140003e-05 8.880408323795455e-06 8 251468 0.0001325719931628555 1.586780767512942e-05 19 143318 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA A183S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|2 NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.4960890412330627 54.66901234388352 H 0.7926439642906189 0.003485734807327389 0.20387032628059387 G 0.7136591076850891 0.08426816761493683 0.00036076141986995935 0.001158500672318041 0.0012004921445623038 0.026683010160923004 0.14965397119522095 0.023016082122921944 -87.80606842041016 -5.977581024169923 0.0038267574273049827 T 0.3962264150943397 S 0.6698113207547169 NA NA T 0.3962264150943397 T 0.5188679245283019 NA NA NA NA NA NA S 0.6226415094339622 T 0.3584905660377358 T 0.3962264150943397 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.5094339622641509 T 0.5943396226415094 T 0.3962264150943397 G 0.3867924528301887 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.7998724356186765e-05 1.939694376983794e-05 1.5906200133031234e-05 9.168950849677037e-06 4 251474 7.677490066271274e-05 1.709303273051513e-05 11 143276 Gcc/Tcc Gcc/Tcc 0 0 NA NA NA NA NA NA A183T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|2 NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.4960890412330627 54.66901234388352 H 0.7926439642906189 0.003485734807327389 0.20387032628059387 G 0.7136591076850891 0.08426816761493683 0.00036076141986995935 0.001158500672318041 0.0012004921445623038 0.026683010160923004 0.14965397119522095 0.023016082122921944 -87.80606842041016 -5.977581024169923 0.0038267574273049827 T 0.3962264150943397 S 0.6698113207547169 NA NA T 0.3962264150943397 T 0.5188679245283019 NA NA NA NA NA NA S 0.6226415094339622 T 0.3584905660377358 T 0.3962264150943397 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.5094339622641509 T 0.5943396226415094 T 0.3962264150943397 G 0.3867924528301887 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 181450 VUS 2 0.000187460220257076 1.7122508273656524e-05 7.555449701612815e-05 7.889383386211584e-06 19 251474 0.0003838739939965308 1.5196641713444613e-05 55 143276 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0 NA NA NA NA NA NA A183V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA TURN|2 NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.4960890412330627 54.66901234388352 H 0.7926439642906189 0.003485734807327389 0.20387032628059387 G 0.7136591076850891 0.08426816761493683 0.00036076141986995935 0.001158500672318041 0.0012004921445623038 0.026683010160923004 0.14965397119522095 0.023016082122921944 -87.80606842041016 -5.977581024169923 0.0038267574273049827 T 0.3962264150943397 S 0.6698113207547169 NA NA T 0.3962264150943397 T 0.5188679245283019 NA NA NA NA NA NA S 0.6226415094339622 T 0.3584905660377358 T 0.3962264150943397 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.5094339622641509 T 0.5943396226415094 T 0.3962264150943397 G 0.3867924528301887 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.953170097607654e-06 8.31538319840884e-06 7.953170097607654e-06 8.31538319840884e-06 2 251472 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C184Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|7 NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.0925009548664093 12.987134063243866 C 0.04760245978832245 0.030588764697313312 0.9218087196350098 C 0.02260403521358967 0.022752275690436363 0.0001901203067973256 0.02616161108016968 0.01587776467204094 0.16103950142860413 0.021363845095038414 0.7300108671188354 -86.61125183105469 127.80171966552734 0.0012824616860598324 - 0.014814814814814815 - 0.022222222222222227 NA NA - 0.014814814814814815 - 0.022222222222222227 NA NA NA NA NA NA - 0.037037037037037035 - 0.06666666666666668 - 0.022222222222222227 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.022222222222222227 - 0.022222222222222227 - 0.02962962962962963 - 0.022222222222222227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 551548 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N185D NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|4 NA NA NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.43862876296043396 64.21525089740753 C 0.015967147424817085 0.02784464880824089 0.9561882615089417 C 0.0017864377005025747 0.008876867592334747 2.972214133478701e-05 0.03794589266180992 0.009962072595953941 0.09321055561304092 0.004551781341433525 0.8436366319656372 -110.4021453857422 161.73419189453125 0.0005731742712669077 - 0.5222929936305732 - 0.6496815286624203 NA NA - 0.5159235668789809 - 0.535031847133758 NA NA NA NA NA NA - 0.6114649681528662 - 0.7006369426751592 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6114649681528662 - 0.6496815286624203 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A 970033 VUS 1 8.105538908534809e-05 1.9690206561274e-05 7.95305022620596e-05 8.875047967522844e-06 20 251476 8.373110176762566e-05 1.757662533024489e-05 12 143316 Aat/Gat Aat/Gat 0 0 NA NA NA NA NA NA N188D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|10 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.37217432260513306 54.48632082939148 H 0.9975784420967102 0.00012624530063476408 0.0022952903527766466 H 0.003559882286936045 0.9925514459609984 0.0014337141765281554 3.270540764788166e-05 5.798484926344827e-05 0.0002327080001123249 0.001524194609373808 0.0006072456599213183 -65.51287841796875 -40.42597961425781 6.196983304107562e-05 H 0.20382165605095545 H 0.19745222929936307 NA NA H 0.20382165605095545 H 0.5668789808917197 NA NA NA NA NA NA H 0.5159235668789809 H 0.2547770700636943 H 0.2420382165605096 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2738853503184713 H 0.5222929936305732 H 0.2547770700636943 H 0.2420382165605096 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 9.549397274889477e-06 3.97652001993265e-06 9.549397274889477e-06 1 251476 NA NA NA NA Aac/Gac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N188S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|10 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.37217432260513306 54.48632082939148 H 0.9975784420967102 0.00012624530063476408 0.0022952903527766466 H 0.003559882286936045 0.9925514459609984 0.0014337141765281554 3.270540764788166e-05 5.798484926344827e-05 0.0002327080001123249 0.001524194609373808 0.0006072456599213183 -65.51287841796875 -40.42597961425781 6.196983304107562e-05 H 0.20382165605095545 H 0.19745222929936307 NA NA H 0.20382165605095545 H 0.5668789808917197 NA NA NA NA NA NA H 0.5159235668789809 H 0.2547770700636943 H 0.2420382165605096 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2738853503184713 H 0.5222929936305732 H 0.2547770700636943 H 0.2420382165605096 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 659101 VUS 1 5.066189196241415e-05 1.8858303000328768e-05 3.578870018827729e-05 9.509411603474104e-06 9 251476 7.676309905946255e-05 1.6285167576906325e-05 11 143298 aAc/aGc aAc/aGc 0 0 NA NA NA NA NA NA I190T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|10 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.03437831997871399 6.359989196062088 H 0.9960057139396667 8.708027598913759e-05 0.003907271660864353 H 0.006901996210217476 0.9826241135597228 0.006360106170177461 4.324223846197128e-05 3.308359009679407e-05 0.0002744286903180181 0.002789568156003952 0.0009733936167322099 -63.38821411132813 -39.05155563354492 5.016132490709424e-05 H 0.0 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.0 H 0.14792899408284024 NA NA NA NA NA NA H 0.005917159763313609 H 0.07692307692307693 H 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.01183431952662722 H 0.0650887573964497 H 0.0 H 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 498758 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA M193I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|10 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.015147984027862547 3.031111603975297 H 0.9019791483879088 0.001328057493083179 0.09669284522533417 H 0.04194935783743858 0.7550356984138489 0.0350521132349968 0.0008602034067735076 0.0002504844160284846 0.012165760621428491 0.14785069227218628 0.006835814565420151 -70.31432342529297 -29.50966835021973 0.00032640589051879937 H 0.13297872340425532 H 0.1702127659574468 NA NA H 0.13297872340425532 H 0.14361702127659576 NA NA NA NA NA NA H 0.15425531914893614 H 0.20212765957446807 H 0.10638297872340426 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.18085106382978725 H 0.2819148936170213 H 0.1276595744680851 H 0.10638297872340426 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 808374 VUS 1 1.1929600077564826e-05 7.662928685095571e-06 1.1929600077564826e-05 7.662928685095571e-06 3 251476 NA NA NA NA atG/atA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M193V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|10 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.015147984027862547 3.031111603975297 H 0.9019791483879088 0.001328057493083179 0.09669284522533417 H 0.04194935783743858 0.7550356984138489 0.0350521132349968 0.0008602034067735076 0.0002504844160284846 0.012165760621428491 0.14785069227218628 0.006835814565420151 -70.31432342529297 -29.50966835021973 0.00032640589051879937 H 0.13297872340425532 H 0.1702127659574468 NA NA H 0.13297872340425532 H 0.14361702127659576 NA NA NA NA NA NA H 0.15425531914893614 H 0.20212765957446807 H 0.10638297872340426 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.18085106382978725 H 0.2819148936170213 H 0.1276595744680851 H 0.10638297872340426 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.986429550562471e-06 3.97652001993265e-06 8.986429550562471e-06 1 251476 NA NA NA NA Atg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F194L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.05791667103767395 11.62387587726116 C 0.20457060635089874 0.0338495709002018 0.7615798115730286 T 0.030337478965520862 0.12645158171653748 0.02199131995439529 0.05784696713089942 0.00862938817590475 0.18163396418094635 0.4231452643871307 0.1499640792608261 -96.69476318359376 19.01996421813965 0.00045519613195210695 T 0.015228426395939087 H 0.03553299492385787 NA NA T 0.01015228426395939 H 0.045685279187817264 NA NA NA NA NA NA H 0.04060913705583756 H 0.04060913705583756 T 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.04060913705583756 H 0.07106598984771574 T 0.01015228426395939 T 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 9.136450406305436e-06 3.976490006607492e-06 9.136450406305436e-06 1 251478 NA NA NA NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F194S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.05791667103767395 11.62387587726116 C 0.20457060635089874 0.0338495709002018 0.7615798115730286 T 0.030337478965520862 0.12645158171653748 0.02199131995439529 0.05784696713089942 0.00862938817590475 0.18163396418094635 0.4231452643871307 0.1499640792608261 -96.69476318359376 19.01996421813965 0.00045519613195210695 T 0.015228426395939087 H 0.03553299492385787 NA NA T 0.01015228426395939 H 0.045685279187817264 NA NA NA NA NA NA H 0.04060913705583756 H 0.04060913705583756 T 0.0 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.04060913705583756 H 0.07106598984771574 T 0.01015228426395939 T 0.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 5.066367121708294e-06 1.8243578222289166e-05 3.9765500332578085e-06 8.175764447605629e-06 1 251474 6.979049885558197e-06 1.630904724531913e-05 1 143286 tTc/tCc tTc/tCc 0 0 NA NA NA NA NA NA K196E NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|11 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.557731032371521 114.72527335882187 C 0.1727954000234604 0.015496344305574894 0.8117082715034485 T 0.09905947744846344 0.028842303901910782 0.0010167774744331837 0.0035316392313688993 0.005921867210417986 0.15812955796718595 0.6383980512619019 0.06510029733181 -68.47413635253906 -28.239273071289066 0.0015015224926173687 G 0.4390243902439024 G 0.3463414634146341 NA NA G 0.4292682926829268 S 0.6146341463414634 NA NA NA NA NA NA G 0.1024390243902439 G 0.33170731707317075 G 0.4341463414634146 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.36585365853658536 G 0.14634146341463414 G 0.4390243902439024 G 0.4439024390243903 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 890771 VUS 1 1.1929500033147631e-05 9.2088733610607e-06 1.1929500033147631e-05 9.2088733610607e-06 3 251478 NA NA NA NA Aag/Gag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D197G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|11 NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.7155974507331848 103.11759265065191 C 0.15802708268165588 0.009623957797884941 0.8323490023612976 T 0.12084396928548813 0.01993599161505699 0.0011615775292739276 0.003543839789927005 0.0034051970578730106 0.1317688673734665 0.6608838438987732 0.0584566742181778 -82.00727844238281 -1.1309237480163574 0.0014329132391139865 G 0.7668711656441718 G 0.8282208588957055 NA NA G 0.7361963190184049 S 0.7914110429447853 NA NA NA NA NA NA G 0.7975460122699386 G 0.7668711656441718 G 0.7484662576687117 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.588957055214724 G 0.7730061349693251 G 0.7607361963190185 G 0.7668711656441718 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.599275507916992e-06 1.8150867113523827e-05 3.976490006607492e-06 8.92136363903526e-06 1 251478 1.3957100236439144e-05 1.5807063224802397e-05 2 143296 gAc/gGc gAc/gGc 0 0 NA NA NA NA NA NA A201T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.02557101845741272 2.817926234006882 C 0.0026568453758955 0.03213091567158699 0.9652121663093568 C 0.0037351467180997133 0.00033147059730254114 1.948141107277479e-05 0.036954790353775024 0.017670858651399612 0.2830098569393158 0.025966040790081024 0.6323124170303345 -91.2382354736328 136.11135864257812 0.0003098034067079425 S 0.10377358490566037 - 0.12264150943396225 NA NA S 0.10377358490566037 S 0.2830188679245283 NA NA NA NA NA NA - 0.1320754716981132 - 0.07547169811320754 S 0.10377358490566037 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.14150943396226415 - 0.1509433962264151 S 0.10377358490566037 S 0.10377358490566037 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976459993282333e-06 8.472743420446901e-06 3.976459993282333e-06 8.472743420446901e-06 1 251480 NA NA NA NA Gca/Aca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A201V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.02557101845741272 2.817926234006882 C 0.0026568453758955 0.03213091567158699 0.9652121663093568 C 0.0037351467180997133 0.00033147059730254114 1.948141107277479e-05 0.036954790353775024 0.017670858651399612 0.2830098569393158 0.025966040790081024 0.6323124170303345 -91.2382354736328 136.11135864257812 0.0003098034067079425 S 0.10377358490566037 - 0.12264150943396225 NA NA S 0.10377358490566037 S 0.2830188679245283 NA NA NA NA NA NA - 0.1320754716981132 - 0.07547169811320754 S 0.10377358490566037 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.14150943396226415 - 0.1509433962264151 S 0.10377358490566037 S 0.10377358490566037 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.52 0.0 0.0 0.52 0.01 602C>T T204A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 e 0.2572928965091705 35.68652474582196 E 0.011311989277601242 0.5285700559616089 0.4601179361343384 E 0.0075172940269112596 0.0016053311992436647 7.915488095022738e-05 0.03396553546190262 0.4756888449192047 0.03805893287062645 0.008223780430853367 0.4348611235618591 -100.13009643554688 134.51222229003906 0.0012611792190000415 E 0.04929577464788732 - 0.20422535211267606 NA NA E 0.06338028169014084 - 0.20422535211267606 NA NA NA NA NA NA - 0.17605633802816897 - 0.11267605633802814 E 0.1056338028169014 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.17605633802816897 - 0.2746478873239437 E 0.11971830985915492 E 0.11971830985915492 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 9.08309337551836e-06 3.9765500332578085e-06 9.08309337551836e-06 1 251474 NA NA NA NA Acc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I205V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA Important_for_cholesterol_binding_and_cholesterol_transfer_from_NPC1_to_liposomes|1 b 0.04645994305610657 8.595089465379715 E 0.0021859132684767246 0.7132596373558044 0.28455451130867004 E 0.0012519551673904061 0.0007272850489243865 2.666973705345299e-05 0.05962960794568064 0.6615362763404846 0.029133742675185207 0.005921585951000452 0.24177293479442605 -102.49177551269531 124.34221649169922 0.0005086486344225705 E 0.059171597633136085 - 0.059171597633136085 NA NA E 0.05325443786982249 - 0.17159763313609466 NA NA NA NA NA NA - 0.08875739644970414 - 0.11834319526627217 E 0.059171597633136085 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.10059171597633136 - 0.1242603550295858 E 0.059171597633136085 E 0.05325443786982249 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.953110070957338e-06 7.846221772811469e-06 7.953110070957338e-06 7.846221772811469e-06 2 251474 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T206I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA NA e 0.36805224418640137 51.04884626865387 C 0.0005545117892324923 0.38513538241386414 0.6143101453781128 C 0.00029252193053253 0.00013114781177137047 5.6282460718648525e-06 0.015935931354761124 0.3626206517219544 0.054208729416131966 0.002575600286945701 0.5642297863960266 -112.9131851196289 108.57799530029295 0.001265808823518455 E 0.2535211267605634 E 0.4577464788732394 NA NA E 0.2535211267605634 E 0.3591549295774648 NA NA NA NA NA NA E 0.4859154929577465 E 0.31690140845070425 E 0.2535211267605634 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5352112676056338 E 0.4084507042253521 E 0.2676056338028169 E 0.2605633802816901 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 8.931420948412918e-06 3.9765500332578085e-06 8.931420948412918e-06 1 251474 NA NA NA NA aCt/aTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T206S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA NA e 0.36805224418640137 51.04884626865387 C 0.0005545117892324923 0.38513538241386414 0.6143101453781128 C 0.00029252193053253 0.00013114781177137047 5.6282460718648525e-06 0.015935931354761124 0.3626206517219544 0.054208729416131966 0.002575600286945701 0.5642297863960266 -112.9131851196289 108.57799530029295 0.001265808823518455 E 0.2535211267605634 E 0.4577464788732394 NA NA E 0.2535211267605634 E 0.3591549295774648 NA NA NA NA NA NA E 0.4859154929577465 E 0.31690140845070425 E 0.2535211267605634 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.5352112676056338 E 0.4084507042253521 E 0.2676056338028169 E 0.2605633802816901 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976620064349845e-06 8.240342604460446e-06 3.976620064349845e-06 8.240342604460446e-06 1 251470 NA NA NA NA Act/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V208L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|9 NA NA NA NA NA e 0.3046586513519287 46.82603471279143 E 0.0028748128097504373 0.5475093722343445 0.4496158063411713 E 0.0018784361891448496 0.000604622473474592 2.539406523283105e-05 0.03842015936970712 0.491950660943985 0.04066731035709381 0.006739077623933554 0.4197143018245697 -103.31433868408205 131.27545166015622 0.0019874090794473886 E 0.2746478873239437 E 0.38028169014084506 NA NA E 0.2746478873239437 E 0.3309859154929577 NA NA NA NA NA NA E 0.3591549295774648 E 0.31690140845070425 E 0.28169014084507044 NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.4154929577464789 E 0.24647887323943665 E 0.2746478873239437 E 0.28169014084507044 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.980710168136284e-06 1.6265169750637362e-05 NA NA NA NA 6.980710168136284e-06 1.6265169750637362e-05 1 143252 NA Gtg/Ctg NA 0 NA NA NA NA NA NA S210A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2503877878189087 29.345448732376102 C 0.0037579771596938367 0.4024440050125122 0.5937979817390442 C 0.002446503145620227 0.0009541608742438256 2.697237505344674e-05 0.04206756129860878 0.3307490944862366 0.08323372900485992 0.021307045593857758 0.5192149877548218 -113.61285400390624 155.27975463867188 0.006073324475437403 - 0.1153846153846154 - 0.2153846153846154 NA NA - 0.1153846153846154 E 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA - 0.19230769230769232 E 0.07692307692307693 - 0.1153846153846154 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.2384615384615385 - 0.16923076923076924 - 0.1153846153846154 - 0.1153846153846154 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.976459993282333e-06 8.981362386100082e-06 3.976459993282333e-06 8.981362386100082e-06 1 251480 NA NA NA NA Tca/Gca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D211H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7536618709564209 108.60267560482023 C 0.00832972303032875 0.05277692526578903 0.9388933181762696 S 0.004311379976570606 0.0012392799835652113 5.265912477625534e-05 0.002583237132057548 0.0392761304974556 0.6309809684753418 0.0754171758890152 0.2461391091346741 -85.39796447753906 -3.5667195320129395 0.011482596397399902 S 0.3067484662576687 S 0.4785276073619632 NA NA S 0.3128834355828221 S 0.294478527607362 NA NA NA NA NA NA S 0.5030674846625767 S 0.4110429447852761 S 0.294478527607362 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.3312883435582822 S 0.4049079754601227 S 0.3128834355828221 S 0.3067484662576687 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.0 0.0 0.36 0.01 631G>C D211Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7536618709564209 108.60267560482023 C 0.00832972303032875 0.05277692526578903 0.9388933181762696 S 0.004311379976570606 0.0012392799835652113 5.265912477625534e-05 0.002583237132057548 0.0392761304974556 0.6309809684753418 0.0754171758890152 0.2461391091346741 -85.39796447753906 -3.5667195320129395 0.011482596397399902 S 0.3067484662576687 S 0.4785276073619632 NA NA S 0.3128834355828221 S 0.294478527607362 NA NA NA NA NA NA S 0.5030674846625767 S 0.4110429447852761 S 0.294478527607362 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.3312883435582822 S 0.4049079754601227 S 0.3128834355828221 S 0.3067484662576687 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.0132780928134672e-05 1.8015705273858442e-05 3.976490006607492e-06 8.736549226774883e-06 1 251478 2.09379995794734e-05 1.5755581364160132e-05 3 143280 Gat/Tat Gat/Tat 0 0 NA NA NA NA NA NA H215R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7994121313095093 145.41306668519977 C 0.013853124342858791 0.06366803497076035 0.9224787950515748 T 0.02599918283522129 0.0038695428520441055 4.1689832869451486e-05 0.017796745523810387 0.05543513596057892 0.11443697661161426 0.5397762656211853 0.2426444739103317 -78.10359191894531 127.37567901611328 0.01068502850830555 T 1.0 T 0.8967391304347826 NA NA T 1.0 S 0.532608695652174 NA NA NA NA NA NA T 0.8043478260869565 T 0.8423913043478259 T 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9836956521739132 T 0.8206521739130435 T 1.0 T 1.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 92714 benign 2 0.31695814034520675 1.2459028725661122e-05 0.3306750059127808 6.432574569799836e-06 82692 250070 0.2929899990558624 1.0670022548749063e-05 41931 143114 cAt/cGt cAt/cGt 15205 7797 NA NA NA NA NA NA H215Y NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7994121313095093 145.41306668519977 C 0.013853124342858791 0.06366803497076035 0.9224787950515748 T 0.02599918283522129 0.0038695428520441055 4.1689832869451486e-05 0.017796745523810387 0.05543513596057892 0.11443697661161426 0.5397762656211853 0.2426444739103317 -78.10359191894531 127.37567901611328 0.01068502850830555 T 1.0 T 0.8967391304347826 NA NA T 1.0 S 0.532608695652174 NA NA NA NA NA NA T 0.8043478260869565 T 0.8423913043478259 T 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9836956521739132 T 0.8206521739130435 T 1.0 T 1.0 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.993990038812626e-06 8.466674522522328e-06 7.993990038812626e-06 8.466674522522328e-06 2 250188 NA NA NA NA Cat/Tat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G216A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5541263222694397 43.609741562604896 C 0.016298551112413406 0.02739105373620987 0.9563103318214417 T 0.014202283695340157 0.0012230051215738054 4.294855534681119e-05 0.002110602566972375 0.016096623614430428 0.1644614040851593 0.7293543815612793 0.07250874489545822 87.85218048095703 -0.870381772518158 0.011137858033180235 T 0.75 T 0.8452380952380952 NA NA T 0.75 S 0.988095238095238 NA NA NA NA NA NA T 0.75 T 0.7261904761904762 T 0.75 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9642857142857144 T 0.8690476190476191 T 0.7619047619047619 T 0.7857142857142857 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9944698073668405e-06 8.641303159912891e-06 3.9944698073668405e-06 8.641303159912891e-06 1 250346 NA NA NA NA gGg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M217L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1305396854877472 26.120991066098213 C 0.002469897968694568 0.3582097887992859 0.6393202543258667 C 0.0016357406275346875 0.000597725622355938 1.618193527974654e-05 0.04834362864494324 0.3124598562717438 0.059422183781862266 0.01055594440549612 0.5669686794281006 -94.58467864990234 134.54386901855472 0.008935040794312954 B 0.10638297872340426 B 0.21808510638297876 NA NA B 0.10106382978723404 - 0.15425531914893614 NA NA NA NA NA NA B 0.21808510638297876 B 0.22340425531914893 B 0.1702127659574468 NA NA NA NA NA NA NA NA B 0.3404255319148936 B 0.13297872340425532 B 0.16489361702127658 B 0.1702127659574468 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9944097807165235e-06 7.974360647987826e-06 3.9944097807165235e-06 7.974360647987826e-06 1 250350 NA NA NA NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P219S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.17792987823486328 25.2482497215271 E 0.0013258836697787044 0.8242698311805725 0.17440424859523773 E 0.0009504317422397436 0.0004547425196506083 3.0705787139595486e-06 0.09572067111730576 0.7210957407951355 0.009004748426377773 0.012869352474808693 0.1599012017250061 -63.93434143066406 139.96336364746094 0.0028374455869197845 - 0.15441176470588236 - 0.09558823529411764 NA NA - 0.15441176470588236 - 0.07352941176470587 NA NA NA NA NA NA - 0.08088235294117647 - 0.15441176470588236 - 0.16176470588235295 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.05882352941176471 - 0.08088235294117647 - 0.15441176470588236 - 0.15441176470588236 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9930400816956535e-06 9.0364743234795e-06 3.9930400816956535e-06 9.0364743234795e-06 1 250436 NA NA NA NA Ccc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N222D NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|5 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4948508143424988 72.44615921974183 C 0.045363828539848335 0.027923766523599625 0.9267123937606812 C 0.02743138372898101 0.021023839712142944 0.0003803821455221623 0.008136749267578125 0.02263905480504036 0.32000476121902466 0.13882407546043396 0.4615598320960999 -81.6435775756836 17.812755584716797 0.008884882554411888 - 0.4267515923566879 - 0.4522292993630573 NA NA - 0.4140127388535032 - 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA - 0.3949044585987261 - 0.4267515923566879 - 0.4203821656050956 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.4140127388535032 - 0.4585987261146497 - 0.43312101910828027 - 0.4203821656050956 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.989529886894161e-06 8.993152732344667e-06 3.989529886894161e-06 8.993152732344667e-06 1 250656 NA NA NA NA Aat/Gat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N222S NPC1_N NA Lumenal|1 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|5 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4948508143424988 72.44615921974183 C 0.045363828539848335 0.027923766523599625 0.9267123937606812 C 0.02743138372898101 0.021023839712142944 0.0003803821455221623 0.008136749267578125 0.02263905480504036 0.32000476121902466 0.13882407546043396 0.4615598320960999 -81.6435775756836 17.812755584716797 0.008884882554411888 - 0.4267515923566879 - 0.4522292993630573 NA NA - 0.4140127388535032 - 0.445859872611465 NA NA NA NA NA NA - 0.3949044585987261 - 0.4267515923566879 - 0.4203821656050956 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.4140127388535032 - 0.4585987261146497 - 0.43312101910828027 - 0.4203821656050956 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 92715 conflict 1 0.0033227936145382173 1.8909445524628127e-05 0.0033592700492590666 8.924372302557621e-06 842 250650 0.003258989891037345 1.6671014037970842e-05 467 143296 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA G226S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2854095995426178 22.46173548400402 C 0.033854659646749496 0.2862367033958435 0.6799086332321167 C 0.012046870775520802 0.019051985815167427 0.00047658689436502766 0.1006600633263588 0.21264974772930145 0.05544621124863625 0.052706293761730194 0.5469622611999512 -78.4433364868164 157.0181121826172 0.017340341582894325 - 0.2023809523809524 - 0.2976190476190476 NA NA - 0.2023809523809524 - 0.3690476190476191 NA NA NA NA NA NA - 0.2023809523809524 - 0.16666666666666666 - 0.13095238095238096 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.2857142857142857 - 0.3690476190476191 - 0.13095238095238096 - 0.14285714285714285 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.988259777543135e-06 9.21743366366268e-06 3.988259777543135e-06 9.21743366366268e-06 1 250736 NA NA NA NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E229K NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA STRAND|10 NA NA NA NA NA e 0.4613038599491121 80.58978433310985 C 0.04118304699659348 0.06776626408100128 0.8910506963729858 C 0.018523653969168663 0.010181937366724014 0.00018144839850720018 0.03230006620287895 0.041837457567453384 0.3765427768230438 0.03316862136125565 0.48726409673690796 -95.25135803222656 137.93780517578122 0.024926874786615368 S 0.42268041237113396 S 0.5309278350515464 NA NA S 0.42268041237113396 S 0.6237113402061856 NA NA NA NA NA NA S 0.5721649484536082 S 0.4587628865979381 S 0.4175257731958763 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.634020618556701 S 0.5773195876288659 S 0.42268041237113396 S 0.4175257731958763 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.977149834914599e-06 8.405085708528831e-06 7.977149834914599e-06 8.405085708528831e-06 2 250716 NA NA NA NA Gag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S230F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.43155112862586975 50.577792274951925 C 0.0372927151620388 0.13142457604408264 0.8312827348709106 C 0.01371057704091072 0.010446797125041485 0.0001620712573640048 0.08182145655155182 0.06806639581918716 0.07754571735858917 0.03448255732655525 0.7137644290924072 -77.69764709472656 145.30421447753906 0.031841080635786057 - 0.4076923076923077 - 0.2076923076923077 NA NA - 0.4076923076923077 - 0.3 NA NA NA NA NA NA - 0.3615384615384615 - 0.3153846153846154 - 0.4230769230769231 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.25384615384615383 - 0.2923076923076923 - 0.4076923076923077 - 0.4153846153846154 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.9773900577274625e-06 1.5040691582262713e-05 NA NA NA NA 6.9773900577274625e-06 1.5040691582262713e-05 1 143320 NA tCt/tTt NA 0 NA NA NA NA NA NA V231A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3762157261371613 57.82435710728168 C 0.06852616369724274 0.0775003656744957 0.8539735078811646 C 0.04347892850637436 0.023563623428344727 0.0004333086544647813 0.02610467560589313 0.053591128438711166 0.197100892663002 0.18997648358345032 0.4657510221004486 -86.4688949584961 31.378131866455078 0.03707122802734375 S 0.17605633802816897 S 0.2112676056338028 NA NA S 0.18309859154929575 S 0.35211267605633795 NA NA NA NA NA NA S 0.20422535211267606 S 0.3591549295774648 S 0.18309859154929575 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.2676056338028169 S 0.19014084507042253 S 0.17605633802816897 S 0.18309859154929575 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.611971440847723e-06 1.828742069415656e-05 7.974609616212547e-06 8.798762982706713e-06 2 250796 6.9773900577274625e-06 1.6031579012037944e-05 1 143320 gTg/gCg gTg/gCg 0 0 NA NA NA NA NA NA D232G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.702454686164856 101.22372027635572 C 0.05484870821237564 0.03631466999650002 0.9088366031646729 C 0.04757339134812355 0.01325826533138752 0.00029376070597209036 0.011203807778656484 0.025541648268699646 0.21610604226589208 0.2272188812494278 0.4588042497634888 -88.28153991699219 90.06758117675781 0.0360531210899353 B 0.3803680981595092 S 0.3987730061349693 NA NA B 0.38650306748466257 S 0.3680981595092024 NA NA NA NA NA NA B 0.4846625766871165 S 0.5705521472392638 S 0.392638036809816 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.34355828220858897 B 0.4539877300613497 B 0.3803680981595092 S 0.4049079754601227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 4.31367082010412e-05 1.8838367617387115e-05 4.784880002262071e-05 9.463947187960742e-06 12 250790 3.489039954729378e-05 1.6288578762780672e-05 5 143306 gAt/gGt gAt/gGt 0 0 NA NA NA NA NA NA V234= NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5031148195266724 77.32874776124953 C 0.032479610294103615 0.019331339746713642 0.9481890797615052 T 0.028939221054315567 0.007826621644198895 0.00019875279394909745 0.006257691886276007 0.012514912523329258 0.24066600203514105 0.4865710139274597 0.2170257419347763 -86.51383209228516 5.954653739929199 0.02675611712038517 T 0.6690140845070423 T 0.35211267605633795 NA NA T 0.6619718309859155 S 0.3732394366197183 NA NA NA NA NA NA T 0.2535211267605634 T 0.5211267605633803 T 0.9366197183098592 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.31690140845070425 T 0.2746478873239437 T 0.943661971830986 T 0.9507042253521126 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.56 0.0 0.0 0.56 0.0 702C>A T235I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4828265309333801 66.96803984045982 C 0.06393445283174515 0.061637237668037415 0.8744283318519592 C 0.053240440785884864 0.01447648927569389 0.00025681033730506897 0.026187784969806668 0.037943679839372635 0.3041839897632599 0.2001473605632782 0.3635633885860443 -100.35043334960938 51.86250305175781 0.02346048876643181 B 0.2535211267605634 S 0.2605633802816901 NA NA B 0.2535211267605634 S 0.2605633802816901 NA NA NA NA NA NA B 0.11267605633802814 S 0.3661971830985916 - 0.2605633802816901 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.3380281690140845 B 0.17605633802816897 B 0.24647887323943665 - 0.2746478873239437 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.976769666129258e-06 8.67153379045325e-06 7.976769666129258e-06 8.67153379045325e-06 2 250728 NA NA NA NA aCa/aTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A236T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.25276750326156616 27.85497885942459 C 0.015578023158013819 0.06277219206094742 0.9216498136520386 C 0.008885547518730164 0.005646952893584968 8.147380867740142e-05 0.035222627222537994 0.03828534483909607 0.2876107394695282 0.0291032362729311 0.5951640605926514 -87.45740509033203 134.90684509277344 0.010916981846094131 - 0.6226415094339622 - 0.4528301886792453 NA NA - 0.6226415094339622 - 0.4433962264150944 NA NA NA NA NA NA - 0.4245283018867925 - 0.2641509433962264 - 0.6415094339622641 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.4433962264150944 - 0.5188679245283019 - 0.6320754716981132 - 0.6320754716981132 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 7.612901452880273e-06 1.7666927403784742e-05 7.97670963947894e-06 7.951973810281989e-06 2 250730 6.976520126045217e-06 1.5776135027667252e-05 1 143338 Gca/Aca Gca/Aca 0 0 NA NA NA NA NA NA P237S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2864006757736206 40.64025589227676 C 0.03562147170305252 0.110147662460804 0.8542308807373047 C 0.016676710918545726 0.009973753243684769 0.0001929720165207982 0.0778706967830658 0.06703605502843857 0.13321426510810852 0.08126524090766908 0.6137702465057373 -71.00434875488281 143.8068084716797 0.010023470036685469 - 0.4117647058823529 - 0.4485294117647059 NA NA - 0.4044117647058824 - 0.5294117647058824 NA NA NA NA NA NA - 0.4779411764705882 - 0.3970588235294117 - 0.3897058823529412 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5073529411764706 - 0.4044117647058824 - 0.3970588235294117 - 0.3970588235294117 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 21142 conflict 1 0.010047858637547577 1.714905055960791e-05 0.00988455954939127 8.62689073431796e-06 2478 250694 0.010333499871194364 1.4821156883122427e-05 1481 143320 Cca/Tca Cca/Tca 26 15 NA NA NA NA NA NA C238G NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA DISULFID|5 NA NA NA NA NA NA b 0.08909547328948975 12.50900444984436 C 0.04941051080822945 0.2093614637851715 0.7412280440330505 C 0.0363285057246685 0.010680463165044785 0.00016073875303845853 0.14959391951560974 0.11262117326259613 0.10900739580392838 0.07713492214679718 0.5044728517532349 -91.71047973632812 129.40489196777344 0.005867757834494114 - 0.06666666666666668 - 0.05925925925925926 NA NA - 0.05925925925925926 - 0.1259259259259259 NA NA NA NA NA NA - 0.05185185185185185 - 0.05925925925925926 - 0.04444444444444445 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.0962962962962963 - 0.05925925925925926 - 0.04444444444444445 - 0.04444444444444445 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.0 0.0 0.34 0.0 712T>G S239N NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09244400262832644 10.834437108039856 C 0.10053043067455293 0.19803012907505035 0.7014394402503967 C 0.05577714741230011 0.02833748236298561 0.000620239123236388 0.09922035783529284 0.11114557087421416 0.1746240258216858 0.08691948652267456 0.4433556497097016 -101.75382232666016 159.44378662109375 0.008559771813452244 - 0.4076923076923077 - 0.4538461538461538 NA NA - 0.4153846153846154 - 0.6923076923076923 NA NA NA NA NA NA - 0.5384615384615384 - 0.2384615384615385 - 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.4461538461538462 - 0.5538461538461539 - 0.4230769230769231 - 0.4461538461538462 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.9891501728561715e-06 8.617892719164014e-06 3.9891501728561715e-06 8.617892719164014e-06 1 250680 NA NA NA NA aGc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S239R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09244400262832644 10.834437108039856 C 0.10053043067455293 0.19803012907505035 0.7014394402503967 C 0.05577714741230011 0.02833748236298561 0.000620239123236388 0.09922035783529284 0.11114557087421416 0.1746240258216858 0.08691948652267456 0.4433556497097016 -101.75382232666016 159.44378662109375 0.008559771813452244 - 0.4076923076923077 - 0.4538461538461538 NA NA - 0.4153846153846154 - 0.6923076923076923 NA NA NA NA NA NA - 0.5384615384615384 - 0.2384615384615385 - 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.4461538461538462 - 0.5538461538461539 - 0.4230769230769231 - 0.4461538461538462 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.0 0.0 0.26 0.0 717C>G Q241* NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4141414141414141 T 0.5303030303030303 NA NA T 0.4090909090909091 T 0.7070707070707071 NA NA NA NA NA NA T 0.4797979797979798 T 0.4898989898989899 G 0.5252525252525253 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5808080808080808 T 0.4292929292929293 G 0.5505050505050505 G 0.5757575757575758 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A 422340 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA D242A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|12 NA NA NA NA b 0.2426729202270508 34.96916780471802 C 0.20770227909088126 0.13481885194778442 0.6574788093566895 C 0.10717713087797164 0.1054793819785118 0.0032660437282174826 0.05670661106705665 0.09844381362199783 0.12836310267448425 0.1218525841832161 0.3787112832069397 -89.71353149414062 60.12128448486328 0.013629755936563015 T 0.03680981595092025 S 0.006134969325153374 NA NA T 0.03680981595092025 S 0.03680981595092025 NA NA NA NA NA NA T 0.018404907975460124 S 0.0920245398773006 G 0.018404907975460124 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.012269938650306749 T 0.04294478527607362 G 0.024539877300613498 G 0.049079754601227 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.6188858957964975e-05 NA NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.6188858957964975e-05 1 143290 NA gAc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA S244T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|13 NA NA NA NA e 0.5609657168388367 65.74518201351167 H 0.8070240020751953 0.003778190817683935 0.1891978532075882 H 0.1587851643562317 0.6039856672286987 0.0016709667397662995 0.001368253375403583 0.0024307332932949066 0.022977720946073532 0.16135530173778534 0.0474262461066246 -63.05551528930664 -31.34518623352051 0.01154485996812582 S 0.4846153846153846 S 0.6384615384615384 NA NA S 0.4923076923076923 - 0.5692307692307692 NA NA NA NA NA NA S 0.7076923076923077 S 0.5769230769230769 G 0.6 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.6307692307692307 S 0.6538461538461539 G 0.5923076923076923 G 0.6 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 3.988259777543135e-06 8.416243379636281e-06 3.988259777543135e-06 8.416243379636281e-06 1 250736 NA NA NA NA Tct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I245T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|13 NA NA NA NA e 0.5726144313812256 105.93366980552672 H 0.8212747573852539 0.004718104843050242 0.17400717735290527 H 0.22876375913619995 0.5433925390243529 0.0016939479392021894 0.0017714244313538074 0.0027599367313086987 0.022467970848083496 0.16983623802661896 0.029314184561371807 -68.16892242431639 -32.579673767089844 0.01483125798404217 S 0.4260355029585799 S 0.7278106508875741 NA NA S 0.4319526627218935 S 0.6568047337278107 NA NA NA NA NA NA S 0.6923076923076923 S 0.6982248520710059 G 0.5443786982248521 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.591715976331361 S 0.6804733727810651 G 0.5443786982248521 G 0.5443786982248521 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5951600289554335e-05 7.937001682242121e-06 1.5951600289554335e-05 7.937001682242121e-06 4 250758 NA NA NA NA aTt/aCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V246F NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|13 NA NA NA NA b 0.17701664566993713 27.207458439469328 H 0.8063565492630005 0.010388429276645184 0.18325497210025787 H 0.2044662982225418 0.5565614700317383 0.005696488078683615 0.002422849414870143 0.004506823606789112 0.02471933886408806 0.1753833144903183 0.026243414729833603 -83.47526550292969 -28.56210517883301 0.010627773590385914 S 0.2887323943661972 S 0.4366197183098591 NA NA S 0.3028169014084507 S 0.5563380281690141 NA NA NA NA NA NA S 0.35211267605633795 S 0.5422535211267606 G 0.4084507042253521 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.3732394366197183 S 0.35211267605633795 G 0.4154929577464789 G 0.4084507042253521 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 5.075858934146827e-06 1.5794912886883262e-05 3.988579919678158e-06 8.799336535614761e-06 1 250716 6.978069905017038e-06 1.311681934148771e-05 1 143306 Gtc/Ttc Gtc/Ttc 0 0 NA NA NA NA NA NA V246I NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA HELIX|13 NA NA NA NA b 0.17701664566993713 27.207458439469328 H 0.8063565492630005 0.010388429276645184 0.18325497210025787 H 0.2044662982225418 0.5565614700317383 0.005696488078683615 0.002422849414870143 0.004506823606789112 0.02471933886408806 0.1753833144903183 0.026243414729833603 -83.47526550292969 -28.56210517883301 0.010627773590385914 S 0.2887323943661972 S 0.4366197183098591 NA NA S 0.3028169014084507 S 0.5563380281690141 NA NA NA NA NA NA S 0.35211267605633795 S 0.5422535211267606 G 0.4084507042253521 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.3732394366197183 S 0.35211267605633795 G 0.4154929577464789 G 0.4084507042253521 6w5t-A|6w5r-A|3gkj-A|3gkh-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|3gki-A NA NA NA 1.5227573862974615e-05 1.9357743244954187e-05 7.977149834914599e-06 9.222990157318691e-06 2 250716 2.7912299628951594e-05 1.7019361800478067e-05 4 143306 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA G248D NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3485744595527649 27.4328099668026 C 0.005802004132419825 0.07456865161657332 0.9196293354034424 C 0.00316240219399333 0.0015635407762601972 0.00015653570881113407 0.02209632657468319 0.047641821205616 0.2767698764801025 0.03418324887752533 0.6144261360168457 97.07453918457031 -179.13809204101562 0.014290413819253443 - 0.5833333333333334 - 0.5833333333333334 NA NA - 0.5833333333333334 - 0.7619047619047619 NA NA NA NA NA NA - 0.6785714285714286 - 0.34523809523809523 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6904761904761905 - 0.7857142857142857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9891501728561715e-06 8.288107804811831e-06 3.9891501728561715e-06 8.288107804811831e-06 1 250680 NA NA NA NA gGc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G248V NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3485744595527649 27.4328099668026 C 0.005802004132419825 0.07456865161657332 0.9196293354034424 C 0.00316240219399333 0.0015635407762601972 0.00015653570881113407 0.02209632657468319 0.047641821205616 0.2767698764801025 0.03418324887752533 0.6144261360168457 97.07453918457031 -179.13809204101562 0.014290413819253443 - 0.5833333333333334 - 0.5833333333333334 NA NA - 0.5833333333333334 - 0.7619047619047619 NA NA NA NA NA NA - 0.6785714285714286 - 0.34523809523809523 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6904761904761905 - 0.7857142857142857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.01531619847077e-05 1.6215211173296816e-05 7.978300345712341e-06 8.201628076354587e-06 2 250680 1.3958099771116395e-05 1.3988079578403965e-05 2 143286 gGc/gTc gGc/gTc 0 0 NA NA NA NA NA NA P249L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.7349694967269897 104.29217158555984 C 0.0014360437635332346 0.04406708851456642 0.9544968605041504 C 0.0007247686153277755 0.00044458874617703264 7.866643500165083e-06 0.029774524271488183 0.025488991290330887 0.2350369393825531 0.018755624070763588 0.6897667646408081 -68.34249114990234 146.22447204589844 0.012394334189593792 - 0.8823529411764706 - 0.9852941176470588 NA NA - 0.8602941176470589 - 0.8897058823529411 NA NA NA NA NA NA - 0.9852941176470588 - 0.8088235294117647 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 1.0 - 0.9852941176470588 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.989090146205854e-06 8.015501541247322e-06 3.989090146205854e-06 8.015501541247322e-06 1 250684 NA NA NA NA cCc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P249T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.7349694967269897 104.29217158555984 C 0.0014360437635332346 0.04406708851456642 0.9544968605041504 C 0.0007247686153277755 0.00044458874617703264 7.866643500165083e-06 0.029774524271488183 0.025488991290330887 0.2350369393825531 0.018755624070763588 0.6897667646408081 -68.34249114990234 146.22447204589844 0.012394334189593792 - 0.8823529411764706 - 0.9852941176470588 NA NA - 0.8602941176470589 - 0.8897058823529411 NA NA NA NA NA NA - 0.9852941176470588 - 0.8088235294117647 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 1.0 - 0.9852941176470588 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.3792816685865229e-05 NA NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.3792816685865229e-05 1 143308 NA Ccc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA K250T NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.4580323100090027 94.21724616885186 C 0.0019182304386049511 0.017700038850307458 0.9803817272186279 C 0.001479342463426292 0.0007212827331386508 1.4022692084836305e-05 0.01589307375252247 0.0096784308552742 0.15539012849330902 0.019375089555978768 0.7974486351013184 -76.61578369140625 139.56838989257812 0.01644570752978325 - 0.7658536585365854 - 0.6487804878048781 NA NA - 0.7707317073170732 - 0.4439024390243903 NA NA NA NA NA NA - 0.7853658536585366 - 0.7463414634146341 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7804878048780488 - 0.7365853658536585 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.196710036310833e-05 8.864102377056199e-06 1.196710036310833e-05 8.864102377056199e-06 3 250688 NA NA NA NA aAg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q252H NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.7996643781661987 142.82005794048308 C 4.95701860927511e-05 0.014240389689803125 0.9857100248336792 C 3.542875128914602e-05 5.687449174729409e-06 8.389415739884497e-08 0.011999299749732021 0.007488149218261242 0.08361862599849701 0.0018569333478808405 0.8949958086013794 -90.18675231933594 136.92216491699222 0.0102367689833045 - 0.8131313131313131 - 0.8535353535353535 NA NA - 0.8232323232323232 - 0.4444444444444444 NA NA NA NA NA NA - 0.797979797979798 - 0.8131313131313131 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.8737373737373737 - 0.7525252525252525 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.5894831568170606e-05 NA NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.5894831568170606e-05 2 143314 NA caG/caC NA 0 NA NA NA NA NA NA P254A NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.4155683517456055 58.96914911270142 C 4.508451456786133e-05 0.0012152394047006965 0.9987396597862244 C 3.746784932445735e-05 7.583882506878581e-06 1.455629785596102e-07 0.000801277463324368 0.0006605416419915855 0.09114642441272736 0.0029005752876400948 0.904446005821228 -66.37049865722656 153.86729431152344 0.005719969980418682 - 0.7794117647058824 - 0.7647058823529411 NA NA - 0.7720588235294118 - 0.4632352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.6544117647058824 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.7647058823529411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A 854368 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P254L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.4155683517456055 58.96914911270142 C 4.508451456786133e-05 0.0012152394047006965 0.9987396597862244 C 3.746784932445735e-05 7.583882506878581e-06 1.455629785596102e-07 0.000801277463324368 0.0006605416419915855 0.09114642441272736 0.0029005752876400948 0.904446005821228 -66.37049865722656 153.86729431152344 0.005719969980418682 - 0.7794117647058824 - 0.7647058823529411 NA NA - 0.7720588235294118 - 0.4632352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.6544117647058824 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.7647058823529411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.7705387150627858e-05 NA NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.7705387150627858e-05 1 143330 NA cCa/cTa NA 0 NA NA NA NA NA NA P254Q NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.4155683517456055 58.96914911270142 C 4.508451456786133e-05 0.0012152394047006965 0.9987396597862244 C 3.746784932445735e-05 7.583882506878581e-06 1.455629785596102e-07 0.000801277463324368 0.0006605416419915855 0.09114642441272736 0.0029005752876400948 0.904446005821228 -66.37049865722656 153.86729431152344 0.005719969980418682 - 0.7794117647058824 - 0.7647058823529411 NA NA - 0.7720588235294118 - 0.4632352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.6544117647058824 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.7647058823529411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.989020115113817e-06 9.099033701383253e-06 3.989020115113817e-06 9.099033701383253e-06 1 250688 NA NA NA NA cCa/cAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P254R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.4155683517456055 58.96914911270142 C 4.508451456786133e-05 0.0012152394047006965 0.9987396597862244 C 3.746784932445735e-05 7.583882506878581e-06 1.455629785596102e-07 0.000801277463324368 0.0006605416419915855 0.09114642441272736 0.0029005752876400948 0.904446005821228 -66.37049865722656 153.86729431152344 0.005719969980418682 - 0.7794117647058824 - 0.7647058823529411 NA NA - 0.7720588235294118 - 0.4632352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.6544117647058824 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7352941176470589 - 0.7647058823529411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 7.978040230227634e-06 9.076319527317653e-06 7.978040230227634e-06 9.076319527317653e-06 2 250688 NA NA NA NA cCa/cGa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P255R NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.7221724987030029 102.47627756595611 C 9.29765883483924e-05 0.0009858283447101712 0.998921275138855 C 7.998392538866028e-05 1.8740234736469574e-05 2.1144973061382183e-07 0.0013302321312949061 0.0005474208737723528 0.18084590137004847 0.007922288030385971 0.8092552423477173 -64.58883666992189 148.1188201904297 0.007162737660109997 - 0.875 - 0.9044117647058824 NA NA - 0.8529411764705882 - 0.7132352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.8676470588235294 - 0.7058823529411765 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.8970588235294118 - 0.8529411764705882 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.3951499568065628e-05 1.440599831247918e-05 NA NA NA NA 1.3951499568065628e-05 1.440599831247918e-05 2 143354 NA cCt/cGt NA 0 NA NA NA NA NA NA P255S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.7221724987030029 102.47627756595611 C 9.29765883483924e-05 0.0009858283447101712 0.998921275138855 C 7.998392538866028e-05 1.8740234736469574e-05 2.1144973061382183e-07 0.0013302321312949061 0.0005474208737723528 0.18084590137004847 0.007922288030385971 0.8092552423477173 -64.58883666992189 148.1188201904297 0.007162737660109997 - 0.875 - 0.9044117647058824 NA NA - 0.8529411764705882 - 0.7132352941176471 NA NA NA NA NA NA - 0.8676470588235294 - 0.7058823529411765 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.8970588235294118 - 0.8529411764705882 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.0149929536257975e-05 1.828541295438948e-05 1.1964800251007546e-05 9.306362693764349e-06 3 250736 6.97564018992125e-06 1.5740010810817934e-05 1 143356 Cct/Tct Cct/Tct 0 0 NA NA NA NA NA NA P256S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.3973371386528015 56.38213997483253 C 0.0004246167663950473 0.0008814119501039387 0.9986940026283264 C 0.00033035915112122893 8.382353553315625e-05 1.1322108548483811e-06 0.0006913153920322658 0.0004872414574492723 0.07724619656801224 0.0098814619705081 0.9112784862518308 -67.48418426513672 149.57257080078125 0.015611739829182625 - 0.9191176470588236 - 0.7941176470588235 NA NA - 0.9191176470588236 - 0.8676470588235294 NA NA NA NA NA NA - 0.7647058823529411 - 0.8897058823529411 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7941176470588235 - 0.7647058823529411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.987689979112474e-06 9.279449659227183e-06 3.987689979112474e-06 9.279449659227183e-06 1 250772 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P257L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.5455233454704285 77.4097627222538 C 0.0003984091163147242 0.003183434717357159 0.9964181184768676 C 0.00031961026252247404 8.257578156189993e-05 6.873155484754535e-07 0.0017127103637903929 0.0024576822761446238 0.2629779279232025 0.0152791952714324 0.7171695828437805 -65.18326568603516 155.55850219726562 0.006825825665146112 - 0.8676470588235294 - 0.8235294117647058 NA NA - 0.8823529411764706 - 0.875 NA NA NA NA NA NA - 0.8161764705882353 - 0.8455882352941176 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.875 - 0.7941176470588235 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 7.975439984875266e-06 9.023662148100544e-06 7.975439984875266e-06 9.023662148100544e-06 2 250770 NA NA NA NA cCt/cTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P257S NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.5455233454704285 77.4097627222538 C 0.0003984091163147242 0.003183434717357159 0.9964181184768676 C 0.00031961026252247404 8.257578156189993e-05 6.873155484754535e-07 0.0017127103637903929 0.0024576822761446238 0.2629779279232025 0.0152791952714324 0.7171695828437805 -65.18326568603516 155.55850219726562 0.006825825665146112 - 0.8676470588235294 - 0.8235294117647058 NA NA - 0.8823529411764706 - 0.875 NA NA NA NA NA NA - 0.8161764705882353 - 0.8455882352941176 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.875 - 0.7941176470588235 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.5224267765051153e-05 1.78963466297874e-05 7.975439984875266e-06 7.647230197563426e-06 2 250770 2.7906100513064306e-05 1.6180206828065482e-05 4 143338 Cct/Tct Cct/Tct 0 0 NA NA NA NA NA NA P259L NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA Poly-Pro|1 NA NA e 0.5610461235046387 79.61244492530822 C 0.004283295478671789 0.0296957865357399 0.966020941734314 C 0.0022643159609287977 0.0010311253136023881 1.2251327461854087e-05 0.011390328407287598 0.022939581423997882 0.14045943319797516 0.06776043772697449 0.7541425228118896 -69.96122741699219 144.06683349609375 0.010584527626633644 - 0.8897058823529411 - 0.5 NA NA - 0.8897058823529411 - 0.8088235294117647 NA NA NA NA NA NA - 0.5588235294117647 S 0.4558823529411765 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5882352941176471 - 0.5514705882352942 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.987850050179986e-06 9.117297274465548e-06 3.987850050179986e-06 9.117297274465548e-06 1 250762 NA NA NA NA cCc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T261M NPC1_N NA Lumenal|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3106815218925476 43.09152708649636 E 0.0003773333446588367 0.9896982312202454 0.009924504905939102 E 0.00020257208961993456 0.00010818731971085072 1.5069131222844592e-06 0.00803736224770546 0.982001006603241 0.0005250843241810799 0.00020441140804905444 0.008919903077185154 -118.4935073852539 133.78025817871094 0.0016301997238770127 H 0.6126760563380281 - 0.39436619718309857 NA NA H 0.6126760563380281 S 0.7394366197183099 NA NA NA NA NA NA - 0.38028169014084506 T 0.4014084507042254 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.3732394366197183 - 0.3380281690140845 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.2689380574942798e-05 1.6883473294551348e-05 1.19656997412676e-05 8.41106181037588e-06 3 250716 1.395540039084153e-05 1.4639184052052387e-05 2 143314 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA G264V NPC1_N TRANSMEM|1 NA NA NA NA STRAND|11 NA NA NA NA NA e 0.3070617616176605 24.16576063930989 C 0.04564274474978447 0.1871836632490158 0.7671735882759094 T 0.017206436023116112 0.031510353088378906 0.0005842741229571402 0.0068523455411195755 0.14336758852005005 0.047535404562950134 0.6353311538696289 0.11761254072189332 79.25927734375 14.08114528656006 0.002456244779750705 H 0.5476190476190477 S 0.6190476190476191 NA NA H 0.5357142857142857 S 0.3928571428571429 NA NA NA NA NA NA S 0.6428571428571429 T 0.3333333333333333 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.7142857142857143 S 0.5952380952380952 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9883498175186105e-06 8.25801195958597e-06 3.9883498175186105e-06 8.25801195958597e-06 1 250730 NA NA NA NA gGc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D266G NPC1_N TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2879500389099121 41.493600606918335 H 0.4261132180690765 0.32851657271385193 0.24537016451358795 H 0.014779862947762012 0.4743154346942902 0.0015510299708694222 0.006443729158490896 0.2924994230270386 0.0255908016115427 0.03122327290475368 0.15359637141227722 -69.49536895751953 21.036075592041016 0.0003482788451947272 H 0.38650306748466257 - 0.3803680981595092 NA NA H 0.38650306748466257 T 0.7300613496932515 NA NA NA NA NA NA - 0.4110429447852761 T 0.22085889570552147 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.34355828220858897 - 0.22699386503067484 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.986850166867952e-06 1.5441238025620396e-05 NA NA NA NA 6.986850166867952e-06 1.5441238025620396e-05 1 143126 NA gAc/gGc NA 0 NA NA NA NA NA NA A267G NPC1_N TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11629116535186768 12.815286421775818 H 0.6964868307113647 0.04267910867929458 0.2608340382575989 H 0.028736615553498268 0.6118327975273132 0.0051320134662091715 0.0058509018272161475 0.03839108347892761 0.0398552268743515 0.0888943076133728 0.1813070923089981 -80.62954711914062 -31.529376983642567 0.0012002884177491069 H 0.2641509433962264 S 0.0 NA NA H 0.2452830188679245 T 0.07547169811320754 NA NA NA NA NA NA S 0.02830188679245283 T 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.1792452830188679 S 0.03773584905660377 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A 500871 VUS 1 3.9888300307211475e-06 9.127291510290532e-06 3.9888300307211475e-06 9.127291510290532e-06 1 250700 NA NA NA NA gCc/gGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A267T NPC1_N TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11629116535186768 12.815286421775818 H 0.6964868307113647 0.04267910867929458 0.2608340382575989 H 0.028736615553498268 0.6118327975273132 0.0051320134662091715 0.0058509018272161475 0.03839108347892761 0.0398552268743515 0.0888943076133728 0.1813070923089981 -80.62954711914062 -31.529376983642567 0.0012002884177491069 H 0.2641509433962264 S 0.0 NA NA H 0.2452830188679245 T 0.07547169811320754 NA NA NA NA NA NA S 0.02830188679245283 T 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.1792452830188679 S 0.03773584905660377 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A 326276 VUS 1 2.0937099179718647e-05 1.4280287293016285e-05 NA NA NA NA 2.0937099179718647e-05 1.4280287293016285e-05 3 143286 NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA A267V NPC1_N TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11629116535186768 12.815286421775818 H 0.6964868307113647 0.04267910867929458 0.2608340382575989 H 0.028736615553498268 0.6118327975273132 0.0051320134662091715 0.0058509018272161475 0.03839108347892761 0.0398552268743515 0.0888943076133728 0.1813070923089981 -80.62954711914062 -31.529376983642567 0.0012002884177491069 H 0.2641509433962264 S 0.0 NA NA H 0.2452830188679245 T 0.07547169811320754 NA NA NA NA NA NA S 0.02830188679245283 T 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.1792452830188679 S 0.03773584905660377 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 7.6140334961937976e-06 1.7732671415591008e-05 3.9888300307211475e-06 9.815954769676276e-06 1 250700 1.3955799659015609e-05 1.4768028558104425e-05 2 143310 gCc/gTc gCc/gTc 0 0 NA NA NA NA NA NA M268R NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09054234623908997 18.117523482441896 H 0.9472786188125608 0.01426171790808439 0.03845972567796707 H 0.020113570615649223 0.9222325682640076 0.005117431748658419 0.0018197429599240427 0.009117864072322844 0.004651516210287809 0.01977638341486454 0.017170917242765427 -70.64395904541016 -40.23594665527344 0.0010254086228087542 H 0.3191489361702128 S 0.2393617021276596 NA NA H 0.32446808510638303 T 0.8723404255319149 NA NA NA NA NA NA S 0.2765957446808511 T 0.2872340425531915 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2819148936170213 S 0.2819148936170213 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.92 0.0 0.0 0.92 0.0 803T>G M268T NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09054234623908997 18.117523482441896 H 0.9472786188125608 0.01426171790808439 0.03845972567796707 H 0.020113570615649223 0.9222325682640076 0.005117431748658419 0.0018197429599240427 0.009117864072322844 0.004651516210287809 0.01977638341486454 0.017170917242765427 -70.64395904541016 -40.23594665527344 0.0010254086228087542 H 0.3191489361702128 S 0.2393617021276596 NA NA H 0.32446808510638303 T 0.8723404255319149 NA NA NA NA NA NA S 0.2765957446808511 T 0.2872340425531915 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2819148936170213 S 0.2819148936170213 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.988579919678158e-06 8.726733682100295e-06 3.988579919678158e-06 8.726733682100295e-06 1 250716 NA NA NA NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y269* NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2747747747747748 H 0.4234234234234234 NA NA H 0.2702702702702703 T 0.3288288288288289 NA NA NA NA NA NA H 0.4009009009009009 H 0.463963963963964 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.33783783783783783 H 0.4684684684684685 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.89 0.0 0.0 0.89 0.0 807T>A Y269C NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.0759635865688324 16.233418449759483 H 0.9954083561897278 0.0005827675340697169 0.0040088435634970665 H 0.0033731881994754076 0.9900387525558472 0.001330175087787211 4.10033535445109e-05 0.0003613429435063154 0.0004487558617256582 0.0020152968354523178 0.002391570946201682 -65.41789245605469 -39.936771392822266 0.0004271463840268552 H 0.2747747747747748 H 0.4234234234234234 NA NA H 0.2702702702702703 T 0.3288288288288289 NA NA NA NA NA NA H 0.4009009009009009 H 0.463963963963964 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.33783783783783783 H 0.4684684684684685 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.5822849960163648e-05 NA NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.5822849960163648e-05 1 143250 NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA V270= NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.20631060004234314 31.709939226508137 H 0.998136043548584 0.00012873084051534534 0.0017351305577903984 H 0.0006817012326791883 0.994963765144348 0.002470643725246191 8.909474672691431e-06 5.4649961384711794e-05 0.00013615463103633374 0.0009218374034389851 0.000762404699344188 -68.18250274658203 -42.91019821166992 0.000557401217520237 H 0.34507042253521125 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.35211267605633795 T 0.3661971830985916 NA NA NA NA NA NA H 0.31690140845070425 H 0.3380281690140845 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.24647887323943665 H 0.35211267605633795 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.52 0.0 0.0 0.52 0.0 810C>A V270I NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.20631060004234314 31.709939226508137 H 0.998136043548584 0.00012873084051534534 0.0017351305577903984 H 0.0006817012326791883 0.994963765144348 0.002470643725246191 8.909474672691431e-06 5.4649961384711794e-05 0.00013615463103633374 0.0009218374034389851 0.000762404699344188 -68.18250274658203 -42.91019821166992 0.000557401217520237 H 0.34507042253521125 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.35211267605633795 T 0.3661971830985916 NA NA NA NA NA NA H 0.31690140845070425 H 0.3380281690140845 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.24647887323943665 H 0.35211267605633795 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9883498175186105e-06 8.269635728958354e-06 3.9883498175186105e-06 8.269635728958354e-06 1 250730 NA NA NA NA Gtc/Atc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I271L NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.2609350085258484 48.27297657728195 H 0.9975661039352416 0.0002808542922139168 0.0021530038211494684 H 0.0010638018138706684 0.9891757369041444 0.007055525667965412 4.480711868382059e-05 0.00016664798022247848 0.00019352587696630508 0.0014001138042658567 0.0008998566190712154 -65.44631958007811 -41.89491271972656 0.0020574340596795078 H 0.2840236686390533 H 0.3431952662721893 NA NA H 0.28994082840236685 H 0.16568047337278108 NA NA NA NA NA NA H 0.4201183431952663 H 0.4260355029585799 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4142011834319527 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.979049885558197e-06 1.5112788294588184e-05 NA NA NA NA 6.979049885558197e-06 1.5112788294588184e-05 1 143286 NA Atc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA I271V NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.2609350085258484 48.27297657728195 H 0.9975661039352416 0.0002808542922139168 0.0021530038211494684 H 0.0010638018138706684 0.9891757369041444 0.007055525667965412 4.480711868382059e-05 0.00016664798022247848 0.00019352587696630508 0.0014001138042658567 0.0008998566190712154 -65.44631958007811 -41.89491271972656 0.0020574340596795078 H 0.2840236686390533 H 0.3431952662721893 NA NA H 0.28994082840236685 H 0.16568047337278108 NA NA NA NA NA NA H 0.4201183431952663 H 0.4260355029585799 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4142011834319527 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.5954299669829197e-05 8.089954044850265e-06 1.5954299669829197e-05 8.089954044850265e-06 4 250716 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA W273C NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.19383257627487185 46.616734594106674 H 0.9982753992080688 1.4858343092782889e-05 0.001709751202724874 H 0.0003315919893793762 0.9957053065299988 0.002398415235802531 1.8464639879312013e-06 5.881524884898681e-06 8.623612666269764e-05 0.0007115858606994152 0.0007590878522023559 -64.75050354003906 -41.57534790039063 0.0030856556259095677 H 0.2687224669603524 H 0.7312775330396476 NA NA H 0.2555066079295154 H 0.2775330396475771 NA NA NA NA NA NA H 0.7577092511013216 H 0.7621145374449341 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6784140969162996 H 0.7180616740088106 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.0 0.0 0.23 0.0 819G>T M277V NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.3202859759330749 64.0892237842083 H 0.9908180236816406 2.7094971301266924e-05 0.009155003353953363 H 0.001365176634863019 0.9842738509178162 0.0049154143780469894 1.0975828445225487e-05 1.4032541912456507e-05 0.0005259569734334947 0.004386560991406441 0.004507885314524175 -65.52164459228516 -38.95453643798828 0.00740406196564436 H 0.32446808510638303 H 0.2925531914893617 NA NA H 0.3191489361702128 H 0.4202127659574468 NA NA NA NA NA NA H 0.4202127659574468 H 0.4308510638297872 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3776595744680851 H 0.39361702127659576 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.015491827793136e-05 1.880498829130347e-05 1.1970800187555142e-05 1.0092798665837013e-05 3 250610 6.978949841141002e-06 1.5867041303498872e-05 1 143288 Atg/Gtg Atg/Gtg 1 0 NA NA NA NA NA NA A278E NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.4330978989601135 47.72738846540451 H 0.9926095604896544 4.885978705715388e-05 0.007341574411839247 H 0.0013996578054502606 0.9825970530509948 0.0073911347426474094 2.1816533262608573e-05 2.864782618416939e-05 0.0006095000426284969 0.004511866718530655 0.0034402813762426376 -66.00328063964844 -43.21282958984375 0.014275974594056606 H 0.4339622641509434 H 0.4622641509433962 NA NA H 0.4528301886792453 T 0.37735849056603776 NA NA NA NA NA NA H 0.5566037735849056 H 0.5471698113207547 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5188679245283019 H 0.4150943396226415 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9910300984047345e-06 8.365935721910629e-06 3.9910300984047345e-06 8.365935721910629e-06 1 250562 NA NA NA NA gCg/gAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A278V NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.4330978989601135 47.72738846540451 H 0.9926095604896544 4.885978705715388e-05 0.007341574411839247 H 0.0013996578054502606 0.9825970530509948 0.0073911347426474094 2.1816533262608573e-05 2.864782618416939e-05 0.0006095000426284969 0.004511866718530655 0.0034402813762426376 -66.00328063964844 -43.21282958984375 0.014275974594056606 H 0.4339622641509434 H 0.4622641509433962 NA NA H 0.4528301886792453 T 0.37735849056603776 NA NA NA NA NA NA H 0.5566037735849056 H 0.5471698113207547 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5188679245283019 H 0.4150943396226415 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 1.7775619519042686e-05 1.870662820851645e-05 1.5964100384735502e-05 8.871701339225914e-06 4 250562 2.0944500647601668e-05 1.6469087839927275e-05 3 143236 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA L281F NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.4393159747123718 80.43875496983526 H 0.98869389295578 8.219792653108017e-05 0.011223986744880676 H 0.002350561786442995 0.9744731783866882 0.008628304116427898 4.717063711723313e-05 4.843407805310562e-05 0.0010660854168236256 0.007812769152224064 0.005573519039899111 -65.91950225830078 -39.924278259277344 0.011328378692269324 H 0.39634146341463417 H 0.7987804878048781 NA NA H 0.3902439024390244 H 0.4268292682926829 NA NA NA NA NA NA H 0.7073170731707317 H 0.7439024390243902 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7439024390243902 H 0.6219512195121951 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 5.078257455229532e-06 1.996247239724586e-05 3.991160156147089e-06 1.0292014172207957e-05 1 250554 6.979239969950868e-06 1.7104816528974325e-05 1 143282 Ctt/Ttt Ctt/Ttt 0 0 NA NA NA NA NA NA L281P NA TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.4393159747123718 80.43875496983526 H 0.98869389295578 8.219792653108017e-05 0.011223986744880676 H 0.002350561786442995 0.9744731783866882 0.008628304116427898 4.717063711723313e-05 4.843407805310562e-05 0.0010660854168236256 0.007812769152224064 0.005573519039899111 -65.91950225830078 -39.924278259277344 0.011328378692269324 H 0.39634146341463417 H 0.7987804878048781 NA NA H 0.3902439024390244 H 0.4268292682926829 NA NA NA NA NA NA H 0.7073170731707317 H 0.7439024390243902 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7439024390243902 H 0.6219512195121951 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 2.53825391152887e-05 1.6164664667834175e-05 3.192060103174299e-05 9.001247082872263e-06 8 250622 1.3951899745734408e-05 1.3426612930170074e-05 2 143350 cTt/cCt cTt/cCt 0 0 NA NA NA NA NA NA G285* NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7380952380952381 H 0.5 NA NA H 0.75 T 0.8333333333333334 NA NA NA NA NA NA H 0.5357142857142857 H 0.4404761904761905 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4880952380952381 H 0.5476190476190477 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.0 0.0 0.24 0.01 853G>T G285R NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.2902024984359741 22.838936626911163 H 0.9744510650634766 0.00028914050199091434 0.025259785354137417 H 0.006851907353848219 0.9453752636909484 0.015959575772285458 0.00013684433361049742 0.0001368143275612965 0.003094772575423121 0.01941836066544056 0.009026331827044487 -64.76622009277344 -37.903465270996094 0.02469460666179657 H 0.7380952380952381 H 0.5 NA NA H 0.75 T 0.8333333333333334 NA NA NA NA NA NA H 0.5357142857142857 H 0.4404761904761905 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4880952380952381 H 0.5476190476190477 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.5926523454132497e-05 NA NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.5926523454132497e-05 1 143238 NA Gga/Aga NA 0 0.23 0.03 0.0 0.23 0.01 853G>A A286V NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.24242150783538816 26.714850163459786 H 0.9628419280052184 0.0006376823876053095 0.0365203320980072 H 0.008074306882917881 0.9283633828163148 0.0154582466930151 0.00029302775510586804 0.0003867966588586569 0.00510619767010212 0.022175723686814308 0.020142337307333943 -67.73904418945311 -40.22772216796875 0.03111206740140915 H 0.8113207547169812 H 0.4716981132075472 NA NA H 0.8113207547169812 - 0.8962264150943396 NA NA NA NA NA NA H 0.4150943396226415 H 0.5849056603773585 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4811320754716981 H 0.5094339622641509 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.5156264179626099e-05 NA NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.5156264179626099e-05 1 143288 NA gCa/gTa NA 0 NA NA NA NA NA NA F287L NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.1984136700630188 39.82162358164787 H 0.9580691456794742 0.0006343852146528661 0.04129642248153687 H 0.009207700379192827 0.9175123572349548 0.0196765884757042 0.0004356144636403769 0.0004055539902765304 0.006587909534573555 0.018478386104106903 0.02769586443901062 -70.14907836914061 -38.78479766845703 0.02929238975048065 H 0.4517766497461929 H 0.3045685279187817 NA NA H 0.4517766497461929 - 0.7360406091370558 NA NA NA NA NA NA H 0.3197969543147208 H 0.3248730964467005 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3553299492385787 H 0.29441624365482233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.992270194430603e-06 9.575906359388555e-06 3.992270194430603e-06 9.575906359388555e-06 1 250484 NA NA NA NA ttT/ttG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A289G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA e 0.2920154333114624 32.18010075092316 H 0.9517983198165894 0.000994513393379748 0.04720716178417207 H 0.015194658190011978 0.907026469707489 0.01536872610449791 0.0003415118844714016 0.0007020315970294178 0.0048029241152107716 0.03167939186096192 0.024884238839149475 -65.24588775634766 -38.05306243896485 0.043276533484458916 NA NA H 0.5471698113207547 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4528301886792453 H 0.5566037735849056 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3962264150943397 H 0.5188679245283019 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.4757984091585428e-05 NA NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.4757984091585428e-05 1 143312 NA gCa/gGa NA 0 NA NA NA NA NA NA V290A NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.17311543226242065 26.60784193873405 H 0.954481303691864 0.0008095221128314734 0.04470913112163544 H 0.01772110536694527 0.8947350382804871 0.023449882864952087 0.00032666273182258015 0.0007187618757598102 0.005751868709921837 0.02494910918176174 0.032347522675991065 -68.88328552246094 -37.89304733276367 0.03634834289550781 NA NA H 0.6267605633802817 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6408450704225352 H 0.4084507042253521 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.647887323943662 H 0.647887323943662 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.991950052295579e-06 9.28080365018449e-06 3.991950052295579e-06 9.28080365018449e-06 1 250504 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V290L NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|14 NA NA NA NA b 0.17311543226242065 26.60784193873405 H 0.954481303691864 0.0008095221128314734 0.04470913112163544 H 0.01772110536694527 0.8947350382804871 0.023449882864952087 0.00032666273182258015 0.0007187618757598102 0.005751868709921837 0.02494910918176174 0.032347522675991065 -68.88328552246094 -37.89304733276367 0.03634834289550781 NA NA H 0.6267605633802817 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6408450704225352 H 0.4084507042253521 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.647887323943662 H 0.647887323943662 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 7.6169198763347385e-06 1.849227862976226e-05 7.98364999354817e-06 9.32740599926124e-06 2 250512 6.976029908400959e-06 1.596758799085533e-05 1 143348 Gtg/Ttg Gtg/Ctg 0 0 NA NA NA NA NA NA W291C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA TURN|3 NA NA NA e 0.2750926613807678 66.15978506207465 H 0.8743147850036621 0.003366350196301937 0.12231895327568056 H 0.025020573288202286 0.7954135537147522 0.03541143611073494 0.0017100439872592688 0.002549284137785435 0.014111302793025969 0.05483170226216316 0.07095204293727875 -68.76265716552734 -35.834625244140625 0.060106489807367325 NA NA T 0.8370044052863436 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.8942731277533039 H 0.2995594713656388 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7533039647577092 H 0.8942731277533039 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A 289805 VUS 2 0.00020821041542284599 1.888153658822487e-05 7.584159902762622e-05 9.309792808690996e-06 19 250522 0.000439605995779857 1.6426812892089567e-05 63 143310 tgG/tgT tgG/tgT 0 1 NA NA NA NA NA NA C292F NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA TURN|3 NA NA NA e 0.3844922184944153 53.98270747661591 H 0.6870782375335693 0.008639286272227764 0.3042825162410736 H 0.032366212457418435 0.5897606611251831 0.0472789853811264 0.003995093517005444 0.005377421155571938 0.030594265088438988 0.1591769903898239 0.13145044445991516 -69.67070007324219 -31.48368263244629 0.10239917039871216 NA NA T 0.5777777777777777 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.6 H 0.4296296296296296 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6074074074074074 H 0.6888888888888889 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9921101233630915e-06 9.383208810946696e-06 3.9921101233630915e-06 9.383208810946696e-06 1 250494 NA NA NA NA tGc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C292Y NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA TURN|3 NA NA NA e 0.3844922184944153 53.98270747661591 H 0.6870782375335693 0.008639286272227764 0.3042825162410736 H 0.032366212457418435 0.5897606611251831 0.0472789853811264 0.003995093517005444 0.005377421155571938 0.030594265088438988 0.1591769903898239 0.13145044445991516 -69.67070007324219 -31.48368263244629 0.10239917039871216 NA NA T 0.5777777777777777 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.6 H 0.4296296296296296 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6074074074074074 H 0.6888888888888889 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.9921101233630915e-06 8.132177338736414e-06 3.9921101233630915e-06 8.132177338736414e-06 1 250494 NA NA NA NA tGc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R294G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3488842844963074 79.89450114965439 C 0.2591210305690765 0.06289347261190414 0.6779855489730835 C 0.029320884495973587 0.1596488207578659 0.013339493423700331 0.019503701478242874 0.04533878341317177 0.103221595287323 0.11130614578723907 0.518320620059967 -85.02790832519531 26.85124206542969 0.15137048065662384 NA NA - 0.38306451612903225 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.3911290322580645 T 0.3548387096774194 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.3870967741935484 H 0.3387096774193548 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.3492175590243021e-05 NA NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.3492175590243021e-05 1 143346 NA Aga/Gga NA 0 NA NA NA NA NA NA K295R NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4503428339958191 92.63552095293998 C 0.18115855753421786 0.09735197573900224 0.7214894890785217 C 0.028512107208371162 0.10871358960866928 0.007301408797502519 0.023845266550779343 0.07061279565095901 0.06956230849027634 0.06875326484441757 0.6226992011070251 -90.36488342285156 88.3920669555664 0.11592482030391693 NA NA - 0.5512195121951221 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6536585365853659 - 0.6146341463414634 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5219512195121951 - 0.5609756097560976 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.7 0.7 0.0 0.0 0.0 884A>G R296L NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.415132999420166 95.06545686721802 C 0.14743876457214355 0.11097638309001924 0.7415848970413208 C 0.029324101284146312 0.09523259103298187 0.00674277450889349 0.02187289856374264 0.08267062902450563 0.0974135473370552 0.07627659291028976 0.5904669165611267 -91.13648223876952 116.54882049560548 0.09369736164808272 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.996390205429634e-06 9.01855583988841e-06 3.996390205429634e-06 9.01855583988841e-06 1 250226 NA NA NA NA cGg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R296Q NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.415132999420166 95.06545686721802 C 0.14743876457214355 0.11097638309001924 0.7415848970413208 C 0.029324101284146312 0.09523259103298187 0.00674277450889349 0.02187289856374264 0.08267062902450563 0.0974135473370552 0.07627659291028976 0.5904669165611267 -91.13648223876952 116.54882049560548 0.09369736164808272 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.6234190036909054e-06 1.6058973202007318e-05 7.992770406417549e-06 8.012731058681853e-06 2 250226 6.9784600782440975e-06 1.3917139119949345e-05 1 143298 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R296W NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.415132999420166 95.06545686721802 C 0.14743876457214355 0.11097638309001924 0.7415848970413208 C 0.029324101284146312 0.09523259103298187 0.00674277450889349 0.02187289856374264 0.08267062902450563 0.0974135473370552 0.07627659291028976 0.5904669165611267 -91.13648223876952 116.54882049560548 0.09369736164808272 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.2704620467207385e-05 1.861514453275133e-05 1.5983399862307127e-05 8.906810051490257e-06 4 250260 6.9784600782440975e-06 1.6346019108085427e-05 1 143298 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA Y297C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.44410207867622375 94.904614213109 C 0.118928462266922 0.15886840224266052 0.7222031354904175 C 0.0276124868541956 0.062050186097621925 0.004332282580435276 0.018556687980890274 0.1267256885766983 0.08123520016670227 0.053741149604320526 0.6257461905479431 -101.22992706298828 131.3565673828125 0.09452152252197266 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.99233022108092e-06 9.027822579945607e-06 3.99233022108092e-06 9.027822579945607e-06 1 250480 NA NA NA NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y297F NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.44410207867622375 94.904614213109 C 0.118928462266922 0.15886840224266052 0.7222031354904175 C 0.0276124868541956 0.062050186097621925 0.004332282580435276 0.018556687980890274 0.1267256885766983 0.08123520016670227 0.053741149604320526 0.6257461905479431 -101.22992706298828 131.3565673828125 0.09452152252197266 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.984670446603559e-06 8.833697543173433e-06 7.984670446603559e-06 8.833697543173433e-06 2 250480 NA NA NA NA tAt/tTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E301K NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.599595308303833 104.74930036067964 C 0.0589957945048809 0.15224674344062805 0.7887575030326843 C 0.027408545836806297 0.0199517160654068 0.0006515845307148992 0.010476686991751194 0.15222470462322235 0.13228999078273773 0.09355080127716063 0.563446044921875 -92.7316665649414 98.07808685302734 0.1402486115694046 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.612784744696114e-06 1.7417894136491518e-05 7.974799700605217e-06 8.548247442368377e-06 2 250790 6.979149929975392e-06 1.5175984377102795e-05 1 143284 Gag/Aag Gag/Aag 0 0 NA NA NA NA NA NA Y302C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3657099306583405 78.15221218168735 C 0.02048908919095993 0.17406348884105682 0.8054474592208862 C 0.013044447638094423 0.009202644228935242 0.0003071072278544307 0.03485012426972388 0.14376218616962433 0.10244300216436386 0.06810426712036133 0.6282862424850464 -98.99592590332031 126.64613342285156 0.19998280704021454 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.072023758577462e-06 1.9878191356703966e-05 3.984920112998225e-06 8.960842074374784e-06 1 250946 6.974769803491653e-06 1.7743894750923624e-05 1 143374 tAc/tGc tAc/tGc 0 0 NA NA NA NA NA NA D306G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5396953821182251 77.77010456323623 C 0.01759747974574566 0.026889689266681668 0.9555128812789916 C 0.00812588818371296 0.0050896452739834785 8.314970182254909e-05 0.010293020866811277 0.015189310535788538 0.04204227030277252 0.03220963478088379 0.8869670629501343 -94.9786376953125 114.81897735595705 0.3708476424217224 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.9827900764066734e-06 9.136041541544722e-06 3.9827900764066734e-06 9.136041541544722e-06 1 251080 NA NA NA NA gAt/gGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D306N NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5396953821182251 77.77010456323623 C 0.01759747974574566 0.026889689266681668 0.9555128812789916 C 0.00812588818371296 0.0050896452739834785 8.314970182254909e-05 0.010293020866811277 0.015189310535788538 0.04204227030277252 0.03220963478088379 0.8869670629501343 -94.9786376953125 114.81897735595705 0.3708476424217224 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 502701 VUS 1 1.01428562505559e-05 1.81824214002768e-05 3.983080205216538e-06 8.287000528059034e-06 1 251062 2.0934499843860973e-05 1.6184130196744993e-05 3 143304 Gat/Aat Gat/Aat 0 0 NA NA NA NA NA NA N308H NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.8163317441940308 119.51096735000613 C 0.012399444356560707 0.003074673470109701 0.9845257997512816 T 0.009982977062463759 0.005345763172954321 6.900240259710699e-05 0.0014707440277561545 0.0024841194972395893 0.134199857711792 0.5572817921638489 0.2891657054424286 -90.3559799194336 10.529428482055664 0.3042464852333069 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.5209202045999146e-05 1.5925714624531602e-05 1.990810051211156e-05 7.71977108646819e-06 5 251154 6.97622999723535e-06 1.3929591547297776e-05 1 143344 Aat/Cat Aat/Cat 0 0 NA NA NA NA NA NA A310D NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4815489649772644 53.06669594049454 C 0.02242722734808921 0.09059207886457443 0.8869806528091431 C 0.009838876314461231 0.007589746266603471 0.00012204016093164682 0.0333743616938591 0.05734244734048844 0.04577041044831276 0.026551254093647003 0.8194108605384827 -83.95989990234375 135.67782592773438 0.4317046701908112 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.070377387747308e-06 1.749584327748356e-05 3.9821297832531855e-06 9.787075272156509e-06 1 251122 6.977099928917596e-06 1.4502333936556876e-05 1 143326 gCt/gAt gCt/gAt 0 0 NA NA NA NA NA NA F311V NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2744491398334503 55.08194236457348 C 0.022602466866374016 0.11651825159788133 0.8608792424201965 C 0.01285523921251297 0.008468985557556152 0.00021681418002117425 0.04466300085186958 0.07686340063810349 0.04786458984017372 0.03622901067137718 0.7728389501571655 -99.58607482910156 128.42927551269528 0.400677353143692 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.980730070907157e-06 8.893984112681108e-06 3.980730070907157e-06 8.893984112681108e-06 1 251210 NA NA NA NA Ttt/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S312P NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3571705222129822 41.86038520336151 C 0.028042010962963104 0.13002382218837738 0.8419342041015625 C 0.012439333833754064 0.01332833245396614 0.00022927259851712734 0.03759823739528656 0.08809477090835571 0.0566592663526535 0.03294771164655685 0.7587030529975891 -105.8005599975586 139.67845153808594 0.411609560251236 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.068838564420658e-06 1.7044689279575394e-05 3.980990186391864e-06 8.6135293088365e-06 1 251194 6.974769803491653e-06 1.4708111553938086e-05 1 143374 Tct/Cct Tct/Cct 0 0 NA NA NA NA NA NA S312T NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3571705222129822 41.86038520336151 C 0.028042010962963104 0.13002382218837738 0.8419342041015625 C 0.012439333833754064 0.01332833245396614 0.00022927259851712734 0.03759823739528656 0.08809477090835571 0.0566592663526535 0.03294771164655685 0.7587030529975891 -105.8005599975586 139.67845153808594 0.411609560251236 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.980990186391864e-06 7.698514132720514e-06 3.980990186391864e-06 7.698514132720514e-06 1 251194 NA NA NA NA Tct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N314K NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5480669140815735 80.23699622154236 C 0.06667254120111465 0.0446649007499218 0.8886625170707703 C 0.024260638281702995 0.04414895921945572 0.0006789435865357517 0.012579926289618015 0.0363866463303566 0.07397478818893433 0.1409970074892044 0.6669731140136719 -90.99776458740234 46.517921447753906 0.3894746899604797 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.0 0.0 0.31 0.0 942T>G A315T NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4628407657146454 51.00505238175392 C 0.10766911506652832 0.017042918130755424 0.8752880096435547 C 0.04120064899325372 0.0571976937353611 0.0005238131270743906 0.003922885749489069 0.01419378165155649 0.08763574063777924 0.14076457917690274 0.6545608043670654 -74.57469940185547 -9.418347358703613 0.4581270515918732 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.069478248181971e-06 1.802868732907112e-05 3.981429927080171e-06 8.118134918086693e-06 1 251166 6.97583982400829e-06 1.6097498323067193e-05 1 143352 Gca/Aca Gca/Aca 0 0 NA NA NA NA NA NA A315V NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4628407657146454 51.00505238175392 C 0.10766911506652832 0.017042918130755424 0.8752880096435547 C 0.04120064899325372 0.0571976937353611 0.0005238131270743906 0.003922885749489069 0.01419378165155649 0.08763574063777924 0.14076457917690274 0.6545608043670654 -74.57469940185547 -9.418347358703613 0.4581270515918732 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.87 0.0 0.0 0.87 0.05 944C>T S316G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6192446351051331 72.5754712343216 C 0.10324136912822723 0.01299623865634203 0.8837623596191406 C 0.0641033872961998 0.0481623038649559 0.0005662890616804361 0.005086213350296021 0.010210667736828329 0.09388262033462524 0.2098233550786972 0.568165123462677 -83.049560546875 -3.6773312091827393 0.4590189456939697 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 326275 VUS 1 3.0416521414184197e-05 1.7451879796338463e-05 1.9907600290025584e-05 9.023006438599018e-06 5 251160 4.882740176981315e-05 1.4938321968509296e-05 7 143362 Agt/Ggt Agt/Ggt 0 0 NA NA NA NA NA NA G319* NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.89 0.0 0.0 0.03 0.89 955G>T G319A NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5234089493751526 41.19228431582451 C 0.05127544701099397 0.028984418138861656 0.9197402000427246 C 0.02936705760657788 0.020852353423833847 0.0006110293907113372 0.007507008034735919 0.023371707648038864 0.15757521986961365 0.16741177439689636 0.5933038592338562 14.57310390472412 3.841818332672119 0.372052401304245 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.83 0.83 0.04 0.0 0.0 956G>C G319E NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5234089493751526 41.19228431582451 C 0.05127544701099397 0.028984418138861656 0.9197402000427246 C 0.02936705760657788 0.020852353423833847 0.0006110293907113372 0.007507008034735919 0.023371707648038864 0.15757521986961365 0.16741177439689636 0.5933038592338562 14.57310390472412 3.841818332672119 0.372052401304245 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.05 0.0 0.0 956G>A G319R NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5234089493751526 41.19228431582451 C 0.05127544701099397 0.028984418138861656 0.9197402000427246 C 0.02936705760657788 0.020852353423833847 0.0006110293907113372 0.007507008034735919 0.023371707648038864 0.15757521986961365 0.16741177439689636 0.5933038592338562 14.57310390472412 3.841818332672119 0.372052401304245 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4913322114626868e-05 NA NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4913322114626868e-05 1 143334 NA Gga/Aga NA 0 0.85 0.0 0.0 0.03 0.85 955G>C G319V NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5234089493751526 41.19228431582451 C 0.05127544701099397 0.028984418138861656 0.9197402000427246 C 0.02936705760657788 0.020852353423833847 0.0006110293907113372 0.007507008034735919 0.023371707648038864 0.15757521986961365 0.16741177439689636 0.5933038592338562 14.57310390472412 3.841818332672119 0.372052401304245 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.64 0.64 0.06 0.0 0.0 956G>T E320* NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.66 0.66 0.0 0.0 0.0 958G>T E320G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6227611899375916 108.79637988209723 C 0.06465610861778259 0.05395551398396492 0.8813884258270264 C 0.027895433828234683 0.021368317306041718 0.0002797496854327619 0.015830863267183304 0.039702609181404114 0.1315508931875229 0.05610566958785057 0.7072664499282837 -86.74942016601562 117.41453552246094 0.39446207880973816 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.994379873503931e-06 1.4445064503596744e-05 NA NA NA NA 6.994379873503931e-06 1.4445064503596744e-05 1 142972 NA gAg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA E320K NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6227611899375916 108.79637988209723 C 0.06465610861778259 0.05395551398396492 0.8813884258270264 C 0.027895433828234683 0.021368317306041718 0.0002797496854327619 0.015830863267183304 0.039702609181404114 0.1315508931875229 0.05610566958785057 0.7072664499282837 -86.74942016601562 117.41453552246094 0.39446207880973816 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 958G>A E320Q NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6227611899375916 108.79637988209723 C 0.06465610861778259 0.05395551398396492 0.8813884258270264 C 0.027895433828234683 0.021368317306041718 0.0002797496854327619 0.015830863267183304 0.039702609181404114 0.1315508931875229 0.05610566958785057 0.7072664499282837 -86.74942016601562 117.41453552246094 0.39446207880973816 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.73 0.73 0.0 0.0 0.0 958G>C A321V NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3583636283874512 39.491671848297116 C 0.04793883115053177 0.12991651892662048 0.822144627571106 C 0.016136731952428818 0.02600782550871372 0.0003642714873421937 0.03174533694982529 0.08852099627256392 0.0585443414747715 0.04082494229078293 0.7378556132316589 -88.70394897460938 133.021240234375 0.3068412244319916 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 889540 VUS 1 8.655453379375064e-05 1.7909213243039682e-05 8.015389903448522e-05 8.911494456267293e-06 20 249520 9.7699899924919e-05 1.5534644686653932e-05 14 143296 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA C323F NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2310866117477417 32.44456028938293 C 0.1993337720632553 0.032362140715122216 0.7683040499687195 C 0.09532418847084044 0.11083764582872392 0.007032552734017372 0.010936309583485126 0.019834384322166443 0.14149542152881622 0.3032369315624237 0.3113024830818176 -79.51182556152344 -18.17057609558105 0.09716353565454484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.9817801886529205e-06 1.41529386356214e-05 NA NA NA NA 6.9817801886529205e-06 1.41529386356214e-05 1 143230 NA tGc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA V327I NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.181931346654892 27.96284798085689 H 0.772645115852356 0.007626834791153667 0.2197280377149582 H 0.0306959580630064 0.7721266150474548 0.010023297742009165 0.003542898455634713 0.003995275124907494 0.02014045789837837 0.057726483792066574 0.1017490029335022 -69.84500885009766 -36.93844223022461 0.03755170479416847 NA NA H 0.5492957746478874 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6830985915492958 - 0.528169014084507 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5492957746478874 - 0.7253521126760564 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 5.081613436629299e-06 1.721118363355307e-05 3.99508007831173e-06 9.215212533178316e-06 1 250308 6.979929821682163e-06 1.4536323470404694e-05 1 143268 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA S328G NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.14173546433448792 16.611396420001984 H 0.8567724823951721 0.0045032366178929814 0.138724222779274 H 0.018754655495285988 0.8476611971855164 0.006877874489873648 0.0007975439075380564 0.0027832158375531435 0.011179911904036999 0.02400106005370617 0.08794457465410233 -65.90444183349611 -43.20991897583008 0.02813873253762722 NA NA H 0.3769230769230769 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.2923076923076923 S 0.7076923076923077 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2384615384615385 S 0.2923076923076923 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 3.993669906776631e-06 1.0353689451343615e-05 3.993669906776631e-06 1.0353689451343615e-05 1 250396 NA NA NA NA Agc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A329T NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.4478704035282135 49.35531846880914 H 0.9342491030693054 0.0014623927418142555 0.0642884224653244 H 0.010660568252205849 0.9348073601722716 0.0038384471554309134 0.0001688623451627791 0.0009930934756994247 0.005246184300631286 0.014219976030290129 0.0300655011087656 -66.05633544921875 -38.354957580566406 0.020764185115695 NA NA H 0.7547169811320755 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5377358490566038 S 0.5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6509433962264151 H 0.5849056603773585 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A 594361 VUS 1 5.336204492104735e-05 1.8451116894810004e-05 3.595709858927876e-05 9.072874728397904e-06 9 250298 8.377549966098742e-05 1.60663206375555e-05 12 143240 Gca/Aca Gca/Aca 0 0 NA NA NA NA NA NA A330P NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.33329638838768005 36.72926200032234 H 0.9535122513771056 0.0016464415239170196 0.044841237366199486 H 0.009872935712337494 0.9442210197448728 0.005888611078262329 0.0003454859252087772 0.0008914095815271139 0.004099004436284304 0.0170170608907938 0.017664413899183273 -64.4254150390625 -41.61286926269531 0.02216258831322193 - 0.9433962264150944 H 0.5660377358490566 NA NA - 0.9528301886792452 NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.6226415094339622 S 0.4245283018867925 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6037735849056604 H 0.6415094339622641 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.4428799973931802e-05 NA NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.4428799973931802e-05 1 143262 NA Gca/Cca NA 0 NA NA NA NA NA NA F331L NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.11717107892036438 23.51623553931713 H 0.964179754257202 0.0011366187827661633 0.03468355163931846 H 0.0056238374672830105 0.9537560939788818 0.011942074634134771 0.00030340088414959615 0.0005412684404291213 0.003046390833333135 0.009338803589344023 0.015448159538209438 -66.01902770996094 -41.88439559936523 0.0117242019623518 H 0.4263959390862944 H 0.4467005076142132 NA NA H 0.4162436548223351 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6040609137055838 H 0.6548223350253807 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5025380710659898 H 0.6649746192893401 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.5651142578731658e-05 NA NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.5651142578731658e-05 1 143250 NA ttT/ttA NA 0 NA NA NA NA NA NA C334S NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.1814736425876617 25.47889941930771 H 0.9917030930519104 0.00019581487867981195 0.008101203478872776 H 0.0012802403653040528 0.9892022013664246 0.002634871518239379 3.6864119465462863e-05 8.88550202944316e-05 0.0005779351922683418 0.003014782210811973 0.003164283232763409 -65.99901580810547 -43.32481384277344 0.0022691653575748205 H 0.4518518518518518 H 0.5481481481481482 NA NA H 0.4592592592592593 - 1.0 NA NA - 1.0 NA NA H 0.5555555555555556 H 0.4962962962962963 NA NA NA NA NA NA - 1.0 NA NA H 0.4740740740740741 H 0.43703703703703706 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.285308075051257e-05 1.819914548890683e-05 2.3947699446580373e-05 8.912990265163227e-06 6 250546 2.0938899979228154e-05 1.5867183148230928e-05 3 143274 tGc/tCc tGc/tCc 0 0 NA NA NA NA NA NA R336K NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.3309950828552246 75.79787397384644 H 0.9919829964637756 0.00018185529916081578 0.00783513579517603 H 0.0017336059827357528 0.9871085286140442 0.00387142738327384 1.782818253559526e-05 9.577734454069288e-05 0.0005473454366438091 0.003801329527050257 