# -------------------- # version: 0 # protein: # name: infile_A # organism: None # uniprot: None # sequence: SELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQALGHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVNALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYTGCSMNPARSLAPAVVTGKFDDHWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLKGL # merged: # file_00: prism_pdb_XXX_infile_A.txt (version 1) # file_01: prism_merged_XXX_P41181_MP.txt (version 0) # variants: # number: 180 # coverage: 0.544 # depth: 1.385 # width: single mutants # columns: # SS_00: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # ASA_00: Accessible surface area # uniprot;pfam_name_00_01: pfam_name # uniprot;TRANSMEM_00_01: TRANSMEM # uniprot;INTRAMEM_00_01: INTRAMEM # uniprot;TOPO_DOM_00_01: TOPO_DOM # uniprot;MOD_RES_00_01: MOD_RES # uniprot;CARBOHYD_00_01: CARBOHYD # uniprot;STRAND_00_01: STRAND # uniprot;HELIX_00_01: HELIX # uniprot;TURN_00_01: TURN # uniprot;MOTIF_00_01: MOTIF # uniprot;mobidb_00_01: mobidb # netsurfp;burried_exposed_01_01: Classification if residue is burried (RSA <= 0.25) or exposed (RSA > 0.25) # netsurfp;rsa_01_01: Relative Surface Accessibility # netsurfp;asa_01_01: Absolute Surface Accessibility # netsurfp;q3_ss_pred_01_01: Secondary structure prediction in 3 class scheme (q3) # netsurfp;p_q3_H_01_01: probability of class H (helix) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_E_01_01: probability of class E (strand) in q3 assignment # netsurfp;p_q3_C_01_01: probability of class C (coil) in q3 assignment # netsurfp;q8_ss_pred_01_01: Secondary structure prediction in 8 class scheme (q8) # netsurfp;p_q8_G_01_01: probability of class G (3-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_H_01_01: probability of class H (4-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_I_01_01: probability of class I (5-turn helix) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_B_01_01: probability of class B (isolated beta-bridge) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_E_01_01: probability of class E (strand) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_S_01_01: probability of class S (bend) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_T_01_01: probability of class T (turn) in q8 assignment # netsurfp;p_q8_C_01_01: probability of class C (coil) in q8 assignment # netsurfp;phi_01_01: phi angle # netsurfp;psi_01_01: psi angle # netsurfp;disorder_01_01: probability of residue being disordered # clinvar;Clinvar_ID_02_01: Clinvar_ID # clinvar;Clinvar_signifiance_02_01: Clinvar_signifiance # clinvar;Clinvar_review_status_02_01: Clinvar_review_status # gnomad;AF_tot_03_01: Frequency estimate of the variant allele from exome and genome data combined (if present in both, otherwise just AF_ex or AF_g). Calculated as (AC*_ex + AC*_g) / (max(AN_ex) + max(AN_g)) where AC*_ex = sum(AF_ex_i) * max(AN_ex) # gnomad;std_AF_tot_03_01: Error estimate on AF_tot from error propagation # gnomad;AF_ex_03_01: Variant allel frequency in exomes data # gnomad;std_AF_ex_03_01: Error estimate on AF_ex derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_ex_03_01: Counts of variant allel in exomes data # gnomad;AN_ex_03_01: Total allel counts at this site in exomes data # gnomad;AF_g_03_01: Variant allel frequency in genomes data # gnomad;std_AF_g_03_01: Error estimate on AF_g derived from the standard deviation of AF when adding pseudocounts # gnomad;AC_g_03_01: Counts of variant allel in genomes data # gnomad;AN_g_03_01: Total allel counts at this site in genomes data # gnomad;Codons_ex_03_01: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Codons_g_03_01: Change on codon level (VEP) in exome data # gnomad;Homozygotes_ex_03_01: Number of individuals homozygous for the variant in exome data # gnomad;Homozygotes_g_03_01: Number of individuals homozygous for the variant in genome data # spliceai;maxdelta_04_01: naximum delta score # spliceai;DS_AG_04_01: delta score for acceptor gain # spliceai;DS_AL_04_01: delta score for acceptor loss # spliceai;DS_DG_04_01: delta score for donor gain # spliceai;DS_DL_04_01: delta score for donor loss # spliceai;HGVSc_04_01: change on nucleotide level # pdb;SS_05_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_05_01: Accessible surface area # pdb;SS_06_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_06_01: Accessible surface area # pdb;SS_07_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_07_01: Accessible surface area # pdb;SS_08_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_08_01: Accessible surface area # pdb;SS_09_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_09_01: Accessible surface area # pdb;SS_10_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_10_01: Accessible surface area # pdb;SS_11_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_11_01: Accessible surface area # pdb;SS_12_01: Secondary structure with H=alpha helix (4-12), B=isolated beta-bridge residue, E=Strand, G=3-10 helix, i=Pi helix, T=Turn, S=Bend, -=None # pdb;ASA_12_01: Accessible surface area # pdb;IDs_01: PDB_ID + chain # -------------------- # # variant SS_00 ASA_00 uniprot;pfam_name_00_01 uniprot;TRANSMEM_00_01 uniprot;INTRAMEM_00_01 uniprot;TOPO_DOM_00_01 uniprot;MOD_RES_00_01 uniprot;CARBOHYD_00_01 uniprot;STRAND_00_01 uniprot;HELIX_00_01 uniprot;TURN_00_01 uniprot;MOTIF_00_01 uniprot;mobidb_00_01 netsurfp;burried_exposed_01_01 netsurfp;rsa_01_01 netsurfp;asa_01_01 netsurfp;q3_ss_pred_01_01 netsurfp;p_q3_H_01_01 netsurfp;p_q3_E_01_01 netsurfp;p_q3_C_01_01 netsurfp;q8_ss_pred_01_01 netsurfp;p_q8_G_01_01 netsurfp;p_q8_H_01_01 netsurfp;p_q8_I_01_01 netsurfp;p_q8_B_01_01 netsurfp;p_q8_E_01_01 netsurfp;p_q8_S_01_01 netsurfp;p_q8_T_01_01 netsurfp;p_q8_C_01_01 netsurfp;phi_01_01 netsurfp;psi_01_01 netsurfp;disorder_01_01 pdb;SS_05_01 pdb;ASA_05_01 pdb;SS_06_01 pdb;ASA_06_01 pdb;SS_07_01 pdb;ASA_07_01 pdb;SS_08_01 pdb;ASA_08_01 pdb;SS_09_01 pdb;ASA_09_01 pdb;SS_10_01 pdb;ASA_10_01 pdb;SS_11_01 pdb;ASA_11_01 pdb;SS_12_01 pdb;ASA_12_01 pdb;IDs_01 clinvar;Clinvar_ID_02_01 clinvar;Clinvar_signifiance_02_01 clinvar;Clinvar_review_status_02_01 gnomad;AF_tot_03_01 gnomad;std_AF_tot_03_01 gnomad;AF_ex_03_01 gnomad;std_AF_ex_03_01 gnomad;AC_ex_03_01 gnomad;AN_ex_03_01 gnomad;AF_g_03_01 gnomad;std_AF_g_03_01 gnomad;AC_g_03_01 gnomad;AN_g_03_01 gnomad;Codons_ex_03_01 gnomad;Codons_g_03_01 gnomad;Homozygotes_ex_03_01 gnomad;Homozygotes_g_03_01 spliceai;maxdelta_04_01 spliceai;DS_AG_04_01 spliceai;DS_AL_04_01 spliceai;DS_DG_04_01 spliceai;DS_DL_04_01 spliceai;HGVSc_04_01 E2K - 0.3350515463917525 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6883574724197388 120.25605043172835 C 0.1424681097269058 0.0888172686100006 0.7687146663665771 C 0.0227353647351264 0.0692275688052177 0.000398787407903 0.0087948152795434 0.0684719681739807 0.034710057079792 0.0181403793394565 0.7775210738182068 -89.73627471923828 123.16665649414062 0.2386992126703262 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.7268041237113402 NA NA - 0.3350515463917525 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 3.984890099673066e-06 9.052452752411028e-06 3.984890099673066e-06 9.052452752411028e-06 1 250948 NA NA NA NA Gag/Aag NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L3P T 0.3841463414634146 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5001160502433777 91.57124879956244 C 0.2234908491373062 0.1055885776877403 0.6709206104278564 C 0.0651195049285888 0.1169072538614273 0.0012987044174224 0.0262346267700195 0.077889397740364 0.0393873453140258 0.0439151600003242 0.6292480826377869 -82.21338653564453 86.70316314697266 0.2513495087623596 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA T 0.3841463414634145 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.732462813071074e-05 NA NA NA NA 1.395540039084153e-05 1.732462813071074e-05 2.0 143314.0 NA cTc/cCc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L3V T 0.3841463414634146 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5001160502433777 91.57124879956244 C 0.2234908491373062 0.1055885776877403 0.6709206104278564 C 0.0651195049285888 0.1169072538614273 0.0012987044174224 0.0262346267700195 0.077889397740364 0.0393873453140258 0.0439151600003242 0.6292480826377869 -82.21338653564453 86.70316314697266 0.2513495087623596 NA NA NA NA NA NA NA NA H 0.3719512195121951 NA NA T 0.3841463414634145 NA NA nan|4nef-A|4nef-D NA NA NA 1.3950099855719598e-05 1.5919405631726834e-05 NA NA NA NA 1.3950099855719598e-05 1.5919405631726834e-05 2.0 143368.0 NA Ctc/Gtc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R4C T 0.8387096774193549 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6061208844184875 138.80168253183365 C 0.1599595248699188 0.098716452717781 0.7413240671157837 C 0.0548062846064567 0.0833799168467521 0.0003888813371304 0.0105115743353962 0.0922988131642341 0.0812299028038978 0.0515388585627079 0.6258457899093628 -94.48140716552734 56.73750686645508 0.1253232657909393 - 0.9556451612903226 - 0.935483870967742 NA NA NA NA H 0.5483870967741935 NA NA T 0.8387096774193549 - 1.0 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B NA NA NA 7.606796766121988e-06 1.715605916456246e-05 7.967300007294398e-06 8.414801517832761e-06 2 251026 6.975540145504056e-06 1.4950634818409785e-05 1.0 143358.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R4H T 0.8387096774193549 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6061208844184875 138.80168253183365 C 0.1599595248699188 0.098716452717781 0.7413240671157837 C 0.0548062846064567 0.0833799168467521 0.0003888813371304 0.0105115743353962 0.0922988131642341 0.0812299028038978 0.0515388585627079 0.6258457899093628 -94.48140716552734 56.73750686645508 0.1253232657909393 - 0.9556451612903226 - 0.935483870967742 NA NA NA NA H 0.5483870967741935 NA NA T 0.8387096774193549 - 1.0 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B NA NA NA 5.831847195898592e-05 1.7970612051878996e-05 5.178659921512008e-05 8.668770667524994e-06 13 251030 6.975640280870722e-05 1.574151557611264e-05 10.0 143356.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA I6V H 0.7041420118343196 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4625524282455444 85.57219922542572 C 0.4741927683353424 0.038095336407423 0.4877118170261383 H 0.0254884790629148 0.5045292377471924 0.0007536833873018 0.0091486126184463 0.0243900176137685 0.0771937519311904 0.0420443341135978 0.3164518475532532 -77.23921966552734 -30.18116569519043 0.0230499636381864 H 0.5088757396449705 H 0.6035502958579881 - 1.0 H 0.6804733727810651 H 0.3550295857988165 H 0.6272189349112426 H 0.7041420118343196 H 0.5680473372781065 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97505993230152e-06 1.7761976559675402e-05 NA NA NA NA 6.97505993230152e-06 1.7761976559675402e-05 1.0 143368.0 NA Ata/Gta NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A7D H 0.5943396226415094 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4110471904277801 45.297400385141366 H 0.7440375685691833 0.0053253867663443 0.2506369650363922 H 0.036912839859724 0.7093353867530823 0.0005943276919424 0.0009129347163252 0.0037279734387993 0.0253390278667211 0.0324270576238632 0.1907504200935364 -69.00321960449219 -40.1317253112793 0.011038196273148 H 0.5 H 0.5188679245283019 H 0.5849056603773585 H 0.6037735849056604 H 0.4528301886792453 H 0.660377358490566 H 0.5943396226415094 H 0.6037735849056604 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.981149802712024e-06 8.76025697814869e-06 3.981149802712024e-06 8.76025697814869e-06 1 251184 NA NA NA NA gCc/gAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A7T H 0.5943396226415094 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4110471904277801 45.297400385141366 H 0.7440375685691833 0.0053253867663443 0.2506369650363922 H 0.036912839859724 0.7093353867530823 0.0005943276919424 0.0009129347163252 0.0037279734387993 0.0253390278667211 0.0324270576238632 0.1907504200935364 -69.00321960449219 -40.1317253112793 0.011038196273148 H 0.5 H 0.5188679245283019 H 0.5849056603773585 H 0.6037735849056604 H 0.4528301886792453 H 0.660377358490566 H 0.5943396226415094 H 0.6037735849056604 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.981149802712024e-06 7.699247325238696e-06 3.981149802712024e-06 7.699247325238696e-06 1 251184 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R10K H 0.2741935483870967 MIP NA NA Cytoplasmic|1 NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4590870141983032 105.13092625141144 H 0.9930419921875 0.0001701526780379 0.0067879538983106 H 0.0032994132488965 0.9882752895355223 0.0017778837354853 4.304733738536015e-05 9.03270483831875e-05 0.0007972813327796 0.0026384056545794 0.0030783931724727 -64.30662536621094 -40.32624053955078 0.0022494681179523 H 0.2862903225806452 H 0.3024193548387097 H 0.2983870967741936 H 0.3346774193548387 H 0.2620967741935484 H 0.3024193548387097 H 0.2741935483870967 H 0.2862903225806452 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 882312.0 VUS 1.0 2.787322649521392e-05 1.6837837402618634e-05 3.979719986091368e-05 9.091835332569256e-06 10 251274 6.974959887884323e-06 1.4172201617337664e-05 1.0 143370.0 aGg/aAg aGg/aAg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F13L H 0.3451776649746192 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.4759250283241272 95.51815318465228 H 0.9986315369606018 6.7053988459520025e-06 0.001361756469123 H 0.0003021527954842 0.9939210414886476 0.0044395946897566 3.1833656066737608e-06 1.7170644923680811e-06 0.0001140924505307 0.0008802796946838 0.0003379648260306 -67.54132843017578 -45.02322769165039 0.0002815748739521 H 0.3553299492385787 H 0.350253807106599 H 0.3604060913705584 H 0.3350253807106599 H 0.3401015228426396 H 0.3553299492385787 H 0.3451776649746193 H 0.4010152284263959 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.958429705468006e-06 7.687952436673953e-06 7.958429705468006e-06 7.687952436673953e-06 2 251306 NA NA NA NA ttC/ttA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A14T H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.1264142096042633 13.930845898389814 H 0.9988093376159668 5.17169974045828e-06 0.0011855487246066 H 0.0003811314818449 0.994668185710907 0.0038599832914769 3.7363834053394393e-06 1.4656243365607224e-06 0.0001244504819624 0.0006908507784828 0.0002701540652196 -63.94103622436523 -41.93472290039063 0.0001142463006544 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2805432377501e-05 1.7465979251132114e-05 2.387769927736372e-05 8.79752837961244e-06 6 251280 2.0925999706378207e-05 1.508853623155312e-05 3.0 143362.0 Gca/Aca Gca/Aca 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F16L H 0.3299492385786802 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.2535200119018555 50.88146638870239 H 0.9994545578956604 1.3144095873940389e-06 0.0005440724780783 H 0.0001725161127978 0.9907797574996948 0.0084680076688528 2.422451927941437e-07 3.222411635306344e-07 4.123646795051173e-05 0.0004315729311201 0.0001064156313077 -63.250770568847656 -43.23881912231445 2.410920933471061e-05 H 0.3197969543147208 H 0.3045685279187817 H 0.299492385786802 H 0.3299492385786802 H 0.3197969543147208 H 0.3096446700507614 H 0.3299492385786802 H 0.3045685279187817 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978550012107007e-06 9.23892253832724e-06 3.978550012107007e-06 9.23892253832724e-06 1 251348 NA NA NA NA Ttc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A18T H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0678934454917907 7.481857693195343 H 0.9993968009948728 1.2328019920460065e-06 0.0006020601722411 H 0.0002906589361373 0.9932613968849182 0.0058729955926537 1.1524438150445349e-06 2.444338065288321e-07 5.5183973017847165e-05 0.0004168125451542 0.0001015340021695 -64.61367034912111 -41.89375305175781 5.3336381824919954e-05 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978710083174518e-06 8.733190174264499e-06 3.978710083174518e-06 8.733190174264499e-06 1 251338 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T19I H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0266481339931488 3.6960961848497385 H 0.9994001388549804 4.838581844524015e-06 0.0005950257764197 H 0.0003070840321015 0.9966841340065002 0.0023288636002689 1.5961161352606723e-06 1.3204521565057803e-06 7.273074879776686e-05 0.0004865044029429 0.0001178523016278 -65.87642669677734 -42.32278823852539 3.502459003357217e-05 H 0.0 H 0.0070422535211267 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.5511926146992055e-05 NA NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.5511926146992055e-05 2.0 143380.0 NA aCa/aTa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L20F H 0.0914634146341463 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.2455446124076843 44.959218531847 H 0.9997113347053528 1.293314085160091e-06 0.0002873009361792 H 0.000122336030472 0.9969781637191772 0.0026119407266378 2.701207506561332e-07 3.684427554162539e-07 2.011383548961021e-05 0.0002154735993826 5.146584226167762e-05 -62.48983001708984 -44.12451171875 3.098669185419567e-05 H 0.0853658536585365 H 0.1402439024390244 H 0.1219512195121951 H 0.0914634146341463 H 0.0853658536585365 H 0.0853658536585365 H 0.0914634146341463 H 0.0975609756097561 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.182909858878702e-05 9.9074853589037e-06 3.182909858878702e-05 9.9074853589037e-06 8 251342 