0.002824186114594341 -65.31146240234375 -40.6473274230957 0.0016875079600140452 H 0.1693548387096774 H 0.5483870967741935 NA NA H 0.1693548387096774 H 0.6612903225806451 NA NA H 0.4637096774193548 NA NA H 0.5564516129032258 H 0.4354838709677419 NA NA NA NA NA NA H 0.5241935483870968 NA NA H 0.4032258064516129 H 0.5241935483870968 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.980610123719089e-06 1.4946154565736396e-05 NA NA NA NA 6.980610123719089e-06 1.4946154565736396e-05 1 143254 NA aGg/aAg NA 0 NA NA NA NA NA NA R337Q NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.4401108622550965 100.78538745641708 H 0.9936256408691406 6.233273597899824e-05 0.0063120326958596715 H 0.0006559485918842256 0.9918646216392516 0.0023325507063418627 1.0498995834495872e-05 2.9032258680672388e-05 0.0004172155458945781 0.0028507935348898172 0.0018392550991848113 -65.94496154785156 -42.27763748168945 0.0012159171747043727 H 0.06048387096774194 H 0.5967741935483871 NA NA H 0.06854838709677419 H 0.8225806451612904 NA NA H 0.7217741935483871 NA NA H 0.5120967741935484 H 0.5120967741935484 NA NA NA NA NA NA H 0.7701612903225806 NA NA H 0.6088709677419355 H 0.4717741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 502348 VUS 1 2.539088837910247e-05 1.4807718313361848e-05 1.5960900782374665e-05 7.444991582350179e-06 4 250612 4.1890700231306255e-05 1.2800024296328771e-05 6 143230 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R337W NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.4401108622550965 100.78538745641708 H 0.9936256408691406 6.233273597899824e-05 0.0063120326958596715 H 0.0006559485918842256 0.9918646216392516 0.0023325507063418627 1.0498995834495872e-05 2.9032258680672388e-05 0.0004172155458945781 0.0028507935348898172 0.0018392550991848113 -65.94496154785156 -42.27763748168945 0.0012159171747043727 H 0.06048387096774194 H 0.5967741935483871 NA NA H 0.06854838709677419 H 0.8225806451612904 NA NA H 0.7217741935483871 NA NA H 0.5120967741935484 H 0.5120967741935484 NA NA NA NA NA NA H 0.7701612903225806 NA NA H 0.6088709677419355 H 0.4717741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0158894425487354e-05 1.806767297371541e-05 7.982500392245129e-06 9.308288994685577e-06 2 250548 1.3966900041850751e-05 1.5485366081450633e-05 2 143196 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA L338P NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.17758330702781674 32.51550351679325 H 0.9931957721710204 8.186979539459571e-05 0.006722458638250828 H 0.0008220060262829065 0.9886972904205322 0.004473885986953975 2.4866263629519377e-05 3.1681105610914535e-05 0.0004934523021802306 0.002724433084949851 0.0027323965914547443 -66.35146331787111 -43.03339767456055 0.0015523377805948255 H 0.3719512195121951 H 0.5182926829268293 NA NA H 0.3719512195121951 H 0.573170731707317 NA NA H 0.6158536585365854 NA NA H 0.5060975609756098 H 0.4939024390243902 NA NA NA NA NA NA H 0.6768292682926829 NA NA H 0.5426829268292683 H 0.39634146341463417 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.992050096712774e-06 8.758401474525203e-06 3.992050096712774e-06 8.758401474525203e-06 1 250498 NA NA NA NA cTg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F339C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.08996286988258362 18.055547985434533 H 0.9846919178962708 0.0001747844071360305 0.015133291482925415 H 0.001815143623389304 0.9748090505599976 0.010479769669473171 6.152148853288962e-05 6.727910658810288e-05 0.0010531597072258592 0.005614680238068104 0.0060993609949946395 -68.35277557373047 -40.29864501953125 0.001554566202685237 H 0.3197969543147208 H 0.1218274111675127 NA NA H 0.3197969543147208 H 0.17766497461928935 NA NA H 0.1116751269035533 NA NA H 0.1218274111675127 H 0.15228426395939088 NA NA NA NA NA NA H 0.08629441624365483 NA NA H 0.14720812182741114 H 0.16243654822335024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.5232515597205053e-05 1.917811925010624e-05 1.1969999832217583e-05 9.001371074782505e-06 3 250626 2.093980037898291e-05 1.6934449407800783e-05 3 143268 tTc/tGc tTc/tGc 0 0 NA NA NA NA NA NA R341C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.34837791323661804 79.77854213118553 H 0.996971607208252 5.203855471336283e-05 0.002976331859827041 H 0.000518248591106385 0.9943055510520936 0.0025348321069031954 1.0916283827100416e-05 1.9437640730757266e-05 0.00022013857960700991 0.0016477935714647176 0.0007430952973663808 -65.67288208007811 -43.27933120727539 0.0006003770395182072 H 0.07258064516129033 H 0.5806451612903226 NA NA H 0.08064516129032258 H 0.6451612903225806 NA NA H 0.6653225806451613 NA NA H 0.6612903225806451 H 0.6491935483870968 NA NA NA NA NA NA H 0.6935483870967742 NA NA H 0.6290322580645161 H 0.717741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.031022544772632e-05 1.7398452484555845e-05 2.792670056805946e-05 7.990858278801332e-06 7 250656 6.98158009981853e-06 1.5454848198072337e-05 1 143234 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R341P NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.34837791323661804 79.77854213118553 H 0.996971607208252 5.203855471336283e-05 0.002976331859827041 H 0.000518248591106385 0.9943055510520936 0.0025348321069031954 1.0916283827100416e-05 1.9437640730757266e-05 0.00022013857960700991 0.0016477935714647176 0.0007430952973663808 -65.67288208007811 -43.27933120727539 0.0006003770395182072 H 0.07258064516129033 H 0.5806451612903226 NA NA H 0.08064516129032258 H 0.6451612903225806 NA NA H 0.6653225806451613 NA NA H 0.6612903225806451 H 0.6491935483870968 NA NA NA NA NA NA H 0.6935483870967742 NA NA H 0.6290322580645161 H 0.717741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.989910055679502e-06 9.12207797594109e-06 3.989910055679502e-06 9.12207797594109e-06 1 250632 NA NA NA NA cGc/cCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G343A NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.01918753981590271 1.5100593835115432 H 0.9978331923484802 1.473772954341257e-05 0.0021520424634218216 H 0.0008481524419039488 0.994766116142273 0.0026705856435000896 5.524583229998825e-06 4.43197814092855e-06 0.00020956777734681964 0.0007181873661465943 0.0007775272242724893 -65.21404266357422 -44.589786529541016 0.00027454967494122684 H 0.4761904761904762 H 0.0 NA NA H 0.4761904761904762 H 0.011904761904761904 NA NA H 0.023809523809523808 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.07142857142857142 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.396510015183594e-05 1.5835897299323338e-05 NA NA NA NA 1.396510015183594e-05 1.5835897299323338e-05 2 143214 NA gGg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA F345C NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.2272089123725891 45.60082871317864 H 0.9958289265632628 0.0001371553080389276 0.004033912904560566 H 0.001539646415039897 0.9901095628738404 0.004407752770930529 2.2507443645736206e-05 7.166192517615855e-05 0.00025409046793356543 0.002257762709632516 0.0013369295047596095 -64.89348602294922 -42.94498062133789 0.0004930155701003969 H 0.29949238578680204 H 0.41116751269035534 NA NA H 0.29949238578680204 H 0.4517766497461929 NA NA H 0.3756345177664975 NA NA H 0.4568527918781726 H 0.4974619289340101 NA NA NA NA NA NA H 0.4365482233502538 NA NA H 0.4568527918781726 H 0.5482233502538071 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.98778001908795e-06 8.410959638785238e-06 3.98778001908795e-06 8.410959638785238e-06 1 250766 NA NA NA NA tTc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V347I NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA b 0.17353537678718567 26.672387412190428 H 0.9713010787963868 0.0001872574503067881 0.02851162478327751 H 0.005370710510760546 0.9648481607437134 0.0036926753818988796 6.198030314408244e-05 4.297768828109838e-05 0.0015028617344796658 0.02144741266965866 0.003033344866707921 -67.62606811523439 -34.659500122070305 0.0005466949660331012 H 0.34507042253521125 H 0.09859154929577464 NA NA H 0.3309859154929577 H 0.16901408450704225 NA NA H 0.1267605633802817 NA NA H 0.08450704225352113 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA NA NA H 0.02112676056338028 NA NA H 0.1056338028169014 H 0.07746478873239436 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 593604 VUS 1 1.5231321517794144e-05 1.818827626779285e-05 1.595130015630275e-05 8.857334634710373e-06 4 250764 1.3970199688628782e-05 1.588587475596848e-05 2 143162 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA R348Q NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA HELIX|15 NA NA NA NA e 0.4786391258239746 109.6083598136902 H 0.9217271208763124 0.00011267727677477525 0.07816022634506226 H 0.009796788915991785 0.9192075133323668 0.003804129082709551 4.037431426695548e-05 1.3926441170042379e-05 0.002755273599177599 0.06288399547338486 0.001497961231507361 -78.6471176147461 -27.24662971496582 0.0005792533047497272 T 0.3064516129032258 H 0.5362903225806451 NA NA T 0.3145161290322581 H 0.5887096774193549 NA NA H 0.5483870967741935 NA NA H 0.625 H 0.7338709677419355 NA NA NA NA NA NA H 0.4959677419354839 NA NA H 0.5403225806451613 S 0.6088709677419355 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.0953499188181013e-05 1.4018413767002598e-05 NA NA NA NA 2.0953499188181013e-05 1.4018413767002598e-05 3 143174 NA cGa/cAa NA 0 NA NA NA NA NA NA G351D NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.3571837544441223 28.11036147475243 H 0.9849552512168884 4.2057105019921444e-05 0.01500269677489996 H 0.01187132578343153 0.9680744409561156 0.0009599977056495844 1.4478931916528381e-05 1.528671964479145e-05 0.0014002608368173242 0.01529738772660494 0.002366792177781463 -62.30905151367188 -40.34574890136719 0.0018499961588531735 S 0.6071428571428571 H 0.6666666666666666 NA NA S 0.6190476190476191 T 0.6071428571428571 NA NA H 0.5595238095238095 NA NA H 0.5357142857142857 H 0.5238095238095238 NA NA NA NA NA NA H 0.6309523809523809 NA NA H 0.5714285714285714 H 0.5357142857142857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.45 0.0 0.0 0.0 1052G>A C352F NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.2840222120285034 39.87671856880189 H 0.9960085153579712 0.00013004925858695057 0.003861404489725828 H 0.008673620410263538 0.9851922988891602 0.0012611843412742019 7.059892959659919e-05 6.290070450631902e-05 0.000387379783205688 0.00327194482088089 0.0010800863383337855 -66.14871215820311 -39.013465881347656 0.00108295155223459 H 0.5555555555555556 H 0.6074074074074074 NA NA H 0.5481481481481482 H 0.3037037037037037 NA NA H 0.4962962962962963 NA NA H 0.4222222222222222 H 0.4888888888888889 NA NA NA NA NA NA H 0.5925925925925926 NA NA H 0.674074074074074 H 0.4444444444444444 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.968889804033099e-06 8.472423859547627e-06 7.968889804033099e-06 8.472423859547627e-06 2 250976 NA NA NA NA tGt/tTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S357* NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4461538461538462 H 0.1 NA NA H 0.4538461538461538 H 0.09230769230769233 NA NA H 0.061538461538461535 NA NA H 0.1076923076923077 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA NA NA H 0.07692307692307693 NA NA H 0.05384615384615385 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.64 0.64 0.0 0.0 0.0 1070C>A S357L NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA b 0.016451865434646606 1.9281586289405823 H 0.9984754920005798 3.6396129871718585e-05 0.0014880283270031214 H 0.0014315961161628366 0.994965136051178 0.002407260006293655 2.5861629637802253e-06 1.672269354457967e-05 9.202922956319526e-05 0.0006626641843467951 0.00042193601257167757 -66.06591033935547 -39.39613723754883 0.0006528220837935804 H 0.4461538461538462 H 0.1 NA NA H 0.4538461538461538 H 0.09230769230769233 NA NA H 0.061538461538461535 NA NA H 0.1076923076923077 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA NA NA H 0.07692307692307693 NA NA H 0.05384615384615385 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 539313 conflict 1 6.979340014368062e-06 1.5301562544759552e-05 NA NA NA NA 6.979340014368062e-06 1.5301562544759552e-05 1 143280 NA tCg/tTg NA 0 NA NA NA NA NA NA L358Q NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.2980204224586487 54.56753935217857 H 0.9983868598937988 1.0820277566381264e-05 0.001602291245944798 H 0.0008807093836367131 0.9959512948989868 0.0016892453422769904 1.4165541415422922e-06 4.267383701517247e-06 9.151895210379736e-05 0.0009288581204600633 0.00045274134026840335 -64.82206726074219 -40.691741943359375 0.0009240914369001985 H 0.1951219512195122 H 0.573170731707317 NA NA H 0.1951219512195122 H 0.6707317073170732 NA NA H 0.5670731707317073 NA NA H 0.6097560975609756 H 0.5853658536585366 NA NA NA NA NA NA H 0.5121951219512195 NA NA H 0.5304878048780488 H 0.6402439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.99 0.0 0.0 0.0 1073T>A F360V NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA b 0.2267417311668396 45.50706544518471 H 0.9974053502082824 1.845205952122342e-05 0.0025761974975466733 H 0.0010255775414407251 0.9919037222862244 0.004067809320986271 8.355210411536971e-06 9.028469321492594e-06 0.00021685424144379795 0.0018665724201127887 0.0009020664147101344 -67.02393341064453 -40.4371223449707 0.0013712228974327445 H 0.3197969543147208 H 0.4517766497461929 NA NA H 0.3248730964467005 H 0.5989847715736041 NA NA H 0.39593908629441626 NA NA H 0.4517766497461929 H 0.41116751269035534 NA NA NA NA NA NA H 0.37055837563451777 NA NA H 0.4010152284263959 H 0.3147208121827411 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.070504115812191e-06 1.8275824470445525e-05 3.981810095865512e-06 9.719069081404633e-06 1 251142 6.978560122661293e-06 1.5477256096137333e-05 1 143296 Ttc/Gtc Ttc/Gtc 0 0 NA NA NA NA NA NA I361V NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA b 0.03501814603805542 6.478357017040253 H 0.9974621534347534 2.20805322896922e-05 0.002515757689252496 H 0.001273957546800375 0.994030237197876 0.0023002321831882 3.97043595512514e-06 1.060749764292268e-05 0.00015847788017708808 0.0013352310052141547 0.0008873493643477559 -68.31095123291016 -39.486419677734375 0.0008714113500900568 H 0.1242603550295858 H 0.09467455621301776 NA NA H 0.13609467455621302 H 0.1242603550295858 NA NA H 0.13609467455621302 NA NA H 0.1242603550295858 H 0.10059171597633136 NA NA NA NA NA NA H 0.10059171597633136 NA NA H 0.1242603550295858 H 0.17159763313609466 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981149802712024e-06 9.659435005965928e-06 3.981149802712024e-06 9.659435005965928e-06 1 251184 NA NA NA NA Att/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T362= NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.3689081072807312 51.167554479837406 H 0.9954857230186462 1.8739972801995464e-05 0.004495484288781881 H 0.0030201354529708624 0.9870238304138184 0.005060072056949139 4.0644954424351445e-06 9.211428732669447e-06 0.0003019609721377492 0.00321806943975389 0.0013626585714519026 -64.89395904541016 -40.27379608154297 0.0016416554572060704 H 0.4366197183098591 H 0.6408450704225352 NA NA H 0.4436619718309859 H 0.4929577464788733 NA NA H 0.5985915492957746 NA NA H 0.6408450704225352 H 0.5352112676056338 NA NA NA NA NA NA H 0.6690140845070423 NA NA H 0.6408450704225352 H 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.53 0.53 0.0 0.0 0.0 1086T>A T362N NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.3689081072807312 51.167554479837406 H 0.9954857230186462 1.8739972801995464e-05 0.004495484288781881 H 0.0030201354529708624 0.9870238304138184 0.005060072056949139 4.0644954424351445e-06 9.211428732669447e-06 0.0003019609721377492 0.00321806943975389 0.0013626585714519026 -64.89395904541016 -40.27379608154297 0.0016416554572060704 H 0.4366197183098591 H 0.6408450704225352 NA NA H 0.4436619718309859 H 0.4929577464788733 NA NA H 0.5985915492957746 NA NA H 0.6408450704225352 H 0.5352112676056338 NA NA NA NA NA NA H 0.6690140845070423 NA NA H 0.6408450704225352 H 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 596448 VUS 1 3.981179906986654e-05 8.021162057042293e-06 3.981179906986654e-05 8.021162057042293e-06 10 251182 NA NA NA NA aCt/aAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A363V NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA e 0.42390376329421997 46.71419471502304 H 0.9820558428764344 0.00010571498569333926 0.017838504165410995 H 0.007628382649272679 0.961494207382202 0.01111819501966238 3.464248220552689e-05 6.032757664797828e-05 0.0012329756282269955 0.014173609204590319 0.004257716704159975 -65.97416687011719 -39.569679260253906 0.0058765709400177 H 0.5377358490566038 H 0.5660377358490566 NA NA H 0.5566037735849056 H 0.660377358490566 NA NA H 0.490566037735849 NA NA H 0.7358490566037735 H 0.7169811320754716 NA NA NA NA NA NA H 0.4528301886792453 NA NA H 0.5660377358490566 H 0.6320754716981132 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 255690 benign 1 1.2677440143848893e-05 1.6799004574520307e-05 1.5925499610602856e-05 8.710844723974942e-06 4 251170 6.9816801442357254e-06 1.4364112882094465e-05 1 143232 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA S365L NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|16 NA NA NA NA b 0.042568087577819824 4.988979864120483 H 0.7850124835968018 0.0008735295850783588 0.21411406993865967 H 0.046450473368167884 0.7481297850608826 0.00839257426559925 0.00036226370139047503 0.00032266246853396297 0.012350870296359062 0.15593242645263672 0.028058992698788643 -72.98756408691406 -29.19269752502441 0.0014566760510206225 H 0.02307692307692308 H 0.24615384615384614 NA NA H 0.030769230769230767 T 0.18461538461538465 NA NA H 0.2769230769230769 NA NA H 0.18461538461538465 H 0.2307692307692308 NA NA NA NA NA NA T 0.2769230769230769 NA NA H 0.2923076923076923 H 0.2769230769230769 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7744316357706302e-05 1.6941403419994018e-05 1.1941499906242825e-05 8.790594399031332e-06 3 251224 2.7919699277845208e-05 1.4482285729493952e-05 4 143268 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA S366* NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5153846153846153 G 0.3923076923076923 NA NA H 0.5153846153846153 S 0.5230769230769231 NA NA H 0.4307692307692308 NA NA G 0.5692307692307692 G 0.6307692307692307 NA NA NA NA NA NA H 0.3538461538461539 NA NA G 0.38461538461538464 G 0.5461538461538461 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 973557 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V371F NA TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10463815927505493 16.08288508057594 C 0.005028538871556521 0.41574952006340027 0.5792219638824463 C 0.0017292501870542765 0.0013863996136933565 6.698089418932796e-05 0.017023870721459392 0.3803439438343048 0.08262281119823456 0.00551185617223382 0.5113148689270021 -97.79502868652344 135.61953735351562 0.0050796656869351855 S 0.5985915492957746 - 0.4366197183098591 NA NA S 0.5985915492957746 H 0.3028169014084507 NA NA - 0.19014084507042253 NA NA - 0.4084507042253521 - 0.3873239436619718 NA NA NA NA NA NA T 0.2112676056338028 NA NA - 0.4859154929577465 - 0.5140845070422535 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979750090365997e-06 8.196000093202292e-06 3.979750090365997e-06 8.196000093202292e-06 1 251272 NA NA NA NA Gtc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R372L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4691003262996674 107.42397472262384 E 0.0021121990866959095 0.8005570769309998 0.19733065366744995 E 0.0006541429320350289 0.000582078704610467 1.661136411712505e-05 0.03457580879330635 0.7201899290084839 0.007010784931480885 0.001908681821078062 0.23506201803684235 -109.62194061279295 132.3720703125 0.0071124257519841185 - 0.3911290322580645 - 0.5846774193548387 NA NA - 0.3951612903225806 - 0.6854838709677419 NA NA - 0.6653225806451613 NA NA - 0.6451612903225806 - 0.6330645161290323 NA NA NA NA NA NA - 0.7661290322580645 NA NA - 0.5362903225806451 - 0.592741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981020199717023e-06 7.5425258891649304e-06 3.981020199717023e-06 7.5425258891649304e-06 1 251192 NA NA NA NA cGg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R372Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4691003262996674 107.42397472262384 E 0.0021121990866959095 0.8005570769309998 0.19733065366744995 E 0.0006541429320350289 0.000582078704610467 1.661136411712505e-05 0.03457580879330635 0.7201899290084839 0.007010784931480885 0.001908681821078062 0.23506201803684235 -109.62194061279295 132.3720703125 0.0071124257519841185 - 0.3911290322580645 - 0.5846774193548387 NA NA - 0.3951612903225806 - 0.6854838709677419 NA NA - 0.6653225806451613 NA NA - 0.6451612903225806 - 0.6330645161290323 NA NA NA NA NA NA - 0.7661290322580645 NA NA - 0.5362903225806451 - 0.592741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 235775 VUS 2 3.042333472890041e-05 1.777964998908805e-05 2.786709956126288e-05 8.834957832639723e-06 7 251192 3.490599920041859e-05 1.5429176058038768e-05 5 143242 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R372W NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4691003262996674 107.42397472262384 E 0.0021121990866959095 0.8005570769309998 0.19733065366744995 E 0.0006541429320350289 0.000582078704610467 1.661136411712505e-05 0.03457580879330635 0.7201899290084839 0.007010784931480885 0.001908681821078062 0.23506201803684235 -109.62194061279295 132.3720703125 0.0071124257519841185 - 0.3911290322580645 - 0.5846774193548387 NA NA - 0.3951612903225806 - 0.6854838709677419 NA NA - 0.6653225806451613 NA NA - 0.6451612903225806 - 0.6330645161290323 NA NA NA NA NA NA - 0.7661290322580645 NA NA - 0.5362903225806451 - 0.592741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.592599983268883e-05 9.643761531922467e-06 1.592599983268883e-05 9.643761531922467e-06 4 251162 NA NA NA NA Cgg/Tgg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V373I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11290225386619568 17.353076419234277 E 0.001293713808991015 0.8129932284355164 0.18571306765079496 E 0.0006375422235578299 0.0003945771313738078 2.286803464812693e-05 0.025032704696059227 0.7478538155555725 0.0064829611219465715 0.0042182914912700644 0.21535724401474 -107.53461456298828 131.37751770019528 0.0019206528086215253 - 0.5563380281690141 B 0.4929577464788733 NA NA - 0.5633802816901409 - 0.4929577464788733 NA NA - 0.5492957746478874 NA NA B 0.5140845070422535 B 0.6197183098591549 NA NA NA NA NA NA - 0.5211267605633803 NA NA B 0.6690140845070423 - 0.6126760563380281 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0139455206761136e-05 1.858262720400621e-05 3.98025986214634e-06 1.0120928468026052e-05 1 251240 2.094119918183424e-05 1.5584634764670346e-05 3 143258 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA T375A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2317704856395721 32.146566358208645 C 0.004017789382487536 0.15747658908367154 0.8385056257247925 S 0.0006444876198656857 0.0015054142568260431 3.8697075069649145e-05 0.010759063996374607 0.0917000025510788 0.5734530091285706 0.027569346129894257 0.2943299412727356 -119.58259582519531 154.23989868164062 0.0010656689992174506 - 0.4859154929577465 - 0.7112676056338029 NA NA - 0.4859154929577465 - 0.3591549295774648 NA NA - 0.2887323943661972 NA NA - 0.2605633802816901 - 0.2535211267605634 NA NA NA NA NA NA - 0.20422535211267606 NA NA - 0.4084507042253521 - 0.3873239436619718 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.2959303475060776e-05 1.820742491804896e-05 4.775969864567742e-05 9.327596320400669e-06 12 251258 6.9848001658101575e-06 1.5636696231302764e-05 1 143168 Acc/Gcc Acc/Gcc 0 0 NA NA NA NA NA NA N376D NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3529426157474518 51.67079894542695 C 0.0014778691111132507 0.016295015811920166 0.9822271466255188 C 0.00020126719027757645 0.000803756935056299 8.747168067202438e-06 0.003346008714288473 0.011149019002914429 0.09437521547079086 0.003059793496504426 0.8870562314987183 -103.3497314453125 104.41159057617188 0.002785719931125641 - 0.5859872611464968 - 0.5286624203821656 NA NA - 0.5859872611464968 - 0.3949044585987261 NA NA - 0.4904458598726114 NA NA - 0.5668789808917197 - 0.4968152866242038 NA NA NA NA NA NA - 0.7643312101910829 NA NA - 0.5222929936305732 - 0.5796178343949044 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.980000201408983e-06 8.542733886725867e-06 3.980000201408983e-06 8.542733886725867e-06 1 251256 NA NA NA NA Aat/Gat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V378A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.22043520212173465 33.88089056611061 H 0.9457046389579772 0.008174507878720759 0.04612089321017265 H 0.2172059565782547 0.6874784827232361 0.01547190919518471 0.0008197825518436731 0.006689514499157667 0.0065887682139873505 0.05739426985383034 0.008351301774382591 -64.24005889892578 -36.147064208984375 0.002209712052717805 S 0.4859154929577465 H 0.14788732394366194 NA NA S 0.5070422535211268 S 0.4366197183098591 NA NA G 0.2183098591549296 NA NA H 0.17605633802816897 H 0.20422535211267606 NA NA NA NA NA NA G 0.5211267605633803 - 1.0 H 0.1619718309859155 H 0.1619718309859155 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.96013955550734e-06 8.671615949702957e-06 7.96013955550734e-06 8.671615949702957e-06 2 251252 NA NA NA NA gTt/gCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V378F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.22043520212173465 33.88089056611061 H 0.9457046389579772 0.008174507878720759 0.04612089321017265 H 0.2172059565782547 0.6874784827232361 0.01547190919518471 0.0008197825518436731 0.006689514499157667 0.0065887682139873505 0.05739426985383034 0.008351301774382591 -64.24005889892578 -36.147064208984375 0.002209712052717805 S 0.4859154929577465 H 0.14788732394366194 NA NA S 0.5070422535211268 S 0.4366197183098591 NA NA G 0.2183098591549296 NA NA H 0.17605633802816897 H 0.20422535211267606 NA NA NA NA NA NA G 0.5211267605633803 - 1.0 H 0.1619718309859155 H 0.1619718309859155 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.194119977299124e-05 9.466101346137688e-06 1.194119977299124e-05 9.466101346137688e-06 3 251232 NA NA NA NA Gtt/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L380F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|18 NA NA NA NA b 0.05660200119018555 10.363826417922974 H 0.8641995787620544 0.0060441968962550155 0.12975621223449707 H 0.31672310829162603 0.4847022593021393 0.01599309965968132 0.0013600338716059925 0.003661426017060876 0.02613266743719577 0.12392178177833554 0.02750565856695175 -77.72933959960938 -26.14618682861328 0.007216347847133875 - 0.6097560975609756 H 0.17682926829268292 NA NA - 0.6036585365853658 - 0.25 NA NA G 0.1951219512195122 NA NA H 0.14634146341463414 H 0.12804878048780488 NA NA NA NA NA NA G 0.1524390243902439 G 0.75 H 0.18292682926829268 H 0.2621951219512195 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 554968 VUS 2 7.604060363414375e-06 1.626006994418578e-05 7.960259608807974e-06 7.967411586026447e-06 2 251248 6.979440058785257e-06 1.4174280482926293e-05 1 143278 Ctc/Ttc Ctc/Ttc 0 0 NA NA NA NA NA NA W381* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5154185022026432 H 0.3259911894273128 NA NA - 0.5022026431718062 S 0.28193832599118945 NA NA G 0.31277533039647576 NA NA H 0.2555066079295154 H 0.22026431718061676 NA NA NA NA NA NA G 0.3524229074889868 G 1.0 H 0.30837004405286345 H 0.21145374449339208 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 198702 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S382* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.08461538461538462 S 0.030769230769230767 NA NA S 0.08461538461538462 S 0.1 NA NA S 0.038461538461538464 NA NA S 0.02307692307692308 S 0.030769230769230767 NA NA NA NA NA NA S 0.08461538461538462 G 0.3615384615384615 S 0.04615384615384616 S 0.02307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.01 0.0 0.27 0.0 1145C>A S382A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|18 NA NA NA NA b 0.15048575401306152 17.636930370330813 C 0.032224126160144806 0.0561579167842865 0.9116179347038268 C 0.007124151568859816 0.016263652592897415 0.0025577403139323 0.03873390331864357 0.02568584494292736 0.3825399875640869 0.047965869307518005 0.4791288375854492 -97.6689910888672 145.38958740234375 0.006031552795320749 S 0.08461538461538462 S 0.030769230769230767 NA NA S 0.08461538461538462 S 0.1 NA NA S 0.038461538461538464 NA NA S 0.02307692307692308 S 0.030769230769230767 NA NA NA NA NA NA S 0.08461538461538462 G 0.3615384615384615 S 0.04615384615384616 S 0.02307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.069783260239606e-06 1.8814675044599798e-05 3.9803799154469735e-06 8.076886336780783e-06 1 251232 6.980219950492027e-06 1.6992819193312522e-05 1 143262 Tca/Gca Tca/Gca 0 0 NA NA NA NA NA NA P384A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5723220705986023 81.21250181794167 C 0.0033534390386193986 0.003013144247233868 0.9936333894729614 T 0.0013435103464871645 0.000911562645342201 1.4481889593298547e-05 0.00048090590280480683 0.0007662673015147448 0.12910614907741547 0.8188080191612244 0.04856913909316063 -65.67884826660156 -9.201738357543944 0.005215922370553018 S 0.5588235294117647 T 0.7279411764705882 NA NA S 0.5441176470588235 T 0.7647058823529411 NA NA T 0.6323529411764706 NA NA T 0.7205882352941176 T 0.5808823529411765 NA NA NA NA - 0.875 T 0.6911764705882353 H 0.625 T 0.7352941176470589 T 0.8161764705882353 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.980040219175862e-06 1.0071721331433126e-05 3.980040219175862e-06 1.0071721331433126e-05 1 251254 NA NA NA NA Ccc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P384S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5723220705986023 81.21250181794167 C 0.0033534390386193986 0.003013144247233868 0.9936333894729614 T 0.0013435103464871645 0.000911562645342201 1.4481889593298547e-05 0.00048090590280480683 0.0007662673015147448 0.12910614907741547 0.8188080191612244 0.04856913909316063 -65.67884826660156 -9.201738357543944 0.005215922370553018 S 0.5588235294117647 T 0.7279411764705882 NA NA S 0.5441176470588235 T 0.7647058823529411 NA NA T 0.6323529411764706 NA NA T 0.7205882352941176 T 0.5808823529411765 NA NA NA NA - 0.875 T 0.6911764705882353 H 0.625 T 0.7352941176470589 T 0.8161764705882353 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978660167078488e-06 1.4706871879059473e-05 NA NA NA NA 6.978660167078488e-06 1.4706871879059473e-05 1 143294 NA Ccc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA S385G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.6441734433174133 75.49712755680085 C 0.00952708162367344 0.003499815706163645 0.9869731068611144 T 0.004829035140573978 0.0033462478313595057 4.2180894524790353e-05 0.0013058168115094304 0.0009545792127028108 0.12262652814388275 0.7774311900138855 0.08946439623832703 -95.3280258178711 18.75337791442871 0.003255847608670593 S 0.5769230769230769 T 0.7230769230769231 NA NA S 0.5769230769230769 T 0.8846153846153846 NA NA T 0.6923076923076923 NA NA T 0.7153846153846154 T 0.7769230769230769 NA NA NA NA H 0.676923076923077 T 0.7307692307692307 H 0.5307692307692308 T 0.6538461538461539 T 0.7076923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 500645 VUS 1 7.85896815009838e-05 1.6443906805474102e-05 3.980160181527026e-05 8.064347964511401e-06 10 251246 0.00014663999900221825 1.4330679081411265e-05 21 143208 Agc/Ggc Agc/Ggc 0 0 NA NA NA NA NA NA S386G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA b 0.1862647235393524 21.830225598812103 C 0.0979788452386856 0.009080688469111921 0.8929404616355896 C 0.003603164805099368 0.07741322368383408 7.776072743581608e-05 0.007139102090150119 0.003878087969496846 0.3152450919151306 0.01597166433930397 0.5766718983650208 -79.37203216552734 149.18634033203125 0.0028078809846192607 T 0.5230769230769231 - 0.16153846153846155 NA NA T 0.5230769230769231 S 0.2230769230769231 NA NA S 0.14615384615384616 NA NA - 0.2 - 0.2307692307692308 NA NA NA NA H 0.6538461538461539 - 0.24615384615384614 H 0.4461538461538462 - 0.2 - 0.2 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 553470 VUS 1 3.98006977775367e-06 8.957463473232436e-06 3.98006977775367e-06 8.957463473232436e-06 1 251252 NA NA NA NA Agc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A388P NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA b 0.04734832048416138 5.217784917354583 H 0.9857988357543944 0.00034924410283565516 0.013851945288479328 H 0.0063072280026972285 0.982948124408722 0.000946659070905298 6.739441596437246e-05 0.00011149673809995876 0.001127006602473557 0.005703196860849857 0.002788952784612775 -65.0479736328125 -39.94784164428711 0.0010973953176289797 H 0.08490566037735849 H 0.018867924528301886 NA NA H 0.08490566037735849 H 0.02830188679245283 NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA H 0.5188679245283019 H 0.009433962264150943 H 0.14150943396226415 H 0.018867924528301886 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 553090 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R389C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.3753646314144135 85.95850059390068 H 0.9932505488395692 0.0004693660303018987 0.006280078087002039 H 0.002986428327858448 0.9908021092414856 0.0008666932699270546 7.861694757593797e-05 0.00018104285118170083 0.000548637704923749 0.002821283647790551 0.0017151160864159465 -63.81779098510742 -40.51985168457031 0.0009383976575918496 H 0.31048387096774194 H 0.125 NA NA H 0.31048387096774194 H 0.21774193548387094 NA NA H 0.2379032258064516 NA NA H 0.1693548387096774 H 0.12903225806451613 NA NA NA NA H 0.7419354838709677 H 0.14919354838709678 H 0.5201612903225806 H 0.2258064516129032 H 0.1532258064516129 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 863837 pathogenic 1 5.070018120698313e-06 1.6960976217921313e-05 3.980610017606523e-06 9.579828030624997e-06 1 251218 6.980410034884699e-06 1.3996485600626472e-05 1 143258 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R389H NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.3753646314144135 85.95850059390068 H 0.9932505488395692 0.0004693660303018987 0.006280078087002039 H 0.002986428327858448 0.9908021092414856 0.0008666932699270546 7.861694757593797e-05 0.00018104285118170083 0.000548637704923749 0.002821283647790551 0.0017151160864159465 -63.81779098510742 -40.51985168457031 0.0009383976575918496 H 0.31048387096774194 H 0.125 NA NA H 0.31048387096774194 H 0.21774193548387094 NA NA H 0.2379032258064516 NA NA H 0.1693548387096774 H 0.12903225806451613 NA NA NA NA H 0.7419354838709677 H 0.14919354838709678 H 0.5201612903225806 H 0.2258064516129032 H 0.1532258064516129 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.0424455366618225e-05 1.889718279517221e-05 2.786739969451446e-05 8.812802250888211e-06 7 251190 3.4908898669527844e-05 1.6716400153169708e-05 5 143230 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA L390R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.3293266296386719 60.29970588684082 H 0.9969907999038696 0.000205142394406721 0.0028039857279509306 H 0.0009557087905704976 0.9956122636795044 0.0012662195367738605 2.84801863017492e-05 6.357659003697337e-05 0.00018386814917903402 0.0012807336170226336 0.000609071459621191 -63.08523941040039 -41.84400177001953 0.00025931742857210344 H 0.5792682926829268 H 0.4878048780487805 - 0.7378048780487805 H 0.5853658536585366 H 0.7012195121951219 NA NA H 0.5060975609756098 NA NA H 0.5914634146341463 H 0.5304878048780488 NA NA NA NA H 0.451219512195122 H 0.4390243902439024 H 0.5853658536585366 H 0.6341463414634146 H 0.5792682926829268 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|nan|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5f1b-C NA NA NA 3.979660050390521e-06 8.443257777090577e-06 3.979660050390521e-06 8.443257777090577e-06 1 251278 NA NA NA NA cTg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E391* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.09278350515463918 H 0.02577319587628866 - 0.21649484536082475 H 0.10824742268041238 H 0.020618556701030927 NA NA H 0.020618556701030927 - 0.30927835051546393 H 0.05154639175257732 H 0.10824742268041238 NA NA NA NA H 0.10309278350515463 H 0.03608247422680412 H 0.14948453608247422 H 0.02577319587628866 H 0.06701030927835051 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|nan|5hns-B|6w5u-A|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5f1b-C 522757 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA D396E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.4553399085998535 65.61448082923889 H 0.9985579848289492 1.5745928976684812e-05 0.0014262876939028502 H 0.0009773907950147986 0.934233546257019 0.06352166086435318 3.7932522900518957e-06 5.081158178654731e-06 0.0001091558951884508 0.0009255657205358149 0.00022383710893336684 -64.70933532714844 -40.86655044555664 0.00011144226300530137 H 0.15950920245398773 H 0.07975460122699386 I 0.7239263803680982 H 0.15950920245398773 T 0.5153374233128835 T 0.0 T 0.196319018404908 H 0.6257668711656442 H 0.061349693251533735 H 0.12269938650306747 NA NA NA NA H 0.4969325153374233 H 0.3067484662576687 H 0.6809815950920245 H 0.07975460122699386 H 0.08588957055214724 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.280800906031992e-05 1.9395374290925347e-05 2.78504894595244e-05 1.313176276783487e-05 2,5 251342,251342 1.3961000149720347e-05 1.4273659323887265e-05 2 143256 gaC/gaG,gaC/gaA gaC/gaA 0,0 0 NA NA NA NA NA NA Q397K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.7320657968521118 130.74695131778716 H 0.9966498017311096 1.6341140508302487e-05 0.003333802567794919 H 0.0011070386972278357 0.9384937286376952 0.05719754099845886 4.9045547712012186e-06 3.6904700664308616e-06 0.00020944367861375213 0.002810168080031872 0.00017344343359582126 -70.79338836669922 -39.20112609863281 0.00016739188868086785 H 0.7727272727272727 H 0.6616161616161617 I 0.5757575757575758 H 0.7777777777777778 T 0.6919191919191919 T 0.3282828282828283 T 0.4090909090909091 H 0.23737373737373735 H 0.5707070707070707 H 0.494949494949495 NA NA NA NA H 0.6161616161616161 H 0.42424242424242425 H 0.6464646464646465 H 0.6111111111111112 H 0.5808080808080808 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.478670687512251e-05 NA NA NA NA 6.9808002081117584e-06 1.478670687512251e-05 1 143250 NA Cag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA Q397R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.7320657968521118 130.74695131778716 H 0.9966498017311096 1.6341140508302487e-05 0.003333802567794919 H 0.0011070386972278357 0.9384937286376952 0.05719754099845886 4.9045547712012186e-06 3.6904700664308616e-06 0.00020944367861375213 0.002810168080031872 0.00017344343359582126 -70.79338836669922 -39.20112609863281 0.00016739188868086785 H 0.7727272727272727 H 0.6616161616161617 I 0.5757575757575758 H 0.7777777777777778 T 0.6919191919191919 T 0.3282828282828283 T 0.4090909090909091 H 0.23737373737373735 H 0.5707070707070707 H 0.494949494949495 NA NA NA NA H 0.6161616161616161 H 0.42424242424242425 H 0.6464646464646465 H 0.6111111111111112 H 0.5808080808080808 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.602552497925542e-06 1.8545107378852113e-05 3.978550012107007e-06 8.966763223323998e-06 1 251348 1.3961000149720347e-05 1.6233242590129654e-05 2 143256 cAg/cGg cAg/cGg 0 0 NA NA NA NA NA NA H398Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|19 NA NA NA NA e 0.3101390600204468 56.41429501771927 H 0.9824787378311156 0.0001028961269184947 0.017418323084712032 H 0.0019046628149226308 0.9191343188285828 0.06313702464103699 1.860086376836989e-05 2.0290572138037533e-05 0.0008456062641926111 0.014164320193231106 0.0007751095690764487 -97.12152099609376 -32.97420883178711 0.0004336443089414388 H 0.375 H 0.2554347826086957 I 0.5706521739130435 H 0.3804347826086957 S 0.1956521739130435 T 0.23369565217391305 T 0.1358695652173913 H 0.11413043478260868 H 0.33695652173913043 H 0.3532608695652174 NA NA NA NA H 0.44565217391304346 H 0.04891304347826087 S 0.4728260869565217 H 0.25 H 0.3641304347826087 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5hns-A|5f1b-C 872387 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P401S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|4 NA NA NA e 0.5005552172660828 71.02878533005715 C 0.2999660074710846 0.0008483426063321531 0.6991856098175049 T 0.3119913637638092 0.01941867917776108 0.00016878815949894488 0.00017714846762828532 0.00016683732974343002 0.11700193583965306 0.5249980092048645 0.02607720531523228 -64.21461486816406 -19.494121551513672 0.0010597358923405409 - 0.13970588235294118 - 0.22794117647058826 T 0.6544117647058824 - 0.15441176470588236 - 0.3014705882352941 T 0.2867647058823529 S 0.16911764705882354 T 0.4632352941176471 - 0.19852941176470587 - 0.15441176470588236 NA NA - 0.7352941176470589 T 0.8088235294117647 S 0.2426470588235294 S 0.8014705882352942 - 0.2058823529411765 - 0.16911764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.958299647725653e-06 6.9146749137570255e-06 7.958299647725653e-06 6.9146749137570255e-06 2 251310 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P401T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|4 NA NA NA e 0.5005552172660828 71.02878533005715 C 0.2999660074710846 0.0008483426063321531 0.6991856098175049 T 0.3119913637638092 0.01941867917776108 0.00016878815949894488 0.00017714846762828532 0.00016683732974343002 0.11700193583965306 0.5249980092048645 0.02607720531523228 -64.21461486816406 -19.494121551513672 0.0010597358923405409 - 0.13970588235294118 - 0.22794117647058826 T 0.6544117647058824 - 0.15441176470588236 - 0.3014705882352941 T 0.2867647058823529 S 0.16911764705882354 T 0.4632352941176471 - 0.19852941176470587 - 0.15441176470588236 NA NA - 0.7352941176470589 T 0.8088235294117647 S 0.2426470588235294 S 0.8014705882352942 - 0.2058823529411765 - 0.16911764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.3959500392957127e-05 1.4912463487045829e-05 NA NA NA NA 1.3959500392957127e-05 1.4912463487045829e-05 2 143272 NA Cct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA F402S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|4 NA NA NA b 0.2434265911579132 48.85571684539318 C 0.3814041018486023 0.0169695932418108 0.6016263365745544 T 0.3200091123580933 0.04259540513157845 0.0006365104927681386 0.003857172094285488 0.005457840394228697 0.08585991710424422 0.5033124685287476 0.038271620869636536 -82.16253662109375 -13.238941192626953 0.0017494662897661328 - 0.3147208121827411 - 0.14213197969543148 T 0.5532994923857868 - 0.3197969543147208 - 0.06598984771573604 T 0.06091370558375635 - 0.06598984771573604 T 0.18274111675126906 - 0.16243654822335024 - 0.14720812182741114 NA NA S 0.6598984771573604 T 0.5532994923857868 - 0.02538071065989848 - 0.7208121827411168 - 0.1116751269035533 - 0.1218274111675127 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.979119810537668e-06 8.463451578583063e-06 3.979119810537668e-06 8.463451578583063e-06 1 251312 NA NA NA NA tTc/tCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F402V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|4 NA NA NA b 0.2434265911579132 48.85571684539318 C 0.3814041018486023 0.0169695932418108 0.6016263365745544 T 0.3200091123580933 0.04259540513157845 0.0006365104927681386 0.003857172094285488 0.005457840394228697 0.08585991710424422 0.5033124685287476 0.038271620869636536 -82.16253662109375 -13.238941192626953 0.0017494662897661328 - 0.3147208121827411 - 0.14213197969543148 T 0.5532994923857868 - 0.3197969543147208 - 0.06598984771573604 T 0.06091370558375635 - 0.06598984771573604 T 0.18274111675126906 - 0.16243654822335024 - 0.14720812182741114 NA NA S 0.6598984771573604 T 0.5532994923857868 - 0.02538071065989848 - 0.7208121827411168 - 0.1116751269035533 - 0.1218274111675127 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.979239863838302e-06 8.46437102226621e-06 3.979239863838302e-06 8.46437102226621e-06 1 251304 NA NA NA NA Ttc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F403S NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.07386395335197449 14.82449543774128 C 0.3622887432575226 0.15649673342704773 0.4812144935131073 G 0.3657141923904419 0.0451933853328228 0.001478555495850742 0.030688771978020668 0.09474776685237883 0.1480742245912552 0.07236272096633911 0.2417403757572174 -96.21968841552734 83.7444076538086 0.0010560608934611082 - 0.2487309644670051 - 0.233502538071066 E 0.19796954314720813 - 0.2538071065989848 - 0.28426395939086296 E 0.08121827411167512 - 0.18781725888324874 E 0.10152284263959392 - 0.27411167512690354 - 0.233502538071066 NA NA E 0.467005076142132 E 0.16243654822335024 - 0.17258883248730966 - 0.2436548223350254 - 0.2538071065989848 - 0.2588832487309645 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.788131778774696e-05 1.895995212032957e-05 1.5917399650788863e-05 8.935178401475779e-06 4 251298 4.88717996631749e-05 1.6722510916097214e-05 7 143232 tTc/tCc tTc/tCc 0 0 NA NA NA NA NA NA R404Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA e 0.27192023396492004 62.26973357796669 E 0.07034146040678024 0.4682165384292602 0.4614419341087341 E 0.04711911454796791 0.015232525765895844 0.0007272812072187662 0.036281704902648926 0.41820764541625977 0.08066576719284058 0.0370655283331871 0.3647004067897797 -109.93620300292969 126.64910888671876 0.0009868807392194867 E 0.16129032258064516 B 0.06048387096774194 E 0.4838709677419355 E 0.1693548387096774 B 0.16129032258064516 E 0.14516129032258066 E 0.03629032258064517 E 0.1532258064516129 B 0.06854838709677419 B 0.06048387096774194 NA NA E 0.06854838709677419 E 0.4354838709677419 E 0.03225806451612903 E 0.1129032258064516 B 0.06451612903225806 E 0.05645161290322581 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 188794 pathogenic 2 2.534763891352065e-05 1.956601798222892e-05 3.5814900911645964e-05 9.456159546300293e-06 9 251292 6.982169907132629e-06 1.7129217913139507e-05 1 143222 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 0.31 0.31 0.0 0.0 0.0 1211G>A R404W NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA e 0.27192023396492004 62.26973357796669 E 0.07034146040678024 0.4682165384292602 0.4614419341087341 E 0.04711911454796791 0.015232525765895844 0.0007272812072187662 0.036281704902648926 0.41820764541625977 0.08066576719284058 0.0370655283331871 0.3647004067897797 -109.93620300292969 126.64910888671876 0.0009868807392194867 E 0.16129032258064516 B 0.06048387096774194 E 0.4838709677419355 E 0.1693548387096774 B 0.16129032258064516 E 0.14516129032258066 E 0.03629032258064517 E 0.1532258064516129 B 0.06854838709677419 B 0.06048387096774194 NA NA E 0.06854838709677419 E 0.4354838709677419 E 0.03225806451612903 E 0.1129032258064516 B 0.06451612903225806 E 0.05645161290322581 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 499939 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T405M NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.08238133788108826 11.426291564106936 E 0.03628367930650711 0.6774730086326599 0.2862432599067688 E 0.017226021736860275 0.008311260491609573 0.0004308164934627712 0.015406294725835325 0.6598882675170898 0.036466669291257865 0.014029426500201224 0.2482412457466125 -106.27967071533205 142.04959106445312 0.0005479833926074207 E 0.38028169014084506 - 0.2535211267605634 E 0.2746478873239437 E 0.3873239436619718 - 0.19718309859154928 E 0.07042253521126761 E 0.23943661971830985 E 0.14788732394366194 - 0.2887323943661972 - 0.2676056338028169 NA NA E 0.3661971830985916 E 0.3309859154929577 E 0.22535211267605634 E 0.3309859154929577 - 0.2535211267605634 E 0.2535211267605634 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 598529 VUS 1 1.1938600437133573e-05 8.359493906681076e-06 1.1938600437133573e-05 8.359493906681076e-06 3 251286 NA NA NA NA aCg/aTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q407* NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.17676767676767674 - 0.1717171717171717 E 0.1414141414141414 E 0.17676767676767674 E 0.15151515151515152 E 0.045454545454545456 E 0.17676767676767674 E 0.09090909090909093 - 0.15656565656565655 - 0.13131313131313133 NA NA E 0.3232323232323233 E 0.1414141414141414 E 0.101010101010101 E 0.3080808080808081 - 0.16666666666666666 - 0.15151515151515152 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 498154 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q407H NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.062199711799621575 11.108868527412412 E 0.0021375911310315128 0.9727301597595216 0.025132231414318085 E 0.0015008545015007255 0.00023693355615250766 5.041304575570393e-06 0.001038599875755608 0.973488748073578 0.004854201804846525 0.0006958606536500156 0.01817975379526615 -131.01119995117188 141.6830291748047 0.0001403861097060144 E 0.17676767676767674 - 0.1717171717171717 E 0.1414141414141414 E 0.17676767676767674 E 0.15151515151515152 E 0.045454545454545456 E 0.17676767676767674 E 0.09090909090909093 - 0.15656565656565655 - 0.13131313131313133 NA NA E 0.3232323232323233 E 0.1414141414141414 E 0.101010101010101 E 0.3080808080808081 - 0.16666666666666666 - 0.15151515151515152 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 281031 VUS 2 5.0693268114666743e-05 1.7597749526418163e-05 7.163840200519189e-05 8.036530683184936e-06 18 251262 1.3959899661131205e-05 1.5655509029500695e-05 2 143268 caG/caC caG/caC 0 0 NA NA NA NA NA NA L408P NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.021668821573257446 3.9675612300634384 E 0.0009159112232737244 0.9912391304969788 0.007844913750886917 E 0.00027177552692592144 0.0002542709407862276 6.442979611165358e-06 0.00045896248775534337 0.9919690489768982 0.0006535738357342781 0.0002986137114930898 0.006087358109652996 -111.173583984375 127.19752502441406 0.00016081363719422367 E 0.0 E 0.0 E 0.0 E 0.0 E 0.012195121951219513 E 0.0 E 0.0 E 0.0 E 0.0 E 0.006097560975609756 NA NA E 0.006097560975609756 E 0.006097560975609756 E 0.0 E 0.0 E 0.0 E 0.012195121951219513 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 561067 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R411Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.2358690798282624 54.01401928067207 E 0.0006220053764991463 0.9331242442131042 0.06625373661518097 E 0.00014723700587637722 0.00019403189071454108 1.4863135220366532e-05 0.006556403823196888 0.9284935593605042 0.006842136848717928 0.0014124705921858553 0.05633937194943427 -112.90545654296876 134.16348266601562 0.0020678755827248088 E 0.31048387096774194 E 0.11693548387096775 E 0.4717741935483871 E 0.3145161290322581 E 0.13709677419354838 E 0.41935483870967744 E 0.10483870967741936 E 0.4435483870967742 - 0.18951612903225806 E 0.1814516129032258 NA NA E 0.4637096774193548 E 0.4395161290322581 - 0.10080645161290322 E 0.4556451612903226 E 0.1693548387096774 - 0.14112903225806453 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 235359 benign 2 0.0010545675107090354 1.4758331668849637e-05 0.0005173389799892902 9.078230217286868e-06 130 251286 0.0019973700400441885 1.1635896603601711e-05 286 143188 cGg/cAg cGg/cAg 2 2 NA NA NA NA NA NA R411W NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|12 NA NA NA NA NA b 0.2358690798282624 54.01401928067207 E 0.0006220053764991463 0.9331242442131042 0.06625373661518097 E 0.00014723700587637722 0.00019403189071454108 1.4863135220366532e-05 0.006556403823196888 0.9284935593605042 0.006842136848717928 0.0014124705921858553 0.05633937194943427 -112.90545654296876 134.16348266601562 0.0020678755827248088 E 0.31048387096774194 E 0.11693548387096775 E 0.4717741935483871 E 0.3145161290322581 E 0.13709677419354838 E 0.41935483870967744 E 0.10483870967741936 E 0.4435483870967742 - 0.18951612903225806 E 0.1814516129032258 NA NA E 0.4637096774193548 E 0.4395161290322581 - 0.10080645161290322 E 0.4556451612903226 E 0.1693548387096774 - 0.14112903225806453 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.068782224752024e-06 1.9253042181577808e-05 3.979399934905814e-06 8.35636535377635e-06 1 251294 6.979440058785257e-06 1.7345050917187314e-05 1 143278 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA D416G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5891673564910889 84.8990160703659 C 0.1103973314166069 0.016623200848698616 0.872979462146759 C 0.08309189975261687 0.02398540265858173 0.00024395248328801244 0.0054200985468924046 0.013616182841360569 0.2785245478153229 0.13730891048908234 0.4578089714050293 -77.33889770507812 55.19432830810547 0.0342644602060318 - 0.8650306748466258 - 0.7914110429447853 - 0.8650306748466258 - 0.8466257668711656 - 0.7730061349693251 - 0.8588957055214724 - 0.8711656441717791 - 0.8588957055214724 - 0.7300613496932515 - 0.7546012269938649 NA NA - 0.8098159509202454 - 0.7730061349693251 - 0.8650306748466258 - 0.7852760736196319 - 0.7668711656441718 - 0.7546012269938649 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.0694774505165856e-06 1.9148312103593705e-05 3.978550012107007e-06 1.0143644834728207e-05 1 251348 6.9847001213929624e-06 1.6240822820396908e-05 1 143170 gAc/gGc gAc/gGc 0 0 NA NA NA NA NA NA H418Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|13 NA NA NA NA NA e 0.2972908616065979 54.07720772624016 C 0.19035330414772034 0.1553492397069931 0.654297411441803 C 0.16098223626613614 0.06067490950226784 0.0009192645666189492 0.012541748583316805 0.14180253446102142 0.13254080712795258 0.20876474678516388 0.2817736864089966 -94.89373016357422 16.382074356079098 0.04668939486145973 E 0.266304347826087 E 0.2989130434782609 E 0.2771739130434783 E 0.2554347826086957 E 0.3967391304347826 E 0.2717391304347826 E 0.22282608695652173 E 0.2717391304347826 E 0.22282608695652173 E 0.2391304347826087 NA NA E 0.266304347826087 E 0.22826086956521735 E 0.2826086956521739 E 0.23369565217391305 E 0.266304347826087 E 0.2989130434782609 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.5291562641589406e-05 NA NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.5291562641589406e-05 1 143262 NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA I419M NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|13 NA NA NA NA NA b 0.11480852961540222 21.23957797884941 C 0.09947066009044647 0.3888069689273834 0.5117223262786865 E 0.061803579330444336 0.04020221531391144 0.0012873575324192645 0.04787125065922737 0.3348763287067413 0.14530010521411896 0.06649556756019592 0.3021635711193085 -100.46086120605469 115.17671966552734 0.03242624923586845 E 0.4911242603550296 E 0.5207100591715976 E 0.6153846153846154 E 0.485207100591716 E 0.6153846153846154 E 0.5443786982248521 E 0.650887573964497 E 0.5325443786982249 E 0.5029585798816568 E 0.5502958579881657 NA NA E 0.5680473372781065 E 0.5325443786982249 E 0.6331360946745562 E 0.5562130177514792 E 0.4970414201183432 E 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.5348153379810957e-05 NA NA NA NA 6.981390015425859e-06 1.5348153379810957e-05 1 143238 NA atT/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA I419V NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|13 NA NA NA NA NA b 0.11480852961540222 21.23957797884941 C 0.09947066009044647 0.3888069689273834 0.5117223262786865 E 0.061803579330444336 0.04020221531391144 0.0012873575324192645 0.04787125065922737 0.3348763287067413 0.14530010521411896 0.06649556756019592 0.3021635711193085 -100.46086120605469 115.17671966552734 0.03242624923586845 E 0.4911242603550296 E 0.5207100591715976 E 0.6153846153846154 E 0.485207100591716 E 0.6153846153846154 E 0.5443786982248521 E 0.650887573964497 E 0.5325443786982249 E 0.5029585798816568 E 0.5502958579881657 NA NA E 0.5680473372781065 E 0.5325443786982249 E 0.6331360946745562 E 0.5562130177514792 E 0.4970414201183432 E 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.9597602962167e-06 8.091487546868631e-06 7.9597602962167e-06 8.091487546868631e-06 2 251264 NA NA NA NA Att/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q421* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5 - 0.696969696969697 - 0.045454545454545456 - 0.09090909090909093 - 0.7727272727272727 - 0.7171717171717171 - 0.696969696969697 - 0.7070707070707071 - 0.7171717171717171 - 0.6212121212121212 NA NA - 0.3888888888888889 - 0.7070707070707071 - 0.7626262626262627 - 0.1919191919191919 - 0.6161616161616161 - 0.5505050505050505 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 958381 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Y423C NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|14 NA NA NA NA NA e 0.2555921673774719 54.62004616856575 C 0.003016121918335557 0.09124153107404707 0.905742347240448 C 0.002111317589879036 0.0008823968819342555 1.6758473066147417e-05 0.03314879909157753 0.06579871475696564 0.15978078544139862 0.01838566176593304 0.7198755145072937 -102.82775115966795 133.54344177246094 0.02053416520357132 T 0.472972972972973 S 0.527027027027027 T 0.2072072072072072 T 0.3288288288288289 S 0.509009009009009 S 0.490990990990991 S 0.5045045045045045 S 0.4864864864864865 S 0.5180180180180181 S 0.4099099099099099 NA NA S 0.1126126126126126 S 0.4009009009009009 S 0.4684684684684685 S 0.12612612612612611 S 0.5675675675675675 S 0.08558558558558559 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.97791018258431e-06 9.413920548887739e-06 3.97791018258431e-06 9.413920548887739e-06 1 251388 NA NA NA NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P424S NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|14 NA NA NA NA NA e 0.5285054445266724 74.99492257833481 C 0.03011738508939743 0.03373418748378754 0.9361484050750732 T 0.029227187857031826 0.00525618065148592 4.9443478928878903e-05 0.003248227993026376 0.023574862629175183 0.12961897253990173 0.5171265602111816 0.29189857840538025 -65.86269378662111 -2.2188193798065186 0.0353211984038353 T 0.6397058823529411 S 0.7867647058823529 T 0.5514705882352942 T 0.5220588235294118 S 0.8088235294117647 S 0.8455882352941176 S 0.8382352941176471 S 0.8382352941176471 S 0.7720588235294118 S 0.75 NA NA S 0.2794117647058824 S 0.7941176470588235 S 0.7647058823529411 S 0.2867647058823529 S 0.8602941176470589 S 0.5441176470588235 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.602596086784165e-06 1.8907860433511113e-05 7.956079571158623e-06 1.0101686396249067e-05 2 251380 6.982169907132629e-06 1.598321363571705e-05 1 143222 Cct/Tct Cct/Tct 0 0 NA NA NA NA NA NA S425L NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|14 NA NA NA NA NA e 0.6798738241195679 79.68121218681334 C 0.034964654594659805 0.01943209208548069 0.9456032514572144 T 0.02745940163731575 0.006211440544575453 6.011367077007889e-05 0.009205596521496771 0.008507141843438148 0.1468922793865204 0.6133656501770021 0.18829844892024994 -87.4141845703125 15.655010223388672 0.05071136355400085 T 0.5538461538461539 S 0.5923076923076923 B 0.6615384615384615 T 0.5076923076923077 S 0.4615384615384616 S 0.8076923076923077 S 0.6846153846153846 S 0.8076923076923077 S 0.7384615384615385 S 0.7538461538461538 NA NA - 0.476923076923077 - 0.7538461538461538 S 0.7230769230769231 - 0.5230769230769231 S 0.8384615384615385 S 0.6 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.575045843135386e-05 1.6517839769806893e-05 1.1933299902011639e-05 9.04185323073916e-06 3 251398 0.00013266499445308 1.3823310776177544e-05 19 143218 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA P433L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|20 NA NA NA NA b 0.15863990783691406 22.51100292205811 C 0.010126003995537758 0.01955212838947773 0.9703218340873718 C 0.0054422980174422255 0.002568714320659637 2.033953023783397e-05 0.010077488608658314 0.010276959277689457 0.13100458681583405 0.02779838629066944 0.8128112554550171 -71.01290130615234 146.8181610107422 0.0018690546276047824 G 0.21323529411764705 S 0.17647058823529413 G 0.2058823529411765 G 0.21323529411764705 S 0.19852941176470587 G 0.21323529411764705 G 0.17647058823529413 G 0.21323529411764705 S 0.2058823529411765 G 0.21323529411764705 NA NA G 0.14705882352941174 G 0.16911764705882354 G 0.2352941176470588 G 0.16911764705882354 S 0.17647058823529413 G 0.2058823529411765 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 419321 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P434L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|20 NA NA NA NA b 0.0510636568069458 7.2459329009056095 C 0.05405071750283241 0.04241371154785156 0.9035356044769288 S 0.04663507267832756 0.01351638697087765 0.0001199064136017114 0.01814096979796886 0.015437516383826731 0.36310842633247375 0.3579526245594025 0.185089111328125 -65.63956451416016 -24.621929168701172 0.0016108275158330796 G 0.0 T 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.014705882352941175 G 0.0 G 0.014705882352941175 G 0.0 T 0.0 G 0.007352941176470587 NA NA G 0.0 G 0.0 G 0.007352941176470587 G 0.014705882352941175 T 0.007352941176470587 G 0.007352941176470587 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 429322 conflict 1 1.7737579738474142e-05 1.9836804282266242e-05 1.591060026839841e-05 9.195999913876346e-06 4 251404 2.094420051435009e-05 1.7576472618728776e-05 3 143238 cCg/cTg cCg/cTg 0 0 NA NA NA NA NA NA P434R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|20 NA NA NA NA b 0.0510636568069458 7.2459329009056095 C 0.05405071750283241 0.04241371154785156 0.9035356044769288 S 0.04663507267832756 0.01351638697087765 0.0001199064136017114 0.01814096979796886 0.015437516383826731 0.36310842633247375 0.3579526245594025 0.185089111328125 -65.63956451416016 -24.621929168701172 0.0016108275158330796 G 0.0 T 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.014705882352941175 G 0.0 G 0.014705882352941175 G 0.0 T 0.0 G 0.007352941176470587 NA NA G 0.0 G 0.0 G 0.007352941176470587 G 0.014705882352941175 T 0.007352941176470587 G 0.007352941176470587 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 502276 VUS 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P434S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|20 NA NA NA NA b 0.0510636568069458 7.2459329009056095 C 0.05405071750283241 0.04241371154785156 0.9035356044769288 S 0.04663507267832756 0.01351638697087765 0.0001199064136017114 0.01814096979796886 0.015437516383826731 0.36310842633247375 0.3579526245594025 0.185089111328125 -65.63956451416016 -24.621929168701172 0.0016108275158330796 G 0.0 T 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.014705882352941175 G 0.0 G 0.014705882352941175 G 0.0 T 0.0 G 0.007352941176470587 NA NA G 0.0 G 0.0 G 0.007352941176470587 G 0.014705882352941175 T 0.007352941176470587 G 0.007352941176470587 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 92700 benign 2 0.00673269719857585 1.7409639509677306e-05 0.0032895500771701336 9.877376906046596e-06 827 251402 0.012775800190865992 1.4336421217054635e-05 1830 143240 Ccg/Tcg Ccg/Tcg 16 28 NA NA NA NA NA NA D436A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3164162039756775 45.595574992895116 C 0.003749592462554574 0.03217863291501999 0.9640717506408693 C 0.001057669403962791 0.0018793615745380519 1.0554063010204116e-05 0.016349762678146362 0.01970050111413002 0.1483459323644638 0.004160364624112845 0.808495819568634 -98.39864349365234 143.3801727294922 0.00033692087163217366 S 0.2576687116564417 S 0.10429447852760736 S 0.25153374233128833 S 0.2576687116564417 S 0.12883435582822084 S 0.2576687116564417 - 0.2699386503067485 S 0.2638036809815951 - 0.2085889570552147 - 0.1840490797546012 NA NA S 0.196319018404908 S 0.22699386503067484 S 0.22085889570552147 S 0.22699386503067484 S 0.24539877300613494 - 0.1840490797546012 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.980410034884699e-06 1.518643846654734e-05 NA NA NA NA 6.980410034884699e-06 1.518643846654734e-05 1 143258 NA gAc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA D436Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3164162039756775 45.595574992895116 C 0.003749592462554574 0.03217863291501999 0.9640717506408693 C 0.001057669403962791 0.0018793615745380519 1.0554063010204116e-05 0.016349762678146362 0.01970050111413002 0.1483459323644638 0.004160364624112845 0.808495819568634 -98.39864349365234 143.3801727294922 0.00033692087163217366 S 0.2576687116564417 S 0.10429447852760736 S 0.25153374233128833 S 0.2576687116564417 S 0.12883435582822084 S 0.2576687116564417 - 0.2699386503067485 S 0.2638036809815951 - 0.2085889570552147 - 0.1840490797546012 NA NA S 0.196319018404908 S 0.22699386503067484 S 0.22085889570552147 S 0.22699386503067484 S 0.24539877300613494 - 0.1840490797546012 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.4612565966855225e-05 NA NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.4612565966855225e-05 1 143270 NA Gac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA Q438* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.5353535353535354 H 0.6111111111111112 H 0.7070707070707071 H 0.5202020202020202 H 0.8131313131313131 H 0.5303030303030303 H 0.7222222222222222 H 0.5252525252525253 H 0.5757575757575758 H 0.5707070707070707 NA NA H 0.3282828282828283 H 0.6616161616161617 H 0.6868686868686869 H 0.2525252525252525 H 0.6262626262626263 H 0.6565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 666979 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q438E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.5762338042259216 102.91535743474961 H 0.9926694631576538 0.00024321780074387797 0.00708735315129161 H 0.005561236292123794 0.9876662492752076 0.00012642880028579384 3.9299084164667875e-05 0.00010366092465119436 0.00044237705878913397 0.004776772577315569 0.001284026773646474 -64.54542541503906 -38.58403396606445 0.00023155036615207797 H 0.5353535353535354 H 0.6111111111111112 H 0.7070707070707071 H 0.5202020202020202 H 0.8131313131313131 H 0.5303030303030303 H 0.7222222222222222 H 0.5252525252525253 H 0.5757575757575758 H 0.5707070707070707 NA NA H 0.3282828282828283 H 0.6616161616161617 H 0.6868686868686869 H 0.2525252525252525 H 0.6262626262626263 H 0.6565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.977880169259152e-06 9.698577192336857e-06 3.977880169259152e-06 9.698577192336857e-06 1 251390 NA NA NA NA Cag/Gag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q438K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.5762338042259216 102.91535743474961 H 0.9926694631576538 0.00024321780074387797 0.00708735315129161 H 0.005561236292123794 0.9876662492752076 0.00012642880028579384 3.9299084164667875e-05 0.00010366092465119436 0.00044237705878913397 0.004776772577315569 0.001284026773646474 -64.54542541503906 -38.58403396606445 0.00023155036615207797 H 0.5353535353535354 H 0.6111111111111112 H 0.7070707070707071 H 0.5202020202020202 H 0.8131313131313131 H 0.5303030303030303 H 0.7222222222222222 H 0.5252525252525253 H 0.5757575757575758 H 0.5707070707070707 NA NA H 0.3282828282828283 H 0.6616161616161617 H 0.6868686868686869 H 0.2525252525252525 H 0.6262626262626263 H 0.6565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.977880169259152e-06 8.792058073629086e-06 3.977880169259152e-06 8.792058073629086e-06 1 251390 NA NA NA NA Cag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I439V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA b 0.03188017010688782 5.897831469774246 H 0.9988941550254822 3.264194674557075e-05 0.0010731894290074706 H 0.0030482716392725697 0.9957717061042786 0.0001275165705010295 7.958696187415626e-06 9.623421647120269e-06 7.162936526583508e-05 0.0007546627311967312 0.00020872477034572512 -63.7177963256836 -42.788246154785156 1.6696803868398998e-05 H 0.017751479289940832 H 0.01183431952662722 H 0.017751479289940832 H 0.017751479289940832 H 0.04733727810650888 H 0.017751479289940832 H 0.035502958579881665 H 0.01183431952662722 H 0.035502958579881665 H 0.0650887573964497 NA NA H 0.02366863905325444 H 0.017751479289940832 H 0.01183431952662722 H 0.005917159763313609 H 0.035502958579881665 H 0.08875739644970414 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 816923 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.0 0.0 0.99 0.03 1315A>G H441Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.39674845337867737 72.16854366958141 H 0.9976219534873962 5.110015990794636e-05 0.0023268596269190307 H 0.0007841347251087428 0.9960783123970032 0.0007990942103788258 9.291480637330096e-06 1.622015224711504e-05 0.00014119681145530194 0.0017847486305981874 0.0003870119689963759 -64.9581298828125 -40.18834686279297 0.00012085966591257602 H 0.08695652173913042 H 0.125 H 0.20108695652173916 H 0.08152173913043477 H 0.3315217391304348 H 0.08695652173913042 H 0.23369565217391305 H 0.09782608695652174 H 0.14130434782608695 H 0.21739130434782608 NA NA H 0.03260869565217391 H 0.1956521739130435 H 0.23369565217391305 H 0.03260869565217391 H 0.14130434782608695 H 0.18478260869565216 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 836745 VUS 1 3.978770109824836e-06 8.211706249527706e-06 3.978770109824836e-06 8.211706249527706e-06 1 251334 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q442= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.25003719329833984 44.65664272308349 H 0.99818217754364 2.9673939934582453e-05 0.0017882139654830098 H 0.0007637867820449172 0.9972836971282959 0.0003024830657523125 6.42591976429685e-06 7.781245585647412e-06 8.3105216617696e-05 0.001291070249862969 0.0002616015844978392 -64.08687591552734 -40.76908493041992 1.8885124518419613e-05 H 0.21212121212121213 H 0.20707070707070707 H 0.1919191919191919 H 0.20707070707070707 H 0.2727272727272727 H 0.2171717171717172 H 0.1717171717171717 H 0.20707070707070707 H 0.2222222222222222 H 0.2575757575757576 NA NA H 0.03535353535353535 H 0.20707070707070707 H 0.18181818181818185 H 0.045454545454545456 H 0.2222222222222222 H 0.2878787878787879 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.0 0.0 0.09 0.38 1326G>A Q442H NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.25003719329833984 44.65664272308349 H 0.99818217754364 2.9673939934582453e-05 0.0017882139654830098 H 0.0007637867820449172 0.9972836971282959 0.0003024830657523125 6.42591976429685e-06 7.781245585647412e-06 8.3105216617696e-05 0.001291070249862969 0.0002616015844978392 -64.08687591552734 -40.76908493041992 1.8885124518419613e-05 H 0.21212121212121213 H 0.20707070707070707 H 0.1919191919191919 H 0.20707070707070707 H 0.2727272727272727 H 0.2171717171717172 H 0.1717171717171717 H 0.20707070707070707 H 0.2222222222222222 H 0.2575757575757576 NA NA H 0.03535353535353535 H 0.20707070707070707 H 0.18181818181818185 H 0.045454545454545456 H 0.2222222222222222 H 0.2878787878787879 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.6 0.0 0.0 0.1 0.6 1326G>C Q447* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.020202020202020204 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.005050505050505051 NA NA H 0.015151515151515154 H 0.005050505050505051 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.005050505050505051 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 371192 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA A449V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA b 0.2278548777103424 25.109607523679728 H 0.9985710382461548 3.228556306567043e-05 0.001396678388118744 H 0.0005924567813053727 0.9974315762519836 0.0007139319204725325 3.2307070796377965e-06 1.086917836801149e-05 5.004712147638202e-05 0.0009955388959497213 0.00020232390670571482 -62.97560119628906 -41.61492919921875 1.1950729458476415e-05 H 0.29245283018867924 H 0.22641509433962265 H 0.2547169811320755 H 0.2830188679245283 H 0.3584905660377358 H 0.2830188679245283 H 0.37735849056603776 H 0.29245283018867924 H 0.3490566037735849 H 0.2830188679245283 NA NA H 0.04716981132075472 H 0.29245283018867924 H 0.3113207547169811 H 0.03773584905660377 H 0.2452830188679245 H 0.3207547169811321 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.7876599474789472e-05 1.76216332478823e-05 7.95854975876864e-06 8.870703463760194e-06 2 251302 6.280789966695009e-05 1.5226049335953948e-05 9 143294 gCc/gTc gCc/gTc 0 0 NA NA NA NA NA NA I450M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA b 0.011004090309143066 2.035756707191468 H 0.995468020439148 0.00014304174692369998 0.004388998728245497 H 0.002558934735134244 0.9912614822387696 0.0017859354848042128 2.5082619686145332e-05 5.6223860156023875e-05 0.00023167044855654237 0.0032394258305430412 0.0008412119932472706 -64.70034790039061 -40.406646728515625 6.147107342258096e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.02366863905325444 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.0 H 0.017751479289940832 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.957100024214014e-06 8.468917520359242e-06 7.957100024214014e-06 8.468917520359242e-06 2 251348 NA NA NA NA atC/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I450V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA b 0.011004090309143066 2.035756707191468 H 0.995468020439148 0.00014304174692369998 0.004388998728245497 H 0.002558934735134244 0.9912614822387696 0.0017859354848042128 2.5082619686145332e-05 5.6223860156023875e-05 0.00023167044855654237 0.0032394258305430412 0.0008412119932472706 -64.70034790039061 -40.406646728515625 6.147107342258096e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.02366863905325444 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.005917159763313609 H 0.0 H 0.0 H 0.017751479289940832 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 501091 VUS 1 7.347616431546464e-05 1.6721793087753247e-05 8.752669964451343e-05 7.743353635878429e-06 22 251352 4.8836998757906265e-05 1.4820891961665485e-05 7 143334 Atc/Gtc Atc/Gtc 0 0 NA NA NA NA NA NA E451K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|21 NA NA NA NA e 0.3776017725467682 65.9670296639204 H 0.905789077281952 0.002577717415988445 0.09163307398557664 H 0.01035541296005249 0.8936247229576111 0.0020866445265710354 0.0003527265798766166 0.0006175402086228133 0.0029238143470138307 0.08466839790344237 0.005370811093598604 -66.349609375 -28.26046562194824 0.00046024599578231573 H 0.2422680412371134 H 0.42268041237113396 H 0.17525773195876287 H 0.24742268041237114 H 0.2371134020618557 H 0.2371134020618557 T 0.2268041237113402 H 0.20618556701030927 H 0.27835051546391754 H 0.3865979381443299 NA NA H 0.29381443298969073 H 0.17010309278350516 H 0.3505154639175257 H 0.28350515463917525 H 0.4020618556701031 H 0.3350515463917525 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 554990 conflict 1 3.294508517973591e-05 1.7866358805456444e-05 3.978200038545765e-05 8.697890002405199e-06 10 251370 2.0945899450452998e-05 1.560620025731346e-05 3 143226 Gaa/Aaa Gaa/Aaa 0 0 NA NA NA NA NA NA S456F NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|16 NA NA NA NA NA e 0.5339528918266296 62.579278922081 E 0.007707876153290272 0.8925995826721191 0.09969255328178406 E 0.004010340664535761 0.00279897078871727 0.00019217946100980043 0.010741095058619976 0.8919397592544556 0.014367007650434969 0.012595434673130512 0.06335518509149551 -108.65885162353516 135.47367858886722 0.0037986885290592905 E 0.7076923076923077 - 0.6307692307692307 E 0.7692307692307693 E 0.7076923076923077 E 0.5615384615384615 E 0.7 - 0.5769230769230769 E 0.7076923076923077 - 0.6230769230769231 - 0.5538461538461539 NA NA E 0.7461538461538462 E 0.6846153846153846 - 0.6692307692307692 E 0.6615384615384615 - 0.7076923076923077 E 0.5846153846153846 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.977029791712994e-06 8.461913641221539e-06 3.977029791712994e-06 8.461913641221539e-06 1 251444 NA NA NA NA tCt/tTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D458V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6995027661323547 100.79834859967232 C 0.004646496381610632 0.007551068905740976 0.9878024458885192 T 0.0012389806797727942 0.00022699119290336967 3.103208200627705e-06 0.00023580039851367482 0.0010782585013657806 0.0383620522916317 0.949387550354004 0.009467265568673607 51.84724426269531 37.45574188232422 0.002576279453933239 T 0.8957055214723927 T 0.6932515337423313 T 0.6625766871165644 T 0.8895705521472392 T 0.7668711656441718 T 0.8343558282208589 T 0.6993865030674846 T 0.8343558282208589 T 0.6625766871165644 S 0.7730061349693251 NA NA T 0.7177914110429447 T 0.6441717791411042 S 0.7361963190184049 T 0.6625766871165644 T 0.5276073619631901 T 0.7852760736196319 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.976999778387835e-06 1.0692711234401024e-05 3.976999778387835e-06 1.0692711234401024e-05 1 251446 NA NA NA NA gAc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V462L NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|17 NA NA NA NA NA b 0.07201844453811647 11.0692349255085 E 8.425582927884534e-05 0.9641931653022766 0.035722501575946815 E 1.7973959984374233e-05 2.2464064386440438e-05 1.6586170659138588e-07 0.005992811638861896 0.9544329047203064 0.0009499007719568908 0.00012085912749171254 0.03846294060349464 -124.8112335205078 140.00444030761722 0.0004337048449087888 E 0.0 - 0.0 E 0.014084507042253518 E 0.0 E 0.007042253521126761 E 0.0 B 0.014084507042253518 E 0.0 - 0.014084507042253518 - 0.007042253521126761 NA NA E 0.035211267605633804 E 0.028169014084507043 B 0.028169014084507043 E 0.007042253521126761 - 0.007042253521126761 - 0.014084507042253518 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9769302020431505e-06 8.098839514594312e-06 3.9769302020431505e-06 8.098839514594312e-06 1 251450 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T463I NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|17 NA NA NA NA NA b 0.21630984544754028 30.002175563573843 E 0.00011587604240048677 0.8843644261360168 0.11551971733570099 E 1.998880907194689e-05 4.567418363876642e-05 5.915765086683678e-07 0.031471427530050285 0.8306936621665955 0.0051926723681390285 0.00017210219812113792 0.13240382075309753 -100.7051239013672 157.80950927734375 0.00020104058785364035 E 0.2183098591549296 - 0.34507042253521125 - 0.23943661971830985 E 0.2112676056338028 - 0.38028169014084506 E 0.20422535211267606 - 0.18309859154929575 E 0.2183098591549296 - 0.3380281690140845 - 0.3661971830985916 NA NA E 0.2887323943661972 E 0.2535211267605634 - 0.14788732394366194 E 0.3309859154929577 - 0.3309859154929577 - 0.3661971830985916 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 889538 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q465E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|22 NA NA NA NA e 0.4098772406578064 73.2040751814842 H 0.9901142120361328 0.0010265758028253913 0.008859207853674889 H 0.40993979573249817 0.5645796656608582 0.0028721513226628304 5.999347558827139e-05 0.0013311328366398814 0.0013434364227578044 0.01773739978671074 0.0021363627165555954 -62.40249252319336 -32.23670196533203 0.0003221206716261804 H 0.4545454545454545 H 0.5353535353535354 H 0.4444444444444444 H 0.4494949494949495 T 0.5808080808080808 H 0.2929292929292929 H 0.5757575757575758 H 0.2929292929292929 H 0.4646464646464646 H 0.5909090909090909 NA NA G 0.4141414141414141 H 0.35353535353535354 G 0.6313131313131313 H 0.5050505050505051 H 0.5505050505050505 H 0.4848484848484849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.0662665035684025e-06 1.6524986809352738e-05 3.976840162067673e-06 9.64112777331154e-06 1 251456 6.977779776207171e-06 1.3421022476248333e-05 1 143312 Caa/Gaa Caa/Gaa 0 0 NA NA NA NA NA NA C468G NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|10 NA NA NA NA NA NA b 0.02964681386947632 4.162412667274476 C 0.1312999576330185 0.2421655058860779 0.6265345811843872 C 0.11040440946817398 0.05584315583109856 0.003919369075447321 0.15659454464912415 0.0938657969236374 0.18846389651298529 0.18405114114284515 0.20685766637325287 -95.38594818115234 86.02323150634766 0.0008168341591954231 B 0.1037037037037037 B 0.07407407407407407 B 0.07407407407407407 B 0.0962962962962963 S 0.08148148148148149 B 0.0962962962962963 B 0.05185185185185185 B 0.08888888888888889 B 0.06666666666666668 B 0.04444444444444445 NA NA B 0.05925925925925926 B 0.0962962962962963 B 0.08148148148148149 B 0.05925925925925926 B 0.1037037037037037 B 0.037037037037037035 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 499800 VUS 1 6.9766101660206905e-06 1.4876299175760693e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.4876299175760693e-05 1 143336 NA Tgc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA C468W NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|10 NA NA NA NA NA NA b 0.02964681386947632 4.162412667274476 C 0.1312999576330185 0.2421655058860779 0.6265345811843872 C 0.11040440946817398 0.05584315583109856 0.003919369075447321 0.15659454464912415 0.0938657969236374 0.18846389651298529 0.18405114114284515 0.20685766637325287 -95.38594818115234 86.02323150634766 0.0008168341591954231 B 0.1037037037037037 B 0.07407407407407407 B 0.07407407407407407 B 0.0962962962962963 S 0.08148148148148149 B 0.0962962962962963 B 0.05185185185185185 B 0.08888888888888889 B 0.06666666666666668 B 0.04444444444444445 NA NA B 0.05925925925925926 B 0.0962962962962963 B 0.08148148148148149 B 0.05925925925925926 B 0.1037037037037037 B 0.037037037037037035 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5570219257369864e-05 NA NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5570219257369864e-05 1 143312 NA tgC/tgG NA 0 NA NA NA NA NA NA L469V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11083570122718812 20.294016894698146 C 0.03835226222872734 0.2076837420463562 0.7539640069007874 C 0.0181485079228878 0.012441498227417469 0.0018233931623399253 0.06455487757921219 0.13815198838710785 0.2382516860961914 0.11056717485189438 0.4160608351230621 -94.63424682617188 62.32160568237305 0.0011172296945005655 - 0.4451219512195122 - 0.24390243902439024 - 0.18902439024390244 - 0.451219512195122 - 0.2804878048780488 - 0.08536585365853659 - 0.18902439024390244 - 0.07926829268292683 - 0.201219512195122 - 0.27439024390243905 NA NA - 0.24390243902439024 - 0.25 - 0.1524390243902439 - 0.13414634146341464 - 0.3048780487804878 - 0.2378048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.5906300177448433e-05 9.588177631957671e-06 1.5906300177448433e-05 9.588177631957671e-06 4 251472 NA NA NA NA Ttg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A470P NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.21528786420822146 23.724722635746 C 0.0077239018864929685 0.12428582459688188 0.8679903149604797 C 0.004599390551447868 0.0022666514851152893 0.00015427543257828802 0.03486419841647148 0.09207147359848022 0.3319850564002991 0.032720454037189484 0.5013384222984314 -100.60257720947266 143.29127502441406 0.0012788402382284405 - 0.16037735849056606 - 0.2641509433962264 - 0.1792452830188679 - 0.16981132075471694 - 0.2452830188679245 - 0.1509433962264151 - 0.1792452830188679 - 0.16981132075471694 - 0.2452830188679245 - 0.2547169811320755 NA NA - 0.16037735849056606 - 0.2358490566037736 - 0.2169811320754717 - 0.16981132075471694 - 0.18867924528301888 - 0.2358490566037736 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.982169907132629e-06 1.7820860458469005e-05 NA NA NA NA 6.982169907132629e-06 1.7820860458469005e-05 1 143222 NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA P471L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|5 NA NA NA e 0.2589464783668518 36.74450528025627 C 0.009630591608583929 0.16018810868263245 0.8301812410354614 C 0.00707128643989563 0.0032740216702222824 9.248696733266115e-05 0.07541554421186447 0.10452184081077576 0.06546586751937866 0.053921956568956375 0.6902370452880859 -66.64412689208984 141.2853546142578 0.002402945421636105 T 0.4632352941176471 S 0.3014705882352941 T 0.4558823529411765 T 0.4632352941176471 S 0.2794117647058824 T 0.007352941176470587 S 0.25 T 0.007352941176470587 S 0.29411764705882354 S 0.3382352941176471 NA NA T 0.5735294117647058 T 0.5 S 0.3235294117647059 T 0.14705882352941174 S 0.2867647058823529 S 0.375 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.599435883553857e-06 1.8272489906694958e-05 7.953420208650641e-06 7.37278589522869e-06 2 251464 6.978269993851428e-06 1.6719028546341618e-05 1 143302 cCt/cTt cCt/cTt 0 0 NA NA NA NA NA NA P471S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|5 NA NA NA e 0.2589464783668518 36.74450528025627 C 0.009630591608583929 0.16018810868263245 0.8301812410354614 C 0.00707128643989563 0.0032740216702222824 9.248696733266115e-05 0.07541554421186447 0.10452184081077576 0.06546586751937866 0.053921956568956375 0.6902370452880859 -66.64412689208984 141.2853546142578 0.002402945421636105 T 0.4632352941176471 S 0.3014705882352941 T 0.4558823529411765 T 0.4632352941176471 S 0.2794117647058824 T 0.007352941176470587 S 0.25 T 0.007352941176470587 S 0.29411764705882354 S 0.3382352941176471 NA NA T 0.5735294117647058 T 0.5 S 0.3235294117647059 T 0.14705882352941174 S 0.2867647058823529 S 0.375 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 972170 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L472F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|5 NA NA NA b 0.2488108575344085 45.55726801455021 C 0.0206903088837862 0.06460565328598022 0.9147040247917176 C 0.01902525313198566 0.00574043020606041 0.0001783446641638875 0.03754064440727234 0.039568427950143814 0.2772086262702942 0.15381360054016113 0.4669247269630432 -84.82292175292969 0.7531547546386719 0.006888891104608774 T 0.1951219512195122 S 0.0 T 0.3048780487804878 T 0.1951219512195122 S 0.03048780487804878 T 0.2865853658536585 - 0.0 T 0.25609756097560976 S 0.006097560975609756 S 0.012195121951219513 NA NA T 0.5 T 0.4024390243902439 S 0.006097560975609756 T 0.0975609756097561 S 0.006097560975609756 S 0.006097560975609756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.977300017751987e-06 1.6149763980448637e-05 NA NA NA NA 6.977300017751987e-06 1.6149763980448637e-05 1 143322 NA Ctt/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA P474L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|5 NA NA NA e 0.5519159436225891 78.3168724000454 C 0.04670296236872673 0.0063351914286613464 0.9469618201255798 T 0.037337567657232285 0.008379962295293808 0.00012026663171127439 0.0011098332470282912 0.0028488594107329845 0.1842489391565323 0.6370401978492737 0.1289142519235611 -65.52451324462889 -18.539230346679688 0.01243092492222786 T 0.8308823529411765 T 0.8455882352941176 T 0.8308823529411765 T 0.8455882352941176 T 0.8382352941176471 S 0.3897058823529412 S 0.6029411764705882 T 0.3235294117647059 T 0.8602941176470589 T 0.8676470588235294 NA NA T 0.6544117647058824 T 0.7279411764705882 S 0.8970588235294118 T 0.5220588235294118 T 0.7941176470588235 T 0.8676470588235294 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 374049 pathogenic 2 1.7733479343865468e-05 1.650383076192326e-05 1.5907000488368794e-05 9.047220844056047e-06 4 251462 2.093920011247974e-05 1.3803051286475839e-05 3 143272 cCg/cTg cCg/cTg 0 0 NA NA NA NA NA NA T477K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5227013826370239 72.49868177175522 C 0.039153847843408585 0.027904493734240532 0.9329416155815125 S 0.027320070192217827 0.008421327918767929 0.00015001712017692628 0.00767601281404495 0.01851486787199974 0.33761245012283325 0.2996458411216736 0.3006593585014343 -88.94403839111328 -7.792126655578612 0.007380874361842871 - 0.6971830985915493 - 0.4014084507042254 - 0.6126760563380281 - 0.6971830985915493 - 0.6056338028169014 - 0.323943661971831 - 0.5704225352112676 S 0.6408450704225352 - 0.528169014084507 - 0.4295774647887324 NA NA - 0.3873239436619718 - 0.5211267605633803 - 0.39436619718309857 - 0.4084507042253521 - 0.4788732394366197 - 0.4014084507042254 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9767101043253206e-06 8.233922665424743e-06 3.9767101043253206e-06 8.233922665424743e-06 1 251464 NA NA NA NA aCg/aAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T477M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5227013826370239 72.49868177175522 C 0.039153847843408585 0.027904493734240532 0.9329416155815125 S 0.027320070192217827 0.008421327918767929 0.00015001712017692628 0.00767601281404495 0.01851486787199974 0.33761245012283325 0.2996458411216736 0.3006593585014343 -88.94403839111328 -7.792126655578612 0.007380874361842871 - 0.6971830985915493 - 0.4014084507042254 - 0.6126760563380281 - 0.6971830985915493 - 0.6056338028169014 - 0.323943661971831 - 0.5704225352112676 S 0.6408450704225352 - 0.528169014084507 - 0.4295774647887324 NA NA - 0.3873239436619718 - 0.5211267605633803 - 0.39436619718309857 - 0.4084507042253521 - 0.4788732394366197 - 0.4014084507042254 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 889537 VUS 1 5.8262970694524705e-05 1.6624117932295967e-05 6.36273980489932e-05 9.39749194380923e-06 16 251464 4.884929876425304e-05 1.3713075592037144e-05 7 143298 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA C479Y NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|10 NA NA NA NA NA NA b 0.0558636486530304 7.843256270885467 E 0.004264398477971554 0.5222289562225342 0.4735066294670105 E 0.003376960288733244 0.0008709145477041602 1.4922976333764387e-05 0.026759011670947075 0.481357753276825 0.04825064167380333 0.019313914701342583 0.4200558662414551 -101.29513549804688 137.28517150878906 0.0012269731378182767 - 0.04444444444444445 - 0.05185185185185185 - 0.02962962962962963 - 0.04444444444444445 - 0.1037037037037037 - 0.014814814814814815 - 0.1037037037037037 - 0.007407407407407408 - 0.037037037037037035 - 0.06666666666666668 NA NA - 0.1037037037037037 - 0.04444444444444445 - 0.14074074074074075 - 0.014814814814814815 - 0.06666666666666668 - 0.08148148148148149 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 539310 conflict 1 6.979630143177928e-06 1.6408318501900502e-05 NA NA NA NA 6.979630143177928e-06 1.6408318501900502e-05 1 143274 NA tGc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA T480A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14016693830490112 19.441154342889785 E 0.00252426671795547 0.899124264717102 0.09835147857666016 E 0.0011098963441327212 0.0011771585559472446 4.5253091229824356e-05 0.037328340113162994 0.8566678166389465 0.020685631781816486 0.0037334230728447437 0.07925251126289368 -119.00553131103516 134.96553039550778 0.0016311792423948646 - 0.06338028169014084 - 0.1267605633802817 - 0.04929577464788732 - 0.06338028169014084 - 0.04929577464788732 - 0.014084507042253518 - 0.1267605633802817 - 0.014084507042253518 - 0.13380281690140844 - 0.09154929577464788 NA NA - 0.07042253521126761 - 0.07746478873239436 - 0.09154929577464788 - 0.007042253521126761 - 0.1267605633802817 - 0.1056338028169014 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.976620064349845e-06 7.862785249689481e-06 3.976620064349845e-06 7.862785249689481e-06 1 251470 NA NA NA NA Acc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T480I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14016693830490112 19.441154342889785 E 0.00252426671795547 0.899124264717102 0.09835147857666016 E 0.0011098963441327212 0.0011771585559472446 4.5253091229824356e-05 0.037328340113162994 0.8566678166389465 0.020685631781816486 0.0037334230728447437 0.07925251126289368 -119.00553131103516 134.96553039550778 0.0016311792423948646 - 0.06338028169014084 - 0.1267605633802817 - 0.04929577464788732 - 0.06338028169014084 - 0.04929577464788732 - 0.014084507042253518 - 0.1267605633802817 - 0.014084507042253518 - 0.13380281690140844 - 0.09154929577464788 NA NA - 0.07042253521126761 - 0.07746478873239436 - 0.09154929577464788 - 0.007042253521126761 - 0.1267605633802817 - 0.1056338028169014 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.976590051024687e-06 9.402803065465603e-06 3.976590051024687e-06 9.402803065465603e-06 1 251472 NA NA NA NA aCc/aTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S483C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07362234592437744 8.628538942337036 C 0.013478990644216536 0.4234338700771332 0.5630871653556824 C 0.0015957752475515008 0.008979447185993195 9.490804950473829e-05 0.054157979786396034 0.342244029045105 0.07984136790037155 0.00925426371395588 0.5038322806358337 -106.59132385253906 149.46420288085938 0.0005708165699616076 S 0.007692307692307694 S 0.0 S 0.0 S 0.007692307692307694 - 0.007692307692307694 S 0.007692307692307694 - 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 - 0.0 NA NA S 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 S 0.0 - 0.0 - 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 1447A>T S483I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07362234592437744 8.628538942337036 C 0.013478990644216536 0.4234338700771332 0.5630871653556824 C 0.0015957752475515008 0.008979447185993195 9.490804950473829e-05 0.054157979786396034 0.342244029045105 0.07984136790037155 0.00925426371395588 0.5038322806358337 -106.59132385253906 149.46420288085938 0.0005708165699616076 S 0.007692307692307694 S 0.0 S 0.0 S 0.007692307692307694 - 0.007692307692307694 S 0.007692307692307694 - 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 - 0.0 NA NA S 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 S 0.0 - 0.0 - 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 1448G>T S483T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07362234592437744 8.628538942337036 C 0.013478990644216536 0.4234338700771332 0.5630871653556824 C 0.0015957752475515008 0.008979447185993195 9.490804950473829e-05 0.054157979786396034 0.342244029045105 0.07984136790037155 0.00925426371395588 0.5038322806358337 -106.59132385253906 149.46420288085938 0.0005708165699616076 S 0.007692307692307694 S 0.0 S 0.0 S 0.007692307692307694 - 0.007692307692307694 S 0.007692307692307694 - 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 - 0.0 NA NA S 0.0 S 0.015384615384615384 - 0.0 S 0.0 - 0.0 - 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.37 0.0 0.0 0.0 1448G>C V484A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.017718404531478882 2.723318776488304 H 0.9173316359519958 0.0024130200035870075 0.08025530725717545 H 0.10700687766075134 0.7797225117683411 0.006691519636660814 0.0005758536863140763 0.0015336530050262807 0.018329871818423268 0.06247304007411001 0.023666679859161373 -63.67716598510742 -34.762779235839844 0.0012278336798772216 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.035211267605633804 G 0.014084507042253518 G 0.007042253521126761 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 T 0.02112676056338028 NA NA G 0.02112676056338028 G 0.014084507042253518 G 0.04929577464788732 G 0.014084507042253518 G 0.028169014084507043 G 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9767101043253206e-06 9.672358936857407e-06 3.9767101043253206e-06 9.672358936857407e-06 1 251464 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V484L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.017718404531478882 2.723318776488304 H 0.9173316359519958 0.0024130200035870075 0.08025530725717545 H 0.10700687766075134 0.7797225117683411 0.006691519636660814 0.0005758536863140763 0.0015336530050262807 0.018329871818423268 0.06247304007411001 0.023666679859161373 -63.67716598510742 -34.762779235839844 0.0012278336798772216 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 G 0.035211267605633804 G 0.014084507042253518 G 0.007042253521126761 G 0.02112676056338028 G 0.02112676056338028 T 0.02112676056338028 NA NA G 0.02112676056338028 G 0.014084507042253518 G 0.04929577464788732 G 0.014084507042253518 G 0.028169014084507043 G 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9768101487425164e-06 8.45218267804515e-06 3.9768101487425164e-06 8.45218267804515e-06 1 251458 NA NA NA NA Gtg/Ctg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L485F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.06770795583724976 12.39732671380043 H 0.978029191493988 0.0006948912632651628 0.02127599716186524 H 0.1320968121290207 0.8263159990310669 0.00986993871629238 0.00021715305047109723 0.0004544646653812378 0.002414574846625328 0.02421108074486256 0.004420074634253979 -64.00724029541016 -35.73487091064453 0.0008281864575110376 G 0.012195121951219513 G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.018292682926829267 G 0.0 G 0.012195121951219513 G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.0 T 0.006097560975609756 NA NA G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.006097560975609756 G 0.018292682926829267 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.0 0.0 0.0 1455A>T N486I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA e 0.2642590403556824 38.6875235080719 H 0.9871065616607666 0.00041980738751590247 0.012473620474338531 H 0.10389374196529387 0.8583864569664001 0.01803034357726574 7.135953637771308e-05 0.00029890876612626016 0.0013995678164064884 0.016044452786445618 0.001875171554274857 -68.29302978515625 -33.864513397216804 0.0004906042595393956 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 NA NA G 0.0 G 0.10828025477707008 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.006369426751592357 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.42 0.42 0.0 0.0 0.0 1457A>T N486Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA e 0.2642590403556824 38.6875235080719 H 0.9871065616607666 0.00041980738751590247 0.012473620474338531 H 0.10389374196529387 0.8583864569664001 0.01803034357726574 7.135953637771308e-05 0.00029890876612626016 0.0013995678164064884 0.016044452786445618 0.001875171554274857 -68.29302978515625 -33.864513397216804 0.0004906042595393956 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 NA NA G 0.0 G 0.10828025477707008 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.006369426751592357 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.38 0.0 0.0 0.0 1456A>T Y487= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.09989878535270692 21.348370429873466 H 0.9410146474838256 0.0016651146579533815 0.05732018128037453 H 0.10895342379808426 0.7893984913825989 0.026362495496869087 0.00030241216882132005 0.0009920616867020726 0.006026125978678465 0.05854092910885812 0.009424041956663132 -75.24604034423828 -32.75178909301758 0.0009800740517675877 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0045045045045045045 NA NA G 0.0 G 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 1461C>T Y487F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.09989878535270692 21.348370429873466 H 0.9410146474838256 0.0016651146579533815 0.05732018128037453 H 0.10895342379808426 0.7893984913825989 0.026362495496869087 0.00030241216882132005 0.0009920616867020726 0.006026125978678465 0.05854092910885812 0.009424041956663132 -75.24604034423828 -32.75178909301758 0.0009800740517675877 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0045045045045045045 NA NA G 0.0 G 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.57 0.57 0.0 0.0 0.0 1460A>T Y487S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.09989878535270692 21.348370429873466 H 0.9410146474838256 0.0016651146579533815 0.05732018128037453 H 0.10895342379808426 0.7893984913825989 0.026362495496869087 0.00030241216882132005 0.0009920616867020726 0.006026125978678465 0.05854092910885812 0.009424041956663132 -75.24604034423828 -32.75178909301758 0.0009800740517675877 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 T 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0045045045045045045 NA NA G 0.0 G 0.0045045045045045045 G 0.0 G 0.0 G 0.0 G 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 1460A>C F488= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|23 NA NA NA NA b 0.0372539758682251 7.476872956752777 H 0.7117676734924316 0.0191398561000824 0.2690923511981964 H 0.07142002135515213 0.5961392521858215 0.03132734447717666 0.007469503208994865 0.006551211699843407 0.04194694384932518 0.2063172608613968 0.03882850706577301 -84.65724182128906 -15.351011276245115 0.0021204422228038307 G 0.030456852791878174 T 0.02030456852791878 G 0.02030456852791878 G 0.03553299492385787 T 0.03553299492385787 G 0.015228426395939087 G 0.01015228426395939 G 0.015228426395939087 T 0.030456852791878174 G 0.02030456852791878 NA NA G 0.02030456852791878 G 0.015228426395939087 G 0.03553299492385787 G 0.015228426395939087 G 0.02538071065989848 G 0.02030456852791878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 1464C>T N490D NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3578616678714752 52.39094817638397 C 0.1740044504404068 0.01118773128837347 0.8148078322410583 T 0.019837690517306328 0.17005537450313568 0.012043122202157974 0.007260816171765327 0.005775719415396452 0.11825092136859895 0.4497577548027039 0.2170186936855316 -90.54711151123048 20.88211250305176 0.0016433319542557 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.10828025477707008 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 T 0.1337579617834395 T 0.08280254777070062 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.15286624203821655 NA NA T 0.1592356687898089 T 0.4012738853503185 T 0.10191082802547773 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 S 0.12101910828025478 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 1468A>G N490I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3578616678714752 52.39094817638397 C 0.1740044504404068 0.01118773128837347 0.8148078322410583 T 0.019837690517306328 0.17005537450313568 0.012043122202157974 0.007260816171765327 0.005775719415396452 0.11825092136859895 0.4497577548027039 0.2170186936855316 -90.54711151123048 20.88211250305176 0.0016433319542557 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.10828025477707008 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 T 0.1337579617834395 T 0.08280254777070062 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.15286624203821655 NA NA T 0.1592356687898089 T 0.4012738853503185 T 0.10191082802547773 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 S 0.12101910828025478 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0 1469A>T N490S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3578616678714752 52.39094817638397 C 0.1740044504404068 0.01118773128837347 0.8148078322410583 T 0.019837690517306328 0.17005537450313568 0.012043122202157974 0.007260816171765327 0.005775719415396452 0.11825092136859895 0.4497577548027039 0.2170186936855316 -90.54711151123048 20.88211250305176 0.0016433319542557 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.10828025477707008 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 T 0.1337579617834395 T 0.08280254777070062 T 0.12101910828025478 S 0.1337579617834395 T 0.15286624203821655 NA NA T 0.1592356687898089 T 0.4012738853503185 T 0.10191082802547773 T 0.12738853503184713 T 0.15286624203821655 S 0.12101910828025478 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.6257531443563026e-05 NA NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.6257531443563026e-05 1 143268 NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA S491N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2628427743911743 30.80517315864563 C 0.1023230031132698 0.03146934509277344 0.8662076592445374 C 0.015292399562895296 0.0673699826002121 0.0032557162921875715 0.020676210522651672 0.014384533278644085 0.11890291422605515 0.05010221526026727 0.7100160121917725 -103.22241973876952 127.77151489257812 0.003466326044872403 - 0.2230769230769231 - 0.3076923076923077 - 0.2384615384615385 - 0.2076923076923077 - 0.38461538461538464 - 0.2384615384615385 - 0.4153846153846154 - 0.2384615384615385 - 0.3538461538461539 - 0.3 NA NA - 0.2230769230769231 - 0.2307692307692308 - 0.2692307692307692 - 0.2153846153846154 - 0.3230769230769231 - 0.3769230769230769 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.976780135417357e-06 9.017175514603673e-06 3.976780135417357e-06 9.017175514603673e-06 1 251460 NA NA NA NA aGc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V494M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|24 NA NA NA NA b 0.1897766292095185 29.168667909502982 H 0.8577024936676025 0.00662971381098032 0.13566777110099792 H 0.2257866859436035 0.6009579300880432 0.0066936537623405465 0.0016149808652698994 0.004793772473931313 0.021119385957717896 0.09850647300481796 0.04052717983722687 -70.85477447509766 -32.95098114013672 0.005691160913556814 H 0.20422535211267606 