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L20P H 0.0914634146341463 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.2455446124076843 44.959218531847 H 0.9997113347053528 1.293314085160091e-06 0.0002873009361792 H 0.000122336030472 0.9969781637191772 0.0026119407266378 2.701207506561332e-07 3.684427554162539e-07 2.011383548961021e-05 0.0002154735993826 5.146584226167762e-05 -62.48983001708984 -44.12451171875 3.098669185419567e-05 H 0.0853658536585365 H 0.1402439024390244 H 0.1219512195121951 H 0.0914634146341463 H 0.0853658536585365 H 0.0853658536585365 H 0.0914634146341463 H 0.0975609756097561 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4834789033559453e-05 NA NA NA NA 6.976420081628021e-06 1.4834789033559453e-05 1.0 143340.0 NA cTc/cCc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L21V H 0.0121951219512195 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA e 0.3782418966293335 69.25609127283096 H 0.9997690320014954 4.572811747038941e-07 0.0002305000234628 H 0.0001147202419815 0.994465172290802 0.0051361829973757 2.0250308807590045e-07 9.297200875835189e-08 1.4889324120304088e-05 0.0002408799482509 2.776751534838695e-05 -64.07865142822266 -45.08827972412109 5.133763261255808e-05 H 0.0060975609756097 H 0.024390243902439 H 0.0121951219512195 H 0.0121951219512195 H 0.0121951219512195 H 0.0060975609756097 H 0.0121951219512195 H 0.0304878048780487 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2800156193284525e-05 1.6504677901248597e-05 3.182710133842193e-05 8.649585453474243e-06 8 251358 6.97467021382181e-06 1.405663772411492e-05 1.0 143376.0 Ctc/Gtc Ctc/Gtc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F22L H 0.0355329949238578 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.1349653899669647 27.08755376636982 H 0.999581515789032 1.4732447652932026e-06 0.0004170129250269 H 0.0002786950208246 0.9932554960250854 0.0059211431071162 9.747845979291014e-07 4.26992983193486e-07 4.139753946219571e-05 0.0004240654816385 7.775893755024299e-05 -66.67125701904297 -41.84574508666992 4.984860061085783e-05 H 0.0406091370558375 H 0.065989847715736 H 0.0558375634517766 H 0.0456852791878172 H 0.0355329949238578 H 0.0355329949238578 H 0.0355329949238578 H 0.0456852791878172 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97622999723535e-06 1.5187771142892504e-05 NA NA NA NA 6.97622999723535e-06 1.5187771142892504e-05 1.0 143344.0 NA Ttc/Ctc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V23I H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0557281374931335 8.565414732694625 H 0.9994416832923888 7.83301038609352e-06 0.000550422060769 H 0.0005574866663664 0.9937611222267152 0.0049324724823236 2.027618165811873e-06 2.2492372409033128e-06 5.642668475047686e-05 0.0006011127843521 8.718034223420544e-05 -66.46652984619139 -41.86840438842773 4.76799214084167e-05 H 0.0070422535211267 H 0.0140845070422535 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 309232.0 conflict 1.0 0.0001140230010211 1.7722614010333345e-05 0.0001432440039934 8.466388447811087e-06 36 251320 6.278869841480628e-05 1.5569563706476652e-05 9.0 143338.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 1 0.0 NA NA NA NA NA NA G26R H 0.0238095238095238 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0374531745910644 2.9475648403167725 H 0.998016357421875 9.076245078176726e-06 0.0019745964091271 H 0.0017383268568664 0.9689854979515076 0.0270839668810367 6.957724508538376e-06 2.7352073175279656e-06 0.0002990990760736 0.0015006157336756 0.0003828939225059 -65.29299926757811 -41.98872375488281 0.0001549900480313 H 0.0238095238095238 H 0.0238095238095238 H 0.0119047619047619 H 0.0119047619047619 H 0.0119047619047619 H 0.0119047619047619 H 0.0238095238095238 H 0.0238095238095238 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.978069798904472e-06 9.19869883424254e-06 3.978069798904472e-06 9.19869883424254e-06 1 251378 NA NA NA NA Ggc/Cgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L27F H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0923169553279876 16.90323452055454 H 0.992128610610962 7.101074152160436e-05 0.0078004030510783 H 0.0051879249513149 0.9733558893203736 0.0124692060053348 3.805563028436154e-05 2.578821295173839e-05 0.000754693581257 0.006618358194828 0.0015500420704483 -67.27407836914061 -38.39870071411133 0.0001023304939735 H 0.0060975609756097 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0060975609756097 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977850155933993e-06 8.106657488251669e-06 3.977850155933993e-06 8.106657488251669e-06 1 251392 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G28S H 0.0 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.1644491255283355 12.942146179080009 H 0.981978476047516 0.0001411086414009 0.0178804546594619 H 0.0172273349016904 0.9381157755851746 0.0219783410429954 7.255254604388028e-05 5.4849893786013126e-05 0.0015104984631761 0.0188062936067581 0.0022342824377119 -65.71240234375 -33.44095993041992 0.0003374571970198 H 0.0357142857142857 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.093250077450648e-05 1.5900192558765272e-05 NA NA NA NA 2.093250077450648e-05 1.5900192558765272e-05 3.0 143318.0 NA Ggc/Agc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A30G H 0.1509433962264151 MIP TRANSMEM|1 NA NA NA NA NA HELIX|1 NA NA NA b 0.0575979948043823 6.347299027442932 H 0.9330365657806396 0.0002387493586866 0.0667246207594871 H 0.085786148905754 0.7888245582580566 0.0140549028292298 0.0001897622569231 8.841545059112832e-05 0.0058544450439512 0.0973052084445953 0.0078964717686176 -68.88636779785156 -30.84703254699707 0.0014916947111487 H 0.1226415094339622 T 0.2264150943396226 H 0.160377358490566 H 0.1698113207547169 H 0.1792452830188679 H 0.1509433962264151 H 0.1509433962264151 H 0.0849056603773584 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.066267237314579e-06 1.880872408156271e-05 3.977469987148652e-06 7.695445423235378e-06 1 251416 6.97583982400829e-06 1.7162407212112252e-05 1.0 143352.0 gCc/gGc gCc/gGc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P34S S 0.2426470588235294 MIP NA NA Extracellular|1 NA NA STRAND|1 NA NA NA NA e 0.5490200519561768 77.90594537258148 C 0.1597624868154525 0.0018151454860344 0.8384224176406859 C 0.1074943915009498 0.0502783842384815 0.0006103417836129 0.0009442121954634 0.0011233347468078 0.1273127645254135 0.2714879512786865 0.4407485127449036 -66.15067291259766 -11.957727432250977 0.0227654054760932 S 0.3235294117647059 T 0.6838235294117647 S 0.6911764705882353 S 0.6102941176470589 S 0.6985294117647058 S 0.2426470588235294 S 0.2426470588235294 S 0.4779411764705882 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977189862780506e-06 8.529354729081823e-06 3.977189862780506e-06 8.529354729081823e-06 1 251434 NA NA NA NA Cca/Tca NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A36V S 0.4339622641509434 MIP NA NA Extracellular|1 NA NA STRAND|1 NA NA NA NA e 0.5264146327972412 58.01089253425597 C 0.2891898155212402 0.0096295103430748 0.7011807560920715 C 0.1551606357097625 0.0907223895192146 0.0007170648896135 0.0051762079820036 0.0048586660996079 0.2351224571466446 0.2118701189756393 0.2963725328445434 -87.03374481201172 6.3521599769592285 0.0162059646099805 S 0.6037735849056604 - 0.3490566037735849 S 0.3396226415094339 S 0.4339622641509434 S 0.3018867924528302 S 0.3867924528301887 S 0.4339622641509434 S 0.5 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97564018992125e-06 1.6667230748546137e-05 NA NA NA NA 6.97564018992125e-06 1.6667230748546137e-05 1.0 143356.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L41P H 0.0548780487804878 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.4187830984592438 76.67918532788754 H 0.982676923274994 0.000133127454319 0.0171899870038032 H 0.0052921888418495 0.9773739576339722 0.0019042224157601 4.026241731480695e-05 5.071660780231469e-05 0.001935921027325 0.0096516851335763 0.003751054406166 -63.86090469360352 -38.923072814941406 0.0006888147909194 H 0.073170731707317 H 0.0548780487804878 H 0.048780487804878 H 0.0548780487804878 H 0.0426829268292682 H 0.048780487804878 H 0.0548780487804878 H 0.1219512195121951 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.06595932606776e-06 1.6483390342655955e-05 3.977029791712994e-06 8.758116275427639e-06 1 251444 6.976029908400959e-06 1.3964152551961505e-05 1.0 143348.0 cTa/cCa cTa/cCa 0 0.0 NA NA NA NA NA NA Q42P H 0.0555555555555555 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3698136806488037 66.04872336387632 H 0.9962517619132996 5.616842463496141e-05 0.0036920914426445 H 0.0024851714260876 0.991860330104828 0.0019716308452188 3.017615017597564e-05 2.292153840244282e-05 0.0005475225043483 0.0019485788652673 0.0011336763855069 -66.54938507080078 -41.10423278808594 0.0005052614142186 H 0.0404040404040404 H 0.0656565656565656 H 0.0252525252525252 H 0.0454545454545454 H 0.0404040404040404 H 0.0404040404040404 H 0.0555555555555555 H 0.0555555555555555 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2665888092877495e-05 1.7458704354739327e-05 1.1931800145248417e-05 8.971858185077815e-06 3 251428 1.3953599591332022e-05 1.4977053063037672e-05 2.0 143332.0 cAg/cCg cAg/cCg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA Q42R H 0.0555555555555555 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3698136806488037 66.04872336387632 H 0.9962517619132996 5.616842463496141e-05 0.0036920914426445 H 0.0024851714260876 0.991860330104828 0.0019716308452188 3.017615017597564e-05 2.292153840244282e-05 0.0005475225043483 0.0019485788652673 0.0011336763855069 -66.54938507080078 -41.10423278808594 0.0005052614142186 H 0.0404040404040404 H 0.0656565656565656 H 0.0252525252525252 H 0.0454545454545454 H 0.0404040404040404 H 0.0404040404040404 H 0.0555555555555555 H 0.0555555555555555 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.954559805511963e-06 8.397118325388437e-06 7.954559805511963e-06 8.397118325388437e-06 2 251428 NA NA NA NA cAg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I43T H 0.1301775147928994 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0970485508441925 17.953981906175613 H 0.9972232580184937 6.319198291748762e-05 0.0027135489508509 H 0.0014666434144601 0.9943345785140992 0.0022209475282579 2.362532904953696e-05 2.362875602557324e-05 0.0002643977932166 0.0009317664080299 0.000734437664505 -62.68268203735352 -41.571754455566406 0.000120517637697 H 0.1301775147928994 H 0.1065088757396449 H 0.1715976331360946 H 0.1183431952662721 H 0.1301775147928994 H 0.1242603550295858 H 0.1301775147928994 H 0.1597633136094674 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.065827426490827e-06 1.6174110131083497e-05 3.977119831688469e-06 9.763789116078587e-06 1 251438 6.975250016694189e-06 1.2894582607791652e-05 1.0 143364.0 aTt/aCt aTt/aCt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A44G H 0.0094339622641509 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0331353843212127 3.651519352197647 H 0.9982447624206544 4.760867159347981e-05 0.0017076015938073 H 0.0011360230855643 0.9945032596588136 0.00268872291781 8.277585038740654e-06 1.7708396626403555e-05 0.0001860416232375 0.0010064415400847 0.0004535915795713 -63.10689163208008 -40.87462615966797 6.149523687781766e-05 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0094339622641509 H 0.0188679245283018 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.4026106351712802e-05 NA NA NA NA 1.394890023220796e-05 1.4026106351712802e-05 2.0 143380.0 NA gCc/gGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA M45I H 0.0372340425531914 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3104443550109863 62.11991543769835 H 0.998539924621582 1.6207706721615978e-05 0.0014438756043091 H 0.0005344517412595 0.9942016005516052 0.0039602257311344 3.78969639314164e-06 5.517436875379644e-06 0.0001499558275099 0.0008207421051338 0.0003236739139538 -64.81626892089844 -43.33988571166992 0.0001021758434944 H 0.0372340425531914 H 0.0372340425531914 H 0.026595744680851 H 0.0319148936170212 H 0.0319148936170212 H 0.0319148936170212 H 0.0372340425531914 H 0.0372340425531914 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.954819920996671e-06 7.904526283711971e-06 7.954819920996671e-06 7.904526283711971e-06 2 251420 NA NA NA NA atG/atA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA M45L H 0.0372340425531914 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3104443550109863 62.11991543769835 H 0.998539924621582 1.6207706721615978e-05 0.0014438756043091 H 0.0005344517412595 0.9942016005516052 0.0039602257311344 3.78969639314164e-06 5.517436875379644e-06 0.0001499558275099 0.0008207421051338 0.0003236739139538 -64.81626892089844 -43.33988571166992 0.0001021758434944 H 0.0372340425531914 H 0.0372340425531914 H 0.026595744680851 H 0.0319148936170212 H 0.0319148936170212 H 0.0319148936170212 H 0.0372340425531914 H 0.0372340425531914 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977409960498336e-06 7.90458529383608e-06 3.977409960498336e-06 7.90458529383608e-06 1 251420 NA NA NA NA Atg/Ttg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A46E H 0.0 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.1949841082096099 21.487248724699025 H 0.9987205862998962 1.2156385309936011e-05 0.0012671897420659 H 0.0005755623569712 0.9926377534866332 0.0056098476052284 6.981850219744957e-06 3.5594634937297087e-06 0.000131381151732 0.0007552356109954 0.0002796789922285 -65.37348937988281 -43.45737075805664 0.0001028843835229 H 0.0094339622641509 H 0.0377358490566037 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977790129283676e-06 8.884490631503603e-06 3.977790129283676e-06 8.884490631503603e-06 1 251396 NA NA NA NA gCg/gAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A46V H 0.0 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.1949841082096099 21.487248724699025 H 0.9987205862998962 1.2156385309936011e-05 0.0012671897420659 H 0.0005755623569712 0.9926377534866332 0.0056098476052284 6.981850219744957e-06 3.5594634937297087e-06 0.000131381151732 0.0007552356109954 0.0002796789922285 -65.37348937988281 -43.45737075805664 0.0001028843835229 H 0.0094339622641509 H 0.0377358490566037 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 631682.0 VUS 1.0 3.977790129283676e-06 7.767155013364661e-06 3.977790129283676e-06 7.767155013364661e-06 1 251396 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA F47I H 0.0050761421319796 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.1448478102684021 29.070955520868303 H 0.9983662962913512 4.1141076508210965e-05 0.0015925482148304 H 0.0008609391516074 0.992405116558075 0.0049453489482402 1.1401044503145386e-05 1.812467962736264e-05 0.000219753026613 0.0010940504726022 0.0004452420689631 -63.95430755615234 -41.7486686706543 0.0001069593417923 H 0.015228426395939 H 0.0355329949238578 H 0.0050761421319796 H 0.0050761421319796 H 0.0050761421319796 H 0.0050761421319796 H 0.0050761421319796 H 0.0355329949238578 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.977530013798969e-06 7.934381755321776e-06 3.977530013798969e-06 7.934381755321776e-06 1 251412 NA NA NA NA Ttt/Att NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T53I H 0.0352112676056338 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.2882321774959564 39.97780301868915 H 0.9986752867698668 1.2186174899397884e-05 0.0013125678524374 H 0.0009429549681954 0.992077112197876 0.005515219643712 3.230380116292508e-06 4.968424036633223e-06 0.000145983940456 0.0010264996672049 0.0002841002715285 -66.68461608886719 -43.13423156738281 6.649865827057508e-05 H 0.0352112676056338 H 0.056338028169014 H 0.0352112676056338 H 0.028169014084507 H 0.028169014084507 H 0.028169014084507 H 0.0352112676056338 H 0.0845070422535211 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.6880657618981142e-05 NA NA NA NA 1.3949899766885212e-05 1.6880657618981142e-05 2.0 143370.0 NA aCc/aTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V55I H 0.0704225352112676 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0644791722297668 9.910448771715163 H 0.9949829578399658 0.0001021449716063 0.0049148853868246 H 0.0068328464403748 0.9712716341018676 0.0161149185150861 3.8551774196093895e-05 5.157656050869264e-05 0.000578865117859 0.0039156470447778 0.0011958961840718 -66.92632293701172 -39.95209503173828 0.0001928770798258 H 0.1338028169014084 H 0.0492957746478873 H 0.1267605633802817 H 0.1408450704225352 H 0.0985915492957746 H 0.0633802816901408 H 0.0704225352112676 H 0.1619718309859155 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.980449946539012e-06 8.259331930884895e-06 3.980449946539012e-06 8.259331930884895e-06 1 251228 NA NA NA NA Gta/Ata NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Q56P H 0.0303030303030303 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3006010055541992 53.68733959197998 H 0.9837740659713744 0.0003194911114405 0.0159064754843711 H 0.0113583896309137 0.9489910006523132 0.0220672208815813 6.816654786234722e-05 0.0001374645653413 0.0015198456821963 0.0134455636143684 0.0024123459588736 -68.04848480224611 -38.49568176269531 0.0002412629401078 H 0.0454545454545454 H 0.0555555555555555 H 0.0858585858585858 H 0.0959595959595959 H 0.0151515151515151 H 0.0101010101010101 H 0.0303030303030303 H 0.0353535353535353 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17842.0 pathogenic 1.0 2.3886499548098072e-05 9.008510849157874e-06 2.3886499548098072e-05 9.008510849157874e-06 6 251188 NA NA NA NA cAg/cCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A57G H 0.0094339622641509 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3341992199420929 36.82875403761864 H 0.9356029629707336 0.0003927744110114 0.0640042051672935 H 0.024871926754713 0.8767823576927185 0.0314206555485725 0.0001757231511874 0.0001429108378943 0.0049133896827697 0.0554353557527065 0.0062576602213084 -71.2319107055664 -32.688751220703125 0.0005071186460554 H 0.0188679245283018 H 0.0377358490566037 H 0.0283018867924528 H 0.0094339622641509 H 0.0471698113207547 H 0.0094339622641509 H 0.0094339622641509 H 0.0283018867924528 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2674124398323574e-05 1.8768073985338225e-05 1.1945599908358416e-05 8.544477208619607e-06 3 251138 1.3950299944553988e-05 1.6710251654314172e-05 2.0 143366.0 gCt/gGt gCt/gGt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A57T H 0.0094339622641509 MIP TRANSMEM|2 NA NA NA NA NA HELIX|2 NA NA NA e 0.3341992199420929 36.82875403761864 H 0.9356029629707336 0.0003927744110114 0.0640042051672935 H 0.024871926754713 0.8767823576927185 0.0314206555485725 0.0001757231511874 0.0001429108378943 0.0049133896827697 0.0554353557527065 0.0062576602213084 -71.2319107055664 -32.688751220703125 0.0005071186460554 H 0.0188679245283018 H 0.0377358490566037 H 0.0283018867924528 H 0.0094339622641509 H 0.0471698113207547 H 0.0094339622641509 H 0.0094339622641509 H 0.0283018867924528 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.069556734045411e-06 1.7097790178592726e-05 3.9813999137550135e-06 8.331678017091283e-06 1 251168 6.97622999723535e-06 1.493042432118725e-05 1.0 143344.0 Gct/Act Gct/Act 0 0.0 NA NA NA NA NA NA I61K H 0.136094674556213 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.2127565741539 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.0353411473333835 0.6526034474372864 T 0.1051729321479797 0.2306262254714965 0.0385193489491939 0.023422721773386 0.0198385883122682 0.1180184781551361 0.2363144755363465 0.228087306022644 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.001225373125635 H 0.2011834319526627 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.1420118343195266 H 0.1420118343195266 H 0.1242603550295858 H 0.136094674556213 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952800145489169e-05 1.4558581497858315e-05 NA NA NA NA 1.3952800145489169e-05 1.4558581497858315e-05 2.0 143340.0 NA aTa/aAa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I61L H 0.136094674556213 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.2127565741539 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.0353411473333835 0.6526034474372864 T 0.1051729321479797 0.2306262254714965 0.0385193489491939 0.023422721773386 0.0198385883122682 0.1180184781551361 0.2363144755363465 0.228087306022644 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.001225373125635 H 0.2011834319526627 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.1420118343195266 H 0.1420118343195266 H 0.1242603550295858 H 0.136094674556213 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.983489932579687e-06 9.811795308238067e-06 3.983489932579687e-06 9.811795308238067e-06 1 251036 NA NA NA NA Ata/Cta NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I61T H 0.136094674556213 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.2127565741539 39.359966218471534 C 0.3120554089546204 0.0353411473333835 0.6526034474372864 T 0.1051729321479797 0.2306262254714965 0.0385193489491939 0.023422721773386 0.0198385883122682 0.1180184781551361 0.2363144755363465 0.228087306022644 -92.54257202148438 -16.645164489746097 0.001225373125635 H 0.2011834319526627 H 0.2189349112426036 H 0.2248520710059172 H 0.1420118343195266 H 0.1420118343195266 H 0.1242603550295858 H 0.136094674556213 H 0.1952662721893491 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.984639988630079e-06 7.793282343690924e-06 3.984639988630079e-06 7.793282343690924e-06 1 250964 NA NA NA NA aTa/aCa NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S62N H 0.0769230769230769 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0753610730171203 8.832317757606507 C 0.1601838618516922 0.0172318276017904 0.822584331035614 C 0.0400215722620487 0.132522240281105 0.0063328305259346 0.0367776714265346 0.0061048893257975 0.1812086850404739 0.2498137205839157 0.34721839427948 -92.1742172241211 55.02476119995117 0.0011368830455467 H 0.0923076923076923 H 0.0846153846153846 H 0.123076923076923 H 0.0846153846153846 H 0.0923076923076923 H 0.1153846153846154 H 0.0769230769230769 H 0.123076923076923 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.072591588821488e-06 1.7651650663109828e-05 3.98539987145341e-06 8.944903873867593e-06 1 250916 6.97545010552858e-06 1.521740667195742e-05 1.0 143360.0 aGc/aAc aGc/aAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA S62R H 0.0769230769230769 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA HELIX|2 NA NA NA b 0.0753610730171203 8.832317757606507 C 0.1601838618516922 0.0172318276017904 0.822584331035614 C 0.0400215722620487 0.132522240281105 0.0063328305259346 0.0367776714265346 0.0061048893257975 0.1812086850404739 0.2498137205839157 0.34721839427948 -92.1742172241211 55.02476119995117 0.0011368830455467 H 0.0923076923076923 H 0.0846153846153846 H 0.123076923076923 H 0.0846153846153846 H 0.0923076923076923 H 0.1153846153846154 H 0.0769230769230769 H 0.123076923076923 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.988070147897815e-06 8.729341724355145e-06 3.988070147897815e-06 8.729341724355145e-06 1 250748 NA NA NA NA agC/agA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G63R - 0.4761904761904761 MIP NA NA Cytoplasmic|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.0606984496116638 4.776967984437943 C 0.07698854804039 0.0041485372930765 0.9188628792762756 C 0.0456815399229526 0.0370502658188343 0.0079272175207734 0.00411914056167 0.0027801201213151 0.2016424685716629 0.3223982453346252 0.378400981426239 50.53944396972656 -3.9354500770568848 0.0001425250375177 - 0.5714285714285714 - 0.6071428571428571 - 0.5476190476190477 - 0.5119047619047619 - 0.4761904761904762 - 0.5357142857142857 - 0.4761904761904762 - 0.5238095238095238 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17830.0 pathogenic 1.0 1.594360037415754e-05 9.376426689367732e-06 1.594360037415754e-05 9.376426689367732e-06 4 250884 NA NA NA NA Ggg/Agg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A64P - 0.0660377358490566 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0215299427509307 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.0116503424942493 0.8499643206596375 C 0.1281444877386093 0.0553562715649604 0.0103051215410232 0.0135676255449652 0.0068668094463646 0.1400327533483505 0.2527493834495544 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.0001258263218915 - 0.0471698113207547 - 0.1037735849056603 - 0.0566037735849056 - 0.0849056603773584 - 0.0754716981132075 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.0849056603773584 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.985309821378905e-06 8.921940127697755e-06 7.985309821378905e-06 8.921940127697755e-06 2 250460 NA NA NA NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A64T - 0.0660377358490566 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0215299427509307 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.0116503424942493 0.8499643206596375 C 0.1281444877386093 0.0553562715649604 0.0103051215410232 0.0135676255449652 0.0068668094463646 0.1400327533483505 0.2527493834495544 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.0001258263218915 - 0.0471698113207547 - 0.1037735849056603 - 0.0566037735849056 - 0.0849056603773584 - 0.0754716981132075 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.0849056603773584 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.078461284860142e-06 1.6336170019690164e-05 3.992649908468593e-06 7.978550980861824e-06 1 250460 6.97545010552858e-06 1.42552858672849e-05 1.0 143360.0 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A64V - 0.0660377358490566 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0215299427509307 2.3725996911525726 C 0.1383853703737259 0.0116503424942493 0.8499643206596375 C 0.1281444877386093 0.0553562715649604 0.0103051215410232 0.0135676255449652 0.0068668094463646 0.1400327533483505 0.2527493834495544 0.3929775357246399 -72.69857788085938 -5.394492149353027 0.0001258263218915 - 0.0471698113207547 - 0.1037735849056603 - 0.0566037735849056 - 0.0849056603773584 - 0.0754716981132075 - 0.0660377358490566 - 0.0660377358490566 - 0.0849056603773584 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.611921526606339e-05 NA NA NA NA 6.976029908400959e-06 1.611921526606339e-05 1.0 143348.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA H65Y - 0.0869565217391304 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0613967180252075 11.168063008785248 C 0.0916256308555603 0.0932324156165123 0.8151419758796692 C 0.0921773463487625 0.0433817952871322 0.0095155416056513 0.1119873523712158 0.044673103839159 0.1591913551092147 0.2306299954652786 0.308443546295166 -92.96077728271484 27.69938087463379 0.0004053353040944 - 0.1521739130434782 - 0.1630434782608695 - 0.1521739130434782 - 0.1521739130434782 - 0.217391304347826 - 0.108695652173913 - 0.0869565217391304 - 0.1467391304347826 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.989910055679502e-06 8.895915802703407e-06 3.989910055679502e-06 8.895915802703407e-06 1 250632 NA NA NA NA Cac/Tac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V70L H 0.0422535211267605 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.0348886847496032 5.362390846014024 H 0.99749493598938 0.0002063609426841 0.0022987364791333 H 0.0023878186475485 0.9908638596534728 0.0041374377906322 6.466417835326865e-05 9.066353959497064e-05 0.0002770673600025 0.0016012523556128 0.0005771871656179 -65.30359649658203 -41.45535278320313 2.7263995434623208e-05 H 0.0211267605633802 H 0.0492957746478873 H 0.056338028169014 H 0.056338028169014 H 0.0352112676056338 H 0.0492957746478873 H 0.0422535211267605 H 0.028169014084507 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5252508636044674e-05 NA NA NA NA 6.975149972276994e-06 1.5252508636044674e-05 1.0 143366.0 NA Gtg/Ctg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V70M H 0.0422535211267605 MIP NA INTRAMEM|1 NA NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.0348886847496032 5.362390846014024 H 0.99749493598938 0.0002063609426841 0.0022987364791333 H 0.0023878186475485 0.9908638596534728 0.0041374377906322 6.466417835326865e-05 9.066353959497064e-05 0.0002770673600025 0.0016012523556128 0.0005771871656179 -65.30359649658203 -41.45535278320313 2.7263995434623208e-05 H 0.0211267605633802 H 0.0492957746478873 H 0.056338028169014 H 0.056338028169014 H 0.0352112676056338 H 0.0492957746478873 H 0.0422535211267605 H 0.028169014084507 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 446860.0 pathogenic 2.0 1.015341189217798e-05 1.7707198572148543e-05 7.981159797054715e-06 8.206923886380305e-06 2 250590 1.3950299944553988e-05 1.5690483791032694e-05 2.0 143366.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA C74G H 0.1111111111111111 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.0232220590114593 3.260377085208893 H 0.998538374900818 5.077041714685038e-05 0.0014108194736763 H 0.0048361411318182 0.9846280813217164 0.0082458527758717 1.060665545082884e-05 2.3632106604054567e-05 0.0001361796312266 0.0018733032047748 0.0002461789408698 -66.01241302490234 -39.3445930480957 9.324702659796458e-06 H 0.0592592592592592 H 0.1185185185185185 H 0.1851851851851852 H 0.037037037037037 H 0.1037037037037037 H 0.037037037037037 H 0.1111111111111111 H 0.0518518518518518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 35693.0 pathogenic 1.0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA C74Y H 0.1111111111111111 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|3 NA NA NA b 0.0232220590114593 3.260377085208893 H 0.998538374900818 5.077041714685038e-05 0.0014108194736763 H 0.0048361411318182 0.9846280813217164 0.0082458527758717 1.060665545082884e-05 2.3632106604054567e-05 0.0001361796312266 0.0018733032047748 0.0002461789408698 -66.01241302490234 -39.3445930480957 9.324702659796458e-06 H 0.0592592592592592 H 0.1185185185185185 H 0.1851851851851852 H 0.037037037037037 H 0.1037037037037037 H 0.037037037037037 H 0.1111111111111111 H 0.0518518518518518 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952299923403184e-05 1.5027573363571524e-05 NA NA NA NA 1.3952299923403184e-05 1.5027573363571524e-05 2.0 143346.0 NA tGc/tAc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA G77S T 0.119047619047619 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.195059597492218 15.351190322637557 C 0.3511357605457306 0.0004806969373021 0.6483835577964783 T 0.0125327156856656 0.3631823360919952 0.0082842214033007 0.0003596835886128 5.058897295384668e-05 0.0230745933949947 0.5813400745391846 0.0111758047714829 -86.72986602783203 -3.2789108753204346 0.0004988624132238 T 0.2380952380952381 S 0.25 H 0.25 S 0.1904761904761904 S 0.0833333333333333 T 0.5714285714285714 T 0.119047619047619 H 0.4166666666666667 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.2862815868513525e-05 1.688840981614202e-05 1.9976299881818704e-05 8.88608708879221e-06 5 250296 2.790260077745188e-05 1.43616100200626e-05 4.0 143356.0 Ggc/Agc Ggc/Agc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V80A S 0.1830985915492957 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1029334068298339 15.820864629745484 C 0.0013876786688342 0.0283154491335153 0.9702968001365662 C 0.0002652223629411 0.000646122789476 3.3452910429332405e-05 0.0127069633454084 0.0141868572682142 0.4731590747833252 0.004340052139014 0.4946623742580414 -110.71260833740234 142.57656860351562 0.0006687848945148 S 0.8098591549295775 - 0.2112676056338028 - 0.1690140845070422 - 0.2323943661971831 - 0.3591549295774648 - 0.1478873239436619 S 0.1830985915492957 - 0.1760563380281689 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.998749889433384e-06 8.638746983690975e-06 3.998749889433384e-06 8.638746983690975e-06 1 250078 NA NA NA NA gTc/gCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V80I S 0.1830985915492957 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1029334068298339 15.820864629745484 C 0.0013876786688342 0.0283154491335153 0.9702968001365662 C 0.0002652223629411 0.000646122789476 3.3452910429332405e-05 0.0127069633454084 0.0141868572682142 0.4731590747833252 0.004340052139014 0.4946623742580414 -110.71260833740234 142.57656860351562 0.0006687848945148 S 0.8098591549295775 - 0.2112676056338028 - 0.1690140845070422 - 0.2323943661971831 - 0.3591549295774648 - 0.1478873239436619 S 0.1830985915492957 - 0.1760563380281689 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.778471870894975e-05 1.9861577895639157e-05 2.397599928372074e-05 8.893172745773189e-06 6 250250 6.976129952818155e-06 1.7759328675892533e-05 1.0 143346.