H 0.2112676056338028 H 0.14788732394366194 H 0.20422535211267606 T 0.1619718309859155 H 0.15492957746478872 H 0.1619718309859155 H 0.1619718309859155 H 0.2535211267605634 H 0.19014084507042253 NA NA H 0.16901408450704225 H 0.07042253521126761 H 0.20422535211267606 H 0.19718309859154928 H 0.38028169014084506 H 0.20422535211267606 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 493233 VUS 2 0.00017229073203253736 1.7389239933629035e-05 0.0001471410068916157 8.810667374194086e-06 37 251460 0.0002164470060961321 1.4991924689332943e-05 31 143222 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA H497Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4730126559734345 86.04100212156773 C 0.12825076282024386 0.10976862162351607 0.7619805932044983 C 0.033466074615716934 0.07193592935800552 0.0040536471642553815 0.024686634540557858 0.09094830602407457 0.14202648401260376 0.16203048825263974 0.4708524346351624 -87.49230194091797 65.50569152832031 0.02155778743326664 - 0.5 - 0.39130434782608703 - 0.3532608695652174 - 0.5 - 0.44565217391304346 - 0.39130434782608703 - 0.3532608695652174 - 0.4021739130434783 - 0.3858695652173913 - 0.4076086956521739 NA NA - 0.3043478260869565 - 0.30978260869565216 - 0.2608695652173913 - 0.2989130434782609 - 0.5434782608695652 - 0.3695652173913043 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9768101487425164e-06 1.0869708876225486e-05 3.9768101487425164e-06 1.0869708876225486e-05 1 251458 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K498E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4897407293319702 100.73966802358628 C 0.11036379635334016 0.2485372871160507 0.6410989165306091 C 0.027993950992822647 0.06982390582561493 0.003190950956195593 0.04212798923254013 0.19940394163131714 0.1206650212407112 0.1142379865050316 0.4225562214851379 -91.16490936279295 124.07691955566406 0.03726467117667198 - 0.6195121951219512 - 0.5073170731707317 - 0.6536585365853659 - 0.6243902439024389 - 0.7121951219512195 - 0.6780487804878049 - 0.4585365853658537 - 0.7219512195121951 - 0.6390243902439025 - 0.6682926829268293 NA NA - 0.6341463414634146 - 0.6780487804878049 - 0.7024390243902439 - 0.5121951219512195 - 0.6048780487804878 - 0.6048780487804878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.013506530850922e-05 1.886222376083603e-05 3.976740117650479e-06 8.54462106973751e-06 1 251462 2.0948600649717264e-05 1.6815853709474435e-05 3 143208 Aag/Gag Aag/Gag 0 0 NA NA NA NA NA NA K499* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.6243902439024389 B 0.3902439024390244 E 0.5024390243902439 E 0.6195121951219512 E 0.42439024390243896 E 0.4634146341463415 B 0.4585365853658537 E 0.5365853658536586 - 0.42439024390243896 - 0.3560975609756097 NA NA E 0.4292682926829268 E 0.4097560975609756 B 0.3560975609756097 E 0.4341463414634146 B 0.3463414634146341 B 0.5317073170731708 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.47 0.0 0.0 0.47 0.0 1495A>T G500E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4981186389923096 39.201936888694775 C 0.06354508548974991 0.04698628187179565 0.8894686102867126 C 0.04266328364610672 0.017378313466906548 0.0007090918952599168 0.014220718294382097 0.03563157096505165 0.2039693295955658 0.23102308809757235 0.4544045627117157 81.97930908203125 -172.440185546875 0.04745529964566232 E 0.4047619047619048 - 0.5357142857142857 E 0.3928571428571429 E 0.3928571428571429 E 0.5357142857142857 E 0.5119047619047619 S 0.35714285714285715 E 0.5357142857142857 - 0.42857142857142855 - 0.4166666666666667 NA NA E 0.5119047619047619 E 0.4880952380952381 S 0.3690476190476191 E 0.5476190476190477 - 0.5833333333333334 - 0.35714285714285715 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.067142407649682e-06 2.0724134822550825e-05 3.976780135417357e-06 9.887156283998828e-06 1 251460 6.981289971008664e-06 1.8213563757789027e-05 1 143240 gGg/gAg gGg/gAg 0 0 NA NA NA NA NA NA G500R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4981186389923096 39.201936888694775 C 0.06354508548974991 0.04698628187179565 0.8894686102867126 C 0.04266328364610672 0.017378313466906548 0.0007090918952599168 0.014220718294382097 0.03563157096505165 0.2039693295955658 0.23102308809757235 0.4544045627117157 81.97930908203125 -172.440185546875 0.04745529964566232 E 0.4047619047619048 - 0.5357142857142857 E 0.3928571428571429 E 0.3928571428571429 E 0.5357142857142857 E 0.5119047619047619 S 0.35714285714285715 E 0.5357142857142857 - 0.42857142857142855 - 0.4166666666666667 NA NA E 0.5119047619047619 E 0.4880952380952381 S 0.3690476190476191 E 0.5476190476190477 - 0.5833333333333334 - 0.35714285714285715 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.976680091000162e-06 8.398191139679222e-06 3.976680091000162e-06 8.398191139679222e-06 1 251466 NA NA NA NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D501Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7383105754852295 106.39055392742156 C 0.05321504175662994 0.012942229397594929 0.933842658996582 T 0.05169536918401718 0.010362032800912857 0.00015828535833861682 0.004183977376669645 0.008218604139983654 0.3097647726535797 0.4070830941200256 0.20853380858898168 -74.30184936523438 6.32440710067749 0.05614914745092392 - 0.5153374233128835 - 0.558282208588957 - 0.2576687116564417 - 0.2699386503067485 - 0.50920245398773 - 0.3987730061349693 - 0.4478527607361963 - 0.4233128834355828 B 0.5214723926380368 B 0.4539877300613497 NA NA - 0.3128834355828221 - 0.4601226993865031 - 0.4601226993865031 S 0.3374233128834356 - 0.6134969325153374 - 0.4969325153374233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.76 0.0 0.0 0.76 0.0 1501G>T D502E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6124786734580994 88.25817684531212 C 0.0738532543182373 0.024582840502262115 0.9015639424324036 T 0.04588591307401657 0.01931939460337162 0.000529679877217859 0.005517764948308468 0.015911227092146873 0.2580806314945221 0.4093511998653412 0.2454042136669159 -85.8624267578125 17.56869888305664 0.043878424912691116 S 1.0 T 0.8282208588957055 S 0.5644171779141104 S 0.5398773006134969 S 1.0 S 1.0 S 0.9018404907975459 S 0.9631901840490796 T 0.7668711656441718 T 0.7852760736196319 NA NA S 0.8834355828220859 S 1.0 S 1.0 S 0.7361963190184049 T 0.8957055214723927 T 0.558282208588957 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.5736853636521336e-05 1.8476268757175952e-05 4.772129977936856e-05 9.206357206655923e-06 12 251460 6.980710168136284e-05 1.6019222645648287e-05 10 143252 gaC/gaG gaC/gaG 0 0 NA NA NA NA NA NA D502N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6124786734580994 88.25817684531212 C 0.0738532543182373 0.024582840502262115 0.9015639424324036 T 0.04588591307401657 0.01931939460337162 0.000529679877217859 0.005517764948308468 0.015911227092146873 0.2580806314945221 0.4093511998653412 0.2454042136669159 -85.8624267578125 17.56869888305664 0.043878424912691116 S 1.0 T 0.8282208588957055 S 0.5644171779141104 S 0.5398773006134969 S 1.0 S 1.0 S 0.9018404907975459 S 0.9631901840490796 T 0.7668711656441718 T 0.7852760736196319 NA NA S 0.8834355828220859 S 1.0 S 1.0 S 0.7361963190184049 T 0.8957055214723927 T 0.558282208588957 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 594222 VUS 1 1.266886031068943e-05 1.5988785677800234e-05 3.976900188717991e-06 8.341277989686497e-06 1 251452 2.79298001260031e-05 1.3640540639923385e-05 4 143216 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA F503L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.25277674198150635 50.732292115688324 C 0.10442379862070084 0.17900680005550385 0.7165694236755371 C 0.05222393944859505 0.039018645882606506 0.00230322009883821 0.023818392306566242 0.1483696550130844 0.2755419909954071 0.12615136802196505 0.332572877407074 -97.67794799804688 50.39062118530274 0.025514660403132442 S 0.8883248730964467 T 0.9746192893401016 S 0.005076142131979695 S 0.1218274111675127 S 0.7512690355329951 S 0.8832487309644671 S 0.8375634517766497 S 0.8883248730964467 T 0.9238578680203046 T 0.8934010152284264 NA NA S 0.2538071065989848 S 0.8730964467005076 S 0.8274111675126904 S 0.3147208121827411 T 1.0 T 0.37055837563451777 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.9808997977816026e-06 1.5258675635035834e-05 NA NA NA NA 6.9808997977816026e-06 1.5258675635035834e-05 1 143248 NA ttC/ttG NA 0 NA NA NA NA NA NA V505G NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|18 NA NA NA NA NA b 0.17023134231567386 26.164557313919072 E 0.07856059074401855 0.5615590810775757 0.3598802983760834 E 0.034000132232904434 0.04533449932932854 0.0028058267198503017 0.05852188915014268 0.4897384941577912 0.07680322974920273 0.034718748182058334 0.25807714462280273 -104.06350708007812 127.32747650146484 0.013456984423100948 E 0.3380281690140845 - 0.4084507042253521 E 0.1056338028169014 E 0.19014084507042253 E 0.4084507042253521 E 0.38028169014084506 - 0.323943661971831 E 0.4436619718309859 - 0.4084507042253521 - 0.3591549295774648 NA NA E 0.3732394366197183 E 0.4859154929577465 - 0.4577464788732394 E 0.4577464788732394 - 0.4084507042253521 - 0.3661971830985916 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9769302020431505e-06 8.737532207732743e-06 3.9769302020431505e-06 8.737532207732743e-06 1 251450 NA NA NA NA gTg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y506* NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E 0.2117117117117117 S 0.4099099099099099 E 0.045045045045045036 E 0.036036036036036036 E 0.4324324324324325 E 0.31981981981981983 S 0.5495495495495496 E 0.3063063063063063 S 0.5585585585585585 S 0.4144144144144144 NA NA E 0.2117117117117117 E 0.3468468468468469 S 0.4594594594594595 E 0.22072072072072071 S 0.4459459459459459 S 0.0945945945945946 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.0 0.0 0.41 0.01 1518T>A Y506H NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|18 NA NA NA NA NA e 0.39994943141937256 85.46919349431991 E 0.09350725263357162 0.4982677102088928 0.4082250595092773 E 0.03885665535926819 0.0482739694416523 0.0017222982132807374 0.051881197839975364 0.4449654519557953 0.0789693221449852 0.048177238553762436 0.28715386986732483 -99.38333129882812 119.2259521484375 0.0051036812365055076 E 0.2117117117117117 S 0.4099099099099099 E 0.045045045045045036 E 0.036036036036036036 E 0.4324324324324325 E 0.31981981981981983 S 0.5495495495495496 E 0.3063063063063063 S 0.5585585585585585 S 0.4144144144144144 NA NA E 0.2117117117117117 E 0.3468468468468469 S 0.4594594594594595 E 0.22072072072072071 S 0.4459459459459459 S 0.0945945945945946 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9771598494553464e-06 8.656980473795196e-06 3.9771598494553464e-06 8.656980473795196e-06 1 251436 NA NA NA NA Tat/Cat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D508N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3436132073402405 49.51466317772865 C 0.0855434462428093 0.19185495376586914 0.722601592540741 C 0.018183451145887368 0.0723499208688736 0.001214440679177642 0.056853316724300385 0.1281885802745819 0.10222269594669342 0.04870368540287018 0.572283923625946 -97.30242156982422 125.27379608154295 0.002706027356907725 S 0.0736196319018405 - 0.11042944785276074 - 0.098159509202454 S 0.061349693251533735 - 0.13496932515337426 - 0.1165644171779141 - 0.1840490797546012 - 0.147239263803681 - 0.1901840490797546 - 0.15950920245398773 NA NA - 0.147239263803681 - 0.1840490797546012 - 0.17791411042944785 - 0.1165644171779141 - 0.13496932515337426 - 0.147239263803681 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.5204084394343707e-05 1.7562326175281197e-05 1.9888100723619573e-05 9.573726338642253e-06 5 251406 6.982069862715434e-06 1.4723418919522555e-05 1 143224 Gat/Aat Gat/Aat 0 0 NA NA NA NA NA NA Y509S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.1029539406299591 22.001257112622266 H 0.8573395609855652 0.008719737641513348 0.1339406967163086 H 0.05304508656263352 0.8083920478820801 0.0076147359795868405 0.002300272462889552 0.0047095674090087405 0.020015299320220947 0.06164621189236641 0.042276814579963684 -65.20738983154297 -32.33357620239258 0.0015739789232611654 T 0.11711711711711713 H 0.13513513513513514 H 0.09009009009009007 T 0.11711711711711713 H 0.16666666666666666 H 0.06756756756756757 H 0.06756756756756757 H 0.06756756756756757 H 0.12612612612612611 H 0.1891891891891892 NA NA H 0.08558558558558559 H 0.07657657657657657 H 0.054054054054054064 H 0.08108108108108109 H 0.0945945945945946 H 0.10810810810810813 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 554002 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H510Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.2060514986515045 37.480767604708674 H 0.9203574657440186 0.008118114434182644 0.07152439653873444 H 0.032314658164978034 0.8783551454544067 0.01919444091618061 0.0013614866184070704 0.004647931549698114 0.009102287702262402 0.037161670625209815 0.01786239817738533 -66.00482177734375 -37.17772674560547 0.0012472847010940313 T 0.005434782608695652 H 0.06521739130434782 H 0.07065217391304347 T 0.005434782608695652 H 0.07065217391304347 H 0.07608695652173914 H 0.08152173913043477 H 0.08152173913043477 H 0.10869565217391304 H 0.11413043478260868 NA NA H 0.09239130434782608 H 0.09239130434782608 H 0.07608695652173914 H 0.09782608695652174 H 0.05434782608695652 H 0.11413043478260868 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.977880169259152e-06 8.951497676178654e-06 3.977880169259152e-06 8.951497676178654e-06 1 251390 NA NA NA NA caC/caG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T511A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.1980421245098114 27.468442669510843 H 0.9599902629852296 0.003159115789458156 0.036850616335868835 H 0.015326963737607002 0.9218262434005736 0.031770560890436166 0.0004313684185035527 0.0016250403132289648 0.005035222973674536 0.015270805917680262 0.008713781833648682 -68.035888671875 -39.37986755371094 0.0006877813721075652 H 0.14788732394366194 H 0.19014084507042253 H 0.14084507042253522 H 0.14084507042253522 H 0.23943661971830985 H 0.18309859154929575 H 0.18309859154929575 H 0.19014084507042253 H 0.22535211267605634 H 0.2112676056338028 NA NA H 0.20422535211267606 H 0.2183098591549296 H 0.22535211267605634 H 0.17605633802816897 H 0.19718309859154928 H 0.16901408450704225 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 495786 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T511M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.1980421245098114 27.468442669510843 H 0.9599902629852296 0.003159115789458156 0.036850616335868835 H 0.015326963737607002 0.9218262434005736 0.031770560890436166 0.0004313684185035527 0.0016250403132289648 0.005035222973674536 0.015270805917680262 0.008713781833648682 -68.035888671875 -39.37986755371094 0.0006877813721075652 H 0.14788732394366194 H 0.19014084507042253 H 0.14084507042253522 H 0.14084507042253522 H 0.23943661971830985 H 0.18309859154929575 H 0.18309859154929575 H 0.19014084507042253 H 0.22535211267605634 H 0.2112676056338028 NA NA H 0.20422535211267606 H 0.2183098591549296 H 0.22535211267605634 H 0.17605633802816897 H 0.19718309859154928 H 0.16901408450704225 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 199001 benign 2 0.0014594826997522635 1.7723166090590374e-05 0.0007120919763110577 9.34591340174997e-06 179 251372 0.002770639955997467 1.5058702432867276e-05 397 143288 aCg/aTg aCg/aTg 0 2 NA NA NA NA NA NA H512R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.06811487674713135 12.390096080303195 H 0.9750757813453674 0.003216028679162264 0.021708108484745026 H 0.015078594908118246 0.9476128220558168 0.016850393265485764 0.000600615341681987 0.0015792867634445427 0.0028674255590885878 0.009887284599244595 0.005523666273802519 -66.62985992431639 -39.46963119506836 0.00035603105789050465 H 0.005434782608695652 H 0.02717391304347826 H 0.016304347826086956 H 0.005434782608695652 H 0.016304347826086956 H 0.005434782608695652 H 0.016304347826086956 H 0.0 H 0.03260869565217391 H 0.02717391304347826 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.010869565217391304 H 0.005434782608695652 H 0.043478260869565216 H 0.016304347826086956 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 595544 VUS 1 6.979440058785257e-06 1.322285579936837e-05 NA NA NA NA 6.979440058785257e-06 1.322285579936837e-05 1 143278 NA cAc/cGc NA 0 NA NA NA NA NA NA H512Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.06811487674713135 12.390096080303195 H 0.9750757813453674 0.003216028679162264 0.021708108484745026 H 0.015078594908118246 0.9476128220558168 0.016850393265485764 0.000600615341681987 0.0015792867634445427 0.0028674255590885878 0.009887284599244595 0.005523666273802519 -66.62985992431639 -39.46963119506836 0.00035603105789050465 H 0.005434782608695652 H 0.02717391304347826 H 0.016304347826086956 H 0.005434782608695652 H 0.016304347826086956 H 0.005434782608695652 H 0.016304347826086956 H 0.0 H 0.03260869565217391 H 0.02717391304347826 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.010869565217391304 H 0.005434782608695652 H 0.043478260869565216 H 0.016304347826086956 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.978389941039495e-06 7.701189339171823e-06 3.978389941039495e-06 7.701189339171823e-06 1 251358 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C516F NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|11 NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.020586997270584103 2.8904144167900085 H 0.8972044587135315 0.008439530618488789 0.0943559780716896 H 0.04706194996833801 0.8088534474372864 0.030731502920389175 0.0017370396526530385 0.004308584611862898 0.0128233740106225 0.07706624269485474 0.017417846247553825 -74.07098388671875 -31.201698303222656 0.0006204518722370268 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 T 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9804799598641685e-06 9.108142412999347e-06 3.9804799598641685e-06 9.108142412999347e-06 1 251226 NA NA NA NA tGc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C516W NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|11 NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.020586997270584103 2.8904144167900085 H 0.8972044587135315 0.008439530618488789 0.0943559780716896 H 0.04706194996833801 0.8088534474372864 0.030731502920389175 0.0017370396526530385 0.004308584611862898 0.0128233740106225 0.07706624269485474 0.017417846247553825 -74.07098388671875 -31.201698303222656 0.0006204518722370268 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 T 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 855353 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.72 0.0 0.0 0.72 0.01 1548C>G C516Y NA NA Lumenal|2 NA NA DISULFID|11 NA HELIX|25 NA NA NA NA b 0.020586997270584103 2.8904144167900085 H 0.8972044587135315 0.008439530618488789 0.0943559780716896 H 0.04706194996833801 0.8088534474372864 0.030731502920389175 0.0017370396526530385 0.004308584611862898 0.0128233740106225 0.07706624269485474 0.017417846247553825 -74.07098388671875 -31.201698303222656 0.0006204518722370268 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 T 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 268186 pathogenic 1 1.3958900126453955e-05 1.8450843096559547e-05 NA NA NA NA 1.3958900126453955e-05 1.8450843096559547e-05 2 143278 NA tGc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA V517I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0825851559638977 12.693338471651074 H 0.5316634178161621 0.08664213120937347 0.381694495677948 H 0.04265470802783966 0.4837754964828491 0.041634202003479004 0.04054428264498711 0.0478862039744854 0.06829746067523956 0.1544698029756546 0.12073784321546555 -81.53048706054688 -20.309833526611328 0.0019434437854215505 T 0.11971830985915492 H 0.08450704225352113 T 0.08450704225352113 T 0.1056338028169014 T 0.07042253521126761 T 0.11971830985915492 T 0.08450704225352113 T 0.11971830985915492 H 0.07746478873239436 H 0.04929577464788732 NA NA T 0.06338028169014084 T 0.04225352112676056 T 0.04225352112676056 T 0.056338028169014086 H 0.04225352112676056 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 596971 VUS 1 7.09841890308615e-05 1.7705441913392978e-05 7.564899715362117e-05 8.627407524009185e-06 19 251160 6.280789966695009e-05 1.546125844694417e-05 9 143294 Gta/Ata Gta/Ata 0 0 NA NA NA NA NA NA V517L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0825851559638977 12.693338471651074 H 0.5316634178161621 0.08664213120937347 0.381694495677948 H 0.04265470802783966 0.4837754964828491 0.041634202003479004 0.04054428264498711 0.0478862039744854 0.06829746067523956 0.1544698029756546 0.12073784321546555 -81.53048706054688 -20.309833526611328 0.0019434437854215505 T 0.11971830985915492 H 0.08450704225352113 T 0.08450704225352113 T 0.1056338028169014 T 0.07042253521126761 T 0.11971830985915492 T 0.08450704225352113 T 0.11971830985915492 H 0.07746478873239436 H 0.04929577464788732 NA NA T 0.06338028169014084 T 0.04225352112676056 T 0.04225352112676056 T 0.056338028169014086 H 0.04225352112676056 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.070302741568403e-06 1.9089343835012467e-05 3.981529971497366e-06 7.753303239950487e-06 1 251160 6.978660167078488e-06 1.7443891106077842e-05 1 143294 Gta/Tta Gta/Cta 0 0 NA NA NA NA NA NA R518Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.39266878366470337 89.92115145921707 C 0.4461340010166168 0.02946237474679947 0.5244036912918091 H 0.029746612533926964 0.4483988583087921 0.02005307748913765 0.009917452000081541 0.017150722444057458 0.13949613273143768 0.19843444228172305 0.13680274784564972 -86.59549713134766 -13.20181655883789 0.002291825367137789 T 0.3225806451612903 H 0.3629032258064516 T 0.9112903225806452 T 0.3185483870967742 T 0.3387096774193548 T 0.6612903225806451 T 0.8306451612903226 T 0.7258064516129032 H 0.4516129032258064 H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5766129032258065 T 0.5604838709677419 T 0.4959677419354839 T 0.5524193548387096 H 0.28225806451612906 H 0.35080645161290325 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 132890 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R518W NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.39266878366470337 89.92115145921707 C 0.4461340010166168 0.02946237474679947 0.5244036912918091 H 0.029746612533926964 0.4483988583087921 0.02005307748913765 0.009917452000081541 0.017150722444057458 0.13949613273143768 0.19843444228172305 0.13680274784564972 -86.59549713134766 -13.20181655883789 0.002291825367137789 T 0.3225806451612903 H 0.3629032258064516 T 0.9112903225806452 T 0.3185483870967742 T 0.3387096774193548 T 0.6612903225806451 T 0.8306451612903226 T 0.7258064516129032 H 0.4516129032258064 H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5766129032258065 T 0.5604838709677419 T 0.4959677419354839 T 0.5524193548387096 H 0.28225806451612906 H 0.35080645161290325 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 550874 pathogenic 2 3.186770118190907e-05 8.779617419702064e-06 3.186770118190907e-05 8.779617419702064e-06 8 251038 NA NA NA NA Cgg/Tgg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A519S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.15557676553726196 17.144559562206272 C 0.017552021890878674 0.02035352773964405 0.9620944261550904 C 0.0038871623110026117 0.008522463962435722 0.000316291960189119 0.009316381998360157 0.012053918093442915 0.3509836196899414 0.024040725082159042 0.5908793807029724 -98.4673080444336 116.2957992553711 0.003184296656399965 - 0.19811320754716985 - 0.3490566037735849 - 0.3113207547169811 - 0.19811320754716985 - 0.3679245283018868 - 0.0 - 0.3584905660377358 - 0.0 - 0.3679245283018868 - 0.0660377358490566 NA NA - 0.3207547169811321 - 0.3113207547169811 S 0.3584905660377358 - 0.3018867924528302 - 0.4245283018867925 - 0.33962264150943394 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.986800038546789e-06 9.906043126871242e-06 3.986800038546789e-06 9.906043126871242e-06 1 250828 NA NA NA NA Gct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P520S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.20597487688064567 29.22783502936363 C 0.3495701551437378 0.021899031475186348 0.6285308003425598 C 0.2855944633483887 0.08860696852207184 0.0008709180983714758 0.007930165156722069 0.014267155900597572 0.048055220395326614 0.20840242505073547 0.346272736787796 -65.71919250488281 -6.768989562988281 0.0036354153417050843 T 0.11029411764705882 T 0.16911764705882354 T 0.1176470588235294 T 0.11029411764705882 S 0.19117647058823528 T 0.036764705882352935 T 0.11029411764705882 T 0.036764705882352935 T 0.16176470588235295 T 0.02205882352941177 NA NA T 0.13970588235294118 T 0.13970588235294118 T 0.15441176470588236 T 0.14705882352941174 T 0.14705882352941174 T 0.16911764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.195660024677636e-05 9.585516304986908e-06 1.195660024677636e-05 9.585516304986908e-06 3 250908 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A521S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4139483273029328 45.61710566878319 C 0.31143876910209656 0.030276916921138763 0.6582843065261841 T 0.290800005197525 0.06768696010112762 0.0004498152702581138 0.006811669562011957 0.014535927213728428 0.09260936081409454 0.3964472413063049 0.1306590437889099 -76.15628814697266 -14.313175201416016 0.008777560666203499 T 0.5566037735849056 T 0.3867924528301887 T 0.6226415094339622 T 0.5471698113207547 S 0.2547169811320755 T 0.009433962264150943 T 0.3679245283018868 T 0.009433962264150943 T 0.4528301886792453 T 0.3490566037735849 NA NA T 0.5566037735849056 T 0.5754716981132075 T 0.33962264150943394 T 0.3490566037735849 T 0.3679245283018868 T 0.5094339622641509 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 500953 conflict 1 0.00032971803534450787 1.9026064646137954e-05 0.00017133899382315576 8.242770664417533e-06 43 250964 0.0006070670206099749 1.7147823992939693e-05 87 143312 Gcc/Tcc Gcc/Tcc 0 0 NA NA NA NA NA NA A521T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4139483273029328 45.61710566878319 C 0.31143876910209656 0.030276916921138763 0.6582843065261841 T 0.290800005197525 0.06768696010112762 0.0004498152702581138 0.006811669562011957 0.014535927213728428 0.09260936081409454 0.3964472413063049 0.1306590437889099 -76.15628814697266 -14.313175201416016 0.008777560666203499 T 0.5566037735849056 T 0.3867924528301887 T 0.6226415094339622 T 0.5471698113207547 S 0.2547169811320755 T 0.009433962264150943 T 0.3679245283018868 T 0.009433962264150943 T 0.4528301886792453 T 0.3490566037735849 NA NA T 0.5566037735849056 T 0.5754716981132075 T 0.33962264150943394 T 0.3490566037735849 T 0.3679245283018868 T 0.5094339622641509 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 597913 VUS 1 1.1953899957006796e-05 8.035817177201461e-06 1.1953899957006796e-05 8.035817177201461e-06 3 250964 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S522T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4958795309066773 58.11708102226258 C 0.2729066908359528 0.04286298900842666 0.6842303276062012 G 0.2714616656303406 0.07192215323448181 0.00045868451707065105 0.012672086246311665 0.023177610710263245 0.11046610027551652 0.2582839727401733 0.2515577077865601 -97.25819396972656 20.438486099243164 0.010270549915730951 - 0.17692307692307693 - 0.17692307692307693 - 0.16153846153846155 - 0.17692307692307693 - 0.3 - 0.038461538461538464 - 0.17692307692307693 - 0.038461538461538464 - 0.13846153846153847 - 0.08461538461538462 NA NA - 0.19230769230769232 - 0.16153846153846155 - 0.16153846153846155 - 0.2076923076923077 - 0.19230769230769232 - 0.1 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.967300007294398e-06 8.99685979193997e-06 7.967300007294398e-06 8.99685979193997e-06 2 251026 NA NA NA NA Tct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D525E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4840749800205231 69.75520462095737 H 0.5939831137657166 0.0019670710898935795 0.404049813747406 H 0.10580702126026154 0.484053760766983 0.0023351656273007393 0.0010042336070910096 0.0011853810865432026 0.060656491667032235 0.16102884709835052 0.1839291155338288 -64.74907684326172 -21.13834381103516 0.01620374619960785 - 0.024539877300613498 - 0.018404907975460124 - 0.018404907975460124 - 0.024539877300613498 - 0.030674846625766868 - 0.018404907975460124 - 0.018404907975460124 - 0.006134969325153374 - 0.012269938650306749 - 0.0 NA NA - 0.0 B 0.006134969325153374 - 0.006134969325153374 - 0.030674846625766868 - 0.07975460122699386 - 0.006134969325153374 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.981529971497366e-06 8.907523163074209e-06 3.981529971497366e-06 8.907523163074209e-06 1 251160 NA NA NA NA gaT/gaA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D525V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4840749800205231 69.75520462095737 H 0.5939831137657166 0.0019670710898935795 0.404049813747406 H 0.10580702126026154 0.484053760766983 0.0023351656273007393 0.0010042336070910096 0.0011853810865432026 0.060656491667032235 0.16102884709835052 0.1839291155338288 -64.74907684326172 -21.13834381103516 0.01620374619960785 - 0.024539877300613498 - 0.018404907975460124 - 0.018404907975460124 - 0.024539877300613498 - 0.030674846625766868 - 0.018404907975460124 - 0.018404907975460124 - 0.006134969325153374 - 0.012269938650306749 - 0.0 NA NA - 0.0 B 0.006134969325153374 - 0.006134969325153374 - 0.030674846625766868 - 0.07975460122699386 - 0.006134969325153374 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.981650024798e-06 9.530551754678532e-06 3.981650024798e-06 9.530551754678532e-06 1 251152 NA NA NA NA gAt/gTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T526A NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.5965591669082642 82.74275645017624 H 0.6718462705612183 0.006122511811554432 0.3220312297344208 H 0.15446922183036804 0.4977631866931915 0.003568688407540321 0.0020605470053851604 0.004560523200780153 0.06306304037570952 0.171901136636734 0.10261362046003343 -74.42764282226562 -26.700103759765625 0.017463762313127518 S 0.4929577464788733 - 0.23943661971830985 S 0.8028169014084507 S 0.471830985915493 S 0.323943661971831 S 0.7746478873239436 S 0.7605633802816901 S 0.8380281690140845 - 0.19718309859154928 - 0.4436619718309859 NA NA S 0.7746478873239436 T 0.7323943661971831 S 0.7042253521126759 S 0.8380281690140845 - 0.2746478873239437 - 0.23943661971830985 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.7871099518961273e-05 8.997666707027478e-06 2.7871099518961273e-05 8.997666707027478e-06 7 251156 NA NA NA NA Aca/Gca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T526R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.5965591669082642 82.74275645017624 H 0.6718462705612183 0.006122511811554432 0.3220312297344208 H 0.15446922183036804 0.4977631866931915 0.003568688407540321 0.0020605470053851604 0.004560523200780153 0.06306304037570952 0.171901136636734 0.10261362046003343 -74.42764282226562 -26.700103759765625 0.017463762313127518 S 0.4929577464788733 - 0.23943661971830985 S 0.8028169014084507 S 0.471830985915493 S 0.323943661971831 S 0.7746478873239436 S 0.7605633802816901 S 0.8380281690140845 - 0.19718309859154928 - 0.4436619718309859 NA NA S 0.7746478873239436 T 0.7323943661971831 S 0.7042253521126759 S 0.8380281690140845 - 0.2746478873239437 - 0.23943661971830985 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.976999884500401e-06 1.551761440312141e-05 NA NA NA NA 6.976999884500401e-06 1.551761440312141e-05 1 143328 NA aCa/aGa NA 0 NA NA NA NA NA NA T526S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.5965591669082642 82.74275645017624 H 0.6718462705612183 0.006122511811554432 0.3220312297344208 H 0.15446922183036804 0.4977631866931915 0.003568688407540321 0.0020605470053851604 0.004560523200780153 0.06306304037570952 0.171901136636734 0.10261362046003343 -74.42764282226562 -26.700103759765625 0.017463762313127518 S 0.4929577464788733 - 0.23943661971830985 S 0.8028169014084507 S 0.471830985915493 S 0.323943661971831 S 0.7746478873239436 S 0.7605633802816901 S 0.8380281690140845 - 0.19718309859154928 - 0.4436619718309859 NA NA S 0.7746478873239436 T 0.7323943661971831 S 0.7042253521126759 S 0.8380281690140845 - 0.2746478873239437 - 0.23943661971830985 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.7745665663561616e-05 1.7024265992729228e-05 2.3889500880613926e-05 7.647909649618912e-06 6 251156 6.978069905017038e-06 1.5209704487019556e-05 1 143306 Aca/Tca Aca/Tca 0 0 NA NA NA NA NA NA S527G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.3055371642112732 35.80895564556122 H 0.6806505918502808 0.013791782781481745 0.3055576682090759 H 0.14623960852622986 0.5019199848175049 0.006627134978771211 0.007073482498526573 0.008938394486904144 0.07090738415718079 0.11373329162597655 0.14456069469451904 -75.06631469726562 -30.11755561828613 0.015813997015357018 S 0.2076923076923077 S 0.3461538461538461 S 0.2230769230769231 S 0.2 S 0.3076923076923077 S 0.17692307692307693 S 0.4 S 0.15384615384615385 S 0.3384615384615385 S 0.476923076923077 NA NA S 0.25384615384615383 T 0.3923076923076923 S 0.3230769230769231 S 0.26153846153846155 S 0.5384615384615384 S 0.3 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 594293 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S527R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.3055371642112732 35.80895564556122 H 0.6806505918502808 0.013791782781481745 0.3055576682090759 H 0.14623960852622986 0.5019199848175049 0.006627134978771211 0.007073482498526573 0.008938394486904144 0.07090738415718079 0.11373329162597655 0.14456069469451904 -75.06631469726562 -30.11755561828613 0.015813997015357018 S 0.2076923076923077 S 0.3461538461538461 S 0.2230769230769231 S 0.2 S 0.3076923076923077 S 0.17692307692307693 S 0.4 S 0.15384615384615385 S 0.3384615384615385 S 0.476923076923077 NA NA S 0.25384615384615383 T 0.3923076923076923 S 0.3230769230769231 S 0.26153846153846155 S 0.5384615384615384 S 0.3 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.78811604534758e-05 1.6525258765927534e-05 3.582749923225492e-05 9.662946575810996e-06 9 251204 1.3953999769000802e-05 1.3405657042975833e-05 2 143328 agT/agA agT/agA 0 0 NA NA NA NA NA NA H530R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|6 NA NA NA e 0.5923592448234558 107.75014663338665 C 0.3370089530944824 0.02049881033599377 0.6424921751022339 T 0.12103099375963212 0.15895062685012815 0.003768832189962268 0.004797517787665129 0.00834157969802618 0.08117006719112396 0.5498821139335632 0.07205826044082643 -91.88297271728516 -2.0240392684936523 0.006374522112309933 - 0.2989130434782609 - 0.6521739130434783 - 0.6521739130434783 - 0.29347826086956524 - 0.8532608695652174 - 0.6086956521739131 - 0.4565217391304348 - 0.625 - 0.6902173913043478 - 0.6902173913043478 NA NA - 0.7119565217391305 T 0.625 T 0.5706521739130435 - 0.6739130434782609 - 0.625 - 0.6086956521739131 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.98108022636734e-06 8.518009260390893e-06 3.98108022636734e-06 8.518009260390893e-06 1 251188 NA NA NA NA cAt/cGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D531E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1656034290790558 23.86345413029193 C 0.009322942234575748 0.02766327373683453 0.963013768196106 C 0.0019630093593150373 0.0047521935775876045 0.00015815587539691478 0.010732545517385006 0.01645800843834877 0.4737359881401062 0.013309207744896412 0.4788908660411834 -86.34054565429688 127.5450439453125 0.006330376956611872 - 0.20245398773006132 - 0.1840490797546012 - 0.12883435582822084 - 0.20245398773006132 - 0.10429447852760736 - 0.10429447852760736 - 0.03680981595092025 - 0.11042944785276074 - 0.2085889570552147 - 0.1411042944785276 NA NA - 0.12269938650306747 B 0.07975460122699386 - 0.098159509202454 - 0.12269938650306747 - 0.3006134969325153 - 0.3128834355828221 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.981269856012658e-06 9.976484621799724e-06 3.981269856012658e-06 9.976484621799724e-06 1 251176 NA NA NA NA gaC/gaA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L534= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.08476686477661133 15.520812940597533 H 0.5500792264938354 0.13196979463100433 0.31795096397399897 G 0.2802387773990631 0.27623629570007324 0.008893563412129879 0.0638657733798027 0.05614402890205383 0.07004844397306442 0.16191555559635162 0.08265751600265503 -85.59330749511719 -7.257678985595702 0.004072754178196192 S 0.09146341463414634 S 0.09146341463414634 S 0.23170731707317074 S 0.08536585365853659 S 0.07317073170731707 S 0.15853658536585366 S 0.042682926829268296 S 0.15853658536585366 S 0.13414634146341464 S 0.17682926829268292 NA NA S 0.21341463414634146 S 0.22560975609756095 S 0.06707317073170732 S 0.12195121951219512 S 0.09146341463414634 S 0.11585365853658534 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.75 0.75 0.28 0.08 0.0 1602G>A L534M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.08476686477661133 15.520812940597533 H 0.5500792264938354 0.13196979463100433 0.31795096397399897 G 0.2802387773990631 0.27623629570007324 0.008893563412129879 0.0638657733798027 0.05614402890205383 0.07004844397306442 0.16191555559635162 0.08265751600265503 -85.59330749511719 -7.257678985595702 0.004072754178196192 S 0.09146341463414634 S 0.09146341463414634 S 0.23170731707317074 S 0.08536585365853659 S 0.07317073170731707 S 0.15853658536585366 S 0.042682926829268296 S 0.15853658536585366 S 0.13414634146341464 S 0.17682926829268292 NA NA S 0.21341463414634146 S 0.22560975609756095 S 0.06707317073170732 S 0.12195121951219512 S 0.09146341463414634 S 0.11585365853658534 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.3956700058770364e-05 1.7211666736702034e-05 NA NA NA NA 1.3956700058770364e-05 1.7211666736702034e-05 2 143300 NA Ctg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA G535C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.17008358240127566 13.385577934980393 C 0.4571683406829834 0.05713726952672005 0.4856944680213928 G 0.2540049254894257 0.2318415939807892 0.005243175197392702 0.022587884217500687 0.033225670456886285 0.07182703912258148 0.201042041182518 0.18022769689559934 -72.39167785644531 -46.4398193359375 0.008377457968890667 - 0.047619047619047616 - 0.10714285714285714 - 0.047619047619047616 - 0.03571428571428571 - 0.09523809523809523 - 0.03571428571428571 - 0.16666666666666666 - 0.047619047619047616 - 0.11904761904761905 - 0.11904761904761905 NA NA - 0.07142857142857142 - 0.3928571428571429 - 0.13095238095238096 - 0.0 - 0.09523809523809523 - 0.10714285714285714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.4533016348952453e-05 NA NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.4533016348952453e-05 1 143300 NA Ggt/Tgt NA 0 NA NA NA NA NA NA T536K NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|19 NA NA NA NA NA e 0.2887536585330963 40.05013243854046 C 0.4074052572250366 0.030358107760548588 0.5622366666793823 T 0.23094670474529266 0.15053939819335938 0.002728173742070794 0.007088772486895324 0.014327848330140112 0.08277489244937898 0.4395895898342133 0.07200466096401215 -76.9172134399414 -22.172691345214844 0.008278990164399147 T 0.23943661971830985 T 0.2535211267605634 T 0.2746478873239437 T 0.2183098591549296 T 0.2676056338028169 T 0.2535211267605634 S 0.16901408450704225 T 0.2535211267605634 T 0.2676056338028169 T 0.20422535211267606 NA NA T 0.2746478873239437 S 0.8661971830985915 S 0.14084507042253522 S 0.2605633802816901 S 0.22535211267605634 T 0.24647887323943665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.54 0.0 0.0 0.54 0.3 1607C>A T536M NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|19 NA NA NA NA NA e 0.2887536585330963 40.05013243854046 C 0.4074052572250366 0.030358107760548588 0.5622366666793823 T 0.23094670474529266 0.15053939819335938 0.002728173742070794 0.007088772486895324 0.014327848330140112 0.08277489244937898 0.4395895898342133 0.07200466096401215 -76.9172134399414 -22.172691345214844 0.008278990164399147 T 0.23943661971830985 T 0.2535211267605634 T 0.2746478873239437 T 0.2183098591549296 T 0.2676056338028169 T 0.2535211267605634 S 0.16901408450704225 T 0.2535211267605634 T 0.2676056338028169 T 0.20422535211267606 NA NA T 0.2746478873239437 S 0.8661971830985915 S 0.14084507042253522 S 0.2605633802816901 S 0.22535211267605634 T 0.24647887323943665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.8024942471266354e-05 1.9581235344283803e-05 1.9904000509995967e-05 9.265724415211176e-06 5 251206 6.979730096645653e-05 1.7250250104551777e-05 10 143272 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA F537S NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|19 NA NA NA NA NA b 0.21257007122039795 42.662813293933866 C 0.3700409531593323 0.017314506694674492 0.6126445531845093 T 0.17591938376426694 0.1286030113697052 0.0035904299002140756 0.007550684269517659 0.006990474183112383 0.09262241423130037 0.5090339183807373 0.07568968087434769 -96.05269622802734 3.6092004776000977 0.01116986945271492 T 0.07106598984771574 T 0.05076142131979696 T 0.06091370558375635 T 0.07106598984771574 T 0.08629441624365483 T 0.030456852791878174 S 0.03553299492385787 T 0.02538071065989848 T 0.07106598984771574 T 0.06598984771573604 NA NA T 0.08629441624365483 S 0.20812182741116755 S 0.015228426395939087 S 0.015228426395939087 S 0.07106598984771574 T 0.07106598984771574 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 813913 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G539R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13199320435523987 10.38786518275738 C 0.007165694143623114 0.149440199136734 0.8433941006660461 C 0.002771642291918397 0.00175329705234617 0.00029378177714534104 0.03564997389912605 0.103404201567173 0.4087865054607392 0.02263279817998409 0.42470782995224 -121.21118927001952 179.1887969970703 0.0043078805319964894 S 0.13095238095238096 S 0.08333333333333333 S 0.14285714285714285 S 0.13095238095238096 S 0.047619047619047616 S 0.0 - 0.11904761904761905 S 0.0 S 0.15476190476190474 S 0.13095238095238096 NA NA S 0.16666666666666666 - 0.3809523809523809 - 0.10714285714285714 S 0.0 S 0.07142857142857142 S 0.10714285714285714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.0 0.0 0.0 0.2 1615G>A P540L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2340840697288513 33.216529494524 C 0.003593579865992069 0.20660363137722013 0.7898027300834656 C 0.0011876184726133945 0.0018236174946650863 4.705838000518271e-05 0.11442486196756366 0.14023126661777496 0.12450141459703445 0.024366669356822968 0.5934175252914429 -72.43359375 142.9469757080078 0.003122448921203613 - 0.3088235294117647 - 0.13970588235294118 - 0.29411764705882354 - 0.3014705882352941 - 0.11029411764705882 - 0.09558823529411764 - 0.10294117647058824 - 0.09558823529411764 - 0.3088235294117647 - 0.35294117647058826 NA NA - 0.3308823529411765 - 0.3014705882352941 S 0.09558823529411764 - 0.18382352941176472 - 0.14705882352941174 - 0.22058823529411764 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.96013955550734e-06 8.066091272729069e-06 7.96013955550734e-06 8.066091272729069e-06 2 251252 NA NA NA NA cCa/cTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P540S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2340840697288513 33.216529494524 C 0.003593579865992069 0.20660363137722013 0.7898027300834656 C 0.0011876184726133945 0.0018236174946650863 4.705838000518271e-05 0.11442486196756366 0.14023126661777496 0.12450141459703445 0.024366669356822968 0.5934175252914429 -72.43359375 142.9469757080078 0.003122448921203613 - 0.3088235294117647 - 0.13970588235294118 - 0.29411764705882354 - 0.3014705882352941 - 0.11029411764705882 - 0.09558823529411764 - 0.10294117647058824 - 0.09558823529411764 - 0.3088235294117647 - 0.35294117647058826 NA NA - 0.3308823529411765 - 0.3014705882352941 S 0.09558823529411764 - 0.18382352941176472 - 0.14705882352941174 - 0.22058823529411764 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 289032 VUS 1 1.5209720997994187e-05 1.9752680232276983e-05 1.990109922189731e-05 9.035403141252549e-06 5 251242 6.981189926591469e-06 1.7565018258847026e-05 1 143242 Cca/Tca Cca/Tca 0 0 NA NA NA NA NA NA P543L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|26 NA NA NA NA b 0.0698384940624237 9.910082307457923 H 0.7392070293426514 0.02780924364924431 0.23298369348049164 H 0.30481916666030884 0.4089325368404389 0.004541913978755474 0.005581215023994446 0.023736638948321342 0.043254371732473366 0.12486131489276885 0.08427290618419647 -62.15487289428711 -26.44004249572754 0.0004721158475149423 G 0.05147058823529412 H 0.02205882352941177 H 0.007352941176470587 G 0.05147058823529412 S 0.04411764705882353 H 0.014705882352941175 G 0.02205882352941177 H 0.014705882352941175 T 0.014705882352941175 G 0.029411764705882356 NA NA G 0.014705882352941175 H 0.04411764705882353 T 0.029411764705882356 G 0.007352941176470587 G 0.014705882352941175 H 0.014705882352941175 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 181455 pathogenic 2 1.2675089989072573e-05 1.7447323012512423e-05 1.5922400052659217e-05 8.900039631321321e-06 4 251218 6.980510079301894e-06 1.5006611038600809e-05 1 143256 cCg/cTg cCg/cTg 0 0 NA NA NA NA NA NA V546G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|26 NA NA NA NA b 0.04224449396133423 6.49297872185707 H 0.6942085027694702 0.17715774476528168 0.1286337524652481 H 0.15198084712028506 0.5032039880752563 0.02552406676113605 0.01180949341505766 0.15284177660942078 0.03463659062981605 0.07294256240129471 0.04706055298447609 -89.27996063232422 -16.894330978393555 0.000992406508885324 T 0.0 H 0.0 H 0.0 T 0.0 T 0.0 H 0.0 T 0.0 H 0.0 S 0.0 S 0.0 NA NA T 0.0 H 0.0 T 0.0 T 0.0 S 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.0 0.0 0.04 0.21 1637T>G V546M NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|26 NA NA NA NA b 0.04224449396133423 6.49297872185707 H 0.6942085027694702 0.17715774476528168 0.1286337524652481 H 0.15198084712028506 0.5032039880752563 0.02552406676113605 0.01180949341505766 0.15284177660942078 0.03463659062981605 0.07294256240129471 0.04706055298447609 -89.27996063232422 -16.894330978393555 0.000992406508885324 T 0.0 H 0.0 H 0.0 T 0.0 T 0.0 H 0.0 T 0.0 H 0.0 S 0.0 S 0.0 NA NA T 0.0 H 0.0 T 0.0 T 0.0 S 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.98006977775367e-06 8.774796879438382e-06 3.98006977775367e-06 8.774796879438382e-06 1 251252 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G549D NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|20 NA NA NA NA NA b 0.1577165424823761 12.412291893363 C 0.016491562128067017 0.09067294746637344 0.8928354978561401 C 0.014103170484304428 0.004765911493450403 0.0009249720023944976 0.02240098267793656 0.07091185450553894 0.19535763561725614 0.2333854287862777 0.4581501483917236 94.97875213623048 38.58302688598633 0.0032630916684865947 S 0.5714285714285714 S 0.3809523809523809 S 0.7142857142857143 S 0.5357142857142857 S 0.3690476190476191 S 0.6666666666666666 S 0.32142857142857145 S 0.6904761904761905 S 0.21428571428571427 S 0.2023809523809524 NA NA S 0.7023809523809523 S 0.5714285714285714 S 0.2619047619047619 S 0.6785714285714286 S 0.30952380952380953 S 0.2619047619047619 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.95995038060937e-06 9.324785938527428e-06 7.95995038060937e-06 9.324785938527428e-06 2 251258 NA NA NA NA gGc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y550C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.11859887838363647 25.34458031058311 C 0.010886500589549541 0.2745087444782257 0.7146047353744507 C 0.007419915869832039 0.002652579918503761 0.0003054036933463067 0.12773263454437256 0.16904686391353607 0.11652835458517075 0.04046550393104553 0.5358486771583557 -104.05524444580078 137.05197143554688 0.003321226453408599 - 0.16666666666666666 - 0.0990990990990991 - 0.20270270270270271 - 0.16666666666666666 - 0.045045045045045036 - 0.1981981981981982 - 0.036036036036036036 - 0.14864864864864866 - 0.04954954954954955 - 0.07207207207207207 NA NA - 0.25225225225225223 - 0.1891891891891892 - 0.08108108108108109 - 0.2702702702702703 - 0.08558558558558559 S 0.07657657657657657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.0686833210018925e-06 1.8015866858656423e-05 3.979660050390521e-06 8.427744035123269e-06 1 251278 6.978269993851428e-06 1.5923083531379188e-05 1 143302 tAt/tGt tAt/tGt 0 0 NA NA NA NA NA NA D552H NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.584067702293396 84.16415590047836 C 0.14788372814655304 0.014417311176657675 0.8376989960670471 T 0.0920335128903389 0.03863722085952759 0.0015480871079489589 0.005968615412712097 0.007878024131059647 0.2828427255153656 0.4073667526245117 0.16372503340244293 -55.12127685546875 11.327205657958984 0.003964948933571577 T 0.8834355828220859 S 0.8282208588957055 T 0.8036809815950919 T 0.8957055214723927 S 0.8036809815950919 T 0.5398773006134969 T 0.7852760736196319 T 0.5398773006134969 S 0.7914110429447853 S 0.8098159509202454 NA NA T 0.7423312883435583 T 0.8527607361963192 T 0.7852760736196319 T 0.8282208588957055 T 0.7668711656441718 S 0.7484662576687117 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.03 0.27 1654G>C D552N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.584067702293396 84.16415590047836 C 0.14788372814655304 0.014417311176657675 0.8376989960670471 T 0.0920335128903389 0.03863722085952759 0.0015480871079489589 0.005968615412712097 0.007878024131059647 0.2828427255153656 0.4073667526245117 0.16372503340244293 -55.12127685546875 11.327205657958984 0.003964948933571577 T 0.8834355828220859 S 0.8282208588957055 T 0.8036809815950919 T 0.8957055214723927 S 0.8036809815950919 T 0.5398773006134969 T 0.7852760736196319 T 0.5398773006134969 S 0.7914110429447853 S 0.8098159509202454 NA NA T 0.7423312883435583 T 0.8527607361963192 T 0.7852760736196319 T 0.8282208588957055 T 0.7668711656441718 S 0.7484662576687117 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.43 0.0 0.0 0.01 0.43 1654G>A D552Y NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.584067702293396 84.16415590047836 C 0.14788372814655304 0.014417311176657675 0.8376989960670471 T 0.0920335128903389 0.03863722085952759 0.0015480871079489589 0.005968615412712097 0.007878024131059647 0.2828427255153656 0.4073667526245117 0.16372503340244293 -55.12127685546875 11.327205657958984 0.003964948933571577 T 0.8834355828220859 S 0.8282208588957055 T 0.8036809815950919 T 0.8957055214723927 S 0.8036809815950919 T 0.5398773006134969 T 0.7852760736196319 T 0.5398773006134969 S 0.7914110429447853 S 0.8098159509202454 NA NA T 0.7423312883435583 T 0.8527607361963192 T 0.7852760736196319 T 0.8282208588957055 T 0.7668711656441718 S 0.7484662576687117 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.0 0.0 0.01 0.4 1654G>T Q553R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6175360679626465 110.29194173812866 C 0.2993723750114441 0.02592795342206955 0.674699604511261 T 0.16469848155975342 0.09024719893932344 0.001726843067444861 0.007373005151748656 0.01709851436316967 0.2682819664478302 0.30399513244628906 0.14657895267009735 -79.99617004394531 -14.350241661071776 0.0031057291198521852 T 0.5959595959595959 S 0.5858585858585859 T 0.6919191919191919 T 0.5909090909090909 S 0.6919191919191919 T 0.494949494949495 T 0.6414141414141414 T 0.3888888888888889 S 0.6818181818181818 S 0.42424242424242425 NA NA T 0.5353535353535354 T 0.6262626262626263 T 0.6010101010101011 T 0.6212121212121212 T 0.5404040404040404 S 0.6616161616161617 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.980999842198799e-06 1.5781933917148633e-05 NA NA NA NA 6.980999842198799e-06 1.5781933917148633e-05 1 143246 NA cAa/cGa NA 0 NA NA NA NA NA NA N554K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.40343421697616577 59.06276936531067 C 0.22340331971645355 0.051843706518411636 0.7247529625892639 C 0.13402584195137024 0.08215457946062088 0.0007337504648603499 0.03859536349773407 0.029517145827412605 0.10783205926418304 0.22284471988677976 0.3842964768409729 -89.6376724243164 45.15673446655274 0.0021803260315209627 - 0.3821656050955414 - 0.4203821656050956 - 0.4267515923566879 - 0.3885350318471338 - 0.3184713375796178 - 0.43312101910828027 - 0.3630573248407643 - 0.4203821656050956 - 0.43312101910828027 - 0.4140127388535032 NA NA B 0.4140127388535032 - 0.3885350318471338 B 0.4203821656050956 B 0.4140127388535032 B 0.4140127388535032 - 0.4649681528662421 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.9909999537048858e-05 9.780105164785828e-06 1.9909999537048858e-05 9.780105164785828e-06 5 251130 NA NA NA NA aaC/aaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N554S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.40343421697616577 59.06276936531067 C 0.22340331971645355 0.051843706518411636 0.7247529625892639 C 0.13402584195137024 0.08215457946062088 0.0007337504648603499 0.03859536349773407 0.029517145827412605 0.10783205926418304 0.22284471988677976 0.3842964768409729 -89.6376724243164 45.15673446655274 0.0021803260315209627 - 0.3821656050955414 - 0.4203821656050956 - 0.4267515923566879 - 0.3885350318471338 - 0.3184713375796178 - 0.43312101910828027 - 0.3630573248407643 - 0.4203821656050956 - 0.43312101910828027 - 0.4140127388535032 NA NA B 0.4140127388535032 - 0.3885350318471338 B 0.4203821656050956 B 0.4140127388535032 B 0.4140127388535032 - 0.4649681528662421 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.982349880971015e-06 8.749501411865526e-06 3.982349880971015e-06 8.749501411865526e-06 1 251108 NA NA NA NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A558S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.025874495506286614 2.8513694047927856 C 0.0032615517266094685 0.2714962661266327 0.7252421975135803 C 0.0011573529336601494 0.0008553715306334198 2.261213921883609e-05 0.014360748231410982 0.23700672388076785 0.05704667791724205 0.004937686026096344 0.6846128702163696 -87.82865142822266 144.6558380126953 0.0001599949027877301 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 891970 VUS 1 2.7952899472438734e-05 1.4018780249868247e-05 NA NA NA NA 2.7952899472438734e-05 1.4018780249868247e-05 4 143098 NA Gcc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA A558T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.025874495506286614 2.8513694047927856 C 0.0032615517266094685 0.2714962661266327 0.7252421975135803 C 0.0011573529336601494 0.0008553715306334198 2.261213921883609e-05 0.014360748231410982 0.23700672388076785 0.05704667791724205 0.004937686026096344 0.6846128702163696 -87.82865142822266 144.6558380126953 0.0001599949027877301 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.97988014810835e-06 8.423440464287404e-06 3.97988014810835e-06 8.423440464287404e-06 1 251264 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L561P NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|21 NA NA NA NA NA b 0.0192568302154541 3.5259256124496465 E 0.0003425506583880633 0.9934153556823728 0.0062419711612164966 E 8.864698611432685e-05 9.209989366354421e-05 1.3494651511791744e-06 0.0005292209680192173 0.9938469529151917 0.0006615313468500973 0.0002912402560468763 0.00448896549642086 -114.96880340576172 128.19667053222656 6.436310650315136e-05 E 0.012195121951219513 E 0.012195121951219513 E 0.006097560975609756 E 0.012195121951219513 E 0.006097560975609756 E 0.012195121951219513 E 0.012195121951219513 E 0.012195121951219513 E 0.006097560975609756 E 0.018292682926829267 NA NA E 0.0 E 0.018292682926829267 E 0.012195121951219513 E 0.006097560975609756 E 0.006097560975609756 E 0.024390243902439025 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 4.884929876425304e-05 1.7521200904641102e-05 NA NA NA NA 4.884929876425304e-05 1.7521200904641102e-05 7 143298 NA cTt/cCt NA 0 NA NA NA NA NA NA V562L NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|21 NA NA NA NA NA b 0.03383103013038635 5.199829331040382 E 5.318456896930002e-05 0.99769788980484 0.0022489761468023053 E 1.15928587547387e-05 1.2958077604707796e-05 2.238218428374239e-07 6.502821634057909e-05 0.99813312292099 0.00019561179215088492 5.3406140068545944e-05 0.001528127584606409 -109.81575775146484 123.79753875732422 5.051400148659013e-05 E 0.1056338028169014 E 0.028169014084507043 E 0.08450704225352113 E 0.11267605633802814 E 0.0 E 0.06338028169014084 E 0.014084507042253518 E 0.1056338028169014 E 0.02112676056338028 E 0.014084507042253518 NA NA E 0.15492957746478872 E 0.028169014084507043 E 0.007042253521126761 E 0.17605633802816897 E 0.007042253521126761 E 0.04929577464788732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.958109563332982e-06 9.571963796687777e-06 7.958109563332982e-06 9.571963796687777e-06 2 251316 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I563S NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|21 NA NA NA NA NA b 0.0038345456123352046 0.7093909382820129 E 2.6659121431293897e-05 0.997097373008728 0.002875970443710685 E 6.16481793258572e-06 6.026870778441663e-06 1.2882459543561703e-07 7.63171337894164e-05 0.9975394010543824 0.0001884739467641339 5.672262705047615e-05 0.0021267780102789398 -109.66810607910156 118.82835388183594 2.579604188213125e-05 E 0.005917159763313609 - 0.01183431952662722 E 0.005917159763313609 E 0.0 E 0.01183431952662722 E 0.005917159763313609 E 0.005917159763313609 E 0.005917159763313609 - 0.017751479289940832 - 0.02366863905325444 NA NA E 0.01183431952662722 E 0.005917159763313609 E 0.01183431952662722 E 0.0 - 0.01183431952662722 E 0.02366863905325444 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.88 0.0 0.01 0.88 0.0 1688T>G P566S NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|21 NA NA NA NA NA b 0.07515543699264526 10.664556509256363 E 0.0007190981996245682 0.8872982263565063 0.11198268830776216 E 0.00028221574029885227 0.00017143487639259547 2.0072300230822293e-06 0.006683934014290571 0.8776394724845886 0.007811248768121005 0.0013201591791585088 0.10608960688114166 -69.88093566894531 134.45204162597656 0.0003158410545438528 E 0.04411764705882353 - 0.029411764705882356 E 0.007352941176470587 E 0.036764705882352935 - 0.05882352941176471 E 0.0 E 0.036764705882352935 E 0.0 - 0.029411764705882356 - 0.02205882352941177 NA NA E 0.11029411764705882 E 0.0 E 0.029411764705882356 E 0.007352941176470587 - 0.029411764705882356 E 0.036764705882352935 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9783599277143375e-06 8.540648006313228e-06 3.9783599277143375e-06 8.540648006313228e-06 1 251360 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N568H NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|21 NA NA NA NA NA e 0.3009379506111145 44.057315969467155 C 0.029542006552219387 0.16238698363304138 0.8080710172653198 C 0.01961394585669041 0.011535778641700743 0.00025359581923112273 0.01960538513958454 0.14588241279125214 0.1934150755405426 0.10846176743507384 0.5012320280075073 -90.19048309326172 90.87372589111328 0.0027063230518251657 - 0.3630573248407643 - 0.3375796178343949 E 0.2802547770700637 - 0.3694267515923567 - 0.34394904458598724 E 0.16560509554140124 - 0.3885350318471338 E 0.15286624203821655 - 0.3057324840764331 - 0.3694267515923567 NA NA E 0.2611464968152866 E 0.19745222929936307 - 0.31210191082802546 - 0.2611464968152866 - 0.31210191082802546 - 0.3312101910828025 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.978199856646825e-06 8.750204617634276e-06 3.978199856646825e-06 8.750204617634276e-06 1 251370 NA NA NA NA Aat/Cat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y570C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2854067981243133 60.991432759165754 C 0.1417621672153473 0.035029903054237366 0.8232079148292542 C 0.08604326844215393 0.05043986812233925 0.001913502695970237 0.01627243310213089 0.01995445042848587 0.20419597625732425 0.303556352853775 0.3176241219043732 -87.41513061523438 12.212535858154295 0.006775585934519768 - 0.11711711711711713 - 0.3063063063063063 - 0.19369369369369369 - 0.12162162162162166 - 0.2927927927927928 - 0.0990990990990991 - 0.2297297297297297 - 0.13063063063063066 - 0.3828828828828829 - 0.4144144144144144 NA NA - 0.25675675675675674 - 0.14864864864864866 - 0.35135135135135137 - 0.20270270270270271 - 0.31981981981981983 - 0.38738738738738737 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.3869999495218508e-05 8.079548638132832e-06 2.3869999495218508e-05 8.079548638132832e-06 6 251362 NA NA NA NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y571C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3344335556030273 71.46845083236694 C 0.09910035133361816 0.014832284301519394 0.8860673904418945 T 0.05632699653506279 0.04075739532709122 0.002064723987132311 0.010363271459937096 0.0074595813639461985 0.2354196161031723 0.3452187180519104 0.30238965153694153 -84.10684204101562 31.359464645385746 0.009466588497161863 T 0.5225225225225225 S 0.5990990990990991 T 0.6981981981981982 T 0.5225225225225225 T 0.4144144144144144 T 0.463963963963964 T 0.5675675675675675 T 0.7747747747747747 S 0.4234234234234234 S 0.527027027027027 NA NA S 0.7792792792792793 T 0.7702702702702703 S 0.4504504504504505 S 0.7297297297297297 S 0.527027027027027 S 0.4504504504504505 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.026897113732244e-05 1.7282656474902177e-05 7.956459739943966e-06 8.990282363474984e-06 2 251368 4.186320074950345e-05 1.476025195768924e-05 6 143324 tAt/tGt tAt/tGt 0 0 NA NA NA NA NA NA D573N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4087775051593781 58.904838493466364 C 0.15754713118076324 0.002336679957807064 0.8401162028312683 C 0.013344860635697842 0.12638582289218905 0.00042868382297456254 0.002587812719866633 0.0008337532635778189 0.20354236662387848 0.030170375481247905 0.6227063536643982 -89.41181945800781 120.23535919189452 0.004915895406156778 - 0.3987730061349693 - 0.37423312883435583 - 0.3006134969325153 - 0.4049079754601227 - 0.3006134969325153 - 0.32515337423312884 - 0.1165644171779141 - 0.3312883435582822 - 0.3987730061349693 - 0.3496932515337423 NA NA - 0.34355828220858897 - 0.32515337423312884 - 0.2331288343558282 - 0.4171779141104294 - 0.37423312883435583 - 0.3680981595092024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.980999842198799e-06 1.7101177876403586e-05 NA NA NA NA 6.980999842198799e-06 1.7101177876403586e-05 1 143246 NA Gat/Aat NA 0 NA NA NA NA NA NA E575Q NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.6211070418357849 108.50740020871164 H 0.9754324555397034 0.0003236199263483286 0.02424393780529499 H 0.009024563245475292 0.9729015231132508 0.00045833270996809006 0.00011861653911182657 0.00012471814989112318 0.002223334973677993 0.007123610004782677 0.00802535843104124 -64.30792999267578 -40.26548767089844 0.002824944909662009 H 0.7577319587628866 H 0.4742268041237113 H 0.4948453608247423 H 0.7628865979381443 T 0.5670103092783505 H 0.7525773195876289 H 0.6546391752577321 H 0.7216494845360825 H 0.31958762886597936 H 0.3608247422680412 NA NA H 0.5515463917525774 H 0.4896907216494845 H 0.6752577319587629 H 0.4639175257731959 H 0.4278350515463917 H 0.28865979381443296 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.067832699779593e-06 1.8173833830278092e-05 3.978389941039495e-06 8.439055241959504e-06 1 251358 6.978949841141002e-06 1.6095669688264483e-05 1 143288 Gag/Cag Gag/Cag 0 0 NA NA NA NA NA NA K576* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4292682926829268 H 0.40487804878048783 H 0.4975609756097561 H 0.4195121951219512 T 0.2780487804878049 H 0.4195121951219512 H 0.3951219512195122 H 0.4195121951219512 H 0.3414634146341464 H 0.3853658536585366 NA NA H 0.3268292682926829 H 0.5121951219512195 H 0.4390243902439024 H 0.42439024390243896 H 0.37560975609756103 H 0.3170731707317073 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.0 0.27 1726A>T K576R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA b 0.1806660890579224 37.16301451921464 H 0.9899572730064392 0.00013846112415194511 0.009904236532747746 H 0.005435004830360414 0.984808087348938 0.0014753880677744744 6.609455886064097e-05 4.7815152356633916e-05 0.0007721164147369564 0.0034252770710736517 0.003970116376876831 -62.52769088745117 -40.90788269042969 0.0015018878038972616 H 0.4292682926829268 H 0.40487804878048783 H 0.4975609756097561 H 0.4195121951219512 T 0.2780487804878049 H 0.4195121951219512 H 0.3951219512195122 H 0.4195121951219512 H 0.3414634146341464 H 0.3853658536585366 NA NA H 0.3268292682926829 H 0.5121951219512195 H 0.4390243902439024 H 0.42439024390243896 H 0.37560975609756103 H 0.3170731707317073 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.0134900300908175e-05 1.734436650185999e-05 1.1934699614357667e-05 8.093679245468775e-06 3 251368 6.977979865041562e-06 1.5340124041946692e-05 1 143308 aAg/aGg aAg/aGg 0 0 NA NA NA NA NA NA L577F NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA b 0.13326969742774966 24.401681599020964 H 0.9922713041305542 0.00028921067132614553 0.007439448032528163 H 0.0016885156510397794 0.9915027618408204 0.001146955415606499 2.737186514423229e-05 0.00012998227612115445 0.0005634526023641229 0.002090305555611849 0.002850732067599893 -63.72518920898438 -41.33306884765625 0.0005100989365018903 H 0.2195121951219512 H 0.2621951219512195 H 0.2926829268292683 H 0.21341463414634146 T 0.25 H 0.24390243902439024 H 0.16463414634146342 H 0.2073170731707317 H 0.2682926829268293 H 0.2378048780487805 NA NA H 0.25609756097560976 H 0.29878048780487804 H 0.2073170731707317 H 0.2195121951219512 H 0.25 H 0.2378048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 854371 VUS 2 5.067579449809398e-06 1.9236565213091615e-05 3.978519998781849e-06 8.747253999444949e-06 1 251350 6.977590146561853e-06 1.713274609240214e-05 1 143316 Ctc/Ttc Ctc/Ttc 0 0 NA NA NA NA NA NA A580T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA b 0.006413757801055908 0.7067961096763611 H 0.9983568787574768 3.5367440432310104e-05 0.0016077419277280571 H 0.00047645575250498956 0.9979735016822816 0.00033586416975595046 5.11777943756897e-06 1.2060717381245922e-05 0.00010483796359039843 0.0005888635641895237 0.0005034065106883645 -62.51967239379883 -43.34751892089844 5.4006861319066963e-05 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.03773584905660377 H 0.0 H 0.02830188679245283 H 0.0 H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.04716981132075472 H 0.04716981132075472 NA NA H 0.009433962264150943 H 0.0 H 0.018867924528301886 H 0.0 H 0.02830188679245283 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.978710083174518e-06 8.813568689717406e-06 3.978710083174518e-06 8.813568689717406e-06 1 251338 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA W583G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA b 0.04150247573852539 9.981345415115355 H 0.9974115490913392 2.217443397967145e-05 0.0025663962587714195 H 0.0007342074532061815 0.9947602152824402 0.0019605769775807858 7.92684659245424e-06 7.914180059742646e-06 0.00018963514594361183 0.0015223624650388956 0.000817128864582628 -63.30577850341797 -43.16618347167969 6.168717663967982e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.00881057268722467 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.5129834775490793e-05 NA NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.5129834775490793e-05 1 143334 NA Tgg/Ggg NA 0 NA NA NA NA NA NA E584* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.005154639175257732 H 0.0 H 0.10309278350515463 H 0.0 H 0.005154639175257732 H 0.25773195876288657 H 0.0 H 0.26288659793814434 H 0.005154639175257732 H 0.0 NA NA H 0.05154639175257732 H 0.0979381443298969 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.005154639175257732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.0 0.0 0.38 0.02 1750G>T K585E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.5402035117149353 111.11986235976221 H 0.999215841293335 8.59796637087129e-06 0.0007755787228234112 H 0.00027968414360657334 0.9977564215660096 0.001195194199681282 1.8645074533196744e-06 3.3671385608613487e-06 3.045740049856249e-05 0.0005380236543715 0.00019493246509227902 -62.81961441040039 -43.17194366455078 8.850127778714523e-05 H 0.526829268292683 H 0.5365853658536586 H 0.7609756097560976 H 0.5317073170731708 H 0.5853658536585366 H 0.7219512195121951 H 0.5560975609756098 H 0.6780487804878049 H 0.4829268292682927 H 0.526829268292683 NA NA H 0.7121951219512195 H 0.7414634146341463 H 0.5317073170731708 H 0.4341463414634146 H 0.5463414634146342 H 0.473170731707317 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.0 0.0 0.36 0.0 1753A>G E586K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.3739441633224487 65.32804533243178 H 0.9984744191169742 1.5129840903682636e-05 0.0015104798367246985 H 0.0005022066179662943 0.9962762594223022 0.0017600872088223696 3.854352144117002e-06 4.2238784772052895e-06 7.581307727377863e-05 0.0010484837694093585 0.0003291166794952005 -65.17005157470703 -41.2729721069336 4.388711749925277e-05 H 0.4381443298969072 H 0.4020618556701031 H 0.4742268041237113 H 0.4329896907216495 H 0.36597938144329895 H 0.4432989690721649 H 0.38144329896907214 H 0.4278350515463917 H 0.3711340206185567 H 0.4020618556701031 NA NA H 0.4278350515463917 H 0.42268041237113396 H 0.4329896907216495 H 0.29896907216494845 H 0.4432989690721649 H 0.4484536082474227 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.2670282348757871e-05 1.8279788709885284e-05 3.979369921580656e-06 8.385729662511468e-06 1 251296 2.7907999538001604e-05 1.6242851144590495e-05 4 143328 Gag/Aag Gag/Aag 0 0 NA NA NA NA NA NA E586V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.3739441633224487 65.32804533243178 H 0.9984744191169742 1.5129840903682636e-05 0.0015104798367246985 H 0.0005022066179662943 0.9962762594223022 0.0017600872088223696 3.854352144117002e-06 4.2238784772052895e-06 7.581307727377863e-05 0.0010484837694093585 0.0003291166794952005 -65.17005157470703 -41.2729721069336 4.388711749925277e-05 H 0.4381443298969072 H 0.4020618556701031 H 0.4742268041237113 H 0.4329896907216495 H 0.36597938144329895 H 0.4432989690721649 H 0.38144329896907214 H 0.4278350515463917 H 0.3711340206185567 H 0.4020618556701031 NA NA H 0.4278350515463917 H 0.42268041237113396 H 0.4329896907216495 H 0.29896907216494845 H 0.4432989690721649 H 0.4484536082474227 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.0 0.0 0.26 0.0 1757A>T N589K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.5553321242332458 81.30062298774719 H 0.9948430061340332 9.199038322549312e-05 0.005064923781901598 H 0.002046067034825682 0.99033385515213 0.0017406585393473506 2.275559381814673e-05 5.015742863179185e-05 0.0003202084335498512 0.004059295635670424 0.0014270832762122154 -64.11347961425781 -41.70574951171875 0.00025064946385100484 H 0.4649681528662421 H 0.4140127388535032 H 0.5414012738853503 H 0.4713375796178344 H 0.5095541401273885 H 0.3503184713375796 H 0.5796178343949044 H 0.4585987261146497 H 0.4713375796178344 H 0.4012738853503185 NA NA H 0.3694267515923567 H 0.5222929936305732 H 0.5987261146496815 H 0.4585987261146497 H 0.4076433121019109 H 0.37579617834394907 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.979179837187985e-06 8.989683560917215e-06 3.979179837187985e-06 8.989683560917215e-06 1 251308 NA NA NA NA aaT/aaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N589S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA e 0.5553321242332458 81.30062298774719 H 0.9948430061340332 9.199038322549312e-05 0.005064923781901598 H 0.002046067034825682 0.99033385515213 0.0017406585393473506 2.275559381814673e-05 5.015742863179185e-05 0.0003202084335498512 0.004059295635670424 0.0014270832762122154 -64.11347961425781 -41.70574951171875 0.00025064946385100484 H 0.4649681528662421 H 0.4140127388535032 H 0.5414012738853503 H 0.4713375796178344 H 0.5095541401273885 H 0.3503184713375796 H 0.5796178343949044 H 0.4585987261146497 H 0.4713375796178344 H 0.4012738853503185 NA NA H 0.3694267515923567 H 0.5222929936305732 H 0.5987261146496815 H 0.4585987261146497 H 0.4076433121019109 H 0.37579617834394907 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C 593806 VUS 2 0.00020527844053476327 1.7708052404535247e-05 7.163610280258581e-05 8.012087708083278e-06 18 251270 0.00043958800961263483 1.5791819734272152e-05 63 143316 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA V591L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|28 NA NA NA NA b 0.030861884355545044 4.743471625447273 H 0.9792444109916688 0.00031580531504005194 0.020439865067601204 H 0.013799347914755344 0.9593300223350524 0.0034749880433082576 6.788565224269405e-05 0.0001431621058145538 0.001230245572514832 0.016706202179193497 0.00524802366271615 -64.78618621826172 -36.37873458862305 0.0005716528394259512 H 0.056338028169014086 H 0.07746478873239436 H 0.02112676056338028 H 0.04929577464788732 H 0.04929577464788732 H 0.07746478873239436 H 0.035211267605633804 H 0.07042253521126761 H 0.056338028169014086 H 0.07746478873239436 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.07746478873239436 H 0.04929577464788732 H 0.035211267605633804 H 0.08450704225352113 H 0.11971830985915492 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.4501474639689963e-05 NA NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.4501474639689963e-05 1 143268 NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA N593T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7323223352432251 107.21198987960815 C 0.4281845390796661 0.00028522766660898924 0.571530282497406 T 0.03987730294466019 0.3180837035179138 0.0014455447671934962 0.00015090269153006378 5.85493617109023e-05 0.016932105645537376 0.6007964015007019 0.02265541814267636 -85.80699157714844 -5.957108497619629 0.0010624085552990437 H 0.7197452229299363 T 0.8152866242038217 T 0.6178343949044586 H 0.7261146496815286 S 0.7961783439490446 H 0.6687898089171974 T 0.6878980891719745 H 0.6942675159235668 H 0.7133757961783439 H 0.8152866242038217 NA NA T 0.5605095541401274 T 0.6050955414012739 S 0.7961783439490446 T 0.5605095541401274 T 0.7452229299363057 H 0.7197452229299363 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 1.7736254676667668e-05 1.6769147574237025e-05 1.1934699614357667e-05 8.356781770809517e-06 3 251368 2.7912699806620367e-05 1.4538518108858456e-05 4 143304 aAc/aCc aAc/aCc 0 0 NA NA NA NA NA NA Y594C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.20930463075637812 44.728399592638006 C 0.09809005260467528 0.005114986095577478 0.8967950344085693 C 0.027817951515316963 0.05557635053992272 0.0015910071088001132 0.005557929165661335 0.002864164998754859 0.2292118519544601 0.10499955713748932 0.5723811984062195 -85.42278289794922 125.91197204589844 0.0029875615146011114 - 0.2972972972972973 - 0.2702702702702703 - 0.28378378378378377 - 0.2972972972972973 - 0.3738738738738739 - 0.2972972972972973 - 0.30180180180180183 - 0.2792792792792793 - 0.3153153153153153 - 0.22522522522522526 NA NA - 0.045045045045045036 - 0.2882882882882883 - 0.2792792792792793 - 0.040540540540540536 - 0.23423423423423426 - 0.28378378378378377 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.977880169259152e-06 9.024608036471665e-06 3.977880169259152e-06 9.024608036471665e-06 1 251390 NA NA NA NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K595R NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7471929788589478 153.69759575128555 C 0.015225197188556194 0.0255367923527956 0.9592379927635192 C 0.009495911188423634 0.006198870949447155 0.0002284947840962559 0.013878196477890016 0.015293980017304419 0.1816367655992508 0.1089821606874466 0.6642856001853943 -87.55709075927734 92.66124725341795 0.0023661656305193892 - 0.9365853658536586 - 0.7853658536585366 - 0.9707317073170731 - 0.9414634146341464 - 0.8536585365853658 - 0.946341463414634 - 0.8780487804878049 - 0.8634146341463415 - 0.775609756097561 - 0.7463414634146341 NA NA B 0.5170731707317073 - 0.8829268292682927 - 0.9073170731707316 B 0.5560975609756098 - 0.8439024390243902 - 0.6682926829268293 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 1784A>G K595T NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7471929788589478 153.69759575128555 C 0.015225197188556194 0.0255367923527956 0.9592379927635192 C 0.009495911188423634 0.006198870949447155 0.0002284947840962559 0.013878196477890016 0.015293980017304419 0.1816367655992508 0.1089821606874466 0.6642856001853943 -87.55709075927734 92.66124725341795 0.0023661656305193892 - 0.9365853658536586 - 0.7853658536585366 - 0.9707317073170731 - 0.9414634146341464 - 0.8536585365853658 - 0.946341463414634 - 0.8780487804878049 - 0.8634146341463415 - 0.775609756097561 - 0.7463414634146341 NA NA B 0.5170731707317073 - 0.8829268292682927 - 0.9073170731707316 B 0.5560975609756098 - 0.8439024390243902 - 0.6682926829268293 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 7.599591409458583e-06 1.620039610182999e-05 7.955320143082645e-06 8.562081810707558e-06 2 251404 6.975739779591095e-06 1.3752948372001513e-05 1 143354 aAg/aCg aAg/aCg 0 0 NA NA NA NA NA NA N598H NA NA Lumenal|2 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|12 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4607849717140198 67.4589198589325 C 0.005108159966766834 0.003581822384148836 0.9913100004196168 T 0.00218354887329042 0.0005332313012331724 1.9142357814416755e-06 9.914355905493721e-05 0.0006467142957262695 0.05664579197764396 0.9305171370506288 0.009372510015964508 -93.56355285644531 -2.7770309448242188 0.002365597290918231 T 0.3694267515923567 T 0.3630573248407643 T 0.35668789808917195 T 0.35668789808917195 S 0.3375796178343949 T 0.3503184713375796 T 0.35668789808917195 T 0.3503184713375796 T 0.3821656050955414 T 0.3949044585987261 NA NA T 0.1337579617834395 T 0.3885350318471338 T 0.31210191082802546 T 0.1592356687898089 T 0.3312101910828025 T 0.43312101910828027 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 3.9767101043253206e-06 8.985183859682588e-06 3.9767101043253206e-06 8.985183859682588e-06 1 251464 NA NA NA NA Aat/Cat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N598S NA NA Lumenal|2 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|12 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4607849717140198 67.4589198589325 C 0.005108159966766834 0.003581822384148836 0.9913100004196168 T 0.00218354887329042 0.0005332313012331724 1.9142357814416755e-06 9.914355905493721e-05 0.0006467142957262695 0.05664579197764396 0.9305171370506288 0.009372510015964508 -93.56355285644531 -2.7770309448242188 0.002365597290918231 T 0.3694267515923567 T 0.3630573248407643 T 0.35668789808917195 T 0.35668789808917195 S 0.3375796178343949 T 0.3503184713375796 T 0.35668789808917195 T 0.3503184713375796 T 0.3821656050955414 T 0.3949044585987261 NA NA T 0.1337579617834395 T 0.3885350318471338 T 0.31210191082802546 T 0.1592356687898089 T 0.3312101910828025 T 0.43312101910828027 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 2.279692260345391e-05 1.651949794232714e-05 2.7837200832436793e-05 7.2563414752437076e-06 7 251462 1.3953999769000802e-05 1.4840462279228655e-05 2 143328 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA I601V NA NA Lumenal|2 NA NA NA STRAND|22 NA NA NA NA NA b 0.06801214814186096 12.582247406244278 E 0.00013463004142977295 0.9902244210243224 0.00964084081351757 E 4.738167262985371e-05 3.709289012476802e-05 7.099121148712585e-07 0.0010870437836274505 0.9908395409584044 0.0004487326368689537 0.00020668598881456998 0.007332831155508757 -115.25858306884766 128.88133239746094 9.481937013333665e-05 E 0.21301775147928995 - 0.1834319526627219 E 0.2248520710059172 E 0.2189349112426036 E 0.2189349112426036 E 0.21301775147928995 E 0.3136094674556213 E 0.2189349112426036 - 0.20710059171597636 - 0.2248520710059172 NA NA E 0.21301775147928995 E 0.2307692307692308 - 0.27218934911242604 E 0.20710059171597636 - 0.1952662721893491 - 0.2485207100591716 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 6.9774901021446575e-06 1.4802044484693506e-05 NA NA NA NA 6.9774901021446575e-06 1.4802044484693506e-05 1 143318 NA Att/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA T604= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10025054216384888 13.904750198125837 E 0.0007311876979656518 0.910988986492157 0.0882798507809639 E 0.00033395650098100305 0.0002254764549434185 1.1989699487457985e-05 0.005283173639327289 0.9123601913452148 0.011977859772741795 0.003031776053830981 0.06677556782960893 -126.52082824707031 151.78216552734375 0.0007106767152436078 - 0.2323943661971831 - 0.07746478873239436 - 0.9859154929577464 - 0.22535211267605634 E 0.02112676056338028 - 0.2323943661971831 E 0.08450704225352113 - 0.2676056338028169 - 0.07746478873239436 - 0.07042253521126761 NA NA E 0.4859154929577465 - 0.943661971830986 E 0.08450704225352113 E 0.4295774647887324 - 0.09154929577464788 - 0.07042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.86 0.86 0.0 0.0 0.0 1812T>A T604I NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10025054216384888 13.904750198125837 E 0.0007311876979656518 0.910988986492157 0.0882798507809639 E 0.00033395650098100305 0.0002254764549434185 1.1989699487457985e-05 0.005283173639327289 0.9123601913452148 0.011977859772741795 0.003031776053830981 0.06677556782960893 -126.52082824707031 151.78216552734375 0.0007106767152436078 - 0.2323943661971831 - 0.07746478873239436 - 0.9859154929577464 - 0.22535211267605634 E 0.02112676056338028 - 0.2323943661971831 E 0.08450704225352113 - 0.2676056338028169 - 0.07746478873239436 - 0.07042253521126761 NA NA E 0.4859154929577465 - 0.943661971830986 E 0.08450704225352113 E 0.4295774647887324 - 0.09154929577464788 - 0.07042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA 5.0661639344601165e-06 1.7253566721456102e-05 3.976620064349845e-06 7.89412856154279e-06 1 251470 6.978069905017038e-06 1.5341717598286434e-05 1 143306 aCt/aTt aCt/aTt 0 0 NA NA NA NA NA NA T604S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10025054216384888 13.904750198125837 E 0.0007311876979656518 0.910988986492157 0.0882798507809639 E 0.00033395650098100305 0.0002254764549434185 1.1989699487457985e-05 0.005283173639327289 0.9123601913452148 0.011977859772741795 0.003031776053830981 0.06677556782960893 -126.52082824707031 151.78216552734375 0.0007106767152436078 - 0.2323943661971831 - 0.07746478873239436 - 0.9859154929577464 - 0.22535211267605634 E 0.02112676056338028 - 0.2323943661971831 E 0.08450704225352113 - 0.2676056338028169 - 0.07746478873239436 - 0.07042253521126761 NA NA E 0.4859154929577465 - 0.943661971830986 E 0.08450704225352113 E 0.4295774647887324 - 0.09154929577464788 - 0.07042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|nan|5f18-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A|5f1b-C NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 1811C>G A605= NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.06229445338249207 6.864848762750626 E 0.00675675505772233 0.7404337525367737 0.2528094947338104 E 0.002920594066381455 0.0018047943012788887 3.3478580007795244e-05 0.007122663781046867 0.7500066757202148 0.04895980656147003 0.0076549709774553784 0.1814969927072525 -136.60061645507812 159.878173828125 0.00045569214853458107 - 0.07547169811320754 - 0.03773584905660377 NA NA - 0.07547169811320754 E 0.0 - 0.8301886792452831 - 0.0 - 1.0 - 0.05660377358490566 - 0.009433962264150943 NA NA - 0.12264150943396225 NA NA - 0.0 - 0.05660377358490566 - 0.03773584905660377 - 0.04716981132075472 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|5hns-B|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A|5hns-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.88 0.88 0.0 0.0 0.0 1815T>A R607* NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2338709677419355 T 0.1532258064516129 NA NA H 0.2338709677419355 S 0.13306451612903225 NA NA T 0.2056451612903226 NA NA T 0.1532258064516129 T 0.07661290322580645 NA NA - 0.7661290322580645 NA NA T 0.1814516129032258 H 0.2903225806451613 T 0.18548387096774194 T 0.16532258064516128 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A|5kwy-A 265495 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S608G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|29 NA NA NA NA b 0.1812308132648468 21.240251314640048 C 0.2648182511329651 0.035865068435668945 0.6993166208267212 C 0.045409373939037316 0.24021123349666595 0.0017079084645956757 0.0260340329259634 0.020660210400819785 0.08445050567388535 0.08376700431108475 0.497759759426117 -84.07561492919922 161.21632385253906 0.0025128803681582212 H 0.05384615384615385 H 0.0 NA NA H 0.05384615384615385 H 0.0 NA NA S 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.5153846153846153 H 0.0 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.02 0.0 0.49 0.0 1822A>G S608N NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|29 NA NA NA NA b 0.1812308132648468 21.240251314640048 C 0.2648182511329651 0.035865068435668945 0.6993166208267212 C 0.045409373939037316 0.24021123349666595 0.0017079084645956757 0.0260340329259634 0.020660210400819785 0.08445050567388535 0.08376700431108475 0.497759759426117 -84.07561492919922 161.21632385253906 0.0025128803681582212 H 0.05384615384615385 H 0.0 NA NA H 0.05384615384615385 H 0.0 NA NA S 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 H 0.5153846153846153 H 0.0 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0133652039436954e-05 1.7850884027582268e-05 3.9766500776750036e-06 8.791064457891415e-06 1 251468 2.0941499315085817e-05 1.5536127132055465e-05 3 143256 aGt/aAt aGt/aAt 0 0 NA NA NA NA NA NA E610K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|29 NA NA NA NA e 0.3535768389701843 61.7698737680912 H 0.9618314504623412 0.0006598473992198706 0.03750871866941452 H 0.01054833084344864 0.9486199021339417 0.004950213246047497 0.00025842880131676804 0.000356328469933942 0.005599871277809143 0.014319490641355516 0.01534742210060358 -64.65544891357422 -41.87771224975586 0.0033718114718794823 H 0.3969072164948453 H 0.42268041237113396 NA NA H 0.4020618556701031 H 0.20103092783505155 NA NA H 0.31443298969072164 NA NA H 0.28350515463917525 H 0.21649484536082475 NA NA NA NA NA NA H 0.4278350515463917 H 0.7680412371134021 H 0.2525773195876289 H 0.27835051546391754 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 9.254240058036329e-06 3.9765500332578085e-06 9.254240058036329e-06 1 251474 NA NA NA NA Gaa/Aaa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D611G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA HELIX|29 NA NA NA NA e 0.4086835384368897 58.89129788875579 H 0.9837015271186828 0.00028963317163288593 0.01600886695086956 H 0.006439787335693836 0.9692376255989076 0.00857992097735405 9.529168164590374e-05 0.00014992228534538302 0.0020754302386194468 0.007784248329699038 0.005637804511934519 -67.87211608886719 -40.95625305175781 0.0014351432910189033 H 0.3128834355828221 H 0.2392638036809816 NA NA H 0.31901840490797545 H 0.4110429447852761 NA NA H 0.3680981595092024 NA NA H 0.3680981595092024 H 0.4171779141104294 NA NA NA NA NA NA H 0.3128834355828221 H 0.4601226993865031 H 0.3680981595092024 H 0.3558282208588957 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.0 0.0 0.24 0.0 1832A>G E612D NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13324561715126038 23.278009316325182 H 0.9880168437957764 0.00021831569029018283 0.011764726601541042 H 0.004786350298672914 0.9737744331359864 0.009298308752477169 0.0001237622636836022 8.892677578842267e-05 0.0014274194836616516 0.005773209035396576 0.0047275880351662644 -67.16300964355469 -40.13780975341797 0.0010456009767949581 H 0.14432989690721648 H 0.07216494845360824 NA NA H 0.15463917525773194 H 0.030927835051546393 NA NA H 0.22164948453608246 NA NA H 0.05154639175257732 H 0.0979381443298969 NA NA NA NA NA NA H 0.010309278350515464 - 0.788659793814433 H 0.05154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|5kwy-B|6w5v-A|5u73-A 555407 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N614K NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4339081943035126 63.52415964603424 H 0.964718461036682 0.0002321870269952342 0.03504938632249832 H 0.0058739539235830324 0.9438161849975586 0.016054103150963783 0.00015415200323332098 0.00010121874220203608 0.003420731052756309 0.02098734304308892 0.009592442773282528 -66.90593719482422 -37.67387771606445 0.002334171906113625 H 0.821656050955414 H 0.6560509554140127 NA NA H 0.8152866242038217 H 0.35668789808917195 NA NA H 0.4394904458598726 NA NA H 0.3248407643312102 H 0.3821656050955414 NA NA NA NA NA NA H 0.5987261146496815 NA NA H 0.4522292993630573 H 0.3248407643312102 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 9.652737111306986e-06 3.976490006607492e-06 9.652737111306986e-06 1 251478 NA NA NA NA aaT/aaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N614S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4339081943035126 63.52415964603424 H 0.964718461036682 0.0002321870269952342 0.03504938632249832 H 0.0058739539235830324 0.9438161849975586 0.016054103150963783 0.00015415200323332098 0.00010121874220203608 0.003420731052756309 0.02098734304308892 0.009592442773282528 -66.90593719482422 -37.67387771606445 0.002334171906113625 H 0.821656050955414 H 0.6560509554140127 NA NA H 0.8152866242038217 H 0.35668789808917195 NA NA H 0.4394904458598726 NA NA H 0.3248407643312102 H 0.3821656050955414 NA NA NA NA NA NA H 0.5987261146496815 NA NA H 0.4522292993630573 H 0.3248407643312102 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.75690053312524e-06 3.97652001993265e-06 8.75690053312524e-06 1 251476 NA NA NA NA aAt/aGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R615C NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4851244688034058 111.09350335597992 H 0.9408289790153505 0.0004965452244505286 0.058674484491348274 H 0.00535088125616312 0.9301777482032776 0.014714005403220654 0.0002392996830167249 0.0001835612783906981 0.007390511222183704 0.03058253601193428 0.011361495591700077 -69.53713989257811 -37.94715118408203 0.0027319202199578285 H 0.7983870967741935 H 0.5241935483870968 NA NA H 0.7983870967741935 H 0.5040322580645161 NA NA H 0.6975806451612904 NA NA H 0.4475806451612903 H 0.32661290322580644 NA NA NA NA NA NA H 0.5685483870967742 NA NA H 0.532258064516129 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 566223 conflict 1 5.169559881323949e-05 7.715403772066597e-06 5.169559881323949e-05 7.715403772066597e-06 13 251472 NA NA NA NA Cgt/Tgt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R615H NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4851244688034058 111.09350335597992 H 0.9408289790153505 0.0004965452244505286 0.058674484491348274 H 0.00535088125616312 0.9301777482032776 0.014714005403220654 0.0002392996830167249 0.0001835612783906981 0.007390511222183704 0.03058253601193428 0.011361495591700077 -69.53713989257811 -37.94715118408203 0.0027319202199578285 H 0.7983870967741935 H 0.5241935483870968 NA NA H 0.7983870967741935 H 0.5040322580645161 NA NA H 0.6975806451612904 NA NA H 0.4475806451612903 H 0.32661290322580644 NA NA NA NA NA NA H 0.5685483870967742 NA NA H 0.532258064516129 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 9.263692967500737e-06 3.97652001993265e-06 9.263692967500737e-06 1 251476 NA NA NA NA cGt/cAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R615L NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4851244688034058 111.09350335597992 H 0.9408289790153505 0.0004965452244505286 0.058674484491348274 H 0.00535088125616312 0.9301777482032776 0.014714005403220654 0.0002392996830167249 0.0001835612783906981 0.007390511222183704 0.03058253601193428 0.011361495591700077 -69.53713989257811 -37.94715118408203 0.0027319202199578285 H 0.7983870967741935 H 0.5241935483870968 NA NA H 0.7983870967741935 H 0.5040322580645161 NA NA H 0.6975806451612904 NA NA H 0.4475806451612903 H 0.32661290322580644 NA NA NA NA NA NA H 0.5685483870967742 NA NA H 0.532258064516129 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 7.945830670520874e-06 3.97652001993265e-06 7.945830670520874e-06 1 251476 NA NA NA NA cGt/cTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R615S NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4851244688034058 111.09350335597992 H 0.9408289790153505 0.0004965452244505286 0.058674484491348274 H 0.00535088125616312 0.9301777482032776 0.014714005403220654 0.0002392996830167249 0.0001835612783906981 0.007390511222183704 0.03058253601193428 0.011361495591700077 -69.53713989257811 -37.94715118408203 0.0027319202199578285 H 0.7983870967741935 H 0.5241935483870968 NA NA H 0.7983870967741935 H 0.5040322580645161 NA NA H 0.6975806451612904 NA NA H 0.4475806451612903 H 0.32661290322580644 NA NA NA NA NA NA H 0.5685483870967742 NA NA H 0.532258064516129 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976590051024687e-06 8.012240794492356e-06 3.976590051024687e-06 8.012240794492356e-06 1 251472 NA NA NA NA Cgt/Agt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E616V NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1632300615310669 28.516291749477386 H 0.8776110410690308 0.0016857523005455732 0.12070322036743165 H 0.012130201794207096 0.8474754095077515 0.02619948796927929 0.00095750653417781 0.0005698672612197697 0.01909230649471283 0.05827252194285393 0.0353027880191803 -74.62775421142578 -32.359867095947266 0.004470153711736202 H 0.16494845360824742 H 0.12371134020618554 NA NA H 0.17010309278350516 H 0.07216494845360824 NA NA H 0.05154639175257732 NA NA H 0.02577319587628866 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA NA NA H 0.08247422680412371 NA NA H 0.11855670103092784 H 0.020618556701030927 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1847A>T S617G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|7 NA NA NA b 0.12748873233795166 14.941679430007934 H 0.8309572339057922 0.004737564362585546 0.1643052101135254 H 0.017822833731770515 0.8017300963401794 0.02689480595290661 0.002709978725761175 0.002048743423074484 0.023510295897722244 0.05446309968829155 0.0708201676607132 -71.2313461303711 -38.96687698364258 0.005996040068566799 T 0.4846153846153846 S 0.5307692307692308 NA NA T 0.4846153846153846 G 0.4153846153846154 NA NA T 0.25384615384615383 NA NA T 0.05384615384615385 H 0.02307692307692308 NA NA NA NA NA NA T 0.3384615384615385 NA NA S 0.3230769230769231 H 0.061538461538461535 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.53 0.0 0.0 0.53 0.0 1849A>G D618E NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|7 NA NA NA e 0.54336017370224 78.29820103049278 H 0.8664440512657166 0.002825878327712417 0.13073015213012695 H 0.02167944610118866 0.8276093006134033 0.03175978735089302 0.0007991036400198936 0.0013751351507380605 0.020211555063724518 0.058320242911577225 0.03824551776051521 -68.86219787597656 -35.978187561035156 0.003732332261279225 T 0.5766871165644172 - 0.558282208588957 NA NA T 0.5705521472392638 G 0.7484662576687117 NA NA T 0.6441717791411042 NA NA T 0.5766871165644172 S 0.4969325153374233 NA NA NA NA NA NA T 0.656441717791411 NA NA S 0.6134969325153374 S 0.5705521472392638 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.0 0.0 0.34 0.0 1854C>G D618G NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|7 NA NA NA e 0.54336017370224 78.29820103049278 H 0.8664440512657166 0.002825878327712417 0.13073015213012695 H 0.02167944610118866 0.8276093006134033 0.03175978735089302 0.0007991036400198936 0.0013751351507380605 0.020211555063724518 0.058320242911577225 0.03824551776051521 -68.86219787597656 -35.978187561035156 0.003732332261279225 T 0.5766871165644172 - 0.558282208588957 NA NA T 0.5705521472392638 G 0.7484662576687117 NA NA T 0.6441717791411042 NA NA T 0.5766871165644172 S 0.4969325153374233 NA NA NA NA NA NA T 0.656441717791411 NA NA S 0.6134969325153374 S 0.5705521472392638 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.043940058792941e-06 1.7271381989093234e-05 NA NA NA NA 7.043940058792941e-06 1.7271381989093234e-05 1 141966 NA gAc/gGc NA 0 NA NA NA NA NA NA D618H NA NA Lumenal|2 NA NA NA NA NA TURN|7 NA NA NA e 0.54336017370224 78.29820103049278 H 0.8664440512657166 0.002825878327712417 0.13073015213012695 H 0.02167944610118866 0.8276093006134033 0.03175978735089302 0.0007991036400198936 0.0013751351507380605 0.020211555063724518 0.058320242911577225 0.03824551776051521 -68.86219787597656 -35.978187561035156 0.003732332261279225 T 0.5766871165644172 - 0.558282208588957 NA NA T 0.5705521472392638 G 0.7484662576687117 NA NA T 0.6441717791411042 NA NA T 0.5766871165644172 S 0.4969325153374233 NA NA NA NA NA NA T 0.656441717791411 NA NA S 0.6134969325153374 S 0.5705521472392638 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.952980013214983e-06 9.205414163888961e-06 7.952980013214983e-06 9.205414163888961e-06 2 251478 NA NA NA NA Gac/Cac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T623N NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.07074180245399475 9.811888000369072 H 0.9941229224205016 0.0002155064139515161 0.005661640781909227 H 0.003138963133096695 0.98481422662735 0.006507877260446549 4.171576438238844e-05 8.299723413074389e-05 0.0004725228354800493 0.003497956553474069 0.0014437482459470632 -65.23615264892578 -40.55642700195313 0.0004337366844993085 H 0.22535211267605634 H 0.13380281690140844 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.1267605633802817 NA NA H 0.02112676056338028 NA NA H 0.09859154929577464 H 0.15492957746478872 NA NA NA NA NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.19014084507042253 H 0.1267605633802817 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976780135417357e-06 8.836527562510421e-06 3.976780135417357e-06 8.836527562510421e-06 1 251460 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V624= NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.06040099263191224 9.28363256752491 H 0.998368203639984 1.912569859996438e-05 0.0016126864356920125 H 0.0005589681677520275 0.9957200884819032 0.0023013600148260593 2.525619265725254e-06 6.9473917392315335e-06 0.0001160053943749517 0.0008093509823083878 0.0004847987438552082 -63.88995361328125 -41.95813751220703 0.00028563282103277743 H 0.2535211267605634 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2676056338028169 NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.13380281690140844 H 0.2183098591549296 NA NA NA NA NA NA H 0.18309859154929575 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.11971830985915492 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.95 0.0 0.0 0.95 0.0 1872T>G V624A NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.06040099263191224 9.28363256752491 H 0.998368203639984 1.912569859996438e-05 0.0016126864356920125 H 0.0005589681677520275 0.9957200884819032 0.0023013600148260593 2.525619265725254e-06 6.9473917392315335e-06 0.0001160053943749517 0.0008093509823083878 0.0004847987438552082 -63.88995361328125 -41.95813751220703 0.00028563282103277743 H 0.2535211267605634 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2676056338028169 NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.13380281690140844 H 0.2183098591549296 NA NA NA NA NA NA H 0.18309859154929575 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.11971830985915492 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976780135417357e-06 7.056764551136255e-06 3.976780135417357e-06 7.056764551136255e-06 1 251460 NA NA NA NA gTt/gCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V624D NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.06040099263191224 9.28363256752491 H 0.998368203639984 1.912569859996438e-05 0.0016126864356920125 H 0.0005589681677520275 0.9957200884819032 0.0023013600148260593 2.525619265725254e-06 6.9473917392315335e-06 0.0001160053943749517 0.0008093509823083878 0.0004847987438552082 -63.88995361328125 -41.95813751220703 0.00028563282103277743 H 0.2535211267605634 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2676056338028169 NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.13380281690140844 H 0.2183098591549296 NA NA NA NA NA NA H 0.18309859154929575 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.11971830985915492 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.0 0.0 0.24 0.0 1871T>A V624I NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.06040099263191224 9.28363256752491 H 0.998368203639984 1.912569859996438e-05 0.0016126864356920125 H 0.0005589681677520275 0.9957200884819032 0.0023013600148260593 2.525619265725254e-06 6.9473917392315335e-06 0.0001160053943749517 0.0008093509823083878 0.0004847987438552082 -63.88995361328125 -41.95813751220703 0.00028563282103277743 H 0.2535211267605634 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2676056338028169 NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.13380281690140844 H 0.2183098591549296 NA NA NA NA NA NA H 0.18309859154929575 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.11971830985915492 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 596531 VUS 1 9.739199980590329e-05 1.842511976360953e-05 0.00013124100223649293 8.643430116006656e-06 33 251446 3.6041201383341104e-05 1.6271943772428156e-05 5 138730 Gtt/Att Gtt/Att 0 0 NA NA NA NA NA NA I626S NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.4480542242527008 82.89003148674966 H 0.9977712631225586 2.403837243036833e-05 0.0022047683596611023 H 0.0006073297117836772 0.994398295879364 0.003191959811374545 7.452937552443473e-06 1.0996926903317217e-05 0.00015097555296961218 0.0011094619985669851 0.0005235215066932142 -64.04900360107422 -43.20073699951172 0.0013905027881264687 H 0.4970414201183432 H 0.4142011834319527 NA NA H 0.5029585798816568 H 0.4911242603550296 NA NA H 0.40236686390532544 NA NA H 0.4911242603550296 H 0.3727810650887574 NA NA NA NA NA NA H 0.3076923076923077 NA NA H 0.4556213017751479 H 0.4201183431952663 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.98 0.0 0.0 0.98 0.0 1877T>G S627N NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.011988222599029541 1.4050196886062625 H 0.9980831146240234 3.25209584843833e-05 0.0018844445003196601 H 0.0007906363462097943 0.9951348900794984 0.0026132299099117517 2.737974000410759e-06 1.2596314263646493e-05 0.00010337427374906838 0.0008635979611426593 0.0004790339153259993 -64.88317108154297 -40.1667594909668 0.0002578726271167397 H 0.030769230769230767 H 0.04615384615384616 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.061538461538461535 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.007692307692307694 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA H 0.05384615384615385 NA NA H 0.038461538461538464 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 1880G>A S627R NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.011988222599029541 1.4050196886062625 H 0.9980831146240234 3.25209584843833e-05 0.0018844445003196601 H 0.0007906363462097943 0.9951348900794984 0.0026132299099117517 2.737974000410759e-06 1.2596314263646493e-05 0.00010337427374906838 0.0008635979611426593 0.0004790339153259993 -64.88317108154297 -40.1667594909668 0.0002578726271167397 H 0.030769230769230767 H 0.04615384615384616 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.061538461538461535 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.007692307692307694 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA H 0.05384615384615385 NA NA H 0.038461538461538464 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1881C>G Y628C NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.17259907722473145 36.88442280292511 H 0.9985641837120056 5.9603644331218675e-06 0.0014298928435891867 H 0.0003909336810465902 0.99717378616333 0.0014459686353802679 8.129067055051564e-07 1.954004574145074e-06 7.562923565274104e-05 0.0005059103132225573 0.0004049658891744912 -63.61716079711914 -42.10655975341797 0.00037859819713048637 H 0.4504504504504505 H 0.2702702702702703 NA NA H 0.4369369369369369 H 0.2117117117117117 NA NA H 0.14864864864864866 NA NA H 0.13963963963963966 H 0.12612612612612611 NA NA NA NA NA NA H 0.2117117117117117 NA NA H 0.20270270270270271 H 0.19369369369369369 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.315290076803648e-06 1.832219668895824e-05 NA NA NA NA 7.315290076803648e-06 1.832219668895824e-05 1 136700 NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA Y628H NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.17259907722473145 36.88442280292511 H 0.9985641837120056 5.9603644331218675e-06 0.0014298928435891867 H 0.0003909336810465902 0.99717378616333 0.0014459686353802679 8.129067055051564e-07 1.954004574145074e-06 7.562923565274104e-05 0.0005059103132225573 0.0004049658891744912 -63.61716079711914 -42.10655975341797 0.00037859819713048637 H 0.4504504504504505 H 0.2702702702702703 NA NA H 0.4369369369369369 H 0.2117117117117117 NA NA H 0.14864864864864866 NA NA H 0.13963963963963966 H 0.12612612612612611 NA NA NA NA NA NA H 0.2117117117117117 NA NA H 0.20270270270270271 H 0.19369369369369369 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9769702198100285e-06 9.136100303922329e-06 3.9769702198100285e-06 9.136100303922329e-06 1 251448 NA NA NA NA Tat/Cat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y628S NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.17259907722473145 36.88442280292511 H 0.9985641837120056 5.9603644331218675e-06 0.0014298928435891867 H 0.0003909336810465902 0.99717378616333 0.0014459686353802679 8.129067055051564e-07 1.954004574145074e-06 7.562923565274104e-05 0.0005059103132225573 0.0004049658891744912 -63.61716079711914 -42.10655975341797 0.00037859819713048637 H 0.4504504504504505 H 0.2702702702702703 NA NA H 0.4369369369369369 H 0.2117117117117117 NA NA H 0.14864864864864866 NA NA H 0.13963963963963966 H 0.12612612612612611 NA NA NA NA NA NA H 0.2117117117117117 NA NA H 0.20270270270270271 H 0.19369369369369369 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 872386 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I630T NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.3823783099651337 70.73998734354974 H 0.997474491596222 6.9861252995906415e-06 0.0025184196420013905 H 0.0005095061496831477 0.9945273995399476 0.002615518169477582 4.1483590393909245e-06 3.0015971788088787e-06 0.0001832809211919084 0.0014970906777307393 0.0006599579355679452 -65.30849456787111 -42.20673370361328 0.0007840766338631513 H 0.3254437869822485 H 0.38461538461538464 NA NA H 0.3195266272189349 H 0.4556213017751479 NA NA H 0.3727810650887574 NA NA H 0.38461538461538464 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA NA NA H 0.3964497041420119 NA NA H 0.4260355029585799 H 0.3076923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.954499778861646e-06 8.185772760324938e-06 7.954499778861646e-06 8.185772760324938e-06 2 251430 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I630V NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.3823783099651337 70.73998734354974 H 0.997474491596222 6.9861252995906415e-06 0.0025184196420013905 H 0.0005095061496831477 0.9945273995399476 0.002615518169477582 4.1483590393909245e-06 3.0015971788088787e-06 0.0001832809211919084 0.0014970906777307393 0.0006599579355679452 -65.30849456787111 -42.20673370361328 0.0007840766338631513 H 0.3254437869822485 H 0.38461538461538464 NA NA H 0.3195266272189349 H 0.4556213017751479 NA NA H 0.3727810650887574 NA NA H 0.38461538461538464 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA NA NA H 0.3964497041420119 NA NA H 0.4260355029585799 H 0.3076923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.5062700185808353e-05 1.6501581533249984e-05 NA NA NA NA 1.5062700185808353e-05 1.6501581533249984e-05 2 132778 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA Y634C NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.2720111608505249 58.12878507375717 H 0.9886695742607116 1.466630601498764e-05 0.011315833777189256 H 0.0015766447177156804 0.983612596988678 0.003936199005693197 1.3080868484394161e-05 7.5235120675642975e-06 0.0009661196381784977 0.005399034824222325 0.0044888053089380256 -68.10623168945311 -40.903167724609375 0.001969375647604465 H 0.427927927927928 H 0.30180180180180183 NA NA H 0.4189189189189189 H 0.2432432432432433 NA NA H 0.15765765765765766 NA NA H 0.2477477477477477 H 0.2882882882882883 NA NA NA NA NA NA H 0.16216216216216214 NA NA H 0.2792792792792793 H 0.2792792792792793 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 553800 VUS 1 1.3021857608250458e-05 1.9541209081145695e-05 1.1934799658774866e-05 8.820482703188491e-06 3 251366 1.5082499885465948e-05 1.7437257159192313e-05 2 132604 tAt/tGt tAt/tGt 0 0 NA NA NA NA NA NA Y634F NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.2720111608505249 58.12878507375717 H 0.9886695742607116 1.466630601498764e-05 0.011315833777189256 H 0.0015766447177156804 0.983612596988678 0.003936199005693197 1.3080868484394161e-05 7.5235120675642975e-06 0.0009661196381784977 0.005399034824222325 0.0044888053089380256 -68.10623168945311 -40.903167724609375 0.001969375647604465 H 0.427927927927928 H 0.30180180180180183 NA NA H 0.4189189189189189 H 0.2432432432432433 NA NA H 0.15765765765765766 NA NA H 0.2477477477477477 H 0.2882882882882883 NA NA NA NA NA NA H 0.16216216216216214 NA NA H 0.2792792792792793 H 0.2792792792792793 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 1901A>T I635V NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.09002262353897095 16.654185354709625 H 0.973223090171814 7.589826418552548e-05 0.026700971648097042 H 0.0043578422628343105 0.9687211513519288 0.004630189388990402 3.4965501981787384e-05 4.155734495725483e-05 0.0018776238430291414 0.01126400288194418 0.00907258503139019 -68.8160400390625 -37.52950668334961 0.002478854963555932 H 0.10059171597633136 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.08875739644970414 H 0.035502958579881665 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.01183431952662722 H 0.01183431952662722 NA NA NA NA NA NA H 0.035502958579881665 NA NA H 0.04142011834319527 H 0.02958579881656805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981840109190672e-06 9.105695589569447e-06 3.981840109190672e-06 9.105695589569447e-06 1 251140 NA NA NA NA Att/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S636A NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.3493143916130066 40.93964669704437 H 0.9383174777030944 0.00020645276526920492 0.06147606298327446 H 0.017487335950136185 0.9169212579727172 0.0070830294862389565 7.67050587455742e-05 0.00011285013897577299 0.005029826890677214 0.03585835173726082 0.0174306221306324 -66.78722381591797 -35.74766159057617 0.0044019995257258415 H 0.09230769230769233 H 0.09230769230769233 NA NA H 0.09230769230769233 H 0.15384615384615385 NA NA H 0.1 NA NA H 0.061538461538461535 H 0.12307692307692307 NA NA NA NA NA NA H 0.14615384615384616 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.2384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979239863838302e-06 8.464866349983461e-06 3.979239863838302e-06 8.464866349983461e-06 1 251304 NA NA NA NA Tcc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L637V NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA e 0.5140109658241272 94.11540784239769 H 0.8768495321273804 0.0005918460083194077 0.1225586161017418 H 0.024058587849140167 0.8546603322029114 0.008243758231401443 0.00022523182269651445 0.0004508545098360628 0.011027317494153976 0.05618809908628464 0.04514583572745323 -67.71250152587889 -37.61669158935547 0.019163891673088074 H 0.6585365853658537 H 0.6524390243902439 NA NA H 0.6646341463414634 H 0.8231707317073171 NA NA H 0.6890243902439024 NA NA H 0.6585365853658537 H 0.6829268292682927 NA NA NA NA NA NA H 0.6402439024390244 NA NA H 0.7621951219512195 H 0.8048780487804879 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979119810537668e-06 8.459299278861238e-06 3.979119810537668e-06 8.459299278861238e-06 1 251312 NA NA NA NA Cta/Gta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A638G NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|30 NA NA NA NA b 0.17930868268013 19.759816831350328 H 0.788655698299408 0.00040104571962729096 0.21094322204589844 H 0.02242281660437584 0.7847933769226074 0.01028964016586542 0.00015758146764710546 0.0002090340422000736 0.013381063006818295 0.11005719751119614 0.05868922919034957 -71.23382568359375 -28.30401992797852 0.025225371122360236 T 0.4245283018867925 H 0.29245283018867924 NA NA T 0.4245283018867925 T 0.16981132075471694 NA NA S 0.330188679245283 NA NA H 0.14150943396226415 H 0.2452830188679245 NA NA NA NA NA NA S 0.330188679245283 NA NA H 0.3113207547169811 H 0.16981132075471694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 1913C>G G640R NA TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4610969424247742 36.28832936882973 C 0.19362176954746246 0.005551764275878668 0.8008264899253845 T 0.046388398855924606 0.15935955941677096 0.003500793594866991 0.0033726752735674377 0.003390497760847211 0.14574889838695526 0.3330194056034088 0.305219829082489 -51.20137405395508 -6.972512245178223 0.04115041717886925 T 0.3809523809523809 S 0.2261904761904762 NA NA T 0.3690476190476191 - 0.2261904761904762 NA NA - 0.32142857142857145 NA NA - 0.023809523809523808 - 0.08333333333333333 NA NA NA NA NA NA - 0.4642857142857143 NA NA S 0.19047619047619047 - 0.08333333333333333 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 842695 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA M642I NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3794551491737366 75.92897534966468 C 0.1760771870613098 0.025093555450439453 0.7988292574882507 C 0.06681615859270096 0.11271976679563522 0.0010264335433021188 0.0125441150739789 0.015569823794066906 0.11980847269296645 0.11407604813575745 0.5574391484260559 -79.83350372314453 44.938812255859375 0.11298509687185287 S 0.32446808510638303 - 0.5212765957446809 NA NA S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7180851063829787 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A 92701 benign 2 0.7330042009381136 1.11144306695484e-05 0.7291011956449438 1.039400820977293e-05 1,174136 238838,238838 0.7399970293045044 3.936389518755868e-06 98646 133306 atG/atT,atG/atC atG/atC 0,66404 37704 NA NA NA NA NA NA M642K NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3794551491737366 75.92897534966468 C 0.1760771870613098 0.025093555450439453 0.7988292574882507 C 0.06681615859270096 0.11271976679563522 0.0010264335433021188 0.0125441150739789 0.015569823794066906 0.11980847269296645 0.11407604813575745 0.5574391484260559 -79.83350372314453 44.938812255859375 0.11298509687185287 S 0.32446808510638303 - 0.5212765957446809 NA NA S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7180851063829787 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 5.279162871790721e-06 2.1426023145864268e-05 3.987529908044961e-06 9.699182844344193e-06 1 250782 7.808470400050282e-06 1.910498154929993e-05 1 128066 aTg/aAg aTg/aAg 0 0 NA NA NA NA NA NA M642L NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3794551491737366 75.92897534966468 C 0.1760771870613098 0.025093555450439453 0.7988292574882507 C 0.06681615859270096 0.11271976679563522 0.0010264335433021188 0.0125441150739789 0.015569823794066906 0.11980847269296645 0.11407604813575745 0.5574391484260559 -79.83350372314453 44.938812255859375 0.11298509687185287 S 0.32446808510638303 - 0.5212765957446809 NA NA S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7180851063829787 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 7.4018098530359575e-06 1.653300680398772e-05 NA NA NA NA 7.4018098530359575e-06 1.653300680398772e-05 1 135102 NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA M642T NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3794551491737366 75.92897534966468 C 0.1760771870613098 0.025093555450439453 0.7988292574882507 C 0.06681615859270096 0.11271976679563522 0.0010264335433021188 0.0125441150739789 0.015569823794066906 0.11980847269296645 0.11407604813575745 0.5574391484260559 -79.83350372314453 44.938812255859375 0.11298509687185287 S 0.32446808510638303 - 0.5212765957446809 NA NA S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.7180851063829787 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 7.808470400050282e-06 1.6844409888304067e-05 NA NA NA NA 7.808470400050282e-06 1.6844409888304067e-05 1 128066 NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA R646C NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.4947535991668701 113.29857420921326 H 0.5198042988777161 0.07314801216125487 0.4070476293563843 H 0.13355140388011932 0.38731980323791504 0.00991003680974245 0.006842539180070162 0.06921632587909697 0.0609489344060421 0.1036863699555397 0.22852449119091034 -73.81770324707031 -27.13238525390625 0.07123750448226929 H 0.10483870967741936 T 0.8991935483870968 NA NA H 0.10080645161290322 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9879032258064516 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 1.3479762500454413e-05 2.1775430292975026e-05 1.6037700333981775e-05 9.650293381862336e-06 4 249412 8.229500053857919e-06 1.952027669087193e-05 1 121514 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R646G NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.4947535991668701 113.29857420921326 H 0.5198042988777161 0.07314801216125487 0.4070476293563843 H 0.13355140388011932 0.38731980323791504 0.00991003680974245 0.006842539180070162 0.06921632587909697 0.0609489344060421 0.1036863699555397 0.22852449119091034 -73.81770324707031 -27.13238525390625 0.07123750448226929 H 0.10483870967741936 T 0.8991935483870968 NA NA H 0.10080645161290322 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9879032258064516 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 8.229500053857919e-06 1.7932367868775064e-05 NA NA NA NA 8.229500053857919e-06 1.7932367868775064e-05 1 121514 NA Cgc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA R646H NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.4947535991668701 113.29857420921326 H 0.5198042988777161 0.07314801216125487 0.4070476293563843 H 0.13355140388011932 0.38731980323791504 0.00991003680974245 0.006842539180070162 0.06921632587909697 0.0609489344060421 0.1036863699555397 0.22852449119091034 -73.81770324707031 -27.13238525390625 0.07123750448226929 H 0.10483870967741936 T 0.8991935483870968 NA NA H 0.10080645161290322 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.9879032258064516 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A 181451 VUS 1 0.00015905807835612262 1.7550944261511707e-05 6.382330320775509e-05 8.289630413534505e-06 16 250692 0.0003388150071259588 1.5469895671196184e-05 45 132816 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA R647S NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.4176754653453827 95.64768156409264 H 0.5301406383514404 0.12264426052570344 0.3472150862216949 H 0.1210697740316391 0.3807529807090759 0.018292270600795742 0.011337297968566421 0.10977835208177568 0.06766483932733536 0.08677799999713898 0.20432651042938232 -80.1345443725586 -22.300880432128906 0.043497458100318916 H 0.7137096774193549 T 0.3911290322580645 NA NA H 0.6935483870967742 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.4919354838709678 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 1.5988700397429056e-05 9.146896069065418e-06 1.5988700397429056e-05 9.146896069065418e-06 4 250176 NA NA NA NA agG/agC NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L648P NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA b 0.2384166717529297 43.65409259796142 H 0.4940460920333862 0.16105110943317413 0.34490275382995605 H 0.09838812798261642 0.3731048107147217 0.03207018971443176 0.01388577837496996 0.13863123953342438 0.06199729815125465 0.06210480630397796 0.219817727804184 -82.20418548583984 -20.808837890625 0.04389432817697525 H 0.054878048780487805 T 0.475609756097561 NA NA H 0.06097560975609756 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5304878048780488 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 4.062369953317102e-06 9.130054431744984e-06 4.062369953317102e-06 9.130054431744984e-06 1 246162 NA NA NA NA cTt/cCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L649R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.3207510709762573 58.729521095752716 H 0.4580957889556885 0.1193789690732956 0.4225252866744995 H 0.07352793961763382 0.3781920969486237 0.045819465070962906 0.015345085412263869 0.09341061860322952 0.08628839999437332 0.1166154444217682 0.19080087542533875 -77.29815673828125 -23.389102935791016 0.050726257264614105 H 0.018292682926829267 T 0.5548780487804879 NA NA H 0.018292682926829267 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.5975609756097561 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 4.207230176689336e-06 8.96436288106311e-06 4.207230176689336e-06 8.96436288106311e-06 1 237686 NA NA NA NA cTg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V650= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.29586875438690186 45.47502754926681 C 0.3521583080291748 0.1602030247449875 0.4876386523246765 C 0.0631101205945015 0.28097668290138245 0.02666182070970536 0.023348335176706314 0.1349806934595108 0.08210401237010956 0.09191273897886276 0.2969056367874145 -87.8226318359375 24.33102035522461 0.031417760998010635 H 0.4014084507042254 T 0.1056338028169014 NA NA H 0.4084507042253521 - 1.0 NA NA - 0.852112676056338 NA NA - 0.7394366197183099 - 0.8661971830985915 NA NA NA NA NA NA - 0.8802816901408451 NA NA T 0.06338028169014084 - 1.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.78 0.78 0.0 0.0 0.0 1950G>A V650E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.29586875438690186 45.47502754926681 C 0.3521583080291748 0.1602030247449875 0.4876386523246765 C 0.0631101205945015 0.28097668290138245 0.02666182070970536 0.023348335176706314 0.1349806934595108 0.08210401237010956 0.09191273897886276 0.2969056367874145 -87.8226318359375 24.33102035522461 0.031417760998010635 H 0.4014084507042254 T 0.1056338028169014 NA NA H 0.4084507042253521 - 1.0 NA NA - 0.852112676056338 NA NA - 0.7394366197183099 - 0.8661971830985915 NA NA NA NA NA NA - 0.8802816901408451 NA NA T 0.06338028169014084 - 1.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 1949T>A V650M Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA TURN|8 NA NA NA e 0.29586875438690186 45.47502754926681 C 0.3521583080291748 0.1602030247449875 0.4876386523246765 C 0.0631101205945015 0.28097668290138245 0.02666182070970536 0.023348335176706314 0.1349806934595108 0.08210401237010956 0.09191273897886276 0.2969056367874145 -87.8226318359375 24.33102035522461 0.031417760998010635 H 0.4014084507042254 T 0.1056338028169014 NA NA H 0.4084507042253521 - 1.0 NA NA - 0.852112676056338 NA NA - 0.7394366197183099 - 0.8661971830985915 NA NA NA NA NA NA - 0.8802816901408451 NA NA T 0.06338028169014084 - 1.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979540103202452e-06 1.6051629474998018e-05 NA NA NA NA 6.979540103202452e-06 1.6051629474998018e-05 1 143276 NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA D651A Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4429016709327698 63.822130781412106 C 0.33614692091941833 0.08826588839292526 0.5755872130393982 C 0.07060161978006363 0.26219677925109863 0.012588800862431526 0.013238902203738693 0.07364233583211899 0.09737364202737807 0.1265103667974472 0.3438476622104645 -86.34337615966797 19.724573135375977 0.01493195630609989 H 0.5460122699386503 S 0.12883435582822084 NA NA H 0.5521472392638037 - 0.3987730061349693 NA NA - 0.4294478527607362 NA NA - 0.5214723926380368 - 0.5276073619631901 NA NA NA NA NA NA - 0.4294478527607362 NA NA S 0.11042944785276074 - 0.5950920245398773 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.977219866006635e-06 8.298473819106144e-06 7.977219866006635e-06 8.298473819106144e-06 2 250714 NA NA NA NA gAt/gCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D651Y Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4429016709327698 63.822130781412106 C 0.33614692091941833 0.08826588839292526 0.5755872130393982 C 0.07060161978006363 0.26219677925109863 0.012588800862431526 0.013238902203738693 0.07364233583211899 0.09737364202737807 0.1265103667974472 0.3438476622104645 -86.34337615966797 19.724573135375977 0.01493195630609989 H 0.5460122699386503 S 0.12883435582822084 NA NA H 0.5521472392638037 - 0.3987730061349693 NA NA - 0.4294478527607362 NA NA - 0.5214723926380368 - 0.5276073619631901 NA NA NA NA NA NA - 0.4294478527607362 NA NA S 0.11042944785276074 - 0.5950920245398773 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1966500096605161e-05 9.081032034658543e-06 1.1966500096605161e-05 9.081032034658543e-06 3 250700 NA NA NA NA Gat/Tat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S652L Sterol-sensing NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1657974123954773 19.43145673274994 C 0.2688308954238892 0.06068918481469154 0.670479953289032 C 0.0292447991669178 0.26117143034935003 0.010972126387059687 0.011505570262670515 0.03688473254442215 0.12472648173570633 0.08009956777095795 0.4453952610492706 -91.27392578125 98.58135986328124 0.013090902008116244 H 0.04615384615384616 - 0.13846153846153847 NA NA H 0.038461538461538464 - 0.3923076923076923 NA NA - 0.3230769230769231 NA NA - 0.4461538461538462 - 0.4307692307692308 NA NA NA NA NA NA S 0.2153846153846154 NA NA - 0.13076923076923078 - 0.38461538461538464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0153525907119529e-05 1.804105574990575e-05 7.977409950399306e-06 7.865686539499311e-06 2 250708 1.3962199773231989e-05 1.6236091519622157e-05 2 143244 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA I658T Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.31982749700546265 59.16808694601059 H 0.991366684436798 0.0003426817711442709 0.008290599100291729 H 0.002302710432559252 0.9715442061424256 0.01836518011987209 7.66047669458203e-05 0.0001837377494666725 0.0009312011534348132 0.004347623325884342 0.0022487486712634568 -67.76725769042969 -43.281211853027344 0.0010841572657227516 H 0.1893491124260355 H 0.4556213017751479 NA NA H 0.17751479289940827 H 0.4970414201183432 NA NA H 0.4260355029585799 NA NA H 0.4556213017751479 H 0.4260355029585799 NA NA NA NA NA NA H 0.4437869822485207 NA NA H 0.4378698224852071 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981429927080171e-06 8.909021821124608e-06 3.981429927080171e-06 8.909021821124608e-06 1 251166 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I658V Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.31982749700546265 59.16808694601059 H 0.991366684436798 0.0003426817711442709 0.008290599100291729 H 0.002302710432559252 0.9715442061424256 0.01836518011987209 7.66047669458203e-05 0.0001837377494666725 0.0009312011534348132 0.004347623325884342 0.0022487486712634568 -67.76725769042969 -43.281211853027344 0.0010841572657227516 H 0.1893491124260355 H 0.4556213017751479 NA NA H 0.17751479289940827 H 0.4970414201183432 NA NA H 0.4260355029585799 NA NA H 0.4556213017751479 H 0.4260355029585799 NA NA NA NA NA NA H 0.4437869822485207 NA NA H 0.4378698224852071 H 0.4792899408284024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978760211495682e-06 1.4759915631736425e-05 NA NA NA NA 6.978760211495682e-06 1.4759915631736425e-05 1 143292 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA A659T Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.08087509870529175 8.912435877323151 H 0.9936150312423706 0.00016914714069571346 0.006215773057192564 H 0.0026105325669050217 0.9721763134002686 0.018697589635849 2.81274024018785e-05 7.202269625850022e-05 0.0005788804264739156 0.004395007621496916 0.0014415231999009848 -65.49177551269531 -40.05041122436523 0.00018551578978076577 H 0.02830188679245283 H 0.16981132075471694 NA NA H 0.03773584905660377 H 0.29245283018867924 NA NA H 0.16981132075471694 NA NA H 0.2075471698113208 H 0.1792452830188679 NA NA NA NA NA NA H 0.19811320754716985 NA NA H 0.1509433962264151 H 0.14150943396226415 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7747725326257394e-05 1.6568071454256006e-05 1.592619992152322e-05 8.243825527148763e-06 4 251158 2.094119918183424e-05 1.4371511138055845e-05 3 143258 Gcg/Acg Gcg/Acg 0 0 NA NA NA NA NA NA A659V Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.08087509870529175 8.912435877323151 H 0.9936150312423706 0.00016914714069571346 0.006215773057192564 H 0.0026105325669050217 0.9721763134002686 0.018697589635849 2.81274024018785e-05 7.202269625850022e-05 0.0005788804264739156 0.004395007621496916 0.0014415231999009848 -65.49177551269531 -40.05041122436523 0.00018551578978076577 H 0.02830188679245283 H 0.16981132075471694 NA NA H 0.03773584905660377 H 0.29245283018867924 NA NA H 0.16981132075471694 NA NA H 0.2075471698113208 H 0.1792452830188679 NA NA NA NA NA NA H 0.19811320754716985 NA NA H 0.1509433962264151 H 0.14150943396226415 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.7889482145912764e-05 1.7137192228194478e-05 3.981780173489824e-05 8.833000700726371e-06 10 251144 6.9798297772649676e-06 1.4685416442411731e-05 1 143270 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA G660S Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.015556037425994871 1.2242601454257966 H 0.9958794116973876 6.566203228430821e-05 0.004054953809827564 H 0.0019465340301394465 0.9684146046638488 0.02661795727908612 8.425707164860796e-06 2.6733616323326714e-05 0.00038793659768998623 0.0014509685570374133 0.001146871829405427 -65.24156951904297 -39.02855682373047 8.785767568042502e-05 H 0.08333333333333333 H 0.0 NA NA H 0.07142857142857142 H 0.08333333333333333 NA NA H 0.0 NA NA H 0.047619047619047616 H 0.023809523809523808 NA NA NA NA NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.023809523809523808 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 558673 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I661L Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.2785043716430664 51.523308753967285 H 0.98958021402359 0.0001373476698063314 0.010282545350492 H 0.0036101792939007282 0.9403939843177797 0.04695487767457962 2.1428222680697214e-05 5.732663339585997e-05 0.0009888462955132127 0.0058808964677155035 0.0020924475975334644 -69.59174346923828 -40.70380783081055 0.0004058248014189304 H 0.5798816568047337 H 0.07692307692307693 NA NA H 0.5680473372781065 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.04733727810650888 NA NA H 0.08284023668639054 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA H 0.0650887573964497 NA NA H 0.10059171597633136 H 0.17751479289940827 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.960709808685351e-06 9.369731751544086e-06 7.960709808685351e-06 9.369731751544086e-06 2 251234 NA NA NA NA Atc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L662M Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.3422979712486267 62.67475853562354 H 0.9873492121696472 0.00016743062587920576 0.01248329784721136 H 0.004951704293489456 0.9417448043823242 0.03908931091427803 4.479068957152776e-05 7.617997471243143e-05 0.0012255655601620676 0.010593567974865437 0.0022740289568901053 -69.40897369384766 -38.872859954833984 0.00031990735442377627 H 0.14634146341463414 H 0.6463414634146342 NA NA H 0.14634146341463414 H 0.6280487804878049 NA NA H 0.5853658536585366 NA NA H 0.5487804878048781 H 0.573170731707317 NA NA NA NA NA NA H 0.6036585365853658 NA NA H 0.6402439024390244 H 0.5792682926829268 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.602640800255586e-06 1.8971745865571452e-05 3.9795900192984845e-06 9.172993102646845e-06 1 251282 1.3955000213172754e-05 1.6606725707574658e-05 2 143318 Ttg/Atg Ttg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA L662W Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.3422979712486267 62.67475853562354 H 0.9873492121696472 0.00016743062587920576 0.01248329784721136 H 0.004951704293489456 0.9417448043823242 0.03908931091427803 4.479068957152776e-05 7.617997471243143e-05 0.0012255655601620676 0.010593567974865437 0.0022740289568901053 -69.40897369384766 -38.872859954833984 0.00031990735442377627 H 0.14634146341463414 H 0.6463414634146342 NA NA H 0.14634146341463414 H 0.6280487804878049 NA NA H 0.5853658536585366 NA NA H 0.5487804878048781 H 0.573170731707317 NA NA NA NA NA NA H 0.6036585365853658 NA NA H 0.6402439024390244 H 0.5792682926829268 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9795900192984845e-06 8.028175243722626e-06 3.9795900192984845e-06 8.028175243722626e-06 1 251282 NA NA NA NA tTg/tGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I663M Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.024243205785751343 4.4849930703639975 H 0.992733597755432 9.936199785443024e-05 0.00716691929847002 H 0.0026455551851540804 0.9757188558578492 0.014206748455762863 1.8097967767971568e-05 3.452728560660035e-05 0.0007125105476006868 0.0052346885204315186 0.0014289675746113062 -65.5120849609375 -38.98423385620117 0.00012534766574390233 H 0.3195266272189349 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.33136094674556216 H 0.059171597633136085 NA NA H 0.05325443786982249 NA NA H 0.04733727810650888 H 0.08875739644970414 NA NA NA NA NA NA H 0.059171597633136085 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.0650887573964497 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 596599 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I663N Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.024243205785751343 4.4849930703639975 H 0.992733597755432 9.936199785443024e-05 0.00716691929847002 H 0.0026455551851540804 0.9757188558578492 0.014206748455762863 1.8097967767971568e-05 3.452728560660035e-05 0.0007125105476006868 0.0052346885204315186 0.0014289675746113062 -65.5120849609375 -38.98423385620117 0.00012534766574390233 H 0.3195266272189349 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.33136094674556216 H 0.059171597633136085 NA NA H 0.05325443786982249 NA NA H 0.04733727810650888 H 0.08875739644970414 NA NA NA NA NA NA H 0.059171597633136085 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.0650887573964497 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979239863838302e-06 8.930414955257095e-06 3.979239863838302e-06 8.930414955257095e-06 1 251304 NA NA NA NA aTc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V664L Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.09042394161224364 13.898159825801844 H 0.9974687099456788 1.414587222825503e-05 0.002517146756872535 H 0.0009315385832451283 0.9935000538825988 0.0034858586732298136 2.6101674848177936e-06 5.3644057516066815e-06 0.00028315110830590134 0.001105983625166118 0.0006854054518043995 -64.3929443359375 -41.704795837402344 8.265291398856789e-05 H 0.2112676056338028 H 0.014084507042253518 NA NA H 0.2112676056338028 H 0.11267605633802814 NA NA H 0.0 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.007042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.958809874253348e-06 9.054671027243553e-06 7.958809874253348e-06 9.054671027243553e-06 2 251294 NA NA NA NA Gtg/Ctg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V664M Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.09042394161224364 13.898159825801844 H 0.9974687099456788 1.414587222825503e-05 0.002517146756872535 H 0.0009315385832451283 0.9935000538825988 0.0034858586732298136 2.6101674848177936e-06 5.3644057516066815e-06 0.00028315110830590134 0.001105983625166118 0.0006854054518043995 -64.3929443359375 -41.704795837402344 8.265291398856789e-05 H 0.2112676056338028 H 0.014084507042253518 NA NA H 0.2112676056338028 H 0.11267605633802814 NA NA H 0.0 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.007042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 370601 pathogenic 2 1.013699216653678e-05 1.8030564076866568e-05 7.958809874253348e-06 8.275989301510692e-06 2 251294 1.3956700058770364e-05 1.6019027498923637e-05 2 143300 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA L665P Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.4116936028003693 75.38109867274761 H 0.9975282549858092 1.722314482321963e-05 0.0024544785264879465 H 0.0015587505185976624 0.9875414967536926 0.008367550559341908 8.215407433453947e-06 6.905767349962844e-06 0.0002341900544706732 0.0016377962892875073 0.0006451965309679508 -66.05599975585939 -42.914222717285156 0.0003272771427873522 H 0.2621951219512195 H 0.4817073170731707 NA NA H 0.2621951219512195 H 0.5975609756097561 NA NA H 0.4268292682926829 NA NA H 0.4024390243902439 H 0.4695121951219512 NA NA NA NA NA NA H 0.4451219512195122 NA NA H 0.5121951219512195 H 0.4390243902439024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979209850513144e-06 7.585137119734769e-06 3.979209850513144e-06 7.585137119734769e-06 1 251306 NA NA NA NA cTg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S666N Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.20007479190826416 23.44876561164856 H 0.9975801706314088 2.1524201656575315e-05 0.002398297656327486 H 0.0008338051848113537 0.9917786717414856 0.004813550505787134 1.1190458280907476e-05 9.432130354980472e-06 0.00022989847639109947 0.001684243674390018 0.0006390397320501506 -67.00765228271484 -39.8638916015625 0.00017668954387772828 T 0.6846153846153846 H 0.16923076923076924 NA NA T 0.676923076923077 H 0.2769230769230769 NA NA H 0.19230769230769232 NA NA H 0.13846153846153847 H 0.24615384615384614 NA NA NA NA NA NA H 0.2076923076923077 NA NA H 0.16923076923076924 H 0.18461538461538465 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.1283975667280453e-05 2.0951006463434e-05 1.5923600585665554e-05 8.312222481481301e-06 4 251200 3.208469934179448e-05 1.9231526960936044e-05 4 124670 aGc/aAc aGc/aAc 0 0 NA NA NA NA NA NA V668L Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.16593647003173828 25.504435443878172 H 0.998513400554657 6.663884505542227e-06 0.0014798863558098676 H 0.000523756374605 0.9946680068969728 0.0036254404112696648 9.819879096539808e-07 2.2341107523971004e-06 8.665534551255405e-05 0.0007001209887675941 0.0003927614889107645 -66.36873626708984 -40.60221862792969 7.280863792402671e-05 - 0.5704225352112676 H 0.15492957746478872 NA NA - 0.5704225352112676 H 0.15492957746478872 NA NA H 0.1267605633802817 NA NA H 0.14084507042253522 H 0.09859154929577464 NA NA NA NA NA NA H 0.11971830985915492 NA NA H 0.17605633802816897 H 0.14788732394366194 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9791498238628265e-06 9.430943052555285e-06 3.9791498238628265e-06 9.430943052555285e-06 1 251310 NA NA NA NA Gtg/Ctg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L672= Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.2667253017425537 48.837402749061575 H 0.9916396737098694 7.01190801919438e-05 0.008290213532745838 H 0.0031270247418433428 0.9807847738265992 0.008240357041358948 1.7097725503845137e-05 2.8608190405066125e-05 0.0007579512894153595 0.00503955315798521 0.0020047028083354235 -66.85575866699219 -40.27346801757813 0.00028993241721764207 S 0.5487804878048781 H 0.15853658536585366 NA NA S 0.5487804878048781 H 0.17682926829268292 NA NA H 0.201219512195122 NA NA H 0.0975609756097561 H 0.07317073170731707 NA NA NA NA NA NA H 0.201219512195122 NA NA H 0.12804878048780488 H 0.23170731707317074 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.0 0.0 0.0 2016G>A G673V Sterol-sensing TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA b 0.1539384424686432 12.114955422282224 H 0.9960642457008362 2.5907673261826848e-05 0.003909909632056952 H 0.0019921106286346912 0.9918935298919678 0.0029815675225108858 6.635569661739282e-06 9.807896276470274e-06 0.0003628309641499072 0.001867943909019232 0.0008855661144480109 -66.29685211181639 -41.68264389038086 0.0003175390302203596 T 0.42857142857142855 H 0.0 NA NA T 0.4166666666666667 H 0.011904761904761904 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 554148 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S676G Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.3574146330356598 41.88899499177933 H 0.9823013544082642 9.76855808403343e-05 0.017601005733013153 H 0.018852228298783302 0.9597207307815552 0.004948144778609276 3.011899207194801e-05 3.868963540298864e-05 0.0010773396352306008 0.013172470964491369 0.0021602415945380926 -66.01488494873047 -37.26452255249024 0.00043553402065299446 H 0.12307692307692307 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.13076923076923078 H 0.07692307692307693 NA NA H 0.04615384615384616 NA NA H 0.04615384615384616 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA H 0.06923076923076922 NA NA H 0.038461538461538464 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977349933848018e-06 8.881060850302113e-06 3.977349933848018e-06 8.881060850302113e-06 1 251424 NA NA NA NA Agc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I678V Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA HELIX|31 NA NA NA NA e 0.2885628938674927 53.384135365486145 H 0.5049504041671753 0.00028807760099880403 0.4947615265846253 H 0.01913146860897541 0.4965077042579651 0.003810034366324544 0.00011884831474162642 4.044200250064023e-05 0.02277309074997902 0.44820669293403625 0.009411741048097607 -89.8516616821289 -2.660524845123291 0.0013861746992915867 H 0.3136094674556213 H 0.7514792899408284 NA NA H 0.33136094674556216 H 0.6804733727810651 NA NA H 0.7514792899408284 NA NA H 0.5857988165680473 H 0.6804733727810651 NA NA NA NA NA NA H 0.7514792899408284 NA NA H 0.7514792899408284 H 0.5502958579881657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 596855 VUS 1 1.2667799004874707e-05 1.757273906392101e-05 7.954179636726622e-06 7.682295511322415e-06 2 251440 2.0940700778737664e-05 1.580454029338946e-05 3 143262 Att/Gtt Att/Gtt 0 0 NA NA NA NA NA NA L680V Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13438498973846436 24.605891621112818 C 7.786470087012276e-05 0.015332660637795925 0.9845895171165466 C 3.2420379284303635e-05 1.3609189409180544e-05 6.726752872054931e-06 0.004236297681927681 0.011245527304708958 0.10138440877199173 0.0010602922411635518 0.8820207118988037 -100.92904663085938 135.60861206054688 0.00045375997433438897 H 0.2926829268292683 - 0.201219512195122 NA NA H 0.2865853658536585 - 0.4268292682926829 NA NA - 0.12804878048780488 NA NA - 0.22560975609756095 - 0.3048780487804878 NA NA NA NA NA NA - 0.201219512195122 NA NA - 0.17073170731707318 - 0.23170731707317074 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977119831688469e-06 8.006525910016842e-06 3.977119831688469e-06 8.006525910016842e-06 1 251438 NA NA NA NA Ttg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P681S Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4030275344848633 57.1896071434021 C 0.00027557084104046226 0.024790726602077484 0.9749336838722228 C 4.693999653682114e-05 5.667662480846049e-05 1.4041036138223715e-06 0.00731333764269948 0.013840632513165474 0.015224159695208073 0.0009967845398932695 0.9625200629234314 -72.71635437011719 138.20123291015622 0.00018978564185090363 H 0.1176470588235294 - 0.19117647058823528 NA NA H 0.125 - 0.3235294117647059 NA NA - 0.34558823529411764 NA NA - 0.16911764705882354 - 0.14705882352941174 NA NA NA NA NA NA - 0.4044117647058824 NA NA - 0.3308823529411765 - 0.29411764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9771598494553464e-06 9.241947283315854e-06 3.9771598494553464e-06 9.241947283315854e-06 1 251436 NA NA NA NA Ccc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L682M Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14292767643928528 26.17005755603313 C 0.004706418141722679 0.313930481672287 0.6813631057739258 C 0.0012880859430879354 0.0014529610052704813 6.577999010914937e-05 0.10357213020324707 0.1723807454109192 0.04930363595485687 0.007953123189508915 0.6639835238456726 -110.72218322753906 139.26065063476562 0.0017402503872290256 H 0.03048780487804878 B 0.042682926829268296 NA NA H 0.024390243902439025 - 0.17073170731707318 NA NA - 0.12195121951219512 NA NA B 0.03048780487804878 B 0.12195121951219512 NA NA NA NA NA NA - 0.13414634146341464 NA NA B 0.06097560975609756 - 0.06707317073170732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.599588690448236e-06 1.880406209042872e-05 7.953989552333951e-06 7.843874846665625e-06 2 251446 6.977779776207171e-06 1.7089949633938212e-05 1 143312 Ttg/Atg Ttg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA L682W Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14292767643928528 26.17005755603313 C 0.004706418141722679 0.313930481672287 0.6813631057739258 C 0.0012880859430879354 0.0014529610052704813 6.577999010914937e-05 0.10357213020324707 0.1723807454109192 0.04930363595485687 0.007953123189508915 0.6639835238456726 -110.72218322753906 139.26065063476562 0.0017402503872290256 H 0.03048780487804878 B 0.042682926829268296 NA NA H 0.024390243902439025 - 0.17073170731707318 NA NA - 0.12195121951219512 NA NA B 0.03048780487804878 B 0.12195121951219512 NA NA NA NA NA NA - 0.13414634146341464 NA NA B 0.06097560975609756 - 0.06707317073170732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976999778387835e-06 9.368652012661948e-06 3.976999778387835e-06 9.368652012661948e-06 1 251446 NA NA NA NA tTg/tGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L684F Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.18674975633621216 34.19388038516045 H 0.8982571363449097 0.0012888984056189654 0.1004539206624031 H 0.06259454786777496 0.8297746181488037 0.012814508751034737 0.0005026404978707434 0.0005988985649310052 0.01507293898612261 0.05693109333515167 0.02171069942414761 -63.44990539550781 -34.578048706054695 0.0003946411015931517 H 0.08536585365853659 T 0.5487804878048781 NA NA H 0.08536585365853659 T 0.5670731707317073 NA NA H 0.6585365853658537 NA NA S 0.2682926829268293 S 0.3719512195121951 NA NA NA NA NA NA H 0.6707317073170732 NA NA T 0.38414634146341453 S 0.3048780487804878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 374167 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I685V Sterol-sensing NA Lumenal|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.2088429033756256 38.635937124490745 H 0.9516212344169616 0.0014149969210848212 0.04696376249194145 H 0.06546124815940857 0.8252654075622559 0.04878871142864226 0.00040267157601192594 0.000836593855638057 0.006966949440538883 0.04167759418487549 0.010600857436656952 -64.52427673339844 -38.337196350097656 0.0006843447918072343 H 0.059171597633136085 T 0.07100591715976333 NA NA H 0.05325443786982249 T 0.16568047337278108 NA NA H 0.1301775147928994 NA NA S 0.26627218934911245 S 0.242603550295858 NA NA NA NA NA NA H 0.0650887573964497 NA NA T 0.11834319526627217 S 0.3609467455621302 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 890727 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V686L Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.06816309690475464 10.476667994260787 H 0.9812518358230592 0.0003534934076014906 0.018394641578197483 H 0.0664287880063057 0.7935670614242554 0.1136159524321556 0.0002419565134914592 0.00015445379540324208 0.002795409178361297 0.01902615651488304 0.004170088097453117 -66.955322265625 -37.24029541015625 0.00025127804838120943 H 0.08450704225352113 H 0.007042253521126761 NA NA H 0.08450704225352113 H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 NA NA H 0.04225352112676056 H 0.04225352112676056 NA NA NA NA NA NA H 0.007042253521126761 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.04929577464788732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979340014368062e-06 1.539436141596582e-05 NA NA NA NA 6.979340014368062e-06 1.539436141596582e-05 1 143280 NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA I687M Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.07563638687133789 13.99273157119751 H 0.92952162027359 0.0013755797408521175 0.06910283118486404 H 0.12598523497581482 0.6753091812133789 0.10834072530269624 0.0005790810682810843 0.0006235729670152067 0.008371896110475063 0.06700195372104645 0.01378839835524559 -74.78561401367188 -32.21393203735352 0.0002525490999687463 H 0.05325443786982249 H 0.485207100591716 NA NA H 0.059171597633136085 H 0.5266272189349113 NA NA H 0.4497041420118344 NA NA H 0.2958579881656805 H 0.28994082840236685 NA NA NA NA NA NA H 0.5029585798816568 NA NA H 0.514792899408284 H 0.40828402366863903 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977119831688469e-06 8.865878134655839e-06 3.977119831688469e-06 8.865878134655839e-06 1 251438 NA NA NA NA atT/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E688A Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.11443006992340088 19.990933215618128 H 0.8234717845916748 0.001441572792828083 0.17508673667907715 H 0.1711890995502472 0.5163412094116211 0.092474065721035 0.0005208019283600154 0.0004807166114915161 0.012654407881200314 0.18565396964550016 0.020685674622654915 -78.53119659423828 -25.92120933532715 0.0001958863867912441 H 0.02577319587628866 H 0.30412371134020616 NA NA H 0.030927835051546393 H 0.25773195876288657 NA NA H 0.16494845360824742 NA NA H 0.020618556701030927 H 0.06701030927835051 NA NA NA NA NA NA H 0.15979381443298968 NA NA H 0.2525773195876289 H 0.041237113402061855 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976999778387835e-06 9.084084428245956e-06 3.976999778387835e-06 9.084084428245956e-06 1 251446 NA NA NA NA gAa/gCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I690M Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.17008137702941895 31.465054750442505 H 0.9950556755065918 7.902959623606876e-06 0.004936359822750092 H 0.00250861095264554 0.9824673533439636 0.008572166785597801 6.41615724816802e-06 2.209099193350994e-06 0.0010558213107287884 0.004545249044895172 0.0008421414531767367 -60.99748229980469 -45.74059295654297 0.00010825737263076009 H 0.035502958579881665 H 0.01183431952662722 NA NA H 0.035502958579881665 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.005917159763313609 H 0.005917159763313609 NA NA NA NA NA NA H 0.017751479289940832 NA NA H 0.02366863905325444 H 0.02958579881656805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1931099834328052e-05 9.602052772744507e-06 1.1931099834328052e-05 9.602052772744507e-06 3 251444 NA NA NA NA atC/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I690V Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.17008137702941895 31.465054750442505 H 0.9950556755065918 7.902959623606876e-06 0.004936359822750092 H 0.00250861095264554 0.9824673533439636 0.008572166785597801 6.41615724816802e-06 2.209099193350994e-06 0.0010558213107287884 0.004545249044895172 0.0008421414531767367 -60.99748229980469 -45.74059295654297 0.00010825737263076009 H 0.035502958579881665 H 0.01183431952662722 NA NA H 0.035502958579881665 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.005917159763313609 H 0.005917159763313609 NA NA NA NA NA NA H 0.017751479289940832 NA NA H 0.02366863905325444 H 0.02958579881656805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3959500392957127e-05 1.5702153658666777e-05 NA NA NA NA 1.3959500392957127e-05 1.5702153658666777e-05 2 143272 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA P691L Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.06868156790733337 9.745914486050607 H 0.9964250922203064 6.348248280119151e-05 0.003511474002152681 H 0.009666214697062973 0.9744764566421508 0.011265816166996956 1.2191559108032381e-05 2.5452634872635823e-05 0.0003809985937550664 0.003524731611832977 0.0006480726297013463 -64.31568145751953 -36.61492156982422 0.00014396963524632156 H 0.02205882352941177 H 0.2867647058823529 NA NA H 0.02205882352941177 H 0.2352941176470588 NA NA H 0.21323529411764705 NA NA H 0.09558823529411764 H 0.05147058823529412 NA NA NA NA NA NA H 0.2352941176470588 NA NA H 0.2720588235294117 H 0.11029411764705882 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 552803 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P691Q Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.06868156790733337 9.745914486050607 H 0.9964250922203064 6.348248280119151e-05 0.003511474002152681 H 0.009666214697062973 0.9744764566421508 0.011265816166996956 1.2191559108032381e-05 2.5452634872635823e-05 0.0003809985937550664 0.003524731611832977 0.0006480726297013463 -64.31568145751953 -36.61492156982422 0.00014396963524632156 H 0.02205882352941177 H 0.2867647058823529 NA NA H 0.02205882352941177 H 0.2352941176470588 NA NA H 0.21323529411764705 NA NA H 0.09558823529411764 H 0.05147058823529412 NA NA NA NA NA NA H 0.2352941176470588 NA NA H 0.2720588235294117 H 0.11029411764705882 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 986365 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V694L Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.1676667034626007 25.77037232220173 H 0.9989449381828308 1.4992427168181164e-05 0.0010400705505162477 H 0.0012140936451032758 0.986186981201172 0.011311558075249195 5.6833887356333435e-06 5.850750312674791e-06 0.00011333515431033447 0.0008969781920313836 0.0002655819116625935 -66.29000091552734 -42.12502670288086 0.00012534587585832924 H 0.3380281690140845 H 0.0 NA NA H 0.3380281690140845 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.007042253521126761 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.06338028169014084 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5458983557161687e-05 NA NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5458983557161687e-05 1 143244 NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA L695V Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.09485331177711487 17.36764138638973 H 0.9964480400085448 6.30794747848995e-05 0.0034888312220573425 H 0.003104249015450477 0.9783084988594056 0.013907510787248613 3.181449937983416e-05 2.6246174456900917e-05 0.00044842387433163816 0.0032699815928936005 0.0009032997186295687 -68.10144805908203 -40.18115997314453 0.00017332883726339787 H 0.1097560975609756 H 0.018292682926829267 NA NA H 0.10365853658536583 H 0.07926829268292683 NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.03658536585365853 H 0.006097560975609756 NA NA NA NA NA NA H 0.03658536585365853 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3957699593447613e-05 1.5429849465266927e-05 NA NA NA NA 1.3957699593447613e-05 1.5429849465266927e-05 2 143290 NA Ctg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA V697A Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.1811063289642334 27.836042761802677 H 0.9832162261009216 0.0006784909055568278 0.016105210408568382 H 0.00552762346342206 0.9320316314697266 0.0451836995780468 0.0001827403175411746 0.0003199840139131993 0.0019251827616244555 0.011687942780554295 0.003141216468065977 -67.58945465087889 -41.26790237426758 0.0003048233338631689 H 0.5563380281690141 H 0.007042253521126761 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.02112676056338028 NA NA H 0.08450704225352113 H 0.07042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.09859154929577464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326266 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N701K Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.059861421585083015 8.763712120056152 H 0.9927234053611756 0.000169716018717736 0.007106950972229242 H 0.004008578136563301 0.9762826561927797 0.01226440630853176 5.951191633357666e-05 6.016561019350775e-05 0.0012153926072642207 0.004804929252713919 0.0013043220387771726 -69.32305145263672 -38.252342224121094 8.113202784443274e-05 S 0.5796178343949044 H 0.012738853503184714 NA NA S 0.5796178343949044 H 0.044585987261146494 NA NA H 0.006369426751592357 NA NA H 0.10191082802547773 H 0.05732484076433121 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.10191082802547773 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 546521 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA N701S Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.059861421585083015 8.763712120056152 H 0.9927234053611756 0.000169716018717736 0.007106950972229242 H 0.004008578136563301 0.9762826561927797 0.01226440630853176 5.951191633357666e-05 6.016561019350775e-05 0.0012153926072642207 0.004804929252713919 0.0013043220387771726 -69.32305145263672 -38.252342224121094 8.113202784443274e-05 S 0.5796178343949044 H 0.012738853503184714 NA NA S 0.5796178343949044 H 0.044585987261146494 NA NA H 0.006369426751592357 NA NA H 0.10191082802547773 H 0.05732484076433121 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.10191082802547773 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3966699953016361e-05 1.599934433479073e-05 NA NA NA NA 1.3966699953016361e-05 1.599934433479073e-05 2 143198 NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA I702T Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.03711265325546265 6.86584085226059 H 0.998004138469696 6.570886762347071e-05 0.0019301652209833267 H 0.0017072133487090464 0.9884538054466248 0.00786623079329729 9.188809599436354e-06 2.3166232494986616e-05 0.00018860030104406178 0.0014050273457542062 0.0003467752831056714 -65.25222778320311 -41.130332946777344 4.050084680784494e-05 S 0.6449704142011834 H 0.017751479289940832 NA NA S 0.6449704142011834 H 0.07100591715976333 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.01183431952662722 H 0.02366863905325444 NA NA NA NA NA NA H 0.059171597633136085 NA NA H 0.035502958579881665 H 0.07100591715976333 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9777200981916386e-06 9.359519342293686e-06 3.9777200981916386e-06 9.359519342293686e-06 1 251400 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I702V Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.03711265325546265 6.86584085226059 H 0.998004138469696 6.570886762347071e-05 0.0019301652209833267 H 0.0017072133487090464 0.9884538054466248 0.00786623079329729 9.188809599436354e-06 2.3166232494986616e-05 0.00018860030104406178 0.0014050273457542062 0.0003467752831056714 -65.25222778320311 -41.130332946777344 4.050084680784494e-05 S 0.6449704142011834 H 0.017751479289940832 NA NA S 0.6449704142011834 H 0.07100591715976333 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.01183431952662722 H 0.02366863905325444 NA NA NA NA NA NA H 0.059171597633136085 NA NA H 0.035502958579881665 H 0.07100591715976333 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977690084866481e-06 9.267745219137536e-06 3.977690084866481e-06 9.267745219137536e-06 1 251402 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F703I Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.13923966884613034 27.94540153741837 H 0.9989137649536132 6.647032569162548e-05 0.0010198300005868075 H 0.0006433161906898023 0.9912034273147584 0.006900893058627844 1.0387577276560478e-05 2.377309465373401e-05 0.00013001292245462537 0.0009192025172524154 0.00016902634524740281 -63.81454849243164 -42.73015213012695 7.572322647320108e-05 - 0.2538071065989848 H 0.0 NA NA - 0.2538071065989848 H 0.005076142131979695 NA NA H 0.005076142131979695 NA NA H 0.02538071065989848 H 0.045685279187817264 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.02030456852791878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97791018258431e-06 9.008564736419203e-06 3.97791018258431e-06 9.008564736419203e-06 1 251388 NA NA NA NA Ttc/Atc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I704F Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.07647305727005005 14.147515594959259 H 0.9993624091148376 5.6821245379978784e-05 0.0005807253182865678 H 0.0005175143014639616 0.9940752983093262 0.004588931333273649 4.707612333731959e-06 2.462997326801997e-05 8.116183016682044e-05 0.0005888408632017673 0.0001189275790238753 -65.17802429199219 -42.75297164916992 3.46724882547278e-05 - 0.4497041420118344 H 0.01183431952662722 NA NA - 0.4556213017751479 H 0.04142011834319527 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0650887573964497 H 0.07692307692307693 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005917159763313609 H 0.02958579881656805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9777200981916386e-06 8.287311914003686e-06 3.9777200981916386e-06 8.287311914003686e-06 1 251400 NA NA NA NA Att/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L705Q Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.07180202007293701 13.146949875354764 H 0.9986880421638488 0.0001112571990233846 0.001200636150315404 H 0.0009043168975040317 0.994271159172058 0.0031381212174892426 9.634521120460704e-06 5.598399002337828e-05 0.0002299745392519981 0.0010855927830561996 0.0003052705724257976 -65.63919830322266 -42.32537078857422 5.407070784713142e-05 S 0.35365853658536583 H 0.03658536585365853 NA NA S 0.3414634146341464 H 0.0975609756097561 NA NA H 0.018292682926829267 NA NA H 0.03658536585365853 H 0.06097560975609756 NA NA NA NA NA NA H 0.024390243902439025 NA NA H 0.03658536585365853 H 0.07926829268292683 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.53 0.0 0.0 0.53 0.0 2114T>A V706= Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.14056044816970825 21.60414088368416 H 0.9979875087738036 0.0001216746895806864 0.00189080648124218 H 0.0010259234113618731 0.9918436408042908 0.0048922551795840255 1.5699739378760572e-05 6.521967588923872e-05 0.00028621742967516184 0.0013929449487477539 0.0004780029412358999 -63.98313522338867 -42.79806518554688 0.00010854949505301191 H 0.5563380281690141 H 0.007042253521126761 NA NA H 0.5492957746478874 H 0.15492957746478872 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA H 0.035211267605633804 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.0 0.0 0.36 0.0 2118G>A V706A Sterol-sensing TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.14056044816970825 21.60414088368416 H 0.9979875087738036 0.0001216746895806864 0.00189080648124218 H 0.0010259234113618731 0.9918436408042908 0.0048922551795840255 1.5699739378760572e-05 6.521967588923872e-05 0.00028621742967516184 0.0013929449487477539 0.0004780029412358999 -63.98313522338867 -42.79806518554688 0.00010854949505301191 H 0.5563380281690141 H 0.007042253521126761 NA NA H 0.5492957746478874 H 0.15492957746478872 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA H 0.035211267605633804 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.957220077514647e-06 9.211541039200202e-06 7.957220077514647e-06 9.211541039200202e-06 2 251344 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q707R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.21413683891296387 38.24483942985536 H 0.9960272312164308 0.00019924313528463244 0.003773490199819207 H 0.001655084895901382 0.9859886169433594 0.00824227835983038 3.4642394894035526e-05 0.00011407981946831568 0.0004765871854033321 0.0023726590443402533 0.0011159791611135006 -66.16817474365234 -40.9786376953125 0.0001971927413251251 H 0.2878787878787879 H 0.060606060606060615 NA NA H 0.2878787878787879 H 0.05555555555555555 NA NA H 0.15656565656565655 NA NA H 0.2272727272727273 H 0.20707070707070707 NA NA NA NA NA NA H 0.12626262626262627 NA NA H 0.08080808080808081 H 0.101010101010101 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979119810537668e-06 9.346569941024864e-06 3.979119810537668e-06 9.346569941024864e-06 1 251312 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA 0.21 0.0 0.0 0.21 0.0 2120A>G Y709F Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA b 0.14323437213897705 30.6091853260994 H 0.9880410432815552 0.0002532800135668366 0.01170574314892292 H 0.002620963612571359 0.9653249382972716 0.020229857414960858 8.460456592729315e-05 0.00010458614997332916 0.001211994094774127 0.007468471303582191 0.002954678609967232 -64.28447723388672 -40.28659439086914 0.0005669343518093227 H 0.12612612612612611 H 0.1036036036036036 NA NA H 0.12162162162162166 H 0.13513513513513514 NA NA H 0.10810810810810813 NA NA H 0.1126126126126126 H 0.12162162162162166 NA NA NA NA NA NA H 0.16216216216216214 NA NA H 0.0990990990990991 H 0.12162162162162166 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.56245983817392e-05 2.024567963586443e-05 3.1837498681852594e-05 9.242482771626275e-06 8 251276 6.980900070630014e-05 1.8012885835818953e-05 10 143248 tAc/tTc tAc/tTc 0 0 NA NA NA NA NA NA Q710= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA e 0.2812166213989258 50.22528858184815 H 0.9853965640068054 0.0001841407211031765 0.01441923435777426 H 0.0018745362758636481 0.9664970636367798 0.01708570495247841 8.672120748087764e-05 8.449204324278979e-05 0.0015479627763852475 0.008527948521077633 0.004295572638511658 -65.52458190917969 -40.39889526367188 0.0010412310948595405 H 0.09595959595959597 H 0.11616161616161615 NA NA H 0.09090909090909093 H 0.3636363636363637 NA NA H 0.202020202020202 NA NA H 0.3434343434343434 H 0.3181818181818182 NA NA NA NA NA NA H 0.297979797979798 NA NA H 0.14646464646464644 H 0.3232323232323233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.04 0.0 0.28 0.29 2130G>A Q710E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA e 0.2812166213989258 50.22528858184815 H 0.9853965640068054 0.0001841407211031765 0.01441923435777426 H 0.0018745362758636481 0.9664970636367798 0.01708570495247841 8.672120748087764e-05 8.449204324278979e-05 0.0015479627763852475 0.008527948521077633 0.004295572638511658 -65.52458190917969 -40.39889526367188 0.0010412310948595405 H 0.09595959595959597 H 0.11616161616161615 NA NA H 0.09090909090909093 H 0.3636363636363637 NA NA H 0.202020202020202 NA NA H 0.3434343434343434 H 0.3181818181818182 NA NA NA NA NA NA H 0.297979797979798 NA NA H 0.14646464646464644 H 0.3232323232323233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.983730145293521e-06 1.6059986308837978e-05 NA NA NA NA 6.983730145293521e-06 1.6059986308837978e-05 1 143190 NA Cag/Gag NA 0 NA NA NA NA NA NA Q710H Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|32 NA NA NA NA e 0.2812166213989258 50.22528858184815 H 0.9853965640068054 0.0001841407211031765 0.01441923435777426 H 0.0018745362758636481 0.9664970636367798 0.01708570495247841 8.672120748087764e-05 8.449204324278979e-05 0.0015479627763852475 0.008527948521077633 0.004295572638511658 -65.52458190917969 -40.39889526367188 0.0010412310948595405 H 0.09595959595959597 H 0.11616161616161615 NA NA H 0.09090909090909093 H 0.3636363636363637 NA NA H 0.202020202020202 NA NA H 0.3434343434343434 H 0.3181818181818182 NA NA NA NA NA NA H 0.297979797979798 NA NA H 0.14646464646464644 H 0.3232323232323233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.63 0.05 0.0 0.38 0.63 2130G>T R711G Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3260453939437866 74.66439521312714 H 0.9484502673149108 0.0011263806372880936 0.05042338371276856 H 0.005286781582981348 0.9168568253517152 0.025271127000451088 0.00043763924622908235 0.0006850890931673348 0.006125274579972029 0.026601092889904976 0.01873614639043808 -67.49008178710939 -39.73503112792969 0.003681484377011657 H 0.28225806451612906 T 0.1814516129032258 NA NA H 0.28225806451612906 T 0.17338709677419356 NA NA H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5362903225806451 T 0.5725806451612904 NA NA NA NA NA NA T 0.1975806451612903 NA NA T 0.2379032258064516 T 0.4838709677419355 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326265 VUS 1 0.00011034101777132314 2.8606599686866985e-05 0.0001146240028901957 1.281764653029906e-05 21 183208 0.00010048499825643377 2.5574312953996843e-05 8 79614 Aga/Gga Aga/Gga 0 0 NA NA NA NA NA NA R711I Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3260453939437866 74.66439521312714 H 0.9484502673149108 0.0011263806372880936 0.05042338371276856 H 0.005286781582981348 0.9168568253517152 0.025271127000451088 0.00043763924622908235 0.0006850890931673348 0.006125274579972029 0.026601092889904976 0.01873614639043808 -67.49008178710939 -39.73503112792969 0.003681484377011657 H 0.28225806451612906 T 0.1814516129032258 NA NA H 0.28225806451612906 T 0.17338709677419356 NA NA H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5362903225806451 T 0.5725806451612904 NA NA NA NA NA NA T 0.1975806451612903 NA NA T 0.2379032258064516 T 0.4838709677419355 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.8 0.8 0.0 0.0 0.0 2132G>T R711K Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3260453939437866 74.66439521312714 H 0.9484502673149108 0.0011263806372880936 0.05042338371276856 H 0.005286781582981348 0.9168568253517152 0.025271127000451088 0.00043763924622908235 0.0006850890931673348 0.006125274579972029 0.026601092889904976 0.01873614639043808 -67.49008178710939 -39.73503112792969 0.003681484377011657 H 0.28225806451612906 T 0.1814516129032258 NA NA H 0.28225806451612906 T 0.17338709677419356 NA NA H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5362903225806451 T 0.5725806451612904 NA NA NA NA NA NA T 0.1975806451612903 NA NA T 0.2379032258064516 T 0.4838709677419355 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.67 0.67 0.0 0.0 0.0 2132G>A R711T Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3260453939437866 74.66439521312714 H 0.9484502673149108 0.0011263806372880936 0.05042338371276856 H 0.005286781582981348 0.9168568253517152 0.025271127000451088 0.00043763924622908235 0.0006850890931673348 0.006125274579972029 0.026601092889904976 0.01873614639043808 -67.49008178710939 -39.73503112792969 0.003681484377011657 H 0.28225806451612906 T 0.1814516129032258 NA NA H 0.28225806451612906 T 0.17338709677419356 NA NA H 0.2540322580645161 NA NA T 0.5362903225806451 T 0.5725806451612904 NA NA NA NA NA NA T 0.1975806451612903 NA NA T 0.2379032258064516 T 0.4838709677419355 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.84 0.84 0.0 0.0 0.0 2132G>C D712A Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19341632723808289 27.871292755007744 H 0.9294198155403136 0.0007647130987606943 0.06981545686721803 H 0.007594724651426077 0.8700945973396301 0.052666813135147095 0.0006504618213512003 0.0003692698082886636 0.008389871567487717 0.029673483222723007 0.03056079149246216 -68.33670043945311 -36.653358459472656 0.004523690324276686 H 0.07975460122699386 - 0.196319018404908 NA NA H 0.0736196319018405 S 0.2638036809815951 NA NA - 0.17791411042944785 NA NA - 0.2147239263803681 - 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA - 0.2147239263803681 NA NA - 0.196319018404908 - 0.196319018404908 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.278289907233557e-06 9.913643033807887e-06 4.278289907233557e-06 9.913643033807887e-06 1 233738 NA NA NA NA gAt/gCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D712H Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19341632723808289 27.871292755007744 H 0.9294198155403136 0.0007647130987606943 0.06981545686721803 H 0.007594724651426077 0.8700945973396301 0.052666813135147095 0.0006504618213512003 0.0003692698082886636 0.008389871567487717 0.029673483222723007 0.03056079149246216 -68.33670043945311 -36.653358459472656 0.004523690324276686 H 0.07975460122699386 - 0.196319018404908 NA NA H 0.0736196319018405 S 0.2638036809815951 NA NA - 0.17791411042944785 NA NA - 0.2147239263803681 - 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA - 0.2147239263803681 NA NA - 0.196319018404908 - 0.196319018404908 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 2134G>C D712N Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19341632723808289 27.871292755007744 H 0.9294198155403136 0.0007647130987606943 0.06981545686721803 H 0.007594724651426077 0.8700945973396301 0.052666813135147095 0.0006504618213512003 0.0003692698082886636 0.008389871567487717 0.029673483222723007 0.03056079149246216 -68.33670043945311 -36.653358459472656 0.004523690324276686 H 0.07975460122699386 - 0.196319018404908 NA NA H 0.0736196319018405 S 0.2638036809815951 NA NA - 0.17791411042944785 NA NA - 0.2147239263803681 - 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA - 0.2147239263803681 NA NA - 0.196319018404908 - 0.196319018404908 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.353690201241989e-06 1.0065435688343636e-05 4.353690201241989e-06 1.0065435688343636e-05 1 229690 NA NA NA NA Gat/Aat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D712V Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19341632723808289 27.871292755007744 H 0.9294198155403136 0.0007647130987606943 0.06981545686721803 H 0.007594724651426077 0.8700945973396301 0.052666813135147095 0.0006504618213512003 0.0003692698082886636 0.008389871567487717 0.029673483222723007 0.03056079149246216 -68.33670043945311 -36.653358459472656 0.004523690324276686 H 0.07975460122699386 - 0.196319018404908 NA NA H 0.0736196319018405 S 0.2638036809815951 NA NA - 0.17791411042944785 NA NA - 0.2147239263803681 - 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA - 0.2147239263803681 NA NA - 0.196319018404908 - 0.196319018404908 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.0675299310823906e-05 2.199378393008358e-05 NA NA NA NA 2.0675299310823906e-05 2.199378393008358e-05 2 96734 NA gAt/gTt NA 0 NA NA NA NA NA NA D712Y Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19341632723808289 27.871292755007744 H 0.9294198155403136 0.0007647130987606943 0.06981545686721803 H 0.007594724651426077 0.8700945973396301 0.052666813135147095 0.0006504618213512003 0.0003692698082886636 0.008389871567487717 0.029673483222723007 0.03056079149246216 -68.33670043945311 -36.653358459472656 0.004523690324276686 H 0.07975460122699386 - 0.196319018404908 NA NA H 0.0736196319018405 S 0.2638036809815951 NA NA - 0.17791411042944785 NA NA - 0.2147239263803681 - 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA - 0.2147239263803681 NA NA - 0.196319018404908 - 0.196319018404908 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 2134G>T E713* Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.11855670103092784 - 0.7061855670103093 NA NA H 0.1134020618556701 - 0.7268041237113402 NA NA - 0.8453608247422679 NA NA - 0.6443298969072165 - 0.7835051546391752 NA NA NA NA NA NA - 0.6701030927835051 NA NA - 0.6030927835051546 - 0.6546391752577321 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.0 0.24 0.0 0.0 2137G>T R714C Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5423620939254761 124.20091950893402 H 0.8880255222320557 0.001961634261533618 0.11001283675432204 H 0.02915523946285248 0.8413193225860596 0.010876392014324663 0.0006387129542417824 0.0012446960899978874 0.012056238949298859 0.0671996995806694 0.0375097393989563 -68.0965576171875 -36.39660263061523 0.015573739074170591 T 0.05645161290322581 - 0.3588709677419355 NA NA T 0.05645161290322581 - 0.6048387096774194 NA NA - 0.3185483870967742 NA NA - 0.625 - 0.3870967741935484 NA NA NA NA NA NA - 0.3588709677419355 NA NA - 0.3387096774193548 - 0.6733870967741935 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.4999173452152906e-06 2.1416987372706046e-05 4.10250004279078e-06 9.227549334719631e-06 1 243754 8.341119610122405e-06 1.9327174687417854e-05 1 119888 Cgt/Tgt Cgt/Tgt 0 0 NA NA NA NA NA NA R714H Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5423620939254761 124.20091950893402 H 0.8880255222320557 0.001961634261533618 0.11001283675432204 H 0.02915523946285248 0.8413193225860596 0.010876392014324663 0.0006387129542417824 0.0012446960899978874 0.012056238949298859 0.0671996995806694 0.0375097393989563 -68.0965576171875 -36.39660263061523 0.015573739074170591 T 0.05645161290322581 - 0.3588709677419355 NA NA T 0.05645161290322581 - 0.6048387096774194 NA NA - 0.3185483870967742 NA NA - 0.625 - 0.3870967741935484 NA NA NA NA NA NA - 0.3588709677419355 NA NA - 0.3387096774193548 - 0.6733870967741935 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 546815 VUS 2 0.0001059437264751258 2.2211981607355107e-05 0.00013507099356502295 9.95165318123082e-06 33 244316 4.846369847655296e-05 1.9857913432331705e-05 6 123804 cGt/cAt cGt/cAt 0 0 NA NA NA NA NA NA L715F Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3992602825164795 73.10455772876739 H 0.6851687431335449 0.003679753048345447 0.3111514747142792 H 0.03515547513961792 0.6555434465408325 0.011270871385931969 0.001894414541311562 0.001844597863964736 0.04136089235544205 0.16538721323013306 0.08754308521747589 -80.96965789794922 -19.14251136779785 0.01826510392129421 T 0.3170731707317073 - 0.6219512195121951 NA NA T 0.32926829268292684 - 0.4817073170731707 NA NA - 0.6463414634146342 NA NA - 0.6341463414634146 - 0.5548780487804879 NA NA NA NA NA NA - 0.6646341463414634 NA NA - 0.5060975609756098 - 0.4939024390243902 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.0387999433733066e-06 8.250659487651437e-06 4.0387999433733066e-06 8.250659487651437e-06 1 247598 NA NA NA NA Ctt/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q716* Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.2929292929292929 T 0.9494949494949496 NA NA T 0.297979797979798 S 0.9343434343434344 NA NA S 0.9797979797979798 NA NA S 0.7272727272727273 S 0.6818181818181818 NA NA NA NA NA NA S 0.9444444444444444 NA NA T 0.9292929292929292 S 1.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.0 0.25 0.0 0.0 2146C>T G717E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.8645337224006653 68.03880395293235 C 0.010067952796816826 0.00033098724088631565 0.9896010756492616 T 0.004389482084661722 0.003637461457401514 0.00024951135856099427 0.00015091946988832208 0.00011357525363564493 0.05779586359858512 0.8242447376251221 0.10941848903894424 83.09123229980469 11.819891929626465 0.024149466305971142 H 0.07142857142857142 T 1.0 NA NA H 0.07142857142857142 S 0.9047619047619048 NA NA S 0.8095238095238095 NA NA S 0.988095238095238 S 0.9404761904761904 NA NA NA NA NA NA S 0.8452380952380952 NA NA T 1.0 S 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.8004019593961906e-05 1.9052262990456567e-05 2.400710036454257e-05 8.093749397942051e-06 6 249926 7.200670097518013e-06 1.7247606956932715e-05 1 138876 gGg/gAg gGg/gAg 0 0 NA NA NA NA NA NA E718D Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3155105710029602 55.11969675421714 C 0.012464672327041626 0.004203065298497678 0.9833322763442992 C 0.001499761245213449 0.0069310409016907215 6.167187530081719e-05 0.0025819307193160053 0.0019223600393161171 0.19860416650772086 0.00413487059995532 0.7842641472816467 -87.56395721435547 149.4381103515625 0.013443132862448692 H 0.10824742268041238 - 0.17010309278350516 NA NA H 0.12371134020618554 - 0.13917525773195874 NA NA - 0.15463917525773194 NA NA - 0.1958762886597938 - 0.08762886597938144 NA NA NA NA NA NA - 0.14432989690721648 NA NA - 0.2371134020618557 - 0.25773195876288657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1984900083916727e-05 1.032864737387354e-05 1.1984900083916727e-05 1.032864737387354e-05 3 250314 NA NA NA NA gaA/gaC NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L720= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.2596224546432495 47.536871445178974 H 0.9756396412849426 9.675588080426678e-05 0.02426367253065109 H 0.002458255272358656 0.9812595248222352 0.000234733714023605 4.049023118568584e-05 3.6720910429721705e-05 0.0027510719373822212 0.0034547597169876107 0.009764490649104118 -59.05508041381836 -40.13473510742188 0.002482925076037645 H 0.006097560975609756 H 0.10365853658536583 NA NA H 0.006097560975609756 H 0.25609756097560976 NA NA H 0.16463414634146342 NA NA S 0.12804878048780488 S 0.10365853658536583 NA NA NA NA NA NA H 0.0975609756097561 NA NA H 0.11585365853658534 S 0.18902439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.0 0.2 0.0 0.0 2160G>A D721E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.5172556042671204 74.53653257489205 H 0.9903879761695862 9.657733608037232e-05 0.009515451267361641 H 0.00218724412843585 0.9895701408386228 0.0006935687852092088 2.274299004056957e-05 4.6147080865921446e-05 0.0008147095213644207 0.0032050544396042824 0.0034604868851602077 -62.84899139404297 -40.44830703735352 0.0009145096410065887 H 0.2699386503067485 H 0.22699386503067484 NA NA H 0.24539877300613494 H 0.20245398773006132 NA NA H 0.3312883435582822 NA NA H 0.2331288343558282 H 0.2883435582822086 NA NA NA NA NA NA H 0.22085889570552147 NA NA H 0.22699386503067484 H 0.27607361963190186 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.1195699446252547e-05 1.5871755797143347e-05 NA NA NA NA 2.1195699446252547e-05 1.5871755797143347e-05 3 141538 NA gaT/gaG NA 0 NA NA NA NA NA NA D721G Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.5172556042671204 74.53653257489205 H 0.9903879761695862 9.657733608037232e-05 0.009515451267361641 H 0.00218724412843585 0.9895701408386228 0.0006935687852092088 2.274299004056957e-05 4.6147080865921446e-05 0.0008147095213644207 0.0032050544396042824 0.0034604868851602077 -62.84899139404297 -40.44830703735352 0.0009145096410065887 H 0.2699386503067485 H 0.22699386503067484 NA NA H 0.24539877300613494 H 0.20245398773006132 NA NA H 0.3312883435582822 NA NA H 0.2331288343558282 H 0.2883435582822086 NA NA NA NA NA NA H 0.22085889570552147 NA NA H 0.22699386503067484 H 0.27607361963190186 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.0 0.26 0.0 0.0 2162A>G D721N Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.5172556042671204 74.53653257489205 H 0.9903879761695862 9.657733608037232e-05 0.009515451267361641 H 0.00218724412843585 0.9895701408386228 0.0006935687852092088 2.274299004056957e-05 4.6147080865921446e-05 0.0008147095213644207 0.0032050544396042824 0.0034604868851602077 -62.84899139404297 -40.44830703735352 0.0009145096410065887 H 0.2699386503067485 H 0.22699386503067484 NA NA H 0.24539877300613494 H 0.20245398773006132 NA NA H 0.3312883435582822 NA NA H 0.2331288343558282 H 0.2883435582822086 NA NA NA NA NA NA H 0.22085889570552147 NA NA H 0.22699386503067484 H 0.27607361963190186 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.5589191269329536e-05 1.680261163863854e-05 1.5957499272190034e-05 8.879203580869303e-06 4 250666 4.281919973436743e-05 1.4264904543963451e-05 6 140124 Gat/Aat Gat/Aat 0 0 NA NA NA NA NA NA Q722* Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3333333333333333 H 0.5252525252525253 NA NA H 0.3333333333333333 H 0.6414141414141414 NA NA H 0.5757575757575758 NA NA H 0.5 H 0.4191919191919192 NA NA NA NA NA NA H 0.6161616161616161 NA NA H 0.5151515151515151 H 0.42424242424242425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.0 0.25 0.0 0.0 2164C>T Q723* Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.0505050505050505 H 0.02525252525252525 NA NA H 0.060606060606060615 H 0.015151515151515154 NA NA H 0.015151515151515154 NA NA H 0.06565656565656566 H 0.03535353535353535 NA NA NA NA NA NA H 0.005050505050505051 NA NA H 0.030303030303030307 H 0.06565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.27 0.0 0.0 2167C>T Q723R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.09849178791046144 17.59063332080841 H 0.9979841709136964 4.0452923713019124e-05 0.0019753442611545324 H 0.0009324189159087836 0.9956445693969728 0.0015289540169760587 2.289613075845409e-05 1.0476136594661513e-05 0.0002517238026484846 0.0009680631919763982 0.0006409191410057247 -64.4122314453125 -41.48346328735352 0.00020149270130787045 H 0.0505050505050505 H 0.02525252525252525 NA NA H 0.060606060606060615 H 0.015151515151515154 NA NA H 0.015151515151515154 NA NA H 0.06565656565656566 H 0.03535353535353535 NA NA NA NA NA NA H 0.005050505050505051 NA NA H 0.030303030303030307 H 0.06565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.086070127115817e-06 1.7557670727013848e-05 NA NA NA NA 7.086070127115817e-06 1.7557670727013848e-05 1 141122 NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA L724P Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.06747546792030333 12.35475817620754 H 0.9971495270729064 5.4067848395789035e-05 0.0027963814791291948 H 0.0008481188560836017 0.9933393597602844 0.003312557004392147 2.9855076718376946e-05 1.600108771526721e-05 0.00024263293016701934 0.0013411890249699356 0.0008702404447831212 -64.83325958251953 -41.70442581176758 0.00029347269446589047 H 0.012195121951219513 H 0.0 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.04878048780487805 NA NA H 0.024390243902439025 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.012195121951219513 NA NA NA NA NA NA H 0.012195121951219513 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.98699012293946e-06 9.02202492682759e-06 3.98699012293946e-06 9.02202492682759e-06 1 250816 NA NA NA NA cTg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L724V Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.06747546792030333 12.35475817620754 H 0.9971495270729064 5.4067848395789035e-05 0.0027963814791291948 H 0.0008481188560836017 0.9933393597602844 0.003312557004392147 2.9855076718376946e-05 1.600108771526721e-05 0.00024263293016701934 0.0013411890249699356 0.0008702404447831212 -64.83325958251953 -41.70442581176758 0.00029347269446589047 H 0.012195121951219513 H 0.0 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.04878048780487805 NA NA H 0.024390243902439025 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.012195121951219513 NA NA NA NA NA NA H 0.012195121951219513 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.39 0.0 0.15 0.39 0.0 2170C>G R726S Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.3587713837623596 82.15864688158034 H 0.9963369369506836 0.00013506508548744023 0.0035279947333037853 H 0.0011124194134026766 0.9927045702934264 0.0019253265345469122 3.946100332541391e-05 6.145435327198356e-05 0.00035391529672779143 0.0028273249045014377 0.000975362432654947 -64.76707458496094 -42.65785217285156 0.0003796311211772263 H 0.3387096774193548 H 0.2903225806451613 NA NA H 0.3467741935483871 H 0.3346774193548387 NA NA H 0.2298387096774193 NA NA H 0.29435483870967744 H 0.2419354838709677 NA NA NA NA NA NA H 0.2338709677419355 NA NA H 0.2459677419354839 H 0.3467741935483871 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.1 0.0 0.22 0.0 2178G>C V727I Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.023172259330749508 3.5615762591362 H 0.9962856769561768 5.013787085772492e-05 0.0036642106715589757 H 0.0019504566444084046 0.9879066944122314 0.0060400175862014285 2.6397829060442746e-05 1.530808185634669e-05 0.00048080211854539817 0.002618865575641393 0.0009614754235371947 -63.77610778808594 -41.58358383178711 0.00019800741574727 H 0.007042253521126761 H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.06338028169014084 NA NA H 0.0 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.028169014084507043 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.04929577464788732 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.982189809903503e-06 8.39024082027415e-06 3.982189809903503e-06 8.39024082027415e-06 1 251118 NA NA NA NA Gtc/Atc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L728= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.15445280075073242 28.28030781745911 H 0.9925606846809388 5.956911263638176e-05 0.007379718124866486 H 0.004308790899813175 0.9723187685012816 0.014847795478999616 6.341544940369204e-05 1.957838139787782e-05 0.0006131281843408942 0.0059628095477819425 0.0018656202591955664 -64.50659942626953 -39.5824089050293 0.0004389836103655398 H 0.0975609756097561 H 0.006097560975609756 NA NA H 0.0975609756097561 H 0.03048780487804878 NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.018292682926829267 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.0975609756097561 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.05 0.0 0.2 0.0 2184A>C G729= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.3189742267131805 25.103271642327307 H 0.9687554240226746 0.000125025850138627 0.03111949190497398 H 0.015279501676559447 0.92812180519104 0.025967646390199658 7.101078517735003e-05 3.417685366002843e-05 0.002173107350245118 0.0256282240152359 0.0027245099190622572 -67.69296264648439 -33.413543701171875 0.0004248222394380719 H 0.047619047619047616 H 0.0 NA NA H 0.047619047619047616 H 0.047619047619047616 NA NA H 0.0 NA NA H 0.07142857142857142 H 0.03571428571428571 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.011904761904761904 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.0 0.0 0.26 0.0 2187A>T P733= Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.21037223935127256 29.851820763945586 H 0.9967917799949646 4.660512058762834e-05 0.0031615877524018288 H 0.009162513539195059 0.9843094348907472 0.0028557779733091593 1.427660754416138e-05 1.7920066966325973e-05 0.00047845259541645646 0.002425924176350236 0.0007356590358540416 -62.59016036987305 -38.0564079284668 0.00014814439055044204 T 0.3970588235294117 H 0.05147058823529412 NA NA T 0.3897058823529412 H 0.08088235294117647 NA NA H 0.04411764705882353 NA NA H 0.16176470588235295 H 0.15441176470588236 NA NA NA NA NA NA H 0.036764705882352935 NA NA H 0.125 H 0.16911764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.0 0.0 0.38 0.08 2199C>A P733H Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.21037223935127256 29.851820763945586 H 0.9967917799949646 4.660512058762834e-05 0.0031615877524018288 H 0.009162513539195059 0.9843094348907472 0.0028557779733091593 1.427660754416138e-05 1.7920066966325973e-05 0.00047845259541645646 0.002425924176350236 0.0007356590358540416 -62.59016036987305 -38.0564079284668 0.00014814439055044204 T 0.3970588235294117 H 0.05147058823529412 NA NA T 0.3897058823529412 H 0.08088235294117647 NA NA H 0.04411764705882353 NA NA H 0.16176470588235295 H 0.15441176470588236 NA NA NA NA NA NA H 0.036764705882352935 NA NA H 0.125 H 0.16911764705882354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.0 0.0 0.21 0.05 2198C>A S734G Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.0323280394077301 3.788846218585968 H 0.9987257122993468 4.33282257290557e-05 0.001230988884344697 H 0.011580889113247395 0.9851367473602296 0.0015607399400323634 1.8067557903123088e-05 1.8616672605276108e-05 0.00013278414553496987 0.0012076329439878466 0.0003444598987698555 -64.90555572509766 -38.58106231689453 0.00010818595183081924 T 0.3 H 0.015384615384615384 NA NA T 0.3 H 0.015384615384615384 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.06923076923076922 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA NA NA H 0.04615384615384616 NA NA H 0.0 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.54 0.0 0.0 0.49 0.54 2200A>G S734I Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.0323280394077301 3.788846218585968 H 0.9987257122993468 4.33282257290557e-05 0.001230988884344697 H 0.011580889113247395 0.9851367473602296 0.0015607399400323634 1.8067557903123088e-05 1.8616672605276108e-05 0.00013278414553496987 0.0012076329439878466 0.0003444598987698555 -64.90555572509766 -38.58106231689453 0.00010818595183081924 T 0.3 H 0.015384615384615384 NA NA T 0.3 H 0.015384615384615384 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.06923076923076922 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA NA NA H 0.04615384615384616 NA NA H 0.0 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 372775 pathogenic 2 0.00010414080744244483 1.768209697968854e-05 8.357340266229585e-05 9.986003114424656e-06 21 251276 0.00014042800466995686 1.4592336872407096e-05 20 142422 aGt/aTt aGt/aTt 0 0 NA NA NA NA NA NA M735K Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.030539810657501217 6.111016112565994 H 0.999062478542328 4.912979420623742e-05 0.0008883383707143367 H 0.001908664125949145 0.9955874681472778 0.0012819139519706366 1.1456401807663495e-05 1.745760164340027e-05 9.574808063916862e-05 0.0008762493380345402 0.00022104063828010112 -66.59275054931639 -40.058799743652344 4.9883270548889413e-05 T 0.0851063829787234 H 0.031914893617021274 NA NA T 0.0851063829787234 H 0.02127659574468085 NA NA H 0.015957446808510637 NA NA H 0.031914893617021274 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.026595744680851064 H 0.031914893617021274 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.69 0.0 0.0 0.49 0.69 2204T>A M735T Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.030539810657501217 6.111016112565994 H 0.999062478542328 4.912979420623742e-05 0.0008883383707143367 H 0.001908664125949145 0.9955874681472778 0.0012819139519706366 1.1456401807663495e-05 1.745760164340027e-05 9.574808063916862e-05 0.0008762493380345402 0.00022104063828010112 -66.59275054931639 -40.058799743652344 4.9883270548889413e-05 T 0.0851063829787234 H 0.031914893617021274 NA NA T 0.0851063829787234 H 0.02127659574468085 NA NA H 0.015957446808510637 NA NA H 0.031914893617021274 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.026595744680851064 H 0.031914893617021274 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.0 0.0 0.26 0.0 2204T>C F736= Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.2920336127281189 58.611146074533465 H 0.9983738660812378 5.628425788017921e-05 0.001569822197780013 H 0.001475888886488974 0.9915361404418944 0.004845584742724896 1.4813339475949759e-05 2.0494546333793547e-05 0.00016756163677200675 0.001593851950019598 0.000345574168022722 -67.54814910888672 -42.17193984985352 0.00019391858950257296 - 0.4213197969543147 H 0.2487309644670051 NA NA - 0.4213197969543147 H 0.3401015228426396 NA NA H 0.20304568527918784 NA NA H 0.2639593908629442 H 0.2588832487309645 NA NA NA NA NA NA H 0.18781725888324874 NA NA H 0.2182741116751269 H 0.2538071065989848 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.0 0.0 0.22 0.18 2208C>T F736L Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.2920336127281189 58.611146074533465 H 0.9983738660812378 5.628425788017921e-05 0.001569822197780013 H 0.001475888886488974 0.9915361404418944 0.004845584742724896 1.4813339475949759e-05 2.0494546333793547e-05 0.00016756163677200675 0.001593851950019598 0.000345574168022722 -67.54814910888672 -42.17193984985352 0.00019391858950257296 - 0.4213197969543147 H 0.2487309644670051 NA NA - 0.4213197969543147 H 0.3401015228426396 NA NA H 0.20304568527918784 NA NA H 0.2639593908629442 H 0.2588832487309645 NA NA NA NA NA NA H 0.18781725888324874 NA NA H 0.2182741116751269 H 0.2538071065989848 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.9581695899833e-06 8.477550709211993e-06 7.9581695899833e-06 8.477550709211993e-06 2 251314 NA NA NA NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F736Y Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.2920336127281189 58.611146074533465 H 0.9983738660812378 5.628425788017921e-05 0.001569822197780013 H 0.001475888886488974 0.9915361404418944 0.004845584742724896 1.4813339475949759e-05 2.0494546333793547e-05 0.00016756163677200675 0.001593851950019598 0.000345574168022722 -67.54814910888672 -42.17193984985352 0.00019391858950257296 - 0.4213197969543147 H 0.2487309644670051 NA NA - 0.4213197969543147 H 0.3401015228426396 NA NA H 0.20304568527918784 NA NA H 0.2639593908629442 H 0.2588832487309645 NA NA NA NA NA NA H 0.18781725888324874 NA NA H 0.2182741116751269 H 0.2538071065989848 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.0 0.0 0.38 0.26 2207T>A L737= Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.26436710357666016 48.405616664886466 H 0.9954891800880432 0.00012554205022752285 0.004385320004075766 H 0.00216361484490335 0.98892480134964 0.004369147121906281 4.452436405699699e-05 6.069801747798921e-05 0.0005691204569302499 0.002669003326445818 0.001199064659886062 -66.57511901855469 -42.37731170654297 0.0004545535193756224 - 0.2073170731707317 H 0.03658536585365853 NA NA - 0.2073170731707317 H 0.03658536585365853 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.018292682926829267 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.0 0.0 0.27 0.28 2211G>T L737V Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.26436710357666016 48.405616664886466 H 0.9954891800880432 0.00012554205022752285 0.004385320004075766 H 0.00216361484490335 0.98892480134964 0.004369147121906281 4.452436405699699e-05 6.069801747798921e-05 0.0005691204569302499 0.002669003326445818 0.001199064659886062 -66.57511901855469 -42.37731170654297 0.0004545535193756224 - 0.2073170731707317 H 0.03658536585365853 NA NA - 0.2073170731707317 H 0.03658536585365853 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.018292682926829267 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.076735229582793e-06 1.6492748028677242e-05 3.979529992648168e-06 8.853046586521932e-06 1 251286 7.009280125203078e-06 1.3915254351764807e-05 1 142668 Ctg/Gtg Ctg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA S738* Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.5538461538461539 H 0.0 NA NA S 0.5538461538461539 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.0 NA NA H 0.06923076923076922 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.02307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 242482 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.0 0.0 0.12 0.3 2213C>A S738L Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.01258772611618042 1.4752815008163451 H 0.9965149164199828 7.394092972390354e-05 0.003411141689866781 H 0.001779000507667661 0.9898528456687928 0.005169601179659368 2.311380012542941e-05 2.701748780964408e-05 0.0004285821341909468 0.0017362593207508323 0.0009835092350840569 -65.78253173828125 -40.8321533203125 8.18672269815579e-05 S 0.5538461538461539 H 0.0 NA NA S 0.5538461538461539 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.0 NA NA H 0.06923076923076922 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.02307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9791498238628265e-06 9.288972462036302e-06 3.9791498238628265e-06 9.288972462036302e-06 1 251310 NA NA NA NA tCa/tTa NA 0 NA 0.23 0.0 0.0 0.23 0.2 2213C>T S739F Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.05654528737068176 6.627107679843903 H 0.9978415966033936 3.8112491893116385e-05 0.0021203071810305123 H 0.0010232724016532302 0.9938902854919434 0.0031363388989120717 6.072246833355168e-06 1.1375934263924135e-05 0.00023883581161499023 0.0012156476732343435 0.00047818827442824846 -69.05744171142578 -40.19695281982422 7.053493754938245e-05 S 0.3153846153846154 H 0.02307692307692308 NA NA S 0.3230769230769231 H 0.061538461538461535 NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.038461538461538464 H 0.038461538461538464 NA NA NA NA NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.05384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.0 0.0 0.24 0.21 2216C>T E742* Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.15463917525773194 H 0.0 NA NA H 0.14948453608247422 H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.0 0.0 0.2 0.4 2224G>T E742D Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.02540719509124756 4.438636982440949 H 0.9979198575019836 5.8335961512057104e-05 0.0020218458957970142 H 0.0011572652729228141 0.9925419092178344 0.004080671817064285 1.2861255527241154e-05 2.476647387084085e-05 0.00023423651873599732 0.0013045938685536385 0.0006436594994738697 -66.09416198730469 -40.33158493041992 8.466971485177055e-05 H 0.15463917525773194 H 0.0 NA NA H 0.14948453608247422 H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.0 0.0 0.23 0.11 2226G>T E742K Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.02540719509124756 4.438636982440949 H 0.9979198575019836 5.8335961512057104e-05 0.0020218458957970142 H 0.0011572652729228141 0.9925419092178344 0.004080671817064285 1.2861255527241154e-05 2.476647387084085e-05 0.00023423651873599732 0.0013045938685536385 0.0006436594994738697 -66.09416198730469 -40.33158493041992 8.466971485177055e-05 H 0.15463917525773194 H 0.0 NA NA H 0.14948453608247422 H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.010309278350515464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 557565 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.0 0.0 0.2 0.17 2224G>A T743I Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.24718469381332397 34.28451703190803 H 0.9970617890357972 1.6939051420195028e-05 0.002921227132901549 H 0.0009787729941308498 0.99078768491745 0.0056521063670516005 2.9140840069885607e-06 5.997518655931344e-06 0.0001939181674970314 0.0016236770898103714 0.0007548804860562086 -68.15886688232422 -40.85822296142578 0.0002024092973442748 H 0.3732394366197183 H 0.06338028169014084 NA NA H 0.38028169014084506 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.056338028169014086 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.07042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.04929577464788732 NA NA H 0.056338028169014086 H 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0157512542391642e-05 1.942129420316456e-05 1.1938999705307653e-05 8.184523698404771e-06 3 251278 7.016560175543417e-06 1.7612502387682562e-05 1 142520 aCt/aTt aCt/aTt 0 0 NA NA NA NA NA NA V744L Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.474147617816925 72.87648885846137 H 0.9940521121025084 6.351692718453705e-05 0.0058843111619353294 H 0.0016410546377301214 0.9800414443016052 0.012208856642246245 2.4489423594786786e-05 3.262982500018552e-05 0.0006193526205606759 0.004125455394387245 0.0013067984255030751 -66.8126220703125 -43.29286575317383 0.0009408200858160851 H 0.1619718309859155 H 0.2605633802816901 NA NA H 0.15492957746478872 H 0.2676056338028169 NA NA H 0.3380281690140845 NA NA H 0.2605633802816901 H 0.2605633802816901 NA NA NA NA NA NA H 0.35211267605633795 NA NA H 0.3028169014084507 H 0.19014084507042253 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.980610017606523e-06 8.555597362648955e-06 3.980610017606523e-06 8.555597362648955e-06 1 251218 NA NA NA NA Gta/Cta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A745E Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.01639464497566223 1.806689876317978 H 0.9939940571784972 2.7650376068777405e-05 0.005978314206004143 H 0.0024218109901994467 0.983029007911682 0.008034788072109222 1.2375103324302472e-05 1.0039131666417234e-05 0.0004930543946102262 0.00453123776242137 0.0014678039588034153 -64.49208068847656 -39.13949966430664 0.0001408689859090373 H 0.18867924528301888 H 0.04716981132075472 NA NA H 0.2169811320754717 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.03773584905660377 H 0.04716981132075472 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 556699 VUS 2 7.963370080688037e-06 9.761998416961896e-06 7.963370080688037e-06 9.761998416961896e-06 2 251150 NA NA NA NA gCa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F747L Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.4544320702552795 91.20451650023459 H 0.9781745672225952 0.0002142086887033656 0.021611211821436882 H 0.013029567897319794 0.9456152915954592 0.017533333972096443 8.095305383903906e-05 0.00010902725625783204 0.002852033823728561 0.01607017032802105 0.004709546454250813 -67.52292633056639 -41.90569686889648 0.0010501622455194592 H 0.07614213197969544 H 0.41116751269035534 NA NA H 0.07614213197969544 H 0.39086294416243655 NA NA H 0.4314720812182741 NA NA H 0.3604060913705584 H 0.3604060913705584 NA NA NA NA NA NA T 0.4416243654822335 NA NA H 0.3807106598984771 H 0.3197969543147208 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.4119300431048032e-05 1.3856452156293265e-05 NA NA NA NA 1.4119300431048032e-05 1.3856452156293265e-05 2 141650 NA ttC/ttG NA 0 NA NA NA NA NA NA F747S Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.4544320702552795 91.20451650023459 H 0.9781745672225952 0.0002142086887033656 0.021611211821436882 H 0.013029567897319794 0.9456152915954592 0.017533333972096443 8.095305383903906e-05 0.00010902725625783204 0.002852033823728561 0.01607017032802105 0.004709546454250813 -67.52292633056639 -41.90569686889648 0.0010501622455194592 H 0.07614213197969544 H 0.41116751269035534 NA NA H 0.07614213197969544 H 0.39086294416243655 NA NA H 0.4314720812182741 NA NA H 0.3604060913705584 H 0.3604060913705584 NA NA NA NA NA NA T 0.4416243654822335 NA NA H 0.3807106598984771 H 0.3197969543147208 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.0954999854438935e-05 1.4549561627634425e-05 NA NA NA NA 2.0954999854438935e-05 1.4549561627634425e-05 3 143164 NA tTc/tCc NA 0 NA NA NA NA NA NA L748I Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.27581024169921875 50.50085525512695 H 0.9587331414222716 0.0003109549288637936 0.040955957025289536 H 0.02751709520816803 0.9173095822334292 0.00929087307304144 0.00016612150648143142 0.00017109884356614202 0.0042606834322214135 0.031659070402383804 0.009625430218875408 -67.33080291748047 -36.57882308959961 0.00256982515566051 H 0.14634146341463414 H 0.4329268292682927 NA NA H 0.14634146341463414 T 0.5487804878048781 NA NA H 0.4939024390243902 NA NA H 0.3048780487804878 H 0.3414634146341464 NA NA NA NA NA NA T 0.4207317073170732 NA NA H 0.4573170731707317 H 0.3780487804878049 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981529971497366e-06 9.442598493263426e-06 3.981529971497366e-06 9.442598493263426e-06 1 251160 NA NA NA NA Tta/Ata NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L748V Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA e 0.27581024169921875 50.50085525512695 H 0.9587331414222716 0.0003109549288637936 0.040955957025289536 H 0.02751709520816803 0.9173095822334292 0.00929087307304144 0.00016612150648143142 0.00017109884356614202 0.0042606834322214135 0.031659070402383804 0.009625430218875408 -67.33080291748047 -36.57882308959961 0.00256982515566051 H 0.14634146341463414 H 0.4329268292682927 NA NA H 0.14634146341463414 T 0.5487804878048781 NA NA H 0.4939024390243902 NA NA H 0.3048780487804878 H 0.3414634146341464 NA NA NA NA NA NA T 0.4207317073170732 NA NA H 0.4573170731707317 H 0.3780487804878049 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.0 0.0 0.4 0.0 2242T>G G749* Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 NA NA H 0.03571428571428571 S 0.07142857142857142 NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA G 0.05952380952380953 NA NA T 0.011904761904761904 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.86 0.0 0.0 0.14 0.86 2245G>T G749A Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.054251998662948615 4.269632294774056 H 0.9685030579566956 0.0001366578071611002 0.031360283493995667 H 0.028479890897870064 0.9212592244148254 0.012115406803786756 8.063037239480764e-05 5.4619871661998325e-05 0.003535166149958968 0.027577858418226242 0.006897225044667721 -66.8380126953125 -32.17439651489258 0.001364259165711701 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 NA NA H 0.03571428571428571 S 0.07142857142857142 NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA G 0.05952380952380953 NA NA T 0.011904761904761904 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.81 0.81 0.02 0.0 0.0 2246G>C G749E Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.054251998662948615 4.269632294774056 H 0.9685030579566956 0.0001366578071611002 0.031360283493995667 H 0.028479890897870064 0.9212592244148254 0.012115406803786756 8.063037239480764e-05 5.4619871661998325e-05 0.003535166149958968 0.027577858418226242 0.006897225044667721 -66.8380126953125 -32.17439651489258 0.001364259165711701 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 NA NA H 0.03571428571428571 S 0.07142857142857142 NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA G 0.05952380952380953 NA NA T 0.011904761904761904 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.47 0.47 0.01 0.0 0.0 2246G>A G749R Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.054251998662948615 4.269632294774056 H 0.9685030579566956 0.0001366578071611002 0.031360283493995667 H 0.028479890897870064 0.9212592244148254 0.012115406803786756 8.063037239480764e-05 5.4619871661998325e-05 0.003535166149958968 0.027577858418226242 0.006897225044667721 -66.8380126953125 -32.17439651489258 0.001364259165711701 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 NA NA H 0.03571428571428571 S 0.07142857142857142 NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA G 0.05952380952380953 NA NA T 0.011904761904761904 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.85 0.0 0.0 0.13 0.85 2245G>C G749V Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|33 NA NA NA NA b 0.054251998662948615 4.269632294774056 H 0.9685030579566956 0.0001366578071611002 0.031360283493995667 H 0.028479890897870064 0.9212592244148254 0.012115406803786756 8.063037239480764e-05 5.4619871661998325e-05 0.003535166149958968 0.027577858418226242 0.006897225044667721 -66.8380126953125 -32.17439651489258 0.001364259165711701 H 0.023809523809523808 H 0.023809523809523808 NA NA H 0.03571428571428571 S 0.07142857142857142 NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA G 0.05952380952380953 NA NA T 0.011904761904761904 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.64 0.64 0.04 0.0 0.0 2246G>T L751S Sterol-sensing TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4585584998130798 83.96206131577492 H 0.5522343516349792 0.0014663611073046925 0.446299284696579 H 0.06232234835624695 0.4684641063213349 0.006403309758752585 0.0003405317256692797 0.0003766920417547226 0.02236042730510235 0.4208309352397919 0.018901612609624863 -89.82225036621094 -16.349418640136722 0.00458720698952675 H 0.03048780487804878 T 0.6646341463414634 NA NA H 0.024390243902439025 - 0.774390243902439 NA NA T 0.6707317073170732 NA NA T 0.3780487804878049 T 0.5182926829268293 NA NA NA NA NA NA G 0.6890243902439024 NA NA T 0.6341463414634146 T 0.3780487804878049 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97730991608114e-06 8.403973349874559e-06 3.97730991608114e-06 8.403973349874559e-06 1 251426 NA NA NA NA tTg/tCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V753M Sterol-sensing NA Lumenal|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5022202134132385 77.19124680161475 C 0.014785370789468287 0.009575859643518923 0.9756386876106262 C 0.010937107726931572 0.008987876586616041 0.0005235159769654273 0.006887413561344147 0.005983029492199421 0.2326580286026001 0.1131046712398529 0.620918333530426 -86.09659576416016 52.34013366699219 0.002461040625348687 H 0.3380281690140845 S 0.7323943661971831 NA NA H 0.3380281690140845 - 0.6408450704225352 NA NA S 0.6267605633802817 NA NA S 0.7535211267605634 S 0.6267605633802817 NA NA NA NA NA NA S 0.6901408450704225 NA NA S 0.647887323943662 S 0.7183098591549296 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 287771 conflict 1 0.0001874659575896973 1.8974490154870974e-05 0.00019091399735771117 8.963425062402311e-06 48 251422 0.00018141699547413737 1.672388375312367e-05 26 143316 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA V757M Sterol-sensing NA Lumenal|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.09932759404182434 15.2666512042284 H 0.9818603396415708 0.0006515177665278318 0.01748824492096901 H 0.015732962638139725 0.9641625881195068 0.001432419172488153 0.00044965455890633166 0.00026316349976696074 0.0021617459133267407 0.007669827900826931 0.008127680979669094 -69.73873138427734 -37.74259948730469 0.0013555309269577265 H 0.4929577464788733 H 0.0 NA NA H 0.4788732394366197 T 0.007042253521126761 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.056338028169014086 H 0.04929577464788732 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326264 VUS 2 1.013318629924956e-05 1.6633794620680794e-05 7.954249667818656e-06 8.15211288369796e-06 2 251438 1.3956299881101584e-05 1.4499178563437135e-05 2 143304 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA T759A Sterol-sensing NA Lumenal|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.2211211919784546 30.669509327411646 H 0.9965067505836488 0.00010153453331440689 0.003391659120097757 H 0.003026186255738139 0.9920094013214112 0.001609027269296348 3.038730028492864e-05 3.393765291548334e-05 0.00033747489214874804 0.0022732203360646963 0.000680381723213941 -66.146240234375 -38.73067855834961 0.00014742149505764246 H 0.07746478873239436 H 0.11267605633802814 NA NA H 0.07042253521126761 H 0.09859154929577464 NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.09154929577464788 H 0.07042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.1267605633802817 NA NA H 0.09154929577464788 H 0.1056338028169014 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 288095 VUS 1 1.7734077079171408e-05 1.6802090597588818e-05 7.953800377435982e-06 8.853966757835715e-06 2 251452 3.489959999569692e-05 1.427996922618262e-05 5 143268 Acc/Gcc Acc/Gcc 0 0 NA NA NA NA NA NA S761T Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.04296976327896118 5.036056256294251 H 0.998016357421875 1.5435001841979098e-05 0.001968218944966793 H 0.0005581170553341508 0.9964411854743958 0.0014163911109790206 6.414101790142013e-06 3.059642267544405e-06 0.0001904633390950039 0.000936347001697868 0.000447998841991648 -64.96019744873047 -41.79344177246094 0.0001138861625804566 H 0.4307692307692308 H 0.0 NA NA H 0.4230769230769231 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.0 NA NA H 0.038461538461538464 H 0.02307692307692308 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.04615384615384616 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976870175392833e-06 8.880993667181474e-06 3.976870175392833e-06 8.880993667181474e-06 1 251454 NA NA NA NA Tct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F763S Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.17143037915229795 34.4060770958662 H 0.9976922273635864 7.523222302552313e-05 0.002232498489320278 H 0.001093947677873075 0.9929574728012084 0.003446641378104687 2.5082152205868624e-05 2.896145815611817e-05 0.00024470919743180286 0.0015670323045924304 0.0006362755666486919 -66.18431091308594 -41.70772933959961 0.00021326483692973847 H 0.02538071065989848 H 0.0 NA NA H 0.02538071065989848 H 0.015228426395939087 NA NA H 0.01015228426395939 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.005076142131979695 NA NA H 0.005076142131979695 H 0.02030456852791878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 808373 VUS 1 3.976620064349845e-06 8.34205628633775e-06 3.976620064349845e-06 8.34205628633775e-06 1 251470 NA NA NA NA tTt/tCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A764= Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.03729695081710816 4.110123980045318 H 0.998723566532135 1.3793540347251113e-05 0.0012626413954421878 H 0.0004892741562798619 0.9960482716560364 0.002210532547906041 2.519483814467094e-06 4.094982159585926e-06 0.00010072944132843986 0.0007951627485454082 0.0003493613039609045 -64.51483154296875 -41.98091125488281 0.00011160124995512888 H 0.22641509433962265 H 0.0 NA NA H 0.2169811320754717 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.009433962264150943 H 0.02830188679245283 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.95 0.95 0.1 0.0 0.0 2292G>A A764V Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.03729695081710816 4.110123980045318 H 0.998723566532135 1.3793540347251113e-05 0.0012626413954421878 H 0.0004892741562798619 0.9960482716560364 0.002210532547906041 2.519483814467094e-06 4.094982159585926e-06 0.00010072944132843986 0.0007951627485454082 0.0003493613039609045 -64.51483154296875 -41.98091125488281 0.00011160124995512888 H 0.22641509433962265 H 0.0 NA NA H 0.2169811320754717 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.009433962264150943 H 0.02830188679245283 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9771598494553464e-06 9.248045413900098e-06 3.9771598494553464e-06 9.248045413900098e-06 1 251436 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G765* Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4047619047619048 H 0.0 NA NA H 0.3809523809523809 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.3 0.0 0.0 0.0 2293G>T L766= Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.39589959383010864 72.48921563029289 H 0.9981502294540404 6.248765566851945e-05 0.0017873861361294985 H 0.0006138116004876792 0.9923585057258606 0.005156867206096649 1.8133476260118186e-05 2.918443715316243e-05 0.00017600602586753666 0.0011800579959526658 0.0004673042858485133 -65.36978149414061 -43.43909072875977 0.0004149103770032525 H 0.4207317073170732 H 0.18292682926829268 NA NA H 0.4207317073170732 H 0.22560975609756095 NA NA H 0.21341463414634146 NA NA H 0.22560975609756095 H 0.18292682926829268 NA NA NA NA NA NA H 0.21341463414634146 NA NA H 0.1524390243902439 H 0.18902439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 2298G>A A767G Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.02028411626815796 2.235309612751008 H 0.9986541271209716 2.0818926714127883e-05 0.0013250010088086126 H 0.0006271263118833302 0.994748055934906 0.003258321667090059 4.354616066848394e-06 6.415727966668783e-06 0.00011587203334784135 0.0008837251225486399 0.00035617043613456184 -64.12541961669922 -42.450889587402344 0.00012110239185858518 H 0.1792452830188679 H 0.0 NA NA H 0.18867924528301888 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.009433962264150943 NA NA H 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976740117650479e-06 9.746622481525321e-06 3.976740117650479e-06 9.746622481525321e-06 1 251462 NA NA NA NA gCa/gGa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A767T Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.02028411626815796 2.235309612751008 H 0.9986541271209716 2.0818926714127883e-05 0.0013250010088086126 H 0.0006271263118833302 0.994748055934906 0.003258321667090059 4.354616066848394e-06 6.415727966668783e-06 0.00011587203334784135 0.0008837251225486399 0.00035617043613456184 -64.12541961669922 -42.450889587402344 0.00012110239185858518 H 0.1792452830188679 H 0.0 NA NA H 0.18867924528301888 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.009433962264150943 NA NA H 0.0 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.57 0.57 0.0 0.0 0.0 2299G>A F769L Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.4522269666194916 90.76195220053197 H 0.9970126152038574 2.1733629182563167e-05 0.0029656363185495143 H 0.000729175575543195 0.9840473532676696 0.012393614277243614 4.994578830519458e-06 8.212826287490317e-06 0.00021723422105424103 0.0018647401593625548 0.0007346121710725129 -65.87297821044922 -44.24409866333008 0.0003452856617514044 H 0.41116751269035534 H 0.4213197969543147 NA NA H 0.4162436548223351 H 0.39593908629441626 NA NA H 0.3857868020304568 NA NA H 0.39593908629441626 H 0.3553299492385787 NA NA NA NA NA NA H 0.3654822335025381 NA NA H 0.4162436548223351 H 0.4060913705583756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 2307C>A I770V Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.3031880855560303 56.0897958278656 H 0.9950957894325256 5.255210271570832e-05 0.004851686768233776 H 0.0011864075204357505 0.9820111393928528 0.012266203761100769 1.803312625270337e-05 2.544854214647785e-05 0.0003700286033563317 0.0027154977433383465 0.0014072515768930314 -66.39751434326172 -40.80704116821289 0.000848160358145833 H 0.4142011834319527 H 0.05325443786982249 NA NA H 0.4142011834319527 H 0.1893491124260355 NA NA H 0.035502958579881665 NA NA H 0.07100591715976333 H 0.1242603550295858 NA NA NA NA NA NA H 0.059171597633136085 NA NA H 0.059171597633136085 H 0.0650887573964497 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 8.666381977576193e-06 3.9766500776750036e-06 8.666381977576193e-06 1 251468 NA NA NA NA Att/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D771V Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.011216580867767334 1.6163093030452729 H 0.9962887763977052 3.6730947613250464e-05 0.0036745348479598756 H 0.001919321133755148 0.9815605878829956 0.012616137042641641 9.620279342925642e-06 1.3647652849613225e-05 0.0003352948115207255 0.0021650823764503 0.0013803248293697836 -65.22407531738281 -39.00616836547852 0.0002189488150179386 H 0.4662576687116564 H 0.0 NA NA H 0.4785276073619632 H 0.0 NA NA H 0.006134969325153374 NA NA H 0.030674846625766868 H 0.018404907975460124 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.04294478527607362 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.4 0.0 0.0 0.0 2312A>T D771Y Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.011216580867767334 1.6163093030452729 H 0.9962887763977052 3.6730947613250464e-05 0.0036745348479598756 H 0.001919321133755148 0.9815605878829956 0.012616137042641641 9.620279342925642e-06 1.3647652849613225e-05 0.0003352948115207255 0.0021650823764503 0.0013803248293697836 -65.22407531738281 -39.00616836547852 0.0002189488150179386 H 0.4662576687116564 H 0.0 NA NA H 0.4785276073619632 H 0.0 NA NA H 0.006134969325153374 NA NA H 0.030674846625766868 H 0.018404907975460124 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.04294478527607362 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0 2311G>T F772C Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.16378790140151978 32.87223181128502 H 0.9965835809707642 1.7375992683810185e-05 0.0033990477677434683 H 0.0008731686975806953 0.9880568981170654 0.008514455519616604 4.2352949094492925e-06 5.5450313993787876e-06 0.00021897262195125225 0.0013323180610314012 0.0009944533230736852 -65.43894958496094 -40.57944107055664 0.00016776386473793536 - 0.5837563451776651 H 0.06598984771573604 NA NA - 0.5786802030456852 H 0.06598984771573604 NA NA H 0.05076142131979696 NA NA H 0.07106598984771574 H 0.05583756345177665 NA NA NA NA NA NA H 0.05076142131979696 NA NA H 0.07106598984771574 H 0.0964467005076142 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 8.873269220160308e-06 3.9765500332578085e-06 8.873269220160308e-06 1 251474 NA NA NA NA tTt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F772V Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.16378790140151978 32.87223181128502 H 0.9965835809707642 1.7375992683810185e-05 0.0033990477677434683 H 0.0008731686975806953 0.9880568981170654 0.008514455519616604 4.2352949094492925e-06 5.5450313993787876e-06 0.00021897262195125225 0.0013323180610314012 0.0009944533230736852 -65.43894958496094 -40.57944107055664 0.00016776386473793536 - 0.5837563451776651 H 0.06598984771573604 NA NA - 0.5786802030456852 H 0.06598984771573604 NA NA H 0.05076142131979696 NA NA H 0.07106598984771574 H 0.05583756345177665 NA NA NA NA NA NA H 0.05076142131979696 NA NA H 0.07106598984771574 H 0.0964467005076142 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 594892 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L773F Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.4105669260025024 75.17480415105821 H 0.9948457479476928 4.476805042941123e-05 0.005109560210257769 H 0.001682781963609159 0.9595229029655457 0.03377162665128708 1.7024971384671513e-05 1.921611328725703e-05 0.00044350538519211113 0.003055355278775096 0.0014875645283609627 -65.62254333496094 -44.04369735717773 0.000801600341219455 NA NA H 0.4268292682926829 NA NA NA NA H 0.5060975609756098 NA NA H 0.36585365853658536 NA NA H 0.4329268292682927 H 0.4390243902439024 NA NA NA NA NA NA H 0.39634146341463417 NA NA H 0.4024390243902439 H 0.38414634146341453 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953110070957338e-06 8.717578686651598e-06 7.953110070957338e-06 8.717578686651598e-06 2 251474 NA NA NA NA Ctt/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L773I Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.4105669260025024 75.17480415105821 H 0.9948457479476928 4.476805042941123e-05 0.005109560210257769 H 0.001682781963609159 0.9595229029655457 0.03377162665128708 1.7024971384671513e-05 1.921611328725703e-05 0.00044350538519211113 0.003055355278775096 0.0014875645283609627 -65.62254333496094 -44.04369735717773 0.000801600341219455 NA NA H 0.4268292682926829 NA NA NA NA H 0.5060975609756098 NA NA H 0.36585365853658536 NA NA H 0.4329268292682927 H 0.4390243902439024 NA NA NA NA NA NA H 0.39634146341463417 NA NA H 0.4024390243902439 H 0.38414634146341453 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 8.17576926186797e-06 3.9765500332578085e-06 8.17576926186797e-06 1 251474 NA NA NA NA Ctt/Att NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L774= Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.14698079228401184 26.91218306720257 H 0.9920148849487304 5.4832449677633115e-05 0.007930171675980091 H 0.0022529596462845802 0.9498100876808168 0.03960796818137169 4.004877337138169e-05 2.138739182555583e-05 0.000703784404322505 0.00496514979749918 0.002598568331450224 -67.91831207275389 -40.05896377563477 0.0010468843393027782 NA NA H 0.03048780487804878 NA NA NA NA H 0.08536585365853659 NA NA H 0.018292682926829267 NA NA H 0.042682926829268296 H 0.07317073170731707 NA NA NA NA NA NA I 0.03048780487804878 NA NA H 0.024390243902439025 H 0.024390243902439025 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.55 0.55 0.0 0.0 0.0 2320C>T Q775P Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.0516832172870636 9.230622607469556 H 0.9886283278465272 8.55857360875234e-05 0.011286129243671894 H 0.008077394217252731 0.9147974252700806 0.06437122076749803 3.3734650060068816e-05 3.561074481694959e-05 0.0011382382363080974 0.00826679915189743 0.0032795772422105074 -70.31606292724611 -36.65025329589844 0.000426835409598425 NA NA I 0.045454545454545456 NA NA NA NA I 0.0505050505050505 NA NA I 0.015151515151515154 NA NA I 0.020202020202020204 I 0.030303030303030307 NA NA NA NA NA NA I 0.010101010101010102 NA NA I 0.0505050505050505 H 0.040404040404040414 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 21134 pathogenic 1 7.953230124257969e-06 7.858763617762093e-06 7.953230124257969e-06 7.858763617762093e-06 2 251470 NA NA NA NA cAg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I776V Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.26554280519485474 49.12541896104813 H 0.959228515625 0.0004994095070287585 0.040272127836942666 H 0.01939532905817032 0.8347637057304382 0.10652144253253937 0.00015955181152094156 0.00019007784430868924 0.002739171031862497 0.02941728569567204 0.006813440937548876 -72.4268798828125 -34.50959014892578 0.0007441026391461493 NA NA I 0.08284023668639054 NA NA NA NA I 0.16568047337278108 NA NA I 0.0650887573964497 NA NA I 0.035502958579881665 I 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA I 0.05325443786982249 NA NA I 0.08284023668639054 H 0.1301775147928994 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 2326A>G T777N Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.2383173108100891 33.054611009359355 H 0.7872810363769531 0.0016403368208557367 0.21107858419418327 H 0.05213085561990738 0.5896469354629517 0.11001618951559068 0.000743801414500922 0.0005823111860081552 0.01746535487473011 0.20430347323417666 0.025111043825745586 -79.88327026367188 -27.19267463684082 0.0030175475403666496 NA NA I 0.19718309859154928 NA NA NA NA I 0.2746478873239437 NA NA I 0.19014084507042253 NA NA I 0.14788732394366194 I 0.11971830985915492 NA NA NA NA NA NA I 0.24647887323943665 NA NA I 0.2112676056338028 H 0.15492957746478872 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9765500332578085e-06 9.168433645336736e-06 3.9765500332578085e-06 9.168433645336736e-06 1 251474 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C778Y Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.06836339831352234 9.598221123218538 H 0.8753273487091064 0.00013072795991320163 0.12454190105199815 H 0.03146607428789139 0.7081083059310913 0.1086917296051979 0.00018329886370338502 3.1659830710850656e-05 0.012109885923564434 0.12183065712451935 0.017578408122062683 -77.57821655273438 -31.07084083557129 0.0007846910157240927 NA NA I 0.02962962962962963 NA NA NA NA I 0.11851851851851852 NA NA I 0.0962962962962963 NA NA I 0.13333333333333333 I 0.15555555555555556 NA NA NA NA NA NA I 0.04444444444444445 NA NA I 0.014814814814814815 H 0.17037037037037034 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 7.960061667640404e-06 3.976490006607492e-06 7.960061667640404e-06 1 251478 NA NA NA NA tGt/tAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F779C Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.1968655288219452 39.5109116345644 H 0.9766875505447388 0.00014537175593432042 0.02316705510020256 H 0.014776356518268585 0.9195978045463562 0.03664861246943474 6.073638360248879e-05 5.248351590125822e-05 0.003172031370922923 0.020747728645801544 0.0049442676827311524 -66.34507751464844 -42.25973510742188 0.00199263752438128 NA NA I 0.015228426395939087 NA NA NA NA I 0.02538071065989848 NA NA I 0.005076142131979695 NA NA I 0.015228426395939087 I 0.04060913705583756 NA NA NA NA NA NA H 0.01015228426395939 NA NA I 0.005076142131979695 H 0.06598984771573604 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 8.627300704257463e-06 3.976490006607492e-06 8.627300704257463e-06 1 251478 NA NA NA NA tTc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F779L Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.1968655288219452 39.5109116345644 H 0.9766875505447388 0.00014537175593432042 0.02316705510020256 H 0.014776356518268585 0.9195978045463562 0.03664861246943474 6.073638360248879e-05 5.248351590125822e-05 0.003172031370922923 0.020747728645801544 0.0049442676827311524 -66.34507751464844 -42.25973510742188 0.00199263752438128 NA NA I 0.015228426395939087 NA NA NA NA I 0.02538071065989848 NA NA I 0.005076142131979695 NA NA I 0.015228426395939087 I 0.04060913705583756 NA NA NA NA NA NA H 0.01015228426395939 NA NA I 0.005076142131979695 H 0.06598984771573604 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 557126 VUS 1 6.977879820624366e-06 1.681737809562248e-05 NA NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.681737809562248e-05 1 143310 NA ttC/ttA NA 0 0.89 0.0 0.0 0.89 0.37 2337C>G F779Y Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.1968655288219452 39.5109116345644 H 0.9766875505447388 0.00014537175593432042 0.02316705510020256 H 0.014776356518268585 0.9195978045463562 0.03664861246943474 6.073638360248879e-05 5.248351590125822e-05 0.003172031370922923 0.020747728645801544 0.0049442676827311524 -66.34507751464844 -42.25973510742188 0.00199263752438128 NA NA I 0.015228426395939087 NA NA NA NA I 0.02538071065989848 NA NA I 0.005076142131979695 NA NA I 0.015228426395939087 I 0.04060913705583756 NA NA NA NA NA NA H 0.01015228426395939 NA NA I 0.005076142131979695 H 0.06598984771573604 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.27 0.0 2336T>A V780= Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.21123260259628296 32.46645101904869 H 0.9902957081794742 0.00034763425355777144 0.009356631897389887 H 0.02115837298333645 0.9526327848434448 0.014190964400768282 7.253089279402047e-05 0.00016460989718325436 0.001109894132241607 0.008855682797729969 0.0018152353586629035 -64.91419982910156 -38.79739761352539 0.002819279441609979 NA NA H 0.007042253521126761 NA NA NA NA H 0.056338028169014086 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA H 0.007042253521126761 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.1267605633802817 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.59 0.0 0.0 0.59 0.04 2340G>A V780M Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.21123260259628296 32.46645101904869 H 0.9902957081794742 0.00034763425355777144 0.009356631897389887 H 0.02115837298333645 0.9526327848434448 0.014190964400768282 7.253089279402047e-05 0.00016460989718325436 0.001109894132241607 0.008855682797729969 0.0018152353586629035 -64.91419982910156 -38.79739761352539 0.002819279441609979 NA NA H 0.007042253521126761 NA NA NA NA H 0.056338028169014086 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA H 0.007042253521126761 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.1267605633802817 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.079796996099449e-05 1.566131017767835e-05 7.555329648312181e-05 9.1707336424237e-06 19 251478 3.4898701414931566e-05 1.2695443314085946e-05 5 143272 Gtg/Atg Gtg/Atg 1 0 NA NA NA NA NA NA S781G Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.06617125868797302 7.755271518230439 H 0.9948468208312988 0.00012373512436170128 0.005029512103646994 H 0.018865196034312248 0.969699203968048 0.005125001538544893 4.334430559538305e-05 8.052822522586212e-05 0.0005752160213887691 0.004091066773980856 0.0015204527880996466 -65.61138153076172 -38.56255722045898 0.0011458352673798802 NA NA H 0.0 NA NA NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.0 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 9.424395849215753e-06 3.976490006607492e-06 9.424395849215753e-06 1 251478 NA NA NA NA Agt/Ggt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L782I Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.08477979898452759 15.523181194067002 H 0.9889053106307985 0.00024236673198174683 0.010852260515093805 H 0.01417436730116606 0.9609158635139464 0.011731569655239582 8.418715151492506e-05 0.00012990630057174712 0.0012895917752757668 0.008389945141971111 0.003284645965322852 -68.04592895507811 -38.05576705932617 0.0017363788792863488 NA NA H 0.25609756097560976 NA NA NA NA T 0.201219512195122 NA NA H 0.21341463414634146 NA NA H 0.2682926829268293 H 0.2195121951219512 NA NA NA NA NA NA H 0.2621951219512195 NA NA H 0.2926829268292683 H 0.2682926829268293 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976459993282333e-06 9.401542184276466e-06 3.976459993282333e-06 9.401542184276466e-06 1 251480 NA NA NA NA Ctc/Atc NA 0 NA 0.78 0.0 0.0 0.78 0.16 2344C>A L783F Sterol-sensing TRANSMEM|7 NA NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.267383486032486 48.95791629254818 H 0.9404786825180054 0.001727522350847721 0.0577937513589859 H 0.024304702877998352 0.8932775855064392 0.02156959846615792 0.0005109289777465165 0.0008573533850722015 0.005260967183858156 0.042408451437950134 0.011810412630438805 -67.45340728759766 -35.152599334716804 0.005558028351515532 NA NA H 0.0 NA NA NA NA H 0.0975609756097561 NA NA H 0.03658536585365853 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.03658536585365853 NA NA H 0.0 H 0.04878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326262 VUS 2 7.093171679535605e-05 1.7440972186508948e-05 9.94138972600922e-05 8.735877402823704e-06 25 251474 2.093920011247974e-05 1.5095428341501707e-05 3 143272 ttG/ttC ttG/ttC 0 0 NA NA NA NA NA NA G784A Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.15275833010673526 12.022080579400065 H 0.8570163249969482 0.002331972122192383 0.14065170288085938 H 0.03298598527908325 0.8067216277122498 0.01657218113541603 0.0007401237380690872 0.0011982112191617489 0.012410880066454407 0.10273316502571106 0.02663774974644184 -68.22071075439453 -30.63776969909668 0.005860807839781046 NA NA H 0.023809523809523808 NA NA NA NA H 0.08333333333333333 NA NA H 0.09523809523809523 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.03571428571428571 NA NA NA NA NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.03571428571428571 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.066498724000997e-06 1.8551451613208946e-05 3.976459993282333e-06 8.385715029892327e-06 1 251480 6.9798297772649676e-06 1.6547995056642687e-05 1 143270 gGg/gCg gGg/gCg 0 0 NA NA NA NA NA NA G784R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.15275833010673526 12.022080579400065 H 0.8570163249969482 0.002331972122192383 0.14065170288085938 H 0.03298598527908325 0.8067216277122498 0.01657218113541603 0.0007401237380690872 0.0011982112191617489 0.012410880066454407 0.10273316502571106 0.02663774974644184 -68.22071075439453 -30.63776969909668 0.005860807839781046 NA NA H 0.023809523809523808 NA NA NA NA H 0.08333333333333333 NA NA H 0.09523809523809523 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.03571428571428571 NA NA NA NA NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.03571428571428571 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.431596620714446e-05 NA NA NA NA 6.9798297772649676e-06 1.431596620714446e-05 1 143270 NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA L785* Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.4390243902439024 NA NA NA NA H 0.475609756097561 NA NA H 0.5060975609756098 NA NA H 0.3902439024390244 H 0.3475609756097561 NA NA NA NA NA NA H 0.4146341463414634 NA NA H 0.4329268292682927 H 0.4268292682926829 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.69 0.0 0.0 0.69 0.08 2354T>A I787V Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.31422072649002075 58.13083440065384 H 0.895837128162384 0.002627611858770252 0.10153529047966003 H 0.022002940997481343 0.8628312945365906 0.02486397698521614 0.0010045100934803486 0.0014115885132923722 0.010486324317753315 0.037011470645666115 0.04038795083761215 -65.37908935546875 -37.77496719360352 0.023872656747698784 NA NA H 0.02958579881656805 NA NA NA NA H 0.20118343195266272 NA NA H 0.01183431952662722 NA NA H 0.13609467455621302 H 0.1124260355029586 NA NA NA NA NA NA H 0.02958579881656805 NA NA H 0.05325443786982249 H 0.08875739644970414 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 833679 conflict 1 8.864971320432146e-05 1.6960326348884697e-05 0.00010736600233940408 1.0255717269544136e-05 27 251476 5.5812899518059573e-05 1.350825425981636e-05 8 143336 Att/Gtt Att/Gtt 0 0 NA NA NA NA NA NA K788E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.3835128545761109 78.888594186306 H 0.934018850326538 0.0024432255886495113 0.06353799253702164 H 0.017040465027093887 0.909454882144928 0.013059070333838465 0.0007374062552116811 0.0016432541888207195 0.005317491479218006 0.022248335182666786 0.03049917332828045 -66.07476043701172 -40.162899017333984 0.0182682890444994 NA NA H 0.4780487804878049 NA NA NA NA H 0.5414634146341464 NA NA H 0.5707317073170731 NA NA H 0.4097560975609756 H 0.5463414634146342 NA NA NA NA NA NA H 0.4146341463414634 NA NA H 0.4926829268292683 H 0.6097560975609756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9773900577274625e-06 1.3689565931162544e-05 NA NA NA NA 6.9773900577274625e-06 1.3689565931162544e-05 1 143320 NA Aaa/Gaa NA 0 NA NA NA NA NA NA R789C Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.15391448140144348 35.246416240930564 H 0.9260784983634948 0.0071250549517571935 0.0667964443564415 H 0.019226539880037308 0.8927904963493347 0.019338054582476616 0.0018815530929714441 0.004280894529074431 0.005937445443123579 0.02274916134774685 0.033795736730098724 -67.62563323974611 -37.59367370605469 0.025248315185308456 NA NA H 0.1693548387096774 NA NA NA NA H 0.4354838709677419 NA NA H 0.31048387096774194 NA NA T 0.2862903225806452 T 0.2903225806451613 NA NA NA NA NA NA H 0.2459677419354839 NA NA H 0.1975806451612903 H 0.3790322580645161 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 554973 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R789H Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA b 0.15391448140144348 35.246416240930564 H 0.9260784983634948 0.0071250549517571935 0.0667964443564415 H 0.019226539880037308 0.8927904963493347 0.019338054582476616 0.0018815530929714441 0.004280894529074431 0.005937445443123579 0.02274916134774685 0.033795736730098724 -67.62563323974611 -37.59367370605469 0.025248315185308456 NA NA H 0.1693548387096774 NA NA NA NA H 0.4354838709677419 NA NA H 0.31048387096774194 NA NA T 0.2862903225806452 T 0.2903225806451613 NA NA NA NA NA NA H 0.2459677419354839 NA NA H 0.1975806451612903 H 0.3790322580645161 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 132898 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q790R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.3461720645427704 61.82633072733879 H 0.887104868888855 0.0035189907066524033 0.1093762218952179 H 0.02377377264201641 0.8660013675689697 0.014497799798846243 0.0010459452169016004 0.0017884151311591265 0.00713897356763482 0.0516003854572773 0.03415336087346077 -64.69822692871094 -40.3238410949707 0.0139199486002326 NA NA H 0.21212121212121213 NA NA NA NA H 0.20707070707070707 NA NA H 0.3080808080808081 NA NA T 0.2878787878787879 T 0.3181818181818182 NA NA NA NA NA NA H 0.3787878787878788 NA NA H 0.23737373737373735 H 0.19696969696969696 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.066628591251722e-06 1.608233634738571e-05 3.976780135417357e-06 7.420248410227025e-06 1 251460 6.979340014368062e-06 1.4268197360597684e-05 1 143280 cAa/cGa cAa/cGa 0 0 NA NA NA NA NA NA E791= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.646258533000946 112.90136571526527 H 0.8138274550437927 0.005645505618304014 0.1805269569158554 H 0.0270098838955164 0.8023297786712646 0.00955477636307478 0.0012129481183364987 0.003738798899576068 0.015509320423007013 0.0902206003665924 0.05042388662695885 -67.86246490478516 -35.402793884277344 0.02734212763607502 NA NA H 0.4793814432989691 NA NA NA NA H 0.6288659793814433 NA NA H 0.3969072164948453 NA NA T 0.6907216494845361 T 0.5515463917525774 NA NA NA NA NA NA H 0.4793814432989691 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.7835051546391752 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.58 0.0 0.0 0.58 0.07 2373G>A E791D Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.646258533000946 112.90136571526527 H 0.8138274550437927 0.005645505618304014 0.1805269569158554 H 0.0270098838955164 0.8023297786712646 0.00955477636307478 0.0012129481183364987 0.003738798899576068 0.015509320423007013 0.0902206003665924 0.05042388662695885 -67.86246490478516 -35.402793884277344 0.02734212763607502 NA NA H 0.4793814432989691 NA NA NA NA H 0.6288659793814433 NA NA H 0.3969072164948453 NA NA T 0.6907216494845361 T 0.5515463917525774 NA NA NA NA NA NA H 0.4793814432989691 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.7835051546391752 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.65 0.0 0.0 0.65 0.1 2373G>T E791G Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.646258533000946 112.90136571526527 H 0.8138274550437927 0.005645505618304014 0.1805269569158554 H 0.0270098838955164 0.8023297786712646 0.00955477636307478 0.0012129481183364987 0.003738798899576068 0.015509320423007013 0.0902206003665924 0.05042388662695885 -67.86246490478516 -35.402793884277344 0.02734212763607502 NA NA H 0.4793814432989691 NA NA NA NA H 0.6288659793814433 NA NA H 0.3969072164948453 NA NA T 0.6907216494845361 T 0.5515463917525774 NA NA NA NA NA NA H 0.4793814432989691 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.7835051546391752 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.46 0.0 0.0 0.46 0.04 2372A>G E791Q Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.646258533000946 112.90136571526527 H 0.8138274550437927 0.005645505618304014 0.1805269569158554 H 0.0270098838955164 0.8023297786712646 0.00955477636307478 0.0012129481183364987 0.003738798899576068 0.015509320423007013 0.0902206003665924 0.05042388662695885 -67.86246490478516 -35.402793884277344 0.02734212763607502 NA NA H 0.4793814432989691 NA NA NA NA H 0.6288659793814433 NA NA H 0.3969072164948453 NA NA T 0.6907216494845361 T 0.5515463917525774 NA NA NA NA NA NA H 0.4793814432989691 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.7835051546391752 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 9.13717839681711e-06 3.9766500776750036e-06 9.13717839681711e-06 1 251468 NA NA NA NA Gag/Cag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E791V Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|34 NA NA NA NA e 0.646258533000946 112.90136571526527 H 0.8138274550437927 0.005645505618304014 0.1805269569158554 H 0.0270098838955164 0.8023297786712646 0.00955477636307478 0.0012129481183364987 0.003738798899576068 0.015509320423007013 0.0902206003665924 0.05042388662695885 -67.86246490478516 -35.402793884277344 0.02734212763607502 NA NA H 0.4793814432989691 NA NA NA NA H 0.6288659793814433 NA NA H 0.3969072164948453 NA NA T 0.6907216494845361 T 0.5515463917525774 NA NA NA NA NA NA H 0.4793814432989691 NA NA H 0.5360824742268041 H 0.7835051546391752 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.0 0.0 0.34 0.03 2372A>T K792= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5368865132331848 110.43755577206608 C 0.26016965508461 0.003631414147093892 0.7361989021301271 T 0.043272368609905236 0.1837214231491089 0.003121378365904093 0.0012905559269711375 0.001493553165346384 0.061397269368171685 0.6307264566421509 0.07497694343328476 -82.04523468017578 -4.0276198387146005 0.048063434660434716 NA NA T 0.6097560975609756 NA NA NA NA T 0.5121951219512195 NA NA T 0.7073170731707317 NA NA T 0.4780487804878049 T 0.5512195121951221 NA NA NA NA NA NA H 0.7560975609756098 NA NA T 0.7170731707317073 T 0.6341463414634146 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.97 0.97 0.0 0.0 0.0 2376A>G K792E Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5368865132331848 110.43755577206608 C 0.26016965508461 0.003631414147093892 0.7361989021301271 T 0.043272368609905236 0.1837214231491089 0.003121378365904093 0.0012905559269711375 0.001493553165346384 0.061397269368171685 0.6307264566421509 0.07497694343328476 -82.04523468017578 -4.0276198387146005 0.048063434660434716 NA NA T 0.6097560975609756 NA NA NA NA T 0.5121951219512195 NA NA T 0.7073170731707317 NA NA T 0.4780487804878049 T 0.5512195121951221 NA NA NA NA NA NA H 0.7560975609756098 NA NA T 0.7170731707317073 T 0.6341463414634146 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976900188717991e-06 1.0042383015407249e-05 3.976900188717991e-06 1.0042383015407249e-05 1 251452 NA NA NA NA Aaa/Gaa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K792R Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5368865132331848 110.43755577206608 C 0.26016965508461 0.003631414147093892 0.7361989021301271 T 0.043272368609905236 0.1837214231491089 0.003121378365904093 0.0012905559269711375 0.001493553165346384 0.061397269368171685 0.6307264566421509 0.07497694343328476 -82.04523468017578 -4.0276198387146005 0.048063434660434716 NA NA T 0.6097560975609756 NA NA NA NA T 0.5121951219512195 NA NA T 0.7073170731707317 NA NA T 0.4780487804878049 T 0.5512195121951221 NA NA NA NA NA NA H 0.7560975609756098 NA NA T 0.7170731707317073 T 0.6341463414634146 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.27 0.0 0.0 0.0 2375A>G N793D Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5865431427955627 85.86991610527039 C 0.03707454726099968 0.0014617708511650562 0.9614636898040771 T 0.007496939040720463 0.01906329207122326 0.0011294747237116098 0.00030817871447652584 0.0005186012131161988 0.05515043437480927 0.8232144713401794 0.09311865270137787 69.67412567138672 31.51752853393555 0.028216022998094562 NA NA T 0.6178343949044586 NA NA NA NA T 0.7515923566878981 NA NA T 0.8662420382165605 NA NA - 0.8407643312101911 - 0.8280254777070064 NA NA NA NA NA NA T 0.8535031847133758 NA NA T 0.5605095541401274 - 0.89171974522293 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.89 0.89 0.0 0.0 0.0 2377A>G N793Y Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5865431427955627 85.86991610527039 C 0.03707454726099968 0.0014617708511650562 0.9614636898040771 T 0.007496939040720463 0.01906329207122326 0.0011294747237116098 0.00030817871447652584 0.0005186012131161988 0.05515043437480927 0.8232144713401794 0.09311865270137787 69.67412567138672 31.51752853393555 0.028216022998094562 NA NA T 0.6178343949044586 NA NA NA NA T 0.7515923566878981 NA NA T 0.8662420382165605 NA NA - 0.8407643312101911 - 0.8280254777070064 NA NA NA NA NA NA T 0.8535031847133758 NA NA T 0.5605095541401274 - 0.89171974522293 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9768101487425164e-06 9.787602959321667e-06 3.9768101487425164e-06 9.787602959321667e-06 1 251458 NA NA NA NA Aat/Tat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R794= Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.347251296043396 79.52054679393768 C 0.04192979633808136 0.08402445912361145 0.8740457892417908 C 0.01418357528746128 0.014684680849313738 0.0011780045460909605 0.014055533334612843 0.05952659249305725 0.14637050032615662 0.050845351070165634 0.6991558074951172 -100.42327880859376 116.85576629638672 0.04385446012020111 NA NA - 0.31048387096774194 NA NA NA NA - 0.6774193548387096 NA NA - 0.6169354838709677 NA NA - 0.6733870967741935 - 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA - 0.625 NA NA - 0.33064516129032256 - 0.8830645161290323 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 2380C>A R794G Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.347251296043396 79.52054679393768 C 0.04192979633808136 0.08402445912361145 0.8740457892417908 C 0.01418357528746128 0.014684680849313738 0.0011780045460909605 0.014055533334612843 0.05952659249305725 0.14637050032615662 0.050845351070165634 0.6991558074951172 -100.42327880859376 116.85576629638672 0.04385446012020111 NA NA - 0.31048387096774194 NA NA NA NA - 0.6774193548387096 NA NA - 0.6169354838709677 NA NA - 0.6733870967741935 - 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA - 0.625 NA NA - 0.33064516129032256 - 0.8830645161290323 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977059805038151e-06 8.143470725558201e-06 3.977059805038151e-06 8.143470725558201e-06 1 251442 NA NA NA NA Cgg/Ggg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R794Q Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.347251296043396 79.52054679393768 C 0.04192979633808136 0.08402445912361145 0.8740457892417908 C 0.01418357528746128 0.014684680849313738 0.0011780045460909605 0.014055533334612843 0.05952659249305725 0.14637050032615662 0.050845351070165634 0.6991558074951172 -100.42327880859376 116.85576629638672 0.04385446012020111 NA NA - 0.31048387096774194 NA NA NA NA - 0.6774193548387096 NA NA - 0.6169354838709677 NA NA - 0.6733870967741935 - 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA - 0.625 NA NA - 0.33064516129032256 - 0.8830645161290323 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7733613552913145e-05 1.61869322093569e-05 1.5908099157968536e-05 8.088059876127693e-06 4 251444 2.0937099179718647e-05 1.4021414400497873e-05 3 143286 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R794W Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.347251296043396 79.52054679393768 C 0.04192979633808136 0.08402445912361145 0.8740457892417908 C 0.01418357528746128 0.014684680849313738 0.0011780045460909605 0.014055533334612843 0.05952659249305725 0.14637050032615662 0.050845351070165634 0.6991558074951172 -100.42327880859376 116.85576629638672 0.04385446012020111 NA NA - 0.31048387096774194 NA NA NA NA - 0.6774193548387096 NA NA - 0.6169354838709677 NA NA - 0.6733870967741935 - 0.7661290322580645 NA NA NA NA NA NA - 0.625 NA NA - 0.33064516129032256 - 0.8830645161290323 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.590819920238573e-05 8.612296279460214e-06 1.590819920238573e-05 8.612296279460214e-06 4 251442 NA NA NA NA Cgg/Tgg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D796N Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA STRAND|23 NA NA NA NA NA b 0.2072368562221527 29.86283098161221 C 0.048551738262176514 0.16815748810768127 0.7832908034324646 C 0.029318239539861683 0.01716172881424427 0.0005274852155707779 0.0219347570091486 0.14337699115276334 0.14647020399570465 0.07906538248062134 0.5621451735496521 -90.724609375 96.98778533935548 0.020659251138567924 NA NA S 0.030674846625766868 NA NA NA NA - 1.0 NA NA S 0.04294478527607362 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.0 NA NA S 0.05521472392638037 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|5u73-A NA NA NA 5.066471679920764e-06 1.835617670490785e-05 3.977059805038151e-06 7.943812355923732e-06 1 251442 6.977879820624366e-06 1.6548264817668196e-05 1 143310 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA I797F Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA STRAND|23 NA NA NA NA NA b 0.07735008001327515 14.309764802455902 C 0.05679101869463921 0.2744239866733551 0.668785035610199 C 0.042465902864933014 0.026821466162800792 0.00103906262665987 0.028019653633236885 0.2447236329317093 0.1300494521856308 0.10859397798776628 0.4182868897914887 -103.45829010009766 80.94891357421875 0.016160035505890846 NA NA S 0.5325443786982249 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.514792899408284 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.514792899408284 NA NA S 0.6035502958579881 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5u74-A|6w5s-A|nan|5u73-A NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.4875215084327014e-05 NA NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.4875215084327014e-05 1 143346 NA Atc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA I797V Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA STRAND|23 NA NA NA NA NA b 0.07735008001327515 14.309764802455902 C 0.05679101869463921 0.2744239866733551 0.668785035610199 C 0.042465902864933014 0.026821466162800792 0.00103906262665987 0.028019653633236885 0.2447236329317093 0.1300494521856308 0.10859397798776628 0.4182868897914887 -103.45829010009766 80.94891357421875 0.016160035505890846 NA NA S 0.5325443786982249 NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.514792899408284 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T 0.514792899408284 NA NA S 0.6035502958579881 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5u74-A|6w5s-A|nan|5u73-A NA NA NA 1.3952299923403185e-05 1.6043547802668707e-05 NA NA NA NA 1.3952299923403185e-05 1.6043547802668707e-05 2 143346 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA V801F Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.17607563734054565 27.062825459241857 E 0.009190255776047708 0.6968592405319214 0.29395049810409546 E 0.004372845869511366 0.0046563888899981976 0.0004099513753317297 0.04133854433894157 0.6172237992286682 0.03719910234212875 0.011906607076525688 0.28289270401000977 -104.88368225097656 134.22198486328122 0.030986225232481963 NA NA - 0.5422535211267606 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.676056338028169 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|6w5s-A|nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.58 0.58 0.0 0.0 0.0 2401G>T R802I Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3888040781021118 89.03613388538359 C 0.007383097428828478 0.4716009199619293 0.521016001701355 C 0.0034303732682019468 0.0036645387299358853 0.00023026429698802528 0.0346723273396492 0.417534738779068 0.04866030439734459 0.023607412353157997 0.4681999683380127 -104.8322982788086 137.04838562011722 0.07050039619207382 NA NA - 0.6532258064516129 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6612903225806451 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|6w5s-A|nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.78 0.78 0.0 0.0 0.0 2405G>T R802T Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3888040781021118 89.03613388538359 C 0.007383097428828478 0.4716009199619293 0.521016001701355 C 0.0034303732682019468 0.0036645387299358853 0.00023026429698802528 0.0346723273396492 0.417534738779068 0.04866030439734459 0.023607412353157997 0.4681999683380127 -104.8322982788086 137.04838562011722 0.07050039619207382 NA NA - 0.6532258064516129 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6612903225806451 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|6w5s-A|nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.77 0.77 0.0 0.0 0.0 2405G>C G803S Sterol-sensing NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3385010659694672 26.64003389179707 C 0.005858746357262135 0.19617001712322235 0.7979712486267091 C 0.002783856121823192 0.002366829430684448 0.00015298408106900752 0.020152494311332703 0.1600070297718048 0.06888002902269362 0.025554409250617027 0.7201023697853088 -107.98303985595705 162.62796020507812 0.20221896469593048 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.976590051024687e-06 8.826810826732263e-06 3.976590051024687e-06 8.826810826732263e-06 1 251472 NA NA NA NA Ggt/Agt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E805K NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7148361802101135 124.8818806827068 C 0.018383555114269257 0.052165839821100235 0.9294506311416626 C 0.013295188546180723 0.008293407969176771 9.396546374773608e-05 0.007944761775434017 0.050002027302980416 0.1153952181339264 0.1643894463777542 0.6405860185623169 -82.72785186767578 95.53752136230469 0.4581524431705475 H 0.29381443298969073 NA NA NA NA H 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A NA NA NA 4.3061307749330265e-05 1.8306137646932952e-05 5.567089829128236e-05 8.12100893200658e-06 14 251478 2.0933899577357806e-05 1.64062149649066e-05 3 143308 Gaa/Aaa Gaa/Aaa 0 0 NA NA NA NA NA NA E805Q NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7148361802101135 124.8818806827068 C 0.018383555114269257 0.052165839821100235 0.9294506311416626 C 0.013295188546180723 0.008293407969176771 9.396546374773608e-05 0.007944761775434017 0.050002027302980416 0.1153952181339264 0.1643894463777542 0.6405860185623169 -82.72785186767578 95.53752136230469 0.4581524431705475 H 0.29381443298969073 NA NA NA NA H 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A 889470 VUS 1 7.952980013214983e-06 7.715556484619878e-06 7.952980013214983e-06 7.715556484619878e-06 2 251478 NA NA NA NA Gaa/Caa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V810A NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3798856437206268 58.388423439860354 C 0.06859403848648071 0.2107897400856018 0.7206161618232727 C 0.02268580906093121 0.03839541971683502 0.00033037984394468367 0.01849412173032761 0.17938663065433502 0.051540456712245934 0.035004004836082465 0.6541630625724792 -93.31072998046876 126.45597839355469 0.22347083687782288 H 0.4295774647887324 NA NA NA NA H 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A NA NA NA 3.977059805038151e-06 8.804881094681864e-06 3.977059805038151e-06 8.804881094681864e-06 1 251442 NA NA NA NA gTc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V810F NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3798856437206268 58.388423439860354 C 0.06859403848648071 0.2107897400856018 0.7206161618232727 C 0.02268580906093121 0.03839541971683502 0.00033037984394468367 0.01849412173032761 0.17938663065433502 0.051540456712245934 0.035004004836082465 0.6541630625724792 -93.31072998046876 126.45597839355469 0.22347083687782288 H 0.4295774647887324 NA NA NA NA H 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A 499327 conflict 1 0.0004914128400659012 1.8874562380742533e-05 0.0005407939897850156 9.151123451465953e-06 136 251482 0.00040475098649039865 1.650775710508763e-05 58 143298 Gtc/Ttc Gtc/Ttc 0 0 NA NA NA NA NA NA V810I NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3798856437206268 58.388423439860354 C 0.06859403848648071 0.2107897400856018 0.7206161618232727 C 0.02268580906093121 0.03839541971683502 0.00033037984394468367 0.01849412173032761 0.17938663065433502 0.051540456712245934 0.035004004836082465 0.6541630625724792 -93.31072998046876 126.45597839355469 0.22347083687782288 H 0.4295774647887324 NA NA NA NA H 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A 833897 benign 1 0.00016718148754007837 1.7285556258486726e-05 0.00022665600408799946 9.554967127054533e-06 57 251482 6.28061970928684e-05 1.440461934124664e-05 9 143298 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA V810L NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3798856437206268 58.388423439860354 C 0.06859403848648071 0.2107897400856018 0.7206161618232727 C 0.02268580906093121 0.03839541971683502 0.00033037984394468367 0.01849412173032761 0.17938663065433502 0.051540456712245934 0.035004004836082465 0.6541630625724792 -93.31072998046876 126.45597839355469 0.22347083687782288 H 0.4295774647887324 NA NA NA NA H 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan|3jd8-A|5jnx-A NA NA NA 1.9882099877577275e-05 9.003641146912727e-06 1.9882099877577275e-05 9.003641146912727e-06 5 251482 NA NA NA NA Gtc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A812V NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.39715638756752014 43.76663390994072 C 0.17903083562850952 0.10111064463853836 0.7198585271835327 C 0.04459742456674577 0.1164991855621338 0.0009929600637406106 0.011571908369660378 0.07963456958532332 0.06470360606908797 0.0716390460729599 0.6103612780570984 -80.9927978515625 123.47240447998048 0.15533459186553955 H 0.5188679245283019 - 0.6320754716981132 NA NA H 0.5283018867924528 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6886792452830188 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A NA NA NA 3.9764299799571745e-06 9.736162338486017e-06 3.9764299799571745e-06 9.736162338486017e-06 1 251482 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E814D NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5694923996925354 99.49032222628591 C 0.21573658287525171 0.07602709531784058 0.7082363367080688 C 0.05067051202058792 0.1418658047914505 0.0016280194977298381 0.010656732134521008 0.06431199610233307 0.15346650779247284 0.1117922216653824 0.4656083285808563 -85.80387878417969 4.586089134216309 0.090518556535244 H 0.31443298969072164 - 0.4484536082474227 NA NA H 0.30927835051546393 - 0.9175257731958762 NA NA - 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.9587628865979382 NA NA - 0.5154639175257731 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|5u73-A NA NA NA 3.9764299799571745e-06 8.08451517376923e-06 3.9764299799571745e-06 8.08451517376923e-06 1 251482 NA NA NA NA gaG/gaT NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E814K NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5694923996925354 99.49032222628591 C 0.21573658287525171 0.07602709531784058 0.7082363367080688 C 0.05067051202058792 0.1418658047914505 0.0016280194977298381 0.010656732134521008 0.06431199610233307 0.15346650779247284 0.1117922216653824 0.4656083285808563 -85.80387878417969 4.586089134216309 0.090518556535244 H 0.31443298969072164 - 0.4484536082474227 NA NA H 0.30927835051546393 - 0.9175257731958762 NA NA - 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.9587628865979382 NA NA - 0.5154639175257731 NA NA NA NA NA NA 6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|5u73-A NA NA NA 1.5197684420552246e-05 1.7167212747858152e-05 1.590549982211087e-05 8.869869603406414e-06 4 251486 1.3955599570181219e-05 1.4698251826281601e-05 2 143312 Gag/Aag Gag/Aag 0 0 NA NA NA NA NA NA S815N NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.31032440066337585 36.37001975774765 C 0.16558577120304108 0.03086260333657265 0.8035516142845154 C 0.009740980342030523 0.12968014180660248 0.0006863816524855793 0.009492856450378895 0.018247807398438454 0.16371364891529086 0.04492056369781493 0.6235175728797913 -85.81212615966797 156.31459045410156 0.0486924946308136 H 0.4615384615384616 - 0.15384615384615385 NA NA H 0.4692307692307692 - 0.5692307692307692 NA NA - 0.25384615384615383 NA NA - 0.8769230769230769 - 0.8615384615384616 NA NA NA NA NA NA - 0.26153846153846155 NA NA - 0.16153846153846155 - 0.5384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 9.579853976802712e-06 3.976490006607492e-06 9.579853976802712e-06 1 251478 NA NA NA NA aGc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S815R NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.31032440066337585 36.37001975774765 C 0.16558577120304108 0.03086260333657265 0.8035516142845154 C 0.009740980342030523 0.12968014180660248 0.0006863816524855793 0.009492856450378895 0.018247807398438454 0.16371364891529086 0.04492056369781493 0.6235175728797913 -85.81212615966797 156.31459045410156 0.0486924946308136 H 0.4615384615384616 - 0.15384615384615385 NA NA H 0.4692307692307692 - 0.5692307692307692 NA NA - 0.25384615384615383 NA NA - 0.8769230769230769 - 0.8615384615384616 NA NA NA NA NA NA - 0.26153846153846155 NA NA - 0.16153846153846155 - 0.5384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.5995117887190215e-06 2.403078073059628e-05 3.9765500332578085e-06 8.673940488124984e-06 1 251474 1.3957899682282005e-05 2.2410738027348928e-05 1,1 143288,143288 agC/agA agC/agG,agC/agA 0 0,0 0.39 0.0 0.0 0.39 0.0 2445C>G C816G NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.28468823432922363 39.970228099823 H 0.8300434350967407 0.004312212113291025 0.16564442217350006 H 0.017564833164215088 0.8282641768455505 0.006585485767573118 0.0016963697271421552 0.002121248980984092 0.02588461898267269 0.05315008386969566 0.0647331178188324 -64.91590881347656 -37.07244873046875 0.01934528723359108 H 0.22962962962962966 T 0.6592592592592592 NA NA H 0.24444444444444444 - 0.4 NA NA T 0.562962962962963 NA NA H 0.6296296296296297 H 0.6888888888888889 NA NA NA NA NA NA T 0.6888888888888889 NA NA T 0.6666666666666666 H 0.5185185185185185 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.0 0.0 0.4 0.0 2446T>G L817M NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23652300238609314 43.30736173689365 H 0.9161275625228882 0.0011525059817358851 0.08271992951631546 H 0.022543275728821758 0.8835163712501526 0.013665324077010156 0.0005713401478715241 0.0005654129199683666 0.009092574007809162 0.03531528264284134 0.03473043069243431 -64.9864501953125 -39.16099166870117 0.04265332594513893 H 0.36585365853658536 T 0.3353658536585366 NA NA H 0.3719512195121951 S 0.3475609756097561 NA NA T 0.573170731707317 NA NA H 0.3048780487804878 H 0.3719512195121951 NA NA NA NA NA NA T 0.6402439024390244 NA NA T 0.3597560975609756 H 0.24390243902439024 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.0 0.0 0.62 0.0 2449T>A R819C NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|35 NA NA NA NA e 0.4237649142742157 97.04216536879541 H 0.9836779832839966 0.00047615732182748616 0.01584586873650551 H 0.006228160578757525 0.9588778018951416 0.0193595252931118 0.00010980814113281667 0.00034100498305633664 0.0019514011219143867 0.005718195345252752 0.007414107210934162 -66.18434906005861 -40.300453186035156 0.007126258686184883 H 0.1935483870967742 H 0.4798387096774194 NA NA H 0.18951612903225806 H 0.1975806451612903 NA NA H 0.18951612903225806 NA NA H 0.5887096774193549 H 0.6209677419354839 NA NA NA NA NA NA H 0.18548387096774194 NA NA H 0.4879032258064516 H 0.6935483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.533336538914167e-05 1.769494017814008e-05 3.578809992177412e-05 9.222249537613733e-06 9 251480 6.980510079301894e-06 1.5101689354967527e-05 1 143256 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R819H NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|35 NA NA NA NA e 0.4237649142742157 97.04216536879541 H 0.9836779832839966 0.00047615732182748616 0.01584586873650551 H 0.006228160578757525 0.9588778018951416 0.0193595252931118 0.00010980814113281667 0.00034100498305633664 0.0019514011219143867 0.005718195345252752 0.007414107210934162 -66.18434906005861 -40.300453186035156 0.007126258686184883 H 0.1935483870967742 H 0.4798387096774194 NA NA H 0.18951612903225806 H 0.1975806451612903 NA NA H 0.18951612903225806 NA NA H 0.5887096774193549 H 0.6209677419354839 NA NA NA NA NA NA H 0.18548387096774194 NA NA H 0.4879032258064516 H 0.6935483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.2800519364294564e-05 1.662067589776716e-05 1.1929600077564826e-05 8.481619385703285e-06 3 251476 4.1884199163177975e-05 1.4293669923944669e-05 6 143252 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA R819L NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|35 NA NA NA NA e 0.4237649142742157 97.04216536879541 H 0.9836779832839966 0.00047615732182748616 0.01584586873650551 H 0.006228160578757525 0.9588778018951416 0.0193595252931118 0.00010980814113281667 0.00034100498305633664 0.0019514011219143867 0.005718195345252752 0.007414107210934162 -66.18434906005861 -40.300453186035156 0.007126258686184883 H 0.1935483870967742 H 0.4798387096774194 NA NA H 0.18951612903225806 H 0.1975806451612903 NA NA H 0.18951612903225806 NA NA H 0.5887096774193549 H 0.6209677419354839 NA NA NA NA NA NA H 0.18548387096774194 NA NA H 0.4879032258064516 H 0.6935483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953050044307021e-06 7.697547126076433e-06 7.953050044307021e-06 7.697547126076433e-06 2 251476 NA NA NA NA cGc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R819S NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|35 NA NA NA NA e 0.4237649142742157 97.04216536879541 H 0.9836779832839966 0.00047615732182748616 0.01584586873650551 H 0.006228160578757525 0.9588778018951416 0.0193595252931118 0.00010980814113281667 0.00034100498305633664 0.0019514011219143867 0.005718195345252752 0.007414107210934162 -66.18434906005861 -40.300453186035156 0.007126258686184883 H 0.1935483870967742 H 0.4798387096774194 NA NA H 0.18951612903225806 H 0.1975806451612903 NA NA H 0.18951612903225806 NA NA H 0.5887096774193549 H 0.6209677419354839 NA NA NA NA NA NA H 0.18548387096774194 NA NA H 0.4879032258064516 H 0.6935483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 287257 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA K822R NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|35 NA NA NA NA e 0.3842712044715881 79.04458675980567 H 0.9788832068443298 0.0005342637305147946 0.02058255858719349 I 0.0025768119376152754 0.2545359134674072 0.7367684245109558 3.652391387731768e-05 7.515262404922396e-05 0.0007190915639512241 0.00352085498161614 0.0017672687536105516 -70.06241607666016 -40.44784164428711 0.0032207125332206488 H 0.2878048780487805 I 0.4341463414634146 NA NA H 0.2926829268292683 H 0.04878048780487805 NA NA H 0.06829268292682927 NA NA I 0.42439024390243896 I 0.5317073170731708 NA NA NA NA NA NA H 0.13658536585365855 NA NA I 0.473170731707317 I 0.4829268292682927 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 291260 VUS 1 7.598747072259728e-06 1.8227448694068452e-05 7.952729902171995e-06 8.423860439744046e-06 2 251486 6.977590146561853e-06 1.6164110281318077e-05 1 143316 aAa/aGa aAa/aGa 0 0 NA NA NA NA NA NA Y825C NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|36 NA NA NA NA b 0.24024781584739685 51.340958246588706 H 0.7352864146232605 0.0016422744374722242 0.2630712687969208 H 0.03111311048269272 0.5592848062515259 0.1709907203912735 0.0005533530493266879 0.00046563369687646633 0.022432716563344 0.181282252073288 0.0338774248957634 -93.59075927734376 -26.56963157653809 0.0061428966000676155 H 0.2792792792792793 I 0.23423423423423426 NA NA H 0.2702702702702703 H 0.4099099099099099 NA NA H 0.2477477477477477 NA NA I 0.23873873873873874 I 0.22522522522522526 NA NA NA NA NA NA H 0.30180180180180183 NA NA I 0.22072072072072071 I 0.26576576576576577 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 370184 pathogenic 2 1.773213257397409e-05 1.643027212659167e-05 1.1929399988730438e-05 8.273936899378618e-06 3 251480 2.791659971990157e-05 1.4194921991295194e-05 4 143284 tAt/tGt tAt/tGt 0 0 NA NA NA NA NA NA S826Y NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|36 NA NA NA NA b 0.14387428760528564 16.862066507339478 H 0.940093159675598 0.0003366711607668549 0.059570249170064926 H 0.1008310467004776 0.8104488849639893 0.011528444476425648 9.976754517992958e-05 0.0002347615227336064 0.008991475217044353 0.03927034139633179 0.028595315292477608 -59.9273567199707 -43.37958908081055 0.005056395661085844 H 0.5076923076923077 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.5 S 0.05384615384615385 NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.030769230769230767 NA NA NA NA NA NA H 0.030769230769230767 NA NA H 0.007692307692307694 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976459993282333e-06 8.063494945369971e-06 3.976459993282333e-06 8.063494945369971e-06 1 251480 NA NA NA NA tCt/tAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P827L NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|36 NA NA NA NA e 0.35755836963653564 50.73753265142441 H 0.9720773696899414 0.0003980335604865104 0.027524583041667938 H 0.20464931428432465 0.7453321814537048 0.008429018780589105 7.227886089822275e-05 0.0002976581163238734 0.002915332326665521 0.0300004780292511 0.008303623646497726 -65.92695617675781 -30.91851806640625 0.0029218504205346107 H 0.3897058823529412 H 0.35294117647058826 NA NA H 0.3970588235294117 T 0.3235294117647059 NA NA H 0.2352941176470588 NA NA H 0.34558823529411764 H 0.4485294117647059 NA NA NA NA NA NA H 0.36764705882352944 NA NA H 0.36764705882352944 H 0.4411764705882353 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976459993282333e-06 8.596394003671058e-06 3.976459993282333e-06 8.596394003671058e-06 1 251480 NA NA NA NA cCa/cTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L829P NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA HELIX|36 NA NA NA NA b 0.18311092257499686 33.52760992348194 H 0.9448785185813904 0.0009954140987247226 0.05412607640028 H 0.1401282250881195 0.759820818901062 0.020483357831835747 0.0004953446332365273 0.00037759036058560014 0.006268441211432218 0.061412043869495385 0.011014153249561787 -73.87574005126953 -28.108871459960927 0.002813231898471713 H 0.5121951219512195 H 0.042682926829268296 NA NA H 0.5182926829268293 T 0.10365853658536583 NA NA H 0.09146341463414634 NA NA H 0.08536585365853659 H 0.0975609756097561 NA NA NA NA NA NA H 0.36585365853658536 NA NA H 0.06097560975609756 H 0.07317073170731707 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97652001993265e-06 9.48489663635573e-06 3.97652001993265e-06 9.48489663635573e-06 1 251476 NA NA NA NA cTg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L830R NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.264558345079422 48.44063298404217 H 0.717731237411499 0.00514712231233716 0.2771216630935669 H 0.10636384040117264 0.5755871534347534 0.016787018626928333 0.00208319746889174 0.0014600650174543262 0.030624212697148327 0.23249591886997226 0.034598719328641885 -85.74285125732422 -11.917226791381836 0.0022803617175668482 - 0.4878048780487805 T 0.042682926829268296 NA NA - 0.5121951219512195 S 0.07317073170731707 NA NA H 0.012195121951219513 NA NA T 0.006097560975609756 T 0.042682926829268296 NA NA NA NA NA NA H 0.03658536585365853 NA NA T 0.03048780487804878 T 0.1402439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 9.812970271193274e-06 3.976490006607492e-06 9.812970271193274e-06 1 251478 NA NA NA NA cTa/cGa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L830V NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.264558345079422 48.44063298404217 H 0.717731237411499 0.00514712231233716 0.2771216630935669 H 0.10636384040117264 0.5755871534347534 0.016787018626928333 0.00208319746889174 0.0014600650174543262 0.030624212697148327 0.23249591886997226 0.034598719328641885 -85.74285125732422 -11.917226791381836 0.0022803617175668482 - 0.4878048780487805 T 0.042682926829268296 NA NA - 0.5121951219512195 S 0.07317073170731707 NA NA H 0.012195121951219513 NA NA T 0.006097560975609756 T 0.042682926829268296 NA NA NA NA NA NA H 0.03658536585365853 NA NA T 0.03048780487804878 T 0.1402439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976590051024687e-06 9.331812653533211e-06 3.976590051024687e-06 9.331812653533211e-06 1 251472 NA NA NA NA Cta/Gta NA 0 NA 0.76 0.0 0.0 0.76 0.0 2488C>G D832E NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA e 0.6761966943740845 97.43994365930556 H 0.6958363652229309 0.0025604870170354843 0.30160316824913025 H 0.1516621559858322 0.4504020810127258 0.05100775510072708 0.000680901575833559 0.0012039351277053356 0.06904387474060059 0.2267594039440155 0.04923994839191437 -71.39799499511719 -30.040924072265625 0.003150371368974448 T 0.4723926380368098 T 0.6687116564417178 NA NA T 0.4601226993865031 T 0.8159509202453987 NA NA T 0.7730061349693251 NA NA T 0.7116564417177914 T 0.7361963190184049 NA NA NA NA NA NA T 0.7484662576687117 NA NA T 0.7055214723926381 T 0.6134969325153374 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.952919986564666e-06 8.835807201142971e-06 7.952919986564666e-06 8.835807201142971e-06 2 251480 NA NA NA NA gaC/gaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D832G NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA e 0.6761966943740845 97.43994365930556 H 0.6958363652229309 0.0025604870170354843 0.30160316824913025 H 0.1516621559858322 0.4504020810127258 0.05100775510072708 0.000680901575833559 0.0012039351277053356 0.06904387474060059 0.2267594039440155 0.04923994839191437 -71.39799499511719 -30.040924072265625 0.003150371368974448 T 0.4723926380368098 T 0.6687116564417178 NA NA T 0.4601226993865031 T 0.8159509202453987 NA NA T 0.7730061349693251 NA NA T 0.7116564417177914 T 0.7361963190184049 NA NA NA NA NA NA T 0.7484662576687117 NA NA T 0.7055214723926381 T 0.6134969325153374 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.067088312817189e-06 1.879717503633456e-05 3.97652001993265e-06 9.180073611133407e-06 1 251476 6.981879778322763e-06 1.6403049650622022e-05 1 143228 gAc/gGc gAc/gGc 0 0 NA NA NA NA NA NA D832V NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA e 0.6761966943740845 97.43994365930556 H 0.6958363652229309 0.0025604870170354843 0.30160316824913025 H 0.1516621559858322 0.4504020810127258 0.05100775510072708 0.000680901575833559 0.0012039351277053356 0.06904387474060059 0.2267594039440155 0.04923994839191437 -71.39799499511719 -30.040924072265625 0.003150371368974448 T 0.4723926380368098 T 0.6687116564417178 NA NA T 0.4601226993865031 T 0.8159509202453987 NA NA T 0.7730061349693251 NA NA T 0.7116564417177914 T 0.7361963190184049 NA NA NA NA NA NA T 0.7484662576687117 NA NA T 0.7055214723926381 T 0.6134969325153374 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.95 0.0 0.0 0.95 0.0 2495A>T W833C NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA e 0.6723543405532837 161.70121890306473 H 0.6659725904464722 0.00410030921921134 0.3299270272254944 H 0.195474460721016 0.407593309879303 0.018761087208986282 0.0007876112358644607 0.001931305509060621 0.04068562015891075 0.29631686210632324 0.038449782878160484 -76.24571990966797 -30.597909927368164 0.00390970055013895 T 0.3612334801762114 T 0.6784140969162996 NA NA T 0.3568281938325991 T 0.8678414096916299 NA NA T 0.8105726872246696 NA NA T 0.6740088105726872 T 0.6607929515418502 NA NA NA NA NA NA T 0.9691629955947136 NA NA T 0.7048458149779736 T 0.6872246696035242 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979340014368062e-06 1.425784954632178e-05 NA NA NA NA 6.979340014368062e-06 1.425784954632178e-05 1 143280 NA tgG/tgC NA 0 NA NA NA NA NA NA M834T NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA b 0.13837724924087524 27.689287573099136 H 0.907084047794342 0.0004672170034609736 0.09244871884584427 H 0.12044387310743332 0.7295771241188049 0.0169004425406456 0.0001676158281043172 0.00017083359125535935 0.008028264157474041 0.10459469258785248 0.02011709846556187 -78.10116577148438 -32.28082656860352 0.0009330168832093476 H 0.35106382978723405 T 0.20212765957446807 NA NA H 0.35106382978723405 T 0.3297872340425532 NA NA T 0.2712765957446808 NA NA H 0.26063829787234044 H 0.24468085106382975 NA NA NA NA NA NA T 0.3723404255319149 NA NA T 0.22340425531914893 H 0.3404255319148936 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326260 conflict 1 0.000210238043952702 1.7997074384040577e-05 0.00024654800654388964 9.031827319030038e-06 62 251472 0.00014652700338046998 1.5566656084847257e-05 21 143318 aTg/aCg aTg/aCg 0 0 NA NA NA NA NA NA M834V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA NA TURN|9 NA NA NA b 0.13837724924087524 27.689287573099136 H 0.907084047794342 0.0004672170034609736 0.09244871884584427 H 0.12044387310743332 0.7295771241188049 0.0169004425406456 0.0001676158281043172 0.00017083359125535935 0.008028264157474041 0.10459469258785248 0.02011709846556187 -78.10116577148438 -32.28082656860352 0.0009330168832093476 H 0.35106382978723405 T 0.20212765957446807 NA NA H 0.35106382978723405 T 0.3297872340425532 NA NA T 0.2712765957446808 NA NA H 0.26063829787234044 H 0.24468085106382975 NA NA NA NA NA NA T 0.3723404255319149 NA NA T 0.22340425531914893 H 0.3404255319148936 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.0 0.0 0.99 0.0 2500A>G I837M NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4687081873416901 86.71101465821266 H 0.9987884163856506 2.8366956030367877e-05 0.0011832653544843195 H 0.0022189447190612555 0.9945005178451538 0.0017603203887119891 9.853970368567387e-06 1.4160760656523053e-05 9.715471242088825e-05 0.0010928332339972258 0.00030621961923316116 -66.03913116455078 -42.42083358764648 0.00029939078376628464 H 0.3609467455621302 H 0.4615384615384616 NA NA H 0.3609467455621302 H 0.5680473372781065 NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.4792899408284024 H 0.5029585798816568 NA NA NA NA NA NA H 0.5088757396449705 NA NA H 0.5443786982248521 H 0.4733727810650887 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.6 0.01 0.0 0.6 0.0 2511T>G I837N NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4687081873416901 86.71101465821266 H 0.9987884163856506 2.8366956030367877e-05 0.0011832653544843195 H 0.0022189447190612555 0.9945005178451538 0.0017603203887119891 9.853970368567387e-06 1.4160760656523053e-05 9.715471242088825e-05 0.0010928332339972258 0.00030621961923316116 -66.03913116455078 -42.42083358764648 0.00029939078376628464 H 0.3609467455621302 H 0.4615384615384616 NA NA H 0.3609467455621302 H 0.5680473372781065 NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.4792899408284024 H 0.5029585798816568 NA NA NA NA NA NA H 0.5088757396449705 NA NA H 0.5443786982248521 H 0.4733727810650887 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.0 0.0 0.23 0.0 2510T>A I837S NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4687081873416901 86.71101465821266 H 0.9987884163856506 2.8366956030367877e-05 0.0011832653544843195 H 0.0022189447190612555 0.9945005178451538 0.0017603203887119891 9.853970368567387e-06 1.4160760656523053e-05 9.715471242088825e-05 0.0010928332339972258 0.00030621961923316116 -66.03913116455078 -42.42083358764648 0.00029939078376628464 H 0.3609467455621302 H 0.4615384615384616 NA NA H 0.3609467455621302 H 0.5680473372781065 NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.4792899408284024 H 0.5029585798816568 NA NA NA NA NA NA H 0.5088757396449705 NA NA H 0.5443786982248521 H 0.4733727810650887 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.0 0.0 0.3 0.0 2510T>G I837T NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4687081873416901 86.71101465821266 H 0.9987884163856506 2.8366956030367877e-05 0.0011832653544843195 H 0.0022189447190612555 0.9945005178451538 0.0017603203887119891 9.853970368567387e-06 1.4160760656523053e-05 9.715471242088825e-05 0.0010928332339972258 0.00030621961923316116 -66.03913116455078 -42.42083358764648 0.00029939078376628464 H 0.3609467455621302 H 0.4615384615384616 NA NA H 0.3609467455621302 H 0.5680473372781065 NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.4792899408284024 H 0.5029585798816568 NA NA NA NA NA NA H 0.5088757396449705 NA NA H 0.5443786982248521 H 0.4733727810650887 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 498832 VUS 1 2.7864427353824047e-05 1.8114411573652146e-05 3.578979885787703e-05 9.936327702110088e-06 9 251468 1.3956700058770364e-05 1.5145999420835271e-05 2 143300 aTt/aCt aTt/aCt 0 0 NA NA NA NA NA NA I837V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4687081873416901 86.71101465821266 H 0.9987884163856506 2.8366956030367877e-05 0.0011832653544843195 H 0.0022189447190612555 0.9945005178451538 0.0017603203887119891 9.853970368567387e-06 1.4160760656523053e-05 9.715471242088825e-05 0.0010928332339972258 0.00030621961923316116 -66.03913116455078 -42.42083358764648 0.00029939078376628464 H 0.3609467455621302 H 0.4615384615384616 NA NA H 0.3609467455621302 H 0.5680473372781065 NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.4792899408284024 H 0.5029585798816568 NA NA NA NA NA NA H 0.5088757396449705 NA NA H 0.5443786982248521 H 0.4733727810650887 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.0662418329449415e-06 1.741077396892264e-05 3.9766500776750036e-06 8.03393187712648e-06 1 251468 6.978269993851428e-06 1.5446390801433367e-05 1 143302 Att/Gtt Att/Gtt 0 0 NA NA NA NA NA NA V838= NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.0400068461894989 6.14905225932598 H 0.9995129108428956 1.225002961291466e-05 0.0004748482315335423 H 0.0004716045805253089 0.9979238510131836 0.001086690928786993 1.266147364731296e-06 4.388465640658978e-06 2.5585331968613893e-05 0.0003722583351191133 0.00011440608068369329 -65.57138824462889 -41.92400741577149 0.00014359780470840633 H 0.35211267605633795 H 0.09154929577464788 NA NA H 0.3661971830985916 H 0.19014084507042253 NA NA H 0.07042253521126761 NA NA H 0.11971830985915492 H 0.15492957746478872 NA NA NA NA NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.09859154929577464 H 0.14788732394366194 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.08 0.0 0.03 0.22 2514G>C A840E NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.569674015045166 62.778076457977285 H 0.9991457462310792 5.634246463159798e-06 0.00084868841804564 H 0.0008879000670276582 0.9955629110336304 0.002503810450434685 1.0103402701133746e-06 2.3950346985657242e-06 5.936675006523728e-05 0.0008202313329093157 0.00016245305596385148 -64.49911499023439 -44.2442741394043 0.000845149508677423 H 0.4150943396226415 H 0.08490566037735849 NA NA H 0.4150943396226415 H 0.4245283018867925 NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.08490566037735849 H 0.10377358490566037 NA NA NA NA NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.12264150943396225 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 2519C>A A840G NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.569674015045166 62.778076457977285 H 0.9991457462310792 5.634246463159798e-06 0.00084868841804564 H 0.0008879000670276582 0.9955629110336304 0.002503810450434685 1.0103402701133746e-06 2.3950346985657242e-06 5.936675006523728e-05 0.0008202313329093157 0.00016245305596385148 -64.49911499023439 -44.2442741394043 0.000845149508677423 H 0.4150943396226415 H 0.08490566037735849 NA NA H 0.4150943396226415 H 0.4245283018867925 NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.08490566037735849 H 0.10377358490566037 NA NA NA NA NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.12264150943396225 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 2519C>G A840V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.569674015045166 62.778076457977285 H 0.9991457462310792 5.634246463159798e-06 0.00084868841804564 H 0.0008879000670276582 0.9955629110336304 0.002503810450434685 1.0103402701133746e-06 2.3950346985657242e-06 5.936675006523728e-05 0.0008202313329093157 0.00016245305596385148 -64.49911499023439 -44.2442741394043 0.000845149508677423 H 0.4150943396226415 H 0.08490566037735849 NA NA H 0.4150943396226415 H 0.4245283018867925 NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.08490566037735849 H 0.10377358490566037 NA NA NA NA NA NA H 0.5849056603773585 NA NA H 0.12264150943396225 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.53 0.53 0.0 0.0 0.0 2519C>T I841K NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.3366677165031433 62.28352755308151 H 0.998953938484192 1.5580953913740814e-05 0.0010304689640179276 H 0.0007094752509146929 0.9953466057777404 0.00264415773563087 2.490494580342784e-06 7.2360494414169815e-06 6.327471055556089e-05 0.0010239331750199199 0.00020285749633330846 -65.38797760009766 -41.44078063964844 0.0004824566130992025 H 0.40828402366863903 H 0.5857988165680473 NA NA H 0.40236686390532544 H 0.5325443786982249 NA NA H 0.5976331360946746 NA NA H 0.5857988165680473 H 0.591715976331361 NA NA NA NA NA NA H 0.6035502958579881 NA NA H 0.5857988165680473 H 0.5502958579881657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9784600782440975e-06 1.521058571179462e-05 NA NA NA NA 6.9784600782440975e-06 1.521058571179462e-05 1 143298 NA aTa/aAa NA 0 NA NA NA NA NA NA I841V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.3366677165031433 62.28352755308151 H 0.998953938484192 1.5580953913740814e-05 0.0010304689640179276 H 0.0007094752509146929 0.9953466057777404 0.00264415773563087 2.490494580342784e-06 7.2360494414169815e-06 6.327471055556089e-05 0.0010239331750199199 0.00020285749633330846 -65.38797760009766 -41.44078063964844 0.0004824566130992025 H 0.40828402366863903 H 0.5857988165680473 NA NA H 0.40236686390532544 H 0.5325443786982249 NA NA H 0.5976331360946746 NA NA H 0.5857988165680473 H 0.591715976331361 NA NA NA NA NA NA H 0.6035502958579881 NA NA H 0.5857988165680473 H 0.5502958579881657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.2681691032646484e-05 1.7918051405292194e-05 1.1950400221394375e-05 9.76698047582024e-06 3 251038 1.3963400306238327e-05 1.502207237859144e-05 2 143232 Ata/Gta Ata/Gta 0 0 NA NA NA NA NA NA F842I NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.06995534896850586 14.040038537979125 H 0.9992401599884032 7.512131560361012e-06 0.0007523535168729722 H 0.0004768013313878328 0.9967557787895204 0.002014493802562356 5.964502634014934e-07 3.2574910164839817e-06 4.328278373577632e-05 0.0004730303771793842 0.00023274756676983086 -68.20738220214844 -40.50151824951172 0.00021658494370058184 H 0.1218274111675127 H 0.13705583756345174 NA NA H 0.12690355329949238 H 0.19796954314720813 NA NA H 0.0964467005076142 NA NA H 0.1319796954314721 H 0.16243654822335024 NA NA NA NA NA NA H 0.1319796954314721 NA NA H 0.116751269035533 H 0.14720812182741114 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.46 0.46 0.0 0.0 0.0 2524T>A F842L NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.06995534896850586 14.040038537979125 H 0.9992401599884032 7.512131560361012e-06 0.0007523535168729722 H 0.0004768013313878328 0.9967557787895204 0.002014493802562356 5.964502634014934e-07 3.2574910164839817e-06 4.328278373577632e-05 0.0004730303771793842 0.00023274756676983086 -68.20738220214844 -40.50151824951172 0.00021658494370058184 H 0.1218274111675127 H 0.13705583756345174 NA NA H 0.12690355329949238 H 0.19796954314720813 NA NA H 0.0964467005076142 NA NA H 0.1319796954314721 H 0.16243654822335024 NA NA NA NA NA NA H 0.1319796954314721 NA NA H 0.116751269035533 H 0.14720812182741114 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 499258 VUS 2 8.366599751506276e-05 1.8784920698877427e-05 3.584289879654534e-05 9.458830465865794e-06 9 251096 0.00016744600725360215 1.6229718786261292e-05 24 143330 Ttt/Ctt Ttt/Ctt 0 0 NA NA NA NA NA NA V843L NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4146185219287872 63.726866820454596 H 0.998854160308838 4.1635867091827095e-06 0.0011416125344112515 H 0.0006249902071431277 0.9949736595153807 0.0033301485236734148 4.021494248718228e-07 1.5696705304435454e-06 5.765234527643769e-05 0.0007396889850497246 0.00027196278097108006 -64.15586853027344 -42.10408020019531 0.0003952576080337167 H 0.2887323943661972 H 0.16901408450704225 NA NA H 0.28169014084507044 H 0.4014084507042254 NA NA H 0.528169014084507 NA NA H 0.2112676056338028 H 0.20422535211267606 NA NA NA NA NA NA H 0.5140845070422535 NA NA H 0.18309859154929575 H 0.24647887323943665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.583939906093292e-05 8.892543449460311e-06 3.583939906093292e-05 8.892543449460311e-06 9 251120 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V843M NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4146185219287872 63.726866820454596 H 0.998854160308838 4.1635867091827095e-06 0.0011416125344112515 H 0.0006249902071431277 0.9949736595153807 0.0033301485236734148 4.021494248718228e-07 1.5696705304435454e-06 5.765234527643769e-05 0.0007396889850497246 0.00027196278097108006 -64.15586853027344 -42.10408020019531 0.0003952576080337167 H 0.2887323943661972 H 0.16901408450704225 NA NA H 0.28169014084507044 H 0.4014084507042254 NA NA H 0.528169014084507 NA NA H 0.2112676056338028 H 0.20422535211267606 NA NA NA NA NA NA H 0.5140845070422535 NA NA H 0.18309859154929575 H 0.24647887323943665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 2527G>A G844C NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4589709043502808 36.1210101723671 H 0.9976294636726379 1.5026340406620873e-05 0.002355624921619892 H 0.0012569637037813663 0.9902440905570984 0.005652109626680613 2.7077740014647134e-06 7.455243121512468e-06 0.00017418763309251517 0.002208088058978319 0.0004543680988717824 -64.85401153564453 -43.3414421081543 0.0007618139497935772 H 0.42857142857142855 H 0.2023809523809524 NA NA H 0.42857142857142855 H 0.3690476190476191 NA NA H 0.42857142857142855 NA NA H 0.15476190476190474 H 0.16666666666666666 NA NA NA NA NA NA H 0.3809523809523809 NA NA H 0.2023809523809524 H 0.13095238095238096 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.62 0.0 0.0 0.0 2530G>T G844V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4589709043502808 36.1210101723671 H 0.9976294636726379 1.5026340406620873e-05 0.002355624921619892 H 0.0012569637037813663 0.9902440905570984 0.005652109626680613 2.7077740014647134e-06 7.455243121512468e-06 0.00017418763309251517 0.002208088058978319 0.0004543680988717824 -64.85401153564453 -43.3414421081543 0.0007618139497935772 H 0.42857142857142855 H 0.2023809523809524 NA NA H 0.42857142857142855 H 0.3690476190476191 NA NA H 0.42857142857142855 NA NA H 0.15476190476190474 H 0.16666666666666666 NA NA NA NA NA NA H 0.3809523809523809 NA NA H 0.2023809523809524 H 0.13095238095238096 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 2531G>T V845F NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.1624039113521576 24.961481174826627 H 0.9970474839210508 2.046576082648244e-05 0.0029321496840566397 H 0.0013479794142767787 0.9913671612739564 0.003529940266162157 3.586877483030548e-06 9.927714927471243e-06 0.00022440029715653512 0.002657262142747641 0.0008597074192948637 -68.80594635009766 -39.57410430908203 0.00045960285933688283 H 0.1267605633802817 H 0.4788732394366197 NA NA H 0.13380281690140844 H 0.3591549295774648 NA NA H 0.4929577464788733 NA NA H 0.4295774647887324 H 0.471830985915493 NA NA NA NA NA NA H 0.5070422535211268 NA NA H 0.4647887323943662 H 0.4647887323943662 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.612980308217055e-06 1.637145429744539e-05 3.9805399865144855e-06 7.633998909346449e-06 1 251222 1.4001499948790295e-05 1.448263016393916e-05 2 142842 Gtt/Ttt Gtt/Ttt 0 0 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 2533G>T L846= NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.14586818218231198 26.70846415758133 H 0.99558687210083 3.3813681511674076e-05 0.00437925336882472 H 0.0018833265639841559 0.9911565780639648 0.0025413066614419213 4.1300741031591315e-06 1.5471918231924068e-05 0.0002793692983686924 0.002653314732015133 0.0014665585476905107 -68.10438537597656 -38.76673126220703 0.0007182850386016071 H 0.25609756097560976 H 0.17682926829268292 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.3231707317073171 NA NA H 0.201219512195122 NA NA H 0.23170731707317074 H 0.25609756097560976 NA NA NA NA NA NA H 0.1951219512195122 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.29878048780487804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 2538G>T,2538G>C L846V NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.14586818218231198 26.70846415758133 H 0.99558687210083 3.3813681511674076e-05 0.00437925336882472 H 0.0018833265639841559 0.9911565780639648 0.0025413066614419213 4.1300741031591315e-06 1.5471918231924068e-05 0.0002793692983686924 0.002653314732015133 0.0014665585476905107 -68.10438537597656 -38.76673126220703 0.0007182850386016071 H 0.25609756097560976 H 0.17682926829268292 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.3231707317073171 NA NA H 0.201219512195122 NA NA H 0.23170731707317074 H 0.25609756097560976 NA NA NA NA NA NA H 0.1951219512195122 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.29878048780487804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979560005973326e-06 7.3603453121577045e-06 3.979560005973326e-06 7.3603453121577045e-06 1 251284 NA NA NA NA Ctg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S847= NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4844004213809967 56.77172938585282 H 0.9919608235359192 3.359030597493984e-05 0.008005625568330288 H 0.003339795395731926 0.9828349351882936 0.006687672808766365 5.719764430978103e-06 1.441418135073036e-05 0.0005031130276620388 0.004936335142701864 0.0016779872821643946 -66.91093444824219 -40.18608474731445 0.0013220695545896888 H 0.2 H 0.1153846153846154 NA NA H 0.2 H 0.14615384615384616 NA NA H 0.4692307692307692 NA NA H 0.1153846153846154 H 0.16153846153846155 NA NA NA NA NA NA H 0.5076923076923077 NA NA H 0.1153846153846154 H 0.17692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.79 0.79 0.0 0.0 0.0 2541A>T S849I NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.018119007349014282 2.123547661304474 H 0.9866722822189332 6.507389480248095e-05 0.013262667693197729 H 0.006995239295065403 0.9757958054542542 0.0043269568122923366 1.5292365787900053e-05 3.234712130506523e-05 0.0010551526211202145 0.0078091612085700035 0.0039700502529740325 -68.63871765136719 -36.08938980102539 0.0005674893036484717 H 0.07692307692307693 H 0.02307692307692308 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 374777 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S849R NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.018119007349014282 2.123547661304474 H 0.9866722822189332 6.507389480248095e-05 0.013262667693197729 H 0.006995239295065403 0.9757958054542542 0.0043269568122923366 1.5292365787900053e-05 3.234712130506523e-05 0.0010551526211202145 0.0078091612085700035 0.0039700502529740325 -68.63871765136719 -36.08938980102539 0.0005674893036484717 H 0.07692307692307693 H 0.02307692307692308 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.015384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.39 0.39 0.0 0.0 0.0 2547C>G I850M NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA b 0.2007960081100464 37.147261500358574 H 0.9864304065704346 0.0001016802925732918 0.013467855751514437 H 0.009388293139636515 0.9718607068061828 0.005402936600148678 2.022553962888196e-05 4.65252815047279e-05 0.0008653672994114459 0.009184589609503746 0.003231307724490761 -65.90209197998047 -37.57921600341797 0.0007458352483808994 H 0.5207100591715976 H 0.3668639053254438 NA NA H 0.514792899408284 H 0.5266272189349113 NA NA H 0.5502958579881657 NA NA H 0.40236686390532544 H 0.3905325443786982 NA NA NA NA NA NA H 0.514792899408284 NA NA H 0.3727810650887574 H 0.4260355029585799 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7763042809801134e-05 1.8155573607422697e-05 2.3875800252426416e-05 9.429921045749366e-06 6 251300 7.003980044828494e-06 1.551455581334757e-05 1 142776 atC/atG atC/atG 0 0 NA NA NA NA NA NA A851T NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA HELIX|37 NA NA NA NA e 0.4877601563930512 53.751169234514244 H 0.9368703961372375 0.0008150727371685207 0.062314551323652274 H 0.03662605211138725 0.8845065832138062 0.012857668101787569 0.00013312045484781265 0.0005380671354942024 0.005088122095912695 0.044327300041913986 0.015923161059617996 -65.85894012451172 -38.02170181274414 0.00372707680799067 S 0.5849056603773585 H 0.0660377358490566 NA NA S 0.5754716981132075 H 0.3018867924528302 NA NA H 0.6415094339622641 NA NA H 0.04716981132075472 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA NA NA H 0.5094339622641509 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.565817237278538e-05 1.8738703703238166e-05 3.5813500289805233e-05 8.271198857326782e-06 9 251302 6.296700303209947e-05 1.6814466567224422e-05 9 142932 Gca/Aca Gca/Aca 0 0 NA NA NA NA NA NA V852F NA TRANSMEM|8 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2677752375602722 41.15705401301384 H 0.8723923563957214 0.0006014855462126434 0.12700611352920532 H 0.0522097535431385 0.8032897114753723 0.011562230996787548 0.00012282673560548574 0.00035314893466420466 0.009804090484976768 0.09559660404920578 0.027061671018600464 -73.52276611328125 -30.645662307739247 0.005749791394919157 - 0.30985915492957744 T 0.0 NA NA - 0.3028169014084507 T 0.16901408450704225 NA NA T 0.19718309859154928 NA NA T 0.007042253521126761 T 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA T 0.09154929577464788 NA NA T 0.014084507042253518 T 0.02112676056338028 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.978740096499678e-06 8.97102710155179e-06 3.978740096499678e-06 8.97102710155179e-06 1 251336 NA NA NA NA Gtc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K855= NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|38 NA NA NA NA e 0.4933736920356751 101.48696845173836 C 0.28327861428260803 0.02971200831234455 0.6870093941688538 T 0.112273707985878 0.17254850268363953 0.003639052389189601 0.0057107461616396895 0.019424675032496445 0.09084868431091307 0.4895267188549042 0.10602795332670213 -99.11455535888672 13.577981948852539 0.004731976892799139 - 0.09268292682926828 G 0.24390243902439024 NA NA - 0.09268292682926828 T 0.6780487804878049 NA NA T 0.7560975609756098 NA NA G 0.2975609756097561 G 0.2975609756097561 NA NA NA NA NA NA T 0.6731707317073171 NA NA G 0.3268292682926829 G 0.3853658536585366 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.67 0.0 0.0 0.67 0.03 2565A>G V856A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13356932997703552 20.52960601747036 C 0.019944919273257256 0.2163697332143784 0.7636853456497192 C 0.00498364120721817 0.011801572516560556 0.0005575959803536534 0.04061846807599069 0.1739019751548767 0.13820955157279968 0.01725110597908497 0.6126760840415955 -95.52318572998048 133.8714599609375 0.0038745407946407795 - 0.09859154929577464 - 0.17605633802816897 NA NA - 0.09859154929577464 - 0.2605633802816901 NA NA - 0.18309859154929575 NA NA - 0.14788732394366194 - 0.15492957746478872 NA NA NA NA NA NA - 0.2183098591549296 NA NA - 0.18309859154929575 - 0.17605633802816897 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.070194541920162e-06 1.6877887715054448e-05 3.980920155299828e-06 9.159061212177901e-06 1 251198 6.980119906074832e-06 1.4176554286340674e-05 1 143264 gTa/gCa gTa/gCa 0 0 NA NA NA NA NA NA V856E NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13356932997703552 20.52960601747036 C 0.019944919273257256 0.2163697332143784 0.7636853456497192 C 0.00498364120721817 0.011801572516560556 0.0005575959803536534 0.04061846807599069 0.1739019751548767 0.13820955157279968 0.01725110597908497 0.6126760840415955 -95.52318572998048 133.8714599609375 0.0038745407946407795 - 0.09859154929577464 - 0.17605633802816897 NA NA - 0.09859154929577464 - 0.2605633802816901 NA NA - 0.18309859154929575 NA NA - 0.14788732394366194 - 0.15492957746478872 NA NA NA NA NA NA - 0.2183098591549296 NA NA - 0.18309859154929575 - 0.17605633802816897 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 2567T>A V856G NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13356932997703552 20.52960601747036 C 0.019944919273257256 0.2163697332143784 0.7636853456497192 C 0.00498364120721817 0.011801572516560556 0.0005575959803536534 0.04061846807599069 0.1739019751548767 0.13820955157279968 0.01725110597908497 0.6126760840415955 -95.52318572998048 133.8714599609375 0.0038745407946407795 - 0.09859154929577464 - 0.17605633802816897 NA NA - 0.09859154929577464 - 0.2605633802816901 NA NA - 0.18309859154929575 NA NA - 0.14788732394366194 - 0.15492957746478872 NA NA NA NA NA NA - 0.2183098591549296 NA NA - 0.18309859154929575 - 0.17605633802816897 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.27 0.0 0.0 0.0 2567T>G D857G NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5317001342773438 76.61798934936523 C 0.016494737938046455 0.4213429093360901 0.5621623396873474 C 0.005260541103780271 0.007337785791605711 0.00018742328393273056 0.051747750490903854 0.3238697648048401 0.02406260930001736 0.013178917579352856 0.5743551850318909 -101.36750030517578 125.1491241455078 0.006850570905953646 - 0.4049079754601227 - 0.6196319018404908 NA NA - 0.392638036809816 - 0.4907975460122699 NA NA - 0.5030674846625767 NA NA B 0.6134969325153374 - 0.5950920245398773 NA NA NA NA NA NA - 0.6134969325153374 NA NA - 0.6748466257668712 B 0.588957055214724 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.86 0.0 0.0 0.86 0.28 2570A>G I858F NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2626126408576965 48.58333855867386 C 0.021255504339933395 0.31062981486320496 0.6681147217750549 C 0.01596713438630104 0.014743839390575888 0.0007778220460750163 0.041603125631809235 0.2838437855243683 0.058442413806915276 0.2914354205131531 0.2931864857673645 -99.3133316040039 102.32892608642578 0.001299327821470797 - 0.5680473372781065 B 0.2840236686390533 NA NA - 0.5680473372781065 - 0.3727810650887574 NA NA - 0.3550295857988165 NA NA - 0.3136094674556213 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA NA NA - 0.2781065088757396 NA NA B 0.28994082840236685 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.025730155874043e-06 1.5471227245893552e-05 NA NA NA NA 7.025730155874043e-06 1.5471227245893552e-05 1 142334 NA Att/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA I858T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2626126408576965 48.58333855867386 C 0.021255504339933395 0.31062981486320496 0.6681147217750549 C 0.01596713438630104 0.014743839390575888 0.0007778220460750163 0.041603125631809235 0.2838437855243683 0.058442413806915276 0.2914354205131531 0.2931864857673645 -99.3133316040039 102.32892608642578 0.001299327821470797 - 0.5680473372781065 B 0.2840236686390533 NA NA - 0.5680473372781065 - 0.3727810650887574 NA NA - 0.3550295857988165 NA NA - 0.3136094674556213 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA NA NA - 0.2781065088757396 NA NA B 0.28994082840236685 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.606684115779455e-06 1.8161307635755287e-05 7.964319593156688e-06 7.929902397559117e-06 2 251120 6.9798297772649676e-06 1.6338596726944738e-05 1 143270 aTt/aCt aTt/aCt 0 0 NA NA NA NA NA NA I858V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2626126408576965 48.58333855867386 C 0.021255504339933395 0.31062981486320496 0.6681147217750549 C 0.01596713438630104 0.014743839390575888 0.0007778220460750163 0.041603125631809235 0.2838437855243683 0.058442413806915276 0.2914354205131531 0.2931864857673645 -99.3133316040039 102.32892608642578 0.001299327821470797 - 0.5680473372781065 B 0.2840236686390533 NA NA - 0.5680473372781065 - 0.3727810650887574 NA NA - 0.3550295857988165 NA NA - 0.3136094674556213 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA NA NA - 0.2781065088757396 NA NA B 0.28994082840236685 - 0.3254437869822485 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 21135 benign 2 0.4859551315721599 9.342119594334872e-06 0.4994289875030518 4.792940315806027e-06 125161 250608 0.4622229933738709 8.018910252894515e-06 65766 142282 Att/Gtt Att/Gtt 32488 15505 NA NA NA NA NA NA G859R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.34795308113098145 27.38390748500824 C 0.005463731940835714 0.09981769323349 0.8947186470031738 T 0.004114776849746704 0.002501807874068618 0.00021366581495385612 0.013208658434450626 0.08670877665281296 0.1256459653377533 0.4546987414360046 0.3129075467586517 118.33462524414062 26.525041580200195 0.002233301987871528 - 0.7261904761904762 S 0.03571428571428571 NA NA - 0.7142857142857143 S 0.023809523809523808 NA NA S 0.011904761904761904 NA NA S 0.023809523809523808 S 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.023809523809523808 NA NA S 0.047619047619047616 S 0.047619047619047616 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.0230598794296375e-06 1.6273304431449147e-05 NA NA NA NA 7.0230598794296375e-06 1.6273304431449147e-05 1 142388 NA Gga/Cga NA 0 NA NA NA NA NA NA Q862P NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA b 0.16088011860847473 28.73318918347359 H 0.7810081839561462 0.009842014871537684 0.2091497778892517 H 0.3479853868484497 0.3962147533893585 0.004822751041501761 0.0034050452522933483 0.007882940582931042 0.022607157006859783 0.12360679358243942 0.09347523003816603 -68.15943908691406 -24.90902328491211 0.003944010939449072 S 0.5101010101010099 S 0.3080808080808081 NA NA S 0.5 T 0.31313131313131315 NA NA T 0.2171717171717172 NA NA S 0.3838383838383838 S 0.37373737373737376 NA NA NA NA NA NA T 0.2474747474747475 NA NA S 0.35353535353535354 S 0.3181818181818182 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.067139904393117e-06 1.5135587199912146e-05 NA NA NA NA 7.067139904393117e-06 1.5135587199912146e-05 1 141500 NA cAg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA L864F NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA e 0.3512154817581177 64.30755470991134 H 0.8440155982971191 0.015343191102147102 0.14064113795757294 H 0.3608935475349426 0.44648826122283936 0.004659363068640232 0.002084749285131693 0.010229856707155704 0.022361945360898968 0.1255929470062256 0.02768932469189167 -73.3094253540039 -24.55748748779297 0.0038562701083719726 S 0.2378048780487805 T 0.14634146341463414 NA NA S 0.24390243902439024 S 0.4878048780487805 NA NA T 0.18292682926829268 NA NA S 0.12195121951219512 S 0.1097560975609756 NA NA NA NA NA NA T 0.3902439024390244 NA NA T 0.27439024390243905 S 0.06097560975609756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.106598525887734e-06 1.885800113564389e-05 4.000380158686312e-06 9.387636297623723e-06 1 249976 7.058460141706746e-06 1.635531997777738e-05 1 141674 Ctt/Ttt Ctt/Ttt 0 0 NA NA NA NA NA NA L864P NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA e 0.3512154817581177 64.30755470991134 H 0.8440155982971191 0.015343191102147102 0.14064113795757294 H 0.3608935475349426 0.44648826122283936 0.004659363068640232 0.002084749285131693 0.010229856707155704 0.022361945360898968 0.1255929470062256 0.02768932469189167 -73.3094253540039 -24.55748748779297 0.0038562701083719726 S 0.2378048780487805 T 0.14634146341463414 NA NA S 0.24390243902439024 S 0.4878048780487805 NA NA T 0.18292682926829268 NA NA S 0.12195121951219512 S 0.1097560975609756 NA NA NA NA NA NA T 0.3902439024390244 NA NA T 0.27439024390243905 S 0.06097560975609756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.995809947809903e-06 8.432175748452907e-06 3.995809947809903e-06 8.432175748452907e-06 1 250262 NA NA NA NA cTt/cCt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S865A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA b 0.15539029240608215 18.21174226999283 H 0.5976395010948181 0.021735893562436104 0.3806246221065521 H 0.20314113795757294 0.3834772706031799 0.00413038395345211 0.004236294422298671 0.012252959422767162 0.07936427742242813 0.24259233474731445 0.07080543041229248 -85.83434295654297 -16.789941787719727 0.0052333478815853604 H 0.04615384615384616 T 0.2230769230769231 NA NA H 0.04615384615384616 S 0.17692307692307693 NA NA T 0.16923076923076924 NA NA S 0.2 S 0.24615384615384614 NA NA NA NA NA NA T 0.16923076923076924 NA NA T 0.19230769230769232 S 0.2230769230769231 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.5417346431862178e-05 1.6867470089040617e-05 1.9989900465589013e-05 9.05386964237181e-06 5 250126 3.489039954729378e-05 1.4231619433627994e-05 5 143306 Tcg/Gcg Tcg/Gcg 0 0 NA NA NA NA NA NA S865L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA b 0.15539029240608215 18.21174226999283 H 0.5976395010948181 0.021735893562436104 0.3806246221065521 H 0.20314113795757294 0.3834772706031799 0.00413038395345211 0.004236294422298671 0.012252959422767162 0.07936427742242813 0.24259233474731445 0.07080543041229248 -85.83434295654297 -16.789941787719727 0.0052333478815853604 H 0.04615384615384616 T 0.2230769230769231 NA NA H 0.04615384615384616 S 0.17692307692307693 NA NA T 0.16923076923076924 NA NA S 0.2 S 0.24615384615384614 NA NA NA NA NA NA T 0.16923076923076924 NA NA T 0.19230769230769232 S 0.2230769230769231 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 803478 pathogenic 1 4.013099896837957e-06 9.20312026222847e-06 4.013099896837957e-06 9.20312026222847e-06 1 249184 NA NA NA NA tCg/tTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S865T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|10 NA NA NA b 0.15539029240608215 18.21174226999283 H 0.5976395010948181 0.021735893562436104 0.3806246221065521 H 0.20314113795757294 0.3834772706031799 0.00413038395345211 0.004236294422298671 0.012252959422767162 0.07936427742242813 0.24259233474731445 0.07080543041229248 -85.83434295654297 -16.789941787719727 0.0052333478815853604 H 0.04615384615384616 T 0.2230769230769231 NA NA H 0.04615384615384616 S 0.17692307692307693 NA NA T 0.16923076923076924 NA NA S 0.2 S 0.24615384615384614 NA NA NA NA NA NA T 0.16923076923076924 NA NA T 0.19230769230769232 S 0.2230769230769231 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3956099792267194e-05 1.435663292042894e-05 NA NA NA NA 1.3956099792267194e-05 1.435663292042894e-05 2 143306 NA Tcg/Acg NA 0 NA NA NA NA NA NA M866I NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07836556434631348 15.680949425697325 C 0.002384313382208348 0.054925888776779175 0.9426897764205932 S 0.0012203864753246307 0.0005710330442525446 6.213642336660996e-05 0.029566135257482525 0.028041865676641464 0.553440272808075 