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA S81F - 0.3461538461538461 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4361588954925537 51.117822551727286 C 0.002402038546279 0.0045675388537347 0.9930304884910583 C 8.585441537434235e-05 0.000805226911325 2.2476519916381213e-06 0.0009854581439867 0.0014558850089088 0.006299381610006 0.0005690045654773 0.9897969365119934 -75.8786849975586 155.40113830566406 0.0005986459436826 S 0.7307692307692307 - 0.5 - 0.476923076923077 - 0.4307692307692308 - 0.5538461538461539 - 0.476923076923077 - 0.3461538461538461 - 0.3230769230769231 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.997220119345002e-06 8.740949637851256e-06 3.997220119345002e-06 8.740949637851256e-06 1 250174 NA NA NA NA tCc/tTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V82I H 0.7887323943661971 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.7032608985900879 108.09120011329652 H 0.8941864371299744 0.0002206098288297 0.1055929213762283 H 0.0387514755129814 0.8637351393699646 0.0005028943414799 7.172151526901871e-05 9.53267008299008e-05 0.0147292101755738 0.0665324255824089 0.0155817717313766 -60.51805114746094 -36.99993515014648 0.0006998094613663 - 0.2887323943661972 H 0.7746478873239436 H 0.7816901408450704 H 0.7957746478873241 H 0.7605633802816901 H 0.8239436619718309 H 0.7887323943661971 H 0.8309859154929577 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 9.149996367174008e-05 1.797020145170373e-05 0.000115957998787 8.421373294705739e-06 29 250090 4.883079964201898e-05 1.58747791180234e-05 7.0 143352.0 Gtt/Att Gtt/Att 0 0.0 NA NA NA NA NA NA L83R H 0.4146341463414634 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.6594114899635315 120.7382438123226 H 0.9282002449035645 0.0003789243637584 0.0714207738637924 H 0.102033257484436 0.7994551658630371 0.0012451909715309 0.0002192303072661 0.0001716115657472 0.0105060385540127 0.0761448070406913 0.0102246701717376 -65.10060119628906 -33.09945297241211 0.0004901985521428 H 0.7073170731707317 H 0.5609756097560976 H 0.5914634146341463 H 0.5853658536585366 H 0.5853658536585366 H 0.5914634146341463 H 0.4146341463414634 H 0.5060975609756098 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.000130047643324e-06 9.077324250116557e-06 4.000130047643324e-06 9.077324250116557e-06 1 249992 NA NA NA NA cTc/cGc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R84Q H 0.2056451612903226 MIP NA NA Cytoplasmic|3 NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1952514052391052 44.712571799755096 H 0.9611335992813108 0.0002264410577481 0.0386400073766708 H 0.1320472657680511 0.8121097683906555 0.0019152222666889 0.0001544149854453 8.627500938018784e-05 0.0047646770253777 0.0384240113198757 0.0104984119534492 -72.2690658569336 -30.41126823425293 0.0005379659123718 H 0.3588709677419355 H 0.2298387096774193 H 0.2983870967741936 H 0.3306451612903225 H 0.3387096774193548 H 0.2983870967741936 H 0.2056451612903226 H 0.3064516129032258 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.0928700905642472e-05 1.360785497477102e-05 NA NA NA NA 2.0928700905642472e-05 1.360785497477102e-05 3.0 143344.0 NA cGa/cAa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A85T H 0.0471698113207547 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0538882315158844 5.938483113050461 H 0.994504988193512 8.551801329303999e-06 0.0054864166304469 H 0.0015700727235525 0.9933846592903136 0.0010746207553893 2.429753521937528e-06 2.1592711618723115e-06 0.0007259122212417 0.0021309140138328 0.0011092436034232 -60.69098663330078 -42.83027267456055 3.200368882971816e-05 H 0.0188679245283018 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0849056603773584 H 0.0660377358490566 H 0.0471698113207547 H 0.0943396226415094 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.001470188086387e-06 8.833567107905292e-06 4.001470188086387e-06 8.833567107905292e-06 1 249908 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A85V H 0.0471698113207547 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0538882315158844 5.938483113050461 H 0.994504988193512 8.551801329303999e-06 0.0054864166304469 H 0.0015700727235525 0.9933846592903136 0.0010746207553893 2.429753521937528e-06 2.1592711618723115e-06 0.0007259122212417 0.0021309140138328 0.0011092436034232 -60.69098663330078 -42.83027267456055 3.200368882971816e-05 H 0.0188679245283018 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 H 0.0849056603773584 H 0.0660377358490566 H 0.0471698113207547 H 0.0943396226415094 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.005059963674285e-06 9.5630816644343e-06 4.005059963674285e-06 9.5630816644343e-06 1 249684 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A86T H 0.5566037735849056 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.5491927266120911 60.52103847265244 H 0.9940509200096128 1.975163831957616e-05 0.0059292651712894 H 0.0017463972326368 0.9871686697006226 0.0046632857993245 1.0814656889124308e-05 5.30496936335112e-06 0.0006510002422146 0.0048975837416946 0.0008569069905206 -64.16121673583984 -42.17277145385742 9.705143747851253e-05 H 0.5471698113207547 H 0.5283018867924528 H 0.5660377358490566 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 H 0.5471698113207547 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.202139992528828e-05 8.373896025359967e-06 1.202139992528828e-05 8.373896025359967e-06 3 249554 NA NA NA NA Gcc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A86V H 0.5566037735849056 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.5491927266120911 60.52103847265244 H 0.9940509200096128 1.975163831957616e-05 0.0059292651712894 H 0.0017463972326368 0.9871686697006226 0.0046632857993245 1.0814656889124308e-05 5.30496936335112e-06 0.0006510002422146 0.0048975837416946 0.0008569069905206 -64.16121673583984 -42.17277145385742 9.705143747851253e-05 H 0.5471698113207547 H 0.5283018867924528 H 0.5660377358490566 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 H 0.5471698113207547 H 0.5566037735849056 H 0.5377358490566038 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6942193711504412e-05 NA NA NA NA 6.975350061111385e-06 1.6942193711504412e-05 1.0 143362.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA F87V H 0.4010152284263959 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.3218860030174255 64.60252080559731 H 0.996920108795166 1.235231957252836e-05 0.0030675614252686 H 0.0022718636319041 0.989410161972046 0.0051711369305849 1.1267301488260271e-05 4.112760052521479e-06 0.00035879726056 0.0022164429537951 0.0005563298473134 -64.19858551025389 -40.2968978881836 7.948389975354074e-05 H 0.5736040609137056 H 0.5126903553299492 H 0.5380710659898477 H 0.5126903553299492 H 0.4923857868020304 H 0.5025380710659898 H 0.4010152284263959 H 0.5025380710659898 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.601999974809587e-05 7.882262296022613e-06 1.601999974809587e-05 7.882262296022613e-06 4 249688 NA NA NA NA Ttc/Gtc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y88N H 0.009009009009009 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0218666493892669 4.672902974486352 H 0.9996685981750488 5.6059820963128e-06 0.0003257931675761 H 0.0003947716031689 0.9970116615295408 0.0021944695618003 1.493279683018045e-06 1.769451728250715e-06 3.878449933836237e-05 0.0002784559037536 7.85713127697818e-05 -62.38782119750977 -42.10335159301758 1.347518355032662e-05 H 0.0405405405405405 H 0.0315315315315315 H 0.0225225225225225 H 0.009009009009009 H 0.0225225225225225 H 0.009009009009009 H 0.009009009009009 H 0.036036036036036 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.6497680558874807e-05 NA NA NA NA 6.975929863983764e-06 1.6497680558874807e-05 1.0 143350.0 NA Tac/Aac NA 0.0 NA NA NA NA NA NA V89A H 0.2464788732394366 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1912584900856018 29.396429926157 H 0.9997454285621644 7.144911364775908e-07 0.0002537990221753 H 8.197478018701077e-05 0.9969373941421508 0.0027666054666042 1.13172390570071e-07 1.424725297738405e-07 1.5426008758367967e-05 0.0001588545273989 3.94130329368636e-05 -61.89892578125 -43.1649169921875 4.535486823442625e-06 H 0.2746478873239437 H 0.2957746478873239 H 0.2253521126760563 H 0.2535211267605634 H 0.2464788732394366 H 0.2535211267605634 H 0.2464788732394366 H 0.2746478873239437 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.031350262172053e-06 9.967012147097504e-06 8.031350262172053e-06 9.967012147097504e-06 2 249024 NA NA NA NA gTg/gCg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V89M H 0.2464788732394366 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.1912584900856018 29.396429926157 H 0.9997454285621644 7.144911364775908e-07 0.0002537990221753 H 8.197478018701077e-05 0.9969373941421508 0.0027666054666042 1.13172390570071e-07 1.424725297738405e-07 1.5426008758367967e-05 0.0001588545273989 3.94130329368636e-05 -61.89892578125 -43.1649169921875 4.535486823442625e-06 H 0.2746478873239437 H 0.2957746478873239 H 0.2253521126760563 H 0.2535211267605634 H 0.2464788732394366 H 0.2535211267605634 H 0.2464788732394366 H 0.2746478873239437 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.274184786106306e-05 1.7429401088561546e-05 1.6060399502748623e-05 9.316220244259818e-06 4 249060 6.976029908400959e-06 1.4730650449535282e-05 1.0 143348.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A91V H 0.0660377358490566 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0479612052440643 5.28532481789589 H 0.999112904071808 1.8186893839811091e-06 0.0008852623868733 H 0.0004081553197465 0.9933969974517822 0.0052545433863997 1.7942570593731946e-06 4.502327044519915e-07 8.117261313600466e-05 0.0007102338131517 0.0001466615794925 -63.32688522338867 -41.21318054199219 1.2170487025287002e-05 H 0.0754716981132075 H 0.1132075471698113 H 0.1132075471698113 H 0.0566037735849056 H 0.0660377358490566 H 0.0471698113207547 H 0.0660377358490566 H 0.0660377358490566 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.027740033052396e-06 9.50121029515061e-06 4.027740033052396e-06 9.50121029515061e-06 1 248278 NA NA NA NA gCc/gTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V97L H 0.2676056338028169 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.3557476103305817 54.6784077078104 H 0.999352753162384 6.938635124242865e-06 0.0006402878207154 H 0.0003463790053501 0.9924384951591492 0.0065485415980219 1.3024844065512298e-06 1.9194496871932643e-06 4.981573147233576e-05 0.0005156763945706 9.797739039640874e-05 -64.57452392578125 -44.732181549072266 2.9486176572390832e-05 H 0.3591549295774648 H 0.2887323943661972 H 0.3098591549295774 H 0.2887323943661972 H 0.2676056338028169 H 0.2605633802816901 H 0.2676056338028169 H 0.3380281690140845 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.819920767166625e-05 1.7674867486265117e-05 2.4318900614161976e-05 9.17060157913038e-06 6 246722 3.4877200960181653e-05 1.5109632931804902e-05 5.0 143360.0 Gtg/Ttg Gtg/Ttg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V97M H 0.2676056338028169 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.3557476103305817 54.6784077078104 H 0.999352753162384 6.938635124242865e-06 0.0006402878207154 H 0.0003463790053501 0.9924384951591492 0.0065485415980219 1.3024844065512298e-06 1.9194496871932643e-06 4.981573147233576e-05 0.0005156763945706 9.797739039640874e-05 -64.57452392578125 -44.732181549072266 2.9486176572390832e-05 H 0.3591549295774648 H 0.2887323943661972 H 0.3098591549295774 H 0.2887323943661972 H 0.2676056338028169 H 0.2605633802816901 H 0.2676056338028169 H 0.3380281690140845 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.7944931863712577e-05 1.808528988286522e-05 2.0265699276933447e-05 8.553010676909175e-06 5 246722 1.395090021105716e-05 1.5934984107552312e-05 2.0 143360.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G99R H 0.0 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0056621134281158 0.445608326792717 H 0.9994677901268004 3.2196787742577726e-06 0.0005290133995003 H 0.0007633424829691 0.99375182390213 0.0049317306838929 2.2609756342717446e-06 9.723241873871302e-07 7.328772335313259e-05 0.0003240876831114 0.0001524122344562 -64.22560882568361 -45.10423278808594 1.434783098375192e-05 H 0.0 H 0.0238095238095238 H 0.0119047619047619 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.064880158693995e-06 8.473587104964935e-06 4.064880158693995e-06 8.473587104964935e-06 1 246010 NA NA NA NA Gga/Aga NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G99V H 0.0 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0056621134281158 0.445608326792717 H 0.9994677901268004 3.2196787742577726e-06 0.0005290133995003 H 0.0007633424829691 0.99375182390213 0.0049317306838929 2.2609756342717446e-06 9.723241873871302e-07 7.328772335313259e-05 0.0003240876831114 0.0001524122344562 -64.22560882568361 -45.10423278808594 1.434783098375192e-05 H 0.0 H 0.0238095238095238 H 0.0119047619047619 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.1340500853497295e-06 1.7154673960534054e-05 4.061670097144088e-06 9.33353112612828e-06 1 246204 6.97583982400829e-06 1.4393333019485785e-05 1.0 143352.0 gGa/gTa gGa/gTa 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A100T H 0.0 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA b 0.0362265110015869 3.992161512374878 H 0.9989157915115356 1.0959088285744656e-05 0.0010732157388702 H 0.0010091647272929 0.9963653087615968 0.001556706498377 2.6424461339047407e-06 3.332839241920737e-06 0.0001078774148481 0.0007658538524992 0.0001891014107968 -63.97304916381836 -41.54487228393555 9.586517080606429e-06 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.5783762626051964e-05 NA NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.5783762626051964e-05 1.0 143342.0 NA Gcc/Acc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA A101S H 0.4245283018867924 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.366277813911438 40.36381509304047 H 0.9970589876174928 4.675425225286745e-05 0.0028943438082933 H 0.0021296206396073 0.9884200096130372 0.0063661481253802 1.1098311915702652e-05 1.7637830751482394e-05 0.0003293071058578 0.0022656735964119 0.0004605089488904 -64.80665588378906 -43.24689102172852 9.368735481984912e-05 H 0.4245283018867925 H 0.5 H 0.3867924528301887 H 0.4339622641509434 H 0.4056603773584906 H 0.4245283018867925 H 0.4245283018867925 H 0.330188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.715412502149702e-06 1.7079348211084828e-05 8.147099833877292e-06 7.508234746826863e-06 2 245486 6.976129952818155e-06 1.534048715986648e-05 1.0 143346.0 Gct/Tct Gct/Tct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A101T H 0.4245283018867924 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.366277813911438 40.36381509304047 H 0.9970589876174928 4.675425225286745e-05 0.0028943438082933 H 0.0021296206396073 0.9884200096130372 0.0063661481253802 1.1098311915702652e-05 1.7637830751482394e-05 0.0003293071058578 0.0022656735964119 0.0004605089488904 -64.80665588378906 -43.24689102172852 9.368735481984912e-05 H 0.4245283018867925 H 0.5 H 0.3867924528301887 H 0.4339622641509434 H 0.4056603773584906 H 0.4245283018867925 H 0.4245283018867925 H 0.330188679245283 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.0367799152154475e-05 8.980753317328065e-06 2.0367799152154475e-05 8.980753317328065e-06 5 245486 NA NA NA NA Gct/Act NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I106L H 0.0 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.4338504374027252 80.26233091950418 H 0.8256223797798157 0.0006217522895894 0.1737559139728546 H 0.023691875860095 0.7962691783905029 0.0200478211045265 0.0001878808106994 0.0001703122688923 0.0244435872882604 0.1234886422753334 0.0117008099332451 -84.61035919189453 -28.457500457763672 0.0044052232988178 H 0.0414201183431952 S 0.0177514792899408 H 0.0236686390532544 H 0.0 T 0.0177514792899408 H 0.0 H 0.0 H 0.0236686390532544 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.633159990888089e-05 9.672993240973683e-06 1.633159990888089e-05 9.672993240973683e-06 4 244924 NA NA NA NA Atc/Ctc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I106T H 0.0 MIP TRANSMEM|3 NA NA NA NA NA HELIX|4 NA NA NA e 0.4338504374027252 80.26233091950418 H 0.8256223797798157 0.0006217522895894 0.1737559139728546 H 0.023691875860095 0.7962691783905029 0.0200478211045265 0.0001878808106994 0.0001703122688923 0.0244435872882604 0.1234886422753334 0.0117008099332451 -84.61035919189453 -28.457500457763672 0.0044052232988178 H 0.0414201183431952 S 0.0177514792899408 H 0.0236686390532544 H 0.0 T 0.0177514792899408 H 0.0 H 0.0 H 0.0236686390532544 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0859399632608975e-06 9.844675302469173e-06 4.0859399632608975e-06 9.844675302469173e-06 1 244742 NA NA NA NA aTc/aCc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T107M S 0.0 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1954040229320526 27.10253798067569 C 0.0245000906288623 0.0050889919511973 0.9704110026359558 S 0.0021674449089914 0.0130481012165546 0.0008116451208479 0.0038990501780062 0.0012670343276113 0.6350706815719604 0.01712048612535 0.3266154825687408 -117.8056411743164 112.75415802001952 0.0064087659120559 S 0.1408450704225352 - 0.2887323943661972 S 0.028169014084507 S 0.0 S 0.0 S 0.0 S 0.0 S 0.056338028169014 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.201969649235252e-06 9.513325411076398e-06 8.201969649235252e-06 9.513325411076398e-06 2 243844 NA NA NA NA aCg/aTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P108T - 0.1029411764705882 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.437157928943634 62.03271011710167 C 0.3075904250144958 0.0040631191805005 0.6883464455604553 C 0.1817836165428161 0.1189181134104728 0.0013620000099763 0.0021788186859339 0.0024425475858151 0.0748656168580055 0.1785285472869873 0.4399207234382629 -63.55710220336914 -23.92159080505371 0.0106055000796914 - 0.1397058823529411 - 0.4558823529411765 - 0.1323529411764706 - 0.0955882352941176 - 0.0808823529411764 - 0.0808823529411764 - 0.1029411764705882 - 0.0808823529411764 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.3868085738242584e-05 NA NA NA NA 6.9769098445249256e-06 1.3868085738242584e-05 1.0 143330.0 NA Cca/Aca NA 0.0 NA NA NA NA NA NA D110G H 0.9263803680981596 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5999798178672789 86.4570917546749 C 0.4754892289638519 0.0084450813010334 0.5160657167434692 G 0.3286459743976593 0.1701331734657287 0.0013143857941031 0.002554174279794 0.0048105176538228 0.0696803778409957 0.2626611590385437 0.1602002084255218 -85.3284683227539 -2.5049304962158203 0.0098908608779311 S 0.6441717791411042 NA NA T 0.7423312883435583 H 0.8527607361963192 H 0.7484662576687117 H 1.0 H 0.9263803680981596 S 0.7914110429447853 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4197110007772238e-05 NA NA NA NA 6.976710210437886e-06 1.4197110007772238e-05 1.0 143334.0 NA gAc/gGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I111N H 0.0532544378698224 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA b 0.1493519246578216 27.63010606169701 C 0.2217831462621688 0.081450805068016 0.6967660784721375 C 0.1162615790963172 0.1011082679033279 0.0024839078541845 0.0318718366324901 0.0493971481919288 0.1204897239804268 0.0828612893819809 0.4955262839794159 -88.54808807373047 92.92927551269533 0.0254292283207178 S 0.2071005917159763 NA NA T 0.0236686390532544 H 0.0473372781065088 H 0.0650887573964497 H 0.1538461538461538 H 0.0532544378698224 S 0.1183431952662721 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.618368969561673e-05 NA NA NA NA 6.978949841141002e-06 1.618368969561673e-05 1.0 143288.0 NA aTc/aAc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R112C H 0.2258064516129032 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5485734939575195 125.62333011627196 C 0.1185976341366768 0.1098562553524971 0.7715461850166321 C 0.0467327274382114 0.0749792233109474 0.0026867832057178 0.0285661406815052 0.0817222818732261 0.0757369175553321 0.1361318677663803 0.5534440279006958 -95.2447509765625 116.56314849853516 0.0151455020532012 - 0.4112903225806452 NA NA - 0.2379032258064516 H 0.2661290322580645 H 0.1935483870967742 H 0.2338709677419355 H 0.2258064516129032 - 0.0806451612903225 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 1.0400050805869472e-05 1.7149791388429894e-05 1.2433500160113908e-05 8.981752441090908e-06 3 241284 6.9769098445249256e-06 1.460970457448137e-05 1.0 143330.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R112H H 0.2258064516129032 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA HELIX|5 NA NA NA e 0.5485734939575195 125.62333011627196 C 0.1185976341366768 0.1098562553524971 0.7715461850166321 C 0.0467327274382114 0.0749792233109474 0.0026867832057178 0.0285661406815052 0.0817222818732261 0.0757369175553321 0.1361318677663803 0.5534440279006958 -95.2447509765625 116.56314849853516 0.0151455020532012 - 0.4112903225806452 NA NA - 0.2379032258064516 H 0.2661290322580645 H 0.1935483870967742 H 0.2338709677419355 H 0.2258064516129032 - 0.0806451612903225 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 2.864836014863529e-05 1.7188812563954814e-05 2.493429929018021e-05 9.045478264584615e-06 6 240632 3.4883600164903335e-05 1.4616244398739994e-05 5.0 143334.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G113R T 0.5952380952380952 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4451961517333984 35.036937141418456 C 0.3631132841110229 0.025142777711153 0.6117439270019531 T 0.1404945403337478 0.1568419635295868 0.0101039269939064 0.0056693381629884 0.0152133665978908 0.2331550270318985 0.3213012516498565 0.1172205135226249 -23.916337966918945 -75.75531005859375 0.0095214918255805 T 0.4880952380952381 NA NA S 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6428571428571429 T 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6666666666666666 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 9.37403515258576e-05 1.7261368915799652e-05 8.308480028063059e-05 8.202910401343551e-06 20 240718 0.0001116369967348 1.5187729184932955e-05 16.0 143322.0 Ggg/Agg Ggg/Agg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G113V T 0.5952380952380952 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4451961517333984 35.036937141418456 C 0.3631132841110229 0.025142777711153 0.6117439270019531 T 0.1404945403337478 0.1568419635295868 0.0101039269939064 0.0056693381629884 0.0152133665978908 0.2331550270318985 0.3213012516498565 0.1172205135226249 -23.916337966918945 -75.75531005859375 0.0095214918255805 T 0.4880952380952381 NA NA S 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6428571428571429 T 0.6547619047619048 T 0.5952380952380952 T 0.6666666666666666 4nef-A|4nef-D|nan|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|4nef-B NA NA NA 4.153199824941112e-06 9.773588943208015e-06 4.153199824941112e-06 9.773588943208015e-06 1 240778 NA NA NA NA gGg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A119G - 0.4339622641509434 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.2122125923633575 23.385827678442 C 0.1192973479628562 0.1938553601503372 0.6868473291397095 C 0.0446139797568321 0.0473437570035457 0.0021501693408936 0.0308300964534282 0.1508782356977462 0.1698434203863144 0.0737724378705024 0.4805678725242615 -91.33057403564452 118.29200744628906 0.0073816985823214 - 0.2924528301886792 - 0.3962264150943397 - 0.2075471698113208 - 0.2735849056603773 - 0.2735849056603773 - 0.4245283018867925 - 0.4339622641509434 - 0.3584905660377358 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.75 0.0 0.0 0.75 0.0 359C>G L120H - 0.2804878048780488 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.2270387113094329 41.57078804075718 C 0.0634271204471588 0.1755904108285904 0.7609824538230896 C 0.0242852605879306 0.0286291390657424 0.0010676769306883 0.0601355768740177 0.1081530749797821 0.1464193761348724 0.0684344097971916 0.562875509262085 -86.9638442993164 126.4272232055664 0.0110178878530859 - 0.2682926829268293 - 0.2378048780487805 - 0.25 - 0.2621951219512195 - 0.2865853658536585 - 0.298780487804878 - 0.2804878048780488 - 0.4329268292682927 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 362T>A L120R - 0.2804878048780488 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.2270387113094329 41.57078804075718 C 0.0634271204471588 0.1755904108285904 0.7609824538230896 C 0.0242852605879306 0.0286291390657424 0.0010676769306883 0.0601355768740177 0.1081530749797821 0.1464193761348724 0.0684344097971916 0.562875509262085 -86.9638442993164 126.4272232055664 0.0110178878530859 - 0.2682926829268293 - 0.2378048780487805 - 0.25 - 0.2621951219512195 - 0.2865853658536585 - 0.298780487804878 - 0.2804878048780488 - 0.4329268292682927 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.5 0.5 0.0 0.0 0.0 362T>G S121C - 0.3384615384615385 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3109332621097565 36.44137831926346 C 0.0288793351501226 0.102452702820301 0.8686679005622864 C 0.0145554961636662 0.0106931440532207 0.000516987289302 0.0234202798455953 0.0696517303586006 0.1146149188280105 0.04789699614048 0.7186504602432251 -101.20709991455078 154.5799560546875 0.0153011586517095 - 0.3769230769230769 S 0.8307692307692308 - 0.4538461538461538 - 0.3384615384615385 - 0.2692307692307692 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.143089881836204e-06 9.497522564229572e-06 4.143089881836204e-06 9.497522564229572e-06 1 241366 NA NA NA NA Agc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA S121R - 0.3384615384615385 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3109332621097565 36.44137831926346 C 0.0288793351501226 0.102452702820301 0.8686679005622864 C 0.0145554961636662 0.0106931440532207 0.000516987289302 0.0234202798455953 0.0696517303586006 0.1146149188280105 0.04789699614048 0.7186504602432251 -101.20709991455078 154.5799560546875 0.0153011586517095 - 0.3769230769230769 S 0.8307692307692308 - 0.4538461538461538 - 0.3384615384615385 - 0.2692307692307692 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 - 0.3384615384615385 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.27 0.0 0.0 0.0 366C>G N122S T 0.2547770700636942 MIP NA NA Extracellular|2 NA N-linked_(GlcNAc...)_asparagine|1 NA NA NA NA NA e 0.7294129133224487 106.7860505104065 C 0.0186454951763153 0.0037941434420645 0.9775604009628296 T 0.0097773075103759 0.0047694616951048 7.500276115024462e-05 0.0003183116496074 0.0015819929540157 0.1625989824533462 0.7754347324371338 0.0454442128539085 -68.07376861572266 -17.200599670410153 0.0119252223521471 S 0.2292993630573248 S 0.4012738853503185 S 0.4777070063694268 T 0.2547770700636943 T 0.1592356687898089 T 0.2802547770700637 T 0.2547770700636943 S 0.4203821656050956 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.01 0.0 0.0 368A>G T124A - 0.0492957746478873 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1461055278778076 20.264836716651917 C 0.0210425369441509 0.0916371718049049 0.8873202800750732 C 0.0048778788186609 0.0127155715599656 0.0001520716032246 0.0227700863033533 0.0579951666295528 0.2847553193569183 0.0135681685060262 0.6031657457351685 -90.85462188720705 141.9168243408203 0.0028833476826548 - 0.0352112676056338 S 0.3591549295774648 - 0.2746478873239437 - 0.0492957746478873 - 0.0422535211267605 - 0.0492957746478873 - 0.0492957746478873 - 0.1338028169014084 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.136709776503267e-06 9.868448293422669e-06 4.136709776503267e-06 9.868448293422669e-06 1 241738 NA NA NA NA Acg/Gcg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T124M - 0.0492957746478873 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA b 0.1461055278778076 20.264836716651917 C 0.0210425369441509 0.0916371718049049 0.8873202800750732 C 0.0048778788186609 0.0127155715599656 0.0001520716032246 0.0227700863033533 0.0579951666295528 0.2847553193569183 0.0135681685060262 0.6031657457351685 -90.85462188720705 141.9168243408203 0.0028833476826548 - 0.0352112676056338 S 0.3591549295774648 - 0.2746478873239437 - 0.0492957746478873 - 0.0422535211267605 - 0.0492957746478873 - 0.0492957746478873 - 0.1338028169014084 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17837.0 pathogenic 1.0 1.2986288952432393e-05 1.803484692118753e-05 8.274450010503642e-06 9.96455098305338e-06 2 241708 2.093309922202025e-05 1.5032079935151932e-05 3.0 143314.0 aCg/aTg aCg/aTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T125K - 0.5633802816901409 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4404597282409668 61.0917643070221 C 0.0129158813506364 0.0766767412424087 0.9104073643684388 C 0.0007650679908692 0.0070719206705689 2.844490700226743e-05 0.0250451806932687 0.0312408246099948 0.0206127949059009 0.0028720109257847 0.9123637676239014 -89.06804656982422 160.7197265625 0.0037813959643244 - 0.5070422535211268 - 0.3732394366197183 - 0.6830985915492958 - 0.5774647887323944 - 0.5704225352112676 - 0.5774647887323944 - 0.5633802816901409 - 0.6408450704225352 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.134929895371897e-06 9.439136639639826e-06 4.134929895371897e-06 9.439136639639826e-06 1 241842 NA NA NA NA aCg/aAg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA T125M - 0.5633802816901409 MIP NA NA Extracellular|2 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4404597282409668 61.0917643070221 C 0.0129158813506364 0.0766767412424087 0.9104073643684388 C 0.0007650679908692 0.0070719206705689 2.844490700226743e-05 0.0250451806932687 0.0312408246099948 0.0206127949059009 0.0028720109257847 0.9123637676239014 -89.06804656982422 160.7197265625 0.0037813959643244 - 0.5070422535211268 - 0.3732394366197183 - 0.6830985915492958 - 0.5774647887323944 - 0.5704225352112676 - 0.5774647887323944 - 0.5633802816901409 - 0.6408450704225352 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.8174178388717185e-05 1.7015896681608768e-05 2.4809600290609524e-05 8.413887968117012e-06 6 241842 6.977390057727463e-06 1.479010578525928e-05 1.0 143320.0 aCg/aTg aCg/aTg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A129V H 0.0 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.0084969997406005 0.9363693714141846 H 0.9989332556724548 1.45137737490586e-05 0.0010522445663809 H 0.0006765220314264 0.997730314731598 0.0008198335999622 3.6295004974817857e-06 4.017322680738289e-06 9.579908510204405e-05 0.0004043920489493 0.000265521230176 -61.34875869750977 -41.73571395874024 5.061227057012729e-05 H 0.0 H 0.0188679245283018 H 0.0377358490566037 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0283018867924528 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2381799933791625e-05 9.58888479729056e-06 1.2381799933791625e-05 9.58888479729056e-06 3 242292 NA NA NA NA gCg/gTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V130M H 0.176056338028169 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.1951727271080017 29.99804815649986 H 0.9985767602920532 1.5371157132904042e-05 0.0014078897656872 H 0.0003345340082887 0.9968457818031312 0.0015274583129212 2.3439849883288844e-06 4.766813617607113e-06 0.0001079839057638 0.0007878902833908 0.0003891554661095 -62.32516860961914 -42.42886734008789 0.0001097898420994 H 0.1830985915492957 H 0.1197183098591549 H 0.2112676056338028 H 0.1760563380281689 H 0.1690140845070422 H 0.1760563380281689 H 0.1760563380281689 H 0.1549295774647887 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 882578.0 VUS 1.0 7.256742307479237e-05 1.8580387549281348e-05 9.48289016378112e-05 8.687575437682144e-06 23 242542 3.489039954729378e-05 1.6424275767779567e-05 5.0 143306.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T131S H 0.3591549295774648 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.5091004967689514 70.61223890185356 H 0.9991793036460876 3.563088966984651e-06 0.0008171244408003 H 0.0002038290404016 0.9963703155517578 0.0026329597458243 1.1311465186736316e-06 1.0709755997595494e-06 5.470034739119001e-05 0.0005650089005939 0.0001709735661279 -64.57180786132811 -44.5981330871582 8.823936514090747e-05 H 0.3169014084507042 H 0.323943661971831 H 0.2605633802816901 H 0.2394366197183098 H 0.2605633802816901 H 0.2464788732394366 H 0.3591549295774648 H 0.3098591549295774 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.04 0.0 0.28 0.0 395C>G E133D H 0.0 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.009554386138916 1.6691512584686283 H 0.9997521042823792 6.123037110228324e-06 0.0002417579089524 H 0.0003440046857576 0.9971755743026732 0.0021929913200438 1.5084177675817043e-06 1.764343323884532e-06 2.650944406923373e-05 0.0001955490442924 6.2097045884002e-05 -62.9585189819336 -41.01195907592773 1.428784707968589e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.29 0.29 0.01 0.0 0.0 402G>T L134F H 0.2073170731707317 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.2517992556095123 46.104443702101705 H 0.999589502811432 1.920524937304436e-06 0.0004086135886609 H 0.000166595345945 0.9964147806167604 0.0030039099510759 3.393128338302631e-07 5.128691782374517e-07 2.542591573728714e-05 0.0003103835624642 7.805658242432399e-05 -61.64667892456055 -42.439056396484375 1.891295141831506e-05 H 0.1829268292682926 H 0.274390243902439 H 0.1829268292682926 H 0.2195121951219512 H 0.201219512195122 H 0.2073170731707317 H 0.2073170731707317 H 0.1585365853658536 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.7063142824447726e-05 NA NA NA NA 6.977979865041562e-06 1.7063142824447726e-05 1.0 143308.0 NA Ctc/Ttc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L140Q H 0.0304878048780487 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.0988037288188934 18.090962746739383 H 0.999022364616394 7.062727036100115e-06 0.0009706515120342 H 0.0005386878619901 0.9885741472244264 0.0096977325156331 2.6441812224220484e-06 2.621428393467795e-06 0.0001244547311216 0.0008305576629936 0.0002291820856044 -67.18727111816406 -41.324684143066406 6.273400504142046e-05 H 0.0426829268292682 H 0.0304878048780487 H 0.0182926829268292 H 0.0365853658536585 H 0.0365853658536585 H 0.0304878048780487 H 0.0304878048780487 H 0.0548780487804878 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.0 0.0 0.28 0.0 422T>A L140V H 0.0304878048780487 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.0988037288188934 18.090962746739383 H 0.999022364616394 7.062727036100115e-06 0.0009706515120342 H 0.0005386878619901 0.9885741472244264 0.0096977325156331 2.6441812224220484e-06 2.621428393467795e-06 0.0001244547311216 0.0008305576629936 0.0002291820856044 -67.18727111816406 -41.324684143066406 6.273400504142046e-05 H 0.0426829268292682 H 0.0304878048780487 H 0.0182926829268292 H 0.0365853658536585 H 0.0365853658536585 H 0.0304878048780487 H 0.0304878048780487 H 0.0548780487804878 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.159855076674027e-06 1.8456073049649067e-05 4.093430106877349e-06 1.0186786584455096e-05 1 244294 6.977690190979048e-06 1.5390127078641955e-05 1.0 143314.0 Ctg/Gtg Ctg/Gtg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA L142F H 0.0060975609756097 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.4086138606071472 74.81719787716865 H 0.998313307762146 3.384231604286469e-05 0.0016528471605852 H 0.001607067300938 0.983363389968872 0.0126774571835994 1.4164259482640771e-05 1.5606234228471294e-05 0.0001880971831269 0.0018207696266472 0.0003133113496005 -63.54004669189453 -42.205039978027344 0.0001771858660504 H 0.0426829268292682 H 0.0548780487804878 H 0.024390243902439 H 0.0060975609756097 H 0.0 H 0.0121951219512195 H 0.0060975609756097 H 0.024390243902439 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.088779860467184e-06 9.518867464136744e-06 4.088779860467184e-06 9.518867464136744e-06 1 244572 NA NA NA NA Ctc/Ttc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA I144V H 0.1301775147928994 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.0610085427761077 11.28658041357994 H 0.9977784752845764 2.279288491990883e-05 0.0021986688952893 H 0.0039326348342001 0.9756362438201904 0.0172149501740932 9.60507895797491e-06 1.187719408335397e-05 0.0003236372140236 0.0023669961374253 0.0005040490650571 -65.06680297851561 -40.20113754272461 7.646467565791681e-05 H 0.1242603550295858 H 0.2071005917159763 H 0.1242603550295858 H 0.1597633136094674 H 0.165680473372781 H 0.136094674556213 H 0.1301775147928994 H 0.1775147928994082 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 9.272966188259815e-05 1.7616004759644947e-05 0.0001061470029526 8.861728053292853e-06 26 244944 6.979239697102457e-05 1.5224762710837755e-05 10.0 143282.0 Atc/Gtc Atc/Gtc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F145L H 0.0456852791878172 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA b 0.2245982587337494 45.07687052786351 H 0.985207200050354 0.0002165060141123 0.0145763251930475 H 0.0095445960760116 0.9575257301330566 0.0158433821052312 8.075455843936652e-05 0.0001018927869154 0.0013928201515227 0.0126675460487604 0.0028433711268007 -66.65296173095703 -37.862789154052734 0.0002628691436257 H 0.065989847715736 