0.014215669594705103 0.3728825449943543 -101.59119415283205 132.58876037597656 0.001874975045211613 H 0.11702127659574467 S 0.010638297872340424 NA NA H 0.10106382978723404 S 0.09042553191489362 NA NA S 0.0425531914893617 NA NA S 0.0053191489361702135 S 0.05319148936170213 NA NA NA NA NA NA S 0.0053191489361702135 NA NA S 0.0425531914893617 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 498823 VUS 1 1.0217218403140304e-05 2.0156900596893635e-05 4.020940195914592e-06 9.066878559905533e-06 1 248698 2.100870005961042e-05 1.800256522979368e-05 3 142798 atG/atT atG/atT 0 0 NA NA NA NA NA NA M866T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07836556434631348 15.680949425697325 C 0.002384313382208348 0.054925888776779175 0.9426897764205932 S 0.0012203864753246307 0.0005710330442525446 6.213642336660996e-05 0.029566135257482525 0.028041865676641464 0.553440272808075 0.014215669594705103 0.3728825449943543 -101.59119415283205 132.58876037597656 0.001874975045211613 H 0.11702127659574467 S 0.010638297872340424 NA NA H 0.10106382978723404 S 0.09042553191489362 NA NA S 0.0425531914893617 NA NA S 0.0053191489361702135 S 0.05319148936170213 NA NA NA NA NA NA S 0.0053191489361702135 NA NA S 0.0425531914893617 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 556263 VUS 1 4.013780198874883e-06 9.412693380836518e-06 4.013780198874883e-06 9.412693380836518e-06 1 249142 NA NA NA NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M866V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.07836556434631348 15.680949425697325 C 0.002384313382208348 0.054925888776779175 0.9426897764205932 S 0.0012203864753246307 0.0005710330442525446 6.213642336660996e-05 0.029566135257482525 0.028041865676641464 0.553440272808075 0.014215669594705103 0.3728825449943543 -101.59119415283205 132.58876037597656 0.001874975045211613 H 0.11702127659574467 S 0.010638297872340424 NA NA H 0.10106382978723404 S 0.09042553191489362 NA NA S 0.0425531914893617 NA NA S 0.0053191489361702135 S 0.05319148936170213 NA NA NA NA NA NA S 0.0053191489361702135 NA NA S 0.0425531914893617 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 967661 VUS 1 2.8185629273402533e-05 1.8580487630494487e-05 4.012939825770445e-05 7.96319825481106e-06 10 249194 7.088379788910969e-06 1.6787554739792595e-05 1 141076 Atg/Gtg Atg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA D868G NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|24 NA NA NA NA NA e 0.6834238767623901 98.48138064146042 C 0.0012308501172810793 0.0011160807916894557 0.9976530671119692 T 0.0008451846661046147 0.00016682653222233057 5.413505277829245e-06 0.0002866106224246323 0.00015793131024111062 0.09671083092689514 0.8831105828285217 0.01871668361127377 -64.32704925537111 -22.58346176147461 0.0022203689441084857 H 0.15950920245398773 S 0.7423312883435583 NA NA H 0.15950920245398773 T 0.8711656441717791 NA NA T 0.9018404907975459 NA NA T 0.8220858895705522 T 0.6871165644171779 NA NA NA NA NA NA S 0.4969325153374233 NA NA T 0.7852760736196319 T 0.8036809815950919 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.7 0.0 0.0 0.7 0.09 2603A>G D868V NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|24 NA NA NA NA NA e 0.6834238767623901 98.48138064146042 C 0.0012308501172810793 0.0011160807916894557 0.9976530671119692 T 0.0008451846661046147 0.00016682653222233057 5.413505277829245e-06 0.0002866106224246323 0.00015793131024111062 0.09671083092689514 0.8831105828285217 0.01871668361127377 -64.32704925537111 -22.58346176147461 0.0022203689441084857 H 0.15950920245398773 S 0.7423312883435583 NA NA H 0.15950920245398773 T 0.8711656441717791 NA NA T 0.9018404907975459 NA NA T 0.8220858895705522 T 0.6871165644171779 NA NA NA NA NA NA S 0.4969325153374233 NA NA T 0.7852760736196319 T 0.8036809815950919 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.043440185341751e-06 8.609025287714067e-06 4.043440185341751e-06 8.609025287714067e-06 1 247314 NA NA NA NA gAt/gTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S870T NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|24 NA NA NA NA NA b 0.06935378909111023 8.12826408147812 C 0.0067715556360781175 0.01724150776863098 0.9759869575500488 C 0.0005811925511807202 0.0029469954315572977 1.5841009371797554e-05 0.01400112733244896 0.006393834482878447 0.4097524285316467 0.005431965924799442 0.5608766674995422 -85.84455871582031 144.04269409179688 0.00036227720556780696 H 0.4846153846153846 S 0.1076923076923077 NA NA H 0.5076923076923077 S 0.13846153846153847 NA NA - 0.13846153846153847 NA NA - 0.04615384615384616 - 0.06923076923076922 NA NA NA NA NA NA S 0.2 NA NA - 0.1 - 0.04615384615384616 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 973558 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Y871C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.28159523010253906 60.176900672912595 H 0.9309098124504088 0.002568830503150821 0.06652141362428665 H 0.017563315108418458 0.915996789932251 0.00048360819346271455 0.0011193465907126665 0.0005603961762972176 0.011571296490728857 0.04664841666817665 0.006056791171431541 -64.99390411376953 -35.72382354736328 0.00019537996558938173 H 0.2747747747747748 H 0.16666666666666666 NA NA H 0.2747747747747748 H 0.14414414414414414 NA NA S 0.13063063063063066 NA NA H 0.17117117117117114 H 0.2072072072072072 NA NA NA NA NA NA T 0.10810810810810813 NA NA H 0.16216216216216214 H 0.22072072072072071 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.6169036001073888e-05 NA NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.6169036001073888e-05 1 143306 NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA M872L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA b 0.024000734090805054 4.802546891570091 H 0.9710185527801514 0.0003537440788932145 0.028627732768654823 H 0.0237144622951746 0.9361736178398132 0.0016107111005112527 0.00023692339891567824 8.064188295975327e-05 0.0024531278759241104 0.032269954681396484 0.003460677573457361 -65.76039886474611 -38.8156623840332 0.0003077624423895031 H 0.03723404255319149 H 0.0 NA NA H 0.0425531914893617 H 0.0 NA NA H 0.02127659574468085 NA NA H 0.04787234042553192 H 0.015957446808510637 NA NA NA NA NA NA T 0.02127659574468085 NA NA H 0.026595744680851064 H 0.03723404255319149 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9797301875951234e-06 1.2827081251900847e-05 NA NA NA NA 6.9797301875951234e-06 1.2827081251900847e-05 1 143272 NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA M872V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA b 0.024000734090805054 4.802546891570091 H 0.9710185527801514 0.0003537440788932145 0.028627732768654823 H 0.0237144622951746 0.9361736178398132 0.0016107111005112527 0.00023692339891567824 8.064188295975327e-05 0.0024531278759241104 0.032269954681396484 0.003460677573457361 -65.76039886474611 -38.8156623840332 0.0003077624423895031 H 0.03723404255319149 H 0.0 NA NA H 0.0425531914893617 H 0.0 NA NA H 0.02127659574468085 NA NA H 0.04787234042553192 H 0.015957446808510637 NA NA NA NA NA NA T 0.02127659574468085 NA NA H 0.026595744680851064 H 0.03723404255319149 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 891921 VUS 1 2.0275010220006344e-05 1.6607173897443312e-05 2.7854899599333287e-05 8.868336149218279e-06 7 251302 6.9797301875951234e-06 1.4041041229352994e-05 1 143272 Atg/Gtg Atg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA D874V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.4690394699573517 67.58858762085437 H 0.996881365776062 0.00012091483222320676 0.002997745294123888 H 0.004285878501832485 0.9911767244338988 0.0009568497771397232 1.676465581113007e-05 5.391370359575376e-05 0.0002703119826037437 0.002616811078041793 0.0006226898403838277 -63.00015640258789 -40.24697494506836 8.491138578392565e-05 H 0.4785276073619632 H 0.4355828220858896 NA NA H 0.4846625766871165 H 0.3803680981595092 NA NA H 0.4846625766871165 NA NA H 0.44171779141104295 H 0.4355828220858896 NA NA NA NA NA NA H 0.4171779141104294 NA NA H 0.37423312883435583 H 0.38650306748466257 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 194810 pathogenic 2 7.095537755887166e-05 1.86876545262507e-05 4.774139961227775e-05 1.0404338563673649e-05 12 251354 0.00011168500350322573 1.5523471607374155e-05 16 143260 gAt/gTt gAt/gTt 0 0 NA NA NA NA NA NA Y875* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2702702702702703 H 0.07207207207207207 NA NA H 0.28378378378378377 H 0.040540540540540536 NA NA H 0.058558558558558564 NA NA H 0.04954954954954955 H 0.07657657657657657 NA NA NA NA NA NA H 0.12162162162162166 NA NA H 0.07657657657657657 H 0.04954954954954955 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 547890 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA K877T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.4640416502952576 95.45336746573449 H 0.9944700002670288 9.995738946599886e-05 0.0054300460033118725 H 0.002504850272089243 0.98976069688797 0.001892470405437052 2.699406104511581e-05 3.571088018361479e-05 0.00035326037323102366 0.004347777925431728 0.0010781880700960755 -62.93092727661133 -41.20104217529297 0.0002771359286271036 - 0.2975609756097561 H 0.5853658536585366 NA NA - 0.2926829268292683 H 0.6536585365853659 NA NA H 0.6878048780487804 NA NA H 0.6048780487804878 H 0.6536585365853659 NA NA NA NA NA NA H 0.6682926829268293 NA NA H 0.6634146341463415 H 0.5756097560975609 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977189862780506e-06 8.206890910380192e-06 3.977189862780506e-06 8.206890910380192e-06 1 251434 NA NA NA NA aAa/aCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I879V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA b 0.05277451872825623 9.763285964727404 H 0.9854308366775512 8.056093065533787e-05 0.014488548040390016 H 0.006827960256487131 0.9715795516967772 0.006965737789869309 4.361970422905871e-05 3.5844132071360946e-05 0.0013136414345353842 0.008473280817270279 0.004760469775646925 -63.57881546020508 -40.82508087158203 0.00040566720417700713 - 0.09467455621301776 H 0.1893491124260355 NA NA - 0.08875739644970414 H 0.2189349112426036 NA NA H 0.16568047337278108 NA NA H 0.20710059171597636 H 0.20118343195266272 NA NA NA NA NA NA H 0.28994082840236685 NA NA H 0.1893491124260355 H 0.1952662721893491 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1930499567824883e-05 8.381556077604766e-06 1.1930499567824883e-05 8.381556077604766e-06 3 251456 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S880G NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA b 0.19425058364868164 22.76616840362549 H 0.9794726371765136 0.00018359716341365126 0.020343869924545288 H 0.02017758972942829 0.9494481682777404 0.007520461454987527 7.441330672008917e-05 7.629437459399924e-05 0.0016324493335559964 0.016598647460341454 0.004472030326724052 -63.01314163208008 -36.06969833374024 0.00048034120118245477 - 0.17692307692307693 H 0.3923076923076923 NA NA - 0.16923076923076924 T 0.3538461538461539 NA NA H 0.4923076923076923 NA NA H 0.3538461538461539 H 0.4076923076923077 NA NA NA NA NA NA H 0.4692307692307692 NA NA H 0.4230769230769231 H 0.3384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.0 0.0 0.33 0.0 2638A>G Q881E NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.5994240045547485 107.05712721347807 H 0.9084302186965942 0.0004676494281738997 0.09110216051340103 H 0.042481504380702965 0.8389555811882019 0.008081055246293545 0.00027096152189187706 0.00019390045781619852 0.007139838766306639 0.09401747584342957 0.008859704248607159 -68.12650299072266 -33.07646942138672 0.0008572731167078017 - 0.2777777777777778 H 0.6515151515151515 NA NA - 0.2777777777777778 T 0.6313131313131313 NA NA H 0.6313131313131313 NA NA H 0.6919191919191919 H 0.6515151515151515 NA NA NA NA NA NA H 0.6060606060606061 NA NA H 0.6666666666666666 H 0.6313131313131313 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.6 0.0 0.0 0.6 0.0 2641C>G Q881K NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.5994240045547485 107.05712721347807 H 0.9084302186965942 0.0004676494281738997 0.09110216051340103 H 0.042481504380702965 0.8389555811882019 0.008081055246293545 0.00027096152189187706 0.00019390045781619852 0.007139838766306639 0.09401747584342957 0.008859704248607159 -68.12650299072266 -33.07646942138672 0.0008572731167078017 - 0.2777777777777778 H 0.6515151515151515 NA NA - 0.2777777777777778 T 0.6313131313131313 NA NA H 0.6313131313131313 NA NA H 0.6919191919191919 H 0.6515151515151515 NA NA NA NA NA NA H 0.6060606060606061 NA NA H 0.6666666666666666 H 0.6313131313131313 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.89 0.0 0.0 0.89 0.0 2641C>A Q881P NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.5994240045547485 107.05712721347807 H 0.9084302186965942 0.0004676494281738997 0.09110216051340103 H 0.042481504380702965 0.8389555811882019 0.008081055246293545 0.00027096152189187706 0.00019390045781619852 0.007139838766306639 0.09401747584342957 0.008859704248607159 -68.12650299072266 -33.07646942138672 0.0008572731167078017 - 0.2777777777777778 H 0.6515151515151515 NA NA - 0.2777777777777778 T 0.6313131313131313 NA NA H 0.6313131313131313 NA NA H 0.6919191919191919 H 0.6515151515151515 NA NA NA NA NA NA H 0.6060606060606061 NA NA H 0.6666666666666666 H 0.6313131313131313 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9767101043253206e-06 8.974630874723045e-06 3.9767101043253206e-06 8.974630874723045e-06 1 251464 NA NA NA NA cAg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q881R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.5994240045547485 107.05712721347807 H 0.9084302186965942 0.0004676494281738997 0.09110216051340103 H 0.042481504380702965 0.8389555811882019 0.008081055246293545 0.00027096152189187706 0.00019390045781619852 0.007139838766306639 0.09401747584342957 0.008859704248607159 -68.12650299072266 -33.07646942138672 0.0008572731167078017 - 0.2777777777777778 H 0.6515151515151515 NA NA - 0.2777777777777778 T 0.6313131313131313 NA NA H 0.6313131313131313 NA NA H 0.6919191919191919 H 0.6515151515151515 NA NA NA NA NA NA H 0.6060606060606061 NA NA H 0.6666666666666666 H 0.6313131313131313 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953420208650641e-06 9.991296067745371e-06 7.953420208650641e-06 9.991296067745371e-06 2 251464 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y882C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.2880536615848541 61.557067480683315 H 0.8307836651802063 0.0008563804440200329 0.16835999488830564 H 0.04154781997203827 0.7348452210426331 0.008981343358755112 0.0002543303999118507 0.0002595123660285026 0.012636875733733177 0.19051030278205872 0.010964646935462952 -84.43889617919922 -23.57481575012207 0.0009090815437957644 - 0.08108108108108109 H 0.17117117117117114 NA NA - 0.08108108108108109 S 0.17567567567567569 NA NA H 0.22072072072072071 NA NA H 0.1981981981981982 H 0.2117117117117117 NA NA NA NA NA NA T 0.20270270270270271 NA NA H 0.17567567567567569 H 0.18468468468468469 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 8.742450817656355e-06 3.9766500776750036e-06 8.742450817656355e-06 1 251468 NA NA NA NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y882H NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|39 NA NA NA NA e 0.2880536615848541 61.557067480683315 H 0.8307836651802063 0.0008563804440200329 0.16835999488830564 H 0.04154781997203827 0.7348452210426331 0.008981343358755112 0.0002543303999118507 0.0002595123660285026 0.012636875733733177 0.19051030278205872 0.010964646935462952 -84.43889617919922 -23.57481575012207 0.0009090815437957644 - 0.08108108108108109 H 0.17117117117117114 NA NA - 0.08108108108108109 S 0.17567567567567569 NA NA H 0.22072072072072071 NA NA H 0.1981981981981982 H 0.2117117117117117 NA NA NA NA NA NA T 0.20270270270270271 NA NA H 0.17567567567567569 H 0.18468468468468469 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976680091000162e-06 8.156672978936122e-06 3.976680091000162e-06 8.156672978936122e-06 1 251466 NA NA NA NA Tac/Cac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H884R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4260406792163849 77.49679954946042 C 0.059159822762012475 0.0381120890378952 0.9027280807495116 T 0.03231176733970642 0.030900225043296814 0.0016384919872507453 0.010514512658119202 0.022345636039972302 0.17914405465126038 0.3784528076648712 0.3446924686431885 -38.410316467285156 38.6675910949707 0.0015259513165801766 - 0.1793478260869565 - 0.3641304347826087 NA NA - 0.16847826086956522 S 0.2989130434782609 NA NA - 0.32065217391304346 NA NA - 0.33695652173913043 - 0.3641304347826087 NA NA NA NA NA NA - 0.3804347826086957 NA NA - 0.33695652173913043 - 0.32608695652173914 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1929700121982025e-05 8.78906282498515e-06 1.1929700121982025e-05 8.78906282498515e-06 3 251474 NA NA NA NA cAt/cGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A885V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.16619592905044556 18.314791381359104 C 0.0479741171002388 0.19962266087532046 0.7524031996726991 C 0.016679540276527405 0.019066093489527702 0.0010539242066442966 0.05507397651672363 0.13681504130363464 0.2605586647987366 0.10240036994218826 0.40835240483284 -103.50851440429688 147.29579162597656 0.004372503142803907 B 0.05660377358490566 - 0.11320754716981132 NA NA B 0.0660377358490566 - 0.04716981132075472 NA NA - 0.08490566037735849 NA NA E 0.07547169811320754 E 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA - 0.12264150943396225 NA NA - 0.10377358490566037 E 0.10377358490566037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 838284 VUS 1 3.9766500776750036e-06 9.354302895401117e-06 3.9766500776750036e-06 9.354302895401117e-06 1 251468 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P887L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|25 NA NA NA NA NA b 0.20217496156692505 28.688627046346674 C 0.0007402412593364716 0.0167312640696764 0.9825284481048584 C 0.0004959094803780316 0.0002703841309994459 5.345093995856587e-06 0.0021359191741794348 0.015280441381037237 0.24798916280269626 0.01135022472590208 0.722472608089447 -71.94332885742188 148.98358154296875 0.00016183887782972306 - 0.07352941176470587 S 0.2426470588235294 NA NA - 0.07352941176470587 S 0.2352941176470588 NA NA - 0.2426470588235294 NA NA E 0.2647058823529412 E 0.2426470588235294 NA NA NA NA NA NA S 0.2867647058823529 NA NA - 0.25735294117647056 E 0.25735294117647056 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 803477 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA P888S NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|25 NA NA NA NA NA b 0.17183223366737366 24.382993957400323 C 0.0005650714738294482 0.1201297864317894 0.8793051242828369 C 0.00015280891966540366 0.00017694308189675212 3.835868028545519e-06 0.01131304446607828 0.0996316596865654 0.055360808968544006 0.006579329259693623 0.8267815113067627 -66.35834503173828 144.42645263671875 0.0001822596968850121 - 0.36764705882352944 E 0.09558823529411764 NA NA - 0.36764705882352944 E 0.11029411764705882 NA NA E 0.10294117647058824 NA NA E 0.1176470588235294 E 0.1176470588235294 NA NA NA NA NA NA - 0.10294117647058824 NA NA E 0.08088235294117647 E 0.09558823529411764 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976359948865138e-06 8.49778464827032e-06 3.976359948865138e-06 8.49778464827032e-06 1 251486 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y890* NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.35585585585585583 E 0.06756756756756757 NA NA - 0.35135135135135137 E 0.04954954954954955 NA NA E 0.0045045045045045045 NA NA E 0.06756756756756757 E 0.07207207207207207 NA NA NA NA NA NA E 0.018018018018018014 NA NA E 0.054054054054054064 E 0.07657657657657657 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 495788 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L893M NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|25 NA NA NA NA NA b 0.02484068274497986 4.548329010605811 E 0.000996001297608018 0.926537036895752 0.07246686518192291 E 0.0003527216031216085 0.00022513489238917828 5.498130121850409e-06 0.007676641922444104 0.9204023480415344 0.006194682791829109 0.001277333591133356 0.06386558711528778 -109.07611846923828 135.94557189941406 0.0006996610900387168 - 0.39634146341463417 E 0.0 NA NA - 0.3902439024390244 E 0.006097560975609756 NA NA E 0.0 NA NA E 0.0 E 0.0 NA NA NA NA NA NA E 0.0 NA NA E 0.0 E 0.018292682926829267 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976399966632016e-06 8.149895720045984e-06 3.976399966632016e-06 8.149895720045984e-06 1 251484 NA NA NA NA Ctg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E895V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5933812856674194 103.66371060609815 C 0.021848009899258614 0.08607903122901918 0.8920729756355286 T 0.019510369747877118 0.006647081580013037 5.392725506681018e-05 0.01062547042965889 0.04515181481838226 0.15086433291435242 0.6609171628952026 0.10622985661029816 -66.80485534667969 138.32080078125 0.006087860558182001 H 0.3917525773195876 T 0.3556701030927835 NA NA H 0.4020618556701031 T 0.3865979381443299 NA NA T 0.4020618556701031 NA NA T 0.30927835051546393 T 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA T 0.4793814432989691 NA NA T 0.3402061855670103 T 0.3350515463917525 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.77 0.0 0.0 0.77 0.0 2684A>T H897Y NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2521001696586609 45.857020860910424 C 0.008760570548474789 0.025162966921925545 0.9660764336586 C 0.003880644217133522 0.00228504603728652 5.180190419196151e-05 0.018085459247231483 0.013564588502049446 0.1859949231147766 0.03258562460541725 0.7435518503189087 -92.0035400390625 136.52227783203122 0.014496589079499243 H 0.31521739130434784 - 0.08152173913043477 NA NA H 0.32065217391304346 - 0.19021739130434784 NA NA - 0.03260869565217391 NA NA - 0.08152173913043477 - 0.09782608695652174 NA NA NA NA NA NA - 0.02717391304347826 NA NA - 0.043478260869565216 - 0.04891304347826087 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9764299799571745e-06 8.507606650633211e-06 3.9764299799571745e-06 8.507606650633211e-06 1 251482 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA 0.4 0.0 0.0 0.4 0.0 2689C>T D898N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5203559398651123 74.98329093456267 C 0.0044634006917476645 0.02396484278142452 0.9715717434883118 C 0.0014587189070880413 0.000748093705624342 5.613472239929251e-06 0.013365478254854679 0.008365948684513569 0.01583906263113022 0.010324461385607721 0.9498925805091858 -94.64585876464844 116.653076171875 0.014305461198091509 H 0.3680981595092024 - 0.5153374233128835 NA NA H 0.3680981595092024 - 0.4539877300613497 NA NA - 0.4049079754601227 NA NA - 0.5460122699386503 - 0.6012269938650306 NA NA NA NA NA NA - 0.4478527607361963 NA NA - 0.4846625766871165 - 0.4478527607361963 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.5468915650960395e-05 1.7310738860984028e-05 3.1810701329959556e-05 8.74895452317015e-06 8 251488 4.189239916740917e-05 1.4937117347891567e-05 6 143224 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA S902C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|40 NA NA NA NA e 0.6253297328948975 73.28864469528199 H 0.9694370031356812 9.810738265514374e-05 0.030464911833405495 H 0.004322448745369911 0.977926790714264 0.00015721307136118412 3.221743099857123e-05 2.326015783182811e-05 0.0028029950335621834 0.010621795430779457 0.004113251343369484 -59.0119743347168 -38.58543395996094 0.0037029068917036057 H 0.4230769230769231 H 0.4538461538461538 NA NA H 0.4230769230769231 H 0.4153846153846154 NA NA H 0.3384615384615385 NA NA H 0.4461538461538462 H 0.4230769230769231 NA NA NA NA NA NA H 0.4230769230769231 NA NA H 0.5 H 0.4461538461538462 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1928799722227268e-05 9.151056902266096e-06 1.1928799722227268e-05 9.151056902266096e-06 3 251492 NA NA NA NA tCc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G904R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|40 NA NA NA NA b 0.04660588502883911 3.667883151769638 H 0.9929847717285156 0.00014407031994778668 0.006871175952255726 H 0.004936559591442347 0.9885371923446656 0.001956172520294785 5.842227619723417e-05 4.13578818552196e-05 0.000673847331199795 0.0018604163778945804 0.0019360691076144574 -61.328468322753906 -42.560325622558594 0.0041896263137459755 H 0.3690476190476191 H 0.07142857142857142 NA NA H 0.3690476190476191 H 0.011904761904761904 NA NA H 0.023809523809523808 NA NA H 0.047619047619047616 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA NA NA H 0.023809523809523808 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.07142857142857142 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976239895564503e-06 9.285256686594624e-06 3.976239895564503e-06 9.285256686594624e-06 1 251494 NA NA NA NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G904V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|40 NA NA NA NA b 0.04660588502883911 3.667883151769638 H 0.9929847717285156 0.00014407031994778668 0.006871175952255726 H 0.004936559591442347 0.9885371923446656 0.001956172520294785 5.842227619723417e-05 4.13578818552196e-05 0.000673847331199795 0.0018604163778945804 0.0019360691076144574 -61.328468322753906 -42.560325622558594 0.0041896263137459755 H 0.3690476190476191 H 0.07142857142857142 NA NA H 0.3690476190476191 H 0.011904761904761904 NA NA H 0.023809523809523808 NA NA H 0.047619047619047616 H 0.05952380952380953 NA NA NA NA NA NA H 0.023809523809523808 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.07142857142857142 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.58 0.0 0.0 0.58 0.0 2711G>T Q905* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3383838383838384 H 0.010101010101010102 NA NA H 0.3232323232323233 H 0.0 NA NA H 0.005050505050505051 NA NA H 0.005050505050505051 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005050505050505051 H 0.020202020202020204 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 417625 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q905R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|40 NA NA NA NA b 0.1444733738899231 25.802944576740266 H 0.9904859662055968 0.0004536593623925 0.009060424752533436 H 0.003173627657815814 0.9774832725524902 0.012934182770550251 0.0001064920361386612 0.0001623945863684639 0.0006206731777638197 0.003003326477482915 0.002515984699130059 -60.05663299560547 -42.23978042602539 0.002075514523312449 H 0.3383838383838384 H 0.010101010101010102 NA NA H 0.3232323232323233 H 0.0 NA NA H 0.005050505050505051 NA NA H 0.005050505050505051 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005050505050505051 H 0.020202020202020204 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.7879808426945778e-05 NA NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.7879808426945778e-05 1 143300 NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA M907K NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3167597055435181 63.38361707925797 H 0.9704352021217346 0.0008816825575195252 0.02868317067623138 H 0.008590820245444775 0.9220055937767028 0.04358461871743202 0.0002699025208130479 0.0003975782892666757 0.0028539719060063358 0.016044670715928078 0.006252846214920282 -65.34946441650389 -40.8836669921875 0.004163801204413176 H 0.24468085106382975 T 0.19680851063829788 NA NA H 0.24468085106382975 T 0.25 NA NA T 0.22340425531914893 NA NA T 0.22340425531914893 T 0.20212765957446807 NA NA NA NA NA NA H 0.2393617021276596 NA NA T 0.24468085106382975 T 0.3138297872340425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.0 0.0 0.62 0.0 2720T>A M907V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3167597055435181 63.38361707925797 H 0.9704352021217346 0.0008816825575195252 0.02868317067623138 H 0.008590820245444775 0.9220055937767028 0.04358461871743202 0.0002699025208130479 0.0003975782892666757 0.0028539719060063358 0.016044670715928078 0.006252846214920282 -65.34946441650389 -40.8836669921875 0.004163801204413176 H 0.24468085106382975 T 0.19680851063829788 NA NA H 0.24468085106382975 T 0.25 NA NA T 0.22340425531914893 NA NA T 0.22340425531914893 T 0.20212765957446807 NA NA NA NA NA NA H 0.2393617021276596 NA NA T 0.24468085106382975 T 0.3138297872340425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.266540705837125e-05 1.8535455949654146e-05 1.1928799722227268e-05 8.729568253531638e-06 3 251492 1.3958299859950785e-05 1.6351078416070962e-05 2 143284 Atg/Gtg Atg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA V908= NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.05913171172142029 9.088544091582298 H 0.9411817789077759 0.002803207840770483 0.056014977395534515 H 0.007508199661970138 0.8505873084068298 0.0910860225558281 0.00117567740380764 0.0008916896185837686 0.008363346569240093 0.02969481237232685 0.01069299690425396 -69.73656463623047 -40.11224365234375 0.007978184148669245 H 0.323943661971831 T 0.0 NA NA H 0.31690140845070425 T 0.0 NA NA T 0.0 NA NA T 0.0 T 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA T 0.0 T 0.007042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.73 0.0 0.0 0.73 0.0 2724G>A V908A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.05913171172142029 9.088544091582298 H 0.9411817789077759 0.002803207840770483 0.056014977395534515 H 0.007508199661970138 0.8505873084068298 0.0910860225558281 0.00117567740380764 0.0008916896185837686 0.008363346569240093 0.02969481237232685 0.01069299690425396 -69.73656463623047 -40.11224365234375 0.007978184148669245 H 0.323943661971831 T 0.0 NA NA H 0.31690140845070425 T 0.0 NA NA T 0.0 NA NA T 0.0 T 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA T 0.0 T 0.007042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976299922214822e-06 9.858338875650383e-06 3.976299922214822e-06 9.858338875650383e-06 1 251490 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V908L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.05913171172142029 9.088544091582298 H 0.9411817789077759 0.002803207840770483 0.056014977395534515 H 0.007508199661970138 0.8505873084068298 0.0910860225558281 0.00117567740380764 0.0008916896185837686 0.008363346569240093 0.02969481237232685 0.01069299690425396 -69.73656463623047 -40.11224365234375 0.007978184148669245 H 0.323943661971831 T 0.0 NA NA H 0.31690140845070425 T 0.0 NA NA T 0.0 NA NA T 0.0 T 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA T 0.0 T 0.007042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976269908889663e-06 8.895332545553242e-06 3.976269908889663e-06 8.895332545553242e-06 1 251492 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C909= NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|12 NA NA NA NA NA NA b 0.17221882939338684 24.179523646831512 H 0.7354434728622437 0.006060688756406307 0.25849586725234985 H 0.014108565635979176 0.6152190566062927 0.11265338957309726 0.006967861671000719 0.0013811669778078794 0.03525986894965172 0.17161084711551666 0.042799152433872216 -83.4064712524414 -22.2391414642334 0.0067482227459549895 H 0.4814814814814815 - 0.0 NA NA H 0.4666666666666667 - 0.014814814814814815 NA NA - 0.022222222222222227 NA NA - 0.007407407407407408 - 0.007407407407407408 NA NA NA NA NA NA - 0.007407407407407408 NA NA - 0.007407407407407408 - 0.007407407407407408 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.27 0.0 2727C>T C909S NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|12 NA NA NA NA NA NA b 0.17221882939338684 24.179523646831512 H 0.7354434728622437 0.006060688756406307 0.25849586725234985 H 0.014108565635979176 0.6152190566062927 0.11265338957309726 0.006967861671000719 0.0013811669778078794 0.03525986894965172 0.17161084711551666 0.042799152433872216 -83.4064712524414 -22.2391414642334 0.0067482227459549895 H 0.4814814814814815 - 0.0 NA NA H 0.4666666666666667 - 0.014814814814814815 NA NA - 0.022222222222222227 NA NA - 0.007407407407407408 - 0.007407407407407408 NA NA NA NA NA NA - 0.007407407407407408 NA NA - 0.007407407407407408 - 0.007407407407407408 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.89 0.0 0.0 0.89 0.0 2725T>A G910S NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.40011104941368103 31.488739588856696 C 0.3040400445461273 0.010686785914003849 0.6852731704711914 T 0.03892310708761215 0.2517007887363434 0.0398000106215477 0.010364744812250136 0.004847008269280195 0.1725003868341446 0.304403156042099 0.1774609088897705 -68.68672943115234 -15.143527030944824 0.02304096706211567 H 0.5476190476190477 - 0.2261904761904762 NA NA H 0.5476190476190477 - 0.2023809523809524 NA NA - 0.2619047619047619 NA NA - 0.19047619047619047 - 0.15476190476190474 NA NA NA NA NA NA - 0.047619047619047616 NA NA - 0.2380952380952381 - 0.2619047619047619 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 268187 pathogenic 2 7.952859959914349e-06 8.887903124252381e-06 7.952859959914349e-06 8.887903124252381e-06 2 251482 NA NA NA NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G911= NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|26 NA NA NA NA NA e 0.473435789346695 37.25939662158489 C 0.1954917162656784 0.008716114796698093 0.7957921028137207 T 0.05590248107910156 0.10420277714729308 0.016533490270376202 0.006633031647652389 0.0042123934254050255 0.2661259472370148 0.3999181389808655 0.14647176861763 -44.32564163208008 -19.61536979675293 0.018440907821059227 H 0.10714285714285714 S 0.5238095238095238 NA NA H 0.11904761904761905 S 0.4166666666666667 NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.35714285714285715 S 0.2261904761904762 NA NA NA NA NA NA S 0.5238095238095238 NA NA S 0.4523809523809524 S 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.0 0.0 0.21 0.0 2733C>T G911S NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|26 NA NA NA NA NA e 0.473435789346695 37.25939662158489 C 0.1954917162656784 0.008716114796698093 0.7957921028137207 T 0.05590248107910156 0.10420277714729308 0.016533490270376202 0.006633031647652389 0.0042123934254050255 0.2661259472370148 0.3999181389808655 0.14647176861763 -44.32564163208008 -19.61536979675293 0.018440907821059227 H 0.10714285714285714 S 0.5238095238095238 NA NA H 0.11904761904761905 S 0.4166666666666667 NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.35714285714285715 S 0.2261904761904762 NA NA NA NA NA NA S 0.5238095238095238 NA NA S 0.4523809523809524 S 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 181452 benign 2 0.001874499959694516 1.7573921090709147e-05 0.0009662639931775631 7.88684569968893e-06 243 251484 0.003468540031462908 1.5704788040969225e-05 497 143288 Ggc/Agc Ggc/Agc 2 2 NA NA NA NA NA NA M912L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|26 NA NA NA NA NA e 0.3981098830699921 79.66178760230541 C 0.10250457376241684 0.02508571743965149 0.8724096417427063 T 0.04599786922335625 0.06078087538480759 0.004632604308426379 0.016253134235739708 0.013605174608528614 0.2392980754375457 0.3869132101535797 0.2325190007686615 -88.02555847167969 15.975525856018065 0.02957121096551418 T 0.34574468085106386 S 0.35106382978723405 NA NA T 0.34574468085106386 S 0.11170212765957446 NA NA S 0.9414893617021276 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA T 0.9787234042553192 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.0395260134595606e-05 1.7545336218885844e-05 1.9882099877577275e-05 9.161660736955901e-06 5 251482 4.8843099648365744e-05 1.4963381822792205e-05 7 143316 Atg/Ctg Atg/Ctg 0 0 NA NA NA NA NA NA M912T NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|26 NA NA NA NA NA e 0.3981098830699921 79.66178760230541 C 0.10250457376241684 0.02508571743965149 0.8724096417427063 T 0.04599786922335625 0.06078087538480759 0.004632604308426379 0.016253134235739708 0.013605174608528614 0.2392980754375457 0.3869132101535797 0.2325190007686615 -88.02555847167969 15.975525856018065 0.02957121096551418 T 0.34574468085106386 S 0.35106382978723405 NA NA T 0.34574468085106386 S 0.11170212765957446 NA NA S 0.9414893617021276 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA T 0.9787234042553192 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.97632993553998e-06 8.233136921228367e-06 3.97632993553998e-06 8.233136921228367e-06 1 251488 NA NA NA NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M912V NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|26 NA NA NA NA NA e 0.3981098830699921 79.66178760230541 C 0.10250457376241684 0.02508571743965149 0.8724096417427063 T 0.04599786922335625 0.06078087538480759 0.004632604308426379 0.016253134235739708 0.013605174608528614 0.2392980754375457 0.3869132101535797 0.2325190007686615 -88.02555847167969 15.975525856018065 0.02957121096551418 T 0.34574468085106386 S 0.35106382978723405 NA NA T 0.34574468085106386 S 0.11170212765957446 NA NA S 0.9414893617021276 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA NA NA T 0.9787234042553192 NA NA S 0.35106382978723405 S 0.3138297872340425 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326258 VUS 1 7.952859959914349e-06 9.415715500540047e-06 7.952859959914349e-06 9.415715500540047e-06 2 251482 NA NA NA NA Atg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N916K NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|13 NA NA STRAND|27 NA NA NA NA NA e 0.4427179396152496 64.81390635967254 C 0.174449160695076 0.010912676341831684 0.8146381974220276 C 0.033069271594285965 0.1377311497926712 0.0013909777626395226 0.00699449609965086 0.005687019322067499 0.18589192628860474 0.09372709691524506 0.5355080366134644 -88.64617919921875 74.36740112304688 0.010586515069007874 E 0.3885350318471338 S 0.8343949044585988 NA NA E 0.3821656050955414 T 0.7197452229299363 NA NA S 0.732484076433121 NA NA S 0.8471337579617835 S 0.8089171974522293 NA NA NA NA NA NA S 0.9044585987261148 NA NA S 0.9044585987261148 T 0.8662420382165605 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1929399988730438e-05 8.909835150759298e-06 1.1929399988730438e-05 8.909835150759298e-06 3 251480 NA NA NA NA aaT/aaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N916S NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|13 NA NA STRAND|27 NA NA NA NA NA e 0.4427179396152496 64.81390635967254 C 0.174449160695076 0.010912676341831684 0.8146381974220276 C 0.033069271594285965 0.1377311497926712 0.0013909777626395226 0.00699449609965086 0.005687019322067499 0.18589192628860474 0.09372709691524506 0.5355080366134644 -88.64617919921875 74.36740112304688 0.010586515069007874 E 0.3885350318471338 S 0.8343949044585988 NA NA E 0.3821656050955414 T 0.7197452229299363 NA NA S 0.732484076433121 NA NA S 0.8471337579617835 S 0.8089171974522293 NA NA NA NA NA NA S 0.9044585987261148 NA NA S 0.9044585987261148 T 0.8662420382165605 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 374343 VUS 2 8.612472143493159e-05 1.7425431191026898e-05 0.0001033869993989356 9.175154611930558e-06 26 251482 5.5829299526521936e-05 1.481425631074279e-05 8 143294 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA L919Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.08386653661727905 15.355962854623794 H 0.9743771553039552 0.0006465266924351454 0.024976329877972603 H 0.010098167695105076 0.9657077789306641 0.0013833618722856045 0.0003120813926216215 0.00021057057892903688 0.003228171728551388 0.012491341680288315 0.006568596698343754 -65.23300170898439 -40.55227661132813 0.0025791628286242485 E 0.3902439024390244 H 0.0 NA NA E 0.3902439024390244 H 0.04878048780487805 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.012195121951219513 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.84 0.0 0.0 0.84 0.07 2756T>A V920= NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.07099080085754395 10.911286091804504 H 0.987672746181488 0.0006056047277525067 0.011721589602530004 H 0.004008371848613025 0.9839096665382384 0.0027856866363435984 0.00010665030276868492 0.0002517057582736016 0.0010426713852211833 0.00377710466273129 0.004118063952773809 -63.17083740234375 -41.25714874267578 0.001876238966360688 E 0.2887323943661972 H 0.06338028169014084 NA NA E 0.29577464788732394 H 0.04929577464788732 NA NA H 0.028169014084507043 NA NA H 0.07746478873239436 H 0.09154929577464788 NA NA NA NA NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.07042253521126761 H 0.07746478873239436 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.67 0.0 0.0 0.67 0.03 2760G>A V920G NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.07099080085754395 10.911286091804504 H 0.987672746181488 0.0006056047277525067 0.011721589602530004 H 0.004008371848613025 0.9839096665382384 0.0027856866363435984 0.00010665030276868492 0.0002517057582736016 0.0010426713852211833 0.00377710466273129 0.004118063952773809 -63.17083740234375 -41.25714874267578 0.001876238966360688 E 0.2887323943661972 H 0.06338028169014084 NA NA E 0.29577464788732394 H 0.04929577464788732 NA NA H 0.028169014084507043 NA NA H 0.07746478873239436 H 0.09154929577464788 NA NA NA NA NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.07042253521126761 H 0.07746478873239436 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.4581625526873529e-05 NA NA NA NA 6.977879820624366e-06 1.4581625526873529e-05 1 143310 NA gTg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA Q921* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.202020202020202 H 0.2777777777777778 NA NA - 0.1919191919191919 H 0.2575757575757576 NA NA H 0.21212121212121213 NA NA H 0.2727272727272727 H 0.3282828282828283 NA NA NA NA NA NA H 0.18181818181818185 NA NA H 0.2777777777777778 H 0.3181818181818182 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 188849 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q921R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA e 0.4785861968994141 85.47549476623534 H 0.990446925163269 0.0002886629954446107 0.00926437508314848 H 0.002605280606076121 0.9860679507255554 0.0028146933764219284 5.439765300252475e-05 0.0001598239759914577 0.0007794062257744372 0.0043183579109609144 0.003200029954314232 -63.88412094116211 -40.28815841674805 0.0022348035126924515 - 0.202020202020202 H 0.2777777777777778 NA NA - 0.1919191919191919 H 0.2575757575757576 NA NA H 0.21212121212121213 NA NA H 0.2727272727272727 H 0.3282828282828283 NA NA NA NA NA NA H 0.18181818181818185 NA NA H 0.2777777777777778 H 0.3181818181818182 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.0 0.0 0.38 0.0 2762A>G Q922* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S 0.0505050505050505 H 0.15151515151515152 NA NA S 0.05555555555555555 H 0.24242424242424246 NA NA H 0.18686868686868688 NA NA H 0.14646464646464644 H 0.16161616161616166 NA NA NA NA NA NA H 0.15151515151515152 NA NA H 0.15151515151515152 H 0.17676767676767674 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 189033 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.0 0.0 0.32 0.04 2764C>T I923V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.036481529474258416 6.749082952737807 H 0.9881457090377808 0.0006581316702067852 0.011196184903383257 H 0.0037285389844328174 0.9790858626365662 0.005828182213008404 0.00012101884203730151 0.0003572849091142416 0.0013192484620958569 0.005391817074269056 0.004168096464127302 -63.97688674926758 -42.86609649658203 0.0015639918856322765 - 0.08875739644970414 H 0.0 NA NA - 0.08875739644970414 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 863860 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0 0.0 0.0 1.0 0.79 2767A>G N925K NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA e 0.484450101852417 70.92349491119386 H 0.9355877637863159 0.0006928877555765213 0.0637192651629448 H 0.007131148129701614 0.9287896752357484 0.0047426484525203705 0.0002761979994829744 0.00037198877544142317 0.005965734366327524 0.033775631338357925 0.01894691959023476 -65.99164581298828 -37.756797790527344 0.0048515782691538325 - 0.08917197452229299 H 0.4777070063694268 NA NA - 0.09554140127388536 H 0.4203821656050956 NA NA H 0.4140127388535032 NA NA H 0.5031847133757962 H 0.4012738853503185 NA NA NA NA NA NA H 0.4968152866242038 NA NA H 0.4713375796178344 H 0.4904458598726114 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977469987148652e-06 9.225570163520093e-06 3.977469987148652e-06 9.225570163520093e-06 1 251416 NA NA NA NA aaC/aaG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A926T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.13880503177642822 15.29631450176239 H 0.9228246212005616 0.0003760503605008125 0.07679937034845352 H 0.03435197472572327 0.8688781261444092 0.003448644652962685 0.00016759037680458277 0.0002336479083169252 0.007577404845505953 0.05706024914979935 0.028282418847084045 -65.36848449707031 -34.621288299560554 0.006673752795904875 - 0.3584905660377358 H 0.05660377358490566 NA NA - 0.3584905660377358 H 0.03773584905660377 NA NA H 0.12264150943396225 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 NA NA NA NA NA NA H 0.10377358490566037 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 985168 pathogenic 1 1.193289972434286e-05 9.661396005215967e-06 1.193289972434286e-05 9.661396005215967e-06 3 251406 NA NA NA NA Gcg/Acg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A926V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.13880503177642822 15.29631450176239 H 0.9228246212005616 0.0003760503605008125 0.07679937034845352 H 0.03435197472572327 0.8688781261444092 0.003448644652962685 0.00016759037680458277 0.0002336479083169252 0.007577404845505953 0.05706024914979935 0.028282418847084045 -65.36848449707031 -34.621288299560554 0.006673752795904875 - 0.3584905660377358 H 0.05660377358490566 NA NA - 0.3584905660377358 H 0.03773584905660377 NA NA H 0.12264150943396225 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 NA NA NA NA NA NA H 0.10377358490566037 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 181456 pathogenic 1 2.0936600776622072e-05 1.6320593280514085e-05 NA NA NA NA 2.0936600776622072e-05 1.6320593280514085e-05 3 143290 NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA A927V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA b 0.1411897838115692 15.559114176034928 H 0.7210693955421448 0.0027227019891142845 0.276207834482193 H 0.0755826085805893 0.6188937425613403 0.002373816445469857 0.0016019870527088642 0.0010923747904598713 0.02444184571504593 0.2259508222341537 0.05006285011768341 -67.53183746337889 -24.085582733154297 0.015318505465984344 - 0.4528301886792453 H 0.08490566037735849 NA NA - 0.4716981132075472 H 0.09433962264150944 NA NA H 0.07547169811320754 NA NA H 0.10377358490566037 H 0.09433962264150944 NA NA NA NA NA NA H 0.0660377358490566 NA NA H 0.1320754716981132 H 0.08490566037735849 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 552715 pathogenic 1 2.3870699806138876e-05 7.946436263911252e-06 2.3870699806138876e-05 7.946436263911252e-06 6 251354 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L929V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|41 NA NA NA NA e 0.2759753465652466 50.531085956096646 C 0.16833016276359558 0.015457889065146446 0.816211998462677 C 0.0417083352804184 0.10343167930841446 0.0013622072292491796 0.012219137512147428 0.009779498912394049 0.244144469499588 0.09068845212459564 0.4966662228107453 -80.67837524414062 120.59111785888672 0.03238271549344063 - 0.2378048780487805 H 0.29878048780487804 NA NA - 0.22560975609756095 - 0.18292682926829268 NA NA S 0.6036585365853658 NA NA H 0.27439024390243905 H 0.36585365853658536 NA NA NA NA NA NA T 0.6890243902439024 NA NA H 0.3231707317073171 H 0.3048780487804878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.68 0.0 0.0 0.68 0.06 2785C>G N931K NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|14 NA NA STRAND|28 NA NA NA NA NA e 0.6345175504684448 92.8933693885803 C 0.10750109702348708 0.010276162996888159 0.8822227716445923 T 0.06693534553050995 0.039547566324472434 0.0006462042802013457 0.0025123655796051025 0.00651110103353858 0.1830469965934753 0.4673015177249909 0.2334989011287689 -73.1209487915039 15.061402320861815 0.03320922702550888 H 0.4585987261146497 S 0.8535031847133758 NA NA H 0.4522292993630573 T 0.8152866242038217 NA NA T 0.8789808917197452 NA NA S 0.7643312101910829 S 0.7961783439490446 NA NA NA NA NA NA T 0.8471337579617835 NA NA S 0.7515923566878981 S 0.7070063694267515 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.989389930822653e-06 1.3920807324638806e-05 NA NA NA NA 6.989389930822653e-06 1.3920807324638806e-05 1 143074 NA aaC/aaG NA 0 0.24 0.0 0.0 0.24 0.05 2793C>G N931S NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|14 NA NA STRAND|28 NA NA NA NA NA e 0.6345175504684448 92.8933693885803 C 0.10750109702348708 0.010276162996888159 0.8822227716445923 T 0.06693534553050995 0.039547566324472434 0.0006462042802013457 0.0025123655796051025 0.00651110103353858 0.1830469965934753 0.4673015177249909 0.2334989011287689 -73.1209487915039 15.061402320861815 0.03320922702550888 H 0.4585987261146497 S 0.8535031847133758 NA NA H 0.4522292993630573 T 0.8152866242038217 NA NA T 0.8789808917197452 NA NA S 0.7643312101910829 S 0.7961783439490446 NA NA NA NA NA NA T 0.8471337579617835 NA NA S 0.7515923566878981 S 0.7070063694267515 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979339908255497e-06 8.062183445645247e-06 3.979339908255497e-06 8.062183445645247e-06 1 251298 NA NA NA NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y932S NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|28 NA NA NA NA NA e 0.31462517380714417 67.2353996425867 C 0.1404687464237213 0.1729455143213272 0.6865857839584351 C 0.07915370166301727 0.059365119785070426 0.0012837079120799901 0.038449622690677636 0.13059541583061218 0.1578909456729889 0.12522989511489868 0.4080315828323364 -99.5011749267578 110.20922088623048 0.03337398543953896 H 0.3648648648648649 S 0.472972972972973 NA NA H 0.3648648648648649 T 0.3783783783783784 NA NA T 0.6171171171171171 NA NA S 0.4099099099099099 S 0.4459459459459459 NA NA NA NA NA NA T 0.6216216216216216 NA NA S 0.4459459459459459 S 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979499979323009e-06 8.495543507436998e-06 3.979499979323009e-06 8.495543507436998e-06 1 251288 NA NA NA NA tAt/tCt NA 0 NA 0.23 0.0 0.0 0.03 0.23 2795A>C T933S NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|28 NA NA NA NA NA e 0.2562035918235779 35.53543818593025 C 0.10427364706993104 0.20582886040210724 0.6898974776268005 C 0.04190588369965553 0.04015179723501205 0.0007423377246595919 0.039468806236982346 0.15499591827392578 0.14078983664512634 0.05929346010088921 0.5226519107818604 -97.0295181274414 111.95028686523438 0.024098165333271027 H 0.4295774647887324 S 0.07746478873239436 NA NA H 0.4225352112676056 S 0.04225352112676056 NA NA S 0.1267605633802817 NA NA S 0.07746478873239436 S 0.07042253521126761 NA NA NA NA NA NA S 0.09859154929577464 NA NA S 0.08450704225352113 S 0.07042253521126761 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.79 0.79 0.0 0.0 0.0 2798C>G R934* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.16129032258064516 - 0.2056451612903226 NA NA H 0.16532258064516128 S 0.20161290322580644 NA NA - 0.2056451612903226 NA NA - 0.1935483870967742 - 0.17338709677419356 NA NA NA NA NA NA S 0.16129032258064516 NA NA - 0.1975806451612903 - 0.21370967741935484 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 917636 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R934L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.32897400856018066 75.33504796028137 C 0.0885225310921669 0.3366453647613525 0.5748321413993835 C 0.03522640839219093 0.052827082574367516 0.0012546998914331198 0.05520479381084442 0.2564069926738739 0.18690495193004608 0.09332718700170516 0.31884780526161194 -106.04630279541016 115.80208587646484 0.022846123203635216 H 0.16129032258064516 - 0.2056451612903226 NA NA H 0.16532258064516128 S 0.20161290322580644 NA NA - 0.2056451612903226 NA NA - 0.1935483870967742 - 0.17338709677419356 NA NA NA NA NA NA S 0.16129032258064516 NA NA - 0.1975806451612903 - 0.21370967741935484 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 289258 VUS 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R934Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.32897400856018066 75.33504796028137 C 0.0885225310921669 0.3366453647613525 0.5748321413993835 C 0.03522640839219093 0.052827082574367516 0.0012546998914331198 0.05520479381084442 0.2564069926738739 0.18690495193004608 0.09332718700170516 0.31884780526161194 -106.04630279541016 115.80208587646484 0.022846123203635216 H 0.16129032258064516 - 0.2056451612903226 NA NA H 0.16532258064516128 S 0.20161290322580644 NA NA - 0.2056451612903226 NA NA - 0.1935483870967742 - 0.17338709677419356 NA NA NA NA NA NA S 0.16129032258064516 NA NA - 0.1975806451612903 - 0.21370967741935484 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 189117 pathogenic 2 7.654533373156488e-06 1.8850859739385943e-05 4.0214899854618125e-06 8.493509142630908e-06 1 248664 1.3960599972051568e-05 1.6828999238161702e-05 2 143260 cGa/cAa cGa/cAa 0 0 NA NA NA NA NA NA G936D NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14129415154457092 11.119849726557732 C 0.043067101389169686 0.33647146821022034 0.6204614639282227 C 0.021189574152231216 0.014425260014832018 0.0013309797504916787 0.05519648641347885 0.2621442675590515 0.20214572548866272 0.11876098811626434 0.32480672001838684 -105.67921447753906 -143.7039794921875 0.01868925616145134 H 0.4761904761904762 - 0.14285714285714285 NA NA H 0.4642857142857143 - 0.05952380952380953 NA NA - 0.05952380952380953 NA NA - 0.13095238095238096 - 0.14285714285714285 NA NA NA NA NA NA - 0.11904761904761905 NA NA - 0.13095238095238096 - 0.16666666666666666 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.0095301301334985e-06 8.562613404967154e-06 4.0095301301334985e-06 8.562613404967154e-06 1 249406 NA NA NA NA gGc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A938T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14655637741088867 16.150512790679933 C 0.015070384368300438 0.05502081662416458 0.9299088120460508 C 0.003825761377811432 0.007456696592271328 8.474533387925476e-05 0.012432428076863287 0.03750929236412048 0.07418809086084366 0.016820063814520836 0.8476829528808594 -76.71703338623047 141.2763214111328 0.007253580261021853 T 0.3679245283018868 - 0.490566037735849 NA NA T 0.3867924528301887 - 0.4622641509433962 NA NA - 0.490566037735849 NA NA - 0.5471698113207547 - 0.4811320754716981 NA NA NA NA NA NA - 0.5566037735849056 NA NA - 0.5377358490566038 - 0.5283018867924528 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.580108793772346e-05 1.7709769433744528e-05 4.4048301788279793e-05 9.71549529391238e-06 11 249726 4.88561017846223e-05 1.4806926912440625e-05 7 143278 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0 NA NA NA NA NA NA P939A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10803452134132384 15.330098578333855 C 0.1318572163581848 0.08890103548765182 0.7792418003082275 C 0.0521860420703888 0.0622519925236702 0.0008432164904661478 0.03135059028863907 0.07075519859790802 0.0615672767162323 0.0678410455584526 0.653204619884491 -68.9244384765625 144.68487548828125 0.007045511156320572 T 0.6544117647058824 - 0.029411764705882356 NA NA T 0.6764705882352942 - 0.1176470588235294 NA NA - 0.1176470588235294 NA NA - 0.036764705882352935 - 0.0661764705882353 NA NA NA NA NA NA - 0.11029411764705882 NA NA - 0.04411764705882353 - 0.05147058823529412 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.0004501897783484e-06 8.565695544799738e-06 4.0004501897783484e-06 8.565695544799738e-06 1 249972 NA NA NA NA Ccc/Gcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S940L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2692666053771973 31.55804615020752 C 0.3151510953903198 0.05901258438825607 0.6258363127708435 C 0.1517263650894165 0.15757568180561066 0.0028266224544495344 0.02171309106051922 0.04211634024977684 0.2062336653470993 0.15910091996192932 0.2587073147296905 -79.86771392822266 -19.783971786499023 0.0037828385829925533 S 0.4461538461538462 - 0.4230769230769231 NA NA S 0.4076923076923077 - 0.4846153846153846 NA NA - 0.2769230769230769 NA NA - 0.5769230769230769 - 0.5538461538461539 NA NA NA NA NA NA B 0.3307692307692308 NA NA - 0.4923076923076923 - 0.5384615384615384 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 188716 pathogenic 2 1.2710179574863983e-05 1.858233189382536e-05 1.5994399291230366e-05 7.853354472827795e-06 4 250088 6.9784600782440975e-06 1.6841255361058888e-05 1 143298 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA D944N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA e 0.3641612231731415 52.475632259249686 H 0.9716681241989136 0.001163179986178875 0.02716865763068199 H 0.05595973879098892 0.9021396040916444 0.007521325722336769 0.00021995106362737715 0.0008165898034349084 0.005289365537464619 0.021554641425609592 0.006498685572296381 -65.02643585205078 -37.03003692626953 0.00041424366645514965 E 0.3803680981595092 H 0.1840490797546012 NA NA E 0.3803680981595092 H 0.3067484662576687 NA NA H 0.22085889570552147 NA NA H 0.27607361963190186 H 0.2085889570552147 NA NA NA NA NA NA H 0.22699386503067484 NA NA H 0.1901840490797546 H 0.22699386503067484 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 594885 pathogenic 1 1.5246232174942054e-05 1.7792948175255543e-05 1.1988299775111955e-05 8.881646387848464e-06 3 250244 2.093570037686732e-05 1.5417696397599348e-05 3 143296 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA D945N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA e 0.2573668956756592 37.086569666862495 H 0.9723161458969116 0.000901724211871624 0.026782097294926643 H 0.04389960691332817 0.9210598468780518 0.006505977362394333 0.0002375221229158342 0.00046634033787995577 0.002276997314766049 0.019208088517189026 0.006345607340335846 -69.07611846923828 -33.71132278442383 0.0002542249858379364 E 0.3496932515337423 H 0.3128834355828221 NA NA E 0.3558282208588957 H 0.22699386503067484 NA NA H 0.27607361963190186 NA NA H 0.2147239263803681 H 0.13496932515337426 NA NA NA NA NA NA H 0.32515337423312884 NA NA H 0.2883435582822086 H 0.32515337423312884 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 539312 VUS 1 7.618428641571605e-06 1.5653492267562455e-05 7.984859621501528e-06 8.116253057427521e-06 2 250474 6.977979865041562e-06 1.3385001175884744e-05 1 143308 Gat/Aat Gat/Aat 0 0 NA NA NA NA NA NA F947S NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA b 0.14895012974739075 29.89429104030132 H 0.980684757232666 0.0006368416943587363 0.01867845095694065 H 0.061030980199575424 0.9029140472412108 0.010430455207824707 0.00019153700850438327 0.00031677703373134136 0.0015727970749139786 0.01949441246688366 0.004048978909850121 -63.07628631591797 -37.22361373901367 0.0001248896587640047 - 0.28426395939086296 H 0.116751269035533 NA NA - 0.29441624365482233 H 0.08629441624365483 NA NA H 0.1319796954314721 NA NA H 0.0964467005076142 H 0.1065989847715736 NA NA NA NA NA NA H 0.15228426395939088 NA NA H 0.116751269035533 H 0.1116751269035533 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.988259777543135e-06 8.547107186809561e-06 3.988259777543135e-06 8.547107186809561e-06 1 250736 NA NA NA NA tTc/tCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D948N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA e 0.5897672772407532 84.98546465039253 H 0.9622899889945984 0.00046754110371693963 0.03724244236946106 H 0.07907173782587051 0.8464505672454834 0.013492421247065069 0.00011888456356246023 0.00024430011399090295 0.002920474158599973 0.05307820439338684 0.004623343236744404 -65.72798919677734 -32.58768081665039 0.0002726215461734683 S 0.4539877300613497 H 0.5398773006134969 NA NA S 0.4601226993865031 H 0.50920245398773 NA NA H 0.5828220858895705 NA NA H 0.4478527607361963 H 0.25153374233128833 NA NA NA NA NA NA T 0.6257668711656442 NA NA H 0.5644171779141104 H 0.5828220858895705 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 552987 pathogenic 2 3.988639946328476e-06 9.548642420946339e-06 3.988639946328476e-06 9.548642420946339e-06 1 250712 NA NA NA NA Gac/Aac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V950A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA b 0.034091025590896606 5.239790633320808 H 0.7770838737487793 0.01015500444918871 0.21276117861270905 H 0.04598575085401535 0.7303619980812073 0.024740954861044884 0.007669727783650159 0.0035711419768631467 0.03358839079737663 0.10859853774309157 0.045483484864234924 -79.66336822509766 -16.83028221130371 0.0005483480636030437 S 0.5774647887323944 H 0.028169014084507043 NA NA S 0.5985915492957746 H 0.06338028169014084 NA NA H 0.028169014084507043 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA S 0.014084507042253518 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.5400066750693225e-05 NA NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.5400066750693225e-05 1 143340 NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA V950G NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA b 0.034091025590896606 5.239790633320808 H 0.7770838737487793 0.01015500444918871 0.21276117861270905 H 0.04598575085401535 0.7303619980812073 0.024740954861044884 0.007669727783650159 0.0035711419768631467 0.03358839079737663 0.10859853774309157 0.045483484864234924 -79.66336822509766 -16.83028221130371 0.0005483480636030437 S 0.5774647887323944 H 0.028169014084507043 NA NA S 0.5985915492957746 H 0.06338028169014084 NA NA H 0.028169014084507043 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA S 0.014084507042253518 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 372774 conflict 1 7.971560080477502e-06 9.10035497356888e-06 7.971560080477502e-06 9.10035497356888e-06 2 250892 NA NA NA NA gTg/gGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V950M NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|42 NA NA NA NA b 0.034091025590896606 5.239790633320808 H 0.7770838737487793 0.01015500444918871 0.21276117861270905 H 0.04598575085401535 0.7303619980812073 0.024740954861044884 0.007669727783650159 0.0035711419768631467 0.03358839079737663 0.10859853774309157 0.045483484864234924 -79.66336822509766 -16.83028221130371 0.0005483480636030437 S 0.5774647887323944 H 0.028169014084507043 NA NA S 0.5985915492957746 H 0.06338028169014084 NA NA H 0.028169014084507043 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA NA NA S 0.014084507042253518 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.035211267605633804 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2971 pathogenic 2 1.268331135903384e-05 1.7743137229890828e-05 1.1957099559367634e-05 9.302802166237013e-06 3 250896 1.3954600035503974e-05 1.5108831543656635e-05 2 143322 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA K951E NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4972799420356751 102.29048407673835 C 0.14676740765571594 0.018118727952241898 0.8351138234138489 T 0.0847533717751503 0.13923443853855133 0.0021390162874013186 0.01250974740833044 0.012309860438108444 0.17007781565189362 0.31660735607147217 0.262368381023407 -77.3438720703125 49.37668991088867 0.0006194240995682776 - 0.36585365853658536 S 0.3414634146341464 NA NA - 0.3560975609756097 S 0.32195121951219513 NA NA - 0.2682926829268293 NA NA S 0.24878048780487805 - 0.23902439024390246 NA NA NA NA NA NA - 0.3121951219512195 NA NA S 0.3121951219512195 S 0.3609756097560976 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9848300730227484e-06 8.842944365845781e-06 3.9848300730227484e-06 8.842944365845781e-06 1 250952 NA NA NA NA Aag/Gag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K951Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4972799420356751 102.29048407673835 C 0.14676740765571594 0.018118727952241898 0.8351138234138489 T 0.0847533717751503 0.13923443853855133 0.0021390162874013186 0.01250974740833044 0.012309860438108444 0.17007781565189362 0.31660735607147217 0.262368381023407 -77.3438720703125 49.37668991088867 0.0006194240995682776 - 0.36585365853658536 S 0.3414634146341464 NA NA - 0.3560975609756097 S 0.32195121951219513 NA NA - 0.2682926829268293 NA NA S 0.24878048780487805 - 0.23902439024390246 NA NA NA NA NA NA - 0.3121951219512195 NA NA S 0.3121951219512195 S 0.3609756097560976 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 594928 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA Q953L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|11 NA NA NA e 0.3230997920036316 57.7056228518486 C 0.23036789894104004 0.015409383922815325 0.7542226910591125 C 0.2243545204401016 0.06474457681179048 0.0006315418868325653 0.0119736660271883 0.008788417093455791 0.15997657179832458 0.1219298169016838 0.40760093927383423 -96.2366180419922 81.24041748046875 0.0013052765280008314 - 0.4292929292929293 T 0.4444444444444444 NA NA - 0.4090909090909091 G 0.3686868686868687 NA NA G 0.6565656565656566 NA NA T 0.5757575757575758 T 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA S 0.5707070707070707 NA NA T 0.3787878787878788 T 0.5707070707070707 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.982379894296173e-06 9.190088097578537e-06 3.982379894296173e-06 9.190088097578537e-06 1 251106 NA NA NA NA cAg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q953R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|11 NA NA NA e 0.3230997920036316 57.7056228518486 C 0.23036789894104004 0.015409383922815325 0.7542226910591125 C 0.2243545204401016 0.06474457681179048 0.0006315418868325653 0.0119736660271883 0.008788417093455791 0.15997657179832458 0.1219298169016838 0.40760093927383423 -96.2366180419922 81.24041748046875 0.0013052765280008314 - 0.4292929292929293 T 0.4444444444444444 NA NA - 0.4090909090909091 G 0.3686868686868687 NA NA G 0.6565656565656566 NA NA T 0.5757575757575758 T 0.2828282828282828 NA NA NA NA NA NA S 0.5707070707070707 NA NA T 0.3787878787878788 T 0.5707070707070707 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.982379894296173e-06 7.860602139894402e-06 3.982379894296173e-06 7.860602139894402e-06 1 251106 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S954L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|11 NA NA NA e 0.5902016162872314 69.17162942886354 C 0.2156003117561341 0.008229286409914494 0.7761704325675964 T 0.18179111182689667 0.04449541121721269 0.0005003605037927628 0.002339101629331708 0.004005910363048315 0.1987779140472412 0.448523074388504 0.11956708878278732 -72.42664337158203 -16.257118225097653 0.0015008713817223909 E 0.4846153846153846 T 0.3307692307692308 NA NA E 0.4846153846153846 G 0.13846153846153847 NA NA G 0.2076923076923077 NA NA T 0.5 T 0.25384615384615383 NA NA NA NA NA NA S 0.25384615384615383 NA NA T 0.3384615384615385 T 0.3307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 181457 pathogenic 2 8.366507909086193e-05 1.6261568033857424e-05 7.566650310764089e-05 7.628395508797391e-06 19 251102 9.767810115590692e-05 1.4361273511814102e-05 14 143328 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA S955F NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4251701235771179 49.82993848323822 C 0.14296461641788485 0.02602146752178669 0.8310138583183289 T 0.11336561292409895 0.034071963280439384 0.0004000152403023094 0.0031903511844575405 0.013792142271995544 0.13387009501457214 0.5858230590820312 0.11548668891191485 -81.5003433227539 -6.5741353034973145 0.0026083034463226795 E 0.5923076923076923 - 0.3384615384615385 NA NA E 0.5769230769230769 - 0.6076923076923076 NA NA S 0.4153846153846154 NA NA - 0.4307692307692308 - 0.2076923076923077 NA NA NA NA NA NA T 0.4384615384615385 NA NA - 0.4153846153846154 - 0.3307692307692308 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3949499589216431e-05 1.4970018735417452e-05 NA NA NA NA 1.3949499589216431e-05 1.4970018735417452e-05 2 143374 NA tCt/tTt NA 0 NA NA NA NA NA NA R958* NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.3548387096774194 E 0.07258064516129033 NA NA - 0.3709677419354839 E 0.18548387096774194 NA NA E 0.05241935483870968 NA NA E 0.10887096774193547 - 0.10483870967741936 NA NA NA NA NA NA E 0.2903225806451613 NA NA - 0.14516129032258066 E 0.15725806451612906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 287837 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R958Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|29 NA NA NA NA NA e 0.31397396326065063 71.900037586689 E 0.002122741192579269 0.9365536570549012 0.0613236166536808 E 0.0011922838166356089 0.000660626741591841 2.6655878173187368e-05 0.0162609051913023 0.9230780005455016 0.01052328385412693 0.002188533078879118 0.04606975242495537 -118.98871612548828 137.84820556640622 0.0009983991039916873 - 0.3548387096774194 E 0.07258064516129033 NA NA - 0.3709677419354839 E 0.18548387096774194 NA NA E 0.05241935483870968 NA NA E 0.10887096774193547 - 0.10483870967741936 NA NA NA NA NA NA E 0.2903225806451613 NA NA - 0.14516129032258066 E 0.15725806451612906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.592499938851688e-05 9.551982119545295e-06 1.592499938851688e-05 9.551982119545295e-06 4 251178 NA NA NA NA cGa/cAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N961D NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|15 NA NA NA NA TURN|12 NA NA NA e 0.25214883685112 36.91458971500397 C 0.00718903262168169 0.3723744451999664 0.6204364895820618 E 0.0056141153909266 0.0035906408447772264 0.00010789842781377956 0.03061146847903728 0.3883340060710907 0.1284405142068863 0.10139894485473633 0.3419024646282196 -103.25096893310548 153.45652770996094 0.002764130476862192 NA NA T 0.6242038216560509 NA NA NA NA T 0.7452229299363057 NA NA T 0.6496815286624203 NA NA T 0.6687898089171974 T 0.6687898089171974 NA NA NA NA NA NA S 0.7261146496815286 NA NA T 0.7133757961783439 T 0.7579617834394905 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981020199717023e-06 8.866752814612858e-06 3.981020199717023e-06 8.866752814612858e-06 1 251192 NA NA NA NA Aat/Gat NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N961S NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|15 NA NA NA NA TURN|12 NA NA NA e 0.25214883685112 36.91458971500397 C 0.00718903262168169 0.3723744451999664 0.6204364895820618 E 0.0056141153909266 0.0035906408447772264 0.00010789842781377956 0.03061146847903728 0.3883340060710907 0.1284405142068863 0.10139894485473633 0.3419024646282196 -103.25096893310548 153.45652770996094 0.002764130476862192 NA NA T 0.6242038216560509 NA NA NA NA T 0.7452229299363057 NA NA T 0.6496815286624203 NA NA T 0.6687898089171974 T 0.6687898089171974 NA NA NA NA NA NA S 0.7261146496815286 NA NA T 0.7133757961783439 T 0.7579617834394905 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 252475 conflict 1 0.001797000785862638 1.7326286846948724e-05 0.0008479100069962442 9.1220317473821e-06 213 251206 0.0034602999221533537 1.4730538099557033e-05 496 143340 aAt/aGt aAt/aGt 0 6 NA NA NA NA NA NA I962V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|12 NA NA NA b 0.2043015956878662 37.79579520225525 C 0.05118152126669884 0.05375479906797409 0.8950636386871338 T 0.02741437964141369 0.012544220313429829 0.0003421864239498973 0.0039115608669817465 0.027019580826163292 0.14662742614746094 0.6832229495048523 0.09891770035028458 -79.67444610595703 -24.51697540283203 0.002261128043755889 NA NA T 0.8994082840236687 NA NA NA NA T 0.9171597633136096 NA NA T 0.7928994082840237 NA NA T 0.8816568047337278 T 0.863905325443787 NA NA NA NA NA NA S 0.8106508875739645 NA NA T 0.8875739644970414 T 0.8816568047337278 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9808001019991934e-06 8.912563844164808e-06 3.9808001019991934e-06 8.912563844164808e-06 1 251206 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q965* NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.6313131313131313 NA NA NA NA - 0.6818181818181818 NA NA - 0.7222222222222222 NA NA - 0.6313131313131313 - 0.6919191919191919 NA NA NA NA NA NA - 0.6818181818181818 NA NA - 0.6414141414141414 - 0.6565656565656566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 188956 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA F966V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.12842288613319394 25.77447324693203 C 0.3158226907253265 0.3089965879917145 0.3751806914806366 E 0.08852693438529967 0.19237732887268064 0.011371073313057423 0.09340973943471907 0.211824119091034 0.10837060958147048 0.1335967183113098 0.1605234295129776 -90.27301788330078 37.16815185546875 0.0031648115254938602 NA NA B 0.2284263959390863 NA NA NA NA E 0.2284263959390863 NA NA E 0.2588832487309645 NA NA B 0.2639593908629442 B 0.2284263959390863 NA NA NA NA NA NA B 0.2385786802030457 NA NA B 0.2385786802030457 B 0.27411167512690354 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.65 0.0 0.0 0.65 0.0 2896T>G N968S NA NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|16 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.35893362760543823 52.547883081436154 C 0.08361629396677017 0.13885028660297394 0.7775334119796753 C 0.030079942196607583 0.04604507237672807 0.001236814190633595 0.04037678241729736 0.10930889844894408 0.10656630992889404 0.10592005401849748 0.5604661703109741 -85.2051010131836 98.65235900878906 0.00472753681242466 NA NA - 0.3630573248407643 NA NA NA NA - 0.4713375796178344 NA NA - 0.37579617834394907 NA NA - 0.4203821656050956 - 0.37579617834394907 NA NA NA NA NA NA - 0.5605095541401274 NA NA - 0.3885350318471338 - 0.4076433121019109 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 554989 VUS 1 3.043077602900603e-05 1.8778793571951376e-05 1.991749923035968e-05 9.906667663500873e-06 5 251036 4.8847901780391105e-05 1.595308822212516e-05 7 143302 aAt/aGt aAt/aGt 0 0 NA NA NA NA NA NA S970L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|30 NA NA NA NA NA e 0.4870295524597168 57.07986354827881 C 0.28653135895729065 0.04370901733636856 0.6697596311569214 T 0.24915267527103424 0.07770299911499022 0.0013824348570778964 0.016710281372070312 0.02535623125731945 0.10157805681228638 0.3224708735942841 0.2056464105844497 -88.23705291748047 4.541683197021484 0.010093679651618004 NA NA S 0.4461538461538462 NA NA NA NA T 0.4692307692307692 NA NA S 0.5846153846153846 NA NA S 0.38461538461538464 S 0.6153846153846154 NA NA NA NA NA NA T 0.4076923076923077 NA NA S 0.4615384615384616 S 0.4461538461538462 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.98637985199457e-06 7.4381806629111285e-06 3.98637985199457e-06 7.4381806629111285e-06 1 250854 NA NA NA NA tCa/tTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V971= NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|30 NA NA NA NA NA e 0.3646762669086456 56.050742223858826 C 0.18403582274913788 0.04565497860312462 0.7703092098236084 C 0.10929156094789504 0.06171181797981262 0.0023211499210447073 0.018586266785860055 0.03069465607404709 0.25815019011497503 0.17261730134487152 0.3466269969940185 -81.8818588256836 27.09821319580078 0.009536338038742542 NA NA S 0.3873239436619718 NA NA NA NA S 0.4577464788732394 NA NA S 0.4154929577464789 NA NA S 0.4225352112676056 S 0.3380281690140845 NA NA NA NA NA NA - 0.4507042253521127 NA NA S 0.471830985915493 S 0.323943661971831 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.93 0.93 0.0 0.0 0.0 2913G>A V971L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|30 NA NA NA NA NA e 0.3646762669086456 56.050742223858826 C 0.18403582274913788 0.04565497860312462 0.7703092098236084 C 0.10929156094789504 0.06171181797981262 0.0023211499210447073 0.018586266785860055 0.03069465607404709 0.25815019011497503 0.17261730134487152 0.3466269969940185 -81.8818588256836 27.09821319580078 0.009536338038742542 NA NA S 0.3873239436619718 NA NA NA NA S 0.4577464788732394 NA NA S 0.4154929577464789 NA NA S 0.4225352112676056 S 0.3380281690140845 NA NA NA NA NA NA - 0.4507042253521127 NA NA S 0.471830985915493 S 0.323943661971831 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.42 0.0 0.0 0.03 0.42 2911G>T V972D NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5064476728439331 77.84100731611252 C 0.07203158736228943 0.03538690507411957 0.8925815224647522 C 0.02500450797379017 0.03648365288972855 0.0010083847446367145 0.019129505380988118 0.022261783480644226 0.3321143984794617 0.13988415896892548 0.4241136312484741 -87.42017364501953 19.308324813842773 0.01045309379696846 NA NA - 0.9014084507042254 NA NA NA NA - 0.9366197183098592 NA NA - 0.8450704225352113 NA NA - 0.9014084507042254 - 0.852112676056338 NA NA NA NA NA NA - 0.9507042253521126 NA NA - 0.9507042253521126 - 0.8943661971830986 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 2915T>A D973N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3402584195137024 49.0312382519245 C 0.004066156223416328 0.02559520676732064 0.9703387022018432 C 0.0018389708129689093 0.0014415791956707835 6.615910933760461e-06 0.00980891939252615 0.015630748122930527 0.15272925794124606 0.007453985046595334 0.8110898733139038 -92.29271697998048 122.21520233154295 0.00977723952382803 NA NA - 0.6257668711656442 NA NA NA NA - 0.3619631901840491 NA NA - 0.392638036809816 NA NA - 0.5705521472392638 - 0.6012269938650306 NA NA NA NA NA NA - 0.4846625766871165 NA NA - 0.5766871165644172 - 0.5950920245398773 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.38 0.0 0.0 0.0 2917G>A P974S NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6800544857978821 96.49973153471949 C 0.33158907294273376 0.003694056998938322 0.6647169589996338 T 0.18368935585021973 0.061388686299324036 7.71821432863362e-05 0.000406161998398602 0.0012870397185906768 0.03620623052120209 0.6682960987091064 0.04864925891160965 -62.4341926574707 -21.617298126220703 0.009038045071065426 NA NA S 0.6985294117647058 NA NA NA NA S 0.8455882352941176 NA NA S 0.8897058823529411 NA NA S 0.6691176470588235 S 0.6985294117647058 NA NA NA NA NA NA T 0.9705882352941176 NA NA S 0.8161764705882353 S 0.6764705882352942 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.96032963990001e-06 8.641537220554021e-06 7.96032963990001e-06 8.641537220554021e-06 2 251246 NA NA NA NA Cct/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A975= NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4069559872150421 44.84654979109765 C 0.4006905257701874 0.016251085326075554 0.5830584168434143 T 0.2437093406915665 0.10906704515218736 0.0002300702763022855 0.0014293809654191134 0.0066663958132267 0.027927840128541 0.5705127716064453 0.040457092225551605 -75.15380859375 -19.652442932128906 0.0048315972089767465 NA NA S 0.5188679245283019 NA NA NA NA S 0.6509433962264151 NA NA S 0.2735849056603773 NA NA S 0.4716981132075472 S 0.5471698113207547 NA NA NA NA NA NA T 0.18867924528301888 NA NA S 0.6320754716981132 S 0.6698113207547169 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 2925C>T A975V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4069559872150421 44.84654979109765 C 0.4006905257701874 0.016251085326075554 0.5830584168434143 T 0.2437093406915665 0.10906704515218736 0.0002300702763022855 0.0014293809654191134 0.0066663958132267 0.027927840128541 0.5705127716064453 0.040457092225551605 -75.15380859375 -19.652442932128906 0.0048315972089767465 NA NA S 0.5188679245283019 NA NA NA NA S 0.6509433962264151 NA NA S 0.2735849056603773 NA NA S 0.4716981132075472 S 0.5471698113207547 NA NA NA NA NA NA T 0.18867924528301888 NA NA S 0.6320754716981132 S 0.6698113207547169 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 2924C>T C976= NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|15 NA NA NA NA NA NA b 0.07935595512390138 11.141576099395753 C 0.3906634449958801 0.1382046341896057 0.4711319506168366 G 0.3201340436935425 0.11097594350576401 0.0005903206183575094 0.017632266506552696 0.13010938465595245 0.08723088353872299 0.08947883546352386 0.2438483685255051 -87.32817077636719 55.66640090942383 0.0024317558854818344 NA NA - 0.14814814814814814 NA NA NA NA E 0.13333333333333333 NA NA E 0.0962962962962963 NA NA E 0.08888888888888889 - 0.17037037037037034 NA NA NA NA NA NA - 0.13333333333333333 NA NA - 0.07407407407407407 - 0.1037037037037037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.45 0.0 0.0 0.0 2928C>T C976F NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|15 NA NA NA NA NA NA b 0.07935595512390138 11.141576099395753 C 0.3906634449958801 0.1382046341896057 0.4711319506168366 G 0.3201340436935425 0.11097594350576401 0.0005903206183575094 0.017632266506552696 0.13010938465595245 0.08723088353872299 0.08947883546352386 0.2438483685255051 -87.32817077636719 55.66640090942383 0.0024317558854818344 NA NA - 0.14814814814814814 NA NA NA NA E 0.13333333333333333 NA NA E 0.0962962962962963 NA NA E 0.08888888888888889 - 0.17037037037037034 NA NA NA NA NA NA - 0.13333333333333333 NA NA - 0.07407407407407407 - 0.1037037037037037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.45 0.0 0.0 0.0 2927G>T C976G NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|15 NA NA NA NA NA NA b 0.07935595512390138 11.141576099395753 C 0.3906634449958801 0.1382046341896057 0.4711319506168366 G 0.3201340436935425 0.11097594350576401 0.0005903206183575094 0.017632266506552696 0.13010938465595245 0.08723088353872299 0.08947883546352386 0.2438483685255051 -87.32817077636719 55.66640090942383 0.0024317558854818344 NA NA - 0.14814814814814814 NA NA NA NA E 0.13333333333333333 NA NA E 0.0962962962962963 NA NA E 0.08888888888888889 - 0.17037037037037034 NA NA NA NA NA NA - 0.13333333333333333 NA NA - 0.07407407407407407 - 0.1037037037037037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.978990207542665e-06 9.32187185576856e-06 3.978990207542665e-06 9.32187185576856e-06 1 251320 NA NA NA NA Tgc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C976S NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|15 NA NA NA NA NA NA b 0.07935595512390138 11.141576099395753 C 0.3906634449958801 0.1382046341896057 0.4711319506168366 G 0.3201340436935425 0.11097594350576401 0.0005903206183575094 0.017632266506552696 0.13010938465595245 0.08723088353872299 0.08947883546352386 0.2438483685255051 -87.32817077636719 55.66640090942383 0.0024317558854818344 NA NA - 0.14814814814814814 NA NA NA NA E 0.13333333333333333 NA NA E 0.0962962962962963 NA NA E 0.08888888888888889 - 0.17037037037037034 NA NA NA NA NA NA - 0.13333333333333333 NA NA - 0.07407407407407407 - 0.1037037037037037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.38 0.38 0.0 0.0 0.0 2927G>C V977F NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.2981041669845581 45.81861046552658 C 0.19917304813861847 0.3991766571998596 0.4016503095626831 E 0.0844419002532959 0.13018488883972168 0.0013317562406882644 0.03554902225732803 0.34950098395347595 0.05496753379702568 0.06525377929210663 0.2787700891494751 -92.4052276611328 111.88516235351562 0.004541565198451282 NA NA E 0.471830985915493 NA NA NA NA E 0.5 NA NA E 0.4929577464788733 NA NA E 0.4154929577464789 B 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA E 0.5985915492957746 NA NA B 0.5492957746478874 E 0.4154929577464789 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 2929G>T V977I NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.2981041669845581 45.81861046552658 C 0.19917304813861847 0.3991766571998596 0.4016503095626831 E 0.0844419002532959 0.13018488883972168 0.0013317562406882644 0.03554902225732803 0.34950098395347595 0.05496753379702568 0.06525377929210663 0.2787700891494751 -92.4052276611328 111.88516235351562 0.004541565198451282 NA NA E 0.471830985915493 NA NA NA NA E 0.5 NA NA E 0.4929577464788733 NA NA E 0.4154929577464789 B 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA E 0.5985915492957746 NA NA B 0.5492957746478874 E 0.4154929577464789 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.0273503970981023e-05 1.917503921220726e-05 1.9895000150427226e-05 9.786289435928332e-06 5 251320 2.093739931297023e-05 1.648971400194447e-05 3 143284 Gtt/Att Gtt/Att 0 0 NA NA NA NA NA NA V977L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.2981041669845581 45.81861046552658 C 0.19917304813861847 0.3991766571998596 0.4016503095626831 E 0.0844419002532959 0.13018488883972168 0.0013317562406882644 0.03554902225732803 0.34950098395347595 0.05496753379702568 0.06525377929210663 0.2787700891494751 -92.4052276611328 111.88516235351562 0.004541565198451282 NA NA E 0.471830985915493 NA NA NA NA E 0.5 NA NA E 0.4929577464788733 NA NA E 0.4154929577464789 B 0.4366197183098591 NA NA NA NA NA NA E 0.5985915492957746 NA NA B 0.5492957746478874 E 0.4154929577464789 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.0 0.0 0.0 2929G>C R978= NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.4909296929836273 112.42289969325066 C 0.19285230338573456 0.38403475284576416 0.4231129288673401 E 0.07371009886264801 0.13574624061584473 0.0009618150652386248 0.05263031646609306 0.3536132574081421 0.04648339003324509 0.093514546751976 0.243340328335762 -87.79954528808594 110.57662200927734 0.005262504331767559 NA NA E 0.32661290322580644 NA NA NA NA E 0.25 NA NA E 0.4032258064516129 NA NA E 0.3024193548387097 - 0.2620967741935484 NA NA NA NA NA NA E 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 E 0.27419354838709675 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.16 0.0 0.0 2934C>T R978C NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.4909296929836273 112.42289969325066 C 0.19285230338573456 0.38403475284576416 0.4231129288673401 E 0.07371009886264801 0.13574624061584473 0.0009618150652386248 0.05263031646609306 0.3536132574081421 0.04648339003324509 0.093514546751976 0.243340328335762 -87.79954528808594 110.57662200927734 0.005262504331767559 NA NA E 0.32661290322580644 NA NA NA NA E 0.25 NA NA E 0.4032258064516129 NA NA E 0.3024193548387097 - 0.2620967741935484 NA NA NA NA NA NA E 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 E 0.27419354838709675 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2976 pathogenic 2 1.193570005852962e-05 9.71328673863145e-06 1.193570005852962e-05 9.71328673863145e-06 3 251346 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 2932C>T R978H NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.4909296929836273 112.42289969325066 C 0.19285230338573456 0.38403475284576416 0.4231129288673401 E 0.07371009886264801 0.13574624061584473 0.0009618150652386248 0.05263031646609306 0.3536132574081421 0.04648339003324509 0.093514546751976 0.243340328335762 -87.79954528808594 110.57662200927734 0.005262504331767559 NA NA E 0.32661290322580644 NA NA NA NA E 0.25 NA NA E 0.4032258064516129 NA NA E 0.3024193548387097 - 0.2620967741935484 NA NA NA NA NA NA E 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 E 0.27419354838709675 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.5204102697609415e-05 1.840138600730333e-05 1.591520049259998e-05 7.227463213456053e-06 4 251332 1.3956900147604754e-05 1.6922611574101625e-05 2 143298 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 2933G>A R978L NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.4909296929836273 112.42289969325066 C 0.19285230338573456 0.38403475284576416 0.4231129288673401 E 0.07371009886264801 0.13574624061584473 0.0009618150652386248 0.05263031646609306 0.3536132574081421 0.04648339003324509 0.093514546751976 0.243340328335762 -87.79954528808594 110.57662200927734 0.005262504331767559 NA NA E 0.32661290322580644 NA NA NA NA E 0.25 NA NA E 0.4032258064516129 NA NA E 0.3024193548387097 - 0.2620967741935484 NA NA NA NA NA NA E 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 E 0.27419354838709675 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 2933G>T R978P NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|31 NA NA NA NA NA e 0.4909296929836273 112.42289969325066 C 0.19285230338573456 0.38403475284576416 0.4231129288673401 E 0.07371009886264801 0.13574624061584473 0.0009618150652386248 0.05263031646609306 0.3536132574081421 0.04648339003324509 0.093514546751976 0.243340328335762 -87.79954528808594 110.57662200927734 0.005262504331767559 NA NA E 0.32661290322580644 NA NA NA NA E 0.25 NA NA E 0.4032258064516129 NA NA E 0.3024193548387097 - 0.2620967741935484 NA NA NA NA NA NA E 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 E 0.27419354838709675 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.45 0.0 0.0 0.0 2933G>C P981A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2836732566356659 40.25323511660099 C 0.02781719155609608 0.22445222735404968 0.7477306127548218 C 0.0206761434674263 0.011437595821917057 0.00020265764032956207 0.05437995120882988 0.1875750869512558 0.08097164332866669 0.1231594979763031 0.5215973854064941 -66.77145385742189 137.40444946289062 0.011267470195889471 NA NA - 0.4779411764705882 NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.4705882352941176 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.5073529411764706 NA NA NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.4852941176470588 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.01 0.0 0.0 2941C>G P981L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2836732566356659 40.25323511660099 C 0.02781719155609608 0.22445222735404968 0.7477306127548218 C 0.0206761434674263 0.011437595821917057 0.00020265764032956207 0.05437995120882988 0.1875750869512558 0.08097164332866669 0.1231594979763031 0.5215973854064941 -66.77145385742189 137.40444946289062 0.011267470195889471 NA NA - 0.4779411764705882 NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.4705882352941176 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.5073529411764706 NA NA NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.4852941176470588 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 597245 VUS 1 7.600581650235077e-06 1.7355838087099396e-05 3.977630058216164e-06 8.604907717183039e-06 1 251406 1.3956700058770364e-05 1.5072514020042373e-05 2 143300 cCt/cTt cCt/cTt 0 0 NA NA NA NA NA NA P981S NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2836732566356659 40.25323511660099 C 0.02781719155609608 0.22445222735404968 0.7477306127548218 C 0.0206761434674263 0.011437595821917057 0.00020265764032956207 0.05437995120882988 0.1875750869512558 0.08097164332866669 0.1231594979763031 0.5215973854064941 -66.77145385742189 137.40444946289062 0.011267470195889471 NA NA - 0.4779411764705882 NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.4705882352941176 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.5073529411764706 NA NA NA NA NA NA - 0.5147058823529411 NA NA - 0.5220588235294118 - 0.4852941176470588 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.46 0.46 0.04 0.0 0.0 2941C>T P984L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|43 NA NA NA NA e 0.5787680149078369 82.12718131542206 C 0.17612692713737488 0.01078854687511921 0.8130845427513123 T 0.12528227269649506 0.04572170600295067 0.00014918926171958447 0.0023662520106881857 0.008330335840582848 0.10728488862514496 0.3918969631195069 0.31896835565567017 -62.83552169799805 -27.48528480529785 0.03831014409661293 - 0.35294117647058826 H 0.8602941176470589 NA NA - 0.35294117647058826 T 0.7058823529411765 NA NA T 0.7720588235294118 NA NA H 0.7426470588235294 H 0.6985294117647058 NA NA NA NA NA NA T 0.7279411764705882 NA NA T 0.7941176470588235 T 0.7941176470588235 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 966848 VUS 1 1.9887500457116406e-05 9.077882210722863e-06 1.9887500457116406e-05 9.077882210722863e-06 5 251414 NA NA NA NA cCg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E985D NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|43 NA NA NA NA e 0.7540904879570007 131.739608246088 C 0.2313397526741028 0.006160540506243707 0.7624997496604919 T 0.1424703747034073 0.049071718007326126 0.00012617163883987814 0.002858165884390473 0.002587439958006144 0.07596158236265182 0.6302458047866821 0.09667880833148956 -70.03140258789061 0.3580578863620758 0.06293213367462157 - 0.3556701030927835 H 0.6752577319587629 NA NA - 0.3556701030927835 T 0.711340206185567 NA NA T 0.788659793814433 NA NA H 0.6546391752577321 H 0.8144329896907216 NA NA NA NA NA NA T 0.7680412371134021 NA NA T 0.5463917525773195 T 0.6134020618556701 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977089818363311e-06 7.716734320250526e-06 3.977089818363311e-06 7.716734320250526e-06 1 251440 NA NA NA NA gaA/gaT NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E985Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|43 NA NA NA NA e 0.7540904879570007 131.739608246088 C 0.2313397526741028 0.006160540506243707 0.7624997496604919 T 0.1424703747034073 0.049071718007326126 0.00012617163883987814 0.002858165884390473 0.002587439958006144 0.07596158236265182 0.6302458047866821 0.09667880833148956 -70.03140258789061 0.3580578863620758 0.06293213367462157 - 0.3556701030927835 H 0.6752577319587629 NA NA - 0.3556701030927835 T 0.711340206185567 NA NA T 0.788659793814433 NA NA H 0.6546391752577321 H 0.8144329896907216 NA NA NA NA NA NA T 0.7680412371134021 NA NA T 0.5463917525773195 T 0.6134020618556701 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5491063623255208e-05 NA NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5491063623255208e-05 1 143306 NA Gaa/Caa NA 0 NA NA NA NA NA NA G986S NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|43 NA NA NA NA e 0.394736647605896 31.06577416658401 C 0.3840520977973938 0.013755159452557564 0.602192759513855 G 0.3325647711753845 0.04880710691213608 0.00038910823059268296 0.006779659073799849 0.008957370184361935 0.1888847053050995 0.17788633704185486 0.2357308715581894 45.71050262451172 -14.098698616027832 0.05457279831171037 S 0.2857142857142857 H 0.011904761904761904 NA NA S 0.27380952380952384 T 0.14285714285714285 NA NA T 0.03571428571428571 NA NA H 0.023809523809523808 H 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA T 0.03571428571428571 NA NA T 0.0 T 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1931199878745247e-05 9.26694279618468e-06 1.1931199878745247e-05 9.26694279618468e-06 3 251442 NA NA NA NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K987Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|43 NA NA NA NA e 0.4847458302974701 99.71221729218959 C 0.22357502579689026 0.03965358808636665 0.7367714047431946 C 0.11732972413301468 0.0726376548409462 0.0011175292311236262 0.0280293133109808 0.027218524366617203 0.15827210247516632 0.1545504778623581 0.4408446550369263 -78.28585815429688 5.7574543952941895 0.04395797848701477 S 0.4341463414634146 H 0.2731707317073171 NA NA S 0.4341463414634146 T 0.3073170731707317 NA NA T 0.5170731707317073 NA NA H 0.2634146341463415 H 0.3463414634146341 NA NA NA NA NA NA S 0.4926829268292683 NA NA T 0.24878048780487805 T 0.25365853658536586 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.2666295202769165e-05 1.942931333546978e-05 3.976870175392833e-06 9.159421599424126e-06 1 251454 2.791460065054707e-05 1.7134853738852473e-05 4 143294 Aaa/Caa Aaa/Caa 0 0 NA NA NA NA NA NA Q991H NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5638163089752197 100.69759278297424 C 0.020588204264640808 0.04908047616481781 0.9303313493728638 C 0.007681465707719327 0.01133852917701006 0.00021997118892613798 0.04487249627709389 0.028846913948655125 0.103046715259552 0.059150490909814835 0.7448434829711914 -92.8339614868164 145.1177520751953 0.0140329422429204 H 0.31313131313131315 - 0.5202020202020202 NA NA H 0.3282828282828283 - 0.4444444444444444 NA NA - 0.5454545454545454 NA NA - 0.5404040404040404 - 0.404040404040404 NA NA NA NA NA NA - 0.5656565656565656 NA NA - 0.5303030303030303 - 0.5151515151515151 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.292741417665647e-05 2.355574283108869e-05 1.5905960026429966e-05 1.1955229510179636e-05 2,2 251478,251478 6.279221042859717e-05 2.0296440763920076e-05 1,8 143330,143330 caG/caT,caG/caC caG/caT,caG/caC 0,0 0,0 NA NA NA NA NA NA G992A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3650572001934052 28.730001655220985 C 0.4239560961723328 0.008544768206775187 0.5674991011619568 T 0.117823489010334 0.2535018026828766 0.004899471532553434 0.0034916142467409372 0.004956218414008617 0.1653318852186203 0.27432799339294434 0.17566755414009094 -40.94990158081055 -46.5347900390625 0.011387339793145657 H 0.5595238095238095 S 0.3928571428571429 NA NA H 0.5714285714285714 S 0.5595238095238095 NA NA S 0.4404761904761905 NA NA S 0.30952380952380953 S 0.4880952380952381 NA NA NA NA NA NA T 0.27380952380952384 NA NA S 0.3928571428571429 S 0.3690476190476191 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976490006607492e-06 7.853705026364096e-06 3.976490006607492e-06 7.853705026364096e-06 1 251478 NA NA NA NA gGg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G992R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3650572001934052 28.730001655220985 C 0.4239560961723328 0.008544768206775187 0.5674991011619568 T 0.117823489010334 0.2535018026828766 0.004899471532553434 0.0034916142467409372 0.004956218414008617 0.1653318852186203 0.27432799339294434 0.17566755414009094 -40.94990158081055 -46.5347900390625 0.011387339793145657 H 0.5595238095238095 S 0.3928571428571429 NA NA H 0.5714285714285714 S 0.5595238095238095 NA NA S 0.4404761904761905 NA NA S 0.30952380952380953 S 0.4880952380952381 NA NA NA NA NA NA T 0.27380952380952384 NA NA S 0.3928571428571429 S 0.3690476190476191 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2969,21137 pathogenic 2,2 5.826034627154315e-05 2.5444418306309132e-05 6.362239946611226e-05 1.291334236658762e-05 12,4 251484,251484 4.8849960876395926e-05 2.1924050991313916e-05 6,1 143296,143296 Ggg/Cgg,Ggg/Agg Ggg/Cgg,Ggg/Agg 0,0 0,0 NA NA NA NA NA NA G992W NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3650572001934052 28.730001655220985 C 0.4239560961723328 0.008544768206775187 0.5674991011619568 T 0.117823489010334 0.2535018026828766 0.004899471532553434 0.0034916142467409372 0.004956218414008617 0.1653318852186203 0.27432799339294434 0.17566755414009094 -40.94990158081055 -46.5347900390625 0.011387339793145657 H 0.5595238095238095 S 0.3928571428571429 NA NA H 0.5714285714285714 S 0.5595238095238095 NA NA S 0.4404761904761905 NA NA S 0.30952380952380953 S 0.4880952380952381 NA NA NA NA NA NA T 0.27380952380952384 NA NA S 0.3928571428571429 S 0.3690476190476191 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2960 conflict 1 1.7731398453627874e-05 1.8801648616417088e-05 1.988199983316008e-05 9.31639430825658e-06 5 251484 1.3957100236439144e-05 1.6331160025800465e-05 2 143296 Ggg/Tgg Ggg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA G993E NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|44 NA NA NA NA e 0.3771324753761292 29.68032581210137 C 0.4848513901233673 0.007723406422883272 0.5074252486228943 H 0.09366798400878906 0.3493972718715668 0.005505685694515705 0.0027652331627905373 0.004793951287865639 0.1171598881483078 0.2877078950405121 0.13900209963321686 -56.21263122558594 -35.59989929199219 0.008643634617328644 H 0.5714285714285714 H 0.6666666666666666 NA NA H 0.5952380952380952 T 0.6428571428571429 NA NA T 0.6666666666666666 NA NA H 0.5833333333333334 H 0.75 NA NA NA NA NA NA H 0.7023809523809523 NA NA T 0.6785714285714286 H 0.6309523809523809 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953420208650641e-06 8.941766522307348e-06 7.953420208650641e-06 8.941766522307348e-06 2 251464 NA NA NA NA gGa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M996I NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|44 NA NA NA NA b 0.2356804609298706 47.1596602320671 H 0.9420754313468932 0.0018458550330251453 0.05607869476079942 H 0.18893170356750488 0.7190398573875427 0.007130693644285201 0.00045875870273448527 0.0009446098702028397 0.004547656048089266 0.07044251263141632 0.008504189550876617 -65.75157928466797 -32.09188461303711 0.0007814777200110258 - 0.4414893617021277 H 0.09042553191489362 NA NA - 0.44680851063829785 H 0.10638297872340426 NA NA H 0.07446808510638298 NA NA H 0.16489361702127658 H 0.11702127659574467 NA NA NA NA NA NA H 0.12234042553191488 NA NA H 0.10106382978723404 H 0.13829787234042554 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.5448574839038158e-05 NA NA NA NA 6.978370038268622e-06 1.5448574839038158e-05 1 143300 NA atG/atA NA 0 NA NA NA NA NA NA M996L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|44 NA NA NA NA b 0.2356804609298706 47.1596602320671 H 0.9420754313468932 0.0018458550330251453 0.05607869476079942 H 0.18893170356750488 0.7190398573875427 0.007130693644285201 0.00045875870273448527 0.0009446098702028397 0.004547656048089266 0.07044251263141632 0.008504189550876617 -65.75157928466797 -32.09188461303711 0.0007814777200110258 - 0.4414893617021277 H 0.09042553191489362 NA NA - 0.44680851063829785 H 0.10638297872340426 NA NA H 0.07446808510638298 NA NA H 0.16489361702127658 H 0.11702127659574467 NA NA NA NA NA NA H 0.12234042553191488 NA NA H 0.10106382978723404 H 0.13829787234042554 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1929199899896048e-05 8.859264979030542e-06 1.1929199899896048e-05 8.859264979030542e-06 3 251484 NA NA NA NA Atg/Ctg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M996R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|44 NA NA NA NA b 0.2356804609298706 47.1596602320671 H 0.9420754313468932 0.0018458550330251453 0.05607869476079942 H 0.18893170356750488 0.7190398573875427 0.007130693644285201 0.00045875870273448527 0.0009446098702028397 0.004547656048089266 0.07044251263141632 0.008504189550876617 -65.75157928466797 -32.09188461303711 0.0007814777200110258 - 0.4414893617021277 H 0.09042553191489362 NA NA - 0.44680851063829785 H 0.10638297872340426 NA NA H 0.07446808510638298 NA NA H 0.16489361702127658 H 0.11702127659574467 NA NA NA NA NA NA H 0.12234042553191488 NA NA H 0.10106382978723404 H 0.13829787234042554 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 554174 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S1004L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|44 NA NA NA NA e 0.4452493488788605 52.18322368860246 C 0.3540371358394623 0.017960194498300552 0.6280027031898499 H 0.03691435605287552 0.3285559713840485 0.018630260601639748 0.012453573755919932 0.008431744761765003 0.16442294418811798 0.2678365409374237 0.16275466978549954 -87.91960906982422 -13.033926010131836 0.005519208498299122 H 0.4 H 0.5153846153846153 NA NA H 0.3923076923076923 T 0.676923076923077 NA NA H 0.4153846153846154 NA NA H 0.6 T 0.5692307692307692 NA NA NA NA NA NA T 0.4 NA NA T 0.5384615384615384 H 0.676923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 326253 conflict 1 0.0006687914734397512 1.9287886245468343e-05 0.0006839350098744035 1.0218126107671415e-05 172 251486 0.0006422069855034351 1.6358864712010134e-05 92 143256 tCg/tTg tCg/tTg 0 0 NA NA NA NA NA NA P1007A NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3230123817920685 45.83545697629453 C 0.003411163575947285 0.05968869477510452 0.9369001984596252 C 0.002227082382887602 0.0011118111433461306 7.885669037932529e-05 0.024897295981645584 0.04937946423888207 0.23049452900886536 0.07003675401210785 0.6217741966247559 -70.90255737304688 61.55649185180664 0.00607670983299613 - 0.35294117647058826 - 0.2058823529411765 NA NA - 0.34558823529411764 - 0.19117647058823528 NA NA - 0.25735294117647056 NA NA - 0.16176470588235295 - 0.19117647058823528 NA NA NA NA NA NA - 0.16176470588235295 NA NA - 0.1323529411764706 - 0.19117647058823528 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2966 conflict 1 0.00015454202071731382 1.8356600023596318e-05 0.00012326499563641846 1.0074195851036693e-05 31 251490 0.00020946199947502464 1.5345205843560763e-05 30 143224 Cct/Gct Cct/Gct 0 0 NA NA NA NA NA NA P1007L NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3230123817920685 45.83545697629453 C 0.003411163575947285 0.05968869477510452 0.9369001984596252 C 0.002227082382887602 0.0011118111433461306 7.885669037932529e-05 0.024897295981645584 0.04937946423888207 0.23049452900886536 0.07003675401210785 0.6217741966247559 -70.90255737304688 61.55649185180664 0.00607670983299613 - 0.35294117647058826 - 0.2058823529411765 NA NA - 0.34558823529411764 - 0.19117647058823528 NA NA - 0.25735294117647056 