H 0.1015228426395939 H 0.0964467005076142 H 0.0964467005076142 H 0.0710659898477157 H 0.0406091370558375 H 0.0456852791878172 H 0.065989847715736 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.856927085304051e-05 1.2261716680597069e-05 2.856927085304051e-05 1.2261716680597069e-05 6,1 245024,244986 NA NA NA NA Ttc/Ctc,ttC/ttA NA 1,0 NA NA NA NA NA NA NA A146T H 0.0 MIP TRANSMEM|4 NA NA NA NA NA HELIX|6 NA NA NA e 0.3284964859485626 36.20031275153161 H 0.9162353873252868 0.0008726664236746 0.082891896367073 H 0.034130897372961 0.8316150903701782 0.0277874581515789 0.0004461488570086 0.000451440224424 0.0081644915044307 0.0839098840951919 0.0134946284815669 -67.675048828125 -32.863189697265625 0.0014541196869686 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0283018867924528 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17832.0 pathogenic 1.0 6.180596803302586e-05 1.7835964396836604e-05 5.304910155246034e-05 9.178792990806255e-06 13 245056 7.678560359636322e-05 1.529285405662229e-05 11.0 143256.0 Gcc/Acc Gcc/Acc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T148I T 0.5845070422535211 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA b 0.136749118566513 18.96710274517536 H 0.5177072882652283 0.0321265645325183 0.4501661658287048 H 0.0467381179332733 0.4616910517215729 0.0249841902405023 0.0238066278398036 0.0156288295984268 0.0873400494456291 0.2024405300617218 0.1373706012964248 -88.06896209716797 -14.155173301696776 0.0043585146777331 T 0.647887323943662 S 0.5140845070422535 S 0.6197183098591549 H 0.4225352112676056 T 0.5704225352112676 T 0.5211267605633803 T 0.5845070422535211 T 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5024714047431187e-05 NA NA NA NA 6.977779776207171e-06 1.5024714047431187e-05 1.0 143312.0 NA aCc/aTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA T148N T 0.5845070422535211 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA b 0.136749118566513 18.96710274517536 H 0.5177072882652283 0.0321265645325183 0.4501661658287048 H 0.0467381179332733 0.4616910517215729 0.0249841902405023 0.0238066278398036 0.0156288295984268 0.0873400494456291 0.2024405300617218 0.1373706012964248 -88.06896209716797 -14.155173301696776 0.0043585146777331 T 0.647887323943662 S 0.5140845070422535 S 0.6197183098591549 H 0.4225352112676056 T 0.5704225352112676 T 0.5211267605633803 T 0.5845070422535211 T 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.147500011546072e-06 9.329714996056422e-06 8.147500011546072e-06 9.329714996056422e-06 2 245474 NA NA NA NA aCc/aAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA D149E - 0.1165644171779141 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.0629639476537704 0.6846764087677002 C 0.0267418324947357 0.1584502607583999 0.0117263719439506 0.0335559621453285 0.0424798280000686 0.1111244857311248 0.0578702501952648 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.0160140693187713 - 0.1288343558282208 - 0.1533742331288343 - 0.2147239263803681 - 0.1104294478527607 - 0.1042944785276073 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 441134.0 pathogenic 1.0 1.541578187747928e-05 1.805902558490683e-05 2.033350028796121e-05 8.882716366995987e-06 5 245900 6.977779776207171e-06 1.5723414229098625e-05 1.0 143312.0 gaT/gaA gaT/gaA 0 0.0 NA NA NA NA NA NA D149G - 0.1165644171779141 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.0629639476537704 0.6846764087677002 C 0.0267418324947357 0.1584502607583999 0.0117263719439506 0.0335559621453285 0.0424798280000686 0.1111244857311248 0.0578702501952648 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.0160140693187713 - 0.1288343558282208 - 0.1533742331288343 - 0.2147239263803681 - 0.1104294478527607 - 0.1042944785276073 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.98 0.0 0.0 0.98 0.0 449A>G D149N - 0.1165644171779141 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2890127301216125 41.64673441052437 C 0.2523596584796905 0.0629639476537704 0.6846764087677002 C 0.0267418324947357 0.1584502607583999 0.0117263719439506 0.0335559621453285 0.0424798280000686 0.1111244857311248 0.0578702501952648 0.5580510497093201 -85.18436431884766 94.95476531982422 0.0160140693187713 - 0.1288343558282208 - 0.1533742331288343 - 0.2147239263803681 - 0.1104294478527607 - 0.1042944785276073 - 0.147239263803681 - 0.1165644171779141 - 0.1656441717791411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.0285424595819816e-05 1.6858121720659587e-05 1.221309958054917e-05 8.593549029060009e-06 3 245638 6.980219950492027e-06 1.4503350751937162e-05 1.0 143262.0 Gat/Aat Gat/Aat 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R151C T 0.3064516129032258 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.0247627962380647 0.738119900226593 C 0.0721211954951286 0.1493319571018219 0.0031914059072732 0.0080086104571819 0.0183859076350927 0.0994929075241088 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.1124641299247741 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.6266400052700192e-05 8.872733928901254e-06 1.6266400052700192e-05 8.872733928901254e-06 4 245906 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R151G T 0.3064516129032258 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.0247627962380647 0.738119900226593 C 0.0721211954951286 0.1493319571018219 0.0031914059072732 0.0080086104571819 0.0183859076350927 0.0994929075241088 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.1124641299247741 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5654919199496974e-05 NA NA NA NA 6.978069905017038e-06 1.5654919199496974e-05 1.0 143306.0 NA Cgc/Ggc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R151H T 0.3064516129032258 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.0247627962380647 0.738119900226593 C 0.0721211954951286 0.1493319571018219 0.0031914059072732 0.0080086104571819 0.0183859076350927 0.0994929075241088 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.1124641299247741 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.8260040336936828e-05 1.9624288915184413e-05 2.845940070983488e-05 9.855856837822553e-06 7 245964 2.791780025290791e-05 1.696982031192365e-05 4.0 143278.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R151L T 0.3064516129032258 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5595263242721558 128.1315282583237 C 0.2371172755956649 0.0247627962380647 0.738119900226593 C 0.0721211954951286 0.1493319571018219 0.0031914059072732 0.0080086104571819 0.0183859076350927 0.0994929075241088 0.27202507853508 0.3774428963661194 -83.15351104736328 -12.886919975280762 0.1124641299247741 G 0.4112903225806452 G 0.3387096774193548 T 0.4879032258064516 G 0.4758064516129033 G 0.4314516129032258 G 0.2983870967741936 T 0.3064516129032258 T 0.4798387096774194 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.131270078592934e-06 9.053790645690684e-06 8.131270078592934e-06 9.053790645690684e-06 2 245964 NA NA NA NA cGc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R152H S 0.0967741935483871 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4632119238376618 106.07553055882454 C 0.1951184123754501 0.0291271395981311 0.7757545113563538 C 0.0801632553339004 0.1058506369590759 0.0022421488538384 0.012182786129415 0.0168797522783279 0.1519303917884826 0.3053279817104339 0.3254231512546539 -92.05215454101562 14.871673583984377 0.1171711161732673 G 0.2620967741935484 G 0.2137096774193548 T 0.189516129032258 G 0.1330645161290322 G 0.2540322580645161 G 0.2459677419354839 S 0.0967741935483871 S 0.0927419354838709 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 2.8232327722046014e-05 1.8227130372412207e-05 1.6238500393228605e-05 9.22148050388945e-06 4 246328 4.8849899030756205e-05 1.5722359203672282e-05 7.0 143296.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G153= - 0.5833333333333334 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5256166458129883 41.366030025482175 C 0.0336900614202022 0.0150810712948441 0.95122891664505 C 0.0234015975147485 0.0118456250056624 0.0006933188415132 0.0072114970535039 0.0102831264957785 0.2217858880758284 0.2639767825603485 0.4608021974563599 61.70980453491211 -5.816244602203369 0.1095083206892013 - 0.5952380952380952 - 0.4285714285714285 T 0.5714285714285714 T 0.5238095238095238 - 0.6071428571428571 - 0.6071428571428571 - 0.5833333333333334 - 0.6190476190476191 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 0.0 0.0 0.99 0.0 462A>T G153R - 0.5833333333333334 MIP NA NA Cytoplasmic|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.5256166458129883 41.366030025482175 C 0.0336900614202022 0.0150810712948441 0.95122891664505 C 0.0234015975147485 0.0118456250056624 0.0006933188415132 0.0072114970535039 0.0102831264957785 0.2217858880758284 0.2639767825603485 0.4608021974563599 61.70980453491211 -5.816244602203369 0.1095083206892013 - 0.5952380952380952 - 0.4285714285714285 T 0.5714285714285714 T 0.5238095238095238 - 0.6071428571428571 - 0.6071428571428571 - 0.5833333333333334 - 0.6190476190476191 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 883362.0 VUS 1.0 4.361438019108913e-05 1.757487422651992e-05 4.46226003987249e-05 9.247083484329894e-06 11 246512 4.187960075796582e-05 1.4945489323264975e-05 6.0 143268.0 Gga/Aga Gga/Aga 0 0.0 NA NA NA NA NA NA P156L T 0.1176470588235294 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.51834636926651 73.55334979891778 C 0.0425352938473224 0.0165678169578313 0.9408969283103944 T 0.0282624494284391 0.0157668832689523 0.0001921963412314 0.0074505740776658 0.0101304417476058 0.1334738731384277 0.4463914036750793 0.3583321273326874 -66.24589538574219 40.11314392089844 0.0893610790371894 - 0.3382352941176471 S 0.2426470588235294 - 0.2647058823529412 T 0.0441176470588235 - 0.2279411764705882 S 0.75 T 0.1176470588235294 T 0.0367647058823529 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.100119885057211e-06 8.9464364248837e-06 8.100119885057211e-06 8.9464364248837e-06 2 246910 NA NA NA NA cCg/cTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G157= T 0.0238095238095238 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4579187035560608 36.038201969862 C 0.1449028253555298 0.0185145251452922 0.8365827202796936 T 0.0548818558454513 0.0775396153330802 0.001814933377318 0.0089054424315691 0.0104582943022251 0.1627796739339828 0.3871591985225677 0.2964609563350677 -62.45027160644531 -8.626885414123535 0.0522678345441818 - 0.1666666666666666 - 0.4047619047619048 - 0.1547619047619047 S 0.1071428571428571 - 0.0714285714285714 S 0.2380952380952381 T 0.0238095238095238 T 0.0476190476190476 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.66 0.0 0.0 0.66 0.0 474C>T A160S H 0.0188679245283018 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.057477205991745 6.3339881002902985 H 0.94822359085083 0.0007036720635369 0.0510727725923061 H 0.0135318730026483 0.9434903860092164 0.0018261671066284 0.0005962632712908 0.0003070412785746 0.0044221174903213 0.0135468319058418 0.0222793240100145 -62.2459602355957 -37.87075424194336 0.0011471951147541 H 0.0471698113207547 H 0.0754716981132075 H 0.0754716981132075 H 0.0754716981132075 H 0.0566037735849056 H 0.0188679245283018 H 0.0188679245283018 H 0.0471698113207547 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.979829777264968e-06 1.403788682157255e-05 NA NA NA NA 6.979829777264968e-06 1.403788682157255e-05 1.0 143270.0 NA Gct/Tct NA 0.0 NA NA NA NA NA NA S162P H 0.0307692307692307 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA e 0.3013414144515991 35.317213773727424 H 0.9925259351730348 0.0003310521424282 0.0071429875679314 H 0.0067705190740525 0.9780465960502625 0.0073933037929236 0.000192822277313 0.0001669132325332 0.0009473609388805 0.0043541090562939 0.0021283873356878 -65.05091094970703 -39.235084533691406 0.0003521762846503 H 0.0307692307692307 H 0.0769230769230769 H 0.0307692307692307 H 0.0153846153846153 H 0.023076923076923 H 0.0384615384615384 H 0.0307692307692307 H 0.0153846153846153 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9848001658101575e-06 1.5520753037275078e-05 NA NA NA NA 6.9848001658101575e-06 1.5520753037275078e-05 1.0 143168.0 NA Tcc/Ccc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I163T H 0.0236686390532544 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0548263490200042 10.142874568700789 H 0.9981448650360109 7.103311509126797e-05 0.0017840726068243 H 0.0014194208197295 0.9925205707550048 0.0041753030382096 2.7134670744999312e-05 2.9084363632136963e-05 0.0002356688637519 0.0011088777100667 0.0004839479224756 -64.13788604736328 -41.70495223999024 8.869678276823834e-05 H 0.0414201183431952 H 0.0887573964497041 H 0.0355029585798816 H 0.0473372781065088 H 0.0532544378698224 H 0.0414201183431952 H 0.0236686390532544 H 0.0473372781065088 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.981879778322763e-06 1.643483479124455e-05 NA NA NA NA 6.981879778322763e-06 1.643483479124455e-05 1.0 143228.0 NA aTa/aCa NA 0.0 NA NA NA NA NA NA I163V H 0.0236686390532544 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0548263490200042 10.142874568700789 H 0.9981448650360109 7.103311509126797e-05 0.0017840726068243 H 0.0014194208197295 0.9925205707550048 0.0041753030382096 2.7134670744999312e-05 2.9084363632136963e-05 0.0002356688637519 0.0011088777100667 0.0004839479224756 -64.13788604736328 -41.70495223999024 8.869678276823834e-05 H 0.0414201183431952 H 0.0887573964497041 H 0.0355029585798816 H 0.0473372781065088 H 0.0532544378698224 H 0.0414201183431952 H 0.0236686390532544 H 0.0473372781065088 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.04227012040792e-06 9.78238734174699e-06 4.04227012040792e-06 9.78238734174699e-06 1 247386 NA NA NA NA Ata/Gta NA 0 NA 0.2 0.0 0.0 0.2 0.0 490A>G G164S H 0.0238095238095238 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0300345420837402 2.3637184619903566 H 0.999140739440918 1.2711275303445287e-05 0.000846434617415 H 0.0008059114334173 0.9925968647003174 0.0059195053763687 3.4731601772364237e-06 4.189894298178842e-06 0.0001036204630509 0.0003163298533763 0.0002500907867215 -64.47385406494139 -42.74343872070313 2.694588147278409e-05 H 0.0238095238095238 H 0.0119047619047619 H 0.0357142857142857 H 0.0238095238095238 H 0.0238095238095238 H 0.0238095238095238 H 0.0238095238095238 H 0.0476190476190476 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5868257447525047e-05 NA NA NA NA 6.981099886615994e-06 1.5868257447525047e-05 1.0 143244.0 NA Ggc/Agc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA S166P H 0.0 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.1893441081047058 22.191129469871527 H 0.9990476965904236 2.8094584195059724e-05 0.0009242169326171 H 0.0015195281011983 0.990724503993988 0.0065248934552073 9.065445738087874e-06 1.2213477020850403e-05 9.102954209083693e-05 0.0009533297852613 0.0001653638028074 -64.95059967041016 -41.31997680664063 6.455451512010768e-05 H 0.0076923076923076 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.2812050792863183e-05 1.9274475655961184e-05 8.096510100585874e-06 9.218158353448344e-06 2 247020 2.094420051435009e-05 1.6927225655227467e-05 3.0 143238.0 Tct/Cct Tct/Cct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V167M H 0.0422535211267605 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0364410281181335 5.600986021757126 H 0.9990179538726808 4.684517625719309e-05 0.0009352458291687 H 0.0013160950038582 0.988856852054596 0.0086444206535816 1.0696960089262577e-05 2.0147248505963944e-05 0.0001347169745713 0.0008045680588111 0.0002124363236362 -65.74604034423828 -41.6869010925293 3.527710578055121e-05 H 0.0140845070422535 H 0.0845070422535211 H 0.0140845070422535 H 0.0492957746478873 H 0.0492957746478873 H 0.0422535211267605 H 0.0422535211267605 H 0.0633802816901408 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.621829039283711e-05 1.765593095525051e-05 6.904110341565683e-05 8.798314313046616e-06 17 246230 6.981969818298239e-06 1.5307565552543362e-05 1.0 143226.0 Gtg/Atg Gtg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA H171Q H 0.0108695652173913 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0408369302749633 7.428237617015839 H 0.9908577799797058 0.000234122009715 0.0089081060141325 H 0.0099982442334294 0.947285294532776 0.0333410315215587 7.547793211415409e-05 0.0001124834598158 0.0011887630680575 0.005943622905761 0.0020551104098558 -69.79582214355469 -38.32950210571289 8.168429485522209e-05 H 0.0163043478260869 H 0.0380434782608695 H 0.0054347826086956 H 0.0108695652173913 H 0.0163043478260869 H 0.0108695652173913 H 0.0108695652173913 H 0.0271739130434782 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.091350092494395e-06 8.51472873064531e-06 4.091350092494395e-06 8.51472873064531e-06 1 244418 NA NA NA NA caC/caA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G174= H 0.0 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.0351671576499938 2.7676553070545205 H 0.8728574514389038 0.0001650779740884 0.1269775480031967 H 0.0350323282182216 0.7923447489738464 0.0578307770192623 0.0002122273290297 4.739954601973295e-05 0.0139231607317924 0.0773915126919746 0.0232178308069706 -72.28236389160156 -30.262041091918945 0.000382382859243 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.63 0.0 0.0 0.04 0.63 525G>C I175F H 0.1597633136094674 MIP TRANSMEM|5 NA NA NA NA NA HELIX|7 NA NA NA b 0.1052128076553344 19.46436941623688 H 0.9461491703987122 