NA NA - 0.16176470588235295 - 0.19117647058823528 NA NA NA NA NA NA - 0.16176470588235295 NA NA - 0.1323529411764706 - 0.19117647058823528 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 973559 pathogenic 1 3.976399966632016e-06 9.417834732165055e-06 3.976399966632016e-06 9.417834732165055e-06 1 251484 NA NA NA NA cCt/cTt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P1009R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|13 NA NA NA e 0.5727911591529846 81.27906548380852 C 0.3261859714984894 0.006386422086507082 0.6674275994300842 T 0.19640523195266724 0.07460081577301025 0.0004136278585065156 0.0011584404855966568 0.002684126375243068 0.06403109431266785 0.5729331970214844 0.08777354657649994 -62.29979705810547 -23.7680778503418 0.015259996056556703 S 0.22794117647058826 T 0.6985294117647058 NA NA S 0.21323529411764705 T 0.7058823529411765 NA NA T 0.7132352941176471 NA NA T 0.6911764705882353 T 0.6691176470588235 NA NA NA NA NA NA T 0.6764705882352942 NA NA T 0.7132352941176471 T 0.6617647058823529 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.983630100876326e-06 1.472664406998941e-05 NA NA NA NA 6.983630100876326e-06 1.472664406998941e-05 1 143192 NA cCc/cGc NA 0 NA NA NA NA NA NA C1011S NA NA Lumenal|5 NA NA DISULFID|13 NA NA TURN|13 NA NA NA b 0.12229207158088685 17.16980684995651 C 0.19998757541179651 0.031943801790475845 0.7680686116218567 C 0.20291438698768616 0.06012527272105218 0.00035512499744072556 0.022359797731041908 0.017991745844483376 0.2058696299791336 0.17465563118457794 0.3157283961772919 -83.4471206665039 50.7430419921875 0.010825084522366524 - 0.2148148148148148 T 0.2 NA NA - 0.2 S 0.13333333333333333 NA NA S 0.16296296296296298 NA NA T 0.2148148148148148 T 0.0962962962962963 NA NA NA NA NA NA S 0.14814814814814814 NA NA T 0.1925925925925926 T 0.2148148148148148 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976399966632016e-06 8.501644230902303e-06 3.976399966632016e-06 8.501644230902303e-06 1 251484 NA NA NA NA Tgt/Agt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1012C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3349639177322388 26.3616603255272 C 0.21735626459121704 0.04689597710967064 0.735747754573822 C 0.10463479161262512 0.1142343133687973 0.0032278094440698624 0.02393011189997196 0.027615297585725784 0.13661079108715055 0.27028220891952515 0.3194646537303925 -66.54120635986328 -20.921382904052734 0.02631664462387561 S 0.9285714285714286 - 0.25 NA NA S 0.8809523809523809 - 0.5 NA NA - 0.30952380952380953 NA NA - 0.2380952380952381 - 0.09523809523809523 NA NA NA NA NA NA - 0.3690476190476191 NA NA - 0.32142857142857145 - 0.25 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 557421 VUS 1 3.976490006607492e-06 9.675649370050873e-06 3.976490006607492e-06 9.675649370050873e-06 1 251478 NA NA NA NA Ggc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1014= NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1989301443099976 15.655802357196805 C 0.2403909116983413 0.08477704226970673 0.6748320460319519 T 0.13310305774211886 0.0986817181110382 0.002108668908476829 0.03375455364584923 0.055754706263542175 0.16488637030124664 0.26155734062194824 0.2501536011695862 -30.900226593017567 -30.198278427124023 0.0163179449737072 S 0.5357142857142857 - 0.13095238095238096 NA NA S 0.5357142857142857 - 0.03571428571428571 NA NA - 0.03571428571428571 NA NA - 0.047619047619047616 - 0.07142857142857142 NA NA NA NA NA NA - 0.047619047619047616 NA NA - 0.08333333333333333 - 0.10714285714285714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.11 0.0 0.0 3042G>C G1014R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1989301443099976 15.655802357196805 C 0.2403909116983413 0.08477704226970673 0.6748320460319519 T 0.13310305774211886 0.0986817181110382 0.002108668908476829 0.03375455364584923 0.055754706263542175 0.16488637030124664 0.26155734062194824 0.2501536011695862 -30.900226593017567 -30.198278427124023 0.0163179449737072 S 0.5357142857142857 - 0.13095238095238096 NA NA S 0.5357142857142857 - 0.03571428571428571 NA NA - 0.03571428571428571 NA NA - 0.047619047619047616 - 0.07142857142857142 NA NA NA NA NA NA - 0.047619047619047616 NA NA - 0.08333333333333333 - 0.10714285714285714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.980510079301894e-06 1.6707900530465123e-05 NA NA NA NA 6.980510079301894e-06 1.6707900530465123e-05 1 143256 NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA G1014V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1989301443099976 15.655802357196805 C 0.2403909116983413 0.08477704226970673 0.6748320460319519 T 0.13310305774211886 0.0986817181110382 0.002108668908476829 0.03375455364584923 0.055754706263542175 0.16488637030124664 0.26155734062194824 0.2501536011695862 -30.900226593017567 -30.198278427124023 0.0163179449737072 S 0.5357142857142857 - 0.13095238095238096 NA NA S 0.5357142857142857 - 0.03571428571428571 NA NA - 0.03571428571428571 NA NA - 0.047619047619047616 - 0.07142857142857142 NA NA NA NA NA NA - 0.047619047619047616 NA NA - 0.08333333333333333 - 0.10714285714285714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.0 0.0 0.0 0.22 3041G>T G1015R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.16964790225028992 13.351289907097811 C 0.2243176847696305 0.16006891429424286 0.6156134009361267 C 0.10772641748189926 0.09700256586074828 0.002998971845954657 0.03788117691874504 0.11028122156858444 0.1520441174507141 0.1775897592306137 0.31447577476501465 -59.70856475830078 -125.99948120117188 0.015998387709259987 - 0.6071428571428571 S 0.0 NA NA - 0.6190476190476191 S 0.0 NA NA S 0.0 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 3043G>A G1015V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.16964790225028992 13.351289907097811 C 0.2243176847696305 0.16006891429424286 0.6156134009361267 C 0.10772641748189926 0.09700256586074828 0.002998971845954657 0.03788117691874504 0.11028122156858444 0.1520441174507141 0.1775897592306137 0.31447577476501465 -59.70856475830078 -125.99948120117188 0.015998387709259987 - 0.6071428571428571 S 0.0 NA NA - 0.6190476190476191 S 0.0 NA NA S 0.0 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.983369879279054e-06 9.818639874544524e-06 3.983369879279054e-06 9.818639874544524e-06 1 251044 NA NA NA NA gGa/gTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H1016Q NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3002169728279114 54.60946735739708 C 0.2670555710792541 0.2439780533313751 0.4889662861824036 C 0.10235322266817093 0.15154211223125458 0.0033472038339823484 0.06406024843454361 0.17224936187267306 0.11408866941928865 0.12953613698482513 0.2628230452537537 -90.03583526611328 20.27069664001465 0.01512408722192049 - 0.09239130434782608 S 0.20108695652173916 NA NA - 0.08152173913043477 T 0.16847826086956522 NA NA T 0.21739130434782608 NA NA S 0.21195652173913046 H 0.19021739130434784 NA NA NA NA NA NA H 0.266304347826087 NA NA S 0.24456521739130435 S 0.17391304347826084 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.37 0.0 0.0 0.0 3048T>G H1016R NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3002169728279114 54.60946735739708 C 0.2670555710792541 0.2439780533313751 0.4889662861824036 C 0.10235322266817093 0.15154211223125458 0.0033472038339823484 0.06406024843454361 0.17224936187267306 0.11408866941928865 0.12953613698482513 0.2628230452537537 -90.03583526611328 20.27069664001465 0.01512408722192049 - 0.09239130434782608 S 0.20108695652173916 NA NA - 0.08152173913043477 T 0.16847826086956522 NA NA T 0.21739130434782608 NA NA S 0.21195652173913046 H 0.19021739130434784 NA NA NA NA NA NA H 0.266304347826087 NA NA S 0.24456521739130435 S 0.17391304347826084 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.07007061814737e-06 1.7671199237847822e-05 3.981149802712024e-06 8.395569873507773e-06 1 251184 6.978949841141002e-06 1.55494594440695e-05 1 143288 cAt/cGt cAt/cGt 0 0 NA NA NA NA NA NA A1018T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA b 0.14196836948394775 15.644914317131045 H 0.5103870034217834 0.11561088263988495 0.3740020990371704 H 0.2352727651596069 0.25637805461883545 0.002794670406728983 0.018131574615836143 0.09045539796352386 0.07052580267190932 0.137827530503273 0.18861423432827 -74.82483673095703 -18.246431350708008 0.0075407326221466064 - 0.7641509433962265 T 0.4245283018867925 NA NA - 0.7924528301886793 T 0.5094339622641509 NA NA T 0.3207547169811321 NA NA T 0.4716981132075472 H 0.5094339622641509 NA NA NA NA NA NA H 0.3679245283018868 NA NA T 0.4056603773584906 T 0.3962264150943397 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 890671 VUS 1 2.027891443351385e-05 1.6825449758733226e-05 2.3882299501565285e-05 8.915012104837532e-06 6 251232 1.3959999705548398e-05 1.4269489085256564e-05 2 143266 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0 NA NA NA NA NA NA Y1019C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA b 0.11677205562591553 24.954188287258148 C 0.3986872434616089 0.19747889041900635 0.4038338661193848 G 0.2217587828636169 0.16459092497825625 0.004120803438127041 0.04961507022380829 0.1280747354030609 0.06718873977661133 0.1971178948879242 0.1675330102443695 -89.49816131591797 -0.32091715931892395 0.004261902067810297 - 0.1981981981981982 T 0.054054054054054064 NA NA - 0.19369369369369369 - 0.14414414414414414 NA NA T 0.06756756756756757 NA NA T 0.07207207207207207 H 0.1036036036036036 NA NA NA NA NA NA T 0.04954954954954955 NA NA T 0.054054054054054064 T 0.054054054054054064 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 371419 pathogenic 1 7.958619789860679e-06 1.0442786712447307e-05 7.958619789860679e-06 1.0442786712447307e-05 2 251300 NA NA NA NA tAt/tGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1020C NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA e 0.3020619750022888 35.40166347026825 C 0.364501416683197 0.1489303857088089 0.4865682423114777 T 0.17319543659687042 0.13674157857894895 0.006086420267820357 0.016222195699810982 0.11755608767271042 0.1706783026456833 0.21205909550189966 0.16746096312999725 -86.08458709716797 -24.00217056274414 0.0035644138697534795 - 0.6923076923076923 T 0.3384615384615385 NA NA - 0.6923076923076923 T 0.38461538461538464 NA NA G 0.25384615384615383 NA NA T 0.3307692307692308 T 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA T 0.2846153846153846 NA NA T 0.3384615384615385 T 0.476923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 3058A>T S1020I NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA e 0.3020619750022888 35.40166347026825 C 0.364501416683197 0.1489303857088089 0.4865682423114777 T 0.17319543659687042 0.13674157857894895 0.006086420267820357 0.016222195699810982 0.11755608767271042 0.1706783026456833 0.21205909550189966 0.16746096312999725 -86.08458709716797 -24.00217056274414 0.0035644138697534795 - 0.6923076923076923 T 0.3384615384615385 NA NA - 0.6923076923076923 T 0.38461538461538464 NA NA G 0.25384615384615383 NA NA T 0.3307692307692308 T 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA T 0.2846153846153846 NA NA T 0.3384615384615385 T 0.476923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.0 0.0 3059G>T S1020N NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA e 0.3020619750022888 35.40166347026825 C 0.364501416683197 0.1489303857088089 0.4865682423114777 T 0.17319543659687042 0.13674157857894895 0.006086420267820357 0.016222195699810982 0.11755608767271042 0.1706783026456833 0.21205909550189966 0.16746096312999725 -86.08458709716797 -24.00217056274414 0.0035644138697534795 - 0.6923076923076923 T 0.3384615384615385 NA NA - 0.6923076923076923 T 0.38461538461538464 NA NA G 0.25384615384615383 NA NA T 0.3307692307692308 T 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA T 0.2846153846153846 NA NA T 0.3384615384615385 T 0.476923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979119810537668e-06 9.664812293922239e-06 3.979119810537668e-06 9.664812293922239e-06 1 251312 NA NA NA NA aGt/aAt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1020T NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA e 0.3020619750022888 35.40166347026825 C 0.364501416683197 0.1489303857088089 0.4865682423114777 T 0.17319543659687042 0.13674157857894895 0.006086420267820357 0.016222195699810982 0.11755608767271042 0.1706783026456833 0.21205909550189966 0.16746096312999725 -86.08458709716797 -24.00217056274414 0.0035644138697534795 - 0.6923076923076923 T 0.3384615384615385 NA NA - 0.6923076923076923 T 0.38461538461538464 NA NA G 0.25384615384615383 NA NA T 0.3307692307692308 T 0.4461538461538462 NA NA NA NA NA NA T 0.2846153846153846 NA NA T 0.3384615384615385 T 0.476923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 452564 VUS 2 2.5344071970261812e-05 1.839789805738745e-05 1.591649925103411e-05 9.282285724411154e-06 4 251312 4.188250022707507e-05 1.5884641156173908e-05 6 143258 aGt/aCt aGt/aCt 0 0 NA NA NA NA NA NA A1022V NA NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA TURN|14 NA NA NA b 0.1110248863697052 12.234942477941516 C 0.06102944537997247 0.287369042634964 0.6516015529632568 C 0.02704484574496746 0.024756360799074173 0.0010865501826629043 0.010783429257571696 0.2685549557209015 0.247894823551178 0.07397597283124924 0.3459031581878662 -99.29591369628906 162.1256103515625 0.003501789178699255 - 0.14150943396226415 T 0.018867924528301886 NA NA - 0.11320754716981132 T 0.018867924528301886 NA NA G 0.009433962264150943 NA NA T 0.018867924528301886 T 0.02830188679245283 NA NA NA NA NA NA T 0.018867924528301886 NA NA T 0.02830188679245283 T 0.03773584905660377 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.11 0.0 0.0 3065C>T V1023G NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|32 NA NA NA NA NA b 0.06442201137542725 9.901663148403166 E 0.007511617150157691 0.8906168341636658 0.10187149047851562 E 0.0037346805911511187 0.0032468147110193968 0.00011576293763937429 0.012690559029579164 0.8859531879425049 0.015903634950518608 0.007204967085272074 0.07115034759044647 -116.08573150634766 134.75660705566406 0.0014886560384184122 - 0.4577464788732394 E 0.04225352112676056 NA NA - 0.4577464788732394 S 0.04225352112676056 NA NA - 0.04929577464788732 NA NA E 0.04225352112676056 - 0.056338028169014086 NA NA NA NA NA NA B 0.04225352112676056 NA NA E 0.04929577464788732 - 0.014084507042253518 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.0 0.01 0.0 3068T>G V1023I NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|32 NA NA NA NA NA b 0.06442201137542725 9.901663148403166 E 0.007511617150157691 0.8906168341636658 0.10187149047851562 E 0.0037346805911511187 0.0032468147110193968 0.00011576293763937429 0.012690559029579164 0.8859531879425049 0.015903634950518608 0.007204967085272074 0.07115034759044647 -116.08573150634766 134.75660705566406 0.0014886560384184122 - 0.4577464788732394 E 0.04225352112676056 NA NA - 0.4577464788732394 S 0.04225352112676056 NA NA - 0.04929577464788732 NA NA E 0.04225352112676056 - 0.056338028169014086 NA NA NA NA NA NA B 0.04225352112676056 NA NA E 0.04929577464788732 - 0.014084507042253518 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.04 0.0 0.0 3067G>A I1025= NA NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|32 NA NA NA NA NA b 0.06977403163909912 12.908195853233336 E 0.0029504492413252588 0.9185487627983092 0.07850081473588942 E 0.0011671241372823715 0.0011683964403346179 4.9757865781430155e-05 0.005862143822014332 0.9210721850395204 0.006429709028452635 0.003926597535610199 0.06032401695847511 -110.18526458740234 124.08135986328124 0.0024652681313455105 - 0.2958579881656805 E 0.2603550295857988 NA NA - 0.3076923076923077 E 0.5384615384615384 NA NA E 0.4201183431952663 NA NA E 0.3431952662721893 B 0.2781065088757396 NA NA NA NA NA NA - 0.2781065088757396 NA NA E 0.26627218934911245 B 0.5266272189349113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.32 0.0 0.0 0.0 3075C>T L1027F Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.19965910911560056 36.557582879066466 C 0.02824648097157478 0.38647809624671936 0.585275411605835 C 0.012078268453478813 0.010491653345525265 0.00039357299101538967 0.02289632521569729 0.3508431911468506 0.06147954612970352 0.07209334522485733 0.4697241485118866 -94.48556518554688 128.81640625 0.01468789763748646 T 0.725609756097561 - 0.9085365853658536 NA NA T 0.7195121951219512 E 0.9390243902439024 NA NA E 0.8963414634146342 NA NA S 1.0 S 1.0 NA NA NA NA NA NA - 0.9146341463414634 NA NA - 0.9329268292682928 - 0.8902439024390244 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.26 0.01 0.0 0.0 3079C>T G1028= Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.540727972984314 42.55529147386551 C 0.04433286190032959 0.053687255829572685 0.9019799232482908 T 0.04502619430422783 0.006712556350976229 0.00021025617024861282 0.005096348933875561 0.04122534021735191 0.18638372421264648 0.5207120180130005 0.19463354349136355 36.20323181152344 -112.3127670288086 0.028481753543019295 T 0.8809523809523809 S 0.4761904761904762 NA NA T 0.8690476190476191 S 0.5357142857142857 NA NA S 0.5476190476190477 NA NA S 0.5119047619047619 S 0.5 NA NA NA NA NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.5595238095238095 S 0.42857142857142855 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.01 0.0 0.0 3084C>T G1028A Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.540727972984314 42.55529147386551 C 0.04433286190032959 0.053687255829572685 0.9019799232482908 T 0.04502619430422783 0.006712556350976229 0.00021025617024861282 0.005096348933875561 0.04122534021735191 0.18638372421264648 0.5207120180130005 0.19463354349136355 36.20323181152344 -112.3127670288086 0.028481753543019295 T 0.8809523809523809 S 0.4761904761904762 NA NA T 0.8690476190476191 S 0.5357142857142857 NA NA S 0.5476190476190477 NA NA S 0.5119047619047619 S 0.5 NA NA NA NA NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.5595238095238095 S 0.42857142857142855 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.47 0.47 0.04 0.0 0.0 3083G>C G1028C Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.540727972984314 42.55529147386551 C 0.04433286190032959 0.053687255829572685 0.9019799232482908 T 0.04502619430422783 0.006712556350976229 0.00021025617024861282 0.005096348933875561 0.04122534021735191 0.18638372421264648 0.5207120180130005 0.19463354349136355 36.20323181152344 -112.3127670288086 0.028481753543019295 T 0.8809523809523809 S 0.4761904761904762 NA NA T 0.8690476190476191 S 0.5357142857142857 NA NA S 0.5476190476190477 NA NA S 0.5119047619047619 S 0.5 NA NA NA NA NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.5595238095238095 S 0.42857142857142855 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.7 0.7 0.12 0.0 0.0 3082G>T G1028V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.540727972984314 42.55529147386551 C 0.04433286190032959 0.053687255829572685 0.9019799232482908 T 0.04502619430422783 0.006712556350976229 0.00021025617024861282 0.005096348933875561 0.04122534021735191 0.18638372421264648 0.5207120180130005 0.19463354349136355 36.20323181152344 -112.3127670288086 0.028481753543019295 T 0.8809523809523809 S 0.4761904761904762 NA NA T 0.8690476190476191 S 0.5357142857142857 NA NA S 0.5476190476190477 NA NA S 0.5119047619047619 S 0.5 NA NA NA NA NA NA S 0.35714285714285715 NA NA S 0.5595238095238095 S 0.42857142857142855 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.71 0.71 0.19 0.0 0.0 3083G>T H1029L Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.8045991659164429 146.35658828020098 C 0.04372142255306244 0.011288322508335114 0.9449902772903442 T 0.03539876639842987 0.004251503385603428 6.658983329543844e-05 0.001629481790587306 0.004454114008694886 0.11199520528316498 0.802384614944458 0.03981970250606537 -86.73509979248047 20.696605682373047 0.036483727395534515 - 0.2771739130434783 G 0.9673913043478259 NA NA - 0.2717391304347826 S 1.0 NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 1.0 NA NA NA NA NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 0.9239130434782608 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1931500011996832e-05 8.958605929816282e-06 1.1931500011996832e-05 8.958605929816282e-06 3 251436 NA NA NA NA cAt/cTt NA 0 NA 0.46 0.46 0.04 0.0 0.0 3086A>T H1029P Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.8045991659164429 146.35658828020098 C 0.04372142255306244 0.011288322508335114 0.9449902772903442 T 0.03539876639842987 0.004251503385603428 6.658983329543844e-05 0.001629481790587306 0.004454114008694886 0.11199520528316498 0.802384614944458 0.03981970250606537 -86.73509979248047 20.696605682373047 0.036483727395534515 - 0.2771739130434783 G 0.9673913043478259 NA NA - 0.2717391304347826 S 1.0 NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 1.0 NA NA NA NA NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 0.9239130434782608 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.31 0.02 0.0 0.0 3086A>C H1029Q Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.8045991659164429 146.35658828020098 C 0.04372142255306244 0.011288322508335114 0.9449902772903442 T 0.03539876639842987 0.004251503385603428 6.658983329543844e-05 0.001629481790587306 0.004454114008694886 0.11199520528316498 0.802384614944458 0.03981970250606537 -86.73509979248047 20.696605682373047 0.036483727395534515 - 0.2771739130434783 G 0.9673913043478259 NA NA - 0.2717391304347826 S 1.0 NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 1.0 NA NA NA NA NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 0.9239130434782608 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.43 0.43 0.0 0.0 0.0 3087T>G H1029R Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.8045991659164429 146.35658828020098 C 0.04372142255306244 0.011288322508335114 0.9449902772903442 T 0.03539876639842987 0.004251503385603428 6.658983329543844e-05 0.001629481790587306 0.004454114008694886 0.11199520528316498 0.802384614944458 0.03981970250606537 -86.73509979248047 20.696605682373047 0.036483727395534515 - 0.2771739130434783 G 0.9673913043478259 NA NA - 0.2717391304347826 S 1.0 NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 1.0 NA NA NA NA NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 0.9239130434782608 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.590859938005451e-05 8.542890949461892e-06 1.590859938005451e-05 8.542890949461892e-06 4 251436 NA NA NA NA cAt/cGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H1029Y Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.8045991659164429 146.35658828020098 C 0.04372142255306244 0.011288322508335114 0.9449902772903442 T 0.03539876639842987 0.004251503385603428 6.658983329543844e-05 0.001629481790587306 0.004454114008694886 0.11199520528316498 0.802384614944458 0.03981970250606537 -86.73509979248047 20.696605682373047 0.036483727395534515 - 0.2771739130434783 G 0.9673913043478259 NA NA - 0.2717391304347826 S 1.0 NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 1.0 NA NA NA NA NA NA S 1.0 NA NA T 1.0 T 0.9239130434782608 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 3085C>T G1030A Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.647186815738678 50.93360239863396 C 0.054124850779771805 0.024304375052452087 0.9215707778930664 S 0.056849487125873566 0.003895490663126111 8.458203228656203e-05 0.0018446800531819465 0.022258974611759186 0.4350988268852234 0.3063609600067139 0.17360706627368927 92.17276000976562 -4.831841945648193 0.02124445699155331 T 0.2976190476190476 G 0.7857142857142857 NA NA T 0.32142857142857145 S 0.7976190476190477 NA NA S 0.7619047619047619 NA NA T 0.7142857142857143 T 0.75 NA NA NA NA NA NA S 0.5 NA NA T 0.8809523809523809 T 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.54 0.54 0.08 0.0 0.0 3089G>C G1030C Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.647186815738678 50.93360239863396 C 0.054124850779771805 0.024304375052452087 0.9215707778930664 S 0.056849487125873566 0.003895490663126111 8.458203228656203e-05 0.0018446800531819465 0.022258974611759186 0.4350988268852234 0.3063609600067139 0.17360706627368927 92.17276000976562 -4.831841945648193 0.02124445699155331 T 0.2976190476190476 G 0.7857142857142857 NA NA T 0.32142857142857145 S 0.7976190476190477 NA NA S 0.7619047619047619 NA NA T 0.7142857142857143 T 0.75 NA NA NA NA NA NA S 0.5 NA NA T 0.8809523809523809 T 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.62 0.62 0.09 0.0 0.0 3088G>T G1030R Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.647186815738678 50.93360239863396 C 0.054124850779771805 0.024304375052452087 0.9215707778930664 S 0.056849487125873566 0.003895490663126111 8.458203228656203e-05 0.0018446800531819465 0.022258974611759186 0.4350988268852234 0.3063609600067139 0.17360706627368927 92.17276000976562 -4.831841945648193 0.02124445699155331 T 0.2976190476190476 G 0.7857142857142857 NA NA T 0.32142857142857145 S 0.7976190476190477 NA NA S 0.7619047619047619 NA NA T 0.7142857142857143 T 0.75 NA NA NA NA NA NA S 0.5 NA NA T 0.8809523809523809 T 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 3088G>C G1030S Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.647186815738678 50.93360239863396 C 0.054124850779771805 0.024304375052452087 0.9215707778930664 S 0.056849487125873566 0.003895490663126111 8.458203228656203e-05 0.0018446800531819465 0.022258974611759186 0.4350988268852234 0.3063609600067139 0.17360706627368927 92.17276000976562 -4.831841945648193 0.02124445699155331 T 0.2976190476190476 G 0.7857142857142857 NA NA T 0.32142857142857145 S 0.7976190476190477 NA NA S 0.7619047619047619 NA NA T 0.7142857142857143 T 0.75 NA NA NA NA NA NA S 0.5 NA NA T 0.8809523809523809 T 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.44 0.44 0.0 0.0 0.0 3088G>A G1030V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.647186815738678 50.93360239863396 C 0.054124850779771805 0.024304375052452087 0.9215707778930664 S 0.056849487125873566 0.003895490663126111 8.458203228656203e-05 0.0018446800531819465 0.022258974611759186 0.4350988268852234 0.3063609600067139 0.17360706627368927 92.17276000976562 -4.831841945648193 0.02124445699155331 T 0.2976190476190476 G 0.7857142857142857 NA NA T 0.32142857142857145 S 0.7976190476190477 NA NA S 0.7619047619047619 NA NA T 0.7142857142857143 T 0.75 NA NA NA NA NA NA S 0.5 NA NA T 0.8809523809523809 T 0.7380952380952381 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.67 0.67 0.15 0.0 0.0 3089G>T T1031= Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.33522725105285645 46.49601972103118 C 0.010854669846594334 0.07168359309434891 0.9174617528915404 C 0.0071349190548062325 0.0014560959534719586 1.2022333066852298e-05 0.007163083646446466 0.06396818161010742 0.0960901528596878 0.020687207579612732 0.8034883737564087 -77.7540512084961 138.69053649902344 0.013175247237086296 T 0.471830985915493 G 0.29577464788732394 NA NA T 0.4577464788732394 E 0.4647887323943662 NA NA E 0.4154929577464789 NA NA - 0.3661971830985916 T 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA - 0.3873239436619718 NA NA - 0.28169014084507044 T 0.39436619718309857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 3093C>T T1031N Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.33522725105285645 46.49601972103118 C 0.010854669846594334 0.07168359309434891 0.9174617528915404 C 0.0071349190548062325 0.0014560959534719586 1.2022333066852298e-05 0.007163083646446466 0.06396818161010742 0.0960901528596878 0.020687207579612732 0.8034883737564087 -77.7540512084961 138.69053649902344 0.013175247237086296 T 0.471830985915493 G 0.29577464788732394 NA NA T 0.4577464788732394 E 0.4647887323943662 NA NA E 0.4154929577464789 NA NA - 0.3661971830985916 T 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA - 0.3873239436619718 NA NA - 0.28169014084507044 T 0.39436619718309857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.01 0.0 0.0 3092C>A T1031P Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.33522725105285645 46.49601972103118 C 0.010854669846594334 0.07168359309434891 0.9174617528915404 C 0.0071349190548062325 0.0014560959534719586 1.2022333066852298e-05 0.007163083646446466 0.06396818161010742 0.0960901528596878 0.020687207579612732 0.8034883737564087 -77.7540512084961 138.69053649902344 0.013175247237086296 T 0.471830985915493 G 0.29577464788732394 NA NA T 0.4577464788732394 E 0.4647887323943662 NA NA E 0.4154929577464789 NA NA - 0.3661971830985916 T 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA - 0.3873239436619718 NA NA - 0.28169014084507044 T 0.39436619718309857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.01 0.0 0.0 3091A>C T1031S Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|45 NA NA NA NA e 0.33522725105285645 46.49601972103118 C 0.010854669846594334 0.07168359309434891 0.9174617528915404 C 0.0071349190548062325 0.0014560959534719586 1.2022333066852298e-05 0.007163083646446466 0.06396818161010742 0.0960901528596878 0.020687207579612732 0.8034883737564087 -77.7540512084961 138.69053649902344 0.013175247237086296 T 0.471830985915493 G 0.29577464788732394 NA NA T 0.4577464788732394 E 0.4647887323943662 NA NA E 0.4154929577464789 NA NA - 0.3661971830985916 T 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA - 0.3873239436619718 NA NA - 0.28169014084507044 T 0.39436619718309857 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.48 0.48 0.0 0.0 0.0 3092C>G V1033F Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|33 NA NA NA NA NA b 0.09552162885665894 14.681674355268473 E 0.0009192886063829064 0.9345445036888124 0.0645361989736557 E 0.00041031051659956574 0.0002458007365930825 3.721943585333065e-06 0.007847173139452934 0.9284367561340332 0.002689690561965108 0.0012490758672356606 0.059117533266544335 -111.28531646728516 127.55684661865234 0.0017460886156186461 - 0.23943661971830985 E 0.028169014084507043 NA NA - 0.2323943661971831 E 0.11267605633802814 NA NA E 0.02112676056338028 NA NA E 0.04929577464788732 B 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA - 0.007042253521126761 NA NA E 0.014084507042253518 B 0.04225352112676056 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.3 0.0 0.0 0.0 3097G>T V1033I Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|33 NA NA NA NA NA b 0.09552162885665894 14.681674355268473 E 0.0009192886063829064 0.9345445036888124 0.0645361989736557 E 0.00041031051659956574 0.0002458007365930825 3.721943585333065e-06 0.007847173139452934 0.9284367561340332 0.002689690561965108 0.0012490758672356606 0.059117533266544335 -111.28531646728516 127.55684661865234 0.0017460886156186461 - 0.23943661971830985 E 0.028169014084507043 NA NA - 0.2323943661971831 E 0.11267605633802814 NA NA E 0.02112676056338028 NA NA E 0.04929577464788732 B 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA - 0.007042253521126761 NA NA E 0.014084507042253518 B 0.04225352112676056 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976840162067673e-06 9.166699284532899e-06 3.976840162067673e-06 9.166699284532899e-06 1 251456 NA NA NA NA Gtc/Atc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1034R Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|33 NA NA NA NA NA b 0.15719115734100342 12.370944082736967 E 0.0008650030358694494 0.9110312461853028 0.0881037637591362 E 0.00026925592101179063 0.00016259013500530267 5.799377959192498e-06 0.003648682730272412 0.9026620388031006 0.007917722687125206 0.0013809062074869873 0.08395306020975113 -112.5072250366211 164.48680114746094 0.0015871124342083929 - 0.30952380952380953 E 0.0 NA NA - 0.32142857142857145 - 0.047619047619047616 NA NA - 0.0 NA NA E 0.047619047619047616 - 0.023809523809523808 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA E 0.03571428571428571 - 0.14285714285714285 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 972703 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA A1035V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|33 NA NA NA NA NA b 0.08866775035858154 9.771186089515686 E 0.003395100357010961 0.8449264168739319 0.15167851746082306 E 0.002271604025736451 0.0004286537296138704 7.578590611956316e-06 0.003871627850458026 0.8603314161300659 0.022381272166967392 0.006270658224821091 0.10443722456693648 -136.23832702636722 149.5189208984375 0.0006521574105136096 - 0.018867924528301886 E 0.0 NA NA - 0.018867924528301886 - 0.0 NA NA - 0.0 NA NA E 0.0 - 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.018867924528301886 NA NA E 0.0 - 0.009433962264150943 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2972 pathogenic 2 7.953800377435982e-06 7.931900486101274e-06 7.953800377435982e-06 7.931900486101274e-06 2 251452 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T1036M Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|33 NA NA NA NA NA b 0.15993481874465942 22.18295935988426 E 0.0017287081573158507 0.8991093039512634 0.09916198253631593 E 0.0009072838583961127 0.0001958085485966876 7.223009561130311e-06 0.0013373565161600713 0.909169614315033 0.025715166702866558 0.0032726419158279896 0.05939494445919991 -127.3435516357422 148.36029052734375 0.00021304734400473527 - 0.4014084507042254 E 0.0 NA NA - 0.4014084507042254 E 0.007042253521126761 NA NA E 0.0 NA NA E 0.0 B 0.0 NA NA NA NA NA NA E 0.0 NA NA E 0.0 E 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2958 conflict 1 2.2800412887346148e-05 1.7994417956378353e-05 2.783990021271165e-05 8.337700092343718e-06 7 251438 1.3957500414107926e-05 1.5946216941925862e-05 2 143292 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA V1044M Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.21882420778274536 33.633280736207965 E 0.0007593813352286818 0.7794801592826843 0.2197604477405548 E 0.00039594928966835136 0.00014777889009565118 1.0675657904357652e-06 0.014426649548113346 0.730299711227417 0.010838751681149006 0.0015598337631672619 0.24233028292655945 -80.93327331542969 130.90902709960938 0.0009274100884795188 - 0.2746478873239437 - 0.1619718309859155 NA NA - 0.28169014084507044 - 0.2676056338028169 NA NA - 0.3380281690140845 NA NA - 0.2183098591549296 - 0.23943661971830985 NA NA NA NA NA NA - 0.5633802816901409 NA NA - 0.2323943661971831 - 0.18309859154929575 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 597412 VUS 2 3.54690730178771e-05 1.817176107508785e-05 5.170259828446433e-05 9.041391281892509e-06 13 251438 6.9797301875951234e-06 1.576280889492086e-05 1 143272 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA L1045P Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.03581628203392029 6.557961240410805 C 0.0008913133642636242 0.3180857300758362 0.6810229420661926 C 0.00040626389090903103 0.00017783096700441092 5.3453154578164686e-06 0.04270519688725472 0.23229531943798065 0.017674332484602928 0.003157987724989653 0.7035776972770691 -98.50173950195312 133.92005920410156 0.0012613803846761586 - 0.5304878048780488 - 0.08536585365853659 NA NA - 0.5365853658536586 - 0.09146341463414634 NA NA - 0.06097560975609756 NA NA - 0.08536585365853659 - 0.09146341463414634 NA NA NA NA NA NA - 0.06707317073170732 NA NA - 0.10365853658536583 - 0.09146341463414634 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 550833 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L1045V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.03581628203392029 6.557961240410805 C 0.0008913133642636242 0.3180857300758362 0.6810229420661926 C 0.00040626389090903103 0.00017783096700441092 5.3453154578164686e-06 0.04270519688725472 0.23229531943798065 0.017674332484602928 0.003157987724989653 0.7035776972770691 -98.50173950195312 133.92005920410156 0.0012613803846761586 - 0.5304878048780488 - 0.08536585365853659 NA NA - 0.5365853658536586 - 0.09146341463414634 NA NA - 0.06097560975609756 NA NA - 0.08536585365853659 - 0.09146341463414634 NA NA NA NA NA NA - 0.06707317073170732 NA NA - 0.10365853658536583 - 0.09146341463414634 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.4512606801984925e-05 NA NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.4512606801984925e-05 1 143330 NA Ctg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA Q1046H Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4926287233829498 87.98348999619482 C 0.0006738083902746439 0.007021305151283741 0.9923048615455629 S 0.000243449307163246 7.98741020844318e-05 7.836520126147661e-07 0.000637468125205487 0.004000639077275992 0.6169138550758362 0.006035127211362124 0.3720887899398804 -96.51931762695312 -20.22965431213379 0.0016183486441150308 S 0.5808080808080808 - 0.4545454545454545 NA NA S 0.5808080808080808 - 0.6363636363636364 NA NA - 0.2222222222222222 NA NA - 0.42424242424242425 - 0.35858585858585856 NA NA NA NA NA NA - 0.5505050505050505 NA NA - 0.4646464646464646 - 0.4646464646464646 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977089818363311e-06 9.9166665272166e-06 3.977089818363311e-06 9.9166665272166e-06 1 251440 NA NA NA NA caG/caT NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q1046K Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4926287233829498 87.98348999619482 C 0.0006738083902746439 0.007021305151283741 0.9923048615455629 S 0.000243449307163246 7.98741020844318e-05 7.836520126147661e-07 0.000637468125205487 0.004000639077275992 0.6169138550758362 0.006035127211362124 0.3720887899398804 -96.51931762695312 -20.22965431213379 0.0016183486441150308 S 0.5808080808080808 - 0.4545454545454545 NA NA S 0.5808080808080808 - 0.6363636363636364 NA NA - 0.2222222222222222 NA NA - 0.42424242424242425 - 0.35858585858585856 NA NA NA NA NA NA - 0.5505050505050505 NA NA - 0.4646464646464646 - 0.4646464646464646 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977059805038151e-06 8.641736728920156e-06 3.977059805038151e-06 8.641736728920156e-06 1 251442 NA NA NA NA Cag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A1049V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.4833262860774994 53.26255672574043 H 0.9846735000610352 0.0002346665278309956 0.015091890469193459 H 0.015635035932064056 0.9720354676246644 0.0007767918286845088 6.223363743629307e-05 0.00010511391155887396 0.0016690321499481795 0.006739445962011814 0.002976780757308007 -63.2929801940918 -40.32948684692383 0.0008579459972679615 H 0.3679245283018868 H 0.6320754716981132 NA NA H 0.3679245283018868 H 0.5 NA NA H 0.5471698113207547 NA NA H 0.6132075471698113 H 0.6226415094339622 NA NA NA NA NA NA H 0.5566037735849056 NA NA H 0.6320754716981132 H 0.5 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.977590146561853e-06 1.5141837542286606e-05 NA NA NA NA 6.977590146561853e-06 1.5141837542286606e-05 1 143316 NA gCt/gTt NA 0 NA NA NA NA NA NA I1052T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.22734856605529785 42.0594847202301 H 0.9979039430618286 0.00021369509340729562 0.001882367767393589 H 0.0009024353930726648 0.995157778263092 0.0021786601282656197 2.3774067813064906e-05 7.534314499935135e-05 0.00015393663488794118 0.0010736833792179825 0.0004343980399426074 -63.51012420654297 -41.99295425415039 9.8257623903919e-05 H 0.10059171597633136 H 0.08875739644970414 NA NA H 0.09467455621301776 H 0.13609467455621302 NA NA H 0.1301775147928994 NA NA H 0.07692307692307693 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA H 0.11834319526627217 NA NA H 0.10059171597633136 H 0.10650887573964496 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 597980 VUS 1 3.489180016913451e-05 1.2844214756541251e-05 NA NA NA NA 3.489180016913451e-05 1.2844214756541251e-05 5 143300 NA aTt/aCt NA 0 NA NA NA NA NA NA A1054T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.01749551296234131 1.928005528450012 H 0.9986248016357422 1.130138844018802e-05 0.0013639281969517472 H 0.0005803267122246325 0.9981670379638672 0.00025831410312093794 2.292279987159418e-06 2.576365659479052e-06 8.024819544516504e-05 0.000642630853690207 0.000266616087174043 -62.6784553527832 -42.382301330566406 2.1560910681728274e-05 H 0.08490566037735849 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.08490566037735849 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.0 NA NA H 0.009433962264150943 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.009433962264150943 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953989552333951e-06 9.469459267565203e-06 7.953989552333951e-06 9.469459267565203e-06 2 251446 NA NA NA NA Gct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L1055M Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.04868730902671814 8.914646282792091 H 0.99812251329422 6.078227306716144e-05 0.0018166276859119528 H 0.0007187007577158513 0.9971091151237488 0.0005071660852991045 5.7350171118741855e-06 2.1093090253998525e-05 0.00013329909415915608 0.0011076638475060463 0.0003973685961682349 -63.03659439086914 -41.54011917114258 4.643231295631267e-05 H 0.07317073170731707 H 0.0 NA NA H 0.07317073170731707 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.0 H 0.006097560975609756 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0133153500664097e-05 1.926717572051153e-05 1.1930999789910855e-05 9.773477986355877e-06 3 251446 6.9784600782440975e-06 1.6604312340331535e-05 1 143298 Ctg/Atg Ctg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA K1057Q Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.310878187417984 63.9476431518793 H 0.9986441731452942 2.533549741201569e-05 0.001330474391579628 H 0.0005312671419233084 0.9980973601341248 0.0001951488375198096 6.047634542483138e-06 7.671744242543355e-06 7.801075116731225e-05 0.000800176989287138 0.00028430053498595964 -63.84283828735352 -41.17155838012695 3.445888796704821e-05 H 0.5707317073170731 H 0.16097560975609754 NA NA H 0.5658536585365853 H 0.2195121951219512 NA NA H 0.1902439024390244 NA NA H 0.14146341463414633 H 0.16097560975609754 NA NA NA NA NA NA H 0.15121951219512195 NA NA H 0.17560975609756094 H 0.22439024390243906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977029791712994e-06 8.882787887533342e-06 3.977029791712994e-06 8.882787887533342e-06 1 251444 NA NA NA NA Aaa/Caa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R1059* Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.2338709677419355 H 0.16532258064516128 NA NA H 0.2298387096774193 H 0.1814516129032258 NA NA H 0.1693548387096774 NA NA H 0.20967741935483872 H 0.2379032258064516 NA NA NA NA NA NA H 0.20161290322580644 NA NA H 0.1814516129032258 H 0.2701612903225806 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 188769 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R1059Q Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.35877060890197754 82.15846943855286 H 0.9993508458137512 4.017361789010465e-05 0.0006090325769037008 H 0.0004375602002255618 0.9986938834190368 0.00019236434309277683 4.03517015001853e-06 1.51623471538187e-05 3.397100226720795e-05 0.0004903412773273885 0.000132808432681486 -63.13334655761719 -42.35953903198242 5.95739038544707e-05 H 0.2338709677419355 H 0.16532258064516128 NA NA H 0.2298387096774193 H 0.1814516129032258 NA NA H 0.1693548387096774 NA NA H 0.20967741935483872 H 0.2379032258064516 NA NA NA NA NA NA H 0.20161290322580644 NA NA H 0.1814516129032258 H 0.2701612903225806 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.040496488070589e-05 1.7152393784830567e-05 2.784159914881457e-05 8.453960522512986e-06 7 251422 3.490399831207469e-05 1.4924314524750748e-05 5 143250 cGa/cAa cGa/cAa 0 0 NA NA NA NA NA NA L1060F Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.4451937973499298 81.51498429477216 H 0.9990254640579224 5.103982039145194e-05 0.0009234880562871696 H 0.00032488841679878533 0.9983727931976318 0.00032512366306036716 8.026783689274453e-06 1.704769420030061e-05 4.953613824909553e-05 0.0007513987366110086 0.00015117549628484994 -63.170570373535156 -43.604400634765625 5.423725451692008e-05 H 0.7073170731707317 H 0.5548780487804879 NA NA H 0.7012195121951219 H 0.6097560975609756 NA NA H 0.6768292682926829 NA NA H 0.5426829268292683 H 0.5670731707317073 NA NA NA NA NA NA H 0.573170731707317 NA NA H 0.5426829268292683 H 0.5426829268292683 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.316049239006429e-05 NA NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.316049239006429e-05 1 143284 NA Ctt/Ttt NA 0 NA NA NA NA NA NA I1061M Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.04368630051612854 8.08196559548378 H 0.9981791973114014 3.871543594868854e-05 0.0017821681685745714 H 0.0006466591148637235 0.9971797466278076 0.0005499976105056703 7.432835445797536e-06 1.4457172255788464e-05 0.000130266766063869 0.000956398609559983 0.0005149728967808187 -63.19143676757813 -44.3092155456543 0.00010405682405689731 H 0.4260355029585799 H 0.08875739644970414 NA NA H 0.4378698224852071 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.09467455621301776 NA NA H 0.08284023668639054 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA H 0.08875739644970414 NA NA H 0.10650887573964496 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 851806 VUS 1 3.977189862780506e-06 8.79845376162657e-06 3.977189862780506e-06 8.79845376162657e-06 1 251434 NA NA NA NA atA/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1061T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.04368630051612854 8.08196559548378 H 0.9981791973114014 3.871543594868854e-05 0.0017821681685745714 H 0.0006466591148637235 0.9971797466278076 0.0005499976105056703 7.432835445797536e-06 1.4457172255788464e-05 0.000130266766063869 0.000956398609559983 0.0005149728967808187 -63.19143676757813 -44.3092155456543 0.00010405682405689731 H 0.4260355029585799 H 0.08875739644970414 NA NA H 0.4378698224852071 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.09467455621301776 NA NA H 0.08284023668639054 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA H 0.08875739644970414 NA NA H 0.10650887573964496 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2967 pathogenic 2 0.00021785282707302683 1.9279751155469463e-05 0.000202840004931204 1.016698132939274e-05 51 251430 0.0002441880060359836 1.6381126190363275e-05 35 143332 aTa/aCa aTa/aCa 0 0 NA NA NA NA NA NA I1061V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.04368630051612854 8.08196559548378 H 0.9981791973114014 3.871543594868854e-05 0.0017821681685745714 H 0.0006466591148637235 0.9971797466278076 0.0005499976105056703 7.432835445797536e-06 1.4457172255788464e-05 0.000130266766063869 0.000956398609559983 0.0005149728967808187 -63.19143676757813 -44.3092155456543 0.00010405682405689731 H 0.4260355029585799 H 0.08875739644970414 NA NA H 0.4378698224852071 H 0.10059171597633136 NA NA H 0.09467455621301776 NA NA H 0.08284023668639054 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA NA NA H 0.08875739644970414 NA NA H 0.10650887573964496 H 0.08284023668639054 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9771598494553464e-06 9.128932772072787e-06 3.9771598494553464e-06 9.128932772072787e-06 1 251436 NA NA NA NA Ata/Gta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1063G Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.4366174340248108 51.171563267707825 H 0.992332935333252 8.159896970028058e-05 0.007585437502712011 H 0.0015946417115628721 0.9911810159683228 0.0011910777539014814 1.229895406140713e-05 3.1624320399714634e-05 0.0003848426276817918 0.004293571691960096 0.0013109579449519515 -64.57205200195311 -39.7586784362793 0.0004467120452318341 H 0.2384615384615385 H 0.3538461538461539 NA NA H 0.25384615384615383 H 0.5692307692307692 NA NA H 0.38461538461538464 NA NA H 0.3230769230769231 H 0.4230769230769231 NA NA NA NA NA NA H 0.4230769230769231 NA NA H 0.3769230769230769 H 0.5692307692307692 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.0 0.0 0.23 0.0 3187A>G T1066A Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.2435646951198578 33.782423213124275 H 0.9861757159233092 0.0006083035259507596 0.013216028921306132 H 0.005056392401456833 0.9774936437606812 0.006034132558852434 0.00011017739598173648 0.00034248223528265964 0.001149362069554627 0.004543877672404051 0.005269811488687992 -63.01634979248047 -41.49057388305664 0.0009226055117323996 H 0.38028169014084506 H 0.20422535211267606 NA NA H 0.3873239436619718 H 0.19718309859154928 NA NA H 0.16901408450704225 NA NA H 0.18309859154929575 H 0.19014084507042253 NA NA NA NA NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.0267918784852e-05 1.862472418642777e-05 2.386499909334816e-05 9.008257175693687e-06 6 251414 1.3956900147604754e-05 1.630127767008068e-05 2 143298 Acc/Gcc Acc/Gcc 0 0 NA NA NA NA NA NA T1066N Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.2435646951198578 33.782423213124275 H 0.9861757159233092 0.0006083035259507596 0.013216028921306132 H 0.005056392401456833 0.9774936437606812 0.006034132558852434 0.00011017739598173648 0.00034248223528265964 0.001149362069554627 0.004543877672404051 0.005269811488687992 -63.01634979248047 -41.49057388305664 0.0009226055117323996 H 0.38028169014084506 H 0.20422535211267606 NA NA H 0.3873239436619718 H 0.19718309859154928 NA NA H 0.16901408450704225 NA NA H 0.18309859154929575 H 0.19014084507042253 NA NA NA NA NA NA H 0.1619718309859155 NA NA H 0.2323943661971831 H 0.2746478873239437 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.954749889904633e-06 8.155707452062304e-06 7.954749889904633e-06 8.155707452062304e-06 2 251422 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E1067K Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.7852873206138611 137.1896949112415 H 0.9815725088119508 0.0005643683252856134 0.017863126471638683 H 0.0068321083672344685 0.9720247983932496 0.00587176950648427 6.812741776229815e-05 0.00030151763348840177 0.0009877777192741632 0.010299254208803177 0.0036145560443401337 -64.95777130126953 -40.65621948242188 0.0015271148877218366 H 0.7216494845360825 H 0.6907216494845361 NA NA H 0.7061855670103093 H 0.865979381443299 NA NA H 0.7628865979381443 NA NA H 0.6752577319587629 H 0.6494845360824743 NA NA NA NA NA NA H 0.7216494845360825 NA NA H 0.8144329896907216 H 0.7680412371134021 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.8138081870634254e-05 1.866094254844794e-05 6.364309956552461e-05 9.54697157229226e-06 16 251402 2.093570037686732e-05 1.6033905032596338e-05 3 143296 Gaa/Aaa Gaa/Aaa 0 0 NA NA NA NA NA NA T1068I Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.43997013568878174 61.023857820034024 H 0.9583675265312196 0.0011032861657440662 0.04052921384572983 H 0.008537574671208858 0.9377179145812988 0.014655489474534987 0.00012857580441050231 0.0005230040405876935 0.002055346267297864 0.030419981107115742 0.005962043534964323 -70.56704711914062 -36.56892776489258 0.002325056586414576 H 0.5774647887323944 H 0.4154929577464789 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.5422535211267606 NA NA H 0.3380281690140845 NA NA H 0.4647887323943662 H 0.4507042253521127 NA NA NA NA NA NA H 0.38028169014084506 NA NA H 0.4647887323943662 H 0.4084507042253521 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.053363631825271e-05 2.007153290975937e-05 5.568550113821403e-05 9.914044326591021e-06 14 251412 1.3954600035503974e-05 1.7452167728908116e-05 2 143322 aCc/aTc aCc/aTc 0 0 NA NA NA NA NA NA T1068S Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA e 0.43997013568878174 61.023857820034024 H 0.9583675265312196 0.0011032861657440662 0.04052921384572983 H 0.008537574671208858 0.9377179145812988 0.014655489474534987 0.00012857580441050231 0.0005230040405876935 0.002055346267297864 0.030419981107115742 0.005962043534964323 -70.56704711914062 -36.56892776489258 0.002325056586414576 H 0.5774647887323944 H 0.4154929577464789 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.5422535211267606 NA NA H 0.3380281690140845 NA NA H 0.4647887323943662 H 0.4507042253521127 NA NA NA NA NA NA H 0.38028169014084506 NA NA H 0.4647887323943662 H 0.4084507042253521 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.60005462442487e-06 1.7593259726552222e-05 3.977530013798969e-06 8.086454312219804e-06 1 251412 1.3954600035503974e-05 1.5624725420381186e-05 2 143322 aCc/aGc aCc/aGc 0 0 NA NA NA NA NA NA M1069V Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|46 NA NA NA NA b 0.11395931243896484 22.803258419036865 H 0.7207183837890625 0.005659996997565031 0.2736216187477112 H 0.02327427640557289 0.6819274425506592 0.007109408266842365 0.0017775894375517964 0.0017264119815081358 0.03113297931849956 0.22113995254039764 0.031911879777908325 -86.68523406982422 -16.451515197753903 0.004342967644333839 S 0.526595744680851 H 0.03723404255319149 NA NA S 0.526595744680851 H 0.13297872340425532 NA NA T 0.031914893617021274 NA NA H 0.06382978723404255 H 0.026595744680851064 NA NA NA NA NA NA S 0.058510638297872335 NA NA H 0.06914893617021277 T 0.11702127659574467 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 571915 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I1071L Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.265567809343338 49.13004472851753 C 0.08844553679227829 0.061985623091459274 0.8495688438415527 C 0.03995312750339508 0.03992592543363571 0.0006079751765355468 0.05955528467893601 0.03499918058514595 0.13258975744247434 0.113622784614563 0.5787459015846252 -93.61357879638672 121.85953521728516 0.004183994140475988 - 0.9822485207100592 - 0.1834319526627219 NA NA - 0.9822485207100592 - 0.2485207100591716 NA NA - 0.2485207100591716 NA NA - 0.20118343195266272 - 0.20710059171597636 NA NA NA NA NA NA - 0.2603550295857988 NA NA - 0.17159763313609466 - 0.2603550295857988 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977880169259152e-06 8.419206840695886e-06 3.977880169259152e-06 8.419206840695886e-06 1 251390 NA NA NA NA Att/Ctt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N1072S Patched NA Lumenal|5 N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|18 NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.7231419682502747 105.8679841518402 C 0.0668129250407219 0.035689860582351685 0.8974972367286682 C 0.03487687185406685 0.029714375734329224 0.0005159389693289995 0.012480213306844234 0.02513500116765499 0.13784779608249664 0.2445141226053238 0.5149156451225281 -100.6535873413086 60.91981887817383 0.009301945567131042 S 0.9490445859872612 S 1.0 NA NA S 0.9490445859872612 S 1.0 NA NA - 1.0 NA NA S 1.0 S 1.0 NA NA NA NA NA NA S 0.9872611464968152 NA NA S 0.9235668789808916 S 1.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.978010227001505e-06 9.45170938785739e-06 3.978010227001505e-06 9.45170938785739e-06 1 251382 NA NA NA NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1073S Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5321080684661865 41.87690498828889 C 0.2978615760803223 0.014425599016249182 0.6877127885818481 T 0.281361848115921 0.044877514243125916 0.000434800167568028 0.0051971739158034325 0.006842201575636864 0.19645732641220093 0.3188813030719757 0.14594782888889313 51.80631637573242 -32.491153717041016 0.0060187987983226785 S 0.8928571428571429 T 0.75 NA NA S 0.9047619047619048 S 0.6428571428571429 NA NA S 0.5833333333333334 NA NA T 0.6785714285714286 S 0.6666666666666666 NA NA NA NA NA NA T 0.7261904761904762 NA NA S 0.8095238095238095 S 0.7023809523809523 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 255696 conflict 1 0.0010719414670416084 1.672336375676179e-05 0.0010980999795719981 8.266087381481703e-06 276 251344 0.001026049954816699 1.453763030011022e-05 147 143268 Ggc/Agc Ggc/Agc 1 0 NA NA NA NA NA NA R1077* Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.5201612903225806 - 0.28225806451612906 NA NA - 0.5362903225806451 - 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 NA NA - 0.3387096774193548 - 0.4596774193548387 NA NA NA NA NA NA - 0.32661290322580644 NA NA - 0.3427419354838709 - 0.3185483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 289257 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA R1077Q Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4558669030666351 104.39352080225945 E 0.0021645643282681704 0.8811143636703491 0.11672105640172956 E 0.0009231989388354123 0.00029982376145198936 4.5208930714579765e-06 0.005811284296214581 0.8792214393615723 0.0065921293571591395 0.0010036700405180452 0.10614392161369324 -109.3166961669922 134.50369262695312 0.0005148650961928072 - 0.5201612903225806 - 0.28225806451612906 NA NA - 0.5362903225806451 - 0.3387096774193548 NA NA - 0.3225806451612903 NA NA - 0.3387096774193548 - 0.4596774193548387 NA NA NA NA NA NA - 0.32661290322580644 NA NA - 0.3427419354838709 - 0.3185483870967742 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 808372 VUS 1 1.5210142603368484e-05 1.7955897299128134e-05 1.5923700630082752e-05 8.943274522335501e-06 4 251198 1.3959100215288345e-05 1.5570230847196256e-05 2 143276 cGa/cAa cGa/cAa 0 0 NA NA NA NA NA NA V1078I Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|34 NA NA NA NA NA b 0.11054208874702454 16.99031904041767 E 0.00026606497704051435 0.966302454471588 0.033431466668844216 E 0.00011709218233590944 6.003215094096959e-05 1.8215743011751326e-06 0.0123739717528224 0.9555210471153259 0.0023919837549328804 0.0004289218341000378 0.02910508960485458 -113.69668579101562 132.91018676757812 0.0002028056915150956 - 0.2323943661971831 E 0.014084507042253518 NA NA - 0.2323943661971831 - 0.035211267605633804 NA NA - 0.014084507042253518 NA NA E 0.0 E 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA E 0.007042253521126761 NA NA E 0.014084507042253518 E 0.04225352112676056 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9808001019991934e-06 9.528532217984096e-06 3.9808001019991934e-06 9.528532217984096e-06 1 251206 NA NA NA NA Gta/Ata NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1078L Patched NA Lumenal|5 NA NA NA STRAND|34 NA NA NA NA NA b 0.11054208874702454 16.99031904041767 E 0.00026606497704051435 0.966302454471588 0.033431466668844216 E 0.00011709218233590944 6.003215094096959e-05 1.8215743011751326e-06 0.0123739717528224 0.9555210471153259 0.0023919837549328804 0.0004289218341000378 0.02910508960485458 -113.69668579101562 132.91018676757812 0.0002028056915150956 - 0.2323943661971831 E 0.014084507042253518 NA NA - 0.2323943661971831 - 0.035211267605633804 NA NA - 0.014084507042253518 NA NA E 0.0 E 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA E 0.007042253521126761 NA NA E 0.014084507042253518 E 0.04225352112676056 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978269993851428e-06 1.5191574143631732e-05 NA NA NA NA 6.978269993851428e-06 1.5191574143631732e-05 1 143302 NA Gta/Tta NA 0 NA NA NA NA NA NA S1082I Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09831267595291138 11.522245621681213 C 0.014592505060136318 0.24877884984016416 0.7366286516189575 C 0.004504725802689791 0.005261247046291828 7.587127038277686e-05 0.028555739670991894 0.1882519721984864 0.2549653649330139 0.014774343930184841 0.5036107897758484 -130.66021728515622 163.15321350097656 0.00030980637529864907 - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.0 0.0 0.38 0.45 3245G>T S1082R Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09831267595291138 11.522245621681213 C 0.014592505060136318 0.24877884984016416 0.7366286516189575 C 0.004504725802689791 0.005261247046291828 7.587127038277686e-05 0.028555739670991894 0.1882519721984864 0.2549653649330139 0.014774343930184841 0.5036107897758484 -130.66021728515622 163.15321350097656 0.00030980637529864907 - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9872998058854145e-06 8.981088056742251e-06 3.9872998058854145e-06 8.981088056742251e-06 1 250796 NA NA NA NA agT/agA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1082T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.09831267595291138 11.522245621681213 C 0.014592505060136318 0.24877884984016416 0.7366286516189575 C 0.004504725802689791 0.005261247046291828 7.587127038277686e-05 0.028555739670991894 0.1882519721984864 0.2549653649330139 0.014774343930184841 0.5036107897758484 -130.66021728515622 163.15321350097656 0.00030980637529864907 - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.02307692307692308 - 0.015384615384615384 NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.015384615384615384 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.015384615384615384 - 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.42 0.0 0.0 0.31 0.42 3245G>C Y1085* Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.045045045045045036 H 0.018018018018018014 NA NA H 0.054054054054054064 T 0.018018018018018014 NA NA H 0.009009009009009007 NA NA H 0.013513513513513514 G 0.013513513513513514 NA NA NA NA NA NA T 0.0045045045045045045 NA NA H 0.009009009009009007 H 0.03153153153153153 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.43 0.43 0.0 0.0 0.0 3255T>G F1087L Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|47 NA NA NA NA b 0.13470950722694394 27.03619810044765 H 0.9513399004936218 0.0031579909846186642 0.04550217464566232 H 0.01163584366440773 0.9201568365097046 0.02838852070271969 0.0010385047644376757 0.0014634638791903851 0.007392659317702055 0.017565703019499782 0.012358503416180607 -67.38233184814453 -43.45124435424805 0.00044792026164941484 H 0.4822335025380711 H 0.3350253807106599 NA NA H 0.4720812182741117 T 0.26903553299492383 NA NA H 0.3147208121827411 NA NA H 0.2588832487309645 T 0.27411167512690354 NA NA NA NA NA NA T 0.233502538071066 NA NA H 0.3197969543147208 H 0.27918781725888325 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 555143 pathogenic 2 1.3961000149720347e-05 1.4872259935104636e-05 NA NA NA NA 1.3961000149720347e-05 1.4872259935104636e-05 2 143256 NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA Y1088* Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.19369369369369369 H 0.0990990990990991 NA NA H 0.19369369369369369 T 0.12612612612612611 NA NA H 0.1126126126126126 NA NA H 0.054054054054054064 T 0.06306306306306306 NA NA NA NA NA NA T 0.1126126126126126 NA NA H 0.06306306306306306 H 0.045045045045045036 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.99 0.39 0.0 0.0 3264C>G Y1088C Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|47 NA NA NA NA b 0.20412108302116394 43.620675441622716 H 0.9824313521385192 0.0009510297677479683 0.016617650166153908 H 0.006601039785891771 0.9459377527236938 0.03099963814020157 0.00030840394902043045 0.0004326042253524065 0.00265507772564888 0.009515601210296154 0.0035499162040650845 -66.62156677246094 -41.97098159790039 0.00027088873321190476 H 0.19369369369369369 H 0.0990990990990991 NA NA H 0.19369369369369369 T 0.12612612612612611 NA NA H 0.1126126126126126 NA NA H 0.054054054054054064 T 0.06306306306306306 NA NA NA NA NA NA T 0.1126126126126126 NA NA H 0.06306306306306306 H 0.045045045045045036 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2964 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA E1089K Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.13229694962501526 23.112277099490164 H 0.9853099584579468 0.0005966386524960399 0.014093293808400631 H 0.006119030062109232 0.9421831369400024 0.036571402102708817 0.0002030605828622356 0.00022464201902039352 0.0016805545892566442 0.009662124328315258 0.003356002038344741 -68.92861938476561 -37.8776969909668 0.00031731752096675336 G 0.12886597938144329 S 0.17010309278350516 NA NA G 0.13402061855670105 S 0.11855670103092784 NA NA S 0.15463917525773194 NA NA S 0.16494845360824742 S 0.1134020618556701 NA NA NA NA NA NA T 0.14432989690721648 NA NA S 0.19072164948453607 S 0.11855670103092784 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 181458 VUS 1 3.980289875471499e-06 8.753584254227005e-06 3.980289875471499e-06 8.753584254227005e-06 1 251238 NA NA NA NA Gaa/Aaa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y1091* Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA G 0.12162162162162166 G 0.12162162162162166 NA NA G 0.12162162162162166 G 0.022522522522522518 NA NA G 0.0945945945945946 NA NA G 0.07657657657657657 G 0.06306306306306306 NA NA NA NA NA NA G 0.08558558558558559 NA NA G 0.0945945945945946 G 0.07207207207207207 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.31 0.0 0.0 0.0 3273C>G Y1091N Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|48 NA NA NA NA b 0.16857993602752686 36.025532329082495 H 0.9860420823097228 0.0007701506838202478 0.01318781916052103 H 0.003204151289537549 0.9477006196975708 0.03710721805691719 0.00023093573690857736 0.000278379739029333 0.0014297880697995426 0.0073948008939623815 0.0026540635153651237 -66.14461517333984 -41.722328186035156 0.00027573693660087883 G 0.12162162162162166 G 0.12162162162162166 NA NA G 0.12162162162162166 G 0.022522522522522518 NA NA G 0.0945945945945946 NA NA G 0.07657657657657657 G 0.06306306306306306 NA NA NA NA NA NA G 0.08558558558558559 NA NA G 0.0945945945945946 G 0.07207207207207207 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.6062963762079785e-05 NA NA NA NA 6.980219950492027e-06 1.6062963762079785e-05 1 143262 NA Tac/Aac NA 0 NA NA NA NA NA NA I1094T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.03337597846984863 6.174556016921997 H 0.983385980129242 0.00024541019229218364 0.01636863872408867 H 0.002439176430925727 0.8807231783866882 0.10075569897890092 0.00012129279639339074 7.658439426450059e-05 0.002620770363137126 0.009682496078312395 0.003580764634534717 -67.13908386230469 -42.92369079589844 0.00017704420315567404 H 0.17751479289940827 H 0.02366863905325444 NA NA H 0.17751479289940827 H 0.01183431952662722 NA NA H 0.0 NA NA H 0.05325443786982249 H 0.059171597633136085 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.017751479289940832 H 0.05325443786982249 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 547997 conflict 1 3.977570031565847e-06 9.171798836471426e-06 3.977570031565847e-06 9.171798836471426e-06 1 251410 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1095T Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.17288434505462644 31.983603835105896 H 0.9932825565338136 0.0002106116444338113 0.006506825797259808 H 0.0012264391407370567 0.9226153492927552 0.06943922489881517 6.7179134930484e-05 6.942309119040146e-05 0.0007373981061391532 0.004379472695291042 0.0014654245460405946 -65.43418884277344 -45.06970977783203 0.00015517696738243103 H 0.6272189349112426 H 0.5739644970414202 NA NA H 0.621301775147929 H 0.5798816568047337 NA NA H 0.5976331360946746 NA NA H 0.5680473372781065 H 0.5562130177514792 NA NA NA NA NA NA H 0.5384615384615384 NA NA H 0.591715976331361 H 0.5443786982248521 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7734022449208592e-05 1.920338979357311e-05 1.1931800145248415e-05 8.871895651326571e-06 3 251430 2.7915000828215852e-05 1.7031137575508e-05 4 143292 aTt/aCt aTt/aCt 0 0 NA NA NA NA NA NA D1097G Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.06730461120605469 9.69859447479248 H 0.9932200908660888 2.9728618756053038e-05 0.006750144995748997 H 0.0011227148352190852 0.9517737030982972 0.04132520779967308 2.6094790882780217e-05 7.088575785019203e-06 0.0006226862315088508 0.0035802118945866828 0.001542279147543013 -68.18381500244139 -39.23843002319336 0.00011296647426206621 H 0.0920245398773006 H 0.17791411042944785 NA NA H 0.098159509202454 H 0.294478527607362 NA NA H 0.196319018404908 NA NA H 0.2699386503067485 H 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA H 0.15337423312883436 NA NA H 0.15337423312883436 H 0.22085889570552147 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977119831688469e-06 8.665322530724976e-06 3.977119831688469e-06 8.665322530724976e-06 1 251438 NA NA NA NA gAc/gGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D1097N Patched NA Lumenal|5 NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.06730461120605469 9.69859447479248 H 0.9932200908660888 2.9728618756053038e-05 0.006750144995748997 H 0.0011227148352190852 0.9517737030982972 0.04132520779967308 2.6094790882780217e-05 7.088575785019203e-06 0.0006226862315088508 0.0035802118945866828 0.001542279147543013 -68.18381500244139 -39.23843002319336 0.00011296647426206621 H 0.0920245398773006 H 0.17791411042944785 NA NA H 0.098159509202454 H 0.294478527607362 NA NA H 0.196319018404908 NA NA H 0.2699386503067485 H 0.2699386503067485 NA NA NA NA NA NA H 0.15337423312883436 NA NA H 0.15337423312883436 H 0.22085889570552147 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 597436 pathogenic 1 1.0137343851806347e-05 1.8380822087230938e-05 3.977279902755981e-06 8.887616860950854e-06 1 251428 2.0956700609531254e-05 1.6089278639372837e-05 3 143152 Gac/Aac Gac/Aac 0 0 NA NA NA NA NA NA T1098A Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.030921876430511475 4.288864260911941 H 0.9959940910339355 5.0333102990407503e-05 0.003955546300858259 H 0.0008908592863008381 0.9753055572509766 0.019578449428081512 2.653817318787333e-05 1.3970824511488901e-05 0.00043346185702830553 0.0029043208342045546 0.0008468216401524843 -66.88388061523439 -41.36792755126953 3.2173487852560356e-05 H 0.17605633802816897 H 0.04929577464788732 NA NA H 0.16901408450704225 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.056338028169014086 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.04225352112676056 NA NA NA NA NA NA H 0.04225352112676056 NA NA H 0.04929577464788732 H 0.028169014084507043 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.977089818363311e-06 9.947322889262853e-06 3.977089818363311e-06 9.947322889262853e-06 1 251440 NA NA NA NA Act/Gct NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T1098I Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.030921876430511475 4.288864260911941 H 0.9959940910339355 5.0333102990407503e-05 0.003955546300858259 H 0.0008908592863008381 0.9753055572509766 0.019578449428081512 2.653817318787333e-05 1.3970824511488901e-05 0.00043346185702830553 0.0029043208342045546 0.0008468216401524843 -66.88388061523439 -41.36792755126953 3.2173487852560356e-05 H 0.17605633802816897 H 0.04929577464788732 NA NA H 0.16901408450704225 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.056338028169014086 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.04225352112676056 NA NA NA NA NA NA H 0.04225352112676056 NA NA H 0.04929577464788732 H 0.028169014084507043 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 813912 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I1099V Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.2247699797153473 41.58244624733925 H 0.9985020160675048 5.937858804827556e-05 0.0014386360999196768 H 0.0006223057862371206 0.9796619415283204 0.017554473131895062 1.7421731172362342e-05 1.5573950804537162e-05 0.0001195087970700115 0.0017902239924296735 0.00021862307039555162 -66.63040161132811 -43.344200134277344 3.5566732549341395e-05 H 0.6863905325443787 H 0.6568047337278107 NA NA H 0.6745562130177515 H 0.6923076923076923 NA NA H 0.6804733727810651 NA NA H 0.6745562130177515 H 0.6686390532544378 NA NA NA NA NA NA H 0.6863905325443787 NA NA H 0.6923076923076923 H 0.6745562130177515 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.954179636726622e-06 8.410976935349355e-06 7.954179636726622e-06 8.410976935349355e-06 2 251440 NA NA NA NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N1101S Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.018857955932617188 2.7608047485351563 H 0.9969899654388428 4.5132324885344126e-05 0.002964819548651576 H 0.0017143961740657687 0.9782249927520752 0.01593688316643238 2.847937139449641e-05 1.0267642210237684e-05 0.00038398546166718006 0.003255354240536689 0.00044565147254616017 -66.69763946533203 -39.652381896972656 2.969496563309804e-05 H 0.21019108280254775 H 0.012738853503184714 NA NA H 0.2229299363057325 H 0.025477707006369428 NA NA H 0.0 NA NA H 0.025477707006369428 H 0.025477707006369428 NA NA NA NA NA NA H 0.025477707006369428 NA NA H 0.012738853503184714 H 0.050955414012738856 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9986799644539124e-06 1.525696363664038e-05 NA NA NA NA 6.9986799644539124e-06 1.525696363664038e-05 1 142884 NA aAc/aGc NA 0 NA NA NA NA NA NA L1102= Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.04489812254905701 8.220846238732339 H 0.9977815747261048 1.261272427655058e-05 0.002205800730735064 H 0.0005613546236418189 0.9861495494842528 0.010604770854115486 4.3875679693883285e-06 3.303953917566105e-06 0.00019559435895644128 0.002064792206510901 0.000416187773225829 -65.0208740234375 -41.77038955688477 2.4213679353124465e-05 H 0.08536585365853659 H 0.12804878048780488 NA NA H 0.08536585365853659 H 0.07926829268292683 NA NA H 0.1097560975609756 NA NA H 0.14634146341463414 H 0.12804878048780488 NA NA NA NA NA NA H 0.09146341463414634 NA NA H 0.1097560975609756 H 0.1524390243902439 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.99 0.0 0.03 0.0 3306C>A L1102F Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.04489812254905701 8.220846238732339 H 0.9977815747261048 1.261272427655058e-05 0.002205800730735064 H 0.0005613546236418189 0.9861495494842528 0.010604770854115486 4.3875679693883285e-06 3.303953917566105e-06 0.00019559435895644128 0.002064792206510901 0.000416187773225829 -65.0208740234375 -41.77038955688477 2.4213679353124465e-05 H 0.08536585365853659 H 0.12804878048780488 NA NA H 0.08536585365853659 H 0.07926829268292683 NA NA H 0.1097560975609756 NA NA H 0.14634146341463414 H 0.12804878048780488 NA NA NA NA NA NA H 0.09146341463414634 NA NA H 0.1097560975609756 H 0.1524390243902439 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976999778387835e-06 8.335281411638296e-06 3.976999778387835e-06 8.335281411638296e-06 1 251446 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1103S Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.2556235790252685 20.11757566928864 H 0.998906135559082 5.144082933838945e-06 0.0010887481039389966 H 0.0004759955918416381 0.9831436276435852 0.015004522167146206 1.6177003772099854e-06 1.1044148777727971e-06 8.323683141497895e-05 0.0011507740709930658 0.00013914218288846314 -66.63557434082031 -43.54556655883789 5.519518163055182e-05 H 0.3809523809523809 H 0.5595238095238095 NA NA H 0.3690476190476191 H 0.4404761904761905 NA NA H 0.5238095238095238 NA NA H 0.5714285714285714 H 0.5714285714285714 NA NA NA NA NA NA H 0.4523809523809524 NA NA H 0.5357142857142857 H 0.5595238095238095 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.095849959005136e-05 1.39823048829549e-05 NA NA NA NA 2.095849959005136e-05 1.39823048829549e-05 3 143140 NA Ggt/Agt NA 0 0.43 0.43 0.0 0.0 0.0 3307G>A V1104E Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.2810685634613037 43.20023820400237 H 0.9983658194541932 3.321843541925773e-05 0.0016009729588404298 H 0.0005782322259619832 0.987880289554596 0.009802069514989851 1.2223747035022825e-05 1.1853697287733667e-05 0.0001342765026492998 0.0013178815133869648 0.0002632400719448924 -67.11042785644531 -44.0058708190918 8.654353587189689e-05 H 0.323943661971831 H 0.2323943661971831 NA NA H 0.323943661971831 H 0.35211267605633795 NA NA H 0.20422535211267606 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2746478873239437 H 0.3661971830985916 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.67 0.0 0.0 0.67 0.0 3311T>A V1104M Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.2810685634613037 43.20023820400237 H 0.9983658194541932 3.321843541925773e-05 0.0016009729588404298 H 0.0005782322259619832 0.987880289554596 0.009802069514989851 1.2223747035022825e-05 1.1853697287733667e-05 0.0001342765026492998 0.0013178815133869648 0.0002632400719448924 -67.11042785644531 -44.0058708190918 8.654353587189689e-05 H 0.323943661971831 H 0.2323943661971831 NA NA H 0.323943661971831 H 0.35211267605633795 NA NA H 0.20422535211267606 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.31690140845070425 NA NA NA NA NA NA H 0.2535211267605634 NA NA H 0.2746478873239437 H 0.3661971830985916 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.0 0.0 0.31 0.0 3310G>A L1106= Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.09063449501991272 16.59517603814602 H 0.9987426400184632 3.746697302631219e-06 0.0012536431895568967 H 0.0003419351996853948 0.9954859614372252 0.0029735383577644825 8.506967787980102e-07 9.864340881904354e-07 9.052166569745168e-05 0.0008664319757372143 0.0002397045464022085 -64.08018493652344 -43.0319938659668 7.83957148087211e-05 H 0.3597560975609756 H 0.22560975609756095 NA NA H 0.36585365853658536 H 0.2378048780487805 NA NA H 0.17682926829268292 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.25 NA NA NA NA NA NA H 0.2378048780487805 NA NA H 0.27439024390243905 H 0.17073170731707318 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.97 0.97 0.0 0.0 0.0 3318G>A L1106Q Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.09063449501991272 16.59517603814602 H 0.9987426400184632 3.746697302631219e-06 0.0012536431895568967 H 0.0003419351996853948 0.9954859614372252 0.0029735383577644825 8.506967787980102e-07 9.864340881904354e-07 9.052166569745168e-05 0.0008664319757372143 0.0002397045464022085 -64.08018493652344 -43.0319938659668 7.83957148087211e-05 H 0.3597560975609756 H 0.22560975609756095 NA NA H 0.36585365853658536 H 0.2378048780487805 NA NA H 0.17682926829268292 NA NA H 0.2378048780487805 H 0.25 NA NA NA NA NA NA H 0.2378048780487805 NA NA H 0.27439024390243905 H 0.17073170731707318 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.61 0.61 0.0 0.0 0.0 3317T>A A1108T Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.25334870815277105 27.919027638435363 H 0.9993971586227416 5.076392426417441e-06 0.000597684527747333 H 0.00037763747968710964 0.9944154024124146 0.0044242958538234225 2.109779643433285e-06 1.5622416640326264e-06 5.432834586827085e-05 0.0006174750742502513 0.00010724501771619543 -67.25679779052734 -43.74917984008789 6.89683511154726e-05 H 0.10377358490566037 H 0.07547169811320754 NA NA H 0.10377358490566037 H 0.11320754716981132 NA NA H 0.08490566037735849 NA NA H 0.2358490566037736 H 0.2452830188679245 NA NA NA NA NA NA H 0.10377358490566037 NA NA H 0.07547169811320754 H 0.2358490566037736 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.2668336796051673e-05 1.841148376530476e-05 1.5906300177448433e-05 9.862298444494859e-06 4 251472 6.982660124776884e-06 1.5547276412021332e-05 1 143212 Gcg/Acg Gcg/Acg 1 0 NA NA NA NA NA NA A1108V Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.25334870815277105 27.919027638435363 H 0.9993971586227416 5.076392426417441e-06 0.000597684527747333 H 0.00037763747968710964 0.9944154024124146 0.0044242958538234225 2.109779643433285e-06 1.5622416640326264e-06 5.432834586827085e-05 0.0006174750742502513 0.00010724501771619543 -67.25679779052734 -43.74917984008789 6.89683511154726e-05 H 0.10377358490566037 H 0.07547169811320754 NA NA H 0.10377358490566037 H 0.11320754716981132 NA NA H 0.08490566037735849 NA NA H 0.2358490566037736 H 0.2452830188679245 NA NA NA NA NA NA H 0.10377358490566037 NA NA H 0.07547169811320754 H 0.2358490566037736 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953300155350007e-06 8.35044764121701e-06 7.953300155350007e-06 8.35044764121701e-06 2 251468 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1109V Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.02738240361213684 5.065744668245316 H 0.9990723133087158 1.4247282706492115e-05 0.0009133173734880985 H 0.0006467759958468378 0.9946405291557312 0.003645335556939244 5.472875272971578e-06 4.4906387302035e-06 0.00010206046135863289 0.00078140280675143 0.0001739683502819389 -68.68199920654297 -42.3056869506836 6.460871372837573e-05 H 0.017751479289940832 H 0.0 NA NA H 0.01183431952662722 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.01183431952662722 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.005917159763313609 H 0.04142011834319527 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.986850166867952e-06 1.5012444932536013e-05 NA NA NA NA 6.986850166867952e-06 1.5012444932536013e-05 1 143126 NA Ata/Gta NA 0 NA NA NA NA NA NA F1110L Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.172867089509964 34.69442486464977 H 0.9987831711769104 2.4324267542397138e-06 0.0012144586071372032 H 0.0003758969542104752 0.9968013763427734 0.0018416089005768301 7.616146149302948e-07 7.030777169347857e-07 7.505631219828501e-05 0.0006401220452971755 0.00026451487792655826 -65.40855407714844 -43.86494827270508 0.00011139189155073835 H 0.4060913705583756 H 0.28426395939086296 NA NA H 0.41116751269035534 H 0.4010152284263959 NA NA H 0.2385786802030457 NA NA H 0.27918781725888325 H 0.3299492385786802 NA NA NA NA NA NA H 0.2436548223350254 NA NA H 0.3147208121827411 H 0.3604060913705584 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953420208650641e-06 8.494833760102434e-06 7.953420208650641e-06 8.494833760102434e-06 2 251464 NA NA NA NA Ttt/Ctt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L1111Q Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.4694211184978485 85.95100679695607 H 0.9987531900405884 2.3379361664410685e-06 0.0012443767627701163 H 0.0004746590566355736 0.9933941960334778 0.004979418125003575 6.784385959690553e-07 8.350924645128543e-07 7.315389666473493e-05 0.0007822477491572499 0.0002947989851236344 -64.52230834960939 -46.27619934082031 0.00023984392464626583 H 0.725609756097561 H 0.6158536585365854 NA NA H 0.725609756097561 H 0.6768292682926829 NA NA H 0.5304878048780488 NA NA H 0.6829268292682927 H 0.6036585365853658 NA NA NA NA NA NA H 0.5487804878048781 NA NA H 0.6219512195121951 H 0.5975609756097561 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.49 0.49 0.0 0.1 0.0 3332T>A T1113S Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.025116443634033203 3.4836507320404047 H 0.9936760067939758 6.260679219849408e-05 0.0062613454647362215 H 0.002925076754763723 0.9826611876487732 0.00822432804852724 2.982317710120697e-05 3.3136184356408194e-05 0.0005822526873089372 0.0035183904692530628 0.0020258633885532613 -70.9824447631836 -39.978511810302734 0.0001721219450701028 T 0.15492957746478872 H 0.014084507042253518 NA NA T 0.15492957746478872 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.028169014084507043 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.0 0.0 0.41 0.0 3338C>G M1114I Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA b 0.19776275753974915 39.57232778370381 H 0.9930084943771362 4.284092574380338e-05 0.0069486950524151325 H 0.003978637047111988 0.9761201739311218 0.012966018170118332 1.4899895177222787e-05 1.829449502110947e-05 0.0004817110893782229 0.0047194072976708395 0.0017008663853630426 -66.0816650390625 -40.14900588989258 0.0002512485953047872 T 0.2074468085106383 H 0.15425531914893614 NA NA T 0.2127659574468085 H 0.2978723404255319 NA NA H 0.18617021276595744 NA NA H 0.2553191489361702 H 0.23404255319148934 NA NA NA NA NA NA H 0.12234042553191488 NA NA H 0.26063829787234044 H 0.2872340425531915 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.0669821370432985e-06 1.7876124487920457e-05 3.976740117650479e-06 1.0128506905947127e-05 1 251462 6.9808002081117584e-06 1.4729873542016946e-05 1 143250 atG/atA atG/atA 0 0 NA NA NA NA NA NA V1115A Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.5188008546829224 79.73969136476516 H 0.9800598621368408 0.00010844962525879964 0.01983168721199036 H 0.007568518165498972 0.9520420432090759 0.02212577313184738 2.321245483472012e-05 5.0494618335505954e-05 0.001615988090634346 0.0130421482026577 0.0035318445879966025 -67.12273406982422 -43.584144592285156 0.0007354683475568893 T 0.6267605633802817 H 0.6197183098591549 NA NA T 0.6408450704225352 H 0.7676056338028169 NA NA H 0.6690140845070423 NA NA H 0.528169014084507 H 0.4859154929577465 NA NA NA NA NA NA H 0.5915492957746479 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.4788732394366197 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976680091000162e-06 9.874005553561682e-06 3.976680091000162e-06 9.874005553561682e-06 1 251466 NA NA NA NA gTc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1115F Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.5188008546829224 79.73969136476516 H 0.9800598621368408 0.00010844962525879964 0.01983168721199036 H 0.007568518165498972 0.9520420432090759 0.02212577313184738 2.321245483472012e-05 5.0494618335505954e-05 0.001615988090634346 0.0130421482026577 0.0035318445879966025 -67.12273406982422 -43.584144592285156 0.0007354683475568893 T 0.6267605633802817 H 0.6197183098591549 NA NA T 0.6408450704225352 H 0.7676056338028169 NA NA H 0.6690140845070423 NA NA H 0.528169014084507 H 0.4859154929577465 NA NA NA NA NA NA H 0.5915492957746479 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.4788732394366197 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 92712 conflict 1 0.0014062098780336662 1.8588964500852987e-05 0.0006879770080558956 9.408059613266452e-06 173 251462 0.0026672999374568467 1.6032405169755326e-05 382 143216 Gtc/Ttc Gtc/Ttc 0 2 NA NA NA NA NA NA V1115I Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.5188008546829224 79.73969136476516 H 0.9800598621368408 0.00010844962525879964 0.01983168721199036 H 0.007568518165498972 0.9520420432090759 0.02212577313184738 2.321245483472012e-05 5.0494618335505954e-05 0.001615988090634346 0.0130421482026577 0.0035318445879966025 -67.12273406982422 -43.584144592285156 0.0007354683475568893 T 0.6267605633802817 H 0.6197183098591549 NA NA T 0.6408450704225352 H 0.7676056338028169 NA NA H 0.6690140845070423 NA NA H 0.528169014084507 H 0.4859154929577465 NA NA NA NA NA NA H 0.5915492957746479 NA NA H 0.5633802816901409 H 0.4788732394366197 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0134848860538201e-05 1.7541291590633746e-05 3.976740117650479e-06 9.327448089979447e-06 1 251462 2.0947400116710924e-05 1.4855827906797285e-05 3 143216 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA L1116V Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA NA HELIX|49 NA NA NA NA e 0.34262901544570923 62.73537272810936 H 0.9168464541435242 0.00012167759268777444 0.08303183317184447 H 0.0103430338203907 0.8787027597427368 0.02538178861141205 3.728546653292142e-05 3.703929542098194e-05 0.00543661043047905 0.0734044685959816 0.006657029036432505 -74.66182708740234 -31.084177017211914 0.0007509097340516746 T 0.23170731707317074 H 0.17073170731707318 NA NA T 0.22560975609756095 H 0.22560975609756095 NA NA H 0.3109756097560976 NA NA H 0.0975609756097561 H 0.0975609756097561 NA NA NA NA NA NA T 0.2926829268292683 NA NA H 0.1524390243902439 H 0.13414634146341464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 8.571013955281991e-06 3.9766500776750036e-06 8.571013955281991e-06 1 251468 NA NA NA NA Ctc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L1117Q Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA STRAND|35 NA NA NA NA NA b 0.19849592447280884 36.3446037709713 C 0.4202336966991425 0.001621265895664692 0.5781450271606445 T 0.01811651885509491 0.4297963380813599 0.016023149713873863 0.0015779436798766255 0.00032580940751358867 0.05731210112571716 0.4383682906627655 0.03847985714673996 -94.14603424072266 -2.5624608993530282 0.0012204028898850086 T 0.3353658536585366 T 0.042682926829268296 NA NA T 0.3353658536585366 H 0.2195121951219512 NA NA S 0.042682926829268296 NA NA T 0.054878048780487805 T 0.11585365853658534 NA NA NA NA NA NA T 0.07317073170731707 NA NA T 0.04878048780487805 T 0.07317073170731707 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9776901909790484e-06 1.5243889923444062e-05 NA NA NA NA 6.9776901909790484e-06 1.5243889923444062e-05 1 143314 NA cTg/cAg NA 0 NA NA NA NA NA NA G1118S Patched TRANSMEM|9 NA NA NA NA STRAND|35 NA NA NA NA NA e 0.4724166393280029 37.179189515113826 C 0.02866406552493572 0.00269077206030488 0.9686452150344848 T 0.011154413223266602 0.019789509475231167 0.0033641201443970203 0.002159051131457091 0.0013855262659490108 0.13055473566055298 0.4811828434467316 0.35040974617004395 80.66120147705078 30.27400779724121 0.0021028774790465827 - 0.5238095238095238 - 0.2023809523809524 NA NA - 0.5119047619047619 - 0.5357142857142857 NA NA S 0.6071428571428571 NA NA - 0.09523809523809523 - 0.17857142857142858 NA NA NA NA NA NA T 0.75 NA NA - 0.14285714285714285 - 0.14285714285714285 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9769302020431505e-06 7.303748975099521e-06 3.9769302020431505e-06 7.303748975099521e-06 1 251450 NA NA NA NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA C1119R Patched NA Cytoplasmic|5 NA NA NA STRAND|35 NA NA NA NA NA e 0.262795627117157 36.89650604724884 C 0.020550226792693138 0.01080108992755413 0.9686486721038818 C 0.0065960525535047046 0.011744160205125807 0.000767796125728637 0.009422942996025084 0.006933060474693775 0.2440390586853028 0.046245086938142776 0.674251914024353 -97.14347839355469 129.00306701660156 0.002699613571166992 - 0.2962962962962963 S 0.6222222222222222 NA NA - 0.3111111111111111 S 0.7481481481481481 NA NA S 0.6518518518518519 NA NA S 0.4666666666666667 S 0.5555555555555556 NA NA NA NA NA NA S 0.6666666666666666 NA NA S 0.8 S 0.5481481481481482 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976870175392833e-06 9.074864777641875e-06 3.976870175392833e-06 9.074864777641875e-06 1 251454 NA NA NA NA Tgt/Cgt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L1121I Patched NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA e 0.5917012691497803 108.34050238132477 H 0.8822175860404968 0.0009696265333332119 0.11681273579597473 H 0.026675265282392502 0.8520675897598267 0.005172239150851965 0.0004322528257034719 0.000379915873054415 0.020570358261466026 0.07331877201795578 0.0213836133480072 -63.64617538452149 -38.8292350769043 0.000988229177892208 T 0.38414634146341453 H 0.5853658536585366 NA NA T 0.38414634146341453 H 0.5243902439024389 NA NA H 0.4146341463414634 NA NA H 0.6219512195121951 H 0.6707317073170732 NA NA NA NA NA NA H 0.4878048780487805 NA NA H 0.6036585365853658 H 0.6280487804878049 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1931800145248415e-05 8.964815901957108e-06 1.1931800145248415e-05 8.964815901957108e-06 3 251428 NA NA NA NA Ctc/Atc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA W1122R Patched NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA e 0.3740123510360718 89.94997042417526 H 0.9332969188690186 0.0007934407331049442 0.06590960174798965 H 0.043946951627731316 0.8818212151527405 0.00466628186404705 0.000292341283056885 0.00036297240876592696 0.007641656789928675 0.046084221452474594 0.015184384770691397 -66.98538970947266 -36.18729782104492 0.0013749385252594948 H 0.22026431718061676 H 0.5947136563876652 NA NA H 0.22466960352422907 H 0.6960352422907489 NA NA H 0.6211453744493393 NA NA H 0.5550660792951542 H 0.5066079295154186 NA NA NA NA NA NA H 0.6255506607929515 NA NA H 0.5550660792951542 H 0.4757709251101322 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 498583 VUS 1 1.5200325203024786e-05 1.7719520807395607e-05 7.954439752211329e-06 9.190252212404827e-06 2 251432 2.791420047287829e-05 1.5149939997112664e-05 4 143296 Tgg/Cgg Tgg/Cgg 0 0 NA NA NA NA NA NA V1125F Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA e 0.3277726769447327 50.37866044640541 H 0.994706928730011 0.0001590093452250585 0.00513406191021204 H 0.0037791237700730562 0.9694238901138306 0.020234193652868267 4.877665924141184e-05 7.315319817280397e-05 0.0006011513178236783 0.004855667240917683 0.0009840446291491394 -66.14506530761719 -41.707366943359375 0.00011118273687316103 H 0.5774647887323944 H 0.3873239436619718 NA NA H 0.5915492957746479 H 0.38028169014084506 NA NA H 0.4014084507042254 NA NA H 0.4366197183098591 H 0.39436619718309857 NA NA NA NA NA NA H 0.4295774647887324 NA NA H 0.38028169014084506 H 0.2887323943661972 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.579919939511456e-05 8.454547761491365e-06 3.579919939511456e-05 8.454547761491365e-06 9 251402 NA NA NA NA Gtc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1126M Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.07193243503570558 13.30750048160553 H 0.9955193996429444 0.00015057402197271585 0.0043299449607729894 H 0.003606358775869012 0.9607858657836914 0.029690627008676525 3.2367832318414e-05 6.357555685099214e-05 0.0004985696286894381 0.00441689882427454 0.000905701657757163 -66.08336639404297 -40.85771942138672 6.665426190011202e-05 H 0.2307692307692308 H 0.04142011834319527 NA NA H 0.242603550295858 H 0.17159763313609466 NA NA H 0.04142011834319527 NA NA H 0.05325443786982249 H 0.04733727810650888 NA NA NA NA NA NA H 0.07100591715976333 NA NA H 0.02958579881656805 H 0.09467455621301776 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979630143177928e-06 1.5033995364414858e-05 NA NA NA NA 6.979630143177928e-06 1.5033995364414858e-05 1 143274 NA atC/atG NA 0 NA NA NA NA NA NA I1126V Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.07193243503570558 13.30750048160553 H 0.9955193996429444 0.00015057402197271585 0.0043299449607729894 H 0.003606358775869012 0.9607858657836914 0.029690627008676525 3.2367832318414e-05 6.357555685099214e-05 0.0004985696286894381 0.00441689882427454 0.000905701657757163 -66.08336639404297 -40.85771942138672 6.665426190011202e-05 H 0.2307692307692308 H 0.04142011834319527 NA NA H 0.242603550295858 H 0.17159763313609466 NA NA H 0.04142011834319527 NA NA H 0.05325443786982249 H 0.04733727810650888 NA NA NA NA NA NA H 0.07100591715976333 NA NA H 0.02958579881656805 H 0.09467455621301776 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.6779376472994458e-05 NA NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.6779376472994458e-05 1 143288 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA M1127V Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.04976281523704529 9.957539328932763 H 0.99321186542511 6.093667980167083e-05 0.00672709196805954 H 0.006206176243722439 0.93568617105484 0.0506165623664856 1.8820463083102368e-05 2.3853906895965328e-05 0.0007822122424840928 0.004879641346633434 0.0017865274567157032 -68.49070739746094 -37.4871711730957 4.2603649490047246e-05 H 0.031914893617021274 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.031914893617021274 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.955580258567352e-06 9.64636246564805e-06 7.955580258567352e-06 9.64636246564805e-06 2 251396 NA NA NA NA Atg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1131V Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.1672263741493225 30.936879217624664 H 0.9945747256278992 7.43300643080147e-06 0.005417889915406704 H 0.0015950690722092984 0.9764061570167542 0.01611606404185295 2.7014175429940224e-06 2.2564861410501184e-06 0.000847923569381237 0.0039935945533216 0.0010363036999478936 -64.07154083251953 -42.950340270996094 1.5694173271185725e-05 H 0.08284023668639054 H 0.0 NA NA H 0.08284023668639054 H 0.005917159763313609 NA NA H 0.005917159763313609 NA NA H 0.0 H 0.01183431952662722 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.005917159763313609 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.980410034884699e-06 1.645978774281525e-05 NA NA NA NA 6.980410034884699e-06 1.645978774281525e-05 1 143258 NA Atc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA A1132T Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA e 0.39436036348342896 43.45851205587388 H 0.9967194199562072 3.222735904273577e-05 0.003248349763453007 H 0.002687562489882111 0.9789727330207824 0.014434870332479475 1.5880983482929878e-05 1.1539940715010745e-05 0.0003094346320722252 0.003003204939886928 0.0005647934158332647 -64.94348907470703 -43.01461410522461 0.00014568743063136935 H 0.5471698113207547 H 0.33962264150943394 NA NA H 0.5660377358490566 H 0.3113207547169811 NA NA H 0.3490566037735849 NA NA H 0.3490566037735849 H 0.33962264150943394 NA NA NA NA NA NA H 0.3113207547169811 NA NA H 0.330188679245283 H 0.4056603773584906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7745781879105135e-05 1.8678227874336984e-05 1.9901899577234868e-05 8.903778943113921e-06 5 251232 1.3963799574412405e-05 1.6419467624068093e-05 2 143228 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0 NA NA NA NA NA NA A1132V Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA e 0.39436036348342896 43.45851205587388 H 0.9967194199562072 3.222735904273577e-05 0.003248349763453007 H 0.002687562489882111 0.9789727330207824 0.014434870332479475 1.5880983482929878e-05 1.1539940715010745e-05 0.0003094346320722252 0.003003204939886928 0.0005647934158332647 -64.94348907470703 -43.01461410522461 0.00014568743063136935 H 0.5471698113207547 H 0.33962264150943394 NA NA H 0.5660377358490566 H 0.3113207547169811 NA NA H 0.3490566037735849 NA NA H 0.3490566037735849 H 0.33962264150943394 NA NA NA NA NA NA H 0.3113207547169811 NA NA H 0.330188679245283 H 0.4056603773584906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979209850513144e-06 9.428177932401113e-06 3.979209850513144e-06 9.428177932401113e-06 1 251306 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1134F Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.01864489912986756 2.865720996260643 H 0.998768150806427 8.31435954751214e-06 0.0012234682217240336 H 0.0008433062466792762 0.9950008988380432 0.002897382713854313 2.120131057381513e-06 2.9649986572621856e-06 0.00012056423292960972 0.0007926134276203811 0.00034014665288850665 -65.72099304199219 -41.06202697753906 2.3151329514803365e-05 H 0.02112676056338028 H 0.035211267605633804 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.02112676056338028 NA NA H 0.0 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.04225352112676056 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.028169014084507043 H 0.056338028169014086 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.980229848821183e-06 8.7809190194356e-06 3.980229848821183e-06 8.7809190194356e-06 1 251242 NA NA NA NA Gtc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M1138L Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.04070931673049927 8.145934277772904 H 0.9935563206672668 2.800979018502403e-05 0.006415692158043385 H 0.00219721207395196 0.9824981093406676 0.009258648380637169 1.1474811799416784e-05 9.367226994072553e-06 0.0006100698374211787 0.003766235196962953 0.0016489073168486355 -67.70486450195311 -39.18229293823242 5.041015174356289e-05 H 0.0 H 0.02127659574468085 NA NA H 0.0 H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.015957446808510637 NA NA H 0.010638297872340424 H 0.015957446808510637 NA NA NA NA NA NA H 0.015957446808510637 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.015957446808510637 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.980730070907157e-06 8.554402644009802e-06 3.980730070907157e-06 8.554402644009802e-06 1 251210 NA NA NA NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1141G Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.06673485040664673 10.2571465075016 H 0.9951992630958556 0.00012026898912154138 0.004680524114519358 H 0.004950313363224268 0.9795136451721193 0.010231022723019123 3.5169323382433504e-05 5.984335075481794e-05 0.00044345110654830927 0.0032981119584292173 0.0014683017507195473 -67.84469604492189 -39.66885757446289 0.00013280921848490834 H 0.2323943661971831 H 0.2535211267605634 NA NA H 0.22535211267605634 H 0.2605633802816901 NA NA H 0.24647887323943665 NA NA H 0.2676056338028169 H 0.2887323943661972 NA NA NA NA NA NA H 0.28169014084507044 NA NA H 0.29577464788732394 H 0.2605633802816901 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.07256527219798e-06 1.965908945625864e-05 3.982509952038527e-06 8.831773591426e-06 1 251098 6.9842199081904255e-06 1.7563586577888063e-05 1 143180 gTt/gGt gTt/gGt 0 0 0.99 0.0 0.0 0.99 0.0 3422T>G M1142I Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.05696746706962585 11.399190160632136 H 0.9942051768302916 9.33833871386014e-05 0.005701418034732342 H 0.007753896992653607 0.978107750415802 0.008078863844275475 2.04573279916076e-05 4.4056501792510965e-05 0.00047064959653653204 0.004096203483641148 0.0014281619805842636 -67.53248596191406 -39.73441696166992 6.025351831340231e-05 H 0.12234042553191488 H 0.010638297872340424 NA NA H 0.12234042553191488 H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.010638297872340424 NA NA NA NA NA NA H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.010638297872340424 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.983399892604211e-06 9.810688741445684e-06 3.983399892604211e-06 9.810688741445684e-06 1 251042 NA NA NA NA atG/atA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M1142T Patched TRANSMEM|10 NA NA NA NA NA HELIX|50 NA NA NA NA b 0.05696746706962585 11.399190160632136 H 0.9942051768302916 9.33833871386014e-05 0.005701418034732342 H 0.007753896992653607 0.978107750415802 0.008078863844275475 2.04573279916076e-05 4.4056501792510965e-05 0.00047064959653653204 0.004096203483641148 0.0014281619805842636 -67.53248596191406 -39.73441696166992 6.025351831340231e-05 H 0.12234042553191488 H 0.010638297872340424 NA NA H 0.12234042553191488 H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.010638297872340424 NA NA NA NA NA NA H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.010638297872340424 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 372435 pathogenic 2 3.982760063081514e-06 9.382311336849026e-06 3.982760063081514e-06 9.382311336849026e-06 1 251082 NA NA NA NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1146S Patched NA Lumenal|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6340106725692749 49.896639931201925 C 0.002221896313130856 7.11640968802385e-05 0.9977068901062012 T 0.0007589911110699178 0.0007894437876529993 0.00016813816910143942 3.3180025639012456e-05 2.251455771329347e-05 0.03117101453244686 0.8671767115592957 0.09988007694482803 75.77118682861328 25.06987571716309 0.00017082536942325532 S 0.6428571428571429 T 0.5595238095238095 NA NA S 0.6547619047619048 T 0.5 NA NA T 0.4523809523809524 NA NA T 0.5595238095238095 T 0.5238095238095238 NA NA NA NA NA NA T 0.4523809523809524 NA NA T 0.6071428571428571 T 0.6428571428571429 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7767683338883303e-05 1.734461991880133e-05 1.5948999134707265e-05 8.697153984588338e-06 4 250800 2.0953499188181013e-05 1.5006510343715453e-05 3 143174 Ggc/Agc Ggc/Agc 0 0 NA NA NA NA NA NA I1147T Patched NA Lumenal|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.14877355098724365 27.52310693264008 C 0.0004966083797626197 0.01810312829911709 0.9814002513885498 C 0.0001511451118858531 0.00011514830111991614 2.969558227050584e-05 0.008346018381416798 0.010104073211550713 0.07821634411811829 0.0022329650819301605 0.90080463886261 -108.12320709228516 139.31910705566406 0.0006271444144658744 - 0.1242603550295858 - 0.02366863905325444 NA NA - 0.1242603550295858 - 0.04733727810650888 NA NA - 0.0 NA NA - 0.01183431952662722 - 0.02958579881656805 NA NA NA NA NA NA - 0.035502958579881665 NA NA - 0.017751479289940832 - 0.02958579881656805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.979630143177928e-06 1.3563632114205702e-05 NA NA NA NA 6.979630143177928e-06 1.3563632114205702e-05 1 143274 NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA S1148R Patched NA Lumenal|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5321275591850281 62.3653499364853 C 0.00146535225212574 0.04820854589343071 0.9503260850906372 C 0.0004702476726379245 0.000301600230159238 5.919271188759013e-06 0.010816791094839571 0.027188105508685112 0.022145355120301247 0.003675494343042373 0.9353964328765868 -92.19193267822266 134.15531921386722 0.0003716354549396783 - 0.3615384615384615 - 0.16923076923076924 NA NA - 0.3692307692307693 - 0.08461538461538462 NA NA - 0.015384615384615384 NA NA B 0.16153846153846155 - 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA - 0.14615384615384616 NA NA - 0.1076923076923077 B 0.08461538461538462 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.988419848610647e-06 8.958788138919212e-06 3.988419848610647e-06 8.958788138919212e-06 1 250726 NA NA NA NA agT/agG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N1150K Patched NA Lumenal|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3037659525871277 44.47133545875551 C 0.005862596444785595 0.01412107888609171 0.98001629114151 C 0.0005801461520604789 0.002587912837043405 8.608275493315887e-06 0.007673987653106452 0.0058092791587114325 0.04622683674097061 0.0025505295488983393 0.934562623500824 -104.38333129882812 149.05409240722656 0.0004531027516350151 S 