0.0005930586485192 0.0532577782869339 H 0.0708016380667686 0.8417295217514038 0.0299867615103721 0.0004131225869059 0.0002327733964193 0.0055769183672964 0.0393043868243694 0.01195496506989 -61.81291198730469 -39.93989181518555 0.000491498329211 H 0.2130177514792899 H 0.2781065088757396 H 0.1775147928994082 H 0.1597633136094674 H 0.1538461538461538 H 0.1538461538461538 H 0.1597633136094674 H 0.1775147928994082 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.396550032950472e-05 1.7115566245018025e-05 NA NA NA NA 1.396550032950472e-05 1.7115566245018025e-05 2.0 143210.0 NA Atc/Ttc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA H176Y H 0.0326086956521739 MIP NA NA Extracellular|3 NA NA NA HELIX|7 NA NA NA e 0.4665572345256805 84.8667609602213 H 0.8904944062232971 0.0007076119654811 0.1087979152798652 H 0.1210647001862526 0.7230765223503113 0.0149820856750011 0.0002904175489675 0.0002678611199371 0.0112694194540381 0.1204463317990303 0.0086026834324002 -66.20994567871094 -33.394962310791016 0.0003622260701376 H 0.0380434782608695 H 0.1630434782608695 H 0.092391304347826 H 0.0271739130434782 H 0.0380434782608695 H 0.0271739130434782 H 0.0326086956521739 H 0.1467391304347826 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.0131346004993103e-05 1.8257835856379464e-05 3.976359948865138e-06 8.669152760166078e-06 1 251486 2.093100010824856e-05 1.6068427445752136e-05 3.0 143328.0 Cat/Tat Cat/Tat 0 0.0 NA NA NA NA NA NA G179R S 0.2857142857142857 MIP NA NA Extracellular|3 NA NA NA NA NA NA NA b 0.0947842597961425 7.459521245956421 C 0.0087928194552659 0.004263212904334 0.9869439601898192 C 0.0052716727368533 0.0030718061607331 0.001240769168362 0.0036649990361183 0.0033212213311344 0.2064656466245651 0.1723698824644088 0.6045939922332764 80.07557678222656 17.005790710449222 0.00019556558982 S 0.2738095238095238 S 0.1071428571428571 S 0.2261904761904762 S 0.2976190476190476 S 0.2857142857142857 S 0.2857142857142857 S 0.2857142857142857 S 0.2976190476190476 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.800142009003025e-05 1.875526366967745e-05 2.3857399355620142e-05 9.805710994742484e-06 6 251494 6.283690163400024e-05 1.598774365589808e-05 9.0 143228.0 Ggc/Cgc Ggc/Cgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA C180Y - 0.0 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA NA NA NA NA b 0.0310071110725402 4.353398394584656 C 0.0073245028033852 0.0772881433367729 0.9153873920440674 C 0.0028935223817825 0.0018355890642851 0.0005493166390806 0.0341423936188221 0.0484277345240116 0.1127101704478264 0.0176136326044797 0.7818276286125183 -96.76285552978516 141.07110595703125 0.0002777919871732 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 - 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976239895564503e-06 8.687382600733667e-06 3.976239895564503e-06 8.687382600733667e-06 1 251494 NA NA NA NA tGc/tAc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA N183S - 0.0254777070063694 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA NA NA NPA_2|1 NA b 0.0612181425094604 8.96233606338501 C 0.0133053557947278 0.0870768725872039 0.8996177315711975 C 0.0031664590351283 0.0058309645392 0.0001964276307262 0.0148057080805301 0.052516158670187 0.0484239570796489 0.0144464056938886 0.8606138229370117 -89.04288482666016 119.42829132080078 0.0002000825188588 - 0.0254777070063694 S 0.0509554140127388 - 0.0318471337579617 - 0.0318471337579617 - 0.019108280254777 - 0.019108280254777 - 0.0254777070063694 - 0.0382165605095541 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.983440016483655e-06 1.4775182386008169e-05 NA NA NA NA 6.983440016483655e-06 1.4775182386008169e-05 1.0 143196.0 NA aAt/aGt NA 0.0 NA NA NA NA NA NA P184A H 0.0 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NPA_2|1 NA b 0.0309714972972869 4.394855466485024 H 0.6326968669891357 0.0263081900775432 0.3409949243068695 H 0.1166507229208946 0.4735209941864014 0.0111794900149106 0.0046102260239422 0.0163891706615686 0.0409430563449859 0.2294742614030838 0.1072320938110351 -64.76774597167969 -23.494991302490234 0.0001297114504268 H 0.0 H 0.0 H 0.0147058823529411 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.5196265863568125e-05 1.821188375166818e-05 1.988119947782252e-05 9.581705327621657e-06 5 251494 6.976420081628021e-06 1.5487531526970403e-05 1.0 143340.0 Cct/Gct Cct/Gct 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A185V H 0.0 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NPA_2|1 NA b 0.0346133112907409 3.814386904239655 H 0.8388950228691101 0.0086308699101209 0.1524741500616073 H 0.1845312863588333 0.6096619963645935 0.0366001650691032 0.0045317206531763 0.004236536566168 0.0142128057777881 0.1168338805437088 0.0293916705995798 -66.78546905517578 -33.010753631591804 0.0002011811448028 H 0.0 H 0.0188679245283018 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.97680980010773e-06 1.4762494732194394e-05 NA NA NA NA 6.97680980010773e-06 1.4762494732194394e-05 1.0 143332.0 NA gCc/gTc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA R186C H 0.0282258064516129 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.1448254585266113 33.165030002593994 H 0.9008768200874328 0.0071925017982721 0.0919306650757789 H 0.2081246376037597 0.626937747001648 0.0419007502496242 0.002471970859915 0.0036050996277481 0.0151710724458098 0.0862758979201316 0.0155128063634037 -73.76443481445312 -31.667638778686523 0.0002003010595217 H 0.0282258064516129 H 0.0241935483870967 H 0.0362903225806451 H 0.0241935483870967 H 0.0241935483870967 H 0.0241935483870967 H 0.0282258064516129 H 0.0161290322580645 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 17828.0 pathogenic 2.0 4.812634644878881e-05 1.5183256944698428e-05 4.771519888890907e-05 8.109322005795771e-06 12 251492 4.884790178039111e-05 1.2836284043875372e-05 7.0 143302.0 Cgc/Tgc Cgc/Tgc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R186H H 0.0282258064516129 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.1448254585266113 33.165030002593994 H 0.9008768200874328 0.0071925017982721 0.0919306650757789 H 0.2081246376037597 0.626937747001648 0.0419007502496242 0.002471970859915 0.0036050996277481 0.0151710724458098 0.0862758979201316 0.0155128063634037 -73.76443481445312 -31.667638778686523 0.0002003010595217 H 0.0282258064516129 H 0.0241935483870967 H 0.0362903225806451 H 0.0241935483870967 H 0.0241935483870967 H 0.0241935483870967 H 0.0282258064516129 H 0.0161290322580645 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 35695.0 pathogenic 1.0 5.067345099702957e-06 1.6758170122010095e-05 3.976269908889663e-06 8.528804857466323e-06 1 251492 6.983630100876326e-06 1.44255243766558e-05 1.0 143192.0 cGc/cAc cGc/cAc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA A191V H 0.0094339622641509 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.0285699069499969 3.148403745889664 H 0.9991279244422911 0.0001019715491565 0.0007701824069954 H 0.007578301243484 0.9844054579734802 0.0070817628875374 1.7775055312085893e-05 4.083424937562087e-05 6.0463691625045606e-05 0.0006814326625317 0.0001341028546448 -63.254920959472656 -41.00181579589844 3.073529660468921e-05 H 0.0 H 0.0094339622641509 H 0.0188679245283018 H 0.0094339622641509 H 0.0 H 0.0188679245283018 H 0.0094339622641509 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.598757232839793e-06 1.5677431406371854e-05 3.976299922214822e-06 8.466319785717282e-06 1 251490 1.395559957018122e-05 1.3194820377233884e-05 2.0 143312.0 gCt/gTt gCt/gTt 0 0.0 NA NA NA NA NA NA V192= H 0.5492957746478874 MIP NA INTRAMEM|2 NA NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.09541055560112 14.664602395892146 H 0.996820330619812 0.000141439246363 0.0030383041594177 H 0.0078666796907782 0.9706320762634276 0.0171681996434927 3.144894071738236e-05 3.857388583128341e-05 0.0001937702472787 0.0037983718793839 0.0002708957763388 -63.95095825195313 -41.35733413696289 6.257256609387697e-05 H 0.5422535211267606 H 0.5352112676056338 H 0.6338028169014085 H 0.5422535211267606 H 0.5563380281690141 H 0.5492957746478874 H 0.5492957746478874 H 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.27 0.0 0.0 0.0 0.27 579C>A V193I H 0.3591549295774648 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA HELIX|8 NA NA NA e 0.2729551494121551 41.953206464648254 H 0.954245388507843 0.000744531454984 0.0450101196765899 H 0.0118620293214917 0.9209091067314148 0.0207022242248058 0.0002415874914731 0.0001659018307691 0.0024134053383022 0.0412067770957946 0.0024989359080791 -71.19284057617188 -33.275279998779304 0.0003372549253981 H 0.2535211267605634 T 0.4366197183098591 H 0.3521126760563379 H 0.3309859154929577 H 0.3309859154929577 H 0.3380281690140845 H 0.3591549295774648 H 0.2676056338028169 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.29352269328034e-05 1.85358795898752e-05 3.976299922214821e-05 8.773410899834124e-06 10 251490 2.0946199583704583e-05 1.6328076841839763e-05 3.0 143224.0 Gtc/Atc Gtc/Atc 0 0.0 NA NA NA NA NA NA T194S H 0.4154929577464789 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA HELIX|8 NA NA NA b 0.2347403466701508 32.55848608314991 H 0.6322765946388245 0.0007776874117553 0.366945743560791 H 0.0211737770587205 0.5901495218276978 0.0114634120836853 0.0004273178055882 0.0001188052192446 0.0176777262240648 0.3494464457035065 0.0095429914072155 -97.27127838134766 -10.742962837219238 0.0005125540774315 H 0.2887323943661972 S 0.204225352112676 S 0.3450704225352112 T 0.2464788732394366 T 0.2535211267605634 H 0.3732394366197183 H 0.4154929577464789 H 0.5352112676056338 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976269908889663e-06 8.434916824624279e-06 3.976269908889663e-06 8.434916824624279e-06 1 251492 NA NA NA NA aCt/aGt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA G195= - 0.5595238095238095 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3931715488433838 30.942600893974305 C 0.0115077327936887 0.0009369609178975 0.9875553250312804 T 0.0026489079464226 0.0092839440330863 0.0011628138599917 0.0011725923977792 0.0003863642050419 0.1749909520149231 0.6530105471611023 0.1573438793420791 77.05644989013672 25.20864486694336 0.00077829771908 - 0.6785714285714286 S 0.9166666666666666 - 0.9047619047619048 T 0.7857142857142857 T 0.8333333333333334 - 0.6190476190476191 - 0.5595238095238095 - 0.2738095238095238 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.79 0.0 0.0 0.79 0.64 588C>T F197L - 0.5076142131979695 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3695414066314697 74.16696031093598 C 0.4105471968650818 0.0098244715481996 0.5796284079551697 T 0.2423417717218399 0.1374992728233337 0.0035356213338673 0.0067176194861531 0.0050112716853618 0.1491237133741378 0.2582921087741852 0.1974785774946212 -81.5665512084961 -12.935670852661133 0.0048619699664413 - 0.6091370558375635 - 0.5837563451776651 - 0.5634517766497462 - 0.5583756345177665 - 0.5279187817258884 - 0.4771573604060914 - 0.5076142131979695 - 0.6802030456852792 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.5114661306750549e-05 NA NA NA NA 6.979929821682163e-06 1.5114661306750549e-05 1.0 143268.0 NA Ttt/Ctt NA 0.0 NA NA NA NA NA NA D199N T 0.3742331288343558 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA e 0.3207207024097442 46.21585321724415 C 0.2906010448932648 0.0100769372656941 0.699321985244751 G 0.255443125963211 0.0995087474584579 0.0015381034463644 0.0054642688482999 0.0048415632918477 0.1380564421415329 0.2529365122318268 0.2422113120555877 -96.69001770019533 21.33171844482422 0.0038787499070167 S 0.392638036809816 T 0.3251533742331288 T 0.392638036809816 T 0.3987730061349693 T 0.3742331288343558 T 0.392638036809816 T 0.3742331288343558 T 0.3496932515337423 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.5904999600024897e-05 7.358453404652069e-06 1.5904999600024897e-05 7.358453404652069e-06 4 251494 NA NA NA NA Gac/Aac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H200L T 0.1467391304347826 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA b 0.1686002016067505 30.668376672267915 H 0.5256035923957825 0.0308332610875368 0.4435631334781647 H 0.0998391956090927 0.4195571541786194 0.0138364788144826 0.0168791618198156 0.0176471062004566 0.1190224736928939 0.091438353061676 0.2217800766229628 -79.4293441772461 -13.496238708496096 0.0003610685234889 - 0.1032608695652174 H 0.1576086956521739 - 0.1630434782608695 T 0.1413043478260869 T 0.125 T 0.1630434782608695 T 0.1467391304347826 H 0.1467391304347826 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 3.976239895564503e-06 9.6067879366445e-06 3.976239895564503e-06 9.6067879366445e-06 1 251494 NA NA NA NA cAc/cTc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA H200Q T 0.1467391304347826 MIP NA NA Extracellular|4 NA NA NA NA TURN|1 NA NA b 0.1686002016067505 30.668376672267915 H 0.5256035923957825 0.0308332610875368 0.4435631334781647 H 0.0998391956090927 0.4195571541786194 0.0138364788144826 0.0168791618198156 0.0176471062004566 0.1190224736928939 0.091438353061676 0.2217800766229628 -79.4293441772461 -13.496238708496096 0.0003610685234889 - 0.1032608695652174 H 0.1576086956521739 - 0.1630434782608695 T 0.1413043478260869 T 0.125 T 0.1630434782608695 T 0.1467391304347826 H 0.1467391304347826 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.02 0.0 0.35 0.2 603C>G W201C T 0.5770925110132159 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA TURN|1 NA NA e 0.4709707200527191 113.26845817267896 H 0.8487279415130615 0.0112546533346176 0.1400173753499984 H 0.0838022530078888 0.7190009951591492 0.03181067481637 0.0054510845802724 0.0063075618818402 0.0278546493500471 0.0865996330976486 0.039173237979412 -67.45601654052734 -37.16478729248047 0.0005777219193987 H 0.5903083700440529 H 0.7092511013215859 H 0.6696035242290749 T 0.5638766519823789 T 0.5770925110132159 T 0.5726872246696035 T 0.5770925110132159 H 0.6167400881057269 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.82 0.05 0.0 0.0 0.82 606G>C V202F H 0.0 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.1026209890842437 15.772846022248268 H 0.9815130233764648 0.0015991219552233 0.0168878473341465 H 0.0371031016111373 0.8797202110290527 0.0596903078258037 0.0005944502190686 0.0008753395522944 0.0027736853808164 0.0147340651601552 0.0045088147744536 -67.87215423583984 -40.20306396484375 9.553263953421264e-05 H 0.0 H 0.0492957746478873 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0070422535211267 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.31 0.0 0.31 0.0 0.0 607G>T V202L H 0.0 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.1026209890842437 15.772846022248268 H 0.9815130233764648 0.0015991219552233 0.0168878473341465 H 0.0371031016111373 0.8797202110290527 0.0596903078258037 0.0005944502190686 0.0008753395522944 0.0027736853808164 0.0147340651601552 0.0045088147744536 -67.87215423583984 -40.20306396484375 9.553263953421264e-05 H 0.0 H 0.0492957746478873 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0070422535211267 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.125960003875663e-06 8.665650922295672e-06 4.125960003875663e-06 8.665650922295672e-06 1 242368 NA NA NA NA Gtc/Ctc NA 0 NA 0.23 0.0 0.23 0.0 0.0 607G>C W204L H 0.2951541850220264 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3104329109191894 74.65911507606506 H 0.9701592326164246 0.0004924727836623 0.0293483398854732 H 0.0314274504780769 0.6640890836715698 0.277011513710022 0.0001302705495618 0.0001484466774854 0.0030830716714262 0.0201339311897754 0.0039762421511113 -72.30474853515625 -37.18893814086914 0.0001021064890665 H 0.3171806167400881 H 0.3215859030837004 H 0.3876651982378855 H 0.2907488986784141 H 0.2995594713656388 H 0.2951541850220264 H 0.2951541850220264 T 0.3788546255506608 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.114080184081104e-06 9.174149142333204e-06 4.114080184081104e-06 9.174149142333204e-06 1 243068 NA NA NA NA tGg/tTg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P207T H 0.0 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.0424574017524719 6.024705308675768 H 0.9989890456199646 1.6784850231488235e-05 0.0009941622847691 H 0.0034781070426106 0.9894145727157592 0.0059287697076797 2.4087373731163098e-06 5.235349817667157e-06 0.0001050137070706 0.0008659373270347 0.0001999680680455 -62.02483367919922 -39.39707946777344 1.002471981337294e-05 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.204249752452597e-06 8.338479959874093e-06 8.204249752452597e-06 8.338479959874093e-06 2 243776 NA NA NA NA Ccc/Acc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L208P H 0.2682926829268293 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.31679368019104 58.00492284297943 H 0.9991683959960938 1.4605509022658223e-05 0.000816996267531 H 0.0008450048044323 0.987305223941803 0.0109459906816482 3.476898427834385e-06 4.062247626279714e-06 6.705238047288731e-05 0.0006715428899042 0.0001577015646034 -66.12423706054689 -43.400821685791016 4.387887383927591e-05 H 0.2865853658536585 H 0.2865853658536585 H 0.2682926829268293 H 0.2865853658536585 H 0.2926829268292683 H 0.3048780487804878 H 0.2682926829268293 H 0.3353658536585366 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 881000.0 VUS 1.0 1.3961200238554737e-05 1.5055489293986672e-05 NA NA NA NA 1.3961200238554737e-05 1.5055489293986672e-05 2.0 143254.0 NA cTg/cCg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA L208V H 0.2682926829268293 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.31679368019104 58.00492284297943 H 0.9991683959960938 1.4605509022658223e-05 0.000816996267531 H 0.0008450048044323 0.987305223941803 0.0109459906816482 3.476898427834385e-06 4.062247626279714e-06 6.705238047288731e-05 0.0006715428899042 0.0001577015646034 -66.12423706054689 -43.400821685791016 4.387887383927591e-05 H 0.2865853658536585 H 0.2865853658536585 H 0.2682926829268293 H 0.2865853658536585 H 0.2926829268292683 H 0.3048780487804878 H 0.2682926829268293 H 0.3353658536585366 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.921180152450688e-05 1.00171463159914e-05 4.921180152450688e-05 1.00171463159914e-05 12 243844 NA NA NA NA Ctg/Gtg NA 1 NA NA NA NA NA NA NA V209M H 0.4154929577464789 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3819413781166077 58.7043898165226 H 0.999545395374298 4.7118351176322895e-06 0.0004497634072322 H 0.0002954952360596 0.9903073310852052 0.0088661089539527 1.901606424326019e-06 1.4506211982734385e-06 3.86952051485423e-05 0.0004163222329225 7.267040928127244e-05 -64.86922454833984 -44.52633666992188 3.939124144380912e-05 H 0.4788732394366197 H 0.4014084507042254 H 0.3873239436619718 H 0.3661971830985916 H 0.3732394366197183 H 0.3732394366197183 H 0.4154929577464789 H 0.3943661971830985 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.096209977433318e-06 8.640544028087147e-06 4.096209977433318e-06 8.640544028087147e-06 1 244128 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA A211P H 0.0 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.0272895395755767 3.0073072612285614 H 0.9998088479042052 2.3223290099849687e-06 0.0001888913830043 H 0.0002821881207637 0.997077226638794 0.0024186368100345 5.4763171419836e-07 6.110194021857751e-07 1.6331023289239965e-05 0.0001689024938968 3.558003299986012e-05 -64.21243286132811 -43.157447814941406 4.749831077788258e-06 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 H 0.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.6484000298078175e-05 9.01784765234818e-06 1.6484000298078175e-05 9.01784765234818e-06 4 242660 NA NA NA NA Gcc/Ccc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L213R H 0.4146341463414634 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.4165361225605011 76.26776404082773 H 0.9996337890625 3.255479441577336e-06 0.000362968101399 H 0.0002230875106761 0.9900572896003724 0.0092587824910879 1.1084752031820244e-06 1.0811123729581595e-06 2.9156828531995416e-05 0.0003697926003951 5.964687807136215e-05 -64.4833984375 -44.72064208984375 7.566894055344164e-05 H 0.4024390243902439 H 0.4573170731707317 H 0.4817073170731707 H 0.4329268292682927 H 0.4085365853658536 H 0.4207317073170732 H 0.4146341463414634 H 0.4634146341463415 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.061239906150149e-06 9.338173235059713e-06 4.061239906150149e-06 9.338173235059713e-06 1 246230 NA NA NA NA cTg/cGg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA Y218= I 0.0135135135135135 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.1276939809322357 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.0031274410430341 H 0.0038651549257338 0.8916479349136353 0.1012404114007949 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693 0.0022338270209729 0.000646447064355 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.0003061353636439 I 0.0405405405405405 I 0.0225225225225225 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.0135135135135135 I 0.0225225225225225 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.07 0.0 0.0 657C>T Y218C I 0.0135135135135135 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.1276939809322357 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.0031274410430341 H 0.0038651549257338 0.8916479349136353 0.1012404114007949 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693 0.0022338270209729 0.000646447064355 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.0003061353636439 I 0.0405405405405405 I 0.0225225225225225 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.0135135135135135 I 0.0225225225225225 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3958099771116396e-05 1.3491413129878172e-05 NA NA NA NA 1.3958099771116396e-05 1.3491413129878172e-05 2.0 143286.0 NA tAc/tGc NA 0.0 NA NA NA NA NA NA Y218H I 0.0135135135135135 MIP TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA b 0.1276939809322357 27.288203725218768 H 0.9968438148498536 2.8774578822776672e-05 0.0031274410430341 H 0.0038651549257338 0.8916479349136353 0.1012404114007949 7.597683634230632e-06 1.1264321983617265e-05 0.0003473418182693 0.0022338270209729 0.000646447064355 -65.823486328125 -41.148414611816406 0.0003061353636439 I 0.0405405405405405 I 0.0225225225225225 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.009009009009009 I 0.0135135135135135 I 0.0225225225225225 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.373433995569092e-05 NA NA NA NA 6.976320037210826e-06 1.373433995569092e-05 1.0 143342.0 NA Tac/Cac NA 0.0 NA NA NA NA NA NA N219S I 0.1273885350318471 NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3280002474784851 48.01923623085022 H 0.985782265663147 0.0002713325666263 0.013946414925158 H 0.0145777501165866 0.8367598652839661 0.1350012570619583 6.342451524687931e-05 9.69804241321981e-05 0.0015660298522561 0.0093688294291496 0.0025659080129116 -67.02587890625 -37.11647033691406 0.0005625704652629 I 0.197452229299363 I 0.1019108280254777 I 0.2356687898089172 I 0.1464968152866242 I 0.1719745222929936 I 0.0828025477707006 I 0.1273885350318471 I 0.1656050955414012 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 659A>G N219T I 0.1273885350318471 NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.3280002474784851 48.01923623085022 H 0.985782265663147 0.0002713325666263 0.013946414925158 H 0.0145777501165866 0.8367598652839661 0.1350012570619583 6.342451524687931e-05 9.69804241321981e-05 0.0015660298522561 0.0093688294291496 0.0025659080129116 -67.02587890625 -37.11647033691406 0.0005625704652629 I 0.197452229299363 I 0.1019108280254777 I 0.2356687898089172 I 0.1464968152866242 I 0.1719745222929936 I 0.0828025477707006 I 0.1273885350318471 I 0.1656050955414012 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B 740161.0 benign 1.0 0.0003533932288088 1.827835693600574e-05 0.0005096429958939 8.095092285517672e-06 126 247232 8.375909965252504e-05 1.6388038722464057e-05 12.0 143268.0 aAc/aCc aAc/aCc 1 0.0 NA NA NA NA NA NA Y220H I 0.6351351351351351 NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA HELIX|9 NA NA NA e 0.6190492510795593 132.29082495570182 H 0.96038019657135 0.0011672275140881 0.0384526066482067 H 0.0274802483618259 0.7560042738914491 0.1772428452968597 0.000282387016341 0.0005184128531254 0.0041622170247137 0.0282056182622909 0.0061041135340929 -70.6322021484375 -38.55044937133789 0.0040620504878461 I 0.6846846846846847 I 0.6441441441441441 I 0.7747747747747747 I 0.536036036036036 I 0.6396396396396397 I 0.6531531531531531 I 0.6351351351351351 I 0.6621621621621622 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0432501009490815e-06 9.340784174668036e-06 4.0432501009490815e-06 9.340784174668036e-06 1 247326 NA NA NA NA Tac/Cac NA 0 NA NA NA NA NA NA NA V221= I 0.4436619718309859 NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4832846224308014 74.28084646761417 H 0.9259748458862304 0.0007787408540025 0.0732463374733924 H 0.0195964891463518 0.7742439508438109 0.1376261711120605 0.000238782929955 0.0002964733866974 0.0102767748758196 0.0471519567072391 0.0105693461373448 -77.55719757080078 -34.35962677001953 0.0068981354124844 I 0.4225352112676056 I 0.4366197183098591 I 0.4647887323943662 I 0.4436619718309859 I 0.4436619718309859 I 0.471830985915493 I 0.4436619718309859 I 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.41 0.41 0.0 0.0 0.0 666G>T V221M I 0.4436619718309859 NA TRANSMEM|6 NA NA NA NA NA NA NA NA NA e 0.4832846224308014 74.28084646761417 H 0.9259748458862304 0.0007787408540025 0.0732463374733924 H 0.0195964891463518 0.7742439508438109 0.1376261711120605 0.000238782929955 0.0002964733866974 0.0102767748758196 0.0471519567072391 0.0105693461373448 -77.55719757080078 -34.35962677001953 0.0068981354124844 I 0.4225352112676056 I 0.4366197183098591 I 0.4647887323943662 I 0.4436619718309859 I 0.4436619718309859 I 0.471830985915493 I 0.4436619718309859 I 0.4577464788732394 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.0424902181257485e-06 9.147664934469956e-06 4.0424902181257485e-06 9.147664934469956e-06 1 247372 NA NA NA NA Gtg/Atg NA 0 NA NA NA NA NA NA NA L222= I 0.0182926829268292 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2953580617904663 54.08006111383438 H 0.6760007739067078 0.0052178311161696 0.3187814056873321 H 0.0284023955464363 0.5969877243041992 0.0529232807457447 0.004248003475368 0.0020843814127147 0.0975913777947425 0.1199991628527641 0.097763568162918 -92.54405975341795 -14.760578155517578 0.0075303800404071 I 0.0182926829268292 S 0.0060975609756097 I 0.0182926829268292 I 0.0121951219512195 I 0.0121951219512195 I 0.0060975609756097 I 0.0182926829268292 S 0.024390243902439 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.37 0.37 0.0 0.0 0.0 669G>T L222M I 0.0182926829268292 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.2953580617904663 54.08006111383438 H 0.6760007739067078 0.0052178311161696 0.3187814056873321 H 0.0284023955464363 0.5969877243041992 0.0529232807457447 0.004248003475368 0.0020843814127147 0.0975913777947425 0.1199991628527641 0.097763568162918 -92.54405975341795 -14.760578155517578 0.0075303800404071 I 0.0182926829268292 S 0.0060975609756097 I 0.0182926829268292 I 0.0121951219512195 I 0.0121951219512195 I 0.0060975609756097 I 0.0182926829268292 S 0.024390243902439 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 7.678134766842009e-06 1.6733204495490617e-05 4.0426898522127885e-06 8.63659601061754e-06 1 247360 1.395090021105716e-05 1.433210877844892e-05 2.0 143360.0 Ctg/Atg Ctg/Atg 0 0.0 NA NA NA NA NA NA F223L S 0.2233502538071066 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.3974937498569489 79.77699559628962 C 0.0118132838979363 0.0062595815397799 0.9819270968437196 C 0.0015422569122165 0.0066185304895043 0.0007718299748376 0.0060256337746977 0.0025265996810048 0.4392301142215729 0.0227618645876646 0.520523190498352 -109.02741241455078 116.52357482910156 0.0074877785518765 - 0.3350253807106599 - 0.3299492385786802 S 0.3908629441624365 S 0.3197969543147208 S 0.299492385786802 - 0.2284263959390863 S 0.2233502538071066 - 0.3147208121827411 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.040370185975917e-06 9.424188527363756e-06 4.040370185975917e-06 9.424188527363756e-06 1 247502 NA NA NA NA Ttt/Ctt NA 0 NA NA NA NA NA NA NA P224= - 0.2205882352941176 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.0053945463150739 0.0009131063707172 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706 0.0025914523284882 7.122094393707812e-05 0.000399761396693 0.0005596239352598 0.1180872991681099 0.0345571674406528 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413 - 0.0588235294117647 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.1985294117647058 - 0.1544117647058823 - 0.2867647058823529 - 0.2205882352941176 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 675G>T P224L - 0.2205882352941176 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.0053945463150739 0.0009131063707172 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706 0.0025914523284882 7.122094393707812e-05 0.000399761396693 0.0005596239352598 0.1180872991681099 0.0345571674406528 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413 - 0.0588235294117647 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.1985294117647058 - 0.1544117647058823 - 0.2867647058823529 - 0.2205882352941176 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 1.3952800145489169e-05 1.5618714392730382e-05 NA NA NA NA 1.3952800145489169e-05 1.5618714392730382e-05 2.0 143340.0 NA cCg/cTg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA P224Q - 0.2205882352941176 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4542969465255737 64.46473671197892 C 0.0053945463150739 0.0009131063707172 0.9936923980712892 C 0.0029626162722706 0.0025914523284882 7.122094393707812e-05 0.000399761396693 0.0005596239352598 0.1180872991681099 0.0345571674406528 0.8407707810401917 -68.18095397949219 148.81924438476562 0.020110186189413 - 0.0588235294117647 - 0.3382352941176471 - 0.2058823529411765 - 0.1985294117647058 - 0.1544117647058823 - 0.2867647058823529 - 0.2205882352941176 - 0.2794117647058824 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.35 0.35 0.0 0.0 0.0 674C>A P225T - 0.4558823529411764 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6438327431678772 91.35986625552178 C 0.0241847988218069 0.0056050471030175 0.9702101945877076 C 0.016792818903923 0.0096258781850337 0.0001534104521851 0.0032525283750146 0.0032639803830534 0.1406487971544265 0.185051143169403 0.6412113904953003 -67.69782257080078 131.864013671875 0.0585944354534149 S 0.5367647058823529 - 0.3897058823529412 - 1.0 - 0.6397058823529411 - 0.6838235294117647 - 0.3602941176470588 - 0.4558823529411765 - 1.0 4nef-A|4nef-D|6qf5-D|4nef-C|6qf5-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.28 0.28 0.0 0.0 0.0 676C>A A226G - 0.3679245283018867 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6449156999588013 71.06971013545991 C 0.0358761735260486 0.0063420082442462 0.9577818512916564 C 0.0257994253188371 0.0189639888703823 0.0001138091902248 0.004015970043838 0.0037673839833587 0.1136738061904907 0.1232431307435035 0.7104225158691406 -81.93953704833984 106.19904327392578 0.0805005431175232 - 0.660377358490566 - 0.8113207547169812 NA NA - 0.8867924528301887 - 0.5188679245283019 - 0.7358490566037735 - 0.3679245283018868 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 680C>G K227R S 0.8341463414634146 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.6160751581192017 126.72666002511976 C 0.054237499833107 0.0055119190365076 0.94025057554245 C 0.0154615715146064 0.0278707053512334 0.0001625861477805 0.0033892602659761 0.0028108006808906 0.2789378464221954 0.0293041840195655 0.6420630812644958 -91.87073516845705 118.7792739868164 0.0982744172215461 S 0.7512195121951221 - 0.6536585365853659 NA NA - 0.8097560975609757 - 1.0 - 0.5560975609756098 S 0.8341463414634146 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.24 0.24 0.0 0.0 0.0 683A>G L229R T 1.0 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA NA NA NA NA e 0.4031502306461334 73.81680723130702 H 0.7285189032554626 0.000759684422519 0.2707214951515198 H 0.0544199831783771 0.7170257568359375 0.0009886771440505 0.0004153332265559 0.0004183301061857 0.0277179591357708 0.0422672182321548 0.1567467004060745 -65.63974761962889 -34.08396530151367 0.1222682744264602 T 1.0 H 0.7804878048780488 NA NA T 0.8109756097560976 T 0.8353658536585366 H 0.7987804878048781 T 1.0 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.628181555821519e-05 NA NA NA NA 6.9766101660206905e-06 1.628181555821519e-05 1.0 143336.0 NA cTg/cGg NA 0.0 NA NA NA NA NA NA E231D H 0.268041237113402 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.5703091621398926 99.63301062583923 H 0.9108636379241944 0.0007026194361969 0.0884336903691291 H 0.0498553626239299 0.8557695150375366 0.0006558655877597 0.0002949282061308 0.0005277974996715 0.0078636277467012 0.0233351774513721 0.061697632074356 -67.28882598876953 -37.70706558227539 0.0772879123687744 - 1.0 H 0.2113402061855669 NA NA H 0.6134020618556701 T 0.922680412371134 H 0.2474226804123711 H 0.268041237113402 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-A|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 5.113965004138677e-06 1.728714266941478e-05 4.036619884573156e-06 9.569898190436984e-06 1 247732 6.975739779591095e-06 1.439660898605544e-05 1.0 143354.0 gaG/gaT gaG/gaT 0 0.0 NA NA NA NA NA NA R232C H 0.6693548387096774 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.2605181634426117 59.65865942835808 H 0.9212921261787416 0.0012698700884357 0.0774379223585128 H 0.0254096575081348 0.8983291983604431 0.0019773449748754 0.0004810406535398 0.0007254148367792 0.005963709205389 0.0167338289320468 0.0503798052668571 -65.23469543457031 -39.38766860961914 0.1047891229391098 NA NA H 0.5080645161290323 NA NA H 0.7016129032258065 - 0.8467741935483871 H 0.5 H 0.6693548387096774 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 8.073960088950116e-06 8.926554239226808e-06 8.073960088950116e-06 8.926554239226808e-06 2 247710 NA NA NA NA Cgc/Tgc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA R232G H 0.6693548387096774 NA NA NA Cytoplasmic|5 NA NA NA HELIX|10 NA NA NA e 0.2605181634426117 59.65865942835808 H 0.9212921261787416 0.0012698700884357 0.0774379223585128 H 0.0254096575081348 0.8983291983604431 0.0019773449748754 0.0004810406535398 0.0007254148367792 0.005963709205389 0.0167338289320468 0.0503798052668571 -65.23469543457031 -39.38766860961914 0.1047891229391098 NA NA H 0.5080645161290323 NA NA H 0.7016129032258065 - 0.8467741935483871 H 0.5 H 0.6693548387096774 NA NA 4nef-A|4nef-D|nan|4nef-C|6qf5-B|4nef-B NA NA NA 4.036980044475058e-06 1.040912269921178e-05 4.036980044475058e-06 1.040912269921178e-05 1 247710 NA NA NA NA Cgc/Ggc NA 0 NA NA NA NA NA NA NA