0.14012738853503184 S 0.01910828025477707 NA NA S 0.15286624203821655 - 0.0 NA NA S 0.03184713375796178 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA NA NA S 0.012738853503184714 NA NA S 0.0 S 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 551573 VUS 1 5.0813272406961125e-06 1.725091304127766e-05 3.994120106654009e-06 9.66988116147491e-06 1 250368 6.9817801886529205e-06 1.4285916109255167e-05 1 143230 aaC/aaA aaC/aaA 0 0 NA NA NA NA NA NA A1151T Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.20160123705863955 22.216456323862076 H 0.966208517551422 0.0001133756377384998 0.03367812559008598 H 0.009549321606755257 0.9539154767990112 0.0011662313481792808 5.859916564077139e-05 4.3003961764043204e-05 0.004826756659895182 0.024004265666008 0.006436320021748543 -61.07145309448242 -35.7722053527832 0.00022084733063820752 H 0.1509433962264151 T 0.02830188679245283 NA NA H 0.14150943396226415 H 0.03773584905660377 NA NA H 0.03773584905660377 NA NA H 0.1320754716981132 H 0.16981132075471694 NA NA NA NA NA NA H 0.02830188679245283 NA NA T 0.02830188679245283 H 0.1320754716981132 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 568770 pathogenic 2 1.01671519326745e-05 1.8159500207353392e-05 3.997120074927807e-06 9.227549344716218e-06 1 250180 2.094330011459533e-05 1.564032547205125e-05 3 143244 Gct/Act Gct/Act 0 0 NA NA NA NA NA NA V1152I Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.1822181046009064 28.006922677159306 H 0.9911043643951416 0.00013961235526949167 0.00875602476298809 H 0.007684379816055299 0.9797191619873048 0.0021717285271734 5.377066554501653e-05 5.757768667535856e-05 0.0008702113409526646 0.007733271922916173 0.0017099473625421526 -64.02079010009766 -39.34388732910156 0.00020410330034792423 H 0.4225352112676056 T 0.14084507042253522 NA NA H 0.4154929577464789 H 0.09859154929577464 NA NA H 0.1056338028169014 NA NA H 0.11971830985915492 H 0.13380281690140844 NA NA NA NA NA NA H 0.16901408450704225 NA NA T 0.035211267605633804 H 0.2183098591549296 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.626439779194019e-06 1.8121613018438835e-05 3.998210104327882e-06 9.774334552520434e-06 1 250112 1.3961000149720347e-05 1.5259595094413777e-05 2 143256 Gta/Ata Gta/Ata 0 0 NA NA NA NA NA NA L1154* Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.09146341463414634 H 0.0 NA NA H 0.09146341463414634 H 0.012195121951219513 NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.03048780487804878 H 0.04878048780487805 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.006097560975609756 H 0.03658536585365853 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 557189 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA V1155I Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.12479588389396667 19.18112735450268 H 0.9687277674674988 0.00047526546404697 0.030796902254223824 H 0.012518943287432194 0.913839876651764 0.03948598727583885 0.00013380806194618344 0.00018125270435120908 0.0029576504603028297 0.025466063991189003 0.005416372325271368 -69.30472564697266 -36.20368194580078 0.00023135199444368482 H 0.3028169014084507 H 0.0 NA NA H 0.30985915492957744 H 0.0 NA NA H 0.014084507042253518 NA NA H 0.04929577464788732 H 0.035211267605633804 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.08450704225352113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.094189173331244e-06 1.7684315726891116e-05 4.009460099041462e-06 8.930484453650702e-06 1 249410 6.983530056459131e-06 1.5263730545036214e-05 1 143194 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0 NA NA NA NA NA NA N1156D Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.0634615421295166 9.290769767761233 H 0.9933716058731079 1.4792462934565265e-05 0.006613539531826973 H 0.0016758118290454151 0.978718638420105 0.012922880239784721 5.920360763411736e-06 4.4215407797310036e-06 0.0009130380349233748 0.004501884337514639 0.0012574655702337625 -67.00392150878906 -41.40251159667969 3.1638715881854296e-05 H 0.050955414012738856 H 0.012738853503184714 NA NA H 0.050955414012738856 H 0.0 NA NA H 0.012738853503184714 NA NA H 0.006369426751592357 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.006369426751592357 NA NA H 0.0 H 0.012738853503184714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 4.013229954580312e-06 9.551617114474084e-06 4.013229954580312e-06 9.551617114474084e-06 1 249176 NA NA NA NA Aac/Gac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N1156I Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.0634615421295166 9.290769767761233 H 0.9933716058731079 1.4792462934565265e-05 0.006613539531826973 H 0.0016758118290454151 0.978718638420105 0.012922880239784721 5.920360763411736e-06 4.4215407797310036e-06 0.0009130380349233748 0.004501884337514639 0.0012574655702337625 -67.00392150878906 -41.40251159667969 3.1638715881854296e-05 H 0.050955414012738856 H 0.012738853503184714 NA NA H 0.050955414012738856 H 0.0 NA NA H 0.012738853503184714 NA NA H 0.006369426751592357 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.006369426751592357 NA NA H 0.0 H 0.012738853503184714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 552768 VUS 1 6.987049800954993e-06 1.6186159323856876e-05 NA NA NA NA 6.987049800954993e-06 1.6186159323856876e-05 1 143122 NA aAc/aTc NA 0 NA NA NA NA NA NA N1156S Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.0634615421295166 9.290769767761233 H 0.9933716058731079 1.4792462934565265e-05 0.006613539531826973 H 0.0016758118290454151 0.978718638420105 0.012922880239784721 5.920360763411736e-06 4.4215407797310036e-06 0.0009130380349233748 0.004501884337514639 0.0012574655702337625 -67.00392150878906 -41.40251159667969 3.1638715881854296e-05 H 0.050955414012738856 H 0.012738853503184714 NA NA H 0.050955414012738856 H 0.0 NA NA H 0.012738853503184714 NA NA H 0.006369426751592357 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.006369426751592357 NA NA H 0.0 H 0.012738853503184714 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 2959 pathogenic 2 1.785468150036057e-05 1.8335898968908167e-05 2.0085799405933358e-05 9.195466406024707e-06 5 248932 1.3974099601909986e-05 1.5863435585448648e-05 2 143122 aAc/aGc aAc/aGc 0 0 NA NA NA NA NA NA M1159I Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.06304439902305603 12.615184244513511 H 0.997780740261078 3.704937262227759e-05 0.0021822266280651093 H 0.0012992372503504155 0.980658769607544 0.015333069488406181 1.3739918358623981e-05 1.3521845176001081e-05 0.00020381610374897718 0.002013857010751963 0.00046402777661569417 -68.38588714599611 -41.29037857055664 4.1433035221416496e-05 H 0.1702127659574468 H 0.0 NA NA H 0.17553191489361702 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.04787234042553192 H 0.058510638297872335 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.010638297872340424 H 0.05319148936170213 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.0 0.0 0.45 0.08 3477G>A S1160R Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.030171811580657962 3.536136317253113 H 0.9956529140472412 7.061191718094051e-05 0.004276458639651537 H 0.0032402377109974627 0.9731780290603638 0.01844434253871441 2.622522151796147e-05 2.6017065465566706e-05 0.0005058409878984094 0.0035849476698786025 0.0009943506447598338 -69.402099609375 -38.48772430419922 5.416241765487939e-05 H 0.02307692307692308 H 0.015384615384615384 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.02307692307692308 NA NA NA NA NA NA H 0.007692307692307694 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.038461538461538464 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 3480C>G C1161S Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.20112460851669312 28.23789503574372 H 0.9887131452560424 0.0001714574609650299 0.011115393601357935 H 0.003767935326322913 0.9583454132080078 0.024868255481123924 6.547112570842728e-05 7.250808266690001e-05 0.0010077975457534194 0.009558981284499168 0.002313732635229826 -67.01551055908203 -39.61516952514648 0.00020903590484522288 H 0.05185185185185185 H 0.02962962962962963 NA NA H 0.06666666666666668 H 0.007407407407407408 NA NA H 0.014814814814814815 NA NA H 0.0 H 0.007407407407407408 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007407407407407408 H 0.007407407407407408 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 595173 VUS 1 6.97622999723535e-06 1.7433349682884805e-05 NA NA NA NA 6.97622999723535e-06 1.7433349682884805e-05 1 143344 NA tGt/tCt NA 0 0.78 0.78 0.0 0.0 0.0 3481T>A I1163N Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.0687917172908783 12.726467698812485 H 0.9810840487480164 0.0010875626467168331 0.017828358337283134 H 0.005577605683356524 0.9386444091796876 0.03691677376627922 0.00027468049665912986 0.0005513568175956607 0.002612857846543193 0.010912135243415829 0.004510167986154556 -69.79397583007811 -40.29551696777344 0.00010823373304447159 H 0.07100591715976333 H 0.02366863905325444 NA NA H 0.07100591715976333 H 0.07100591715976333 NA NA H 0.05325443786982249 NA NA H 0.07100591715976333 H 0.1242603550295858 NA NA NA NA NA NA H 0.05325443786982249 NA NA H 0.059171597633136085 H 0.07692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.619721839864054e-05 NA NA NA NA 6.978849796723806e-06 1.619721839864054e-05 1 143290 NA aTc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA V1165L Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.11189794540405272 17.198714208602905 H 0.9864808320999146 0.0005748329567722976 0.012944384478032587 H 0.0023436506744474173 0.9282628297805786 0.05601572245359422 0.00017728855891618878 0.00023006426636129615 0.0019122593803331254 0.008584171533584595 0.002474046777933836 -66.86390686035156 -44.961727142333984 0.0001756214624037966 H 0.04225352112676056 H 0.0 NA NA H 0.04225352112676056 T 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.986669980804437e-06 8.529503010505284e-06 3.986669980804437e-06 8.529503010505284e-06 1 250836 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1165M Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.11189794540405272 17.198714208602905 H 0.9864808320999146 0.0005748329567722976 0.012944384478032587 H 0.0023436506744474173 0.9282628297805786 0.05601572245359422 0.00017728855891618878 0.00023006426636129615 0.0019122593803331254 0.008584171533584595 0.002474046777933836 -66.86390686035156 -44.961727142333984 0.0001756214624037966 H 0.04225352112676056 H 0.0 NA NA H 0.04225352112676056 T 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.007042253521126761 H 0.014084507042253518 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 195723 conflict 1 7.61088122145974e-06 1.813390068150976e-05 3.986669980804437e-06 8.03693222550179e-06 1 250836 1.3953200323157944e-05 1.625564745956158e-05 2 143336 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA E1166K Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.06471973657608032 11.306537979841227 H 0.9921914935112 0.00018828411702997983 0.007620196789503098 H 0.004010101314634086 0.9499349594116212 0.03866821900010109 6.369671609718354e-05 6.677421333733946e-05 0.0008740746416151524 0.0047357776202261465 0.0016463608480989929 -65.74765777587889 -40.82109451293945 9.437941480427979e-05 H 0.0 H 0.0 NA NA H 0.005154639175257732 H 0.005154639175257732 NA NA H 0.05154639175257732 NA NA H 0.0 H 0.005154639175257732 NA NA NA NA NA NA H 0.02577319587628866 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 593663 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA F1167C Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.042094886302948 8.448443681001661 H 0.9924769997596741 0.0002786174009088427 0.007244350388646127 H 0.003729295684024692 0.9513722658157348 0.03725520521402359 0.0001255225797649473 9.267024870496243e-05 0.0011549293994903564 0.004706816282123327 0.001563343801535666 -70.32099151611328 -39.877628326416016 8.8346547272522e-05 H 0.045685279187817264 H 0.005076142131979695 NA NA H 0.05583756345177665 H 0.07614213197969544 NA NA H 0.05583756345177665 NA NA H 0.02030456852791878 H 0.015228426395939087 NA NA NA NA NA NA H 0.06091370558375635 NA NA H 0.01015228426395939 H 0.02538071065989848 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 557024 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA C1168Y Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.01869627833366394 2.6249574780464173 H 0.9948545694351196 0.0001621966512175277 0.00498312059789896 H 0.0022495172452181573 0.9747129678726196 0.018250800669193268 4.064316090079956e-05 5.503421198227443e-05 0.0004122538375668228 0.003237700555473566 0.0010410206159576774 -66.48487091064453 -40.33210754394531 1.892373984446749e-05 H 0.07407407407407407 H 0.014814814814814815 NA NA H 0.05925925925925926 H 0.014814814814814815 NA NA H 0.0 NA NA H 0.02962962962962963 H 0.02962962962962963 NA NA NA NA NA NA H 0.007407407407407408 NA NA H 0.014814814814814815 H 0.022222222222222227 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 502274 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S1169I Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.08394366502761841 9.83819754123688 H 0.9985104203224182 9.757054067449644e-05 0.0013920027995482087 H 0.0013637598603963852 0.9892922639846802 0.00733512733131647 1.5534647900494747e-05 3.694836050271988e-05 0.0001504949905211106 0.001569847809150815 0.00023601451539434493 -65.39960479736328 -41.8091926574707 4.661421553464606e-05 H 0.015384615384615384 H 0.0 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.774306750921737e-05 2.063903528747664e-05 3.9812398426875015e-06 1.0362621640866604e-05 1 251178 4.1857900214381516e-05 1.7848973368962965e-05 6 143342 aGc/aTc aGc/aTc 0 0 NA NA NA NA NA NA S1169R Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.08394366502761841 9.83819754123688 H 0.9985104203224182 9.757054067449644e-05 0.0013920027995482087 H 0.0013637598603963852 0.9892922639846802 0.00733512733131647 1.5534647900494747e-05 3.694836050271988e-05 0.0001504949905211106 0.001569847809150815 0.00023601451539434493 -65.39960479736328 -41.8091926574707 4.661421553464606e-05 H 0.015384615384615384 H 0.0 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.007692307692307694 NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.0 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.0 H 0.007692307692307694 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 834089 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA I1171V Patched TRANSMEM|11 NA NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.07577478885650635 14.018335938453676 H 0.9972628355026244 0.00018053480016533283 0.002556524006649852 H 0.002335786819458008 0.986049473285675 0.00773559045046568 2.5238396119675602e-05 8.154795796144754e-05 0.0004677210527006537 0.002746161306276917 0.0005585305625572801 -66.65522766113281 -42.74168014526367 7.46974183130078e-05 H 0.04142011834319527 H 0.017751479289940832 NA NA H 0.04142011834319527 H 0.05325443786982249 NA NA H 0.017751479289940832 NA NA H 0.017751479289940832 H 0.02366863905325444 NA NA NA NA NA NA H 0.017751479289940832 NA NA H 0.02366863905325444 H 0.04733727810650888 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9803198887966565e-06 9.357503301529013e-06 3.9803198887966565e-06 9.357503301529013e-06 1 251236 NA NA NA NA Ata/Gta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R1173G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.2252907752990723 51.59158754348755 H 0.9929937720298768 0.0003654592728707939 0.00664076441898942 H 0.004774123895913362 0.9692342281341552 0.017592214047908783 6.895575643284245e-05 0.00019253842765465381 0.0009672410669736564 0.005743269808590412 0.0014274611603468654 -64.42098236083984 -41.58626937866211 0.00030430621700361366 H 0.14516129032258066 H 0.05241935483870968 NA NA H 0.14919354838709678 H 0.16532258064516128 NA NA H 0.21774193548387094 NA NA H 0.20967741935483872 H 0.1774193548387097 NA NA NA NA NA NA H 0.1975806451612903 NA NA H 0.0846774193548387 H 0.09274193548387097 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4843157356947974e-05 NA NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4843157356947974e-05 1 143340 NA Aga/Gga NA 0 NA NA NA NA NA NA A1174V Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.07033053040504456 7.750424450635911 H 0.9910193085670472 0.0001799750025384128 0.00880075991153717 H 0.004858413711190225 0.9702502489089966 0.016120048239827156 4.3430729419924326e-05 8.102028368739409e-05 0.0009605660452507435 0.005499832797795534 0.0021864748559892178 -65.02552795410156 -41.17483139038086 0.00030445272568613285 T 0.3584905660377358 H 0.12264150943396225 NA NA T 0.37735849056603776 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.2358490566037736 NA NA H 0.1792452830188679 H 0.1320754716981132 NA NA NA NA NA NA H 0.16037735849056606 NA NA H 0.12264150943396225 H 0.1509433962264151 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.06857601628444e-06 1.791807172887665e-05 3.979780103691155e-06 9.400237452118049e-06 1 251270 6.9774901021446575e-06 1.5254272526900979e-05 1 143318 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA F1175L Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA b 0.16897836327552795 33.91395750939846 H 0.9744172692298888 0.00036075676325708633 0.025221943855285645 H 0.0077628749422729015 0.9399644136428832 0.02925757132470608 0.00015875011740718037 0.00013654738722834736 0.0025949745904654264 0.014775344170629978 0.005349494516849518 -64.93478393554689 -40.31552505493164 0.0014945854200050235 T 0.10152284263959392 H 0.0 NA NA T 0.1116751269035533 H 0.01015228426395939 NA NA H 0.0 NA NA H 0.005076142131979695 H 0.005076142131979695 NA NA NA NA NA NA H 0.01015228426395939 NA NA H 0.005076142131979695 H 0.0 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 863838 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA T1176K Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA e 0.2713649272918701 37.63831541538238 H 0.9528698921203612 0.000677158241160214 0.04645301029086113 H 0.009975921362638474 0.9134750962257384 0.033000543713569634 0.00023845252871979028 0.00031322790891863406 0.0052208686247468 0.02737570740282536 0.01040018629282713 -68.02635192871094 -38.242671966552734 0.002500893548130989 T 0.2112676056338028 H 0.056338028169014086 NA NA T 0.20422535211267606 H 0.2323943661971831 NA NA H 0.14788732394366194 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.14788732394366194 NA NA NA NA NA NA H 0.2323943661971831 NA NA H 0.09154929577464788 H 0.1056338028169014 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.0 0.0 0.36 0.0 3527C>A T1176M Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|51 NA NA NA NA e 0.2713649272918701 37.63831541538238 H 0.9528698921203612 0.000677158241160214 0.04645301029086113 H 0.009975921362638474 0.9134750962257384 0.033000543713569634 0.00023845252871979028 0.00031322790891863406 0.0052208686247468 0.02737570740282536 0.01040018629282713 -68.02635192871094 -38.242671966552734 0.002500893548130989 T 0.2112676056338028 H 0.056338028169014086 NA NA T 0.20422535211267606 H 0.2323943661971831 NA NA H 0.14788732394366194 NA NA H 0.035211267605633804 H 0.14788732394366194 NA NA NA NA NA NA H 0.2323943661971831 NA NA H 0.09154929577464788 H 0.1056338028169014 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 663971 VUS 1 4.561812756535225e-05 1.7499122836115892e-05 5.5723601690260693e-05 9.262387722227437e-06 14 251240 2.790570033539552e-05 1.484680011708257e-05 4 143340 aCg/aTg aCg/aTg 0 0 NA NA NA NA NA NA V1177= Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3515342175960541 54.03080924451351 H 0.8653101921081543 0.0018828472821041946 0.1328069567680359 H 0.01874913834035397 0.8137333393096924 0.036620061844587326 0.0007569469162262976 0.0009218524792231619 0.020312383770942688 0.07876863330602646 0.030137665569782257 -73.19927215576172 -35.19837188720703 0.0038934648036956787 T 0.4436619718309859 S 0.4084507042253521 NA NA T 0.4507042253521127 S 0.4084507042253521 NA NA S 0.5985915492957746 NA NA S 0.7676056338028169 S 0.7183098591549296 NA NA NA NA NA NA S 0.5352112676056338 NA NA S 0.4154929577464789 S 0.6901408450704225 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.4 0.0 0.0 0.4 0.0 3531G>A S1178= Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.29817360639572144 34.945946669578554 H 0.7685424089431763 0.0018458521226421 0.2296118289232254 H 0.03500894084572792 0.7207246422767639 0.019143836572766304 0.000988613348454237 0.0007249247282743454 0.030338488519191745 0.13773611187934875 0.05533439293503761 -80.51837921142578 -22.462764739990234 0.008927729912102222 - 0.16923076923076924 - 0.1076923076923077 NA NA - 0.16923076923076924 - 0.08461538461538462 NA NA - 0.1153846153846154 NA NA - 0.1 - 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA - 0.16923076923076924 NA NA - 0.07692307692307693 - 0.07692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.45 0.0 0.0 0.45 0.0 3534C>T S1178G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.29817360639572144 34.945946669578554 H 0.7685424089431763 0.0018458521226421 0.2296118289232254 H 0.03500894084572792 0.7207246422767639 0.019143836572766304 0.000988613348454237 0.0007249247282743454 0.030338488519191745 0.13773611187934875 0.05533439293503761 -80.51837921142578 -22.462764739990234 0.008927729912102222 - 0.16923076923076924 - 0.1076923076923077 NA NA - 0.16923076923076924 - 0.08461538461538462 NA NA - 0.1153846153846154 NA NA - 0.1 - 0.13076923076923078 NA NA NA NA NA NA - 0.16923076923076924 NA NA - 0.07692307692307693 - 0.07692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.6224284944925832e-05 NA NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.6224284944925832e-05 1 143348 NA Agc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA M1179V Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.27503502368927 55.034508240222934 C 0.29225820302963257 0.005235069431364536 0.7025067210197449 C 0.0349988266825676 0.27897658944129944 0.009096084162592888 0.005095052532851696 0.0022068857215344906 0.14853647351264954 0.2379010766744613 0.2831890285015106 -84.1611328125 8.737029075622559 0.017579022794961933 S 0.5797872340425532 - 0.851063829787234 NA NA S 0.5797872340425532 - 0.8936170212765957 NA NA - 0.7978723404255319 NA NA - 0.9840425531914894 - 0.9734042553191491 NA NA NA NA NA NA - 0.8936170212765957 NA NA - 0.9308510638297872 - 0.8031914893617021 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 92713 benign 2 0.002326044558493813 1.6623544500396594e-05 0.0010903599904850123 8.032415923256364e-06 274 251294 0.004491940140724182 1.4554124026971995e-05 644 143368 Atg/Gtg Atg/Gtg 4 5 NA NA NA NA NA NA K1180R Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.72563636302948 149.26339987516403 C 0.146492138504982 0.004185682162642479 0.8493221402168274 T 0.025624863803386688 0.12938560545444489 0.0037564376834779978 0.0028345277532935143 0.002042613457888365 0.21946248412132266 0.3234517276287079 0.2934417426586151 -84.03378295898438 35.19160842895508 0.0286799930036068 S 0.4536585365853658 - 0.4682926829268293 NA NA S 0.4439024390243903 - 0.4829268292682927 NA NA - 0.3853658536585366 NA NA - 0.2682926829268293 - 0.3951219512195122 NA NA NA NA NA NA - 0.4926829268292683 NA NA - 0.5560975609756098 - 0.3853658536585366 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.60221073271151e-06 1.656327003418017e-05 7.958929927553983e-06 9.082748102089747e-06 2 251290 6.97680980010773e-06 1.3850833951035434e-05 1 143332 aAa/aGa aAa/aGa 0 0 NA NA NA NA NA NA G1181D Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5746511220932007 45.2250433087349 C 0.008420560508966446 0.002759520197287202 0.9888198971748352 S 0.002179544186219573 0.0029432226438075304 0.00022616323258262128 0.0016328562051057813 0.0011575428070500493 0.5985730290412903 0.08390805870294571 0.30937960743904114 109.57512664794922 -175.00856018066406 0.024165237322449684 - 0.6666666666666666 S 0.7738095238095238 NA NA - 0.6547619047619048 S 0.8333333333333334 NA NA S 1.0 NA NA S 0.9642857142857144 S 0.8571428571428571 NA NA NA NA NA NA S 0.9285714285714286 NA NA S 0.8333333333333334 S 0.8809523809523809 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6741055007487563e-05 NA NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6741055007487563e-05 1 143362 NA gGc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA G1181S Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5746511220932007 45.2250433087349 C 0.008420560508966446 0.002759520197287202 0.9888198971748352 S 0.002179544186219573 0.0029432226438075304 0.00022616323258262128 0.0016328562051057813 0.0011575428070500493 0.5985730290412903 0.08390805870294571 0.30937960743904114 109.57512664794922 -175.00856018066406 0.024165237322449684 - 0.6666666666666666 S 0.7738095238095238 NA NA - 0.6547619047619048 S 0.8333333333333334 NA NA S 1.0 NA NA S 0.9642857142857144 S 0.8571428571428571 NA NA NA NA NA NA S 0.9285714285714286 NA NA S 0.8333333333333334 S 0.8809523809523809 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.979750090365997e-06 8.220936020345575e-06 3.979750090365997e-06 8.220936020345575e-06 1 251272 NA NA NA NA Ggc/Agc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1182N Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4485787451267241 52.57342892885208 C 0.008423047140240671 0.003230785718187689 0.9883461594581604 C 0.0009120095055550336 0.006024966016411781 2.7556903660297394e-05 0.0039300830103456965 0.0009589033434167504 0.20358259975910187 0.007492637261748314 0.7770711779594421 -98.0941162109375 154.42872619628906 0.010153676383197308 - 0.3692307692307693 S 0.4076923076923077 NA NA - 0.3615384615384615 S 0.4615384615384616 NA NA S 0.3076923076923077 NA NA S 0.4461538461538462 S 0.5307692307692308 NA NA NA NA NA NA S 0.3615384615384615 NA NA S 0.4384615384615385 S 0.3384615384615385 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.602672670982834e-06 1.7694512435686122e-05 7.960639777593315e-06 9.352757610598308e-06 2 251236 6.975350061111385e-06 1.5020708885203994e-05 1 143362 aGc/aAc aGc/aAc 0 0 NA NA NA NA NA NA R1183C Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.4083087146282196 93.50269564986229 H 0.9792041778564452 8.321499626617879e-05 0.020712584257125854 H 0.0017549211625009775 0.9855916500091552 0.00019953861192334443 1.9761822841246606e-05 2.6097997761098668e-05 0.0023770432453602552 0.0043100365437567225 0.005720866844058037 -58.24600219726562 -39.59095764160156 0.006314739119261503 S 0.36693548387096775 H 0.3709677419354839 NA NA S 0.3709677419354839 H 0.4475806451612903 NA NA H 0.38306451612903225 NA NA H 0.3064516129032258 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA NA NA H 0.4677419354838709 NA NA H 0.4153225806451613 H 0.3064516129032258 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.7742996443763446e-05 1.838645440662149e-05 1.5923700630082752e-05 9.443197481350353e-06 4 251198 2.0931600374751724e-05 1.5776175930021483e-05 3 143324 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R1183H Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.4083087146282196 93.50269564986229 H 0.9792041778564452 8.321499626617879e-05 0.020712584257125854 H 0.0017549211625009775 0.9855916500091552 0.00019953861192334443 1.9761822841246606e-05 2.6097997761098668e-05 0.0023770432453602552 0.0043100365437567225 0.005720866844058037 -58.24600219726562 -39.59095764160156 0.006314739119261503 S 0.36693548387096775 H 0.3709677419354839 NA NA S 0.3709677419354839 H 0.4475806451612903 NA NA H 0.38306451612903225 NA NA H 0.3064516129032258 H 0.3346774193548387 NA NA NA NA NA NA H 0.4677419354838709 NA NA H 0.4153225806451613 H 0.3064516129032258 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 594562 VUS 2 0.00023573048659336168 1.7621899903247893e-05 0.00010750199726317078 8.216242394076479e-06 27 251158 0.000460379000287503 1.558925005001423e-05 66 143360 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA V1184M Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.3816458880901337 58.65897299945353 H 0.9883657693862916 0.00013584054249804467 0.01149845402687788 H 0.001950993901118636 0.988642156124115 0.0009007296175695957 2.673184098966885e-05 6.413686787709594e-05 0.0013331988593563435 0.0036603787448257212 0.003421737579628825 -63.07558059692383 -40.85422897338867 0.0012029645731672645 S 0.5492957746478874 H 0.3309859154929577 NA NA S 0.5422535211267606 H 0.4225352112676056 NA NA H 0.2887323943661972 NA NA H 0.2183098591549296 H 0.2887323943661972 NA NA NA NA NA NA H 0.3380281690140845 NA NA H 0.3873239436619718 H 0.3591549295774648 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 593066 VUS 1 6.590598997228369e-05 1.6321176424204884e-05 3.981780173489824e-05 7.915385173698281e-06 10 251144 0.00011160899884998798 1.4273313470320016e-05 16 143358 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0 NA NA NA NA NA NA E1185* Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.8144329896907216 H 0.3556701030927835 NA NA H 0.8041237113402062 H 0.5515463917525774 NA NA H 0.5257731958762887 NA NA H 0.4896907216494845 H 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA H 0.5051546391752577 NA NA H 0.3711340206185567 H 0.3711340206185567 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.0 0.0 0.17 0.2 3553G>T E1185G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.4617936909198761 80.67535780370234 H 0.9958330988883972 7.989603182068095e-05 0.004087081179022789 H 0.0013673503417521715 0.9937852621078492 0.0010359701700508597 2.074688563880045e-05 4.12353256251663e-05 0.0006530421087518334 0.0015160092152655125 0.0015804524300619962 -65.58048248291016 -41.43889617919922 0.0007235124357976017 H 0.8144329896907216 H 0.3556701030927835 NA NA H 0.8041237113402062 H 0.5515463917525774 NA NA H 0.5257731958762887 NA NA H 0.4896907216494845 H 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA H 0.5051546391752577 NA NA H 0.3711340206185567 H 0.3711340206185567 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.0 0.0 0.25 0.16 3554A>G E1185K Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.4617936909198761 80.67535780370234 H 0.9958330988883972 7.989603182068095e-05 0.004087081179022789 H 0.0013673503417521715 0.9937852621078492 0.0010359701700508597 2.074688563880045e-05 4.12353256251663e-05 0.0006530421087518334 0.0015160092152655125 0.0015804524300619962 -65.58048248291016 -41.43889617919922 0.0007235124357976017 H 0.8144329896907216 H 0.3556701030927835 NA NA H 0.8041237113402062 H 0.5515463917525774 NA NA H 0.5257731958762887 NA NA H 0.4896907216494845 H 0.27835051546391754 NA NA NA NA NA NA H 0.5051546391752577 NA NA H 0.3711340206185567 H 0.3711340206185567 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.981680038123159e-06 9.277507773707687e-06 3.981680038123159e-06 9.277507773707687e-06 1 251150 NA NA NA NA Gag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R1186C Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.1436934471130371 32.9057993888855 H 0.9971803426742554 8.25654569780454e-05 0.0027370478492230177 H 0.0009055743576027453 0.9952521324157716 0.001519502722658217 2.9159875339246355e-05 2.8128326448495507e-05 0.00028160252259112884 0.0008652669494040308 0.001118572079576552 -63.0776252746582 -42.25546646118164 0.00048595029511488974 H 0.32661290322580644 H 0.016129032258064516 NA NA H 0.32661290322580644 H 0.03629032258064517 NA NA H 0.020161290322580645 NA NA H 0.024193548387096774 H 0.016129032258064516 NA NA NA NA NA NA H 0.012096774193548387 NA NA H 0.028225806451612906 H 0.04032258064516129 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 286652 VUS 1 2.7890617406474584e-05 1.9558528463055086e-05 2.390040026511997e-05 9.176354369628868e-06 6 251042 3.487820140435361e-05 1.7272248149072234e-05 5 143356 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R1186H Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.1436934471130371 32.9057993888855 H 0.9971803426742554 8.25654569780454e-05 0.0027370478492230177 H 0.0009055743576027453 0.9952521324157716 0.001519502722658217 2.9159875339246355e-05 2.8128326448495507e-05 0.00028160252259112884 0.0008652669494040308 0.001118572079576552 -63.0776252746582 -42.25546646118164 0.00048595029511488974 H 0.32661290322580644 H 0.016129032258064516 NA NA H 0.32661290322580644 H 0.03629032258064517 NA NA H 0.020161290322580645 NA NA H 0.024193548387096774 H 0.016129032258064516 NA NA NA NA NA NA H 0.012096774193548387 NA NA H 0.028225806451612906 H 0.04032258064516129 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 189174 pathogenic 2 2.2815327973997466e-05 1.9472022957655534e-05 2.3892800527391955e-05 8.427958391723347e-06 6 251122 2.092780050588772e-05 1.7553609184747287e-05 3 143350 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA A1187G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.037323862314224236 4.113089627027511 H 0.9984373450279236 1.547400461276993e-05 0.001547145890071988 H 0.0004019477055408061 0.9975478053092957 0.0009208802948705852 4.91655373480171e-06 5.125583356857534e-06 0.0001108705037040636 0.0005458921659737825 0.000462530879303813 -62.67706680297852 -42.57654571533203 7.707198528805748e-05 H 0.1320754716981132 H 0.02830188679245283 NA NA H 0.1320754716981132 H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA H 0.02830188679245283 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 374166 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.0 0.0 0.21 0.09 3560C>G A1187T Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.037323862314224236 4.113089627027511 H 0.9984373450279236 1.547400461276993e-05 0.001547145890071988 H 0.0004019477055408061 0.9975478053092957 0.0009208802948705852 4.91655373480171e-06 5.125583356857534e-06 0.0001108705037040636 0.0005458921659737825 0.000462530879303813 -62.67706680297852 -42.57654571533203 7.707198528805748e-05 H 0.1320754716981132 H 0.02830188679245283 NA NA H 0.1320754716981132 H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA H 0.02830188679245283 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 499348 VUS 2 7.352385413803006e-05 1.7468774530363595e-05 6.372830102918671e-05 8.97375960939843e-06 16 251066 9.067830251296982e-05 1.498765232000693e-05 13 143364 Gcg/Acg Gcg/Acg 0 0 NA NA NA NA NA NA A1187V Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.037323862314224236 4.113089627027511 H 0.9984373450279236 1.547400461276993e-05 0.001547145890071988 H 0.0004019477055408061 0.9975478053092957 0.0009208802948705852 4.91655373480171e-06 5.125583356857534e-06 0.0001108705037040636 0.0005458921659737825 0.000462530879303813 -62.67706680297852 -42.57654571533203 7.707198528805748e-05 H 0.1320754716981132 H 0.02830188679245283 NA NA H 0.1320754716981132 H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.03773584905660377 NA NA NA NA NA NA H 0.02830188679245283 NA NA H 0.02830188679245283 H 0.05660377358490566 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 556002 VUS 2 9.380883439595087e-05 1.8280590116568425e-05 0.0001194910000776872 8.483188858055137e-06 30 251064 4.883019937551581e-05 1.6193068943487782e-05 7 143354 gCg/gTg gCg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA E1188* Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.23195876288659795 H 0.32989690721649484 NA NA H 0.2422680412371134 H 0.31443298969072164 NA NA H 0.20103092783505155 NA NA H 0.17525773195876287 H 0.26288659793814434 NA NA NA NA NA NA H 0.3350515463917525 NA NA H 0.36597938144329895 H 0.3402061855670103 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 943983 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.0 0.0 0.16 0.22 3562G>T E1188G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.40974900126457214 71.58315052092075 H 0.9991267323493958 2.8713277060887776e-05 0.0008445892017334701 H 0.00030363796395249665 0.997511863708496 0.0013843025080859661 3.356289425937576e-06 1.3651849258167204e-05 6.204255623742938e-05 0.000487371813505888 0.00023379251069854945 -64.28273773193361 -43.31691360473633 7.818950689397751e-05 H 0.23195876288659795 H 0.32989690721649484 NA NA H 0.2422680412371134 H 0.31443298969072164 NA NA H 0.20103092783505155 NA NA H 0.17525773195876287 H 0.26288659793814434 NA NA NA NA NA NA H 0.3350515463917525 NA NA H 0.36597938144329895 H 0.3402061855670103 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.0 0.0 0.22 0.14 3563A>G E1188K Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.40974900126457214 71.58315052092075 H 0.9991267323493958 2.8713277060887776e-05 0.0008445892017334701 H 0.00030363796395249665 0.997511863708496 0.0013843025080859661 3.356289425937576e-06 1.3651849258167204e-05 6.204255623742938e-05 0.000487371813505888 0.00023379251069854945 -64.28273773193361 -43.31691360473633 7.818950689397751e-05 H 0.23195876288659795 H 0.32989690721649484 NA NA H 0.2422680412371134 H 0.31443298969072164 NA NA H 0.20103092783505155 NA NA H 0.17525773195876287 H 0.26288659793814434 NA NA NA NA NA NA H 0.3350515463917525 NA NA H 0.36597938144329895 H 0.3402061855670103 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.983369879279054e-06 7.959500606615793e-06 3.983369879279054e-06 7.959500606615793e-06 1 251044 NA NA NA NA Gaa/Aaa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E1188Q Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.40974900126457214 71.58315052092075 H 0.9991267323493958 2.8713277060887776e-05 0.0008445892017334701 H 0.00030363796395249665 0.997511863708496 0.0013843025080859661 3.356289425937576e-06 1.3651849258167204e-05 6.204255623742938e-05 0.000487371813505888 0.00023379251069854945 -64.28273773193361 -43.31691360473633 7.818950689397751e-05 H 0.23195876288659795 H 0.32989690721649484 NA NA H 0.2422680412371134 H 0.31443298969072164 NA NA H 0.20103092783505155 NA NA H 0.17525773195876287 H 0.26288659793814434 NA NA NA NA NA NA H 0.3350515463917525 NA NA H 0.36597938144329895 H 0.3402061855670103 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.966729754116386e-06 9.474431268282668e-06 7.966729754116386e-06 9.474431268282668e-06 2 251044 NA NA NA NA Gaa/Caa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E1189* Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.6391752577319587 H 0.22164948453608246 NA NA H 0.6237113402061856 H 0.16494845360824742 NA NA H 0.3711340206185567 NA NA H 0.30412371134020616 H 0.15463917525773194 NA NA NA NA NA NA H 0.25773195876288657 NA NA H 0.20618556701030927 H 0.28865979381443296 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.0 0.0 0.2 0.19 3565G>T E1189G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.3699187934398651 64.62481321394444 H 0.99846351146698 3.700835077324882e-05 0.0014995423844084144 H 0.0005178489373065531 0.996109902858734 0.0018096911953762167 9.8044720289181e-06 1.5635558156645857e-05 0.00014436339552048594 0.0009436114924028516 0.00044910071301274 -65.02987670898439 -42.86964797973633 0.00014180845755618066 H 0.6391752577319587 H 0.22164948453608246 NA NA H 0.6237113402061856 H 0.16494845360824742 NA NA H 0.3711340206185567 NA NA H 0.30412371134020616 H 0.15463917525773194 NA NA NA NA NA NA H 0.25773195876288657 NA NA H 0.20618556701030927 H 0.28865979381443296 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 371037 pathogenic 1 1.5215664540333109e-05 1.9507703507860905e-05 1.9921399143640883e-05 9.566302535445397e-06 5 250986 6.97622999723535e-06 1.7001069141408123e-05 1 143344 gAg/gGg gAg/gGg 0 0 0.26 0.0 0.0 0.26 0.15 3566A>G A1190G Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.012017399072647095 1.3243173778057098 H 0.9987971782684326 1.3425096767605282e-05 0.0011893557384610176 H 0.0005729105905629692 0.9966471791267396 0.0016889004036784172 5.643520580633776e-06 3.322581278553116e-06 0.00012146701919846235 0.0006639939965680243 0.0002966332249343395 -62.62289047241211 -42.95006561279297 5.2411462093004964e-05 H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.03773584905660377 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.073332711305907e-06 1.7356685334253748e-05 3.98637985199457e-06 8.843474315225624e-06 1 250854 6.975250016694189e-06 1.4934774448522611e-05 1 143364 gCa/gGa gCa/gGa 0 0 NA NA NA NA NA NA A1190S Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.012017399072647095 1.3243173778057098 H 0.9987971782684326 1.3425096767605282e-05 0.0011893557384610176 H 0.0005729105905629692 0.9966471791267396 0.0016889004036784172 5.643520580633776e-06 3.322581278553116e-06 0.00012146701919846235 0.0006639939965680243 0.0002966332249343395 -62.62289047241211 -42.95006561279297 5.2411462093004964e-05 H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.03773584905660377 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9853298403613735e-06 9.279785807497487e-06 3.9853298403613735e-06 9.279785807497487e-06 1 250920 NA NA NA NA Gca/Tca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A1190V Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.012017399072647095 1.3243173778057098 H 0.9987971782684326 1.3425096767605282e-05 0.0011893557384610176 H 0.0005729105905629692 0.9966471791267396 0.0016889004036784172 5.643520580633776e-06 3.322581278553116e-06 0.00012146701919846235 0.0006639939965680243 0.0002966332249343395 -62.62289047241211 -42.95006561279297 5.2411462093004964e-05 H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.18867924528301888 H 0.009433962264150943 NA NA H 0.03773584905660377 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.009433962264150943 NA NA NA NA NA NA H 0.018867924528301886 NA NA H 0.018867924528301886 H 0.018867924528301886 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.98637985199457e-06 8.668572150971833e-06 3.98637985199457e-06 8.668572150971833e-06 1 250854 NA NA NA NA gCa/gTa NA 0 NA 0.38 0.0 0.0 0.38 0.21 3569C>T A1192T Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.3371649384498596 37.15557621717453 H 0.9650214314460754 0.0001635805529076606 0.034814946353435516 H 0.008595213294029236 0.942357063293457 0.016289371997117996 6.283548282226548e-05 4.910906500299461e-05 0.0017264045309275387 0.0276753269135952 0.0032447106204926968 -69.19083404541016 -33.43674850463867 0.0005904252757318318 H 0.2075471698113208 I 0.009433962264150943 NA NA H 0.2075471698113208 I 0.03773584905660377 NA NA H 0.10377358490566037 NA NA I 0.0 I 0.018867924528301886 NA NA NA NA NA NA H 0.2169811320754717 NA NA H 0.009433962264150943 I 0.09433962264150944 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.987649961345596e-06 8.594438945100878e-06 3.987649961345596e-06 8.594438945100878e-06 1 250774 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H1193Y Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA e 0.2872493267059326 52.250652527809144 H 0.8872628808021545 0.00029472008463926613 0.11244247853755952 H 0.015299302525818346 0.8217329978942871 0.04317675158381462 0.00020343941287137568 5.6272947404067957e-05 0.006473315414041282 0.10612258315086363 0.006935363169759512 -84.41802978515625 -26.91628456115723 0.000430446321843192 H 0.5978260869565217 I 0.3695652173913043 NA NA H 0.5869565217391305 I 0.44021739130434784 NA NA H 0.3532608695652174 NA NA I 0.3641304347826087 I 0.4565217391304348 NA NA NA NA NA NA H 0.4619565217391304 NA NA H 0.3967391304347826 I 0.4293478260869565 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.614362214628357e-06 1.7349289734701786e-05 3.9893998291518065e-06 9.066232481985488e-06 1 250664 1.3953999769000802e-05 1.4791933033962128e-05 2 143328 Cac/Tac Cac/Tac 0 0 NA NA NA NA NA NA M1194T Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.03450354933738708 6.904160222411155 H 0.8623638153076172 0.0025444752536714077 0.13509170711040494 H 0.018887097015976902 0.7531024813652039 0.10120297223329544 0.0016590990126132965 0.0006249183788895607 0.02789809741079808 0.07157234847545624 0.025052988901734352 -78.19011688232422 -33.46566772460937 0.0004645605222322047 H 0.031914893617021274 I 0.1276595744680851 NA NA H 0.031914893617021274 I 0.0851063829787234 NA NA H 0.13829787234042554 NA NA I 0.26595744680851063 I 0.23404255319148934 NA NA NA NA NA NA H 0.09574468085106384 NA NA H 0.13829787234042554 I 0.20212765957446807 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.990170171164209e-06 9.029255670178833e-06 3.990170171164209e-06 9.029255670178833e-06 1 250616 NA NA NA NA aTg/aCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M1194V Patched NA Cytoplasmic|6 NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.03450354933738708 6.904160222411155 H 0.8623638153076172 0.0025444752536714077 0.13509170711040494 H 0.018887097015976902 0.7531024813652039 0.10120297223329544 0.0016590990126132965 0.0006249183788895607 0.02789809741079808 0.07157234847545624 0.025052988901734352 -78.19011688232422 -33.46566772460937 0.0004645605222322047 H 0.031914893617021274 I 0.1276595744680851 NA NA H 0.031914893617021274 I 0.0851063829787234 NA NA H 0.13829787234042554 NA NA I 0.26595744680851063 I 0.23404255319148934 NA NA NA NA NA NA H 0.09574468085106384 NA NA H 0.13829787234042554 I 0.20212765957446807 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.2993929051576035e-05 1.679701193964513e-05 2.7927400878979828e-05 8.133869174687405e-06 7 250650 4.185210127616301e-05 1.4696250622170648e-05 6 143362 Atg/Gtg Atg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA S1196R Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.1987859308719635 23.297711098194128 H 0.9873337745666504 0.00036940822610631585 0.012296745553612707 H 0.008610519580543041 0.9660584330558776 0.009192133322358131 0.00020588439656421542 0.00017131886852439493 0.0024596164003014565 0.009446129202842712 0.003855875227600336 -64.62163543701172 -41.81266784667969 7.22969343769364e-05 H 0.2307692307692308 H 0.0 NA NA H 0.2153846153846154 H 0.0 NA NA H 0.0 NA NA H 0.1076923076923077 H 0.1076923076923077 NA NA NA NA NA NA H 0.08461538461538462 NA NA H 0.02307692307692308 H 0.08461538461538462 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.73 0.0 0.0 0.73 0.42 3588C>G S1197F Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.027021825313568115 3.166957926750184 H 0.9965848922729492 0.0001544680562801659 0.0032606776803731927 H 0.009389890357851982 0.9817424416542052 0.004846131894737482 6.47937849862501e-05 6.163039506645873e-05 0.00045794516336172825 0.002612711628898979 0.0008245317148976027 -65.12066650390625 -39.93929290771485 3.623244992922992e-05 H 0.1076923076923077 H 0.015384615384615384 NA NA H 0.1 H 0.030769230769230767 NA NA H 0.0 NA NA H 0.17692307692307693 H 0.2 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.09230769230769233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 834088 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA S1197Y Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.027021825313568115 3.166957926750184 H 0.9965848922729492 0.0001544680562801659 0.0032606776803731927 H 0.009389890357851982 0.9817424416542052 0.004846131894737482 6.47937849862501e-05 6.163039506645873e-05 0.00045794516336172825 0.002612711628898979 0.0008245317148976027 -65.12066650390625 -39.93929290771485 3.623244992922992e-05 H 0.1076923076923077 H 0.015384615384615384 NA NA H 0.1 H 0.030769230769230767 NA NA H 0.0 NA NA H 0.17692307692307693 H 0.2 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.015384615384615384 H 0.09230769230769233 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9974102037376716e-06 8.821112703816907e-06 3.9974102037376716e-06 8.821112703816907e-06 1 250162 NA NA NA NA tCc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S1200G Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.15094494819641113 17.690747928619388 H 0.9829370379447936 0.00024836533702909946 0.016814498230814934 H 0.00619502691552043 0.9522733092308044 0.022065842524170882 0.00012481454177759588 0.00010644611029420048 0.002188930520787835 0.013231878168880941 0.003813748946413398 -69.40171813964844 -38.86470413208008 0.000351040274836123 I 0.19230769230769232 I 0.04615384615384616 NA NA I 0.18461538461538465 H 0.02307692307692308 NA NA T 0.07692307692307693 NA NA I 0.16153846153846155 I 0.19230769230769232 NA NA NA NA NA NA T 0.08461538461538462 NA NA I 0.038461538461538464 I 0.17692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 284662 benign 2 0.0018492161915680066 1.9188653494238744e-05 0.0008789999992586673 8.929011736099187e-06 221 251422 0.003551000030711293 1.6984615754810698e-05 509 143340 Agt/Ggt Agt/Ggt 1 2 NA NA NA NA NA NA S1200T Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|52 NA NA NA NA b 0.15094494819641113 17.690747928619388 H 0.9829370379447936 0.00024836533702909946 0.016814498230814934 H 0.00619502691552043 0.9522733092308044 0.022065842524170882 0.00012481454177759588 0.00010644611029420048 0.002188930520787835 0.013231878168880941 0.003813748946413398 -69.40171813964844 -38.86470413208008 0.000351040274836123 I 0.19230769230769232 I 0.04615384615384616 NA NA I 0.18461538461538465 H 0.02307692307692308 NA NA T 0.07692307692307693 NA NA I 0.16153846153846155 I 0.19230769230769232 NA NA NA NA NA NA T 0.08461538461538462 NA NA I 0.038461538461538464 I 0.17692307692307693 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.6812609534569845e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.6812609534569845e-05 1 143336 NA aGt/aCt NA 0 NA NA NA NA NA NA L1204V Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.19204974174499512 35.16430771350861 H 0.9953078627586364 0.00018017951515503228 0.00451196078211069 H 0.0015883093001320956 0.9603624939918518 0.03286613896489144 6.618924089707434e-05 8.17600084701553e-05 0.000603676657192409 0.003296424867585301 0.0011349392589181662 -68.70296478271484 -42.375091552734375 0.0002089536137646064 H 0.12195121951219512 H 0.32926829268292684 NA NA H 0.12804878048780488 H 0.03658536585365853 NA NA H 0.0 NA NA H 0.35365853658536583 H 0.3353658536585366 NA NA NA NA NA NA H 0.0 NA NA H 0.3414634146341464 H 0.38414634146341453 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.954119610076305e-06 9.242357039438983e-06 7.954119610076305e-06 9.242357039438983e-06 2 251442 NA NA NA NA Ctt/Gtt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T1205K Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.014150053262710571 1.962612387537956 H 0.9956592917442322 0.00022800691658630967 0.004112642258405685 H 0.00250042206607759 0.9273708462715148 0.0653427466750145 6.908427167218179e-05 7.870230911066757e-05 0.00042517995461821556 0.003287104656919837 0.0009258256759494543 -67.60350799560547 -40.40680694580078 5.417719148681499e-05 H 0.2323943661971831 H 0.014084507042253518 NA NA H 0.22535211267605634 H 0.09859154929577464 NA NA H 0.04929577464788732 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.007042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.035211267605633804 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 188747 pathogenic 2 1.0131908856070906e-05 1.6672255018224757e-05 7.953680324135347e-06 8.964587834091388e-06 2 251456 1.3953200323157944e-05 1.4057035688849246e-05 2 143336 aCa/aAa aCa/aAa 0 0 NA NA NA NA NA NA T1205R Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.014150053262710571 1.962612387537956 H 0.9956592917442322 0.00022800691658630967 0.004112642258405685 H 0.00250042206607759 0.9273708462715148 0.0653427466750145 6.908427167218179e-05 7.870230911066757e-05 0.00042517995461821556 0.003287104656919837 0.0009258256759494543 -67.60350799560547 -40.40680694580078 5.417719148681499e-05 H 0.2323943661971831 H 0.014084507042253518 NA NA H 0.22535211267605634 H 0.09859154929577464 NA NA H 0.04929577464788732 NA NA H 0.014084507042253518 H 0.007042253521126761 NA NA NA NA NA NA H 0.035211267605633804 NA NA H 0.02112676056338028 H 0.02112676056338028 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 505018 pathogenic 2 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA F1207L Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA e 0.4277579188346863 85.85101431012153 H 0.9899137020111084 7.926645048428327e-05 0.010006939992308615 H 0.003096164669841528 0.8644092679023743 0.12155314534902573 1.8916180124506354e-05 2.6475663617020473e-05 0.0008852435275912285 0.008459283038973808 0.0015515186823904516 -68.10105895996094 -44.41166687011719 0.00040673982584849 H 0.5177664974619289 H 0.5685279187817259 NA NA H 0.5380710659898477 H 0.5736040609137056 NA NA H 0.4822335025380711 NA NA H 0.4822335025380711 H 0.5076142131979695 NA NA NA NA NA NA H 0.4822335025380711 NA NA H 0.5025380710659898 H 0.5076142131979695 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.0131698954864988e-05 1.80419077960156e-05 3.976680091000162e-06 1.0020327742739509e-05 1 251466 2.0930099708493802e-05 1.500344856518039e-05 3 143334 Ttt/Ctt Ttt/Ctt 0 0 NA NA NA NA NA NA F1207S Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA e 0.4277579188346863 85.85101431012153 H 0.9899137020111084 7.926645048428327e-05 0.010006939992308615 H 0.003096164669841528 0.8644092679023743 0.12155314534902573 1.8916180124506354e-05 2.6475663617020473e-05 0.0008852435275912285 0.008459283038973808 0.0015515186823904516 -68.10105895996094 -44.41166687011719 0.00040673982584849 H 0.5177664974619289 H 0.5685279187817259 NA NA H 0.5380710659898477 H 0.5736040609137056 NA NA H 0.4822335025380711 NA NA H 0.4822335025380711 H 0.5076142131979695 NA NA NA NA NA NA H 0.4822335025380711 NA NA H 0.5025380710659898 H 0.5076142131979695 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.2664472983480521e-05 1.835161554315834e-05 1.1930000255233608e-05 8.826969385676228e-06 3 251466 1.3953000234323557e-05 1.608932579408551e-05 2 143338 tTt/tCt tTt/tCt 0 0 NA NA NA NA NA NA I1210M Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.16716086864471436 30.92476069927216 H 0.9947404265403748 3.612309228628874e-05 0.00522339204326272 H 0.003285546554252505 0.9670721292495728 0.02433907613158226 9.156276064459233e-06 1.2463477105484344e-05 0.0006228735437616706 0.003547322703525424 0.0011113594518974423 -67.51177215576172 -40.48810958862305 9.488385694567114e-05 H 0.34911242603550297 H 0.017751479289940832 NA NA H 0.3550295857988165 H 0.6153846153846154 NA NA H 0.4437869822485207 NA NA H 0.10059171597633136 H 0.10059171597633136 NA NA NA NA NA NA H 0.4674556213017752 NA NA H 0.07100591715976333 H 0.10059171597633136 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.013127148221714e-05 1.8218343778633006e-05 1.1929900210816413e-05 8.831893982314294e-06 3 251468 6.976029908400959e-06 1.5934418681634308e-05 1 143348 atT/atG atT/atG 0 0 NA NA NA NA NA NA V1212L Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.08013215661048889 12.31631247103214 H 0.9975115060806274 4.076037657796405e-05 0.002447639591991901 H 0.008845696225762367 0.9769188761711121 0.010722086764872074 1.3885390217183158e-05 1.9741293726838197e-05 0.00025118543999269605 0.0026206495240330696 0.0006078761070966723 -66.44432830810547 -39.79310989379883 0.00016281323041766882 H 0.1619718309859155 H 0.19014084507042253 NA NA H 0.17605633802816897 H 0.11971830985915492 NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.11267605633802814 H 0.09859154929577464 NA NA NA NA NA NA H 0.07746478873239436 NA NA H 0.2746478873239437 H 0.14084507042253522 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 558706 pathogenic 2 1.5906600310700014e-05 7.4869672841689026e-06 1.5906600310700014e-05 7.4869672841689026e-06 4 251468 NA NA NA NA Gtg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V1212M Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.08013215661048889 12.31631247103214 H 0.9975115060806274 4.076037657796405e-05 0.002447639591991901 H 0.008845696225762367 0.9769188761711121 0.010722086764872074 1.3885390217183158e-05 1.9741293726838197e-05 0.00025118543999269605 0.0026206495240330696 0.0006078761070966723 -66.44432830810547 -39.79310989379883 0.00016281323041766882 H 0.1619718309859155 H 0.19014084507042253 NA NA H 0.17605633802816897 H 0.11971830985915492 NA NA H 0.08450704225352113 NA NA H 0.11267605633802814 H 0.09859154929577464 NA NA NA NA NA NA H 0.07746478873239436 NA NA H 0.2746478873239437 H 0.14084507042253522 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 3634G>A L1213= Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.042752444744110114 7.827972632646563 H 0.9883937239646912 0.00018497719429433346 0.01142131444066763 H 0.020209226757287986 0.9528915286064148 0.011964892037212849 6.0904021665919565e-05 9.429924102732913e-05 0.0012671102304011585 0.010542036034166813 0.002969958353787661 -69.80833435058594 -34.104915618896484 0.00026167312171310186 H 0.06707317073170732 H 0.07317073170731707 NA NA H 0.054878048780487805 H 0.5426829268292683 NA NA H 0.4573170731707317 NA NA H 0.07317073170731707 H 0.07317073170731707 NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA H 0.018292682926829267 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.03 0.0 0.0 3639G>A L1213V Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA HELIX|53 NA NA NA NA b 0.042752444744110114 7.827972632646563 H 0.9883937239646912 0.00018497719429433346 0.01142131444066763 H 0.020209226757287986 0.9528915286064148 0.011964892037212849 6.0904021665919565e-05 9.429924102732913e-05 0.0012671102304011585 0.010542036034166813 0.002969958353787661 -69.80833435058594 -34.104915618896484 0.00026167312171310186 H 0.06707317073170732 H 0.07317073170731707 NA NA H 0.054878048780487805 H 0.5426829268292683 NA NA H 0.4573170731707317 NA NA H 0.07317073170731707 H 0.07317073170731707 NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA H 0.018292682926829267 H 0.054878048780487805 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 5.065546379759194e-06 1.704500076167445e-05 3.97652001993265e-06 1.001402722715442e-05 1 251476 6.976029908400959e-06 1.3793161699164285e-05 1 143348 Ttg/Gtg Ttg/Gtg 0 0 NA NA NA NA NA NA A1214T Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.2591853737831116 28.562228190898896 H 0.8389623165130615 0.0006698074867017567 0.16036786139011386 H 0.05504647642374039 0.7433489561080933 0.010221335105597971 0.0002637841971591115 0.0002028826565947384 0.008090458810329437 0.16886569559574127 0.013960490934550762 -71.7317123413086 -26.49972343444824 0.000957688025664538 T 0.5283018867924528 T 0.3018867924528302 NA NA T 0.5471698113207547 H 0.5660377358490566 NA NA H 0.6792452830188679 NA NA T 0.22641509433962265 T 0.1792452830188679 NA NA NA NA NA NA H 0.6037735849056604 NA NA T 0.3113207547169811 T 0.2169811320754717 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.71 0.71 0.06 0.0 0.0 3640G>A F1215Y Patched TRANSMEM|12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5242990255355835 105.22681442499159 C 0.4786054790019989 0.00044885469833388925 0.5209456086158752 T 0.041418250650167465 0.3684498071670532 0.005974486470222472 0.0001430791598977521 0.00010101420048158616 0.0217051301151514 0.5456562638282776 0.016552025452256203 -95.16899871826172 -11.043098449707033 0.003615285037085414 S 0.2385786802030457 - 0.6802030456852792 NA NA S 0.2284263959390863 T 0.7715736040609137 NA NA H 0.6548223350253807 NA NA S 0.7715736040609137 S 0.7868020304568528 NA NA NA NA NA NA H 0.6395939086294417 NA NA - 0.7512690355329951 S 0.8172588832487309 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 3644T>A A1216D Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.085349440574646 9.40550835132599 C 0.07771223783493042 0.006900224834680557 0.9153875708580016 C 0.018751664087176326 0.05561259761452675 0.0012894468382000925 0.011914298869669436 0.003000837052240968 0.2514751255512237 0.1291310042142868 0.5288249850273132 -81.38557434082031 137.55082702636722 0.005083200056105852 - 0.7358490566037735 - 0.018867924528301886 NA NA - 0.7169811320754716 - 0.3490566037735849 NA NA - 0.11320754716981132 NA NA - 0.16037735849056606 - 0.2075471698113208 NA NA NA NA NA NA - 0.03773584905660377 NA NA - 0.03773584905660377 - 0.2075471698113208 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.33 0.33 0.0 0.0 0.0 3647C>A A1216T Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.085349440574646 9.40550835132599 C 0.07771223783493042 0.006900224834680557 0.9153875708580016 C 0.018751664087176326 0.05561259761452675 0.0012894468382000925 0.011914298869669436 0.003000837052240968 0.2514751255512237 0.1291310042142868 0.5288249850273132 -81.38557434082031 137.55082702636722 0.005083200056105852 - 0.7358490566037735 - 0.018867924528301886 NA NA - 0.7169811320754716 - 0.3490566037735849 NA NA - 0.11320754716981132 NA NA - 0.16037735849056606 - 0.2075471698113208 NA NA NA NA NA NA - 0.03773584905660377 NA NA - 0.03773584905660377 - 0.2075471698113208 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.0 0.0 0.0 3646G>A K1217I Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.6525060534477234 134.2204951941967 C 0.01266530714929104 0.0111616812646389 0.9761729836463928 C 0.011105484329164028 0.008990034461021423 0.0002620154118631035 0.004881086759269238 0.008509057573974133 0.2424435466527939 0.12939578294754028 0.5944130420684814 -89.35053253173828 37.23366928100586 0.004282169044017793 - 0.2878048780487805 - 0.8536585365853658 NA NA - 0.2878048780487805 - 0.7219512195121951 NA NA - 0.6975609756097559 NA NA S 0.4682926829268293 S 0.22926829268292684 NA NA NA NA NA NA - 0.6829268292682927 NA NA - 0.8975609756097561 S 0.4926829268292683 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9766500776750036e-06 7.342915102402985e-06 3.9766500776750036e-06 7.342915102402985e-06 1 251468 NA NA NA NA aAa/aTa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q1219H Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA e 0.5755318999290466 102.78999732732773 H 0.906088411808014 0.0031068765092641115 0.09080468863248824 H 0.03740760684013367 0.8741201758384705 0.0018228768603876235 0.0006205614190548657 0.0015905676409602163 0.018857797607779503 0.04660681262612343 0.01897362433373928 -64.56452941894531 -35.9683723449707 0.002118181437253952 - 0.1111111111111111 H 0.3080808080808081 NA NA - 0.10606060606060606 S 0.5555555555555556 NA NA H 0.5404040404040404 NA NA S 0.2272727272727273 S 0.3181818181818182 NA NA NA NA NA NA H 0.202020202020202 NA NA H 0.4141414141414141 S 0.2272727272727273 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 3657A>T F1221S Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA b 0.11461842060089113 23.00391701459884 H 0.9815006256103516 0.0003257884818594904 0.01817362755537033 H 0.02512309141457081 0.9447939395904541 0.00888656172901392 0.00021927054331172252 0.0001383279450237751 0.002548492513597012 0.01158358622342348 0.006706793326884508 -68.28301239013672 -37.20091247558594 0.0010184207931160927 H 0.3299492385786802 H 0.04060913705583756 NA NA H 0.3350253807106599 H 0.19796954314720813 NA NA I 0.05583756345177665 NA NA I 0.05583756345177665 I 0.030456852791878174 NA NA NA NA NA NA I 0.09137055837563453 NA NA H 0.06091370558375635 I 0.05583756345177665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 594425 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA F1221Y Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA b 0.11461842060089113 23.00391701459884 H 0.9815006256103516 0.0003257884818594904 0.01817362755537033 H 0.02512309141457081 0.9447939395904541 0.00888656172901392 0.00021927054331172252 0.0001383279450237751 0.002548492513597012 0.01158358622342348 0.006706793326884508 -68.28301239013672 -37.20091247558594 0.0010184207931160927 H 0.3299492385786802 H 0.04060913705583756 NA NA H 0.3350253807106599 H 0.19796954314720813 NA NA I 0.05583756345177665 NA NA I 0.05583756345177665 I 0.030456852791878174 NA NA NA NA NA NA I 0.09137055837563453 NA NA H 0.06091370558375635 I 0.05583756345177665 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976740117650479e-06 8.217034299357768e-06 3.976740117650479e-06 8.217034299357768e-06 1 251462 NA NA NA NA tTc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q1222H Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA e 0.3226860761642456 57.63173320293426 H 0.9942845702171326 0.0002505740849301219 0.00546486582607031 H 0.008706397376954556 0.9762240052223206 0.008859001100063324 4.869902113568969e-05 0.00010977361671393737 0.0006151447305455804 0.004117791075259447 0.0013191899051889775 -64.02317810058594 -40.51021957397461 0.0002652039984241128 H 0.1111111111111111 I 0.2676767676767677 NA NA H 0.12121212121212123 H 0.18181818181818185 NA NA I 0.2272727272727273 NA NA I 0.37373737373737376 I 0.3484848484848485 NA NA NA NA NA NA I 0.13131313131313133 NA NA H 0.20707070707070707 I 0.3636363636363637 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 3666G>T I1223T Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA e 0.3746954798698425 69.31866377592087 H 0.9776766896247864 0.0008275120635516943 0.02149575389921665 H 0.014295291155576706 0.9363880753517152 0.026841172948479645 0.00017024853150360286 0.0003945533826481552 0.002061360515654087 0.015843739733099937 0.0040055750869214535 -67.71127319335939 -39.69132995605469 0.0003208591078873724 H 0.25443786982248523 I 0.17159763313609466 NA NA H 0.2603550295857988 H 0.2603550295857988 NA NA I 0.11834319526627217 NA NA I 0.11834319526627217 I 0.1124260355029586 NA NA NA NA NA NA I 0.1893491124260355 NA NA H 0.10059171597633136 I 0.17751479289940827 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 7.953230124257969e-06 7.710554826442064e-06 7.953230124257969e-06 7.710554826442064e-06 2 251470 NA NA NA NA aTa/aCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1223V Patched NA Lumenal|7 NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA e 0.3746954798698425 69.31866377592087 H 0.9776766896247864 0.0008275120635516943 0.02149575389921665 H 0.014295291155576706 0.9363880753517152 0.026841172948479645 0.00017024853150360286 0.0003945533826481552 0.002061360515654087 0.015843739733099937 0.0040055750869214535 -67.71127319335939 -39.69132995605469 0.0003208591078873724 H 0.25443786982248523 I 0.17159763313609466 NA NA H 0.2603550295857988 H 0.2603550295857988 NA NA I 0.11834319526627217 NA NA I 0.11834319526627217 I 0.1124260355029586 NA NA NA NA NA NA I 0.1893491124260355 NA NA H 0.10059171597633136 I 0.17751479289940827 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 889411 VUS 1 5.066083508298258e-05 1.7929236384205572e-05 3.976740117650479e-05 9.195306388412187e-06 10 251462 6.977390148676932e-05 1.539168144628607e-05 10 143320 Ata/Gta Ata/Gta 0 0 0.61 0.11 0.0 0.61 0.0 3667A>G F1224C Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA b 0.159666508436203 32.04506824314594 H 0.9631822109222412 0.00037384754978120327 0.03644393756985664 H 0.01214186754077673 0.9088641405105592 0.04071827605366707 0.0001809882669476792 0.00012661541404668242 0.0037044677883386608 0.02697701379656792 0.007286666892468929 -72.1170883178711 -35.30084228515625 0.0005085230804979801 H 0.4822335025380711 I 0.015228426395939087 NA NA H 0.4720812182741117 T 0.02538071065989848 NA NA I 0.01015228426395939 NA NA I 0.015228426395939087 I 0.0 NA NA NA NA NA NA I 0.07106598984771574 NA NA H 0.015228426395939087 I 0.02030456852791878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 287836 pathogenic 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA F1224L Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|54 NA NA NA NA b 0.159666508436203 32.04506824314594 H 0.9631822109222412 0.00037384754978120327 0.03644393756985664 H 0.01214186754077673 0.9088641405105592 0.04071827605366707 0.0001809882669476792 0.00012661541404668242 0.0037044677883386608 0.02697701379656792 0.007286666892468929 -72.1170883178711 -35.30084228515625 0.0005085230804979801 H 0.4822335025380711 I 0.015228426395939087 NA NA H 0.4720812182741117 T 0.02538071065989848 NA NA I 0.01015228426395939 NA NA I 0.015228426395939087 I 0.0 NA NA NA NA NA NA I 0.07106598984771574 NA NA H 0.015228426395939087 I 0.02030456852791878 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.562899368577358e-05 NA NA NA NA 6.976129952818155e-06 1.562899368577358e-05 1 143346 NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA Y1225= Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10658589005470276 22.77740470468997 H 0.9917269945144652 3.2401618227595463e-05 0.008240674622356892 H 0.0015912539092823865 0.9700798988342284 0.02040923200547695 1.8325632481719367e-05 8.696505574334877e-06 0.0009475058177486062 0.005042118951678276 0.001902996446006 -62.80279922485352 -41.602210998535156 0.00015457339759450406 H 0.17567567567567569 I 0.058558558558558564 NA NA H 0.17117117117117114 T 0.08108108108108109 NA NA I 0.06756756756756757 NA NA I 0.07207207207207207 I 0.07207207207207207 NA NA NA NA NA NA I 0.0990990990990991 NA NA T 0.018018018018018014 I 0.06756756756756757 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.22 0.22 0.0 0.0 0.0 3675C>T Y1225C Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10658589005470276 22.77740470468997 H 0.9917269945144652 3.2401618227595463e-05 0.008240674622356892 H 0.0015912539092823865 0.9700798988342284 0.02040923200547695 1.8325632481719367e-05 8.696505574334877e-06 0.0009475058177486062 0.005042118951678276 0.001902996446006 -62.80279922485352 -41.602210998535156 0.00015457339759450406 H 0.17567567567567569 I 0.058558558558558564 NA NA H 0.17117117117117114 T 0.08108108108108109 NA NA I 0.06756756756756757 NA NA I 0.07207207207207207 I 0.07207207207207207 NA NA NA NA NA NA I 0.0990990990990991 NA NA T 0.018018018018018014 I 0.06756756756756757 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.977099928917596e-06 1.385143139043726e-05 NA NA NA NA 6.977099928917596e-06 1.385143139043726e-05 1 143326 NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA Y1225D Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.10658589005470276 22.77740470468997 H 0.9917269945144652 3.2401618227595463e-05 0.008240674622356892 H 0.0015912539092823865 0.9700798988342284 0.02040923200547695 1.8325632481719367e-05 8.696505574334877e-06 0.0009475058177486062 0.005042118951678276 0.001902996446006 -62.80279922485352 -41.602210998535156 0.00015457339759450406 H 0.17567567567567569 I 0.058558558558558564 NA NA H 0.17117117117117114 T 0.08108108108108109 NA NA I 0.06756756756756757 NA NA I 0.07207207207207207 I 0.07207207207207207 NA NA NA NA NA NA I 0.0990990990990991 NA NA T 0.018018018018018014 I 0.06756756756756757 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9767101043253206e-06 7.71037760218175e-06 3.9767101043253206e-06 7.71037760218175e-06 1 251464 NA NA NA NA Tac/Gac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R1227G Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.41240251064300537 94.44017493724823 H 0.9970079064369202 6.553431740030646e-05 0.002926569199189544 H 0.0018511329544708133 0.9834843277931212 0.011165948584675787 2.539965862524696e-05 2.9200387871242132e-05 0.0004081388178747147 0.002329240553081036 0.0007066285470500588 -65.31351470947266 -41.634803771972656 0.000193775151274167 H 0.4516129032258064 H 0.2782258064516129 NA NA H 0.4556451612903226 H 0.1935483870967742 NA NA H 0.21370967741935484 NA NA H 0.2620967741935484 H 0.27419354838709675 NA NA NA NA NA NA H 0.18548387096774194 NA NA H 0.21370967741935484 H 0.28225806451612906 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 945147 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA L1230S Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.3849836587905884 70.49050792455672 H 0.9988818764686584 1.1591756447160153e-05 0.0011065838625654578 H 0.0006256719934754075 0.9877558946609496 0.01004562061280012 4.2028909774671774e-06 4.27227405452868e-06 0.00011894320778083056 0.0011846243869513273 0.0002607030037324876 -65.56212615966797 -44.53071212768555 0.00011924716091016309 H 0.17682926829268292 H 0.201219512195122 NA NA H 0.18902439024390244 H 0.3597560975609756 NA NA H 0.24390243902439024 NA NA H 0.27439024390243905 H 0.22560975609756095 NA NA NA NA NA NA H 0.1402439024390244 NA NA H 0.2073170731707317 H 0.27439024390243905 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.53294090405147e-05 1.7470053938600054e-05 2.38603006437188e-05 7.874047199692406e-06 6 251464 2.7906800823984668e-05 1.5594940375474715e-05 4 143334 tTg/tCg tTg/tCg 0 0 NA NA NA NA NA NA M1232R Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.028079092502594 5.618626409769059 H 0.9986982345581056 3.1446626962861046e-05 0.0012703248066827655 H 0.0008798979106359184 0.9887261986732484 0.008552313782274723 8.879443157638889e-06 1.1484959941299167e-05 0.00017975989612750712 0.0013196864165365696 0.0003218566416762769 -67.57705688476561 -40.83462905883789 3.768478927668184e-05 H 0.0053191489361702135 H 0.026595744680851064 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.031914893617021274 NA NA H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA NA NA H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0425531914893617 H 0.04787234042553192 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.5546601445009373e-05 NA NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.5546601445009373e-05 1 143350 NA aTg/aGg NA 0 NA NA NA NA NA NA M1232V Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.028079092502594 5.618626409769059 H 0.9986982345581056 3.1446626962861046e-05 0.0012703248066827655 H 0.0008798979106359184 0.9887261986732484 0.008552313782274723 8.879443157638889e-06 1.1484959941299167e-05 0.00017975989612750712 0.0013196864165365696 0.0003218566416762769 -67.57705688476561 -40.83462905883789 3.768478927668184e-05 H 0.0053191489361702135 H 0.026595744680851064 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.031914893617021274 NA NA H 0.010638297872340424 NA NA H 0.0053191489361702135 H 0.02127659574468085 NA NA NA NA NA NA H 0.0053191489361702135 NA NA H 0.0425531914893617 H 0.04787234042553192 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 836417 VUS 1 6.9773900577274625e-06 1.5962039016329698e-05 NA NA NA NA 6.9773900577274625e-06 1.5962039016329698e-05 1 143320 NA Atg/Gtg NA 0 NA NA NA NA NA NA G1236E Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.00517582893371582 0.4073377370834351 H 0.9991829991340636 9.385017619933933e-06 0.000807620701380074 H 0.0009518477600067854 0.9698533415794371 0.028186600655317307 3.419393124204362e-06 3.098718252658728e-06 0.00013028888497501612 0.0006137253367342055 0.0002576661645434797 -64.93466186523439 -41.7557373046875 2.2386344426195134e-05 H 0.047619047619047616 H 0.03571428571428571 NA NA H 0.05952380952380953 H 0.047619047619047616 NA NA H 0.0 NA NA H 0.023809523809523808 H 0.047619047619047616 NA NA NA NA NA NA H 0.011904761904761904 NA NA H 0.03571428571428571 H 0.047619047619047616 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.1930499567824883e-05 9.041902263030586e-06 1.1930499567824883e-05 9.041902263030586e-06 3 251456 NA NA NA NA gGa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A1237T Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.2291065156459809 25.247538024187087 H 0.9982632994651794 9.419228263141122e-06 0.0017273323610424993 H 0.0009007658227346838 0.959211528301239 0.03793060407042504 2.1959058358334005e-06 3.1013457828521487e-06 0.00014798509073443708 0.00142485904507339 0.0003789630718529224 -65.99913024902344 -41.043052673339844 6.777929229428992e-05 H 0.0660377358490566 H 0.11320754716981132 NA NA H 0.0660377358490566 H 0.07547169811320754 NA NA H 0.11320754716981132 NA NA H 0.14150943396226415 H 0.14150943396226415 NA NA NA NA NA NA H 0.1320754716981132 NA NA H 0.09433962264150944 H 0.10377358490566037 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976870175392833e-06 8.186500059779613e-06 3.976870175392833e-06 8.186500059779613e-06 1 251454 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T1238S Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.4067274630069733 56.41309911906719 H 0.9960325360298156 4.480389543459751e-05 0.00392265897244215 H 0.0017892168834805489 0.9033257365226746 0.09011260420084 2.0473327822401192e-05 1.968530887097586e-05 0.00047814004938118165 0.0034150669816881427 0.0008390566799789668 -66.877197265625 -44.001708984375 0.0003507460933178663 H 0.5140845070422535 H 0.3380281690140845 NA NA H 0.528169014084507 H 0.2605633802816901 NA NA H 0.38028169014084506 NA NA H 0.39436619718309857 H 0.34507042253521125 NA NA NA NA NA NA H 0.3661971830985916 NA NA H 0.34507042253521125 H 0.34507042253521125 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 6.977099928917596e-06 1.5486510165874647e-05 NA NA NA NA 6.977099928917596e-06 1.5486510165874647e-05 1 143326 NA Act/Tct NA 0 NA NA NA NA NA NA G1240R Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.02150094509124756 1.6921243786811828 H 0.9960426092147828 3.5337547160452225e-05 0.003922055009752512 H 0.004966793581843376 0.6563205718994141 0.33544087409973145 1.5652722140657715e-05 7.621590611961438e-06 0.00035475866752676666 0.002272506942972541 0.0006212225998751817 -68.32154846191406 -37.75770950317383 6.704639235977082e-05 H 0.03571428571428571 H 0.011904761904761904 NA NA H 0.047619047619047616 I 0.07142857142857142 NA NA I 0.0 NA NA I 0.03571428571428571 I 0.023809523809523808 NA NA NA NA NA NA I 0.0 NA NA H 0.011904761904761904 I 0.047619047619047616 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.976999778387835e-06 8.43785319687376e-06 3.976999778387835e-06 8.43785319687376e-06 1 251446 NA NA NA NA Gga/Aga NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1242V Patched TRANSMEM|13 NA NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.3487879037857056 64.52576220035553 H 0.9472134709358216 0.0002992508525494486 0.052487242966890335 H 0.022913552820682533 0.6623058319091797 0.2528973519802093 0.00012264230463188142 0.00010300301801180467 0.005393100436776877 0.05034948140382767 0.00591508485376835 -80.31024932861328 -34.60460662841797 0.000578998529817909 H 0.3017751479289941 H 0.28994082840236685 NA NA H 0.3017751479289941 I 0.2485207100591716 NA NA I 0.27218934911242604 NA NA I 0.25443786982248523 I 0.2485207100591716 NA NA NA NA NA NA I 0.3431952662721893 NA NA H 0.3076923076923077 I 0.2366863905325444 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 2.279925289123462e-05 1.816456392479857e-05 1.9884999346686527e-05 8.500527548080285e-06 5 251446 2.7912699806620367e-05 1.605280081426359e-05 4 143304 Ata/Gta Ata/Gta 0 0 NA NA NA NA NA NA L1248F Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA b 0.20163747668266296 36.91982198059559 H 0.9889875054359436 5.375585169531405e-05 0.010958707891404629 H 0.017850741744041443 0.9651073813438416 0.0047343261539936074 2.0588217012118548e-05 2.9998502213857137e-05 0.0009060859447345137 0.0075117056258022785 0.0038390471599996094 -66.77352905273439 -36.19201278686523 0.001808550558052957 H 0.1524390243902439 H 0.006097560975609756 NA NA H 0.15853658536585366 H 0.024390243902439025 NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.012195121951219513 H 0.006097560975609756 NA NA NA NA NA NA H 0.006097560975609756 NA NA H 0.006097560975609756 H 0.018292682926829267 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 1.3957699593447613e-05 1.4798296090452454e-05 NA NA NA NA 1.3957699593447613e-05 1.4798296090452454e-05 2 143290 NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA S1249G Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.4518466591835022 52.956428456306455 H 0.9328554272651672 0.0003545835497789085 0.06678996980190277 H 0.05132070928812027 0.8703721165657043 0.008016170933842659 0.0001316926209256053 0.00017397291958332062 0.004534420557320118 0.05309956893324852 0.012351348996162416 -70.95465850830078 -31.55996131896973 0.006966209504753351 H 0.5461538461538461 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.5538461538461539 T 0.061538461538461535 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.038461538461538464 NA NA NA NA NA NA H 0.07692307692307693 NA NA H 0.04615384615384616 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 555483 VUS 1 1.3955599570181219e-05 1.5157638568262689e-05 NA NA NA NA 1.3955599570181219e-05 1.5157638568262689e-05 2 143312 NA Agt/Ggt NA 0 NA NA NA NA NA NA S1249R Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.4518466591835022 52.956428456306455 H 0.9328554272651672 0.0003545835497789085 0.06678996980190277 H 0.05132070928812027 0.8703721165657043 0.008016170933842659 0.0001316926209256053 0.00017397291958332062 0.004534420557320118 0.05309956893324852 0.012351348996162416 -70.95465850830078 -31.55996131896973 0.006966209504753351 H 0.5461538461538461 H 0.038461538461538464 NA NA H 0.5538461538461539 T 0.061538461538461535 NA NA H 0.038461538461538464 NA NA H 0.030769230769230767 H 0.038461538461538464 NA NA NA NA NA NA H 0.07692307692307693 NA NA H 0.04615384615384616 H 0.06923076923076922 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.6 0.0 0.0 0.6 0.02 3747T>G Y1250C Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.6034913063049316 128.96609215736387 H 0.8379252552986145 0.0007544340332970022 0.1613202691078186 H 0.04154492542147637 0.7930960059165955 0.013096447102725506 0.00023495272034779188 0.00034348946064710617 0.012535401619970798 0.11352160573005675 0.02562718465924263 -79.18462371826172 -31.975086212158203 0.029594577848911282 H 0.3963963963963964 H 0.2117117117117117 NA NA H 0.4009009009009009 T 0.6846846846846847 NA NA H 0.7252252252252253 NA NA H 0.2432432432432433 H 0.2972972972972973 NA NA NA NA NA NA H 0.5900900900900901 NA NA H 0.2297297297297297 H 0.2882882882882883 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA 3.9779802136763465e-06 8.115013850532103e-06 3.9779802136763465e-06 8.115013850532103e-06 1 251384 NA NA NA NA tAc/tGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I1251V Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA HELIX|55 NA NA NA NA e 0.3902711868286133 72.20016956329346 H 0.7004328370094299 0.002707064151763916 0.296860009431839 H 0.0469173900783062 0.6392790079116821 0.007897934876382351 0.001402457244694233 0.0010632815537974238 0.05868124961853027 0.17430809140205386 0.0704505443572998 -94.67314910888672 -11.309590339660645 0.05956331267952919 - 0.6982248520710059 H 0.4260355029585799 NA NA - 0.6982248520710059 S 0.5029585798816568 NA NA H 0.4437869822485207 NA NA H 0.4733727810650887 H 0.4674556213017752 NA NA NA NA NA NA H 0.3668639053254438 NA NA H 0.4201183431952663 H 0.5266272189349113 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|5jnx-A|nan|6w5s-A|3jd8-A|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.32 0.0 0.0 0.32 0.01 3751A>G G1252A Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23647573590278625 18.61064041554928 C 0.10348344594240187 0.010075565427541731 0.8864409327507019 C 0.03035214357078076 0.03891926258802414 0.0020371335558593273 0.00509236054494977 0.0043292883783578855 0.2497351765632629 0.06299977004528046 0.6065348386764526 107.5426254272461 -175.53521728515625 0.06684669107198715 NA NA - 0.0 NA NA NA NA - 0.023809523809523808 NA NA - 0.0 NA NA - 0.011904761904761904 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.25 0.0 0.0 3755G>C G1252E Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23647573590278625 18.61064041554928 C 0.10348344594240187 0.010075565427541731 0.8864409327507019 C 0.03035214357078076 0.03891926258802414 0.0020371335558593273 0.00509236054494977 0.0043292883783578855 0.2497351765632629 0.06299977004528046 0.6065348386764526 107.5426254272461 -175.53521728515625 0.06684669107198715 NA NA - 0.0 NA NA NA NA - 0.023809523809523808 NA NA - 0.0 NA NA - 0.011904761904761904 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.25 0.25 0.17 0.0 0.0 3755G>A G1252R Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23647573590278625 18.61064041554928 C 0.10348344594240187 0.010075565427541731 0.8864409327507019 C 0.03035214357078076 0.03891926258802414 0.0020371335558593273 0.00509236054494977 0.0043292883783578855 0.2497351765632629 0.06299977004528046 0.6065348386764526 107.5426254272461 -175.53521728515625 0.06684669107198715 NA NA - 0.0 NA NA NA NA - 0.023809523809523808 NA NA - 0.0 NA NA - 0.011904761904761904 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.88 0.0 0.0 0.0 0.88 3754G>C G1252V Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23647573590278625 18.61064041554928 C 0.10348344594240187 0.010075565427541731 0.8864409327507019 C 0.03035214357078076 0.03891926258802414 0.0020371335558593273 0.00509236054494977 0.0043292883783578855 0.2497351765632629 0.06299977004528046 0.6065348386764526 107.5426254272461 -175.53521728515625 0.06684669107198715 NA NA - 0.0 NA NA NA NA - 0.023809523809523808 NA NA - 0.0 NA NA - 0.011904761904761904 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.26 0.27 0.0 0.0 3755G>T G1252W Patched NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.23647573590278625 18.61064041554928 C 0.10348344594240187 0.010075565427541731 0.8864409327507019 C 0.03035214357078076 0.03891926258802414 0.0020371335558593273 0.00509236054494977 0.0043292883783578855 0.2497351765632629 0.06299977004528046 0.6065348386764526 107.5426254272461 -175.53521728515625 0.06684669107198715 NA NA - 0.0 NA NA NA NA - 0.023809523809523808 NA NA - 0.0 NA NA - 0.011904761904761904 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA NA NA - 0.0 NA NA - 0.0 - 0.011904761904761904 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.92 0.0 0.0 0.0 0.92 3754G>T S1254T NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5189950466156006 60.82621946334839 C 0.17201754450798035 0.04901084303855896 0.7789716124534607 C 0.06042183190584183 0.07447618246078491 0.0004008693504147232 0.01959130167961121 0.02942258864641189 0.05434100329875946 0.0716705322265625 0.6896756887435913 -83.42131805419922 100.66514587402344 0.13872362673282626 NA NA - 0.6307692307692307 NA NA NA NA - 0.5230769230769231 NA NA - 0.676923076923077 NA NA - 0.6615384615384615 - 0.6461538461538462 NA NA NA NA NA NA - 0.9692307692307692 NA NA - 0.6538461538461539 - 0.676923076923077 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A|5u73-A 808370 VUS 1 5.07400432896818e-06 1.6377476422527933e-05 3.984349859820213e-06 7.357269946384912e-06 1 250982 6.984019819356035e-06 1.4631893688326187e-05 1 143184 Tca/Aca Tca/Aca 0 0 NA NA NA NA NA NA V1255I NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.3053484559059143 46.93205767273903 C 0.2288147509098053 0.048033840954303735 0.7231513857841492 C 0.06006525829434395 0.1223602220416069 0.0008291125996038318 0.0131052378565073 0.030065206810832024 0.06303241848945618 0.06340856105089188 0.6471339464187622 -87.74655151367188 17.458234786987305 0.1385788768529892 NA NA - 0.7042253521126759 NA NA NA NA - 1.0 NA NA - 0.8309859154929577 NA NA - 0.9014084507042254 - 0.7887323943661971 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA - 0.9859154929577464 - 0.9577464788732394 NA NA NA NA 6w5t-A|6w5r-A|5u74-A|6uox-A|6w5s-A|nan|6w5u-A|6w5v-A NA NA NA 7.608097026290809e-06 1.951700109960816e-05 3.983239821536699e-06 9.305655703752474e-06 1 251052 1.3960199794382788e-05 1.715570178819057e-05 2 143264 Gta/Ata Gta/Ata 0 0 NA NA NA NA NA NA K1257E NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5149672031402588 105.9287536859512 C 0.2830115556716919 0.012732713483273985 0.7042557597160339 C 0.043149519711732864 0.18077963590621948 0.0008527231402695179 0.0038916317280381922 0.008704056963324547 0.05123491957783699 0.07439766824245453 0.6369898319244385 -76.95075988769531 -16.221025466918945 0.2746048867702484 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.981780082540354e-06 8.028520954407153e-06 3.981780082540354e-06 8.028520954407153e-06 1 251144 NA NA NA NA Aaa/Gaa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A1258S NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.44151127338409424 48.654542326927185 C 0.36793091893196106 0.0047128512524068356 0.6273562908172607 C 0.04659655690193176 0.2490030229091645 0.0008258991874754429 0.0013638375094160438 0.003296556649729609 0.040370963513851166 0.0626973956823349 0.5958458185195923 -71.69869232177734 -28.60532569885254 0.2906190454959869 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.980920155299828e-06 8.640689953022312e-06 3.980920155299828e-06 8.640689953022312e-06 1 251198 NA NA NA NA Gcc/Tcc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A1258V NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.44151127338409424 48.654542326927185 C 0.36793091893196106 0.0047128512524068356 0.6273562908172607 C 0.04659655690193176 0.2490030229091645 0.0008258991874754429 0.0013638375094160438 0.003296556649729609 0.040370963513851166 0.0626973956823349 0.5958458185195923 -71.69869232177734 -28.60532569885254 0.2906190454959869 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 289812 VUS 1 3.980920155299828e-06 9.917886052835442e-06 3.980920155299828e-06 9.917886052835442e-06 1 251198 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K1259T NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5321634411811829 109.46601985096927 C 0.3110042214393616 0.006504370365291835 0.6824913620948792 C 0.03971637412905693 0.21090933680534368 0.0008989957859739662 0.0019505887757986786 0.004614954348653555 0.04833884537220001 0.06430629640817642 0.6292645931243896 -78.37303924560547 -21.514577865600586 0.3786433935165405 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.97988014810835e-06 8.315492462587102e-06 3.97988014810835e-06 8.315492462587102e-06 1 251264 NA NA NA NA aAa/aCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E1264* NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.11 0.24 0.0 0.0 3790G>T E1264V NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4513824880123138 78.85652065575124 C 0.3806147575378418 0.00363461091183126 0.6157506108283997 C 0.01922224462032318 0.30659914016723633 0.0016522591467946768 0.000892506679520011 0.0026674552354961642 0.028329446911811832 0.032156545668840415 0.6084803342819214 -71.02516174316406 -36.433048248291016 0.5111653804779053 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.3 0.12 0.3 0.0 0.0 3791A>T E1265* NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.26 0.15 0.26 0.0 0.0 3793G>T E1265K NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5752264857292175 100.4920670568943 C 0.3356950879096985 0.0033508045598864555 0.6609541177749634 C 0.015076844953000547 0.2719767689704895 0.0015967885265126824 0.0007886872044764459 0.002469738014042377 0.020204106345772743 0.02851375006139278 0.6593733429908752 -71.8563232421875 -35.04349136352539 0.6002616286277771 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.066858499895536e-06 1.7259948120297817e-05 3.977189862780506e-06 8.16778600965069e-06 1 251434 6.978949841141002e-06 1.5205034719326575e-05 1 143288 Gag/Aag Gag/Aag 0 0 NA NA NA NA NA NA E1265V NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5752264857292175 100.4920670568943 C 0.3356950879096985 0.0033508045598864555 0.6609541177749634 C 0.015076844953000547 0.2719767689704895 0.0015967885265126824 0.0007886872044764459 0.002469738014042377 0.020204106345772743 0.02851375006139278 0.6593733429908752 -71.8563232421875 -35.04349136352539 0.6002616286277771 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 291193 VUS 1 2.280086536316696e-05 1.649542374570615e-05 2.3861999579821717e-05 7.597553419168637e-06 6 251446 2.093859984597657e-05 1.464159098572574e-05 3 143276 gAg/gTg gAg/gTg 0 0 NA NA NA NA NA NA R1266Q NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5062035322189331 115.92060887813568 C 0.2719150483608246 0.006689383182674646 0.7213956117630005 C 0.017721373587846756 0.228524848818779 0.0018609012477099887 0.0016543528763577342 0.004981732927262783 0.02635582908987999 0.04502289742231369 0.6738780736923218 -76.2016372680664 -29.614389419555664 0.6164394617080688 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 21140 benign 2 0.08304879959919385 1.498035634784686e-05 0.07234840095043182 8.497539791316583e-06 18192 251450 0.101842999458313 1.2337053692169255e-05 14580 143162 cGa/cAa cGa/cAa 1320 1309 NA NA NA NA NA NA Y1267D NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.32739394903182983 69.96408690810203 C 0.19383154809474945 0.0074404943734407425 0.7987279295921326 C 0.017751850187778473 0.1647394299507141 0.0017726820660755038 0.002262208610773086 0.005263098981231451 0.03210696578025818 0.04905668273568154 0.7270471453666687 -84.13523864746094 -14.246058464050293 0.6221632361412048 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.9768101487425164e-06 7.267956967702267e-06 3.9768101487425164e-06 7.267956967702267e-06 1 251458 NA NA NA NA Tac/Gac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA K1268E NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5981911420822144 123.0479179263115 C 0.1114186868071556 0.004431506153196096 0.8841497898101807 C 0.0068705654703080645 0.09484421461820602 0.0011842629173770547 0.0012740771053358912 0.003254505107179284 0.026779349893331528 0.053203921765089035 0.8125891685485841 -81.07234191894531 -13.908076286315918 0.7203479409217834 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 968009 VUS 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA K1268Q NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5981911420822144 123.0479179263115 C 0.1114186868071556 0.004431506153196096 0.8841497898101807 C 0.0068705654703080645 0.09484421461820602 0.0011842629173770547 0.0012740771053358912 0.003254505107179284 0.026779349893331528 0.053203921765089035 0.8125891685485841 -81.07234191894531 -13.908076286315918 0.7203479409217834 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.97652001993265e-06 9.69312229071346e-06 3.97652001993265e-06 9.69312229071346e-06 1 251476 NA NA NA NA Aaa/Caa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1269A NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5986905097961426 47.11694312095642 C 0.06439174711704254 0.0006462751771323383 0.9349619746208192 C 0.005932951811701059 0.04235399514436722 0.0003891165542881936 0.0001847671810537577 0.00047934878966771066 0.02719301357865334 0.0545700378715992 0.8688967227935791 -47.2402458190918 -31.7849063873291 0.7963489890098572 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.179673245395669e-06 3.97652001993265e-06 8.179673245395669e-06 1 251476 NA NA NA NA gGa/gCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G1269E NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5986905097961426 47.11694312095642 C 0.06439174711704254 0.0006462751771323383 0.9349619746208192 C 0.005932951811701059 0.04235399514436722 0.0003891165542881936 0.0001847671810537577 0.00047934878966771066 0.02719301357865334 0.0545700378715992 0.8688967227935791 -47.2402458190918 -31.7849063873291 0.7963489890098572 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.785014502481218e-06 3.97652001993265e-06 8.785014502481218e-06 1 251476 NA NA NA NA gGa/gAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T1270K NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.44235894083976746 61.35518509447574 C 0.06881029158830643 0.0015500157605856655 0.9296397566795348 C 0.0050211981870234 0.03956837207078934 9.127500379690899e-05 0.00046669490984641016 0.000859828491229564 0.016870884224772453 0.013631886802613735 0.9234899878501892 -80.15133666992188 -37.514915466308594 0.8238242864608765 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.97652001993265e-06 8.805963439332163e-06 3.97652001993265e-06 8.805963439332163e-06 1 251476 NA NA NA NA aCa/aAa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA E1271A NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5311185717582703 92.78641448616979 C 0.0749087706208229 0.00257456349208951 0.9225166440010072 C 0.004672869108617307 0.0422535352408886 0.00011218419967917724 0.0006559476023539902 0.0013635549694299698 0.00982469506561756 0.010531733743846416 0.9305854439735411 -76.70586395263672 -30.24736404418945 0.8182201981544495 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 593418 VUS 1 2.786321170904629e-05 1.7186857316511166e-05 1.5905599866528064e-05 9.084112313032157e-06 4 251484 4.8847901780391105e-05 1.4589961202906982e-05 7 143302 gAg/gCg gAg/gCg 0 0 NA NA NA NA NA NA E1271Q NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5311185717582703 92.78641448616979 C 0.0749087706208229 0.00257456349208951 0.9225166440010072 C 0.004672869108617307 0.0422535352408886 0.00011218419967917724 0.0006559476023539902 0.0013635549694299698 0.00982469506561756 0.010531733743846416 0.9305854439735411 -76.70586395263672 -30.24736404418945 0.8182201981544495 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 594215 VUS 1 3.0396190832571626e-05 1.6612227330099325e-05 1.5905799955362454e-05 8.193208264179695e-06 4 251480 5.5824599257903174e-05 1.4451208780122045e-05 8 143306 Gag/Cag Gag/Cag 0 0 NA NA NA NA NA NA R1272C NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5017778277397156 114.90712255239487 C 0.06085442379117013 0.0025932739954441786 0.9365522861480712 C 0.0039014043286442757 0.03545770421624184 9.704007243271917e-05 0.0006920391460880637 0.0013757775304839015 0.007201485335826874 0.008752655237913132 0.9425219297409058 -76.20037078857422 -29.15107345581055 0.8672215342521667 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 891857 VUS 1 2.2801543631460002e-05 1.5988864765968045e-05 2.7836300432682037e-05 8.394816971510068e-06 7 251470 1.3962599950900765e-05 1.3607749428882825e-05 2 143240 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0 NA NA NA NA NA NA R1272H NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5017778277397156 114.90712255239487 C 0.06085442379117013 0.0025932739954441786 0.9365522861480712 C 0.0039014043286442757 0.03545770421624184 9.704007243271917e-05 0.0006920391460880637 0.0013757775304839015 0.007201485335826874 0.008752655237913132 0.9425219297409058 -76.20037078857422 -29.15107345581055 0.8672215342521667 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 5.5734835105692245e-05 1.7442385705870844e-05 3.97652001993265e-05 9.409725530357046e-06 10 251476 8.376959885936229e-05 1.4686520505406115e-05 12 143250 cGc/cAc cGc/cAc 0 0 NA NA NA NA NA NA E1273* NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.65 0.65 0.0 0.0 0.0 3817G>T E1273G NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5880116820335388 102.72564085125923 C 0.05894700810313225 0.0022474569268524647 0.9388055801391602 C 0.004127216525375843 0.03513933718204498 0.00013275555102154613 0.0004889622214250267 0.0012968985829502346 0.005981040187180042 0.007989552803337574 0.9448442459106444 -77.12845611572266 -28.29538536071777 0.888685941696167 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 2.279771779437379e-05 1.8896212693359517e-05 1.988179974432569e-05 1.0006763695932589e-05 5 251486 2.7915399186895226e-05 1.602908401894652e-05 4 143290 gAa/gGa gAa/gGa 0 0 NA NA NA NA NA NA E1273K NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5880116820335388 102.72564085125923 C 0.05894700810313225 0.0022474569268524647 0.9388055801391602 C 0.004127216525375843 0.03513933718204498 0.00013275555102154613 0.0004889622214250267 0.0012968985829502346 0.005981040187180042 0.007989552803337574 0.9448442459106444 -77.12845611572266 -28.29538536071777 0.888685941696167 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.9808997977816026e-06 1.638519401818063e-05 NA NA NA NA 6.9808997977816026e-06 1.638519401818063e-05 1 143248 NA Gaa/Aaa NA 0 NA NA NA NA NA NA R1274Q NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5662567615509033 129.67279839515686 C 0.05070754140615463 0.004411401692777872 0.9448810815811156 C 0.005172244273126125 0.030664784833788875 0.0001652016071602702 0.0010332922684028745 0.0025930283591151237 0.008498597890138626 0.010996087454259396 0.9408767819404602 -80.99116516113281 -15.34301471710205 0.8693471550941467 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 539311 VUS 2 6.080319351642366e-05 1.7125827288591947e-05 4.7717101551825174e-05 7.459803519266602e-06 12 251482 8.377899939659983e-05 1.5415748174273543e-05 12 143234 cGg/cAg cGg/cAg 0 0 NA NA NA NA NA NA R1274W NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.5662567615509033 129.67279839515686 C 0.05070754140615463 0.004411401692777872 0.9448810815811156 C 0.005172244273126125 0.030664784833788875 0.0001652016071602702 0.0010332922684028745 0.0025930283591151237 0.008498597890138626 0.010996087454259396 0.9408767819404602 -80.99116516113281 -15.34301471710205 0.8693471550941467 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan 181460 VUS 1 2.2799926213678595e-05 1.812587205667241e-05 3.1810399377718575e-05 1.0041183167974318e-05 8 251490 6.9808997977816026e-06 1.5090456533917285e-05 1 143248 Cgg/Tgg Cgg/Tgg 0 0 NA NA NA NA NA NA L1276Q NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.4559805989265442 83.49004766345023 C 0.02735440619289875 0.0053257266990840435 0.967319905757904 C 0.005999373272061348 0.01834817044436932 0.0001216159798786975 0.0020766316447407007 0.00321884173899889 0.008984820917248726 0.013412960804998876 0.9478375911712646 -89.83561706542969 45.87358093261719 0.8938539028167725 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.6273498212767728e-05 NA NA NA NA 6.979149929975392e-06 1.6273498212767728e-05 1 143284 NA cTa/cAa NA 0 NA NA NA NA NA NA N1277I NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.7549889087677002 110.53037624359129 C 0.008709789253771305 0.002951979637145996 0.98833829164505 C 0.003595372661948204 0.0037057590670883656 1.2473577953642234e-05 0.000720029347576201 0.0018192802090197802 0.003653689753264189 0.009312769398093224 0.9771806001663208 -99.25035858154295 70.67960357666016 0.8794401288032532 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.0 0.0 0.0 3830A>T N1277S NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.7549889087677002 110.53037624359129 C 0.008709789253771305 0.002951979637145996 0.98833829164505 C 0.003595372661948204 0.0037057590670883656 1.2473577953642234e-05 0.000720029347576201 0.0018192802090197802 0.003653689753264189 0.009312769398093224 0.9771806001663208 -99.25035858154295 70.67960357666016 0.8794401288032532 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 1.1928599633392878e-05 9.732983871378653e-06 1.1928599633392878e-05 9.732983871378653e-06 3 251496 NA NA NA NA aAt/aGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N1277T NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.7549889087677002 110.53037624359129 C 0.008709789253771305 0.002951979637145996 0.98833829164505 C 0.003595372661948204 0.0037057590670883656 1.2473577953642234e-05 0.000720029347576201 0.0018192802090197802 0.003653689753264189 0.009312769398093224 0.9771806001663208 -99.25035858154295 70.67960357666016 0.8794401288032532 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 6.9817801886529205e-06 1.4817719307635062e-05 NA NA NA NA 6.9817801886529205e-06 1.4817719307635062e-05 1 143230 NA aAt/aCt NA 0 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 3830A>C F1278L NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.6817407011985779 136.82535873055457 C 0.0003818749682977796 1.7329290130874142e-05 0.9996008276939392 C 4.002611240139231e-05 0.00011793490557465704 6.434529353782636e-08 8.020138011488598e-06 6.025406946719159e-06 0.00010265286982757972 0.0001753431570250541 0.9995499253273008 -101.49304962158205 112.6505126953125 0.9448819160461426 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 3.976239895564503e-06 8.931915813460482e-06 3.976239895564503e-06 8.931915813460482e-06 1 251494 NA NA NA NA ttC/ttG NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F1278S NA NA Cytoplasmic|7 NA NA NA NA NA NA NA Di-leucine_motif|1 Required_for_location_in_lysosomes|1 e 0.6817407011985779 136.82535873055457 C 0.0003818749682977796 1.7329290130874142e-05 0.9996008276939392 C 4.002611240139231e-05 0.00011793490557465704 6.434529353782636e-08 8.020138011488598e-06 6.025406946719159e-06 0.00010265286982757972 0.0001753431570250541 0.9995499253273008 -101.49304962158205 112.6505126953125 0.9448819160461426 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA nan NA NA NA 7.952479791129006e-06 8.461678569237703e-06 7.952479791129006e-06 8.461678569237703e-06 2 251494 NA NA NA NA tTc/tCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA